PDCD1

PDCD1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2M2D, 3RRQ, 4ZQK
Ідентифікатори
Символи	PDCD1, CD279, PD-1, PD1, SLEB2, hPD-1, hPD-l, hSLE1, Programmed cell death 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600244 MGI: 104879 HomoloGene: 3681 GeneCards: PDCD1
Реагує на сполуку
	Пембролізумаб
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • сигнальна трансдукторна активність;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • клітинна мембрана; • мембрана; • зовнішня поверхня плазматичної мембрани;
Біологічний процес	• позитивна регуляція апоптозу; • розвиток багатоклітинного організму; • T cell costimulation; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of T cell apoptotic process; • humoral immune response; • negative regulation of tolerance induction; • процес імунної системи; • GO:0097285 апоптоз; • GO:0072468 сигнальна трансдукція;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5133
	18566
	ENSG00000188389; ENSG00000276977
	ENSMUSG00000026285
	Q15116
	Q02242
	NM_005018
	NM_008798
	NP_005009
	NP_032824
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDCD1 (англ. Programmed cell death 1) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 288 амінокислот, а молекулярна маса — 31 647^[5].

Відкриття

Під час скринінгу генів, залучених до апоптозу, Ясумаса Ісіда, Хондзьо Тасуку і його колеги з Університету Кіото в 1992 році виявили і назвали PD-1.^[6]^[7] У 1999 році одна і та ж група продемонструвала, що миші з нокаутованим PD-1, були схильні до автоімунного захворювання, і тому прийшли до висновку, що PD-1 є негативним регулятором імунних відповідей.^[7]

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQIPQAPWPV	VWAVLQLGWR	PGWFLDSPDR	PWNPPTFSPA	LLVVTEGDNA
TFTCSFSNTS	ESFVLNWYRM	SPSNQTDKLA	AFPEDRSQPG	QDCRFRVTQL
PNGRDFHMSV	VRARRNDSGT	YLCGAISLAP	KAQIKESLRA	ELRVTERRAE
VPTAHPSPSP	RPAGQFQTLV	VGVVGGLLGS	LVLLVWVLAV	ICSRAARGTI
GARRTGQPLK	EDPSAVPVFS	VDYGELDFQW	REKTPEPPVP	CVPEQTEYAT
IVFPSGMGTS	SPARRGSADG	PRSAQPLRPE	DGHCSWPL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, поліморфізм. Локалізований у мембрані.

Література

Shinohara T., Taniwaki M., Ishida Y., Kawaich M., Honjo T. (1994). Structure and chromosomal localization of the human PD-1 gene (PDCD1). Genomics. 23: 704—706. PMID 7851902 doi:10.1006/geno.1994.1562
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Fife B.T., Pauken K.E. (2011). The role of the PD-1 pathway in autoimmunity and peripheral tolerance. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1217: 45—59. PMID 21276005 doi:10.1111/j.1749-6632.2010.05919.x

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з PDCD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8760 (англ.) . Архів оригіналу за 18 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-18 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q15116 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ Ishida Y, Agata Y, Shibahara K, Honjo T (Листопад 1992). Induced expression of PD-1, a novel member of the immunoglobulin gene superfamily, upon programmed cell death. The EMBO Journal. 11 (11): 3887—95. doi:10.1002/j.1460-2075.1992.tb05481.x. PMC 556898. PMID 1396582.
1 2 Bardhan K, Anagnostou T, Boussiotis VA (2016). The PD1:PD-L1/2 Pathway from Discovery to Clinical Implementation. Frontiers in Immunology. 7: 550. doi:10.3389/fimmu.2016.00550. PMC 5149523. PMID 28018338.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з PDCD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8760 (англ.) . Архів оригіналу за 18 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-18 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q15116 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[Ishida_1992-6] Ishida Y, Agata Y, Shibahara K, Honjo T (Листопад 1992). Induced expression of PD-1, a novel member of the immunoglobulin gene superfamily, upon programmed cell death. The EMBO Journal. 11 (11): 3887—95. doi:10.1002/j.1460-2075.1992.tb05481.x. PMC 556898. PMID 1396582.

[Bardhan_2016-7] 1 2 Bardhan K, Anagnostou T, Boussiotis VA (2016). The PD1:PD-L1/2 Pathway from Discovery to Clinical Implementation. Frontiers in Immunology. 7: 550. doi:10.3389/fimmu.2016.00550. PMC 5149523. PMID 28018338.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350