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TP1 Intro Microbio English Version

Le document présente une introduction à la microbiologie, définissant les microorganismes et les disciplines associées. Il décrit les objectifs des travaux pratiques, les techniques d'identification des micro-organismes, ainsi que les méthodes de stérilisation. Enfin, il aborde les matériaux utilisés en microbiologie et les différentes méthodes de stérilisation, tant physiques que chimiques.

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TP1 Intro Microbio English Version

Le document présente une introduction à la microbiologie, définissant les microorganismes et les disciplines associées. Il décrit les objectifs des travaux pratiques, les techniques d'identification des micro-organismes, ainsi que les méthodes de stérilisation. Enfin, il aborde les matériaux utilisés en microbiologie et les différentes méthodes de stérilisation, tant physiques que chimiques.

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University of Science and Technology Houari Boumediene

Faculty of Biological Sciences


SNV – L2

Université des Sciences et de la Technologie Houari Boumediene


Faculté des Sciences Biologiques
SNV – L2

TP 1: INTRODUCTION TO MICROBIOLOGY
TP 1: INTRODUCTION A LA MICROBIOLOGIE

Academic year: 2024 - 2025


Année: 2024 - 2025
Introduction
Definitions
Microbiology = is the science that studies small living organisms called
microorganisms, such as bacteria, viruses, and fungi.

-A microorganism or microbe: is a
living organism, invisible to the Petri dish
naked eye, that can only be containing
observed with the help of a microorganisms
microscope.

Test tube with


microorganisms
Définitions
Microbiologie = est la science qui étudie les êtres vivants de petite taille qu’on
appelle des microorganismes. ex : les bactéries, les virus, les champignons.

-Un micro-organisme ou microbe:


est un organisme vivant, invisible à Boite de Pétri
l'œil nu, qui ne peut être observé contenant des
qu'à l'aide d'un microscope. microorganismes

Tube à essai avec


microorganismes
Microbiology includes several disciplines, depending on the type
of « microbe » being studied.
La microbiologie compte plusieurs disciplines, en fonction du type de
«microbe» étudié.
Microbiology TP’s Purpose:
- Familiarize oneself with the microbial world and the equipment used.

- Acquire the techniques used (sterilization, preparation of culture media, identification


of microorganisms).

Among the identification techniques, we mention:

1. Morphological study:

A - Macroscopic morphology (Study of B - Microscopic morphology (Study of the germ):


the colony): Size, shape, color. Shape, grouping pattern.
But des TP de Microbiologie:
- Se familiariser avec le monde microbien et le matériel utilisé .
- Acquérir les techniques utilisées (stérilisation, préparation des milieux de culture,
identification des micro-organismes).

Parmi les techniques d’identification on cite:

1. Etude morphologique

A -morphologie macroscopique (Etude B- morphologie microscopique (Etude du germe):


de la colonie):Taille, Forme, couleur. forme, mode de regroupement.
2. Study of mobility: mobile germ or immobile All these
germ. parameters allow
for the
3. Study of growth temperature. classification of the
Microorganism.
4. Study of respiratory type: aerobic, anaerobic.

• Classification

Kingdom: Bacteria
Phylum: Proteobacteria
Class: Gamma Proteobacteria
Order: Enterobacteriales
Family: Enterobacteriaceae
Genus: Escherichia
Species: Escherichia coli
2. Etude de la mobilité: germe mobile ou germe Tous ces
immobile. paramètres
Permettent de
3. Etude de la température de croissance. donner une
classification au
4. Etude du type respiratoire: aérobie, anaérobie. Microorganisme.

• Classification

Règne: Bacteria
Embranchement: Proteobacteria
Classe: Gamma Proteobacteria
Ordre: Enterobacteriales
Famille: Enterobacteriaceae
Genre: Escherichia
Espèce: Escherichia coli
Important Concepts
Culture: A population of microorganisms growing Microbiocenosis: A
in a nutrient medium. microbial community
coexisting in balance.
Example: Microorganisms in
a natural environment: soil,
ocean, pathological
samples.

Pure or Mixed Culture: The


Monomicrobial growth of multiple
Culture: species of
The culture of a single microorganisms in the
species. same culture medium.
Notions importantes
Culture: est une population de micro organismes micro biocénose: est une
qui poussent dans un milieu nutritif. communauté microbienne
coexistant en équilibre.
Exemple: microorganismes
dans un milieu naturel: sol,
océan, échantillons
pathologiques

Culture pure ou Culture mixte: c’est la


monomicrobienne: croissance de plusieurs
est la culture d’une espèces de micro
seule espèce organismes dans un
même milieu de culture.
Materials used in microbiology:
The equipment used in microbiology is made of Pyrex glass (chemically clean glass). Metals (such
as zinc or copper) are not used because they react with the culture media of microorganisms and
become toxic to them.

[Link] burner: It must operate with a blue flame.


