APOF

APOF
Ідентифікатори
Символи	APOF, Apo-F, LTIP, apolipoprotein F
Зовнішні ІД	OMIM: 107760 MGI: 104539 HomoloGene: 48030 GeneCards: APOF
Онтологія гена Молекулярна функція • cholesterol binding • signaling receptor binding • lipid transporter activity Клітинна компонента • low-density lipoprotein particle • high-density lipoprotein particle • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • steroid metabolic process • lipid transport • cholesterol metabolic process • обмін жирів Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	319	103161
Ensembl	ENSG00000175336	ENSMUSG00000047631
UniProt	Q13790	Q91V80
RefSeq (мРНК)	NM_001638	NM_133997
RefSeq (білок)	NP_001629	NP_598758
Локус (UCSC)	Хр. 12: 56.36 – 56.36 Mb	Хр. 10: 128.1 – 128.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

APOF (англ. Apolipoprotein F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 326 амінокислот, а молекулярна маса — 35 399.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTGLCGYSAP		DMRGLRLIMI		PVELLLCYLL		LHPVDATSYG		KQTNVLMHFP
LSLESQTPSS		DPLSCQFLHP		KSLPGFSHMA		PLPKFLVSLA		LRNALEEAGC
QADVWALQLQ		LYRQGGVNAT		QVLIQHLRGL		QKGRSTERNV		SVEALASALQ
LLAREQQSTG		RVGRSLPTED		CENEKEQAVH		NVVQLLPGVG		TFYNLGTALY
YATQNCLGKA		RERGRDGAID		LGYDLLMTMA		GMSGGPMGLA		ISAALKPALR
SGVQQLIQYY		QDQKDANISQ		PETTKEGLRA		ISDVSDLEET		TTLASFISEV
VSSAPYWGWA		IIKSYDLDPG		AGSLEI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, транспорт, метаболізм холестеролу, транспорт ліпідів, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів. Секретований назовні.

Література

• Wang X., Driscoll D.M., Morton R.E. (1999). Molecular cloning and expression of lipid transfer inhibitor protein reveals its identity with apolipoprotein F. J. Biol. Chem. 274: 1814—1820. PMID 9880564 doi:10.1074/jbc.274.3.1814
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Olofsson S.-O., McConathy W.J., Alaupovic P. (1978). Isolation and partial characterization of a new acidic apolipoprotein (apolipoprotein F) from high density lipoproteins of human plasma. Biochemistry. 17: 1032—1036. PMID 204339 doi:10.1021/bi00599a014
• Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 doi:10.1074/mcp.M111.013649

Див. також

• Хромосома 12