Books by Nikita Khromov-Borisov
Objectives: This study aimed at evaluating the agreement between bioelectrical impedance analysis... more Objectives: This study aimed at evaluating the agreement between bioelectrical impedance analysis (BIA) using ABC-02 Medas and A-mode ultrasound (AUS) using BodyMetrix™ BX2000 for fat mass (FM), fat free mass (FFM), and body fat percentage (%BF) in females. Methods: The cross-sectional, single-center, observational study was performed in 206 female subjects aged 18-67 years. The examination program included measurements of body height and weight along with waist, hip circumferences, and body composition analysis. The measurements were performed by ultrasound scanner and bioimpedance analyzer. Results: We found that 20.9% of women were obese based on BMI (≥30 kg/m 2), which was significantly lower when using a criterion based on body fat percentage (%BF ≥ 30%) measured with US (53.4%, p = .0056) or BIA (54.8%, p = .0051). At the group level, both methods were found interchangeable and showed practically negligible differences (0.1% for %BF, 0.5 kg for FM, and 0.4 kg for FFM). Agreement analysis conducted in the whole sample revealed a low level of agreement in estimating %BF (CCC = 0.72 0.77 0.82) and FFM (CCC = 0.81 0.84 0.86), and medium level of agreement in estimating FM (CCC = 0.91 0.93 0.94). The level of agreement in estimating %BF and FFM was improved to the medium level with the use of newly generated prediction equations. Conclusion: Thus, the proposed equations can be used for conversion of body composition results obtained by AUS into the BIA data. 1 | INTRODUCTION Body composition analysis is a routine practice in the medical science and used in muscle mass evaluation in the groups of elderly or critically ill subjects and also in the risk assessment of the obesity-related diseases and sarcopenia (Heymsfield et al., 2005). It is also widely used in the epidemiological studies of obesity prevalence, or in the field of the biological anthropology (Kasper et al., 2021; Price & Earthman, 2019). Quantitative analysis of body composition is commonly used in sports including selection procedures of athletes onto
Клиническая психофармакогенетика, 2020
Статистико-методологические аспекты геномики
Клиническая психофармакогенетика, 2020
Номенклатура вариантов последовательностей ДНК, РНК и белков
Международные рекомендации по их опи... more Номенклатура вариантов последовательностей ДНК, РНК и белков
Международные рекомендации по их описанию
Вопреки заявлениям В.Х. Хавинсона и др. и рекламе в СМИ нет убедительных экспериментальных доказа... more Вопреки заявлениям В.Х. Хавинсона и др. и рекламе в СМИ нет убедительных экспериментальных доказательств геропротекторной активности пептидов Хавинсона.
Contrary to V.K. Khavinson et al. and advertising in the media there is no convincing experimental evidence of the geroprotective activity of the Khavinson peptides.
(2017): Comparative efficacy evaluation of catheter intraperitoneal chemotherapy, normothermic an... more (2017): Comparative efficacy evaluation of catheter intraperitoneal chemotherapy, normothermic and hyperthermic chemoperfusion in a rat model of ascitic ovarian cancer,
Отзыв об автореферате диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Федото... more Отзыв об автореферате диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Федотовской Ольгой Николаевной по специальностям 14.03.11 -Восстановительная медицина, спортивная медицина, лечебная физкультура, курортология и физиотерапия и 03.02.07 -Генетика на тему: «Ассоциация полиморфизмов генов AMPD1, CKMM, G6PC2 и MCT1 человека с мышечной деятельностью различной метаболической направленности» Можно придраться уже к заголовку работы: словосочетание «мышечная деятельность различной метаболической направленности» представляется ненаучным и некорректным.
Отзыв об автореферате диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Федото... more Отзыв об автореферате диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Федотовской Ольгой Николаевной по специальностям 14.03.11 -Восстановительная медицина, спортивная медицина, лечебная физкультура, курортология и физиотерапия и 03.02.07 -Генетика на тему: «Ассоциация полиморфизмов генов AMPD1, CKMM, G6PC2 и MCT1 человека с мышечной деятельностью различной метаболической направленности» Можно придраться уже к заголовку работы: словосочетание «мышечная деятельность различной метаболической направленности» представляется ненаучным и некорректным.
