Papers by Fernando Trujillo

Biological Conservation, Mar 1, 2016
Abstract Rivers worldwide, particularly in tropical regions, support multiple human uses that can... more Abstract Rivers worldwide, particularly in tropical regions, support multiple human uses that can threaten water security and cause species decline. Some tropical rivers are home to obligate freshwater cetaceans (river dolphins) that are vulnerable to exploitation and to upstream and downstream habitat degradation due to limited dispersal opportunities. Assessing vulnerability is complicated by difficulty in reliably estimating abundance, due to the animals' cryptic nature and complex, dynamic habitat. We compared density estimates from surveys conducted in 1993, 2002 and 2007. Surveys were not part of a coordinated monitoring plan and thus were conducted using slightly different methods in different months, which complicated statistical inference. We used information from the most recent survey to account for bias and uncertainty in earlier estimates and used bootstrap and Bayesian approaches to estimate trends, conditional on a plausible range of process variance associated with seasonal movements. For Inia , probability of decline was > 0.75, even under the highest seasonal movement levels considered. For Sotalia , there was a > 0.75 probability of population increase. There are 151 proposals pending in the Amazon for large (> 2 MW) hydroelectric developments that would fragment habitat, and reports suggest that Inia is experiencing illegal killing for fish bait. In this context, our population trend estimates are cause for concern, but improved monitoring is needed to more reliably assess population status. Based on lessons learned from our analysis, future surveys will be standardized in terms of timing (conducted during the transitional water season) and methodology (using our most recent field protocols) to minimize confounding factors and provide more robust inference about population trends. We provide recommendations for ways to distinguish seasonal movements from annual population trends to guide Amazon river dolphin conservation. Until then, two interpretations exist: either Inia is declining, or existing information cannot detect declines unambiguously without additional surveys. Neither explanation bodes well, given the myriad anthropogenic stressors Amazon river dolphins face.

DOAJ (DOAJ: Directory of Open Access Journals), Sep 1, 2018
regiones biogeográficas y es poco conocida. Por lo tanto se emplearon técnicas de fototrampeo par... more regiones biogeográficas y es poco conocida. Por lo tanto se emplearon técnicas de fototrampeo para el registro de los mamíferos medianos y grandes asociados al bosque ribereño en la cuenca alta y media del río Bita, Vichada, Colombia. Se estimó la diversidad, el índice de abundancia relativa y los patrones de actividad. Se instalaron 77 cámaras trampa a lo largo de 200 km del río en dos periodos hidroclimáticos (baja y alta precipitación). Se obtuvieron en total 16439 imágenes, con un esfuerzo de muestreo de 7700 días-trampa. Se registraron 24 especies de mamíferos, agrupados en 17 familias y 9 órdenes. El índice de diversidad de Shannon-Wiener obtenido a través de este método fue H´= 1,995, las especies mejor representadas a través del índice de abundancia relativa fueron Tayassu pecari (IAR = 0,176, n = 1360), Cuniculus paca (IAR = 0,174, n = 1346), Tapirus terrestris (IAR = 0,144, n = 1114) y Dasyprocta fuliginosa (IAR = 0,116, n=900). En términos de patrones de actividad Dasyprocta fuliginosa presentó patrones de actividad diurnos, Leopardus pardalis catemeral, Tayassu pecari crepuscular matutino, Cuniculus paca y Didelphis marsupialis nocturna y Tapirus terrestris crepuscular vespertino. Esta información puede ser de utilidad para la generación de programas para el manejo y conservación de la mastofauna en la cuenca del río Bita.