- It provides a sterile manipulation zone of 20 cm.
- It is used for sterilizing small equipment: Pasteur
pipettes, inoculating loops, cotton forceps.

Sterility or protection
zone
Matériel utilisé en microbiologie:
Le matériel utilisé en microbiologie est en verre pyrex (verre chimiquement propre), on n’utilise
pas les métaux (tel que zinc ou le cuivre) car ils réagissent avec les milieux de culture des
microorganismes et deviennent toxiques pour eux.

[Link] bünsen: doit fonctionner avec une flamme bleue.


- Il procure une zone de manipulation stérile de 20cm.
- Il est utilisé pour la stérilisation du petit matériel :
pipette Pasteur, anse à ensemencer, pince à coton.

Zone de protection
ou de stérilité
2. Inoculation instruments:

Spreader or rake:

-Used to spread
microorganisms on the
surface of a solid Swabs
Pasteur pipettes Platinum loop culture medium.

Used for sample collection and inoculation of


microorganisms in liquid or solid media.
2. Les instruments d’ensemencement:

Etaloir ou râteau

-sert à étaler les germes


à la surface d’un milieu
de culture solide Ecouvillons
Pipettes Pasteur Anse de platine
Sont utilisés pour prélèvements et l’ensemencement
des microorganismes en milieu liquide ou solide.
3. Glassware: 3. La verrerie:

Test tubes / Petri dishes /


Tubes à essai Boites de Pétri

Used for liquid and solid culture media / Used for solid culture media /
Servent pour milieu de culture liquide et solide Servent pour milieu de culture solide
Graduated Cylinder
/ Eprouvette

Beaker / Bécher
Volumetric
flask / Fiole jaugée

Funnel / Entonnoir
4. Heavy equipment used: 4. Le matériel lourd utilisé:

Magnetic stirrer
Water bath / with heating plate / Microscope
Bain-marie Agitateur magnétique à Autoclave
plaque chauffante

Precision
Pasteur oven / pH meter / Drying oven or incubator / balance / Balance de
Four Pasteur pH mètre Etuve ou incubateur précision
Sterilization techniques

Techniques de stérilisation
Definitions
- Sterilization: A process that completely eliminates (irreversibly
eradicates) microorganisms (viruses, bacteria, fungi, parasites),
whether they are in their vegetative or spore form.
- Pasteurization: This is not true sterilization. It is used in the
food industry as a preservation method. It only destroys non-
sporulating pathogenic germs, primarily used for milk and
dairy products.
The choice of a sterilization method depends on:
The nature of the substance or object to be sterilized and the
available equipment in the laboratory.
Définitions
- Stérilisation: Procédé permettant l’élimination totale
(éradication totale irréversible) des microorganismes (virus,
bactéries, champignons, parasites), qu’ils soient sous leur forme
végétative ou sporulée.

- Pasteurisation: n’est pas une vraie stérilisation. Elle est utilisée


en industrie agro-alimentaire. C’est un procédé de conservation
des aliments. Elle détruit uniquement les germes pathogènes non
sporulés, utilisée principalement pour le lait et dérivés.

Le choix d’une méthode de stérilisation est en fonction de:


La nature de la substance ou l’ objet à stériliser et de
l’équipement disponible au laboratoire.
Methods of Sterilization
A. Physical Methods
1. Action of 2. Action of heat: [Link]
radiation:
a. Controlled temperature: b. Uncontrolled temperature:
-Solar rays
-UV light Moist heat: Dry heat: Direct heating
-Ionizing Flaming: Bunsen burner
radiation - Boiling - Pasteur oven
- Autoclaving
- Tyndallization

B. Chemical Methods

1. Antiseptics 2. Disinfectants
Méthodes de stérilisation
A. Méthodes physiques
[Link] [Link] de la chaleur [Link]
des radiations
a. T° contrôlée b. T° non contrôlée
-Les rayons
solaires Chaleur humide Chaleur sèche Chauffage direct
-La lumière U.V Flambage: bec Bunsen
-Les rayons - Ebullition - Four Pasteur
- Autoclavage
ionisants - Tyndallisation

B. Méthodes chimiques

1. Les antiseptiques 2. Les désinfectants


1. Sterilization by radiation

1. Stérilisation par les radiations


UV Rays
- UV light, which is most commonly used, is
produced by special lamps: germicidal
lamps.
- UV light inactivates microorganisms by
degrading their nucleic acids.
- Use: Sterilization of more or less enclosed
spaces used for manipulations in sterile
environments, such as operating rooms,
laboratories, and isolation rooms.
- Low penetration rays.
Rayons UV
- la lumière U.V qui le plus souvent utilisée,
ces radiations sont produites par des lampes
spéciales: lampes germicides.

-La lumière UV inactive les microorganismes


par la dégradation de leurs acides
nucléiques.

- utilisation: stérilisation des espaces plus au


moins clos, servant aux manipulations en
atmosphère stérile tels que: bloc opératoire,
laboratoire, bloc d’isolement.