В нашей российской медицине происходят чудеса. Авторитетный рецензируемый журнал «Успехи физиолог... more В нашей российской медицине происходят чудеса. Авторитетный рецензируемый журнал «Успехи физиологических наук» публикует научную статью, где утверждается, например, что алкоголизм и наркоманию можно лечить гомеопатическими разведениями этанола и морфинов соответственно. Эти чудеса в последнее время все больше и больше привлекают к себе внимание
специалистов, далеких по своей узкой специализации от медицины. Они стали интересны физикам и химикам после административного слияния российской Академии медицинских наук РАМН с «большой» российской Академией наук РАН. Одним из последствий слияния стал небольшой скандал, связанный с выбором в члены-корреспонденты обновленной РАН доктора медицинских наук Олега Ильича Эпштейна. Его избрали в Отделение физиологических наук, секцию Фундаментальной медицины. Авторы данной статьи пробуют разобраться, обоснованы ли выпады против молодого чл.-корр. РАН и созданных в его фирме инновационных препаратов, которые критически настроенные медики называют «стыдливой гомеопатией», а иногда и более резко «фуфлоферонами».
Papers by Nikita Khromov-Borisov
Экологий человека, 2024
Обоснование. Российская Федерация входит в десятку стран-лидеров по ожирению у взрослого населени... more Обоснование. Российская Федерация входит в десятку стран-лидеров по ожирению у взрослого населения. Цель. Анализ влияния эндогенных (пол, возраст, генотип FTO) и экзогенных (особенности диеты, уровень физической активности) факторов на количество жира и его топографию в группе мужчин и женщин, проживающих в Москве. Материал и методы. Проведено одноцентровое одномоментное обсервационное антропогенетическое исследование 464 добровольцев (231 женщина и 233 мужчины) в возрасте от 18 до 60 лет, проживающих в Москве. Программа обследования включала измерение длины и массы тела, обхватов корпуса и конечностей, калиперометрию, биоимпедансометрию и анкетирование. Были рассчитаны индексы топографии жироотложения, определён генотип по варианту Т/А гена FTO (rs9939609). Результаты. Длительная (не менее трёх лет) приверженность вегетарианской диете у мужчин и женщин приводит к снижению жировой и безжировой массы тела и не влияет на выраженность абдоминального жироотложения. Наиболее выраженный эффект на снижение абдоминального жироотложения в подгруппе мужчин и женщин оказывают регулярные физические нагрузки. При этом положительное влияние на снижение количества жира оказывают и любительские, и профессиональные занятия спортом от 180 мин в неделю. Полученные результаты свидетельствуют в пользу отсутствия влияния Т/А-замены FTO на количественные характеристики жироотложения, а также его топографию в подгруппах мужчин и женщин вне зависимости от модификаций диеты и уровня физической активности. Заключение. Для взрослых мужчин и женщин, проживающих в Москве, наиболее эффективными стратегиями по снижению жирового депо и абдоминального жироотложения являются приверженность вегетарианской диете и регулярные физические нагрузки.
American Journal of Human Biology, Oct 10, 2023
Научный редактор и издатель. 2024;9(1 Suppl. 1):1S5–1S32. , 2024
A critical analysis of the article by S.V. Mylnikov (Scientific Editor and Publisher. 2023;8(1 S... more A critical analysis of the article by S.V. Mylnikov (Scientific Editor and Publisher. 2023;8(1 Suppl):S52–S61) in the form of a correspondence dialogue is conducted. Aspects such as frequentist and Bayesian point and interval estimation of the parameters of binomial and polynomial
distributions, linear correlation coefficient (r), coefficient of determination (R2), linear regression parameters, difference (PD) and proportion ratio (RR), odds ratio (OR), estimation of minimum required sample sizes, advantages of statistical estimation based on bootstrap, random number generator, graphical methods of statistical analysis: décolleté and whisker boxes, probability plots, histograms, Gardner-Altman plots, rain clouds, corrections for multiple comparisons, complexities of correlation
analysis, effect size, replication probabilities (prep, psrep and prerep), mid-p values, prediction intervals for p values, for effect sizes, and for combined effects in meta-analysis. A description of the programs
recommended for solving the discussed statistical problems is presented.
