SPN

SPN
Ідентифікатори
Символи	SPN, CD43, GALGP, GPL115, LSN, sialophorin, LEU-22
Зовнішні ІД	OMIM: 182160 MGI: 98384 HomoloGene: 36108 GeneCards: SPN
Онтологія гена Молекулярна функція • активність трансмембранного сигнального рецептора • Hsp70 protein binding • heat shock protein binding Клітинна компонента • інтегральний компонент мембрани • мембрана • клітинна мембрана • інтегральний компонент плазматичної мембрани • базальна мембрана • поверхня клітини • uropod • екзосома • зовнішня поверхня плазматичної мембрани • міжклітинний простір Біологічний процес • negative regulation of cell adhesion • positive regulation of protein phosphorylation • negative regulation of type IV hypersensitivity • response to protozoan • T cell costimulation • negative thymic T cell selection • хемотаксис • establishment or maintenance of cell polarity • cellular defense response • cell surface receptor signaling pathway • negative regulation of T cell proliferation • defense response to bacterium • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of T cell proliferation • regulation of immune response • apoptotic signaling pathway • regulation of defense response to virus • negative regulation of T cell activation • leukocyte migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6693	20737
Ensembl	ENSG00000197471	ENSMUSG00000051457
UniProt	P16150	P15702
RefSeq (мРНК)	NM_001030288 NM_003123	NM_001037810 NM_009259
RefSeq (білок)	NP_001025459 NP_003114	NP_001032899 NP_033285
Локус (UCSC)	Хр. 16: 29.66 – 29.67 Mb	Хр. 7: 126.73 – 126.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPN (англ. Sialophorin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 400 амінокислот, а молекулярна маса — 40 322.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATLLLLLGV		LVVSPDALGS		TTAVQTPTSG		EPLVSTSEPL		SSKMYTTSIT
SDPKADSTGD		QTSALPPSTS		INEGSPLWTS		IGASTGSPLP		EPTTYQEVSI
KMSSVPQETP		HATSHPAVPI		TANSLGSHTV		TGGTITTNSP		ETSSRTSGAP
VTTAASSLET		SRGTSGPPLT		MATVSLETSK		GTSGPPVTMA		TDSLETSTGT
TGPPVTMTTG		SLEPSSGASG		PQVSSVKLST		MMSPTTSTNA		STVPFRNPDE
NSRGMLPVAV		LVALLAVIVL		VALLLLWRRR		QKRRTGALVL		SRGGKRNGVV
DAWAGPAQVP		EEGAVTVTVG		GSGGDKGSGF		PDGEGSSRRP		TLTTFFGRRK
SRQGSLAMEE		LKSGSGPSLK		GEEEPLVASE		DGAVDAPAPD		EPEGGDGAAP

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у мембрані.

Література

• Shelley C.S., Remold-O'Donnell E., Rosen F.S., Whitehead D.A.S. (1990). Structure of the human sialophorin (CD43) gene. Identification of features atypical of genes encoding integral membrane proteins. Biochem. J. 270: 569—576. PMID 2241892 doi:10.1042/bj2700569
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 doi:10.1021/pr800500r
• Kudo S., Fukuda M. (1991). A short, novel promoter sequence confers the expression of human leukosialin, a major sialoglycoprotein on leukocytes. J. Biol. Chem. 266: 8483—8489. PMID 1827122
• Piller V., Piller F., Fukuda M. (1989). Phosphorylation of the major leukocyte surface sialoglycoprotein, leukosialin, is increased by phorbol 12-myristate 13-acetate. J. Biol. Chem. 264: 18824—18831. PMID 2530225

Див. також

• Хромосома 16