ASAM AMINO DAN PROTEIN
What is Protein?
Makes up your body
(muscles and meat are the same thing)
Tinjauan Umum
Protein adalah makromolekul yang paling berlimpah
di dalam sel hidup dan merupakan 50% berat kering
sel.
Protein sangat bervariasi mempunyai berbagai
peranan biologis.
Kunci struktur ribuan protein yang berbeda-beda
adalah gugus pada molekul unit pembangun protein
yang relatif sederhana yakni 20 asam amino yang
berikatan kovalen dalam urutan yang khas.
Examples of protein
Hair
Skin
Muscles
Meat
Nails
All organs
Eyes
The differences between organisms is mostly because
of their PROTEINS.
ASAM AMINO DAN PROTEIN
Asam amino adalah senyawa penyusun protein.
Asam amino mempunyai satu gugus karboksil dan
satu gugus amino. Pada umumnya gugus amino
terikat pada posisi dari gugus karboksil.
basa
asam
R H, C - : kiral
R
NH3
NH2
CH
COOH
CH
COO-
asam -amino
ion switter pH : 7,4
(Amfoter)
Asam Amino Amfoter
Asam amino dapat berperan sebagai asam
(mendonorkan proton pada basa kuat) dan dapat
berperan sebagai basa (menerima proton dari asam
kuat)
Bentuk kesetimbangan :
HO
RCHCOOH
H
NH3+
pH rendah
RCHCOO
HO
H
RCHCOO
NH3+
NH2
pH netral
pH tinggi
CONTOH ASAM AMINO
COO-
COOCOO-
COO+
H 3N
+H
H3N
CH2OH
L-serine
NH3+
CH2OH
D-serine
CH2OH
L-serine
CH2OH
D-serine
NH3+
Penamaan Asam Amino
Didasarkan pada struktur D gliseraldehid jika gugus
NH3+ terletak disebelah kanan diberi awalan D, jika
NH3+ dikiri diberi awalan L.
Semua asam amino yang ada di alam dalam protein
mempunyai konfigurasi L. Ada beberapa asam amino
yang penting dalam struktur dan metabolisme mempunyai
konfigurasi D, yaitu asam D-alanin dan D-glutamat yang
merupakan komponen penyusun dinding sel bakteri
tertentu.
Penulisan asam amino (20 asam amino yang umum)
dapat disingkat dengan 3 huruf.
Misal : Serine Ser
Glysin gly
Penggolongan Asam Amino
Penggolongan asam amino didasarkan pada sifat dari rantai samping (R). Berdasarkan sifat rantai samping R, asam amino dapat digolongkan
menjadi :
1. Asam amino dengan R non polar
2. Asam amino dengan R polar
3. Asam amino dengan R polar bermuatan
Penggolongan asam amino
Berdasarkan gugus fungsinya:
Asam amino dg gugus NH2 dan COOH
Asam amino dg gugus OH
Asam amino dg rantai R mengandung S Asam amino dg gugus amina sekunder
Asam amino dg cincin aromatis
Asam amino dg 2 gugus COOH
Asam amino dg gugus amida
Asam amino dg 2 gugus basa
Asam amino mengandung hanya gugus NH2 dan
COOH
NH3
H
NH3+
NH3+
COO- CH3
CH
COO-
CH
H3 C
CH
L - alanin (ala)
NH3+
NH3+
HC
COO-
CH3
glysin (gly)
H 3C
CH
CH2
CH3
Leusin (Leu)
CH
COO
H3 C
H2 C
CH
CH3
Isoleusin (Ile)
CH
COO-
Asam amino yang mengandung gugus -OH
NH3+
HO
CH2
CH
L - serine (Ser)
COO-
CH3
OH
NH3+
CH
CH
