TRIOBP

TRIOBP
Ідентифікатори
Символи	TRIOBP, DFNB28, TAP68, TARA, dJ37E16.4, HRIHFB2122, TRIO and F-actin binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 609761 MGI: 1349410 HomoloGene: 5104 GeneCards: TRIOBP
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal recessive nonsyndromic deafness 28
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з актиновими філаментами • зв'язування з актином • зв'язування з убіквітинпротеїнлігазою • зв'язування з міозином ІІ Клітинна компонента • focal adhesion • центр організації мікротрубочок • клітинне ядро • цитоскелет • midbody • actin cytoskeleton • цитоплазма Біологічний процес • barbed-end actin filament capping • regulation of actin cytoskeleton organization • клітинний цикл • поділ клітини • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • actin modification • слух • auditory receptor cell stereocilium organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11078	110253
Ensembl	ENSG00000100106	ENSMUSG00000033088
UniProt	Q9H2D6	Q99KW3
RefSeq (мРНК)	NM_138632 NM_001039141 NM_007032	NM_001024716 NM_001039155 NM_001039156 NM_138579
RefSeq (білок)	NP_001034230 NP_008963 NP_619538	NP_001019887 NP_001034244 NP_001034245 NP_613045
Локус (UCSC)	Хр. 22: 37.7 – 37.78 Mb	Хр. 15: 78.83 – 78.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIOBP (англ. TRIO and F-actin binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 365 амінокислот, а молекулярна маса — 261 376.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEVPGDALC		EHFEANILTQ		NRCQNCFHPE		EAHGARYQEL		RSPSGAEVPY
CDLPRCPPAP		EDPLSASTSG		CQSVVDPGLR		PGPKRGPSPS		AGLPEEGPTA
APRSRSRELE		AVPYLEGLTT		SLCGSCNEDP		GSDPTSSPDS		ATPDDTSNSS
SVDWDTVERQ		EEEAPSWDEL		AVMIPRRPRE		GPRADSSQRA		PSLLTRSPVG
GDAAGQKKED		TGGGGRSAGQ		HWARLRGESG		LSLERHRSTL		TQASSMTPHS
GPRSTTSQAS		PAQRDTAQAA		STREIPRASS		PHRITQRDTS		RASSTQQEIS
RASSTQQETS		RASSTQEDTP		RASSTQEDTP		RASSTQWNTP		RASSPSRSTQ
LDNPRTSSTQ		QDNPQTSFPT		CTPQRENPRT		PCVQQDDPRA		SSPNRTTQRE
NSRTSCAQRD		NPKASRTSSP		NRATRDNPRT		SCAQRDNPRA		SSPSRATRDN
PTTSCAQRDN		PRASRTSSPN		RATRDNPRTS		CAQRDNPRAS		SPSRATRDNP
TTSCAQRDNP		RASRTSSPNR		ATRDNPRTSC		AQRDNPRASS		PNRAARDNPT
TSCAQRDNPR		ASRTSSPNRA		TRDNPRTSCA		QRDNPRASSP		NRATRDNPTT
SCAQRDNPRA		SRTSSPNRAT		RDNPRTSCAQ		RDNPRASSPN		RTTQQDSPRT
SCARRDDPRA		SSPNRTIQQE		NPRTSCALRD		NPRASSPSRT		IQQENPRTSC
AQRDDPRASS		PNRTTQQENP		RTSCARRDNP		RASSRNRTIQ		RDNPRTSCAQ
