Cours 1 Introduction BM
Cours 1 Introduction BM
Les acides nucléiques (ADN, ARN) sont constituées par des molécules relativement
simples que l’on appelle des nucléotides.
Ils jouent également un rôle fondamental dans le métabolisme sous forme di- et tri-
phosphorylée ainsi que dans la transmission de l’information dans la cellule (AMPc
et GMPc).
Les acides nucléiques
Structure des acides nucléiques
N 4
H HN 4
CH3 HN 4
H
3 5 3 5 3 5
2 6 2 6 2 6
1 1 1
O N H O N H O N H
H H H
cytosine (C) thymine (T) uracile (U)
5-méthyl-uracile
ADN/ARN ADN ARN
ACIDES NUCLEIQUES
NH2 NH2
3
+ H H
H N 4 H-N 4
3 2
5 3 5
2 6 2 6
1 1
O N H O N H
1
H
Echange d’hydrogène entre N1 et N3
NH2 NH
N 4
H HN 4
H
3 5 3 5
2 6 2 6
1 1
O N H O N H
H H
99,99% 0,01%
En solution ces 2 espèces moléculaires sont en équilibre (équilibre
fortement déplacé vers la forme amino).
ACIDES NUCLEIQUES
Il existe des bases pyrimidiques modifiées (chez les phages par
exemple…).
NH2 NH2
N 4
CH3 N 4
CH2OH
3 5 3 5
2 6 2 6
1 1
O N H O N H
H H
5-méthylcytosine 5-hydroxyméthylcytosine
ACIDES NUCLEIQUES
Des analogues de l’uracile (5-halogéno-uracile) sont utilisés en
thérapeutique anti-tumorale.
HN 4
X
3 5
2 6
1
O N H
H
X = F, Cl, Br, I
ACIDES NUCLEIQUES
NH2 O
N N
N1 6
5 7 HN 1 6
5 7
2 4 8 2 4 8
3 9 3 9
N NH H2N N NH
adénine (A) guanine (G)
ADN/ARN ADN/ARN
ACIDES NUCLEIQUES
D’autres purines existent : xanthine, hypoxanthine, acide urique, caféine…
O O
N N
HN N
O N NH N NH
H H
xanthine hypoxanthine
Intermédiaire du métabolisme de l’adénine et de la guanine
ACIDES NUCLEIQUES
D’autres purines existent : xanthine, hypoxanthine, acide urique, caféine…
O O
CH3 N CH3 NH
N N
O N N O N N
CH3 CH3 CH3
caféine théophylline
ACIDES NUCLEIQUES
D’autres purines existent : xanthine, hypoxanthine, acide urique, caféine…
O
O CH3
NH
N HN
HN O
O NH NH
O N N
O
CH3
N
théobromine HN
-
O
O NH NH
acide urique (goutte)
ACIDES NUCLEIQUES
Tautomérie : équilibre impliquant la migration de protons
2 4 8 2 4 8
3 9 3 9
H2N NH NH H2N NH NH
thiocétoguanine
7%
Les acides nucléiques
Structure des acides nucléiques
II. LES NUCLÉOTIDES
II.1. Définition suite.
3’ 2’ 3’ 2’
OH OH OH H
ARN ADN
pentoses sous forme furanique (5 atomes dans le cycle)
ACIDES NUCLEIQUES
Liaison base-sucre nucléoside
N
N 4 N 6 7
3 5 1 5
8
2 6 2 4
1 3 9
N H2O N N H2O
5’ H 5’
H
HOH2C O OH HOH2C O OH
4’ 1’ 4’ 1’
3’ 2’ 3’ 2’
OH OH / H OH OH / H
on obtient une liaison carbone-azote : liaison N-glycosidique
L’ADN contient le désoxyribose tandis
que l’ARN contient le ribose
Les acides nucléiques
Structure des acides nucléiques
II. LES NUCLÉOTIDES
II.1. Définition suite.
pKa = 2 O
pKa = 10
P
H-O O-H
pKa = 7 O-H
Les différentes fonctions acides ont des pKa avec des valeurs très
variables.
ACIDES NUCLEIQUES
Liaison acide phosphorique-sucre
OH
5’
O P OH HO-H2C O OH
O
- 4’ 1’
3’ 2’
H2O OH OH / H
OH
5’
O P O CH2 O OH
O - 4’ 1’
3’ 2’
OH OH / H
ACIDES NUCLEIQUES
nucléotides pyrimidiques
NH2 O
H3C H
4 N 6 N
5 3 5 1
OH 6
1
2 OH 4
3
2
5’
N O
5’
N O
O P O CH2 O O P O CH2 O
- -
O 4’ 1’ O 4’ 1’
3’ 2’ 3’ 2’
HO H HO H
désoxycytosine-5’-monophosphate désoxythymidine-5’-monophosphate
(dCMP) (dTMP)
ACIDES NUCLEIQUES
nucléotides puriques
NH2 O
N N N
7
5
6
1
N 7
5
6
1
OH 8 4
3
2 OH 8 4
3
2
5’ 9 5’ 9
O P O CH2 O N N O P O CH2 O N N NH2
- -
O 4’ 1’ O 4’ 1’
3’ 2’ 3’ 2’
HO H HO H
désoxyadénosine-5’-monophosphate désoxyguanosine-5’-monophosphate
(dAMP) (dGMP)
ACIDES NUCLEIQUES
NOMENCLATURE
type de base base azotée
nucléoside nucléotide
Le préfixe désoxy- ou désoxyribo- est ajouté aux nucléosides ou nucléotides qui comportent
du désoxyribose. Le préfixe ribo- est ajouté aux nucléosides ou nucléotides qui comportent du
ribose.
