Israels armé meddelade på måndagen att man utreder ett fall där nio soldater ska ha misshandlat en palestinsk fånge.
Enligt de israeliska försvarsstyrkorna har offret tjänstgjort i Hamas elittrupper.
Misshandeln ska ha skett vid Sde Teiman, en dold militärförläggning i södra Israel.
Tusentals palestinier har frihetsberövats sedan kriget i Gaza bröt ut i fjol, enligt officiella uppgifter.
Största delen av dem ska ha hållits fängslade vid Sde Teiman.
Flera rapporter om våld och missförhållanden
Detaljerna kring fallet är oklara, men utredningar som har gjorts bland annat av AP och människorättsaktivister tyder på att förhållandena vid Sde Teiman är inhumana.
Enligt The Times of Israel har fången som tillfångatogs i Gaza för flera veckor sedan utsatts för ”allvarlig sexuell misshandel” och förts till sjukhus i allvarligt tillstånd för att opereras.
UNRWA, FN:s hjälporganisation för palestinska flyktingar, har rapporterat om våld och undermåliga israeliska fängelseförhållanden.
Israel har i allmänhet förnekat att palestinska fångar skulle misshandlas, men militären har ändå sagt att största delen av fångarna i Sde Teiman ska förflyttas och att förhållandena ska förbättras.
Israels antitortyrkommitté har välkomnat utredningen, men säger att våldet vid de israeliska interneringsanläggningarna är systematiskt och inte handlar om enskilda fall.
Ytterhögern hetsade under upplopp
Militärpolis som anlände till Sde Teiman för att gripa de misstänkta soldaterna möttes av demonstranter som hade samlats för att visa sitt stöd för soldaterna. Tumult uppstod då demonstranter bröt sig in på förläggningen.
En ytterligare incident ska ha skett vid militärförläggningen i Beit Lid i norra Israel, dit de gripna soldaterna flyttades.
Hundratals tog sig in på militärområdet och krävde att soldaterna skulle friges. En del av demonstranterna var utrustade med masker och skjutvapen.
Det israeliska ultranationalistiska partiet Otzma Yehudit deltog också i protesterna.
Flera partimedlemmar, bland annat Israels minister för nationell säkerhet, Itamar Ben Gvir, kritiserade utredningen.
Ben Gvir styr ministeriet som kontrollerar polisen och fängelsemyndigheterna, men har inget inflytande över försvarsmakten.
Han beskriver de misstänkta soldaterna som Israels ”bästa hjältar” och säger att deras gripande är ”ingenting annat än skamligt”.
Också Finansminister Bezalel Smotrich, som representerar det religiösa zionistpartiet, försvarade soldaterna på X och sa att de ”förtjänar respekt”.
Försvarsledningen manar till lugn
Israels premiärminister Benjamin Netanyahu har fördömt tumultet och manar till lugn. Också försvarsminister Yoav Gallant betonar att lagen gäller alla och att ingen får göra intrång på militärbaserna.
Israels militärchef Herzi Halevi har i sin tur uttryckt ett starkt stöd för militärutredningen.
Enligt den israeliska tidningen Haaretz har armén förstärkt bevakningen vid Beit Lid inför häktningsförhandlingarna.