Recherche
bibliographique
Plan
• Introduction
• Outils et sources de recherche documentaire
• Quelques styles de citation
• Stratégies de recherche bibliographique
• PubMed/HINARI en pratique
Introduction
Introduction
•Recherche documentaire: faire le point des connaissances
sur un sujet d’intérêt scientifique ou non à un moment
précis de l’histoire
•Synonymes: recherche bibliographique, revue
littéraire, revue bibliographique, Revue de la littérature
•Pourquoi: Rédaction d’un ouvrage scientifique sur un sujet
donné, préparation d’un cours/conférence/leçon, rédaction
d’un projet, d’une publication scientifique, vérification
d’opinions/assertions
Introduction: Qui fait une revue de littérature?
• Les enseignants
• Les conférenciers/panelistes
• Les chercheurs/experts/consultants
• Les étudiants/élèves/stagiaires
• Les journalistes des médias spécialisés
ou non
• Curieux/information personnelle
Introduction: Comment peut-on faire?
•Revue manuelle: Visite d’une bibliothèque, compilation de
livres, journaux, articles, lecture intégrale, résumé et
citations des principales idées, fut la règle avant internet
Simple, fastidieuse, tâtonnement
•Revue électronique: définition du sujet d’intérêt y compris
mots- clés, identification d’un site web/server spécialisé,
sélection de sources les plus pertinentes, lecture
intégrale, sauvegarde des données majeures et citation
électronique
Scientifique, méthode élaborée
Outils et sources de recherche documentaire
Outils et sources
Pour réaliser une recherche bibliographique, on a
besoin:
• Sources documentaires
• Moteur de recherche bibliographique
• Logiciel de gestion bibliographique
Sources documentaires
• Encyclopédies spécialisées: EMC
•Sites spécialisés dans la surveillance sanitaire: InVS,
OMS, ONUSIDA, UNICEF
•Base de données bibliographiques: MEDLINE, BDSP,
EMBASE, INTUTE, AMED, CINAHL, DH-DATA
Sources documentaires
•MEDLINE est la base de données
bibliographique de référence pour les sciences
biomédicales
•Rassemble des citations, des résumés et des
articles de recherche biomédicale
Moteurs de recherche
Moteurs de recherche ou robots
• Outils automatisés d’indexation et de recherche de
ressources Internet interrogeables par mots-clés
• Peuvent être généralistes ou spécialisés
• Explorent automatiquement les sites
• Constituent un énorme stock de données à partir
desquelles les questions posées trouvent souvent des
réponses
Moteurs de recherche généralistes
Moteurs de recherche
Moteurs de recherche spécialisés scientifiques
• Moteurs de recherche spécialisés dans la littérature
scientifique et académique
•Outils prenant en compte les sources d’information
privilégiées par les chercheurs: articles de revues
scientifiques, actes de congrès, ouvrages, brevets,
thèses, rapports de recherche, etc.
Exemples de moteurs de recherche scientifique
Google scholar
Google Scholar [Link]
• Lancée en 2004
• Indexation de la littérature scientifique mondiale
•Partenaires: universités, éditeurs, sociétés savantes,
bibliothèques
•Préférences: langue, liens vers les bibliothèques
•Champs : auteur, titre de revue, titre du document, date
Résultats dans Google Scholar
• Informations présentes : titre, auteurs, revue, date,
éditeur, source, résumé généré automatiquement
• Référence
• Lien vers la référence, accès à un abstract, au
minimum
• [PDF], [DOC], [HTML] : document accessible en
texte intégral
• [CITATION]: Citation dans un document
(bibliographie)
• [BOOK]: Indique un livre, souvent disponible en
texte intégral
Moteurs de recherche
Portails scientifiques: [Link]
• Accès aux ressources scientifiques officielles
américaines
• Toutes disciplines
• Tous types de ressources
• Alliance
• 14 agences fédérales, NASA, Library of
Congress
• Sources
• 45 bases de données
• 2000 sites sélectionnés
Portails scientifiques: [Link]
• Portal mondial d’accès (Global Science
Gateway)
• Origine et hébergement américain
• Sources
• Banques de données, portails scientifiques,
sociétés savantes
• Couverture
• Toutes discipline mondiale
• Fonctionnalités
Moteurs de recherche
Moteurs de recherche disciplinaires
• Sciences Humaines et Sociales
[Link]
• Sciences économiques [Link]
• Droit [Link]
•Chimie [Link]
•Science en général [Link]
•Science de la santé
[Link]
Moteurs de recherche
Moteurs spécialisés en santé
– Cochrane
– Pubmed
– WHO/Hinari
– Search
medica
– PubGene
Moteurs de recherche: Cochrane
• Réseau mondial indépendant de chercheurs, de
professionnels, de patients, de soignants et de
personnes intéressées par les questions de santé
•Résume les meilleures données probantes issues de la
recherche
•Aide à améliorer la prise de décisions en matière de
santé
Moteurs de recherche: PubMed
•PubMed est le principal moteur de recherche de
l'ensemble des domaines de spécialisation de la
biologie et de la médecine.
