Biologia

NOTE

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medico
1. Lez
Macromolecole
molecole organiche=contengono carbonio
Formano struttura cellule
Alla base delle attivita cellulari,di grandi dimensioni
LIPIDI unici non polimeri

elementi costitutivi della cellula

Cellula vegetale:

Fosfoproteine: proteina con uno o piu grupppi fosfato _fosforilazione=attiva

3 amminoacidi di fosforilazione:
Serina
Treonina
Tirosina

CHINASI=aggiunta gruppo fosfato

Importanti fosfoproteine perche sono varianti

Proto procarioti da alla vita il mitocondrio

PROTEINE

Più alto livello di complessità della cellula(eterogenee,diverse)

Amminoacidi differiscono dalla catena laterale

Proteine di tanti amminoacidi diversi (20^n,n=numero amminacidi)perche differiscono per

la catena laterale,produce strutture e funzione diverse

GLICINA unica proteina che si lega a quattro gruppi diversi,esisterà in forma di e l

Domini:un iniseme di pezzi che uniscono la catena che possono essere a elica o beta foglietto)
Globine=struttura terziaria ma senza funzione

Proteineconiugate:legate a acidi nucleici

Isoterme/protoforme, diversificano spettro di funzioni che si puo svolgere

 ⚠
CARBOIDRATI. (CH2O)n
DIVERSI TIPI:triosi,pentosi,esosi
Esosi:FRUTTOSIO,che toso perche ha una catena carbonilica all interno della sua
catena

-legami glicosidici per formare gli zuccheri,polisaccardi piu semplici 7-20

unità:OLIGOSACCARDI

-nel fegato e nella parete cellulare vegetale

-formano glicolipidi e glicoproteine
LEGAMI:
Lattosio unico ad avere legami beta 1.4 maCTOSIO

Legami alfa:
Glicogeno
Legami 1-4 semplici
‘’’’’’. 1-6 ramificati

Amido:
Amilosio. Lineare
Amilopectina ramificata

Legami b
1-4 cellulosa

I LIPIDI:
-Non polari
TIPI:
Grassi,steroidi e fosfolipidi

1.I GRASSI:1 glicerolo+3 acidi grassi

Margarina,grasso solido ottenuto da olio vegetale rompendo doppi legami

2.STEROIDI:
Scheletro a quattro anelli

COLESTEROLO fa parte degli steroidi

-cio che distingue cellule animali
-In una cellula il 50% è costituito da lipidi

-testosterone,progesterone ed estrogeni

Acidi nucleici:
MICROSCOPIO
lvoeta:1600 Hooke SUGHERO

METABOLISMO:Insieme reationichimiche
organismo

Gauchere
ne

no agonuei(MESSO1 -> aplegomento membe.cece.

IRIBOSOMI x proteine

11 A dlameico
=

VIRUS
vizione - materiale generico
copside

proVis -> DNA

vicaleintegrate
 Il dna
La maggior parte del dna

A cui attribuiamo un significato funzionale,codifica per polipeptidi

Il 2% di dna codifica per proteine

Codifica per un rna non codificante(non messaggero) ma non e la maggior parte del
genoma
TRASCRITTOMA=tutto rna trascritto

Lunge sequenze non vengono trascritte per rna messaggeri ma sono proteine modulatori
per rna

Il dna ha funzioni sconosciute,biomarcatori aumentano in stato di malattia(piccoli rna

non codificante che circolano nel sangue)

Ha una funzione anche se non attribuibile perche si conservano dei pezzi di dna ancora
tra le specie
DNA STRUTTIURE
Per essere attivo deve essere associato a proteine,

Istoni=proteine per compattarlo,lo tengono assieme

Dna assume organizzazioni strutturali alternative in base allo stato funzionale(cellula

divisa=dna piu compattato)

Lunghezza 1 m di dna da far entrare nel nucleo,se dna e impacchettato non puo essere
trascritto

Dna associato con legami ad idrogeno,il nucleo soma

+ nucleosomi:bidon screen-trascrizione geni attiva

Fibra spesa:30 nm-geni meno attivi

Cromosoma,max condensazione
La cellula quando si inizia a dividere,si iniziano a formare i cromosomi

I CROMOSOMI
Visibili durante mitosi cellulare
In interface meno condensato,cromatina

Per colorare il dna,

Per vedere gli acidi nucleici

FISH(Ibridazione fluorescente in vitro)

