The economical value of betta fish (Betta imbellis) is mostly determined by its body color and si... more The economical value of betta fish (Betta imbellis) is mostly determined by its body color and size. The present study was conducted to evaluate PhGH transmission, mRNA expression level and production performance of the first generation of transgenic betta (F1). Three males and three females of transgenic F0 were mated with nontransgenic to produce F1 generation, and three pairs of non-transgenic betta as control were used. PhGH transgene transmissions were analyzed using PCR method, mRNA expression was analyzed by RT-PCR and production performance was evaluated based on the fertilization level, hatching level, body length and weight. The percentage of F1 transgenic fish carrying PhGH gene was 62.5±5.89%, and mRNA expression varied amongst F1 transgenic fish. Fertilization (FR: 91.7±7.5%) and hatching rates (HR: 91.3±9.4%) of transgenic fish were higher than those of non-transgenic (FR: 70.0±10.0%; HR: 70.8±4.5%). At five-months-old, the mean body weight of males and females of tran...
Transfeksi merupakan salah satu metode transfer gen (transgenesis) yang tepat diaplikasikan pada ... more Transfeksi merupakan salah satu metode transfer gen (transgenesis) yang tepat diaplikasikan pada cupang alam (wild betta), Betta imbellis dikarenakan pemijahannya yang alami dan sulit untuk dilakukan stimulasi. Penelitian yang terkait dengan upaya peningkatan kualitas warna ikan cupang alam ini bertujuan untuk melihat efektivitas metode transfeksi dalam penyisipan gen asing pada zigot B. imbellis. Analisis laboratorium dan proses pemeliharaan ikan dilaksanakan di Balai Penelitian dan Pengembangan Budidaya Ikan Hias serta Balai Penelitian Pemuliaan Ikan, selama enam bulan. Calon induk B. imbellis diseleksi dan dipijahkan dengan perbandingan 1 :1, selanjutnya dilakukan transfeksi pada telur yang telah dibuahi, sebagian kecil diambil untuk isolasi DNA dan di-PCR. Gen asing yang digunakan untuk perlakuan adalah Green Flourenscent Protein (GFP) 1:1 dan 3:1 serta Red Flourescent Protein (RFP) 1:1 dan 3:1 dengan jumlah ulangan masing-masing sebanyak enam kali. Sebagai kontrol, ditambahkan ...
Pertumbuhan ikan dipengaruhi oleh beberapa faktor, diantaranya yaitu seberapa banyak pakan yang d... more Pertumbuhan ikan dipengaruhi oleh beberapa faktor, diantaranya yaitu seberapa banyak pakan yang dapat dimanfaatkan menjadi energi untuk tumbuh.Pakan merupakan salah satu faktor penting dalam budidaya, oleh karena pemberian pakan yang tepat dan efisien dapat meningkatkan produksi dan menekan biaya produksi.Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pertumbuhan dan tingkat konsumsi pakan Tubifex sp. pada ikan cupang Betta imbellis yang berbeda ukuran. Ikan dipelihara dalam satu wadah dengan kepadatan 3 ekor/perlakuan yang dianggap sebagai ulangan individu, yang dibedakan berdasarkan ukuran, yaitu : a) ukuran rata-rata 4,19 cm, b) ukuran rata-rata 3,26 cm, c) ukuran rata-rata 2,54 cm dan d) ukuran rata-rata 2,01 cm. Biota uji diukur panjang dan berat secara individu pada awal dan akhir pemeliharaan..Penelitian dilakukan selama 20 hari.Pemberian pakan dilakukan dengan menghitung jumlah awal pemberian dan menimbang kembali pakan yang tersisa setiap hari. Hasil yang diperoleh selama peneli...
Kabupaten Blitar merupakan sentra produksi koi lokal terbesar di Indonesia. Namun demikian saat i... more Kabupaten Blitar merupakan sentra produksi koi lokal terbesar di Indonesia. Namun demikian saat ini populasi ikan hias koi lokal yang ada telah mengalami penurunan kualitas secara kompleks untuk semua karakter yang disebabkan oleh beberapa faktor. Untuk mencegah terjadinya penurunan berkepanjangan yang akan berakibat merosotnya pangsa pasar, pada ikan hias koi lokal tersebut, dilakukan berbagai upaya untuk meningkatkan kualitas genetiknya, salah satunya melalui program pemuliaan. Langkah awal yang perlu dilakukan adalah mengkarakterisasi stok induk ikan secara genetik dengan mengumpulkan data atau informasi mengenai keragaman genetik beberapa strain yang menjadi sumber induk budidaya di sentra produksi dalam kajian ini adalah Kabupaten Blitar. Informasi keragaman genetik, status genetik (gene pool) dan keunggulan sifat suatu populasi akan menjadi dasar kegiatan dalam melakukan program pemuliaan ikan. Makalah ini menjelaskan keanekaragaman genotip beberapa strain induk ikan hias koi ...
Ikan rainbow (ikan pelangi) merupakan ikan yang cantik dan terkenal dari Indonesia bagian timur t... more Ikan rainbow (ikan pelangi) merupakan ikan yang cantik dan terkenal dari Indonesia bagian timur terutama Papua. Permintaan yang tinggi terutama pasar ekspor dituntut untuk dapat memproduksi dalam jumlah yang besar pula. Produktivitas yang optimal akan menuntut kondisi lingkungan yang optimal. Kondisi media pemeliharaan terutama pH yang amat berpengaruh terhadap perkembangan gonad merupakan faktor yang amat penting untuk diketahui nilai optimalnya. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui pengaruh pH air media dalam perkembangan gonad rainbow untuk memperbaiki atau meningkatkan produksinya. Sebanyak 378 ekor calon induk ikan rainbow Sawiat (Melanotaenia sp.) dipelihara dalam 18 akuarium berukuran 50 cm x 40 cm x 35 cm dengan kepadatan 21 ekor, berukuran bobot rata-rata 1,502 g ± 0,539 (jantan); betina 1,339 g ± 0,298 dan panjang induk jantan rata-rata 5,227 cm ± 0,426; betina 5,160 cm ± 0,332. Calon induk dipelihara dalam 3 perlakuan dan 6 ulangan di hatcheri Loka Riset Budidaya...