Surprising Wilkins’ error (Nature 1953, 172: 755–762), 1924
The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1962 was awarded jointly to Francis Harry Compton Crick... more The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1962 was awarded jointly to Francis Harry Compton Crick, James Dewey Watson and Maurice Hugh Frederick Wilkins “for their discoveries concerning the molecular structure of nucleic acids and its significance for information transfer in living material”. Building the scale atomic-molecular models and applying strong inference Watson and Crick (1953a,b) presented convincing evidences for the following features of the spatial structure of the DNA molecule: (i) this structure has two helical chains each coiled round the same axis; (ii) both chains follow right-handed helices; (iii) the sequences of the atoms in the two chains run in opposite directions; (iv) the two chains are held together by hydrogen-bonded purine and pyrimidine bases; (v) the planes of the bases are perpendicular to the fibre axis; (vi) only specific pairs of bases can bond together: adenine (purine) with thymine (pyrimidine), and guanine (purine) with cytosine (pyrimidine). X-ray evidence obtained
at the same time by Wilkins et al. (1953a,b), and Franklin et al. (1953a,b) gave qualitative support to this structure and was incompatible with all previously proposed structures. Wilkins et al. (1953b) built molecular models of the type described by Watson and Crick (1953a) and adjusted them to conform with their experimental data. However, it appeared that the paper by Wilkins et al. (1953b) contains a curious and inexplicable error. Namely, in their Figure 3 DNA is schematically drawn as a left-handed helix, which, as Crick and Watson (1954) explained, is stereochemically impossible and must be right-handed. The fact stated here was mysteriously not noticed before and, fortunately, had no detrimental effect on the development of science.
Human Physiology
Reproducibility of body fat (BF) and fat-free mass (FFM) measurements obtained by two indirect me... more Reproducibility of body fat (BF) and fat-free mass (FFM) measurements obtained by two indirect methods (bioimpedance analysis (BIA) and ultrasound scanning (US)) was performed in a group of young adults. To evaluate reproducibility, the repeated body composition measurements obtained using an ABC-02 Medass bioimpedance analyzer and BodyMetrixTM ultrasound scanner were carried out in the group of adult men and women. The study indicates the reliability of both individual and group estimates, as well as high reproducibility of measurements obtained with BIA and US. Strong positive significant correlations were found between the body composition measurements obtained with an ABC-02 Medass and BodyMetrixTM, as well as between repeated measurements of each of the devices. The analysis carried out for the ABC-02 Medass and BodyMetrixTM devices indicates good reproducibility of BF and FFM measurements in young men and women. The highest reproducibility was shown for the results of FFM measurements.
Uploads
Books by Nikita Khromov-Borisov
Международные рекомендации по их описанию
Contrary to V.K. Khavinson et al. and advertising in the media there is no convincing experimental evidence of the geroprotective activity of the Khavinson peptides.
специалистов, далеких по своей узкой специализации от медицины. Они стали интересны физикам и химикам после административного слияния российской Академии медицинских наук РАМН с «большой» российской Академией наук РАН. Одним из последствий слияния стал небольшой скандал, связанный с выбором в члены-корреспонденты обновленной РАН доктора медицинских наук Олега Ильича Эпштейна. Его избрали в Отделение физиологических наук, секцию Фундаментальной медицины. Авторы данной статьи пробуют разобраться, обоснованы ли выпады против молодого чл.-корр. РАН и созданных в его фирме инновационных препаратов, которые критически настроенные медики называют «стыдливой гомеопатией», а иногда и более резко «фуфлоферонами».