Se dapi si utilizza mentre la cellula non si sta dividendi,si vede il nucleo

LA STRUTTURA DEL DNA

-ROSALIND FRANKLIN: ottiene dettagli cristallografici sul nucleo,conoscendo la struttura

base delle basi azotate

2 filamenti lineari legati tra legami covalenti fosfodiesterici

Catene antiparallele 5’ 3’(DOVE si fanno i legami )
Ogni polimerasi sintetizza in direzione 35’,sequenza letta al contrario

Doppia elica destrorsa(oraria),per ogni giro sono compresi 10 nucleotidi

Si formano un solco
-minore
-maggiore
Si legano proteine ai solichi in base a una affinità sferica

-SUPERAVVOLGIMENTO DNA:
Per compattare il dna
Interazioni deboli e lavoro svolt dalle proteine
+ compatto,+robusto(volume ridotto),protetto da elementi fisici(calore) o chimici che lo
danneggiano

DUE TIPI:
-POSITIVO:si avvolge in direzione destrosrsa
-NEGATIVO:nell altra direzione ma lungo lo stesso asse di rotazione -> si realizza nella
trascrizione del dna

ENZIMI TOPOISOMERASI:
Tagliano il dna,modificano lo stato topologico e

1.classe 1:rottura a singola elica,si srotola e di riattacca

2.classe 2:rottura doppia elica
CROMATINA:

COrnberg:il dna è impacchettato con i stoni

Nucleasi: Endonucleasi-tagliano dna
Ottiene frammenti tutti uguali fra loro,in alcune regioni il dna è protetto con delle
proteine,ha trattato con protrasti per togliere proteine e poi ha tagliato il dna
.
ISTONI:proteine basiche
-2H2A,2H2B,2XH3/4
-1 hB1 che stabilizza il nucleosoma

CORE ,un ottamero,Istoni o circondato dal dna:NUCLEOSOMA

Nella fase interfasica

1.ETEROCROMATINA:molto compatta,scura 10%
2.EUCROMATINA:meno condensato 90%-sempre trascritto

ETEROCROMATINA:

COSTITUTIVA
presente in zolle dense,corrisponde in zone che non devono essere trascritte in zone :
-pericentromeriche (nel centromero) e telomariche
-braccio lungo del cromosoma Y(NON POSSSIEDE INFORMAZIONI GENETICHE
FONDAMENTALI)
Sono regioni associate a proteine,si dissoceranno solo durante la duplicazione
Servono a una funzione strutturale,fungono da attacco e proteggono

FACOLTATIVA
Non c e in tutte le cellule degli organismi di quella specie
Regioni che si possono attivare ma una volta formati i tessuti devono essere
silenti(proliferazione cellulare nell embriogenesi)
In attivazione del cromosoma X nelle cellule di sesso femminile,nel corpo di
barr(masserella)

DNA ORAGINZZAZIONE
EPIGENETICA=modo in cui ambiente può influenzare-mo espressione genica,tutte lle
influenze che modificano le altre strutture tranne quella primaria del dna(non intaccata
la struttura)

C-terminali:media la dimerizzazione delle molecole,favorisce la

Zon carbossiterminale:dimerizzazione(ogni dimero dell Istoni)

N-terminale:
Fibre piu spesse 30 nm,gli Istoni vicini si legano fra loro da legami deboli per compattare la fibra.Le
fibre formano delle anse con della coesina

La struttura 3d del genoma si adatta e importante che il dna venga espresso nelle varie fasi

Modifiche epigenetiche dipendono da come il dna viene compattato poiché un gruppo di geni si puo
esprimere tutti in siete

Tad topologically domains,matassa di cromatina del nucleo interfasico non è casuale,tiene a

conservare

CROMATINA
-ASSETTO APLOIDE 3 MILIARDI
-analisi citogenetica:
Osservazione della cellula in METAFASE
44 autosomi+2 cromosomi sessuali-23 coppie

CROMOSOMI
Ogni cromosoma contiene 1 filamento dna(1 cm dna)

Cromosoma in duplicazione(fase s) ha 2 cromatidi

CENTROMERO
strutture non codificanti per legare strutture delle proteine nel CINETOCORE per legare le fibre nel
fuso mitotico

Le fibre del citoscheletro sono legati alle proteine del cinetocore

Gli anticorpi si possono usare dei CENP A per garantire adesione a dna,le proteine del cinetocore si
possono legare in quella zona

Struttura comprende 3 domini strutturali

-dominio di appartamento
-dominio centrale
-cinetocore:piastra interna,zona intermeDIA,PIASTRA ESTERNA E CORONA FIBROSA
INTERNA