- Rayons peu pénétrants.


Ionizing Rays: X and Gamma

-These are radiations that


penetrate deeply into objects to
be sterilized.

-Very strong penetrating power.

-They pose a danger to those who


handle them.

-Use: Pharmaceutical industry


(bandages), canned food industry.
Rayons ionisants: X et Gamma

-Ce sont des radiations qui


pénètrent en profondeur dans les
objets à stériliser.

- Très fort pouvoir de pénétration.

-Constituent un danger pour ceux


qui les manipulent.

-utilisation: industrie
pharmaceutique (pansements),
industrie de la mise en conserve.
2. Sterilization by heat

2. Stérilisation à la chaleur
Sterilization by Heat
C. Uncontrolled C. Controlled heat
heat
Direct Heating C. Moist C. Dry
- Flaming: Boiling Autoclaving Tyndallization Pasteur Oven:
Passing the 140°/4h or
objects to be 100°/30mn 120°/20 mn under -3 successive
200°/2h
-Destruction steam pressure heatings at 90°/1h,
sterilized -Total eradication of with a 24-hour -Destruction of
through the of vegetative interval.
forms. all germs. both vegetative
blue flame of a -Used for glassware -Used for forms and
Bunsen burner 3 -Used for thermolabile
water, milk, and culture media. spores.
to 4 times. products. -Used for
surgical -Not suitable for -1st day: elimination
instruments. delicate liquid of vegetative forms. glassware and
- Forceps, products (milk, -2nd day: elimination metal
scissors, Pasteur gelatin, albumin- of spores. instruments.
pipettes. -Very limited use for
based media). thermolabile, non- -Not suitable for
filterable substances culture media or
(egg yolk emulsion, plastic objects.
vaccines).
Stérilisation à la chaleur
C. Non contrôlée C. contrôlée
Chauffage direct C. humide C. sèche
- Flambage : Ebullition Autoclavage Tyndallisation Four Pasteur:
passage 3 à 4 fois 140°/4h ou
des objets à 100°/30mn 120°/20mn/pression 3 chauffages
bien 200°/2h
-destruction de vapeur d’eau successifs de
stériliser dans la -éradication totale 90°/1h à intervalle -destruction des
flamme bleue du des formes 24h.
végétatives. de tous les germes. formes
bec bunsen. - Verrerie et milieux - Produits végétatives et
- pinces, ciseaux, - Eau , lait , thermolabiles.
instruments de culture. - 1er jour: élimination
sporulées.
pipettes Pasteur. - Verrerie et
chirurgicaux -Ne convient pas des formes
pour les produits végétatives. instruments
liquides délicats
- 2ème jour: élimination métalliques.
des spores. - Ne convient pas
(lait, gélatine milieux - Utilisation très
albumineux). limitée aux pour les milieux
substances de culture et
thermolabiles non objets en
filtrables (émulsion de plastique.
jaune d'œuf, vaccins)
[Link] at Low Temperature: Room Temperature - Filtration

Filtration: This is a separation process that allows the components of a mixture to be


separated by using a filter. It retains the particles in the mixture that are larger than the
pores of the filter (porosity).

-Used for thermosensitive (thermolabile),


water-soluble, non-acidic, and non-viscous
substances such as vitamins, antibiotics,
and amino acids.

-It is not effective for viruses and toxins.


[Link]érilisation à basse température: température ambiante: filtration

La filtration: est un procédé de séparation permettant de séparer les constituants d'un


mélange par l'utilisation d'un filtre, permet de retenir les particules du mélange qui sont plus
grosses que les trous du filtre (porosité).

-Utiliser pour les substances


thermosensibles
(thermolabiles), hydrosolubles, non acides
et non visqueuses telles que: vitamines,
antibiotiques et acides aminés.

-Elle n’est pas efficace pour les virus et


les toxines.
Microbiological analysis of water by filtration
Analyse µbiologique de l'eau par filtration
B. Sterilization by Chemical Agents
A disinfectant: A chemical product Antiseptics: A disinfectant for bodily
that kills or inactivates use; it is a substance that kills or
microorganisms such as bacteria and prevents the growth of bacteria,
viruses on inert surfaces, such as fungi, and viruses (microorganisms)
medical equipment and surfaces on external surfaces of the body,
(floors, walls, door handles, such as Dakin’s solution, hydrogen
stretchers, ambulances, peroxide.
workbenches, etc.).
B. Stérilisation par des agents chimiques
Un désinfectant: est un produit - Antiseptiques: est un désinfectant
chimique qui tue ou inactive des à usage corporel ; c'est une
micro-organismes, tels les bactéries, substance qui tue ou prévient la
virus sur des surfaces inertes telles croissance des bactéries,
que le matériel à usage médical et champignons et des virus (micro-
des surfaces (sols, murs, , poignées organismes) sur les surfaces
de porte, brancards, ambulance, externes du corps, tel que: dakin,
paillasse, etc.) eau oxygéné.

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