Papers by Ismael Gárate-lizárraga

Se describe la variación espacial de la materia orgánica particulada (MOP), en términos de proteí... more Se describe la variación espacial de la materia orgánica particulada (MOP), en términos de proteínas, carbohidratos y clorofilas, así como la abundancia específica del titoplancton, para bahía Concepción durante el pico reproductivo de Argopecten circuluris. La distribucibn de estas variables evidenció dos zonas de mayor concentración de partículas: una en el primer "tercio" de la bahía y la otra en la cabecera. Los valores altos de clorofila a se debieron al nanofitoplancton, el cual contribuyó en mayor proporción a la abundancia total. Las especies abundantes del microtitoplancton fueron Chaetoceros curvisetus, Ch. lorenzianus, Ch. teres, Ch. cinctus y Lithodesmiun undulatum. El cálculo de las contribuciones de materia orgánica particulada fitoplanctónica y no fitoplanctónica mostró que en superficie el mayor porcentaje de proteínas (69.5%) está dado por el fitoplancton, mientras que a 10 m correspondió al material organito particulado no fitoplanctónico o detrítico. Esto permite inferir una alta calidad de la MOP en la columna de agua, la cual constituye una fuente potencial de alimento para los diferentes estadios de la almeja catarina.

Algae, Sep 15, 2022
The genus Coolia A. Meunier 1919 has a global distribution and is a common member of epiphytic di... more The genus Coolia A. Meunier 1919 has a global distribution and is a common member of epiphytic dinoflagellate assemblages in neritic ecosystems. Coolia monotis is the type species of the genus and was the only known species for 76 years. Over the past few decades, molecular characterization has unveiled two species complexes that group morphologically very similar species, so their limits are often unclear. To provide new knowledge on the biogeography and species composition of the genus Coolia, 16 strains were isolated from Bahía de La Paz, Gulf of California. The species were identified by applying morphological and molecular approaches. The morphometric characteristics of all isolated Coolia species were consistent with the original taxa descriptions. Phylogenetic analyses (large subunit [LSU] rDNA D1 / D2 and internal transcribed spacer [ITS] 1 / 5.8S / ITS2) revealed a species assemblage comprising Coolia malayensis, C. palmyrensis, C. tropicalis, and the C. cf. canariensis lineage. This is the first report of Coolia palmyrensis and C. cf. canariensis in Mexico and C. tropicalis in the Gulf of California. Our results strengthen the biogeographical understanding of these potentially harmful epiphytic dinoflagellate species.

Hidrobiologica, Dec 31, 2022
Antecedentes. Los registros ilustrados de los Podolampadaceae de aguas mexicanas son escasos. Obj... more Antecedentes. Los registros ilustrados de los Podolampadaceae de aguas mexicanas son escasos. Objetivos. Estudiar la morfología tecal de los géneros Blepharocysta y Podolampas y documentar la presencia de especies planctónicas en aguas del Atlántico y Pacífico alrededor de México fueron los principales objetivos del presente estudio. Métodos. Se tomaron muestras de botellas y de red en la columna de agua en el sur del Golfo de California (estado de Baja California Sur) y el sur del Golfo de México (estados de Veracruz y Yucatán) de 2008 a 2019. Se tomaron fotos en microscopio electrónico de luz y barrido (MEB), y se realizaron observaciones sobre la morfología tecal de los Podolampadaceae. Resultados. Se examinó la morfología tecal de Blepharocysta denticulata, B. okamurae, B. paulsenii, B. splendor-maris, Podolampas bipes, P. elegans, P. palmipes, P. reticulata y P. spinifera; se muestran micrografías en MEB de siete especies. Las células de Blepharocysta exhibieron una amplia variación de las características tecales. Las descripciones breves van acompañadas de referencias a publicaciones que contienen ilustraciones. Se presenta la historia del estudio de los Podolampadaceae. Conclusiones. Los datos morfológicos no son suficientes para confirmar el estado dudoso de algunos Podolampadaceae o para aclarar las relaciones genéricas, específicas e infraespecíficas dentro de la familia; por lo tanto, los datos moleculares son necesarios.

Acta Botanica Mexicana, 2006
An annotated checklist of about 605 principally free-living dinoflagellate species and infraspeci... more An annotated checklist of about 605 principally free-living dinoflagellate species and infraspecific taxa from 91 genera reported from the Mexican Pacific is presented on the basis of published literature, some theses, unpublished reports, and original data. Literature references from 1878 to 2005 (in total, 311) are included in the bibliography, and taxonomic notes in regard to some taxa are given, where appropriate. The presence of illustrations divided into three categories (line drawings, light micrographs and scanning electronic micrographs) in the cited works is indicated as well as the known distribution of the taxa in the Mexican Pacific. The nomenclature is brought up to date, and 193 species and infraspecific taxa are accompanied with original comments. Four new combinations are proposed: Histioneis pieltainii (B. F. Osorio) Okolodkov comb. nov., Latifascia subantarctica (Balech) Okolodkov comb. nov., Peridiniella globosa (P. A. Dang.) Okolodkov comb. nov. and Protoperidinium curtipes (Jörg.) Balech f. asymmetricum (Matzen.) Okolodkov comb. nov. Twentynine nomina nuda were revealed. The leading genera are Protoperidinium (111 species), Ceratium (63) Dinophysis (41), Gonyaulax (25), Oxytoxum (22), Gymnodinium (22), Prorocentrum (21), Alexandrium (17) Ornithocercus (12) and Amphidinium (12). To discover the true dinoflagellate species diversity in the Mexican Pacific, more studies on the athecate Gymnodiniales species, benthic and epiphytic dinoflagellates, the ''Diplopsalis group'', the genus Protoperidinium and recently described genera of the family Podolampadaceae, are needed.
Proliferación de Pseudo-nitzschia brasiliana y P. cf. pseudodelicatissima (Bacillariophyceae)
Polibotánica
Las opiniones expresadas por los autores no necesariamente reflejan la postura del editor de la p... more Las opiniones expresadas por los autores no necesariamente reflejan la postura del editor de la publicación. Queda estrictamente prohibida la reproducción total o parcial de los contenidos e imágenes de la publicación sin previa autorización del Instituto Politécnico Nacional.