Momentos de Ciencia, 2015
Los depredadores tope como delfines de rio, nutrias y grandes bagres, son considerados buenos bio... more Los depredadores tope como delfines de rio, nutrias y grandes bagres, son considerados buenos bioindicadores para medir el estado de salud de las cuencas hidrograficas donde se distribuyen. En la actualidad estan siendo empleados para evaluar la presencia y concentracion de contaminantes al interior de la dinamica trofica en los ecosistemas acuaticos de la Amazonia y Orinoquia. En estas ecorregiones historicamente se han desarrollado fuertes procesos intervencion a escala de cuenca, actividades extractivas como la mineria aurifera y deforestacion por implementacion de actividades agropecuarias y comercializacion de madera, han liberado de forma artificial o natural grandes cantidades de este metal a los cuerpos de agua. Se evaluo de forma preliminar el proceso de biomagnificacion del Mercurio total (Hg) en las redes troficas acuaticas para los rio Amazonas y Orinoco (Colombia), a traves de la determinacion de la concentracion de Mercurio total (Hg) en tejido de muestras obtenidas de dos individuos varados, el primer especimen correspondio a un adulto de Inia humboltiana ubicado en el rio Arauca que registro 3,51 mg.kg-1 Hg y la segunda muestra correspondio a un neonato, encontrado en la localidad de Puerto Narino (Amazonas) registrando 0,16 mg.kg-1 Hg. Los valores obtenidos, presentaron niveles de Mercurio total (Hg) por encima de la normatividad nacional y lo establecido por la organizacion mundial de la salud (OMS), infiriendo de forma preliminar la existencia de procesos de biomagnificacion de Mercurio total (Hg) en las redes troficas para los sistemas hidricos de la Amazonia y Orinoquia.

Momentos de Ciencia, 2015
En esta investigación, se caracterizaron las relaciones cultura-naturaleza que establecen los pes... more En esta investigación, se caracterizaron las relaciones cultura-naturaleza que establecen los pescadores y comunidades ribereñas situadas en las zonas de influencia de los ríos Orinoco, Meta y Bita en el municipio de Puerto Carreño, Vichada, con el delfín rosado (Inia geoffrensis); para ello, se aplicaron metodologías de investigación cualitativa y etnografía, en el marco de la conservación biocultural y la etnoecología y se establecieron escenarios participativos de enseñanza aprendizaje en las comunidades educativas de las áreas anteriormente mencionadas. A partir de ello, se determinaron prácticas de uso, percepciones locales y potenciales amenazas para la especie en la región, lo que permitió identificar como prioritario el diseño e implementación de estrategias y propuestas educativas y participativas contextualizadas, que incorporen dichos elementos y contribuyan a la conservación de la especie, desde el hacer y saber local. Palabras claves: Conservación biocultural, relaciones cultura-naturaleza, delfín rosado, investigación cualitativa y etnoecología.

Momentos de Ciencia, 2015
En Colombia desde el año 2005, se ha venido implementado el programa de estimación poblacional pa... more En Colombia desde el año 2005, se ha venido implementado el programa de estimación poblacional para las especies de delfines de río de los géneros Inia y Sotalia en las cuencas de los ríos Amazonas y Orinoco. Se presentan estimaciones de densidad, tamaño de grupo y población para Inia geoffrensis geoffrensis, Inia geoffrensis humboldltiana y Sotalia fluviatilis en cinco diferentes tipos de hábitat (río principal, confluencia, canales, lagos e islas) en diferentes ecosistemas acuáticos asociados a las cuencas de los ríos Amazonas y Orinoco. Se logró establecer que tipos de hábitats como confluencias y lagos fueron los lugares donde se registraron los mayores valores para la densidad de las especies I. g. humboldtiana, I. g. geoffrensis y S. fluviatilis. Algunas de las confluencias más importantes (hot spots) identificadas para los delfines de río durante la investigación, han sido propuestas como áreas prioritarias para la conservación de la biodiversidad en la cuenca debido a que la presencia de los delfines constituye una valiosa herramienta al ser empleados como especies sombrilla en las diferentes iniciativas de conservación a escala regional como el río Bita en la cuenca del Orinoco y los sistemas lagunares de Tarapoto en el Amazonas en proceso de designación de área RAMSAR. El tamaño poblacional y densidad para los delfines de río en cada tipo de hábitat se ven afectados por tensores ambientales de origen antrópico y las variables ecohidráhulicas presentes en los sistemas acuáticos evaluados.

