CD40

CD40
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1CZZ, 1D00, 1FLL, 1LB6, 3QD6, 5DMJ, 5IHL, 5DMI
Ідентифікатори
Символи	CD40, Bp50, CDW40, TNFRSF5, p50, CD40 (protein), CD40 molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 109535 MGI: 88336 HomoloGene: 954 GeneCards: CD40
Пов'язані генетичні захворювання
	ревматоїдний артрит, CD40 deficiency
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0003823, GO:0051635 antigen binding; • сигнальна трансдукторна активність; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • tumor necrosis factor-activated receptor activity; • enzyme binding; • зв'язування з убіквітинпротеїнлігазою; • protein domain specific binding; • сигнальна рецепторна активність;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • інтегральний компонент мембрани; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • мембрана; • клітинна мембрана; • інтегральний компонент плазматичної мембрани; • extracellular region; • поверхня клітини; • CD40 receptor complex; • екзосома; • зовнішня поверхня плазматичної мембрани; • міжклітинний простір; • сома; • varicosity;
Біологічний процес	• positive regulation of protein phosphorylation; • positive regulation of MAP kinase activity; • positive regulation of interleukin-12 production; • protein kinase B signaling; • positive regulation of protein kinase C signaling; • процес імунної системи; • cellular calcium ion homeostasis; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • immune response-regulating cell surface receptor signaling pathway; • platelet activation; • розвиток багатоклітинного організму; • B cell activation; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • response to lipopolysaccharide; • B cell proliferation; • cellular response to mechanical stimulus; • positive regulation of endothelial cell apoptotic process; • regulation of cell population proliferation; • positive regulation of B cell proliferation; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • defense response to virus; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • regulation of immune response; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • apoptotic signaling pathway; • positive regulation of isotype switching to IgG isotypes; • cellular response to lipopolysaccharide; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • defense response to protozoan; • response to bacterium; • response to nutrient levels; • response to cobalamin; • відповідь на γ-інтерферон; • cellular response to erythropoietin; • cellular response to interleukin-1; • cellular response to tumor necrosis factor; • response to peptide; • inflammatory response; • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein; • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration; • positive regulation of angiogenesis; • GO:0034622 protein-containing complex assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	958
	21939
	ENSG00000101017
	ENSMUSG00000017652
	P25942
	P27512
NM_001250; NM_001302753; NM_152854; NM_001322421; NM_001322422;
	NM_001362758
	NM_011611; NM_170702; NM_170703; NM_170704
NP_001241; NP_001289682; NP_001309350; NP_001309351; NP_690593;
	NP_001349687
	NP_035741; NP_733803; NP_733804; NP_733805
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CD40 (англ. CD40 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 277 амінокислот, а молекулярна маса — 30 619^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVRLPLQCVL	WGCLLTAVHP	EPPTACREKQ	YLINSQCCSL	CQPGQKLVSD
CTEFTETECL	PCGESEFLDT	WNRETHCHQH	KYCDPNLGLR	VQQKGTSETD
TICTCEEGWH	CTSEACESCV	LHRSCSPGFG	VKQIATGVSD	TICEPCPVGF
FSNVSSAFEK	CHPWTSCETK	DLVVQQAGTN	KTDVVCGPQD	RLRALVVIPI
IFGILFAILL	VLVFIKKVAK	KPTNKAPHPK	QEPQEINFPD	DLPGSNTAAP
VQETLHGCQP	VTQEDGKESR	ISVQERQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Tone M., Tone Y., Fairchild P.J., Wykes M., Waldmann H. (2001). Regulation of CD40 function by its isoforms generated through alternative splicing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 1751—1756. PMID 11172023 doi:10.1073/pnas.98.4.1751
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504
Sato T., Irie S., Reed J.C. (1995). A novel member of the TRAF family of putative signal transducing proteins binds to the cytosolic domain of CD40. FEBS Lett. 358: 113—118. PMID 7530216 doi:10.1016/0014-5793(94)01406-Q
Bajorath J., Aruffo A. (1997). Construction and analysis of a detailed three-dimensional model of the ligand binding domain of the human B cell receptor CD40. Proteins. 27: 59—70. PMID 9037712 doi:10.1002/(SICI)1097-0134(199701)27:1<59::AID-PROT7>3.3.CO;2-Z
Stamenkovic I., Clark E.A., Seed B. (1989). A B-lymphocyte activation molecule related to the nerve growth factor receptor and induced by cytokines in carcinomas. EMBO J. 8: 1403—1410. PMID 2475341

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CD40 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11919 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P25942 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CD40 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11919 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P25942 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350