Variabilità genomica di HIV: Un altro modo di presentarla

Intermédialités, 2004

médecine/sciences, 1990

Dina Kremsdorf l : chargée de recherche. Valé rie Thiers 2: technicien de recherche. Flo rianne Garreau 1 : assistant ingénieur. Albert Tran 1, 5 : docteur en médecine. Patrizia Pater lini 1 : docteur en médecine. Guido Gerken 1 : docteur en médecine. Bertrand Nalpas5 : chargé de recherche.

Médecine et Maladies Infectieuses, 2004

Le t6nofovir, analogue nucl6otidique de la transriptase inverse du VIH, peut Ore utilis6 en traitelnent de premiere ligne dans l'infection par le VIH. Cependant, l'association avec certains analogues nucleosidiques (AN) (abacavir et lamivudine, ou didanosine et lamivudine) est ddconseillee, en raison d'un taux 61ev6 d'echecs virologiques. En revanche, la combinaison avec un analogue de la thymidine semble efficace sur le plan virologique, mais est peu rapportee pour l'instant. Nous avons donc 6value l'efficacit6 immuno-vimlogique (lymphocytes CD4 par cytometrie de flux; charge virale VIH-1, Ampficor HIV Monitor V 1.5, Roche Diagnostic Systems) de l'association zidovudine, lmnivudine et tenofovir, prescfits en Iraitement de prcmibre intention, d'avfil 2002 h decembre 2003, quelle que soit la situation immunovirologique initiale. Nous avons inclus 21 patients (17 hommes, 4 femmes), d'fige moyen 40 ans (22-73 ans), en majorit6 asymptomatiques (14 au stade A, 9 au stade Bet 1 au stade C, de la classification des CDC). Le mode de contamination est essentiellement sexuel (h6tdmsexuel: 11, homosexuel: 9, usage de drogues iv: 1). lls sont 5 un stade plutet avanc6 de deficit immunitaire: mediane des CD4 h 209/ram 3 (69-355/mm 3) avant traitement, et la charge vh'ale mddiane est de 5 log (3.14-> 5.87 log). 11 patients ont une charge virale > 5 log. Treize patients sont 6valuables ~t 6 mois de traitement, dont 2 ont interrompu le tdnofovir pour intol6rance, et 1 a chang6 Fun des AN. La charge virale est < 50 copies/ml chez 9/t3 (69%) en intention de traiter, et 9/10 (90%) en analyse << sous traitement >>. Chez les 10 sujets dont le traitement n'a pas 6t6 modifi6, la m6diane des CD4 ~ 6 mois est de 247/mm 3 (121-658/mm~), soit + 38/mm ~. L'efficacit6 antivirale de la combinaison zidovudine, lamivudine et tdnofovir est tr~s bonne en traitement de premiere ligne, 'a 6 mois, avec une restanration itmnunitaire satis*hisante.

2015

La proteine Rev du VIH-1 est une petite proteine qui permet l&#39;export nucleaire des transcrits viraux partiellement ou non episses. L&#39;import nucleaire de Rev est realise par Importin β (Impβ), un facteur de transport cellulaire qui reconnait le signal de localisation nucleaire (NLS) riche en arginine present sur Rev. Le but de cette these est de determiner la structure tridimensionnelle du complexe forme par Impβ et Rev. Apres des essais de cristallogenese infructueux, nous avons sonde la structure du complexe Impβ/Rev en utilisant differentes approches biochimiques, biophysiques et computationnelles. Les resultats suggerent un nombre limite de modeles tridimensionnels du complexe Impβ/Rev. Ces travaux augmentent notre comprehension de la facon dont Impβ reconnait Rev et devraient dans l&#39;avenir, faciliter la determination de la structure de ce complexe a haute resolution.

médecine/sciences, 2020

2019

Les techniques de sequencage de nouvelle generation (NGS) offrent desormais de nouvelles perspectives aux chercheurs en oncogenomique. Ces techniques sont tres utiles et donnent acces a de l’information cruciale pour la recherche en detectant et identifiant rapidement les possibles mutations genetiques afin de diagnostiquer des maladies ou d’ameliorer leurs traitements. Afin de l’utiliser efficacement, il est primordial que chaque chercheur puisse traiter, explorer et interpreter, avec soin et rapidement, cette grande quantite de donnees. Les recherches en oncologie progressent rapidement. Elles produisent de nouvelles connaissances et generent de nouveaux resultats continuellement grâce a des projets collaboratifs, a grande echelle, qui offrent librement l’acces a des donnees cliniques et genomiques sur le cancer. Malheureusement, peu de chercheurs peuvent utiliser ces informations a leur plein potential meme si elles sont disponibles publiquement. Entre la taille grandissante, la ...