L - threonina (Thr)
COO-
Asam amino yang rantai R mengandung Sulfur
NH3+
HS
CH2
CH
COO-
L - systein (Cys)
NH3+
CH3
CH2
CH3
L - methionin (Met)
CH
COO-
Asam amino dengan gugus amino
sekunder, siklis
N +
COOH2
L-prolin (pro)
Asam amino yang rantai R mengandung cincin
aromatis
NH3
HO
CH2
NH3+
CH
COO
CH2
L-fenilalanin (Phe)
L - tyrosin (Tyr)
NH3+
CH2
CH
N
H
L - tryptofan (Trp)
COO-
CH
COO-
Asam amino mengandung gugus NH2 dan 2 gugus
COOH
NH3+
HOOC
NH3
HOOC
CH2
CH
CH2
CH2
CH
COO-
asam L - glutamat (Glu)
COO-
asam L - aspartat (Asp)
Asam amino mengandung gugus amida
NH3+
O
H 2N
CH2
CH
COO-
L - asparagin (Asn)
NH3+
O
H 2N
CH2
CH2
CH
L - glutamin (Gln)
COO-
Asam amino mengandung dua gugus basa
NH3+
NH3
H 2N
(CH2)4
CH
HC
COO-
H2
C
CH
NH
L - lysin (lys)
L - histidin (His)
NH
H2N
NH3+
NH
(CH2)3
L - arginin (arg)
CH
COO-
COO-
Pada asam amino yang gugus R (rantai samping)
bermuatan menyebabkan asam amino-asam amino ini
pada pH 7,4 berada dalam bentuk ionik
L - aspartat
bermuatan - 1
L - glutamat
L - lysin
bermuatan + 1
L - arginin
Muatan total asam amino dalam larutan akan
menentukan kelarutannya, sebagai fungsi pH. pH
dimana asam amino mempunyai muatan = 0 (tidak
bermuatan) disebut pH isoelektrik (pI). Pada pI,
kelarutan asam amino <<<, oleh karena itu pada pI
asam amino akan mengendap.
pH isoelektrik untuk asam amino dengan R tidak
terionisasi berkisar 5.5 6.5. pH isoelektrik untuk asam
amino dengan R terionisasi.
pH Isoelektrik Asam Amino
Asam Amino
Gugus Terionisasi
pH Isoelektrik
As. Aspartat
Karboksil
2,98
As. Glutamat
Karboksil
3,08
Histidin
Imidazol
7,64
Sistein
Tiol
5,05
Tirosin
Fenol
5,63
Lisin
Amino
9,47
Arginin
Amino
10,76
Fungsi pH Isoelektrik (pI)
Untuk mengkristalkan asam amino/protein pengendapan isoeletrik
Dengan mengetahui titik isoelektrik dapat meramalkan proses migrasi
protein dalam medan elektrikum Dasar untuk pemisahan asam
amino dengan elektroforesis
Reaksi Asam Amino
Reaksi dengan Ninhidrin
Ninhidrin di dalam air akan terhidrasi membentuk ninhydrin
hidrat. Ninhydrin hidrat bereaksi dengan asam amino
menghasilkan anion berwarna ungu, aldehid dan CO2.
Reaksi Ninhidrin
O
O
OH
RCHCOO
+
OH
O
N
NH3+
O
anion berwarna ungu
+ RCHO+ CO2 + H2O + H+
Asam Amino Essensial
Selain 20 asam amino yang dibutuhkan oleh tubuh untuk produksi
protein. Ada 12 macam asam amino lain yang tidak terdapat di alam
tetapi dapat disintesis dari fragmen karbohidrat dan lipid sebagai
sumber nitrogen melalui reaksi katalis enzim. Asam amino ini sangat
dibutuhkan oleh tubuh dan disebut Asam amino essential.
Ikatan Peptida
Ikatan yang menghubungkan 2 asam amino melalui gugus
karboksil dari satu asam amino dengan gugus amino dari asam
amino yang lain.