Papers by Nikita Khromov-Borisov
distributions, linear correlation coefficient (r), coefficient of determination (R2), linear regression parameters, difference (PD) and proportion ratio (RR), odds ratio (OR), estimation of minimum required sample sizes, advantages of statistical estimation based on bootstrap, random number generator, graphical methods of statistical analysis: décolleté and whisker boxes, probability plots, histograms, Gardner-Altman plots, rain clouds, corrections for multiple comparisons, complexities of correlation
analysis, effect size, replication probabilities (prep, psrep and prerep), mid-p values, prediction intervals for p values, for effect sizes, and for combined effects in meta-analysis. A description of the programs
recommended for solving the discussed statistical problems is presented.
at the same time by Wilkins et al. (1953a,b), and Franklin et al. (1953a,b) gave qualitative support to this structure and was incompatible with all previously proposed structures. Wilkins et al. (1953b) built molecular models of the type described by Watson and Crick (1953a) and adjusted them to conform with their experimental data. However, it appeared that the paper by Wilkins et al. (1953b) contains a curious and inexplicable error. Namely, in their Figure 3 DNA is schematically drawn as a left-handed helix, which, as Crick and Watson (1954) explained, is stereochemically impossible and must be right-handed. The fact stated here was mysteriously not noticed before and, fortunately, had no detrimental effect on the development of science.
Международные рекомендации по их описанию
Contrary to V.K. Khavinson et al. and advertising in the media there is no convincing experimental evidence of the geroprotective activity of the Khavinson peptides.
специалистов, далеких по своей узкой специализации от медицины. Они стали интересны физикам и химикам после административного слияния российской Академии медицинских наук РАМН с «большой» российской Академией наук РАН. Одним из последствий слияния стал небольшой скандал, связанный с выбором в члены-корреспонденты обновленной РАН доктора медицинских наук Олега Ильича Эпштейна. Его избрали в Отделение физиологических наук, секцию Фундаментальной медицины. Авторы данной статьи пробуют разобраться, обоснованы ли выпады против молодого чл.-корр. РАН и созданных в его фирме инновационных препаратов, которые критически настроенные медики называют «стыдливой гомеопатией», а иногда и более резко «фуфлоферонами».
distributions, linear correlation coefficient (r), coefficient of determination (R2), linear regression parameters, difference (PD) and proportion ratio (RR), odds ratio (OR), estimation of minimum required sample sizes, advantages of statistical estimation based on bootstrap, random number generator, graphical methods of statistical analysis: décolleté and whisker boxes, probability plots, histograms, Gardner-Altman plots, rain clouds, corrections for multiple comparisons, complexities of correlation
analysis, effect size, replication probabilities (prep, psrep and prerep), mid-p values, prediction intervals for p values, for effect sizes, and for combined effects in meta-analysis. A description of the programs
recommended for solving the discussed statistical problems is presented.
at the same time by Wilkins et al. (1953a,b), and Franklin et al. (1953a,b) gave qualitative support to this structure and was incompatible with all previously proposed structures. Wilkins et al. (1953b) built molecular models of the type described by Watson and Crick (1953a) and adjusted them to conform with their experimental data. However, it appeared that the paper by Wilkins et al. (1953b) contains a curious and inexplicable error. Namely, in their Figure 3 DNA is schematically drawn as a left-handed helix, which, as Crick and Watson (1954) explained, is stereochemically impossible and must be right-handed. The fact stated here was mysteriously not noticed before and, fortunately, had no detrimental effect on the development of science.
массы (БЖМ) тела, а также доли ЖМ (%ЖМ), полученных с применением двух различных косвенных методов: биоимпедансометрии и ультразвукового сканирования в группе молодых взрослых.
Для оценки воспроизводимости результатов определения состава тела, получаемых с применением
биоимпедансного анализатора АВС-02 “Медасс” и ультразвукового сканера BodyMetrixTM были проведены повторные измерения каждым прибором в группе взрослых мужчин и женщин. Проведенный анализ свидетельствует о надежности получаемых оценок как на групповом, так и на индивидуальном уровнях и высокой воспроизводимости для методов ультразвукового исследования и биоимпедансного анализа, реализованных в данных приборах. Были выявлены сильные статистически
значимые положительные корреляционные связи между оценками состава тела, полученными с
применением АВС-02 “Медасс” и BodyMetrixTM, а также между повторными измерениями каждым
из приборов. Проведенный анализ для приборов АВС-02 “Медасс” и BodyMetrixTM свидетельствует
о хорошей воспроизводимости результатов измерения ЖМ и БЖМ у молодых мужчин и женщин.