Per riconoscere queste strutture

TELOMERI formati da dna non codificanti per legare proteine strutturali,serve a proteggere dalle
esonucleasi che potrebbero danneggiare il dna.
TTAGGG ripetute per 500 volte

STRUTTURA BASE DEL CROMOSOMA:

Con immunofluorescenza:marcato per visualizzare proteine specifiche(con dapi=colorante)

TIPI DI CROMOSOMI
Braccio corto:p(petite)
Braccio lungo:q
IL NUCLEO DELLA CELLULA:

-processata e elaborata l informazione:

-cromatina organizzata in complessi associati TAD(formati da proteine chiamate coesine)
-dna organizzate in strutture ben precise

Di solito il nucleo è soltanto uno:

-di solito arrotondato:cheratinocita(deriva da ectoderma),di cute e annessi cutanei
Osteoblasto(mesoderma)

Filamenti intermedi:fa distinguere un tipo cellulare dall’altro

ECCEZIONI:globuli rossi,emazie,cheratinociti(negli ultimi strati si riducono a

scaglia,perdendo il suo contenuto idrico):non hanno il nucleo
Polimorfonucleato(eritrocita,granulocita neutrofilo)

Megacariocita:precursore delle piastrine,polinucleata.si formano piu cellule che formano

megacariocita e poi verranno frammentate in piastrine

Osteoclasto:polinucleato,derivano dai monociti,non puo dividere,digerisce matrice

Muscolare striata(volontario):piu cellule unite fra loro e nuclei allineati longitudinalmente

fra loro

CHE COS E IL NUCLEO?

Codifica delle proteine
E il centro di controllo
Contiene dna e enzimi e proteine strutturali per far funzionare il dna

ASPETTI STRUTTURALI
Occupa 10 % cellula
Rilevabile al microscopio ottico
Dimensioni 5/20 micron
E rivestito da involucro:2 membrane con doppio strato fosfolipidco (per proteggere e anche
dividere l ambiente acido rispetto al resto della cellula)con spazio all Inter no chiamato
PERINUCLARE
Per attraversare le due membrane is Devon attraversare i pori nucleari che sono il punto di
contratto fra le due membrane

Deve essere stabile e mantenere la sua posizione(attraverso il citoscheletro)

Nell involucro nucleare c e una matrice:nucleoplasma costituita da

Cromatina(dna,proteine Istoni he e non).
Il nucleolo (produzione e assemblaggio dei ribosomi),acidi nucleici e proteine con una zona
meno acida rispetto al nucleo
I nucleotidi disciolti nel nucleoplasma

Altri aggregati:corpi di kajaò,gems e cluster di granuli

Spazio perinucleare 10-50 nm
Involucro formato da 60 proteine distinte che mettono in comunicazione citoscheletro e
nucleo

Membrana
Esterna:in continuità con il RER,ha pochi ribosomi
:cisterne interne in continuità con spazio perinucleare

Membrana interna.
Lamina nucleare(diversa da membrana) formata da proteine fibrose che supportano
invoucro nucleare,hanno proteine fibrose simili a quelle del citoscheletro

Proteine nucleari in contatto con quelle della lamina

LAMINA(forma:garza) e una rete fibrillare

Làmine:proteine fluorescenti fibrose(b foglietti) dei filamenti intermedi,stessa famiglia di
proteine che formano citoscheletro
Supporto per il nucleo

Nucleoscheletro: associa involucro nucleare e citoscheletro,fuori

Link complex:connessioni meccaniche tra citoscheletro r nucleocheletro
Nesprine:famiglia di proteine che sono sulla membrana esterna associata al link
Nesprina 1/2
Nesprina 3

Informazione passa prima dal nucleoscheletro e poi al nucleo

Freezefracture:congelato tessuto e scalfita tessuto nucleare

MECCANO TRASDUZIONENUCLEARE: recepisce cellula stimoli meccanici e li traduce

Trascduzione,cascata che li trasforma in cascata di segnali chimici

Variazioni meccaniche che si traducono al nucleo,puo influenzare traduzione

geni,apoptosi,dice come dividersi

LAMINA NUCLEARE:
LAMINE sono la 5 classe nella famiglia di proteine(stessa funzione)
Sottoclassificata in ulteriori classi
1.cheratine acide:cellule epiteliali
2.proteine acide/basiche
3.tipiche dei connettivi
4.
5.proteine cito plasmatiche che formano involucro nucleare
6.dei neurofilamenti

SI CLASSIFICANO IN QUATTRI DIVERSE LAMINE CON STRUTTURE SIMILI

.-tesa
-coda