O
C O- + +H3N
+H3N CH2
O
CH
CH3
alanin O
glysin
O
+H3N
C
H2
N-terminal
H
N
C
CH3
ikatan peptida
gly - ala
(glysinalanin)
O-
+ H2O
C-terminal
Ikatan Peptida
Berdasarkan konvensi ikatan peptida ditulis dengan asam amino yg
mempunyai NH3+ bebas (sebelah kiri) dan as. Amino dg gugus COObebas (sebelah kanan)
Molekul yang mengandung 2 asam amino dg 1 ikatan peptida disebut
dipeptida
Molekul mengandung 3 asam amino disebut tripeptida. Ada
tetrapeptida, pentapeptida, dst.
Ikatan Sulfida
Disamping ikatan peptida, ikatan kovalen lain diantara
as. Amino dlm peptida dan protein adalah ikatan
disulfida.
Ikatan disulfida adalah ikatan tunggal -SS-.
Ikatan disulfida menghubungkan 2 unit sisteina.
Senyawa peptida alam yang mengandung ikatan
disulfida : Oksitosin, vasopresin.
Oksitosin: hormon yang mengatur kontraksi uterus
dan laktasi untuk merangsang kelahiran bayi
PROTEIN
Biopolimer yang terdiri dari banyak satuan as.
Amino yg dihubungkan oleh ikatan peptida
Beberapa protein merupakan komponen utama
dalam jaringan struktur (otot, rambut, kuku, kulit)
Struktur protein :
Struktur primer
Struktur sekunder
Struktur tersier
Struktur kuartener
Protein
Molekul yg sangat vital untuk organisme
terdapt di semua sel
Polimer disusun oleh 20 mcm asam
amino standar
Rantai asam amino dihubungkan dg iktn
kovalen yg spesifik
Struktur & fungsi ditentukan oleh
kombinasi, jumlah dan urutan asam
amino
Sifat fisik dan kimiawi dipengaruhi
oleh asam amino penyusunnya
Struktur Primer
Rantai peptida yang dihubungkan oleh ikatan amida (peptida)
Penggolongan Protein
Protein Fibrous (Serat)
Protein yang terdapat pada hewan, tidak larut dalam air. Misal :
keratin, kolagen, sutra
Proterin Globular
Protein yang larut dalam air. Misal : enzim, hormon, hemoglobin,
mioglobin, ovalbumin (pada putih telur)
Struktur primer
Urutan berulang satu atom nitrogen dan 2
atom carbon.
Ikatan antara peptida
Struktur skunder
Ikatan hidrogen
Ada bentkan heliks.
Struktur tertier
Struktur heliks lebih lengkap
Protein serat dan globuler
Protein serat: kreatin, kolagen, sutera.
Protein globuler: enzim, hormon, protein
pengangkut, mioglobin.
Struktur kuartener
Struktur agregat yang dibentuk oleh subunit
dari protein berbobot molekul tinggi.
Contoh hemoglobin: empat unit. 2 unit alpha
dengan 141 asam amino 2, 2 unit beta dengan
146 asam amino.
Fungsi Protein
Reaksi kimia enzymes
Immune system antibodies
Mechanical structure tendons
Generation of force muscles
Nerve conduction ion channels
Vision eye lens
. . . and much more!
Beberapa penyakit akibat defisiensi
protein
Kwashiorkor : kekurangan kwalitas maupun
kwantitas protein meski masukan kalori
memadai.
Marasmus: jika masukan kalori maupun
protein spesifik kurang.
Pengertian
Metabolisme meliputi:
1) jalur sintesis (anabolisme/endorgenik)
menggabungkan molekul-molekul kecil menjadi
makromolekul yang lebih kompleks; memerlukan
energi yang disuplai dari hidrolisis ATP
2) jalur degradatif (katabolisme/eksorgenik)
memecah molekul kompleks menjadi molekul
yang lebih sederhana; melepaskan energi yang
dibutuhkan untuk mensintesis ATP.
40
Protein
Asam amino dalam tubuh terutama digunakan
untuk sintesis protein. Tetapi, jika asupan glukosa
rendah, asam amino dapat diubah menjadi glukosa
melalui jalur yang disebut glukoneogenesis yaitu
pembentukan glukosa baru dari prekursor
nonkarbohidrat.