Особенно хорошо воспроизводятся результаты измерения БЖМ.
men and women. The study indicates the reliability of both individual and group estimates, as well as high reproducibility of measurements obtained with BIA and US. Strong positive significant correlations were
found between the body composition measurements obtained with an ABC-02 Medass and BodyMetrixTM, as well as between repeated measurements of each of the devices. The analysis carried out for the ABC-02 Medass and BodyMetrixTM devices indicates good reproducibility of BF and FFM measurements in young men and women. The highest reproducibility was shown for the results of FFM measurements.
Protoplasmas,” published a year earlier in Zeitschrift fur die gesamte experimentelle Medizin. In these articles, the author described the experiments on the action of various poisons on the vessels of an isolated rabbit ear, maintained that “The degree of delution at which the poirsons still exhibited their activity was 10–32 in our experiments,” and made pseudoscientific assumptions about “gradual transformation of poison matter into electrical energy”, “the influence of metals over a distance,”
“energy transfer via a layer of air,” “connection of life with the global transformation of matter,” etc. In fact, only one person, his student and associate Mikhail Ivanovich Gramenitskii (1882–1942), pointed out in 1927 at the shortcomings of the experimental technique used by Kravkov. Sixty years later, in 1984, the same shortcomings were mentioned by Scofield. Other authors who have cited this article saw Kravkov’s experiments as a firm experimental proof of the principle of low doses in
homeopathy. Shortly before his death, however, N.P. Kravkov revised and supplemented the 9th edition of his major work “Fundamentals of Pharmacology,” in which he expressed his opinion about homeopathy, which leaves no doubt about his true attitude towards it. He wrote, “Apart from the theoretical inconsistency, the main weakness of homeopathic doctrine lies in the fact that it is destroyed by experiment. <…> The experimental data regarding the doses of active substances, presented by us, have nothing in common with the homeopathic data and cannot serve as a support for it.” Kravkov’s fallacy is an instructive example of ‘scientific credulity syndrome’, when the readers and followers uncritically accept the conclusions of a study, without paying close attention to the technical
details of planning (design) and conducting an experiment, taking no notice of inadequate methods of analysis, etc. In any case, Kravkov himself did not believe that his findings could substantiate the low dose principle in homeopathy. He did not observe the increase in the biological activity of substances (poisons) postulated by homeopats as their dose decreases,
Для оценки воспроизводимости результатов определения состава тела, получаемых с применением биоимпедансного анализатора АВС-02 “Медасс” и ультразвукового сканера BodyMetrixTM были проведены повторные измерения каждым прибором в группе взрослых мужчин и женщин. Проведенный анализ свидетельствует о надежности получаемых оценок как на групповом, так и на индивидуальном уровнях и высокой воспроизводимости для методов ультразвукового исследования и биоимпедансного анализа, реализованных в данных приборах. Были выявлены сильные статистически значимые положительные корреляционные связи между оценками состава тела, полученными с применением АВС-02 “Медасс” и BodyMetrixTM, а также между повторными измерениями каждым из приборов. Проведенный анализ для приборов АВС-02 “Медасс” и BodyMetrixTM свидетельствует о хорошей воспроизводимости результатов измерения ЖМ и БЖМ у молодых мужчин и женщин.
Особенно хорошо воспроизводятся результаты измерения БЖМ.
30 декабря 1946 г . на заседании Ученого совета Ленинградского университета состоялась защита диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук Михаилом Ефимовичем Лобашевым. Тема диссертации "О природе действия внешних условий на динамику мутационного процесса". В этой работе М.Е.Лобашев - один из первооткрывателей химического мутагенеза - сформулировал и экспериментально аргументировал физиологическую (паранекротическую) гипотезу мутационного процесса, основное содержание которой, по словам самого автора, "сводилось к тому, что как генные мутации, так и хромосомные перестройки являются следствием нетождественной репарации обратимо денатурированных структур хромосом.
