El proceso de inactivación mediante fluidos supercríticos asistido con ultrasonidos de potencia (SC-CO2 + HPU) en un sistema en discontinuo ha sido estudiado. Los resultados mostraron que la combinación de ambas técnicas aceleran la inactivación de E. coli. El objetivo de este trabajo fue el diseño y construcción de una planta de SC-CO2 + HPU en régimen continuo y determinar el efecto sobre la inactivación de E. coli. Fueron inoculadas 10 8 UFC/ml de E. coli en jugo de manzana comercial para ser tratado en un sistema en continuo con SC+CO2 y SC+CO2+HPU, evaluando la influencia de la presión (100-200 bar), temperatura (31, 36 y 41 ºC) y tiempos de residencia (1.72, 2.58 y 5.44 min) sobre la inactivación del microorganismo. En los tratamientos con SC-CO2+HPU, la agitación generada por los ultrasonidos permite la mezcla y contacto entre el CO2 y las células rápidamente. Además, el daño en la pared celular del microorganismo causado por la cavitación, generada por los ultrasonidos, facilita la penetración del SC-CO2 dentro de la célula y la extracción de componentes intracelulares, lo que acelera la muerte celular. Estos fenómenos permitieron que el nivel de inactivación se incrementara significativamente (p <0.05) para todos los tratamientos realizados con HPU, respecto a los tratamientos en los que se empleó únicamente SC-CO2.