RDNPRASSPN		RTIQQENLRT		SCTRQDNPRT		SSPNRATRDN		PRTSCAQRDN
LRASSPIRAT		QQDNPRTCIQ		QNIPRSSSTQ		QDNPKTSCTK		RDNLRPTCTQ
RDRTQSFSFQ		RDNPGTSSSQ		CCTQKENLRP		SSPHRSTQWN		NPRNSSPHRT
NKDIPWASFP		LRPTQSDGPR		TSSPSRSKQS		EVPWASIALR		PTQGDRPQTS
SPSRPAQHDP		PQSSFGPTQY		NLPSRATSSS		HNPGHQSTSR		TSSPVYPAAY
GAPLTSPEPS		QPPCAVCIGH		RDAPRASSPP		RYLQHDPFPF		FPEPRAPESE
PPHHEPPYIP		PAVCIGHRDA		PRASSPPRHT		QFDPFPFLPD		TSDAEHQCQS
PQHEPLQLPA		PVCIGYRDAP		RASSPPRQAP		EPSLLFQDLP		RASTESLVPS
MDSLHECPHI		PTPVCIGHRD		APSFSSPPRQ		APEPSLFFQD		PPGTSMESLA
PSTDSLHGSP		VLIPQVCIGH		RDAPRASSPP		RHPPSDLAFL		APSPSPGSSG
GSRGSAPPGE		TRHNLEREEY		TVLADLPPPR		RLAQRQPGPQ		AQCSSGGRTH
SPGRAEVERL		FGQERRKSEA		AGAFQAQDEG		RSQQPSQGQS		QLLRRQSSPA
PSRQVTMLPA		KQAELTRRSQ		AEPPHPWSPE		KRPEGDRQLQ		GSPLPPRTSA
RTPERELRTQ		RPLESGQAGP		RQPLGVWQSQ		EEPPGSQGPH		RHLERSWSSQ
EGGLGPGGWW		GCGEPSLGAA		KAPEGAWGGT		SREYKESWGQ		PEAWEEKPTH
ELPRELGKRS		PLTSPPENWG		GPAESSQSWH		SGTPTAVGWG		AEGACPYPRG
SERRPELDWR		DLLGLLRAPG		EGVWARVPSL		DWEGLLELLQ		ARLPRKDPAG
HRDDLARALG		PELGPPGTND		VPEQESHSQP		EGWAEATPVN		GHSPALQSQS
PVQLPSPACT		STQWPKIKVT		RGPATATLAG		LEQTGPLGSR		STAKGPSLPE
LQFQPEEPEE		SEPSRGQDPL		TDQKQADSAD		KRPAEGKAGS		PLKGRLVTSW
RMPGDRPTLF		NPFLLSLGVL		RWRRPDLLNF		KKGWMSILDE		PGEPPSPSLT
TTSTSQWKKH		WFVLTDSSLK		YYRDSTAEEA		DELDGEIDLR		SCTDVTEYAV
QRNYGFQIHT		KDAVYTLSAM		TSGIRRNWIE		ALRKTVRPTS		APDVTKLSDS
NKENALHSYS		TQKGPLKAGE		QRAGSEVISR		GGPRKADGQR		QALDYVELSP
LTQASPQRAR		TPARTPDRLA		KQEELERDLA		QRSEERRKWF		EATDSRTPEV
PAGEGPRRGL		GAPLTEDQQN		RLSEEIEKKW		QELEKLPLRE		NKRVPLTALL
NQSRGERRGP		PSDGHEALEK		EVQALRAQLE		AWRLQGEAPQ		SALRSQEDGH
IPPGYISQEA		CERSLAEMES		SHQQVMEELQ		RHHERELQRL		QQEKEWLLAE
ETAATASAIE		AMKKAYQEEL		SRELSKTRSL		QQGPDGLRKQ		HQSDVEALKR
ELQVLSEQYS		QKCLEIGALM		RQAEEREHTL		RRCQQEGQEL		LRHNQELHGR
LSEEIDQLRG		FIASQGMGNG		CGRSNERSSC		ELEVLLRVKE		NELQYLKKEV
QCLRDELQMM		QKDKRFTSGK		YQDVYVELSH		IKTRSEREIE		QLKEHLRLAM
AALQEKESMR		NSLAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Hirosawa M., Nagase T., Murahashi Y., Kikuno R., Ohara O. (2001). Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping. DNA Res. 8: 1—9. PMID 11258795 doi:10.1093/dnares/8.1.1
• Seipel K., O'Brien S.P., Iannotti E., Medley Q.G., Streuli M. (2001). Tara, a novel F-actin binding protein, associates with the Trio guanine nucleotide exchange factor and regulates actin cytoskeletal organization. J. Cell Sci. 114: 389—399. PMID 11148140

Див. також

• Хромосома 22