THE 2ND SCIENCE AND MATHEMATICS INTERNATIONAL CONFERENCE (SMIC 2020): Transforming Research and Education of Science and Mathematics in the Digital Age
Variant identification of exon 11 of galactosamine (N-acetyl)-6-sulfatase (GALNS) gene in mucopol... more Variant identification of exon 11 of galactosamine (N-acetyl)-6-sulfatase (GALNS) gene in mucopolysaccharidosis type IVA patients in Indonesia
Groupers populations in Indonesia, particularly from Madura Island, East Java are indicated to be... more Groupers populations in Indonesia, particularly from Madura Island, East Java are indicated to be over-fished, thereby requiring data collection of more accurate genetic resources as an important step for grouper conservation. A total of 14 samples of the Epinepheplus groupers were obtained from the fish landing port on Madura Island. The 617 bp CO1 gene sequence was utilized for genetic diversity analysis and phylogenetic tree reconstruction. Genetic diversity is based on the value of haplotype diversity (Hd) and nucleotide diversit y (π). Reconstruction of the phylogenetic tree includes neighbor-joining (NJ) implementing K2P substitution model, while maximum likelihood (ML) is conducted by implementing HKY+G+I substitution model, both of which were evaluated by employing a bootstrap of 1000 replications. Analysis of genetic distance between species indicated that the farthest distance between E. heniochus and E. fasciatus was 0.189, while the closest distance between E. erythrurus and E. ongus was 0.099. Intrapopulation genetic diversity indicated a high value with details of Hd=0.978 and π=0.12107. Furthermore, NJ and ML phylogenetic tree demonstrated similar topology in the observed Epinephelus spp. obtained from Madura Island grouped into 7 clades, that is Epinephelus coioides
Highlight ResearchThe F2 of GH-transgenic B. imbellis was successfully producedThe transgene inhe... more Highlight ResearchThe F2 of GH-transgenic B. imbellis was successfully producedThe transgene inheritance by the F2 fish was more than 90%The growth and body size of transgenic fish was significantly higher than controlF2 fish reached a larger body size in a shorter period compared to the F1 In our previous research, we had successfully produced G0 and G1 Pangasianodon hypophthalmus growth hormone (PhGH) transgenic B. imbellis, native ornamental betta from Indonesia, which its giant-sized variant has valuable price for the breeders. The G0 and G1 transgenic (TG) fish showed higher growth rate and body size compared to the non-transgenic (NT) fish. The study was aimed to produce and evaluate the consistencies of transgene transmission and expression in G2 generation. The growth rate and body size between TG and NT fish was also compared. The G2 generation was produced using crosses between TG and NT G1 fish: ♂TG × ♀TG, ♂TG × ♀NT, ♂NT × ♀TG, and ♂NT ×♀ NT. Fish were reared for 12 weeks...
Cryopreservation techniques have been carried out on many endangered species and animals with uni... more Cryopreservation techniques have been carried out on many endangered species and animals with unique characteristics. Successful cryopreservation techniques vary between species depending on various factors. The study used cryopreserved spermatozoa of the albino Pangasius catfish as samples. The cryopreserved spermatozoa were analyzed by its ultrastructure, functional mitochondria, and viability. The cryopreservation was performed using a combination of 10% methanol, skim milk, and fish ringer extender. A deep freezer is used for cryopreservation at-80 °C with a storage period of 14 days. Observations were made on fresh spermatozoa, post-equilibration spermatozoa, and frozen-thaw spermatozoa. This study found there were differences in ultrastructure and morphology in the three treatments. Fresh spermatozoa and post-equilibration spermatozoa appeared intact membrane, mitochondrial, and flagellar structures. In contrast, in frozen-thaw spermatozoa, there was damage to the cell membrane. The study showed different percentages of yields on functional mitochondria of fresh spermatozoa (98 ± 2%), spermatozoa post-equilibration (57 ± 7%), frozen-thaw spermatozoa (42 ± 3.21%). Cell viability showed that there were differences in viability of fresh spermatozoa and frozen-thaw (p <0.05), the results of fresh spermatozoa (92 ± 0.57%) spermatozoa post-equilibration (80 ± 3.51%), frozen-thaw spermatozoa (61 ± 2.30%).The study concluded that the spermatozoa cryopreservation affects the ultrastructure, mitochondrial function, and viability in albino Pangasius catfish spermatozoa.
Transfection and electroporation method shave a high possibility to apply towards transgenic prod... more Transfection and electroporation method shave a high possibility to apply towards transgenic production of small eggs size fish species. This study aimed to examine the potential of transfection and electroporation methods to use for transferring a foreign gene into betta fish (Betta splendens) embryos using green fluorescent protein (GFP) gene as a model. Fish were spawned naturally in the ratio of male: female was 1:1, then a total of 200 eggs were taken for each treatment. Transfection was performed for 30 minutes (room temperature of about 25 °C) at two-cell stage of embryos using transfast reagent. Transfection reaction consisted of 0.75 µL transfast reagent, 0.25 µL GFP expression vector (DNA concentration: 50 µg/µL) and 99 µL NaCl solution (concentration: 0,95%). Electroporation was performed using 125 volt cm-1, 3 times pulse frequency at one second interval and pulse length of 7 micro seconds. A volume of 800 µL GFP expression vector solution (DNA concentration: 50 µg...