Acta Botanica Mexicana, 2006
An annotated checklist of about 605 principally free-living dinoflagellate species and infraspeci... more An annotated checklist of about 605 principally free-living dinoflagellate species and infraspecific taxa from 91 genera reported from the Mexican Pacific is presented on the basis of published literature, some theses, unpublished reports, and original data. Literature references from 1878 to 2005 (in total, 311) are included in the bibliography, and taxonomic notes in regard to some taxa are given, where appropriate. The presence of illustrations divided into three categories (line drawings, light micrographs and scanning electronic micrographs) in the cited works is indicated as well as the known distribution of the taxa in the Mexican Pacific. The nomenclature is brought up to date, and 193 species and infraspecific taxa are accompanied with original comments. Four new combinations are proposed: Histioneis pieltainii (B. F. Osorio) Okolodkov comb. nov., Latifascia subantarctica (Balech) Okolodkov comb. nov., Peridiniella globosa (P. A. Dang.) Okolodkov comb. nov. and Protoperidinium curtipes (Jörg.) Balech f. asymmetricum (Matzen.) Okolodkov comb. nov. Twentynine nomina nuda were revealed. The leading genera are Protoperidinium (111 species), Ceratium (63) Dinophysis (41), Gonyaulax (25), Oxytoxum (22), Gymnodinium (22), Prorocentrum (21), Alexandrium (17) Ornithocercus (12) and Amphidinium (12). To discover the true dinoflagellate species diversity in the Mexican Pacific, more studies on the athecate Gymnodiniales species, benthic and epiphytic dinoflagellates, the ''Diplopsalis group'', the genus Protoperidinium and recently described genera of the family Podolampadaceae, are needed.
CICIMAR Oceánides, 2012
During a sampling on 15 December 2011 in Bahía de La Paz, a bloom of the benthic dinoflagellateAm... more During a sampling on 15 December 2011 in Bahía de La Paz, a bloom of the benthic dinoflagellateAmphidinium carterae was detected. Its abundance ranged from 28.2 to 64.8 × 103 cells L–1. Cells of A. carterae varied in length from 18 to 28 µm and 13 to 18 µm in wide (n = 30). The presence of A. carterae and benthic species of diatoms and dinoflagellates at the surface could be an indicator of upwelling water generated by northwestern winds. Seawater temperature during the bloom was 20 °C. Also, new records of dinoflagellates for the Mexican coast of the Pacific are here reported: Amphidiniopsis hirsuta, Amphidiniopsis sp., Amylax buxus,Cochlodinium pulchellum, Cochlodinium virescens, Durinskia cf. baltica, Gyrodinium sp., Thecadinium sp., and Prorocentrum minimum var. triangulatum.

Ciencias Marinas, 1990
otoño de 1986. Se calculó la diversidad (H y SMP), equitabilidad (E) y dominancia (REDI); así com... more otoño de 1986. Se calculó la diversidad (H y SMP), equitabilidad (E) y dominancia (REDI); así como la similitud entre muestras (SIMI) y la amplitud de nicho espacial (Bi). Se determinó la biomasa fitoplanctónica en muestras de superficie y se estimó la proporción de nano y microfitoplancton. Se identificaron 172 taxa entre especies y variedades, comprendidas en 61 géneros. Las especies más abundantes fueron: Stephanop+k palmeriana, Thafassionemafmuenfeldii, Chaetoceros loren.zianwn, C. radicans y T. nitzschioides. Exceptuando el valor de H' = 0.85, la diversidad fue comparativamente alta (5.0-5.87). La similitud entre muestras sugiere una sola asociación con codominancia de especies en toda el área de estudio. Las especies con mayor amplitud de nicho espacial fueron: T. fmuenfeldii (19.82), Dictyocha messanensis (19.74) y Distephanus pulchra (19.25). La abundancia fitoplanctónica mínima fue de 13,400 cel/l y la mkxima fue de 475,000 cel/l; se encontró que la mayor concentración de células se presentó en las áreas en donde se registraron las temperaturas más bajas y viceversa. La fracción del microfitoplancton dominó en abundancia al nanofitoplancton en un 60% de las muestras.
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