Предполагалось, что химические агенты и ионизирующая радиация наряду с необратимой денатурацией белков клетки вызывают также обратимую денатурацию. В последнем случае при репарации поврежденных хромосом мутации генов и перестройки возникают как нетождественные исходному состоянию реверсии. При этом предполагалось, что мутация гена есть не прямая реакция гена на применяемый агент, как это следовало из физической концепции мутации гена, а вторичная - лишь как следствие сложных физико-химических процессов в клетке". Подчеркнем здесь, что М.Е. Лобашев не только указал на комплексность ("физиологичность") мутационного процесса, но представил разумный принцип возникновения мутаций - принцип нетождественной репарации. Он был, по-видимому, первым, кто употребил слово "репарация" в контексте со словом "мутация".
Данная, посмертная, публикация работы М.Е.Лобашева (1907-1971 г г . ) представляет собой обзорно-теоретическую часть его докторской диссертации. Публикация предпринята в связи с тем, что опубликованная автором в 1947 г. статья, единственная на эту тему, не претендовала на ту детальную аргументацию, которая содержится в диссертации.
Выдвинутая автором гипотеза в настоящее время звучит как нельзя
более современно и может служить универсальной общей теорией мутационного процесса. Основные ее положения в той или иной форме сегодня все чаще принимаются многими исследователями.
Н.Н.Хромов-Борисов
Methods: Ascitic liquid containing 1 107 tumour cells was inoculated to female Wistar rats and 48 hours
after rats received dioxadet and cisplatin at the maximum tolerated doses. Dioxadet at doses 1.5, 30 and 15 mg/kg and cisplatin at doses 4, 40 and 20 mg/kg body weight were administered for CIPC, NIPEC and HIPEC, respectively. Rats in the control groups received physiological saline and CIPC with physiological
saline was regarded as the untreated control. The antitumor activity of the drugs was evaluated as an
increase in average life expectancy (ALE). Analysis of the data was based primarily on Bayesian statistics
and included Kaplan–Meier method, log-rank test and hazard ratio (HR) estimation.
Results: Compared to the untreated control CIPC, NIPEC and HIPEC with dioxadet significantly increased ALE by 101316, 61524 and 1.71735 days, whereas with cisplatin by 61013, 122437 and –13523 days, respectively.
Conclusions: Dioxadet and cisplatin show similar efficacy in the CIPC route. Compared with CIPC IP chemotherapy by chemoperfusions is more effective for both the drugs. Dioxadet in HIPEC showed highest survival benefit whereas largest effect during NIPEC is achieved with cisplatin.
Статистический анализ должен быть исчерпывающим и гармонизирующим как статистические доказательства и предсказания, так частотнический и бейзовские подходы.
Недостаточно проводить проверку значимости нулевой гипотезы, сообщая лишь P-значения.
Статистическая значимость не означает практическую (клиническую) важность.
Следует указывать размер эффекта с доверительными и предсказательными интервалами. Эксперименты и/или наблюдения следует повторять многократно и исследовать их воспроизводимость. Лучше всего повторять эксперименты независимо в разных лабораториях (и в разных странах).
(ортодоксальный, классический, традиционный) подходы носят взаимодополнительный
(комплементарный) характер и совместно обеспечивают значительно лучшее понимание статистических проблем, чем каждый из них в отдельности (Lindley). Правильная оценка положения дел в статистической науке может быть получена только в результате сопоставления классического и
бейзовского подходов к разнообразным статистическим проблемам, выяснения того, что делает каждый из подходов и насколько хорошо он это делает (Anscombe).
Парадокс контрольной группы
Эволюционная нейтральность
Отношение шансов как мера нейтральности аллелей
Парадокс суммирования баллов генетического риска
Парадокс множественных сравнений и отклонения от равновесия Харди-Вайнберга (РХВ)
Эпистаз и нейтрализующая плейотропия
Мания секретности
Научно слабо обоснованные попытки практического использования плохо воспроизводимых результатов плохо спланированных исследований генетических «ассоциаций» для выявления и отбора (евгенической селекции) потенциальных элитных атлетов, как минимум, преждевременны. Пока что нельзя исключить, что такие действия принесут больше вреда, чем пользы. Дай бог, если их последствия будут нейтральными.
1. Масштабные атомно-молекулярные модели – эффективный инструмент обучения и исследований.
2. Устанавливая структуру биомолекулы, желательно задумываться о ее биологическом предназначении, о ее биологической функции.
3. Реакции ДНК с различными агентами являются топохимическими и/или контекст-зависимыми.
