SLAMF6

SLAMF6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2IF7
Ідентифікатори
Символи	SLAMF6, CD352, KALI, KALIb, Ly108, NTB-A, NTBA, SF2000, SLAM family member 6
Зовнішні ІД	OMIM: 606446 MGI: 1353620 HomoloGene: 49945 GeneCards: SLAMF6
Пов'язані генетичні захворювання
дифузний токсичний зоб, Graves' disease
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми Клітинна компонента • інтегральний компонент мембрани • клітинна мембрана • екзосома • мембрана Біологічний процес • natural killer cell proliferation • процес імунної системи • positive regulation of interferon-gamma production • positive regulation of interleukin-17 production • вроджений імунітет • positive regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity • адаптивна імунна відповідь • T-helper 17 cell lineage commitment • regulation of immune response • natural killer cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	114836	30925
Ensembl	ENSG00000162739	ENSMUSG00000015314
UniProt	Q96DU3	Q9ET39
RefSeq (мРНК)	NM_052931 NM_001184714 NM_001184715 NM_001184716	NM_030710 NM_001347186 NM_001347187
RefSeq (білок)	NP_001171643 NP_001171644 NP_001171645 NP_443163	NP_001334115 NP_001334116 NP_109635
Локус (UCSC)	Хр. 1: 160.49 – 160.52 Mb	Хр. 1: 171.75 – 171.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLAMF6 (англ. SLAM family member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 332 амінокислот, а молекулярна маса — 37 345.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLWLFQSLLF		VFCFGPGNVV		SQSSLTPLMV		NGILGESVTL		PLEFPAGEKV
NFITWLFNET		SLAFIVPHET		KSPEIHVTNP		KQGKRLNFTQ		SYSLQLSNLK
MEDTGSYRAQ		ISTKTSAKLS		SYTLRILRQL		RNIQVTNHSQ		LFQNMTCELH
LTCSVEDADD		NVSFRWEALG		NTLSSQPNLT		VSWDPRISSE		QDYTCIAENA
VSNLSFSVSA		QKLCEDVKIQ		YTDTKMILFM		VSGICIVFGF		IILLLLVLRK
RRDSLSLSTQ		RTQGPAESAR		NLEYVSVSPT		NNTVYASVTH		SNRETEIWTP
RENDTITIYS		TINHSKESKP		TFSRATALDN		VV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504
• Eissmann P., Watzl C. (2006). Molecular analysis of NTB-A signaling: a role for EAT-2 in NTB-A-mediated activation of human NK cells. J. Immunol. 177: 3170—3177. PMID 16920955 doi:10.4049/jimmunol.177.5.3170

Див. також

• Хромосома 1