Ikan rainbow Ajamaru (Melanotaenia ajamarunensis) yang dinyatakan punah pada tahun 1996 merupakan... more Ikan rainbow Ajamaru (Melanotaenia ajamarunensis) yang dinyatakan punah pada tahun 1996 merupakan ikan endemik dari Danau Ajamaru, Papua. Namun ikan ini berhasil ditemukan kembali pada tahun 2007 di Sungai Kaliwensi, Sorong, Papua. Domestikasi ex-situ ikan rainbow Ajamaru sedang dilakukan di Balai Riset Budidaya ikan Hias, Depok-Jawa Barat. Penelitian ini bertujuan mengevaluasi perbedaan genotipe ikan rainbow Ajamaru di alam dan budidaya melalui analisis keragaman genetik untuk melihat adanya perubahan genetik, migrasi maupun mutasi gen. Metode yang digunakan adalah Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) dengan 3 jenis primer (OPA 03, OPB 6, dan OPZ 5). Setiap populasi baik, dari alam (Papua) maupun budidaya (Depok dan Papua) masing-masing diambil secara acak sebanyak 10 sampel ikan uji. Hasil penelitian menunjukkan nilai keragaman genetik pada ikan di alam lebih rendah (62,5%) dibanding ikan budidaya di Papua (70,31%) dan tertinggi pada ikan budidaya di Depok (73,43%). Heterozig...
Salah satu jenis ikan cupang alam yang menarik perhatian adalah cupang Betta rubra Perugia, 1893;... more Salah satu jenis ikan cupang alam yang menarik perhatian adalah cupang Betta rubra Perugia, 1893; yang merupakan jenis endemik dari perairan Banda Aceh. Status B. rubra di habitat aslinya sudah mulai sulit diperoleh sedangkan budidayanya belum berkembang. Oleh karena itu, informasi tentang embriogenesis dan perkembangan stadia awal ikan B. rubra sangat diperlukan untuk mendukung keberhasilan pengembangbiakannya. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui embriogenesis dan perkembangan larva ikan B. rubra. Telur dan larva yang digunakan berupa hasil pemijahan alami B. rubra di Balai Riset Budidaya Ikan Hias, Depok. Parameter yang diamati yaitu fase embriogenesis, perkembangan larva, dan benih ikan B. rubra. Pengamatan embriologi di mulai setelah ikan memijah sampai telur menetas, sedangkan perkembangan larva di mulai dari larva menetas sampai menjadi benih atau perkembangan telah sempurna. Pengamatan dilakukan setiap hari di bawah mikroskop binokuler Olympus SZX9 perbesaran 8-25 kali....
Identifikasi spesies menjadi tantangan dalam pengelolaan ikan hias introduksi baik untuk tujuan b... more Identifikasi spesies menjadi tantangan dalam pengelolaan ikan hias introduksi baik untuk tujuan budidaya maupun konservasi. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan identifikasi molekuler ikan hias introduksi yang beredar di pembudidaya dan pasar ikan hias Indonesia dengan menggunakan barcode DNA gen COI. Sampel ikan diperoleh dari pembudidaya dan importir ikan hias di kawasan Bandung dan Jakarta. Total DNA diekstraksi dari jaringan sirip ekor dengan menggunakan metode kolom. Amplifikasi gen target dilakukan dengan menggunakan primer FishF1, FishF2, FishR1, dan FishR2. Hasil pembacaan untai DNA disejajarkan dengan sekuen yang terdapat pada genbank melalui program BLAST. Identifikasi dilakukan melalui kekerabatan pohon filogenetik dan presentasi indeks kesamaan dengan sekuen genbank. Hasil identifikasi menunjukkan sampel yang diuji terbagi menjadi lima grup, yaitu: Synodontis terdiri atas lima spesies, Corydoras: empat spesies, Phseudoplatystoma: tiga spesies, Botia: tiga spesies, da...
Teknik transfer gen banyak dikembangkan untuk mengintroduksi molekul DNA ke dalam embrio. Keberha... more Teknik transfer gen banyak dikembangkan untuk mengintroduksi molekul DNA ke dalam embrio. Keberhasilan transfer gen menggunakan metode transfeksi ditentukan oleh berbagai faktor, antara lain pemilihan larutan transfeksi yang sesuai dengan mempertimbangkan kesediaan secara komersial, mudah diaplikasikan, keberhasilan tinggi, dan tidak bersifat toksik terhadap embrio. Studi awal untuk mengetahui keberhasilan transfer gen terhadap embrio ikan wild betta digunakan Green Fluorescent Protein (GFP) dan juga dapat digunakan sebagai model terhadap ikan betta. GFP merupakan gen yang mengkodekan protein dan memiliki sifat berpendar hijau. Induk jantan dan betina dipijahkan dengan perbandingan 1:1 pada wadah baskom dengan ketinggian air ± 14 cm serta diberikan substrat. Transfeksi dilakukan pada embrio fase pembelahan 2 sel. Larutan transfeksi dibuat dari campuran DNA plasmid pada media NaCl 0.9% hingga mencapai konsentrasi akhir 100 μL media (campuran transfast + DNA + NaCl). Aktivitas gen ini...
Penelitian dilakukan untuk mengidentifikasi keberhasilan introduksi gen penyandi hormon pertumbuh... more Penelitian dilakukan untuk mengidentifikasi keberhasilan introduksi gen penyandi hormon pertumbuhan (Growth Hormone, GH) pada induk F-0 ikan Betta imbellis. Ikan transgenik F-0 dibuat dengan menggunakan metode transfeksi. Identifikasi dilakukan menggunakan metode RT-PCR. RNA total diekstraksi dari embrio pooled sample hasil persilangan induk transgenik dan non-transgenik. Berdasarkan analisis ekspresi gen pada embrio juga menunjukkan adanya aktivitas ekspresi gen GH pada semua perlakuan dibandingkan dengan kontrol (embrio hasil persilangan non-transgenik x non-transgenik). Jumlah individu induk F-0 yang membawa gen GH eksogen berdasarkan analisis PCR dengan DNA template dari sirip ekor adalah sebanyak 16%. Individu positif membawa gen GH eksogen tersebut dibesarkan lebih lanjut untuk memproduksi Betta imbellis transgenik F-1. Kandidat ikan transgenik jantan F-0 dikawinkan dengan ikan non-transgenik betina, sedangkan transgenik F-0 betina dikawinkan dengan non-transgenik jantan. Seba...