Momentos de Ciencia, 2015
M a n t i l l a -M e l u k , F e r n a n d o 2 Trujillo y Federico Mosquera-2 Guerra* Aunque los ... more M a n t i l l a -M e l u k , F e r n a n d o 2 Trujillo y Federico Mosquera-2 Guerra* Aunque los delfines rosados son mamíferos acuáticos obligados, variables ambientales atmosféricas asociadas a las cuencas de los ríos que habitan, como la precipitación y la temperatura, se constituyen en determinantes de su ecología, afectando directamente su ocurrencia en un área particular. Para Colombia, se reconocen dos subespecies de Inia geoffrensis, distribuidas en las cuencas del Orinoco (Inia geoffrensis humboldtiana) y Amazonas (Inia geoffrensis geoffrensis). Accidentes geomorfológicos como los rápidos, se han sugerido como barreras que separan las poblaciones naturales de delfines, promoviendo potencialmente procesos de especiación que pueden estar siendo reforzados por ecologías contrastantes entre cuencas. A la fecha, no se cuenta con un análisis comprensivo sobre la diferenciación ecológica entre las cuencas habitadas por las subespecies de Inia geoffrensis. En este trabajo, a través de herramientas de modelamiento de nicho, investigamos la potencial diferenciación ecológica entre las dos subespecies de Inia para el territorio colombiano. Los modelos aquí presentados fueron construidos usando el algoritmo MaxEnt a través de la integración de 8435 avistamientos de delfines (I. g. geoffrensis N= 3592 y I. g. humboldtiana N= 4843), y 22 variables ambientales derivadas de la base de datos Bioclim e Hydroshed, que fueron parametrizadas en el programa R. Las áreas con alta disponibilidad para los delfines rosados, realizadas por nuestros modelos, fueron congruentes con la distribución previa propuesta para las dos subespecies en Colombia y estuvieron fuertemente soportadas por la métrica del área bajo la curva (AUC 0,985). Nuestros resultados sugieren una diferenciación ecológica entre las cuencas ocupadas por las subespecies de delfines rosados. En globalidad, concluimos que factores externos al ambiente acuático, tienen participación en la diferenciación ecológica entre las subespecies de I. geoffrensis.
Universidad Nacional Abierta y a Distancia, UNAD eBooks, May 1, 2021
Biodiversidad y Sistemas Productivos en la Cuenca Media y Baja del Río Cravo Sur marsupiales y mu... more Biodiversidad y Sistemas Productivos en la Cuenca Media y Baja del Río Cravo Sur marsupiales y musarañas), acuáticos (nutrias, manatíes y delfines de río) y voladores (murciélagos) (Mosquera-Guerra et al., 2019). En la actualidad, se ha evidenciado un creciente interés en generar conocimiento científico acerca de la ecología y diversidad de las especies de mamíferos, asociados a los ecosistemas de la Orinoquía colombiana, reflejada en diferentes publicaciones en los departamentos que la conforman.

Conservation Science and Practice
The Amazon Basin features a vast network of healthy, free‐flowing rivers, which provides habitat ... more The Amazon Basin features a vast network of healthy, free‐flowing rivers, which provides habitat for the most biodiverse freshwater fauna of any basin globally. However, existing and future infrastructure developments, including dams, threaten its integrity by diminishing river connectivity, altering flows, or changing sediment regimes, which can impact freshwater species. In this study, we assess critical rivers that need to be maintained as freshwater connectivity corridors (FCCs) for selective freshwater species—long‐distance migratory fishes and turtles (both with migrations >500 km) and river dolphins. We define FCCs as river stretches of uninterrupted river connectivity that provide important riverine and floodplain habitat for long‐distance migratory and other species and that maintain associated ecosystem functions. We assessed more than 340,000 km of river, beginning with an assessment of the connectivity status of all rivers and then combining river status with models o...
Landscape Ecology
used by I. geoffrensis as reported in the literature as follows: (1) main river, (2) confluences,... more used by I. geoffrensis as reported in the literature as follows: (1) main river, (2) confluences, (3) tributaries, (4) channels, (5) islands, (6) bays, and (7) lagoons. We combined this dataset with GPS location data obtained from 17 tagged Amazon River dolphins to quantify the proportion of habitat types used. We used kernel density estimate (KDE) analysis to identify both areas used (K 95) and core areas (K 50) in the habitat types for the satellite-monitored individuals. Results Satellite tracking of I. geoffrensis individuals reported 16,098 locations classified into seven habitat types. For the analyzed period (rising waters) main habitat types used were as follow: (1) main river (n = 9144, 57%); (2) confluences (n = 932, 6%); (3) tributaries (n = 1423, 9%); (4) channels (n = 1597,

