Перейти до вмісту

PTPRJ

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
PTPRJ
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PTPRJ, CD148, DEP1, HPTPeta, R-PTP-ETA, SCC1, protein tyrosine phosphatase, receptor type J, protein tyrosine phosphatase receptor type J, R-PTP-J, HPTP eta
Зовнішні ІД OMIM: 600925 MGI: 104574 HomoloGene: 2130 GeneCards: PTPRJ
шифр КФ 3.1.3.48
Пов'язані генетичні захворювання
lymphoblastic leukemia[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001098503
NM_002843
NM_001135657
NM_008982
RefSeq (білок)
NP_001091973
NP_002834
NP_001129129
NP_033008
Локус (UCSC) Хр. 11: 47.98 – 48.17 Mb Хр. 2: 90.26 – 90.41 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PTPRJ (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type J) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 337 амінокислот, а молекулярна маса — 145 941[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKPAAREARL PPRSPGLRWA LPLLLLLLRL GQILCAGGTP SPIPDPSVAT
VATGENGITQ ISSTAESFHK QNGTGTPQVE TNTSEDGESS GANDSLRTPE
QGSNGTDGAS QKTPSSTGPS PVFDIKAVSI SPTNVILTWK SNDTAASEYK
YVVKHKMENE KTITVVHQPW CNITGLRPAT SYVFSITPGI GNETWGDPRV
IKVITEPIPV SDLRVALTGV RKAALSWSNG NGTASCRVLL ESIGSHEELT
QDSRLQVNIS GLKPGVQYNI NPYLLQSNKT KGDPLGTEGG LDASNTERSR
AGSPTAPVHD ESLVGPVDPS SGQQSRDTEV LLVGLEPGTR YNATVYSQAA
NGTEGQPQAI EFRTNAIQVF DVTAVNISAT SLTLIWKVSD NESSSNYTYK
IHVAGETDSS NLNVSEPRAV IPGLRSSTFY NITVCPVLGD IEGTPGFLQV
HTPPVPVSDF RVTVVSTTEI GLAWSSHDAE SFQMHITQEG AGNSRVEITT
NQSIIIGGLF PGTKYCFEIV PKGPNGTEGA SRTVCNRTVP SAVFDIHVVY
VTTTEMWLDW KSPDGASEYV YHLVIESKHG SNHTSTYDKA ITLQGLIPGT
LYNITISPEV DHVWGDPNST AQYTRPSNVS NIDVSTNTTA ATLSWQNFDD
ASPTYSYCLL IEKAGNSSNA TQVVTDIGIT DATVTELIPG SSYTVEIFAQ
VGDGIKSLEP GRKSFCTDPA SMASFDCEVV PKEPALVLKW TCPPGANAGF
ELEVSSGAWN NATHLESCSS ENGTEYRTEV TYLNFSTSYN ISITTVSCGK
MAAPTRNTCT TGITDPPPPD GSPNITSVSH NSVKVKFSGF EASHGPIKAY
AVILTTGEAG HPSADVLKYT YEDFKKGASD TYVTYLIRTE EKGRSQSLSE
VLKYEIDVGN ESTTLGYYNG KLEPLGSYRA CVAGFTNITF HPQNKGLIDG
AESYVSFSRY SDAVSLPQDP GVICGAVFGC IFGALVIVTV GGFIFWRKKR
KDAKNNEVSF SQIKPKKSKL IRVENFEAYF KKQQADSNCG FAEEYEDLKL
VGISQPKYAA ELAENRGKNR YNNVLPYDIS RVKLSVQTHS TDDYINANYM
PGYHSKKDFI ATQGPLPNTL KDFWRMVWEK NVYAIIMLTK CVEQGRTKCE
EYWPSKQAQD YGDITVAMTS EIVLPEWTIR DFTVKNIQTS ESHPLRQFHF
TSWPDHGVPD TTDLLINFRY LVRDYMKQSP PESPILVHCS AGVGRTGTFI
AIDRLIYQIE NENTVDVYGI VYDLRMHRPL MVQTEDQYVF LNQCVLDIVR
SQKDSKVDLI YQNTTAMTIY ENLAPVTTFG KTNGYIA

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

[ред. | ред. код]
  • Oestman A., Yang Q., Tonks N.K. (1994). Expression of DEP-1, a receptor-like protein-tyrosine-phosphatase, is enhanced with increasing cell density. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 9680—9684. PMID 7937872 doi:10.1073/pnas.91.21.9680
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Baker J.E., Majeti R., Tangye S.G., Weiss A. (2001). Protein tyrosine phosphatase CD148-mediated inhibition of T-cell receptor signal transduction is associated with reduced LAT and phospholipase Cgamma1 phosphorylation. Mol. Cell. Biol. 21: 2393—2403. PMID 11259588 doi:10.1128/MCB.21.7.2393-2403.2001
  • Persson C., Engstrom U., Mowbray S.L., Ostman A. (2002). Primary sequence determinants responsible for site-selective dephosphorylation of the PDGF beta-receptor by the receptor-like protein tyrosine phosphatase DEP-1. FEBS Lett. 517: 27—31. PMID 12062403 doi:10.1016/S0014-5793(02)02570-X
  • Holsinger L.J., Ward K., Duffield B., Zachwieja J., Jallal B. (2002). The transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase DEP1 interacts with p120(ctn). Oncogene. 21: 7067—7076. PMID 12370829 doi:10.1038/sj.onc.1205858
  • Palka H.L., Park M., Tonks N.K. (2003). Hepatocyte growth factor receptor tyrosine kinase met is a substrate of the receptor protein-tyrosine phosphatase DEP-1. J. Biol. Chem. 278: 5728—5735. PMID 12475979 doi:10.1074/jbc.M210656200

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з PTPRJ переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9673 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-17 у Wayback Machine.]
  5. UniProt, Q12913 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]