4. Без подтверждения структуры с помощью масштабных молекулярных моделей всяческие гипотетические построения почти наверняка обречены на провал.
5. Наука редко отвечает на вопрос «почему?», чаще только на вопрос «как?».
6. Современная структурная химия исключительно плодотворно объясняет и предсказывает геометрию молекул.
7. Таутомерный и ионизационный механизмы возникновения замен пар оснований – идеи, которые трудно доказать.
8. «Конформационный» механизм неправильного спаривания оснований представляется наболее правдоподобным.
9. Никакими силами и никогда мы не сможем избавиться от радиоактивных изотопов в природе.
10. Фотодимеризация тимина – яркая демонстрация топохимической природы реакций мутагена с ДНК.
11. Озоновый слой в стратосфере действительно надежно защищает нас от вредного мутагенно-канцерогенного действия коротковолнового УФ-излучения.
12. Основной (мажорный) продукт реакции агента с ДНК далеко не всегда является основной причиной его мутагенности. Чем мягче мутаген, тем больше его видовая и локусная специфичности.
13. Делетогены и амплигены заслуживают пристального внимания.
14. Анализ и сравнение мутационных спектров – продуктивный подход к выявлению сходства и различий между мутагенами.
1. Вопрос о форме (морфе) белковой молекулы лежит в основе всей проблемы физико-химической природы морфологии организмов.
2. Хромосомы – это огромные белковые молекулы, в которых радикалы распределены в определенном для каждого вида порядке.
3. Сложность такой молекулы столь велика, что ее копия не может создаваться в клетке заново.
Она возникает только при наличии в клетке уже готовой молекулы – затравки. Omnis molecula ex molecula
4. Радикалы хромосомной молекулы занимают в ней совершенно определенное место, и малейшие химические изменения в этих радикалах, должны являться источником новых мутаций.
Основным результатом научного исследования должны быть статистические оценки размера эффекта с доверительными и предсказательными интервалами (ДИ и ПИ),
а не p-значения.
Крайне желательно визуализировать как исходные данные, так и результаты их статистического анализа.
Одним из основных путей преодоления обнаружившегося кризиса воспроизводимости результатов научных исследований является многократное их повторение, желательно в разных лабораториях и странах
ПО: авторская программаDiagStat, EsayROC, MetaboAnalyst, модуль Biomarker Analysis, agreestat360, BA-plotteR, Risk_Lins_Concordance, cp_R, JASP
Его методы не регламентированы, не стандартизированы и не верифицированы.
Поэтому нельзя исключить, что такие действия принесут больше вреда, чем пользы.
Дай бог, если их последствия будут нейтральными.
Практическая нейтральность подавляющего большинства природных аллелей делают их абсолютно непригодными для диагностики и прогноза предрасположенности к болезням, профессиональных пригодностей, склонностей к занятиям спортом и прочим видам человеческой деятельности.
Обсуждаемое явление можно назвать биологическим «принципом неопределенности», сдерживающим наши неуемные желания и примиряющим их с нашими возможностями.
классический, традиционный) подходы носят взаимодополнительный (комплементарный) характер и
совместно обеспечивают значительно лучшее понимание статистических проблем, чем каждый из них
в отдельности (Lindley). Правильная оценка положения дел в статистической науке может быть получена только в результате сопоставления классического и бейзовского подходов к разнообразным статистическим проблемам, выяснения того, что делает каждый из подходов и насколько хорошо он это делает (Anscombe).
техническое исполнение предлагаемого метода были бы безукоризненными. В частности,
безукоризненными должны быть статистические методы, использованные для доказательства надежности, эффективности и воспроизводимости результатов предлагаемого метода.
Рецензент находится в явном замешательстве. Рецензент не уверен, что на подобные промахи можно смотреть снисходительно, сквозь пальцы и прощать, в надежде на то, что в будущем диссертант не допустит подобных ошибок. Жизненный опыт рецензента свидетельствует о том, что после защиты авторы напрочь забывают о своих просчетах, о
рекомендациях оппонентов и рецензентов, о собственных клятвенных обещаниях стараться впредь не ничего подобного не допускать, и продолжают совершать те же ошибки в своей дальнейшей работе.
