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ADN (Repaired)

Le matériel génétique, présent chez tous les êtres vivants, est principalement constitué d'acides nucléiques, notamment l'ADN et l'ARN. L'ADN, support de l'hérédité, se caractérise par sa structure en double hélice et son organisation en chromosomes, tandis que l'ARN joue un rôle différent dans la synthèse des protéines. Les différences entre ADN et ARN incluent la composition chimique et la stabilité, l'ADN étant plus stable en raison de sa structure et de son orientation antiparallèle.

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ADN (Repaired)

Le matériel génétique, présent chez tous les êtres vivants, est principalement constitué d'acides nucléiques, notamment l'ADN et l'ARN. L'ADN, support de l'hérédité, se caractérise par sa structure en double hélice et son organisation en chromosomes, tandis que l'ARN joue un rôle différent dans la synthèse des protéines. Les différences entre ADN et ARN incluent la composition chimique et la stabilité, l'ADN étant plus stable en raison de sa structure et de son orientation antiparallèle.

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QUEL EST LE SUPPORT PHYSICO-CHIMIQUE DU MATERIEL

GÉNÉTIQUE ?
1- Le matériel génétique

• Il existe en chaque être vivant (procaryote ou


eucaryote), une substance qui est qualifiée de
matériel génétique.
• Le matériel génétique est composé d’acides
nucléiques.
Matériel génétique des bactéries

• L’expérience de Griffith (1928) sur les


Pneumocoques a démontré le transfert du
caractère -virulence- et du type antigénique
d’une souche bactérienne tuée à une autre
souche vivante. Ce phénomène a été appelée
transformation bactérienne.
Matériel génétique des virus

• Plus tard, il a été démontré que les virus sont


constitués d’un acide nucléique(soit l’ADN, soit
l’ARN) et de protéines. L’expérience de
Hershey et Chase (1952) a démontré que le
matériel génétique du phage est constitué par
l’ADN. Chez les virus à ARN, l’information
génétique est contenue dans l’ARN.
Matériel génétique chez les organismes eucaryotes

• Un certain nombre d’arguments indirects ont


montré que l’ADN est le matériel génétique
des eucaryotes.
• Les études cytologiques et génétiques ont
montré que les chromosomes, qui sont le
support de l’hérédité, sont faits
principalement d’ADN.
2- Différences entre ADN et ARN

• - Au lieu du désoxyribose présent dans les


nucléotides de l’ADN, les nucléotides de l’ARN
contiennent un sucre ribose.
• - A cause du groupe hydroxyle libre sur
l’atome de carbone 2’ du ribose, l’ARN est
rapidement dégradé dans des conditions
alcalines. L’absence de ce groupe dans le
désoxyribose, rend l’ADN beaucoup plus
stable.
• - La thymine, une des deux pyrimidines
présentes dans l’ADN, est remplacée par
l’uracile dans l’ARN.
• - L’ARN existe habituellement sous la forme
d’une molécule simple brin (monocaténaire),
tandis que l’ADN comporte deux brins associés
par des liaisons hydrogène entre bases
complémentaires.
3- ORGANISATION PHYSIQUE DE
L’ADN
• 1944: l'ADN est le support de l'hérédité
• 1953: les propriétés de la molécule d'ADN
expliquent la dualité de son rôle:
- instructions fonctionnelles pour l'organisme:
séquence des nucléotides
- reproduction (formation du semblable):
appariement des nucléotides
L’information génétique est portée par l’ADN chez tous les êtres vivants
• La molécule d'ADN doit avoir une structure bien
particulière pour que sa fonction soit correctement
remplie.
• L’ADN est le seul constituant cellulaire qui de façon
rigoureuse est transmis d’une cellule mère à une cellule‐
fille.
• C’est une caractéristique essentielle que doit avoir le
matériel génétique.
• Pour une espèce donnée, la quantité d’ADN est
constante dans chaque cellule alors que ce n’est pas le
cas pour les protéines et pour l’ARN.
Les structures de l’ADN

• - La structure primaire de l’ADN est une chaîne


de nucléotides joints par des liaisons
phosphodiester – sa structure hélicoïdale de
base.
• - La structure secondaire de l’ADN est sa
configuration tridimensionnelle.
• - La structure tertiaire correspond au
surenroulement de l’ADN en chromosomes.
A- Structure primaire de l’ADN
• L’ADN est un polymère formé de l’enchainement
de nucléotides.
• Chaque nucléotide est formé d’un assemblage
de trois types de molécules : O -