Big size betta (Giant) have a high economic value compared to normal size betta, and over express... more Big size betta (Giant) have a high economic value compared to normal size betta, and over expression of growth hormone gene can produce giant fish. As an initial step of giant transgenic betta productions, this study was conducted in order to obtain DNA plasmid concentration which provide higher hatching and survival rate of betta larvae. Construction of PhGH pCcBA gene contains growth hormone gene of Siamese catfish (PhGH) and it is controlled by the CCBA promoter. Betta imbellis broodstocks were spawned naturally, and embryos were collected 1-2 minutes after spawning time. One hundred embryos were dipped in 2 mL of transfectan X-treme gene which containp CcBA-PhGH construction genes (50 µg/mL), on room temperature for about 30 minutes. Treatments on this study were different transfectant : DNA plasmid ratiosnamely:A (0,75 µL: 0,25 µL); B (0,75 µL : 0,50 µL); C (0,75 µL: 0,75 µL), D as Control 1(without transfectant, 0,25 µL DNA); E.as Control 2(0,75 µL transfectant, without DNA)...
Penelitian ini dilakukan untuk menguji pengaruh kondisi lingkungan dengan intensitas cahaya dan w... more Penelitian ini dilakukan untuk menguji pengaruh kondisi lingkungan dengan intensitas cahaya dan warna latar yang berbeda terhadap pertumbuhan dan warna ikan cupang (Betta sp.). Biota uji diberi kombinasi perlakuan perbedaan kondisi cahaya dan warna latar, yaitu: (A-1) 100 lux dan latar putih; (A-2) 100 lux dan latar hitam; (A-3) 100 lux dan latar biru; (B-1) 800 lux dan latar putih; (B-2) 800 lux dan latar hitam; (B-3) 800 lux dan latar biru; (C-1) 1.500 lux dan latar putih; (C-2) 1.500 lux dan latar hitam; dan (C-3) 1.500 Lux dan latar biru. Setiap perlakuan diulang tiga kali. Ikan diberikan pakan berupa larva Chironomus sp. secara ad libitum. Penelitian dilakukan selama 84 hari. Hasil terbaik diperoleh pada perlakuan A-1 (intensitas 100 lux dan latar putih), dengan laju pertumbuhan spesifik panjang dan bobot masing-masing sebesar 0,48 ± 0,06%/hari dan 0,75 ± 0,22%/hari; sintasan sebesar 100%, serta persentase perubahan hue (H), saturation (S), dan brightness (B) berturut-turut ada...
Udang jerbung, Fenneropenaeus merguiensis merupakan salah satu jenis udang penaeid indegenous yan... more Udang jerbung, Fenneropenaeus merguiensis merupakan salah satu jenis udang penaeid indegenous yang memiliki prospek untuk dikembangkan sebagai kandidat budidaya tambak. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman secara morfologi dan jarak genetik udang jerbung dari populasi alam di Selat Sunda, pantai Cilacap, pantai Bengkulu, Selat Lombok, dan pantai Pontianak. Analisis komponen utama (PCA) digunakan untuk mengetahui keragaman morfologi antar populasi alami udang jerbung. Hasil penelitian menunjukkan adanya perbedaan secara morfologi udang jerbung yang diteliti. Populasi Pontianak memiliki keragaman yang paling tinggi dan Bengkulu paling rendah. Dari analisis kluster diperoleh dua kelompok utama yaitu kluster yang pertama terdiri atas Pontianak-Selat Lombok-Bengkulu dan kluster kedua Selat Sunda-Cilacap. Jarak genetik terjauh dimiliki populasi udang jerbung dari Cilacap-Selat Lombok dan terdekat Cilacap-Selat Sunda.Banana prawn, Fenneropenaeus merguiensis, is one of severa...
Tujuan penelitian ini adalah untuk mendapatkan teknik rekayasa penyisipan gen warna pada ikan hia... more Tujuan penelitian ini adalah untuk mendapatkan teknik rekayasa penyisipan gen warna pada ikan hias dan pengetahuan tentang pola pewarisannya yang akan dapat membantu perbaikan mutu ikan. Metode yang diterapkan adalah elektroforasi. Ikan hias yang digunakan dalam penelitian adalah ikan komet (Carassius auratus) sedangkan gen pemendar yang digunakan adalah GFP (green fluorescent protein) dengan konstruksi DNA yang digunakan berbentuk plasmid yang dikontrol oleh promoter b-aktin dari ikan Japanese flounder (ikan sebelah) dengan panjang fragmen pKer-GFP 6,0 kb. Sintasan dan keberadaan gen GFP diamati mulai dari telur menetas. Ekspresi gen dapat diamati setelah fase terbentuknya sirip dan dilakukan secara deskriptif (performa) dan PCR. Hasil yang diperoleh gen GFP terekspresi mulai pembentukan sirip dan hasil cek PCR semua ketiga konsentrasi DNA yang dicobakan mempunyai ekspresi yang sama. Untuk dapat mengetahui ekspresi gen GFP sampai pada F0 masih menunggu ikan dewasa dan matang gonad....
Budidaya udang galah di lahan suboptimal rawa masih mengalami kendala karena tingkat mortalitas y... more Budidaya udang galah di lahan suboptimal rawa masih mengalami kendala karena tingkat mortalitas yang tinggi pada stadia pascalarva terutama saat penebaran awal di media air rawa. Kondisi perairan rawa yang kurang sesuai untuk budidaya udang galah perlu ditingkatkan daya dukungnya terutama yang berhubungan dengan kemampuan osmoregulasi dan metabolisme pascalarva udang galah, salah satunya berupa penambahan mineral kalsium. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan penambahan kadar kalsium terbaik yang dapat menghasilkan sintasan, tingkat kerja osmotik, dan tingkat konsumsi oksigen terbaik pada pascalarva udang galah selama masa adaptasi pergantian media hidup dari media bersalinitas 12 ppt ke media air rawa 0 ppt, selama 10 hari mulai dari udang galah stadia PL1 hingga PL11 dengan penurunan salinitassecara gradual dan persentase volume. Rancangan percobaan yang digunakan yaitu rancangan acak lengkap dengan lima perlakuan penambahan kalsium pada air rawa pengencer salinitas media, yai...