•C’est un moteur de recherche donnant accès à la base
de donnée bibliographique MEDLINE qui rassemble des
citations, des résumés, des articles de recherche
biomédicale
Moteurs de recherche : HINARI
• L’accès à ces articles est souvent payant ce qui a
motivé la création du programme HINARI pour les
pays en voie de développement pour un accès
facile aux articles
• Version en français
• Plus de 8000 journaux en 30 langues
• Compte
•Username: BFA014
•Password: 8F5349
Logiciel de gestion bibliographique
•Un logiciel de gestion bibliographique est un logiciel
destiné à établir, trier et utiliser des listes de référence
bibliographiques d'articles, d'ouvrages ou même de
sites web concernant des publications scientifiques
•Exemples: Zotero, Mendeley, EndNote, BibTex, Bookend,
Bibus, Tellico
Quelques styles de citation
Citer selon le style Vancouver
• Style bibliographique lié aux exigences uniformes
pour les manuscrits présentés aux revues
biomédicales
• Numérotation dans l'ordre de mention dans le
texte
• Identifier en chiffres arabes dans le texte (1) ou
[1].
•Référence incorporée à la fin de la phrase avant le
point (2).
•Plusieurs références au même endroit intégrées
Citer selon le style Vancouver
• Références triées par ordre d'apparition dans le
texte
• Bibliographie à la fin du document
• Après plus de six auteurs, inscrire la mention “et
al.”
Article typique
•Nom du/des auteurs(s). Titre de l’article. Titre
abrégé du périodique. Année;
Volume(Numéro):Pages.
•Halpern SD, Ubel PA, Caplan AL. Solid-organ
Autres styles de citation
• Harvard : citations « auteur-date » les références
dans la bibliographie sont classées par ordre
alphabétique d’auteur
• American Anthropological Association
• American Psychological Association
• Chicago Manual of style 16th edition
• Cell
• IEEE
• Modern Language Association 7th edition
Stratégies de recherche bibliographique
Mots clés
Comment déterminer les mots clés
• PICOS (Patient, Intervention, Control, Outcome,
Study)
• Medical Subject Headings (Mesh): Système de
métadonnées médicales en langue anglaise
concernant la nomenclature en se basant sur
l'indexation d'articles en sciences de la vie
Mots clés
• Exemples: Je recherche des informations sur la
prévention du paludisme par les antibiotiques.
• Mots-clés : prévention, paludisme, antibiotique,
•Pubmed est une base de donnée américaine. Il
convient de traduire en langue anglaise les termes
employés pour notre recherche.
•Pour cela, ce site peut être utile :
[Link]
Mots clés: Mesh terms
• Malaria, Prevention, Anti-Bacterial
Agents
•Pour trouver un terme du MeSH, il suffit
de:
• Sélectionner la base de donnée
MeSh et y
• Entrer le terme recherché.