 Une molécule de sucre O P O

O
 Une molécule d’acide phosphorique Base

5’CH
 Une molécule d’une base azotée O 2

4’ C H H C 1’

H C C 2’ H
3’

OH H

désoxyribonucléotides
• ADN (acide désoxyribonucléique) :
- un ose qui est le 2'-désoxyribose
- la base : soit adénine ou guanine
(purine), soit cytosine ou thymine (pyrimidine)
CH3 O NH2
N
N O
NH2 8
7
5 6 6 7
5
8 6
T
5
4 1
NH 4 C N 5 6 9
1
N
9 N
4 G 1 NH
N
3 2 3
N
2 4 A 1 N
3 2
3 2
sucre N
sucre
O N
O NH2
sucre sucre

thymine cytosine adenine guanine


• L'orientation entre les liaisons donne une
structure en forme de double hélice
• Une molécule d’ADN est un polymère formé
de l’enchaînement d’unités plus simples
appelées nucléotides.
Caractéristiques de l’ADN
 Structure en double hélice : Les deux brins
d’ADN sont réunis sous forme d’une double
hélice par des liaisons chimiques de faible
énergie (liaisons hydrogène) qui lient les bases
entre elles.
 Complémentarité des bases : En 1953, James
Watson et Francis Crick découvraient la structure
de l’ADN en établissant que les deux brins d’ADN
étaient complémentaires. Les barreaux de
l’échelle sont toujours de type (A=>T) ou (G=>C).
II y a donc une contrainte totale entre les
deux chaines puisque la séquence de 1'une
détermine celle de l’autre. Les deux chaines
sont dites complémentaires.
 Appariement : L'appariement des bases
se fait de telle manière qu’une purine soit
en face d'une pyrimidine et plus
précisément que l’adénine soit associée à
la thymine et la guanine à la cytosine.
• les bases des acides nucléiques
s'apparient grâce à des liaisons H
(hydrogène).
• Pour l’ADN il existe:
•  3 liaisons H entre C et G
•  2 liaisons H entre A et T
C avec G: trois liaisons hydrogène
A avec T: deux liaisons hydrogène (liaisons
faibles)
 Antiparallèles : Elles sont orientées en sens
inverse c'est a dire I’extrémité phosphorylée de
l'une faisant face a l'extrémité hydroxylée de
l'autre. Elles sont alors dites antiparallèles.

