Sintesi scienze pag 165-167
In una reazione catalizzata da un enzima, i reagenti prendono il nome di substrati. Le molecole di
substrato (S) si legano a un sito dell'enzima (sito attivo) dove avviene la reazione. Il legame di un
substrato con il sito attivo di un enzima produce il complesso enzima-substrato (ES), che dà origine
al prodotto (P) e rilascia l'enzima. Alla fine della reazione, l'enzima liberato (E) riacquista la stessa
forma chimica che aveva inizialmente:
E+S ES E+P
La specificità di un enzima deriva dalla struttura tridimensionale del suo sito attivo, al quale si
adatta un solo substrato o al massimo una gamma molto ristretta di substrati. È interessante notare
che di norma un enzima catalizza sia una data reazione sia la reazione inversa. Inoltre può anche
prendere parte alla reazione:
E+P E+S
È la cellula che, regolando il proprio metabolismo, fa sì che avvenga la reazione diretta (dal
substrato al prodotto) oppure la reazione inversa (dal prodotto al substrato).
La capacità di attivare reazioni chimiche di alcuni enzimi dipende dall'interazione tra il sito attivo e
il substrato; in altri casi, invece, l'azione di un enzima è legata alla presenza di molecole non
proteiche che possono essere cofattori, coenzimi o gruppi prostetici.
I cofattori sono ioni inorganici come lo zinco, il ferro o il magnesio.
I coenzimi sono composti organici di piccole dimensioni che formano un legame transitorio con
l'enzima.
I gruppi prostetici sono gruppi molecolari di grandi dimensioni legati in modo permanente
all'enzima tramite legami covalenti.
Una caratteristica degli enzimi è che spesso lavorano in serie. Ogni enzima catalizza un singolo
passaggio di una serie ordinata di reazioni che costituisce una via metabolica. Vie metaboliche
diverse svolgono funzioni differenti nella vita di una cellula; per esempio, una via può essere
coinvolta nella demolizione del glucosio, un'altra nella sintesi di ATP e un'altra ancora nella sintesi
di un amminoacido.
Le vie metaboliche seguono tre principi comuni:
1. ogni via metabolica è regolata da enzimi chiave che determinano la velocità con cui avviene il
processo complessivo;
2. ogni fase della reazione è catalizzata da un enzima specifico;
3. le vie metaboliche sono attive in specifici compartimenti, come il citoplasma o l'interno di alcuni
organuli.
Reazioni importanti per la realizzazione del metabolismo sono le ossidoriduzioni o reazioni redox,
in cui uno o più elettroni sono trasferiti da una sostanza a un'altra. La riduzione è una reazione che
prevede l'acquisto di uno o più elettroni da parte di un atomo, di uno ione o di una molecola;
l'ossidazione consiste invece nella cessione di uno o più elettroni. (Riduzione e ossidazione
avvengono sempre insieme). Sebbene l'ossidazione e la riduzione siano un passaggio di elettroni,
nelle reazioni biologiche spesso si fa riferimento all'acquisizione o alla perdita di atomi di idrogeno.
H = H++e-
Nei processi biochimici, una molecola che perde atomi di idrogeno si ossida e una molecola che
acquista atomi di idrogeno si riduce.
Per esempio, nell'ossidazione del glucosio la molecola di zucchero perde atomi di idrogeno e
l'ossigeno li accetta, formando acqua:
C6H12O6 + 6O2 6CO2 + 6 H2O + energia
Nella fotosintesi, invece, gli elettroni passano da una molecola più ossidata a una più ridotta; in
questo caso avranno bisogno di un apporto di energia esterno, fornito dalla luce solare:
6CO2 + 6H2O + energia C6H12O6 + 6O2
Gli enzimi che catalizzano le reazioni redox lavorano spesso in coppia con coenzimi che funzionano
come delle navette, trasportando gli elettroni da una via metabolica a un'altra. Tra tutti, il più
importante è il coenzima NAD, una sigla che sta per nicotinammide adenin dinucleotide, che
lavora insieme a un gruppo di enzimi chiamati deidrogenasi. II NAD si presenta in due forme
chimicamente distinte: la forma ossidata NAD+, con un contenuto energetico inferiore, e la forma
ridotta NADH+H+, più ricca di energia.