The Action Plan for South American River Dolphins 2010 – 2020, 2010
In the early eighties a great concern about the future of river dolphins led the Cetacean Special... more In the early eighties a great concern about the future of river dolphins led the Cetacean Specialist Group of the IUCN Species Survival Commission to concentrate their efforts on strategy to deal with those concerns. In 1986, the Workshop on Biology and Conservation of the Platanistoid Dolphins was the first step to asses issues related with threats and recommendations for the survival of river dolphins in the entire world (Perrin et al. 1989). This meeting encouraged some researchers in South America to start long term river projects related to river dolphins, especially in Brazil and Colombia. For almost ten years some important contributions about the distribution, biology and identification of threats were made. During these years some documents were published. These documents were and are currently the lead information to all researchers involved in research, conservation and educational projects. These documents are the 1994-1998 Action Plan for the Conservation of Cetaceans (Reeves & Leatherwood 1994), International Whaling Commission Scientific Committee Report 2000, and the 2002-2010 Conservation Action Plan the World’s Cetaceans (Reeves et al. 2003).Fil: Trujillo, Fernando. Fundación Omacha; ColombiaFil: Crespo, Enrique Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Nacional Patagónico; ArgentinaFil: Van Damme, Paul. No especifíca;Fil: Usma, Saulo. World Wide Fund For Nature; Estados UnidosFil: Morales-Betancourt, Diana. No especifíca;Fil: Wood, Alison. Whale and Dolphin Conservation Society; Reino UnidoFil: Portocarrero, Marcela. Fundación Omacha; Colombi

Frontiers in Marine Science, 2021
In many regions of the world, the use of cetaceans as bait or protein source has been reported. I... more In many regions of the world, the use of cetaceans as bait or protein source has been reported. In most cases the individuals are from bycatch but also from intentionally killed animals. Cetaceans with coastal habits are more susceptible to negative interactions with small-scale fisheries, as in the case of the Guiana dolphin (Sotalia guianensis) in the Lake Maracaibo system. For decades, the use of Guiana dolphins by local communities has been reported in this region and is culturally supported by recipes for its preparation. Most of these data was outdated and some were anecdotal, so the objective of this work was to collect systematically data through surveys using the snowball method in seven artisanal fishing communities and to try to quantify the capture rate and to inquire about the potential impact of this practice on the population of Guiana dolphin. From 2017 to 2019, 95 semi-structured interviews were applied. An average bycatch of 180 individuals/year was obtained, the h...

Los depredadores tope como delfines de rio, nutrias y grandes bagres, son considerados buenos bio... more Los depredadores tope como delfines de rio, nutrias y grandes bagres, son considerados buenos bioindicadores para medir el estado de salud de las cuencas hidrograficas donde se distribuyen. En la actualidad estan siendo empleados para evaluar la presencia y concentracion de contaminantes al interior de la dinamica trofica en los ecosistemas acuaticos de la Amazonia y Orinoquia. En estas ecorregiones historicamente se han desarrollado fuertes procesos intervencion a escala de cuenca, actividades extractivas como la mineria aurifera y deforestacion por implementacion de actividades agropecuarias y comercializacion de madera, han liberado de forma artificial o natural grandes cantidades de este metal a los cuerpos de agua. Se evaluo de forma preliminar el proceso de biomagnificacion del Mercurio total (Hg) en las redes troficas acuaticas para los rio Amazonas y Orinoco (Colombia), a traves de la determinacion de la concentracion de Mercurio total (Hg) en tejido de muestras obtenidas de...