• Exemple de « malaria »
Opérateurs booléens
En vert : Sujet a En rouge : Sujet a
NOT sujet b sujet
AND
Ensemble :
b
sujet a OR sujet
b
Sujet
Sujet b
a
Quelques commandes et languages de PubMed
[Author] [Title]
[Affiliation] [Title/Abstract]
[Author - [MeSH Major
First] Topic] [MeSH
[Author - Terms]
Last] [Language]
[Investigator “YYYY/MM/
] [Editor] DD"[Date -
[Grant Publication] : "
Number] YYYY/MM/DD "[Date
[Publication -
Etapes des stratégies de recherche
• Sélectionner les mots -clés
• Identifier les termes Meshs
• Élargir/Limiter la recherche avec les opérateurs
booléens (AND, OR, NOT)
• Écrire l’algorithme de recherche
• Exécuter la recherche
Algorithme de recherche
• Malaria AND Prevention AND Anti-Bacterial Agents
• ? résultats de recherche à l’algorithme
• ((malaria[Title/Abstract]) AND prevention[Title/Abstract])
AND Anti- Bacterial Agents
•? résultats de recherche à l’algorithme
• ((malaria) AND tinto[Author]) AND burkina faso
•? résultats de recherche à l’algorithme
Exemples d’algorithme de recherche
Mots clés Algorithme
MEDA Nicolas (MEDA Nicolas[Author]) OR MEDA N[Author]
Pays ((MEDA Nicolas[Author]) OR MEDA N[Author])
AND burkina faso
Affiliation pays ((MEDA Nicolas[Author]) OR MEDA N[Author])
AND burkina faso[Affiliation]
Affiliation ((MEDA Nicolas[Author]) OR MEDA N[Author])
Centre AND centre muraz[Affiliation]
Muraz
Algorithme de recherche
• Exemple d’étude : Etude de la mortalité dans une
cohorte thérapeutique de patients infectés par le
VIH
•Recherche de Mesh terme pour le VIH
•Construction d’un algorithme de recherche en
utilisant les opérateurs booléens
Algorithme de recherche
Exemple d’algorithme de recherche sur le VIH
(((((((((((((((((hiv[MeSH Terms]) OR hiv infections[MeSH Terms]) OR hiv-
1[MeSH Terms]) OR hiv-2[MeSH Terms]) OR acquired immunodeficiency
syndrome[MeSH Terms]) OR hiv[Text Word]) OR hiv[Text Word]) OR
hiv1[Text Word]) OR hiv2[Text Word]) OR acquired immunodeficiency
syndrome[Text Word]) OR hiv[Title/Abstract]) OR hiv1[Title/Abstract])
OR hiv2[Title/Abstract]) OR acquired immunodeficiency
syndrome[Title/Abstract]) OR hiv-1[Title/Abstract]) OR hiv-
2[Title/Abstract]) OR hiv-1[Text Word]) OR hiv-2[Text Word]
Algorithme de recherche
Exemple d’algorithme sur la thérapie antirétrovirale
((((((((haart[MeSH Terms]) OR highly active antiretroviral
therapy[MeSH Terms]) OR antiretroviral therapy highly
active[MeSH Terms]) OR haart[Text Word]) OR highly active
antiretroviral therapy[Text Word]) OR antiretroviral
therapy highly active[Text Word]) OR haart[Title/Abstract])
OR highly active antiretroviral therapy[Title/Abstract]) OR
antiretroviral therapy highly active[Title/Abstract]
Algorithme de recherche
Exemple d’algorithme de recherche sur la mortalité
(((mortality[MeSH Terms]) OR survival[MeSH Terms]) OR
mortality[Title/Abstract]) OR survival[Title/Abstract]
Possibilité d’écrire un seul algorithme ou combinaison
((#1) AND #2) AND #3
PubMed/HINARI en pratique
Pubmed en pratique
• Créer un compte Pubmed
• Exécuter une stratégie de recherche
bibliographique
• Comprendre l’interface de Pubmed
• Comprendre la recherche avancée dans
Pubmed
• Sauvegarder les résultats dans la
bibliothèque
• Envoyer les résultats par email
• Créer des emails d’alertes
• Utiliser HINARI