The economical value of betta fish (Betta imbellis) is mostly determined by its body color and si... more The economical value of betta fish (Betta imbellis) is mostly determined by its body color and size. The present study was conducted to evaluate PhGH transmission, mRNA expression level and production performance of the first generation of transgenic betta (F1). Three males and three females of transgenic F0 were mated with nontransgenic to produce F1 generation, and three pairs of non-transgenic betta as control were used. PhGH transgene transmissions were analyzed using PCR method, mRNA expression was analyzed by RT-PCR and production performance was evaluated based on the fertilization level, hatching level, body length and weight. The percentage of F1 transgenic fish carrying PhGH gene was 62.5±5.89%, and mRNA expression varied amongst F1 transgenic fish. Fertilization (FR: 91.7±7.5%) and hatching rates (HR: 91.3±9.4%) of transgenic fish were higher than those of non-transgenic (FR: 70.0±10.0%; HR: 70.8±4.5%). At five-months-old, the mean body weight of males and females of tran...
Transfeksi merupakan salah satu metode transfer gen (transgenesis) yang tepat diaplikasikan pada ... more Transfeksi merupakan salah satu metode transfer gen (transgenesis) yang tepat diaplikasikan pada cupang alam (wild betta), Betta imbellis dikarenakan pemijahannya yang alami dan sulit untuk dilakukan stimulasi. Penelitian yang terkait dengan upaya peningkatan kualitas warna ikan cupang alam ini bertujuan untuk melihat efektivitas metode transfeksi dalam penyisipan gen asing pada zigot B. imbellis. Analisis laboratorium dan proses pemeliharaan ikan dilaksanakan di Balai Penelitian dan Pengembangan Budidaya Ikan Hias serta Balai Penelitian Pemuliaan Ikan, selama enam bulan. Calon induk B. imbellis diseleksi dan dipijahkan dengan perbandingan 1 :1, selanjutnya dilakukan transfeksi pada telur yang telah dibuahi, sebagian kecil diambil untuk isolasi DNA dan di-PCR. Gen asing yang digunakan untuk perlakuan adalah Green Flourenscent Protein (GFP) 1:1 dan 3:1 serta Red Flourescent Protein (RFP) 1:1 dan 3:1 dengan jumlah ulangan masing-masing sebanyak enam kali. Sebagai kontrol, ditambahkan ...
Pertumbuhan ikan dipengaruhi oleh beberapa faktor, diantaranya yaitu seberapa banyak pakan yang d... more Pertumbuhan ikan dipengaruhi oleh beberapa faktor, diantaranya yaitu seberapa banyak pakan yang dapat dimanfaatkan menjadi energi untuk tumbuh.Pakan merupakan salah satu faktor penting dalam budidaya, oleh karena pemberian pakan yang tepat dan efisien dapat meningkatkan produksi dan menekan biaya produksi.Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pertumbuhan dan tingkat konsumsi pakan Tubifex sp. pada ikan cupang Betta imbellis yang berbeda ukuran. Ikan dipelihara dalam satu wadah dengan kepadatan 3 ekor/perlakuan yang dianggap sebagai ulangan individu, yang dibedakan berdasarkan ukuran, yaitu : a) ukuran rata-rata 4,19 cm, b) ukuran rata-rata 3,26 cm, c) ukuran rata-rata 2,54 cm dan d) ukuran rata-rata 2,01 cm. Biota uji diukur panjang dan berat secara individu pada awal dan akhir pemeliharaan..Penelitian dilakukan selama 20 hari.Pemberian pakan dilakukan dengan menghitung jumlah awal pemberian dan menimbang kembali pakan yang tersisa setiap hari. Hasil yang diperoleh selama peneli...
Kabupaten Blitar merupakan sentra produksi koi lokal terbesar di Indonesia. Namun demikian saat i... more Kabupaten Blitar merupakan sentra produksi koi lokal terbesar di Indonesia. Namun demikian saat ini populasi ikan hias koi lokal yang ada telah mengalami penurunan kualitas secara kompleks untuk semua karakter yang disebabkan oleh beberapa faktor. Untuk mencegah terjadinya penurunan berkepanjangan yang akan berakibat merosotnya pangsa pasar, pada ikan hias koi lokal tersebut, dilakukan berbagai upaya untuk meningkatkan kualitas genetiknya, salah satunya melalui program pemuliaan. Langkah awal yang perlu dilakukan adalah mengkarakterisasi stok induk ikan secara genetik dengan mengumpulkan data atau informasi mengenai keragaman genetik beberapa strain yang menjadi sumber induk budidaya di sentra produksi dalam kajian ini adalah Kabupaten Blitar. Informasi keragaman genetik, status genetik (gene pool) dan keunggulan sifat suatu populasi akan menjadi dasar kegiatan dalam melakukan program pemuliaan ikan. Makalah ini menjelaskan keanekaragaman genotip beberapa strain induk ikan hias koi ...
Ikan rainbow (ikan pelangi) merupakan ikan yang cantik dan terkenal dari Indonesia bagian timur t... more Ikan rainbow (ikan pelangi) merupakan ikan yang cantik dan terkenal dari Indonesia bagian timur terutama Papua. Permintaan yang tinggi terutama pasar ekspor dituntut untuk dapat memproduksi dalam jumlah yang besar pula. Produktivitas yang optimal akan menuntut kondisi lingkungan yang optimal. Kondisi media pemeliharaan terutama pH yang amat berpengaruh terhadap perkembangan gonad merupakan faktor yang amat penting untuk diketahui nilai optimalnya. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui pengaruh pH air media dalam perkembangan gonad rainbow untuk memperbaiki atau meningkatkan produksinya. Sebanyak 378 ekor calon induk ikan rainbow Sawiat (Melanotaenia sp.) dipelihara dalam 18 akuarium berukuran 50 cm x 40 cm x 35 cm dengan kepadatan 21 ekor, berukuran bobot rata-rata 1,502 g ± 0,539 (jantan); betina 1,339 g ± 0,298 dan panjang induk jantan rata-rata 5,227 cm ± 0,426; betina 5,160 cm ± 0,332. Calon induk dipelihara dalam 3 perlakuan dan 6 ulangan di hatcheri Loka Riset Budidaya...