Investigadores de la Fundacion Omacha, Universidades Quindio, Tolima, Amazonia y Parques Nacional... more Investigadores de la Fundacion Omacha, Universidades Quindio, Tolima, Amazonia y Parques Nacionales Naturales, realizaron entre los dias 3 al 11 de julio, la expedicion al rio Caqueta y tributarios como: Yari, Miriti, Meta, Cahunari y canos Solarte y San Francisco. Los objetivos de la investigacion fue realizar la estimacion de densidades y tamano poblacional para los delfines de rio Inia geoffrensis y Sotalia fluviatilis en la cuenca media del rio Caqueta en los tipos de habitat Rio Principal, Confluencias, Canal e Isla. Se caracterizaron las principales amenazas para su conservacion identificando a la mineria ilegal, deforestacion y uso de redes de pesca como los principales tensores para la conservacion de estas especies. Se evaluo un tramo 625 km-1 comprendidos entre las localidades de Araracuara (Caqueta) y La Pedrera (Amazonas) en Colombia, registrando 126 observaciones en ambas plataformas (I geoffrensis: 99 (78,5%); S fluviatilis: 27 (21,5%), contabilizando 242 individuos (I...

Journal of Heredity, Sep 25, 2018
Coastal and freshwater cetaceans are particularly vulnerable due to their proximity to human acti... more Coastal and freshwater cetaceans are particularly vulnerable due to their proximity to human activity, localized distributions, and small home ranges. These species include Sotalia guianensis, found in the Atlantic and Caribbean coastal areas of central and South America, and Sotalia fluviatilis, distributed in the Amazon River and tributaries. We investigated the population structure and genetic diversity of these 2 species by analyses of mtDNA control region and 8-10 microsatellite loci. MtDNA analyses revealed strong regional structuring for S. guianensis (i.e., Colombian Caribbean vs. Brazilian Coast, F ST = 0.807, Φ ST = 0.878, P < 0.001) especially north and south of the Amazon River mouth. For S. fluviatilis, population structuring was detected between the western and eastern Amazon (i.e., Colombian Amazon vs. Brazilian Amazon, F ST = 0.085, Φ ST = 0.277, P < 0.001). Haplotype and nucleotide diversity were higher for S. fluviatilis. Population differentiation was supported by analysis of the microsatellite loci (S. guianensis, northern South America vs. southern South America F ST = 0.275, Jost's D = 0.476, P < 0.001; S. fluviatilis, western and eastern Amazon F ST = 0.197, Jost's D = 0.364, P < 0.001). Most estimated migration rates in both species overlapped with zero, suggesting no measurable migration between most of the sampling locations. However, for S. guianensis, there was measurable migration in neighboring sampling locations. These results indicate that the small home ranges of these species may act to restrict gene flow between populations separated by relatively short distances, increasing the risk of extirpation of some localized populations in the future if existing threats are not minimized.

Biota Colombiana, Sep 15, 2019
We describe the diversity of medium and large mammals from an area in the Colombian Orinoco River... more We describe the diversity of medium and large mammals from an area in the Colombian Orinoco River basin. For three years we systematically used camera traps at 72 sampling stations and walked forest and savanna transects to determine the diversity of medium and large mammals. Relative abundance was documented for 29 native and 2 feral mammals from a sampling effort of 1789 camera-days and 469.5 km walked. Thirty-one species of mammals (9 orders, 19 families) were recorded. Threatened species recorded included the giant armadillo (Priodontes maximus), lowland tapir (Tapirus terrestris), white-lipped peccary (Tayassu pecari), and giant anteater (Myrmecophaga tridactyla). The most abundant species were the collared peccary (Pecari tajacu) and the common opossum (Didelphis marsupialis). We recorded rare species, including the bush dog (Speothos venaticus) and the Llano semi-endemic long-nosed armadillo (Dasypus sabanicola). The species documented face diverse pressures, including development, hunting for subsistence, and competition with invasive species and livestock. Our results suggest that the surveyed areas are important for the conservation of mammals in the eastern plains of Colombia.
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Papers by Fernando Trujillo