Les acides ribonucléiques
A.R.N.
1. Structure des ARN
1.1. Structure primaire :
1.1.1. composition :
– Polymères de ribonucléotides
– Liaisons : 3'-5' phosphodiester.
– Ose = -D-ribofuranose
– Phosphate
– Bases =
Bases majeures :
NH2 NH2 O
O
N N
N HN N HN
N H2N N N N N
N H O O H
H H
adénine guanine cytosine uracile
1.1.2. masse moléculaire :
• 25 000 à plusieurs millions de Da
• Grande variété
1.1.3. La liaison phosphodiester
•Structure monocaténaire
•La chaîne est vectorisée : 5’ vers 3’
•Le squelette covalent (ose-P)n porte les bases
•La molécule est un polyanion
•La variété des bases est réduite
1.2. Structure secondaire :
1.2.1. conformation en double-hélice :
1.2. Structure secondaire :
1.2.2. les motifs élémentaires :
1.3. Structure tertiaire :
Des régions secondaires plus ou moins distantes (dans un plan en 2
dimensions) d’une molécule d’ARN peuvent interagir entre elles et
entraîner un repliement dans l’espace de la molécule.
Ces interactions peuvent être :
• Des liaisons H entre bases complémentaires de régions non
appariées
• Des interactions entre bases modifiées
• Entre atomes du squelette ribose-phosphate
• Entre bases et atomes du squelette ribose-phosphate
• Exemples :H du OH du 2’ du ribose et O du groupe phosphate
• Les molécules d'ARN peuvent exister sous plusieurs conformations
réversibles dépendantes des conditions de milieu : Mg 2+, protéines,
peptides…
2. Les différents types d’ARN
2.1. les ARN messagers
2.1. les ARN messagers
2.1.1. caractéristiques générales
•copies de gènes de l’ADN.
•leur séquence en bases détermine la séquence en
acides aminés de la protéine.
•possèdent des séquences nécessaires au mécanisme de
la traduction et à sa régulation.
•faible pourcentage des ARN cellulaires : 2 à 4%
•durée de vie relativement courte :
•1 à 2 minutes chez une bactérie
•plus long chez les organismes supérieurs (quelques
heures à 24 h)
•taille des ARNm très variable :
•dépend de la taille de la protéine à traduire.
2.1.2. Structure
Polyribonucléotides monocaténaires. (107 Daltons)
Cas particulier des ARNm des eucaryotes :
Les ARNm des eucaryotes possèdent
•A leur extrémité 5’, un groupement méthyl-7-guanosine
monophosphate appelée « coiffe en 5’ » ou structure CAP (chaperon)
•A l’extrémité 3’, une « queue polyA » par fixation d’une chaîne de
résidus adénosine (de 50 à 250)
Met-7-G-Ribose-5'-O-P-P-P-O-5'-Ribose-P---------------------------3'A-A-A-A---------------A-AA
Rôles :
*protection de l’ARNm des 3’ et 5’ vis-à-vis des exonucléases
*Régulation de la traduction
2.1.2. Structure
Structure CAP des ARN m eucaryotes
2.2. les ARN transfert
• 2.2.1. Caractéristiques générales
• Taille : 70 à 90 nucléotides seulement ( 30000 Da)
• Chaque ARNt est spécifique d’un acide aminé
• 70 ARNt différents , plusieurs ARNt portent le même AA,
ARNt isoaccepteurs.
• Ils diffèrent entre eux au niveau de leur séquence
nucléotidique mais ils peuvent avoir soit :
– Le même anticodon
– Des anticodons différents mais qui correspondent au même AA (car plusieurs
codons du code génétique codent pour le même AA (“ dégénérescence du code
génétique ”)
• Ils représentent 15% de l’ARN total
2.2. les ARN transfert
• 2.2.1. Caractéristiques générales
• Ils comportent des nucléotides rares, inhabituels :
– Bases méthylées (méthylG, méthylC)
– Bases rares (T !, dihydrouracile)
– Liaison base-ribose inhabituelle : comme dans la
pseudouridine où le C1’ du ribose est lié au C5 de l’U
au lieu du N1)
• .
2.2.2. Structure secondaire en “feuille de trèfle”
Schéma de l'ARNt : α,anti-codon (3
nucleotides) ; β,site de fixation de
l'acide aminé ; γ, boucle variable ; δ,
branche D ; τ, Branche T ; A, Boucle
de l'anticodon ; D, Boucle D ; T,
Boucle T
2.2.3. Structure tertiaire en “L” des ARNt
Structure tertiaire en L
2.3. Les ARN ribosomiques
Structure secondaire d’un ARNr 16 S de procaryote
2.4. les ARN stables:
• Les cellules eucaryotes contiennent des ARN stables
liés à des protéines (RNPsn) . Ils sont présents surtout
dans le noyau n de nombreuses copies (105 à 106
copies/cellules). Ils sont appelés SNURPS (small nuclear
ribonucleoprotein particles). Ils interviennent dans les
modifications posttranscriptionnelles des ARNm.
(fabrication des polyA, enlèvement des introns).
• Les ARNsn ont une activité catalytique (ribozymes), ils
coupent les ARNhn pour libérer les introns et soudés les
exons.
3. Propriétés des ARN
• Propriétés physiques et chimiques
• Dénaturation thermique
• Hydrolyse des ARN :
– Acide
– Alcaline
– Enzymatique