Archives de Pédiatrie, 2012

La mucoviscidose se défi nit comme la plus fréquente des maladies génétiques graves de l'enfant dans les populations caucasiennes. La découverte du gène responsable-le gène CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Regulator)-il y a plus de 20 ans permet aujourd'hui de mieux comprendre la physiopathologie de cette maladie. La mucoviscidose se caractérise par une grande variabilité phénotypique et les mutations de CFTR ne peuvent expliquer à elles seules toute la variabilité observée. Il a donc été évoqué l'implication de facteurs d'environnement et de gènes modifi cateurs. Des variants génétiques codant pour des gènes impliqués dans la physiopathologie de la maladie ont été étudiés, notamment des gènes de l'immunité ou de la réponse infl ammatoire. Certains de ces gènes ont en effet été montrés comme infl uençant la sévérité de la maladie. Une nouvelle approche a également été développée consistant à réaliser l'étude du génome entier. Cette revue a pour objectif de faire le point sur la génétique de la mucoviscidose dans ses présentations classique et atypique, ainsi que sur les travaux réalisés dans le domaine des gènes modifi cateurs.

Depuis les années 1990, de nombreux travaux portent sur l'étude de l'évolution des anticorps anti-VIH menantà des tests permettant de distinguer les infections récentes des infections déjà bienétabliesà partir d'un seuléchantillon de sérum. L'incidence peut alorsêtre estiméeà partir de la relation entre la prévalence, l'incidence et la durée de l'infection récente ("période fenêtre"). Cependant, de récents travaux ont montré les limites de cette approche dues essentiellementà une grande variabilité de la "période fenêtre". Nous proposons une approche alternative qui consisteà estimer la distribution du temps d'infection basée sur la valeur des marqueurs virologiques au moment où l'infection est découverte pour la première fois. Dans un premier temps, un modèle pour l'évolution des marqueurs est spécifié et estiméà partir de mesures répétées de marqueurs virologiques de séroconversion. Les paramètres du modèle sont estimésà partir des données d'une cohorte de patients inclus pendant la primo-infection. Dans un second temps, nous utilisons ce modèle pour estimer la distribution des temps d'infection pour les sujets nouvellement diagnostiqués VIH+ et reportés dans le système de surveillance des diagnostics VIH en France. Abstract: In the last decade, interest has been focused on HIV antibody assays and testing strategies that could distinguish recent infections from established infection in a single serum sample. Incidence estimates are obtained by using the relationship between prevalence, incidence and duration of recent infection ("window period"). However, recent works demonstrated limitations of this approach due to variability of the "window period". We propose an alternative approach which consists in estimating the distribution on infection times based on serological marker values at the moment when the infection is first discovered. We propose a model based on the repeated measurements of virological markers of seroconversion for the marker trajectory. The parameters of the model are estimated using data from a cohort of HIV infected patients enrolled during primary infection. We use this model to estimate the distribution of infection times for newly HIV diagnosed subjects reported in the French HIV surveillance system.

2010

Virus de l'immunodéficience humaine VIH Les virus de l'immunodéficience humaine (HIV) appartiennent à la famille des Rétrovirus. Ces derniers sont caractérisés par leur matériel génétique qui est constitué de deux molécules d'acide ribonucléique (ARN) associées à deux molécules d'une enzyme: la réverse transcriptase (RT) ou transcriptase inverse, qui est une ADN polymérase ARN dépendante, permettant de synthétiser un acide désoxyribonucléique (ADN), double brin, complémentaire de l'ARN viral, dans la cellule infectée par le rétrovirus. Cet ADN néoformé possède à chaque extrémité une même séquence répétitive de taille variable dite LTR (Long Terminal Repeat), il peut alors s'intégrer de manière stable dans l'ADN chromosomique de la cellule devenant un provirus. Ce provirus se comporte comme un gène de la cellule et peut soit, rester silencieux en se contentant d'être transmis aux cellules filles à chaque mitose, soit s'exprimer et être transcrit en ARN messager (ARNm), traduit ensuite en protéines virales, pour donner naissance à des particules virales identiques au virus infectieux de départ. Classification Les rétrovirus constituent une grande famille de virus pouvant infecter pratiquement toutes les espèces animales. Il existe trois sous familles ou catégories de rétrovirus classés selon des critères de pathogénie et de divergences génétiques : les Oncovirus, les lentivirus, et les Spumavirus (tableau n°1) Les virus VIH appartiennent à la catégorie des Lentivirus.