THE 2ND SCIENCE AND MATHEMATICS INTERNATIONAL CONFERENCE (SMIC 2020): Transforming Research and Education of Science and Mathematics in the Digital Age
Variant identification of exon 11 of galactosamine (N-acetyl)-6-sulfatase (GALNS) gene in mucopol... more Variant identification of exon 11 of galactosamine (N-acetyl)-6-sulfatase (GALNS) gene in mucopolysaccharidosis type IVA patients in Indonesia
Groupers populations in Indonesia, particularly from Madura Island, East Java are indicated to be... more Groupers populations in Indonesia, particularly from Madura Island, East Java are indicated to be over-fished, thereby requiring data collection of more accurate genetic resources as an important step for grouper conservation. A total of 14 samples of the Epinepheplus groupers were obtained from the fish landing port on Madura Island. The 617 bp CO1 gene sequence was utilized for genetic diversity analysis and phylogenetic tree reconstruction. Genetic diversity is based on the value of haplotype diversity (Hd) and nucleotide diversit y (π). Reconstruction of the phylogenetic tree includes neighbor-joining (NJ) implementing K2P substitution model, while maximum likelihood (ML) is conducted by implementing HKY+G+I substitution model, both of which were evaluated by employing a bootstrap of 1000 replications. Analysis of genetic distance between species indicated that the farthest distance between E. heniochus and E. fasciatus was 0.189, while the closest distance between E. erythrurus and E. ongus was 0.099. Intrapopulation genetic diversity indicated a high value with details of Hd=0.978 and π=0.12107. Furthermore, NJ and ML phylogenetic tree demonstrated similar topology in the observed Epinephelus spp. obtained from Madura Island grouped into 7 clades, that is Epinephelus coioides
Highlight ResearchThe F2 of GH-transgenic B. imbellis was successfully producedThe transgene inhe... more Highlight ResearchThe F2 of GH-transgenic B. imbellis was successfully producedThe transgene inheritance by the F2 fish was more than 90%The growth and body size of transgenic fish was significantly higher than controlF2 fish reached a larger body size in a shorter period compared to the F1 In our previous research, we had successfully produced G0 and G1 Pangasianodon hypophthalmus growth hormone (PhGH) transgenic B. imbellis, native ornamental betta from Indonesia, which its giant-sized variant has valuable price for the breeders. The G0 and G1 transgenic (TG) fish showed higher growth rate and body size compared to the non-transgenic (NT) fish. The study was aimed to produce and evaluate the consistencies of transgene transmission and expression in G2 generation. The growth rate and body size between TG and NT fish was also compared. The G2 generation was produced using crosses between TG and NT G1 fish: ♂TG × ♀TG, ♂TG × ♀NT, ♂NT × ♀TG, and ♂NT ×♀ NT. Fish were reared for 12 weeks...
Cryopreservation techniques have been carried out on many endangered species and animals with uni... more Cryopreservation techniques have been carried out on many endangered species and animals with unique characteristics. Successful cryopreservation techniques vary between species depending on various factors. The study used cryopreserved spermatozoa of the albino Pangasius catfish as samples. The cryopreserved spermatozoa were analyzed by its ultrastructure, functional mitochondria, and viability. The cryopreservation was performed using a combination of 10% methanol, skim milk, and fish ringer extender. A deep freezer is used for cryopreservation at-80 °C with a storage period of 14 days. Observations were made on fresh spermatozoa, post-equilibration spermatozoa, and frozen-thaw spermatozoa. This study found there were differences in ultrastructure and morphology in the three treatments. Fresh spermatozoa and post-equilibration spermatozoa appeared intact membrane, mitochondrial, and flagellar structures. In contrast, in frozen-thaw spermatozoa, there was damage to the cell membrane. The study showed different percentages of yields on functional mitochondria of fresh spermatozoa (98 ± 2%), spermatozoa post-equilibration (57 ± 7%), frozen-thaw spermatozoa (42 ± 3.21%). Cell viability showed that there were differences in viability of fresh spermatozoa and frozen-thaw (p <0.05), the results of fresh spermatozoa (92 ± 0.57%) spermatozoa post-equilibration (80 ± 3.51%), frozen-thaw spermatozoa (61 ± 2.30%).The study concluded that the spermatozoa cryopreservation affects the ultrastructure, mitochondrial function, and viability in albino Pangasius catfish spermatozoa.
Transfection and electroporation method shave a high possibility to apply towards transgenic prod... more Transfection and electroporation method shave a high possibility to apply towards transgenic production of small eggs size fish species. This study aimed to examine the potential of transfection and electroporation methods to use for transferring a foreign gene into betta fish (Betta splendens) embryos using green fluorescent protein (GFP) gene as a model. Fish were spawned naturally in the ratio of male: female was 1:1, then a total of 200 eggs were taken for each treatment. Transfection was performed for 30 minutes (room temperature of about 25 °C) at two-cell stage of embryos using transfast reagent. Transfection reaction consisted of 0.75 µL transfast reagent, 0.25 µL GFP expression vector (DNA concentration: 50 µg/µL) and 99 µL NaCl solution (concentration: 0,95%). Electroporation was performed using 125 volt cm-1, 3 times pulse frequency at one second interval and pulse length of 7 micro seconds. A volume of 800 µL GFP expression vector solution (DNA concentration: 50 µg...