Proporsi protein sebagai sumber energi dalam diet
yang dianjurkan adalah sebesar 15%.
41
Protein
Asam amino merupakan sumber utama untuk glukosa melalui jalur
glukoneogenesis, tetapi gliserol dari trigliserida juga dapat digunakan.
Glukoneogenesis dan glikogenolisis penting untuk memback up
sumber glukosa pada saat puasa.
42
Amino Acids
Asam amino dalam darah
Jumlah asam amino dalam darah tergantung jumlah yang
diterima dan jumlah yang digunakan
Proses absorbsi asam amino dalam dingding usus adalah
proses transport aktif yang memelukan energi
Dalam keadaan berpuasa. Konsentrasi asam amino dalam
darah 3.5-5 mg/ 100ml darah. Setelah ada asupan makanan
menjasi 5-10mg/100ml darah. Dan turun kembali setelah 6
jam.
Reaksi metabolisme asam amino
Meliputi reaksi pelepasan gugus asam amino
Kemudian perubahan kerangka karbon
A1. transaminasi : Proses katabolisme asam amino berupa
pemindahan gugus amino darisuatu asam amino ke senyawa
lain (keto. Asam piruvat, ketoglutarat atau oksaloasaetat).
Sehingga (keto)senyawa tersebut dirubah menjadi asam
amino. Sedangkan asam amino dirubah menjadi senyawa
keto)
Reaksi metabolisme asam amino
katabolisme asam amino menjadi energi melalui siklus asam serta
siklus urea sebagai proses pengolahan hasil sampingan pemecahan
asam amino.
sintesis protein dari asam-asam amino.
Tahapan:
Ada 2 tahap pelepasan gugus amin dari asam amino, yaitu:
Transaminasi
Enzim aminotransferase memindahkan amin kepada -ketoglutarat
menghasilkan glutamat atau kepada oksaloasetat menghasilkan aspartat
Deaminasi oksidatif
Pelepasan amin dari glutamat menghasilkan ion amonium
Reaksi Transaminasi & Deaminasi Oksidatif
[Link]@[Link]
Jalur katabolisme yang menguraikan molekul kompleks menjadi
senyawa sederhana mencakup:
hidrolisis protein menjadi asam amino.
Ikatan peptida yang membangun rantai polipeptida dalam protein
dapat diputus (dihidrolisis) menggunakan asam, basa atau enzim
pemecahan ikatan peptida dalam kondisi asam atau basa kuat
merupakan proses hidrolisis kimia dan pemecahan ikatan peptida
menggunakan enzim merupakan proses hidrolisis biokimia reaksi
hidrolisis peptida akan menghasilkan produk reaksi yang berupa satu
molekul dengan gugus karboksil dan molekul lainnya memiliki gugus
amina (Juniarso dki, 2007).
Sintesis Protein
Sintesis protein adalah proses pencetakan protein dalam sel. Sifat
enzim (protein) sebagai pengendali dan penumbuh karakter makhluk
hidup ditentukan oleh jumlah jenis, dan urutan asam amino yang
menyusunnya. Jenis dan urutan asam amino ditentukan oleh ADN
(Asam Dioksiribose Nukleat).Sintesis protein meliputi dua langkah,
yaitu transkripsi dan translasi.
1. Transkripsi
pembentukan kode genetik oleh DNA
Pilinan DNA membuka sebagian > salah satu rantainya (Rantai sense
)akan membentuk rantai penggenap (ARN duta) yang berisi kode
genetik (kodon) > setelah ARN duta terbentuk, kemudian melepaskan
diri dari DNA dan berpiln kembali.
2. Translasi
proses penterjemahan kode genetik oleh RNA transfer
RNA duta masuk ke ribosom dari satu ujung ke ujung yang lain
setiapkodon (3 basa N) masuk ribosom maka datanglah RNA transfer
membawa asam aminosesuai kode genetiknya. Kemudian bergeser
lagi ke kodon lain dan seterusnya sampai ke ujung yang lain.
Asam amino akan membentuk rantai polipeptida (protein)
