STX6

STX6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NPS, 4J2C
Ідентифікатори
Символи	STX6, syntaxin 6
Зовнішні ІД	OMIM: 603944 MGI: 1926235 HomoloGene: 115622 GeneCards: STX6
Пов'язані генетичні захворювання
прогресуючий супрануклеарний параліч
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • syntaxin binding • SNAP receptor activity • SNARE binding Клітинна компонента • мембрана • клітинна мембрана • SNARE complex • рання ендосома • phagocytic vesicle • перинуклеарна ділянка цитоплазми • clathrin-coated vesicle • trans-Golgi network • інтегральний компонент мембрани • Golgi membrane • trans-Golgi network membrane • комплекс Ґольджі • нуклеоплазма • гіалоплазма • Синаптичні бульбашки • integral component of synaptic vesicle membrane • система ендомембран Біологічний процес • endosome organization • regulation of protein localization • vesicle docking • retrograde transport, endosome to Golgi • Golgi vesicle transport • транспорт білків • vesicle fusion • Golgi ribbon formation • vesicle-mediated transport • intracellular protein transport • endocytic recycling • synaptic vesicle to endosome fusion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10228	58244
Ensembl	ENSG00000135823	ENSMUSG00000026470
UniProt	O43752	Q9JKK1
RefSeq (мРНК)	NM_001286210 NM_005819	NM_021433
RefSeq (білок)	NP_001273139 NP_005810	NP_067408
Локус (UCSC)	Хр. 1: 180.97 – 181.02 Mb	Хр. 1: 155.03 – 155.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STX6 (англ. Syntaxin 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 255 амінокислот, а молекулярна маса — 29 176.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSMEDPFFVV		KGEVQKAVNT		AQGLFQRWTE		LLQDPSTATR		EEIDWTTNEL
RNNLRSIEWD		LEDLDETISI		VEANPRKFNL		DATELSIRKA		FITSTRQVVR
DMKDQMSTSS		VQALAERKNR		QALLGDSGSQ		NWSTGTTDKY		GRLDRELQRA
NSHFIEEQQA		QQQLIVEQQD		EQLELVSGSI		GVLKNMSQRI		GGELEEQAVM
LEDFSHELES		TQSRLDNVMK		KLAKVSHMTS		DRRQWCAIAI		LFAVLLVVLI
LFLVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, ацетиляція. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Charest A., Lane K., McMahon K., Housman D.E. (2001). Association of a novel PDZ domain-containing peripheral Golgi protein with the Q-SNARE (Q-soluble N-ethylmaleimide-sensitive fusion protein (NSF) attachment protein receptor) protein syntaxin 6. J. Biol. Chem. 276: 29456—29465. PMID 11384996 doi:10.1074/jbc.M104137200
• Martin-Martin B., Nabokina S.M., Lazo P.A., Mollinedo F. (1999). Co-expression of several human syntaxin genes in neutrophils and differentiating HL-60 cells: variant isoforms and detection of syntaxin 1. J. Leukoc. Biol. 65: 397—406. PMID 10080545

Див. також

• Хромосома 1