с рассмотрения в Диссертационном совете
переосмысление. В таком виде она не удовлетворяет требованиям,
предъявляемым к докторским диссертациям.
различающимися» в сравниваемых группах и подгруппах и интерпретирует их как «информативные», на самом деле (с учетом множественности) таковыми не являются. В силу этого основные выводы автора о разработке «на основе данных ГРВ» диагностического правила, якобы «позволяющего диагностировать симпатикотонию у больных АГ» и «диагностического правила, позволяющего оценивать состояния
централизации управления ритмом сердца» не имеют под собой ни малейшего обоснования. Соответственно, не имеет никакого практического медицинского применения разработанное автором «информационное и алгоритмическое обеспечение для модуля автоматизированной оценки вегетативного статуса пациентов с артериальной гипертонией, позволяющее диагностировать симпатикотонию и высокое напряжение регуляторных систем у больных АГ, на основе данных ГРВ». Итак, обсуждаемая работа не отвечает требованиям, предъявляемым к кандидатским диссертациям и ее автор, Коробка Илона Евгеньевна, не заслуживает вожделенной степени кандидата медицинских наук, и можно лишь настоятельно рекомендовать автору критически переосмыслить результаты и выводы своей работы и снять ее с защиты.
промахи можно смотреть снисходительно, сквозь пальцы и прощать, в надежде на то, что
в будущем диссертант не допустит подобных ошибок. Жизненный опыт рецензента свидетельствует о том, что после защиты авторы напрочь забывают о своих просчетах, о рекомендациях оппонентов и рецензентов, о собственных клятвенных обещаниях
стараться впредь не ничего подобного не допускать, и продолжают совершать те же ошибки в своей дальнейшей работе. В итоге, рецензент настоятельно рекомендует диссертанту снять диссертацию с защиты, исправить все ошибки и уже после этого с чистой совестью претендовать на соискание вожделенной степени кандидата биологических наук по специальности 03.02.07 -
генетика.
Сергеевичем к защите на сосискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.00.15 – генетика. Обсуждаемая диссертация являет собой ярчайший пример того, какую злую шутку может сыграть с автором игнорирование проблемы множественных сравнений при статистическом анализе полученных данных. Автор совершает типичнейшую ошибку: в целом (в общем) различия в распределениях изученных генотипов и аллелей статистически незначимы, поэтому их дальнейший анализ – от лукавого. Ошибка в том, что в статистически однородных данных автор пытается выявить статистически гетерогенные (неоднородные) части. Делать это так, как автор – без учета множественности сравнений и (или) проверяемых статистических гипотез – неправомочно. При попарных сравнениях надо учитывать их число и использовать соответствующие поправки (хотя бы поправки Бонферрони или Шидака). Автор явно поспешил с представлением своей работы к защите. Работу надо
привести в соответствие с международными требованиями, предъявляемыми к анализу,
представлению и публикации данных по установлению связей («ассоциаций») между
генотипами и мнопричинными болезнями (См. Nature, 2004; 447:655-660), отделить «зерна
от плевел» и «мух от котлет», т.е. попытаться отделить ложные «ассоциации» от более
или менее правдоподобных и убедительных и обсудить результаты более самокритично.
деятельностью, адаптацией сердечно-сосудистой системы к физическим нагрузкам и типом мышечных волокон человека», представленной Ахметовым Ильдусом Ильясовичем на
соискание ученой степени кандидата медицинских наук по специальностям: 14.00.51 – восстановительная медицина, лечебная физкультура и спортивная медицина, курортология и
физиотерапия, 03.00.15 – генетика (медицинские науки). Автор претендует на соискание Ученой степени Кандидата Медицинских наук, да еще и
по специальности Генетика. Насколько мне известно, И.И. Ахметов даже не сдавал
кандидатского экзамена по генетике. И отсутствие глубоких познаний в этой области, равно как
и недостаток познаний в области корректного статистического анализа результатов
экспериментов и явились основными причинами научной несостоятельности его работы,
вследствие чего она, по-моему, не удовлетворяет требованиям, предъявляемым к работам на
соискание ученой степени кандидата медицинских наук по специальности 03.00.15 – Генетика.