Ikan rainbow Ajamaru (Melanotaenia ajamarunensis) yang dinyatakan punah pada tahun 1996 merupakan... more Ikan rainbow Ajamaru (Melanotaenia ajamarunensis) yang dinyatakan punah pada tahun 1996 merupakan ikan endemik dari Danau Ajamaru, Papua. Namun ikan ini berhasil ditemukan kembali pada tahun 2007 di Sungai Kaliwensi, Sorong, Papua. Domestikasi ex-situ ikan rainbow Ajamaru sedang dilakukan di Balai Riset Budidaya ikan Hias, Depok-Jawa Barat. Penelitian ini bertujuan mengevaluasi perbedaan genotipe ikan rainbow Ajamaru di alam dan budidaya melalui analisis keragaman genetik untuk melihat adanya perubahan genetik, migrasi maupun mutasi gen. Metode yang digunakan adalah Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) dengan 3 jenis primer (OPA 03, OPB 6, dan OPZ 5). Setiap populasi baik, dari alam (Papua) maupun budidaya (Depok dan Papua) masing-masing diambil secara acak sebanyak 10 sampel ikan uji. Hasil penelitian menunjukkan nilai keragaman genetik pada ikan di alam lebih rendah (62,5%) dibanding ikan budidaya di Papua (70,31%) dan tertinggi pada ikan budidaya di Depok (73,43%). Heterozig...
Salah satu jenis ikan cupang alam yang menarik perhatian adalah cupang Betta rubra Perugia, 1893;... more Salah satu jenis ikan cupang alam yang menarik perhatian adalah cupang Betta rubra Perugia, 1893; yang merupakan jenis endemik dari perairan Banda Aceh. Status B. rubra di habitat aslinya sudah mulai sulit diperoleh sedangkan budidayanya belum berkembang. Oleh karena itu, informasi tentang embriogenesis dan perkembangan stadia awal ikan B. rubra sangat diperlukan untuk mendukung keberhasilan pengembangbiakannya. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui embriogenesis dan perkembangan larva ikan B. rubra. Telur dan larva yang digunakan berupa hasil pemijahan alami B. rubra di Balai Riset Budidaya Ikan Hias, Depok. Parameter yang diamati yaitu fase embriogenesis, perkembangan larva, dan benih ikan B. rubra. Pengamatan embriologi di mulai setelah ikan memijah sampai telur menetas, sedangkan perkembangan larva di mulai dari larva menetas sampai menjadi benih atau perkembangan telah sempurna. Pengamatan dilakukan setiap hari di bawah mikroskop binokuler Olympus SZX9 perbesaran 8-25 kali....
Identifikasi spesies menjadi tantangan dalam pengelolaan ikan hias introduksi baik untuk tujuan b... more Identifikasi spesies menjadi tantangan dalam pengelolaan ikan hias introduksi baik untuk tujuan budidaya maupun konservasi. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan identifikasi molekuler ikan hias introduksi yang beredar di pembudidaya dan pasar ikan hias Indonesia dengan menggunakan barcode DNA gen COI. Sampel ikan diperoleh dari pembudidaya dan importir ikan hias di kawasan Bandung dan Jakarta. Total DNA diekstraksi dari jaringan sirip ekor dengan menggunakan metode kolom. Amplifikasi gen target dilakukan dengan menggunakan primer FishF1, FishF2, FishR1, dan FishR2. Hasil pembacaan untai DNA disejajarkan dengan sekuen yang terdapat pada genbank melalui program BLAST. Identifikasi dilakukan melalui kekerabatan pohon filogenetik dan presentasi indeks kesamaan dengan sekuen genbank. Hasil identifikasi menunjukkan sampel yang diuji terbagi menjadi lima grup, yaitu: Synodontis terdiri atas lima spesies, Corydoras: empat spesies, Phseudoplatystoma: tiga spesies, Botia: tiga spesies, da...
Teknik transfer gen banyak dikembangkan untuk mengintroduksi molekul DNA ke dalam embrio. Keberha... more Teknik transfer gen banyak dikembangkan untuk mengintroduksi molekul DNA ke dalam embrio. Keberhasilan transfer gen menggunakan metode transfeksi ditentukan oleh berbagai faktor, antara lain pemilihan larutan transfeksi yang sesuai dengan mempertimbangkan kesediaan secara komersial, mudah diaplikasikan, keberhasilan tinggi, dan tidak bersifat toksik terhadap embrio. Studi awal untuk mengetahui keberhasilan transfer gen terhadap embrio ikan wild betta digunakan Green Fluorescent Protein (GFP) dan juga dapat digunakan sebagai model terhadap ikan betta. GFP merupakan gen yang mengkodekan protein dan memiliki sifat berpendar hijau. Induk jantan dan betina dipijahkan dengan perbandingan 1:1 pada wadah baskom dengan ketinggian air ± 14 cm serta diberikan substrat. Transfeksi dilakukan pada embrio fase pembelahan 2 sel. Larutan transfeksi dibuat dari campuran DNA plasmid pada media NaCl 0.9% hingga mencapai konsentrasi akhir 100 μL media (campuran transfast + DNA + NaCl). Aktivitas gen ini...
Penelitian dilakukan untuk mengidentifikasi keberhasilan introduksi gen penyandi hormon pertumbuh... more Penelitian dilakukan untuk mengidentifikasi keberhasilan introduksi gen penyandi hormon pertumbuhan (Growth Hormone, GH) pada induk F-0 ikan Betta imbellis. Ikan transgenik F-0 dibuat dengan menggunakan metode transfeksi. Identifikasi dilakukan menggunakan metode RT-PCR. RNA total diekstraksi dari embrio pooled sample hasil persilangan induk transgenik dan non-transgenik. Berdasarkan analisis ekspresi gen pada embrio juga menunjukkan adanya aktivitas ekspresi gen GH pada semua perlakuan dibandingkan dengan kontrol (embrio hasil persilangan non-transgenik x non-transgenik). Jumlah individu induk F-0 yang membawa gen GH eksogen berdasarkan analisis PCR dengan DNA template dari sirip ekor adalah sebanyak 16%. Individu positif membawa gen GH eksogen tersebut dibesarkan lebih lanjut untuk memproduksi Betta imbellis transgenik F-1. Kandidat ikan transgenik jantan F-0 dikawinkan dengan ikan non-transgenik betina, sedangkan transgenik F-0 betina dikawinkan dengan non-transgenik jantan. Seba...