• les 2 brins sont dits anti-parallèle, car leur


polarité est inversée. Dans une double hélice
d'ADN, un brin est dans le sens 5'->3' alors que
le brin complémentaire est en sens 3'->5'.
 Les lois de Chargaff: La quantité d’adénine est
toujours égale à la quantité de thymine et la
quantité de guanine est toujours égale à la
quantité de cytosine (A=T et G=C).
 La liaison phosphodiester Chaque brin est
formé d’une succession d’unités sucre et
phosphate unies par des liaisons
phosphodiesters.
B. Structure secondaire de l’ADN
• La stabilité de la structure secondaire de ces
différentes double hélices d'ADN est
essentiellement due aux :
• - liaisons hydrogènes entre les bases
complémentaires de chacun des brins
• - interactions hydrophobes et électrostatiques
des bases successives empilées dans la
structure de l'hélice,
• Cette stabilité n'entraîne pas une rigidité de la
molécule d'ADN et celle-ci peut adopter des
conformations différentes selon les régions.
• L’ADN peut exister à l’état relâché avec une
contrainte minimale dans la molécule.
• Cependant, l’axe de la double hélice d’ADN
peut s’enrouler sur lui-même en formant un
super enroulement.
LA CONFORMATION DES ADN
LES TOPOISOMÈRES
Plusieurs conformations correspondant à des
sens d'enroulement différents ou des pas
différents ont été trouvées,
• Conformation B :
• c'est le modèle de Watson et Crick,
• le plus stable dans les conditions
physiologiques.
• - enroulement droit
• - pas : 3,4 nm
• - 10 pb par tour
• - rotation du plan des bases : 36°
• Conformation A :
• - enroulement droit
• - pas : 2,8 nm
• - 11 pb par tour
• - rotation du plan des bases : 33°
• Conformation Z :
• - enroulement gauche
• - pas : 4,5 nm
• - 12 pb par tour
• - rotation du plan des bases : - 30°
• Les topoisomères sont deux molécules d’ADN
qui ont la même séquence & diffèrent
uniquement par le nombre d’enlacements
( superenroulement ou le nombre de tours
que fait l’un des brins autour de l’autre brin).
• Il existe Différents états des topoisomères.
• Deux formes de superenroulement sont alors
possibles:
• -Un superenroulement qui correspond à une
augmentation du nombre d’enroulements
dans la même direction que la rotation de
l’hélice B (rotation droite).
• On parle de superenroulement positif.
• -Un superenroulement de l’ADN autour de son
axe dans la direction opposée au sens des
aiguilles d’une montre.
• On parle de superenroulement négatif.
• Le superenroulement de l’ADN a des
conséquences importantes:
• - Il permet de le rendre plus compact et
diminuer ainsi le volume occupé dans la
cellule.
• - Ces modifications du degré d’enroulement
de la double hélice d’ADN influencent les
interactions de l’ADN avec d’autres molécules.
LES TOPOISOMÉRASES
• Les topoisomérases sont des enzymes qui
modifient le nombre d’enlacements. Elles
augmentent ou diminuent le nombre de
supertours dans les molécules d’ADN double
brin.
• Les topoisomérases I & II permettent de
désenrouler l’ADN.
• Les topoisomérases de type I: Coupent
transitoirement et ressoudent un seul brin
d’ADN double brin. Ils peuvent agir sur de
l’ADN superenroulé positif ou négatif.
• Les topoisomérases II : coupent de manière
transitoire les deux brins de l’ADN, puis les
ressoudent et agissent uniquement sur l’ADN
superenroulé négatif .
C- Structure Tertiaire de l’ADN
• Pour emmagasiner toute la longueur d’ADN
dans le volume restreint d’un noyau, il faut
que chaque molécule d’ADN soit enroulée de
façon serrée autour de molécules de protéines
appelées histones.
Les histones
• Ce sont des protéines très basiques du fait d’un
grand nombre de résidus Arg et Lys dans leur
structure.
• Elles sont riches en charge positive et pourront
établir des liaisons avec les phosphates
• Il existe 5 types principaux : H1, H2A, H2B, H3
et H4.
• Le nucléosome correspond à de l’ADN enroulé
deux fois autour d’un octamère d’histones (deux
exemplaires de chacune des histones H2A, H2B,
H3 et H4), à la façon d’un fil enroulé autour d’une
bobine.
• La 5ème sorte d’histones, H1, ne fait pas partie du
noyau octamérique, mais joue un rôle important
dans la structure du nucléosome. H1 maintient
l’ADN en place en « verrouillant » le nucléosome.
• L’ensemble du nucléosome et de l’histone H1
qui lui est associée est appelé chromatosome.
• (nucléosome + Histone H1)
• L'ensemble (ADN et histones) s'enroule à
nouveau sur lui-même pour former une structure
plus compacte appelée chromatine.
• Chromatine= mélange de protéines appelées
histones et d'ADN (environ moitié-moitié)
• L'ensemble des chromatines forme le
chromosome
• Lors de la mitose ou de la méiose, les fibres de
chromatine s’enroulent et se condensent formant
les entités visibles au microscope, appelées
chromosomes.
• Quand la cellule ne se divise pas, les chromosomes
se déroulent et se décondensent en chromatine
formant un réseau diffus dans le noyau.
• Localisation du centromère, des télomères et
des bras du chromosome
Différents types et état des ADN
• La majeure partie du génome eucaryote est
contenue dans les chromosomes du noyau
(génome nucléaire).
• Cependant, en plus de l’ADN nucléaire,
certains organites cellulaires : mitochondries
et chloroplastes contiennent également un
génome qui leur est « spécifique »
• L’ADN mitochondrial
• Chez la plupart des eucaryotes, l’ADNmt est
circulaire, double brin qui se réplique selon un
mode semi-conservatif et est dépourvu des
protéines caractéristiques de l’ADN
chromosomique eucaryote.
• L’ADN chloroplastique (ADNcp)
• L’ADNcp est circulaire, double brin, répliqué
selon un mode semi-conservatif, mais ne
possède pas les protéines associées à l’ADN
caractéristiques de l’ADN eucaryote
• L’ADN bactérien
• Il correspond à l’ADN des Procaryotes.
• •Non contenu dans un noyau pourvu d’une
enveloppe nucléaire.
• •ADN = 1 seule molécule
• •Circulaire
• •Bicaténaire
• •Structure très condensée
• Exemple : [Link] : ADN = 4.106 pb ; 3.109 Da ;
1,36 mm dans une bactérie d’environ 5 μm de
long
• Structure en superhélices avec des torsades
négatives
• L’ADN des plasmides
• Plasmides = éléments génétiques
extrachromosomiques présents chez de
nombreuses bactéries, porteurs de gènes et
capables d’autoreproduction.
• ADN = bicaténaire, circulaire et de taille
variable
• L’ADN viral
• Les virus ne comportent pas tous de l’ADN
(certains virus portent de l’ARN)
• •La structure la plus courante de l’ADN des
virus à ADN : bicaténaire et circulaire
• Mais il existe aussi des virus à
• •ADN monocaténaire circulaire
• •ADN linéaire
Propriétés physicochimiques de l’ADN
• Solubilité
• L'ADN est un polyanion dont les sels de
sodium sont solubles dans l’eau en formant
des solutions à viscosité élevée.
• Les alcools, et en particulier l'éthanol,
précipitent les molécules d'ADN sous forme
d'agglomérat en longues fibres
• Densité
• - la densité des molécules d'ADN est telle qu'on
peut les séparer par ultracentrifugation dans
des gradients de densité (chlorure de césium)