Les monomères d’acides nucléiques sont des nucléotides
Nitrogenous
base (A)
Phosphate
group
Sugar
Les acides nucléiques
Structure des acides nucléiques
LES NUCLÉOTIDES
2. Les liaisons dans les nucléotides.
acide
adénine adénosine AMP dAMP A
adénylique
acide
guanine guanosine GMP dGMP G
guanylique
acide
cytosine cytidine CMP dCMP C
cytidylique
acide
thymine thymidine - dTMP T
thymidylique
acide
uracile uridine UMP - U
uridylique
Les acides nucléiques
Structure des acides nucléiques
III. LES ACIDES NUCLÉIQUES
Antiparallèles
Complémentaires:
Hélicoïdales:
Les acides nucléiques
Structure des acides nucléiques
Les tARN sont les vecteurs qui vont transférer les acides
aminés jusqu’à l’usine ribosome où s’effectue la
synthèse protéique.
Les acides nucléiques
Structure des acides nucléiques
V. LES ARN
II. LES DIFFÉRENTS TYPES D’ARN.
II.3 LES ARN MESSAGERS (mARN).
1960
Le dogme central de la biologie moléculaire
3-1-1 Au niveau des molécules
Transcription Traduction
Le dogme central de la biologie moléculaire
3-1-2 Au niveau cellulaire
En 1960 En 2000
Transcription
Traduction
La réplication de l’ADN
• Avant la division
cellulaire l’ADN doit se
copier, ce processus
s’appelle la réplication
de l’ADN.
• La molécule d’ADN se
divise en deux et
forme un nouveau
brin, c’est l’aspect
semi-conservatrice de
l’ADN.
La structure de l’ADN
• La lecture se fait de
3’ à 5’
• La réplication se
fait 5’ à 3’
La réplication de l’ADN
Où ? Quand ? Comment ? Pourquoi ?
Duplication
Dans une
Phase
AssurerSla
de du bagage
cellule génétique
en division
transmission
l’interphase (chromosomes)
génétique à la par
(mitose/méiose)
du bagage une batterie
descendance
enzymatique
Croissance
Période durant
Le cycle laquelle il ya
cellulaire réplication
D’ADN
Croissance et
Mitose préparation à la
division
La réplication de l’ADN
• Les hypothèses de modèles de réplication
• Les étapes du modèle procaryote
– Origine de réplication
– Élongation du brin d’ADN continu 5’ 3’
– Élongation du brin d’ADN discontinu 3’ 5’
– Corrections subséquentes
http://www.ustboniface.mb.ca/cusb/abernier/
Origine de réplication
Protéines fixatrices
d’ADN monocaténaire
ADN bicaténaire
ADN hélicase 3’
3’
5’ 5’
ADN topoisomérase
5’
ADN primase
Fourche de réplication
Élongation du brin d’ADN
continu 5’ 3’
5’
Brin continu (directeur)
3’
ADN bicaténaire
3’
3’3’
ADN polymérase 5’
5’
5’ 5’
5’
ADN bicaténaire
3’
3’
ADN polymérase
5’
Brin discontinu
5’
5’
3’ 3’
ADN
ARNase
polymérase
ADN H
ligase 5’
5’
5
’
http://www.ustboniface.mb.ca/cusb/abernier/
Transcription de l’ADN en ARN
Etapes de la transcription
Définition :
Ensemble des mécanismes qui assurent la
synthèse des protéines selon la séquence de
nucléotides de l’ARNm
Composants de la machinerie:
Structure tridimensionelle du
ribosome à basse résolution
Le code
génétique
(déchiffré entre 1960 et 1964)
La traduction Acide aminé
(Crick, 1960)
Mécanisme de la traduction
Aperçu sur la transcription et la traduction
De l’ADN à la protéine
3. Traduction
Synthèse protéique
Mots croisés
s e m i - c o n s e r v a t e u r
d i s c o n t i n u
n u c l é o t i d e
c o n t i n u h y d r o g è n e
a d n h é l i c a s e
a d n p r i m a s e
m i t o s e d i s p e r s i f
Vertical
Horizontal
12.
2.
3. Modèle
1.Division
Modèle de
de réplication
réplication
catalysant d'ADN
d'ADN
l'élongationou
où chaque
chaque
d'un nouveau
brin
nouveau 3'brin
parental
brin d'ADN5‘
10.
11.
4.
7.
5.
6.
8.
9. Type
Enzyme
Segment
Molécule
Brin d'ADN
de cellulaire
liaison
reliant
fabriquant
brisant
d’un
constituée
dont
brin
les
entre
les
l'élongation
non-sexuée
discontinu
fragments
une
liens
d'un
lesamorce
nucléotides
hydrogènes
groupement
se
d’Okazaki
fait
d’ARNdans
de
des
phosphate,
la
entre
ledeux
double
sens
eux
brins
5'd'un
hélice
au 3‘
filleforme
est ununmélange
nouveau des
brin brins
d'ADNparentaux et de brins
désoxyribose
d'ADN et d'une base azotée
nouvellement synthétisées