Big size betta (Giant) have a high economic value compared to normal size betta, and over express... more Big size betta (Giant) have a high economic value compared to normal size betta, and over expression of growth hormone gene can produce giant fish. As an initial step of giant transgenic betta productions, this study was conducted in order to obtain DNA plasmid concentration which provide higher hatching and survival rate of betta larvae. Construction of PhGH pCcBA gene contains growth hormone gene of Siamese catfish (PhGH) and it is controlled by the CCBA promoter. Betta imbellis broodstocks were spawned naturally, and embryos were collected 1-2 minutes after spawning time. One hundred embryos were dipped in 2 mL of transfectan X-treme gene which containp CcBA-PhGH construction genes (50 µg/mL), on room temperature for about 30 minutes. Treatments on this study were different transfectant : DNA plasmid ratiosnamely:A (0,75 µL: 0,25 µL); B (0,75 µL : 0,50 µL); C (0,75 µL: 0,75 µL), D as Control 1(without transfectant, 0,25 µL DNA); E.as Control 2(0,75 µL transfectant, without DNA)...
Penelitian ini dilakukan untuk menguji pengaruh kondisi lingkungan dengan intensitas cahaya dan w... more Penelitian ini dilakukan untuk menguji pengaruh kondisi lingkungan dengan intensitas cahaya dan warna latar yang berbeda terhadap pertumbuhan dan warna ikan cupang (Betta sp.). Biota uji diberi kombinasi perlakuan perbedaan kondisi cahaya dan warna latar, yaitu: (A-1) 100 lux dan latar putih; (A-2) 100 lux dan latar hitam; (A-3) 100 lux dan latar biru; (B-1) 800 lux dan latar putih; (B-2) 800 lux dan latar hitam; (B-3) 800 lux dan latar biru; (C-1) 1.500 lux dan latar putih; (C-2) 1.500 lux dan latar hitam; dan (C-3) 1.500 Lux dan latar biru. Setiap perlakuan diulang tiga kali. Ikan diberikan pakan berupa larva Chironomus sp. secara ad libitum. Penelitian dilakukan selama 84 hari. Hasil terbaik diperoleh pada perlakuan A-1 (intensitas 100 lux dan latar putih), dengan laju pertumbuhan spesifik panjang dan bobot masing-masing sebesar 0,48 ± 0,06%/hari dan 0,75 ± 0,22%/hari; sintasan sebesar 100%, serta persentase perubahan hue (H), saturation (S), dan brightness (B) berturut-turut ada...
Udang jerbung, Fenneropenaeus merguiensis merupakan salah satu jenis udang penaeid indegenous yan... more Udang jerbung, Fenneropenaeus merguiensis merupakan salah satu jenis udang penaeid indegenous yang memiliki prospek untuk dikembangkan sebagai kandidat budidaya tambak. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman secara morfologi dan jarak genetik udang jerbung dari populasi alam di Selat Sunda, pantai Cilacap, pantai Bengkulu, Selat Lombok, dan pantai Pontianak. Analisis komponen utama (PCA) digunakan untuk mengetahui keragaman morfologi antar populasi alami udang jerbung. Hasil penelitian menunjukkan adanya perbedaan secara morfologi udang jerbung yang diteliti. Populasi Pontianak memiliki keragaman yang paling tinggi dan Bengkulu paling rendah. Dari analisis kluster diperoleh dua kelompok utama yaitu kluster yang pertama terdiri atas Pontianak-Selat Lombok-Bengkulu dan kluster kedua Selat Sunda-Cilacap. Jarak genetik terjauh dimiliki populasi udang jerbung dari Cilacap-Selat Lombok dan terdekat Cilacap-Selat Sunda.Banana prawn, Fenneropenaeus merguiensis, is one of severa...
Tujuan penelitian ini adalah untuk mendapatkan teknik rekayasa penyisipan gen warna pada ikan hia... more Tujuan penelitian ini adalah untuk mendapatkan teknik rekayasa penyisipan gen warna pada ikan hias dan pengetahuan tentang pola pewarisannya yang akan dapat membantu perbaikan mutu ikan. Metode yang diterapkan adalah elektroforasi. Ikan hias yang digunakan dalam penelitian adalah ikan komet (Carassius auratus) sedangkan gen pemendar yang digunakan adalah GFP (green fluorescent protein) dengan konstruksi DNA yang digunakan berbentuk plasmid yang dikontrol oleh promoter b-aktin dari ikan Japanese flounder (ikan sebelah) dengan panjang fragmen pKer-GFP 6,0 kb. Sintasan dan keberadaan gen GFP diamati mulai dari telur menetas. Ekspresi gen dapat diamati setelah fase terbentuknya sirip dan dilakukan secara deskriptif (performa) dan PCR. Hasil yang diperoleh gen GFP terekspresi mulai pembentukan sirip dan hasil cek PCR semua ketiga konsentrasi DNA yang dicobakan mempunyai ekspresi yang sama. Untuk dapat mengetahui ekspresi gen GFP sampai pada F0 masih menunggu ikan dewasa dan matang gonad....
Budidaya udang galah di lahan suboptimal rawa masih mengalami kendala karena tingkat mortalitas y... more Budidaya udang galah di lahan suboptimal rawa masih mengalami kendala karena tingkat mortalitas yang tinggi pada stadia pascalarva terutama saat penebaran awal di media air rawa. Kondisi perairan rawa yang kurang sesuai untuk budidaya udang galah perlu ditingkatkan daya dukungnya terutama yang berhubungan dengan kemampuan osmoregulasi dan metabolisme pascalarva udang galah, salah satunya berupa penambahan mineral kalsium. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan penambahan kadar kalsium terbaik yang dapat menghasilkan sintasan, tingkat kerja osmotik, dan tingkat konsumsi oksigen terbaik pada pascalarva udang galah selama masa adaptasi pergantian media hidup dari media bersalinitas 12 ppt ke media air rawa 0 ppt, selama 10 hari mulai dari udang galah stadia PL1 hingga PL11 dengan penurunan salinitassecara gradual dan persentase volume. Rancangan percobaan yang digunakan yaitu rancangan acak lengkap dengan lima perlakuan penambahan kalsium pada air rawa pengencer salinitas media, yai...
Uploads
Papers by eni kusrini