• L’effet Hyperchrome
• Ce phénomène diminue l'absorption des bases
dans l'ultraviolet .
• Charge
• La charge de ces molécules à pH physiologique
est négative.
• Charge dont la contribution est uniquement
due aux groupements phosphates ( à ce pH,
les bases ne portent aucune charge). Cette
propriété est utilisée pour les séparer par
électrophorèse
• Propriétés spectrales
Ces propriétés optiques sont communément
utilisées pour la détection, le dosage et le
contrôle de pureté d'acides nucléiques.
• Dénaturation et renaturation:
• destruction de la double hélice qui supprime
les interactions entre bases qui retrouvent
leurs propriétés spectrales originales.
• 5’P- A T C G T A -3’OH -----5’P- A T C G T A -3’OH
3’OH - T A G C A T - 5’P
<-------3’OH - T A G C A T - 5’P
• La dénaturation, qui libère chacun des deux
brins d'ADN, est obtenue par destruction des
liaisons hydrogènes soit :
• - par addition d'urée en concentration > 6M
• - par augmentation de la température
• Phénomène d'hystérésis :
• après dénaturation par chauffage, les deux brins
d'ADN sont libres.
• Un refroidissement lent permet un réappariement
des deux brins d'ADN qui aboutit à la double hélice
originale.
• Un refroidissement rapide ne permet pas un
réappariement total des deux brins, seules
certaines régions complémentaires des deux brins
reforment des doubles hélices partielles.
• L'absorption de la molécule aura une valeur
intermédiaire entre celle de la molécule native
et de la molécule dénaturée : phénomène
d'hystérésis.
• Température de fusion : la température de
fusion de molécule d'ADN en double hélice est
dépendante de la composition du pourcentage
de bases G + C.
• Elle est d'autant plus élevée que celui-ci est élevé
• ceci peut s'expliquer par le fait que les
appariements de ces bases fait intervenir trois
liaisons hydrogène alors que les appariements A-
T en font intervenir seulement deux.
ADN chez l’homme
•  Enchainement de 3 milliards de nucléotides
•  1 à 3% de ces séquences représentent
l’information génétique codant la totalité des
protéines
•  Molécules d’ADN double brin pratiquement
indestructible par agents physiques et
chimiques
•  Information transmise par duplication des
molécules d’ADN dans 2 cellules filles
•  Un chromosome humain peut contenir entre
20 et 100 millions de paires de bases.
• Le nombre de chromosomes par cellule est
caractéristique de l'espèce.
• Les cellules humaines contiennent 46
chromosomes chacune
Fonctions Biologiques de l'ADN
 Détenir l'information génétique propre à son
espèce
• l'ordre d'enchaînement des nucléotides
constitue un message, permettant à la cellule
d'assembler dans le bon ordre les acides
aminés de ses protéines.
 Pouvoir se reproduire avec le moins d'erreurs
possibles
• À chaque fois qu'une cellule se divise en deux
cellules, l'information doit être reproduite
intégralement de façon à ce que chacune des
deux cellules obtenues détienne l'ensemble
de l'information qui était dans la cellule de
départ.
 Pouvoir se modifier (mais pas trop)
• L'ADN n'est pas une molécule d'une stabilité à
toute épreuve. Des modifications accidentelles
peuvent modifier le message. Ce sont ces
modifications qui permettent l'évolution.
 Pouvoir être traduit en caractéristiques
physiques
• Le message contenu dans l'ADN doit pouvoir
être « lu » par la cellule. Ce n'est pas tout de
détenir de l'information, mais encore, cette
information doit pouvoir être utilisée, elle doit
pouvoir être traduite en quelque chose de
concret, en protéines dans le cas de l'ADN.

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