ACIDES NUCLEIQUES ET
BIOSYNTHESE DES
PROTEINES
NUCLEOTIDES /
NUCLEOSIDES
Les bases azotées
Il existe cinq types de bases azotées réparties en
deux grandes catégories:
Les purines.
Les pyrimidines.
Les sucres (Oses)
Les sucres (Oses)
Il s'agit du ribose avec les
caractéristiques suivantes :
- L'énantiomère est de la série D
- L'ose est sous forme furane
- L'anomère est en conformation
β
Les nucléosides
Les nucléosides résultent de la condensation d'un
ose (ribose) avec base azotée.
Les nucléosides
Liée de manière covalente via
une liaison N-osidique entre
l’un de ses azotes et le carbone
1′ du ribose.
Les nucléosides
La nomenclature:
Les noms des nucléosides ont comme suffixe :
- "osine" pour les nucléosides puriques
- "idine" pour les nucléosides pyrimidiques
Les nucléosides
Les nucléotides
Les
nucléotides sont des nucléosides
phosphorylés en position 5′ du pentose.
Les nucléotides
Les nucléotides
Les nucléotides
Trois phosphates peuvent être fixés.
Le 1er phosphate est lié au (désoxy) ribose par une
liaison phosphoester, ce qui donne: - Un
nucléoside monophosphate. - Un
nucléoside diphosphate -
Un nucléoside triphosphate
Les nucléotides
Les nucléotides
Les nucléotides
La liaison formée entre deux phosphates est une
liaison anhydre (très riche en énergie).
Les nucléotides
• L’ATP ou adénosine triphosphate : est la molécule
centrale du métabolisme énergétique.
STRUCTURE DES ACIDES
NUCLÉIQUES
Les acides nucléiques
•Les deux types d'acides nucléiques sont :
- ADN = acide désoxyribonucléique
- ARN = acide ribonucléique
Les acides nucléiques
Les acides nucléiques sont des enchaînements de
nucléosides 5'-phosphates (nucléotides) dont
l'assemblage est réalisé par une liaison
phosphodiester.
Structure de l’ADN
Structure de l’ADN
Structure de l’ADN
Les nucléotides sont associés par paire de l’ADN
-Une Adénine est associée à une Thymine -
Une Cytosine est associée à une Guanine
Structure en double hélice
l’ADN
Structure de l’ADN
La composition en bases
- Quelle que soit l'origine de l'ADN, le nombre de
purines est toujours égal au nombre de
pyrimidines : A + G = T + C
Structure de l’ADN
La composition en bases
- De plus, les bases sont telles que :
A = T et G = C
Structure de l’ARN
Structure de l’ARN
L’ARN ou acide ribonucléique est constitué d’un
seul brin, formé par l’enchaînement de 4
nucléotides différents.
Structure de l’ARN
Chacun de ces nucléotides est formé:
-D’une molécule d’ose (le ribose) -
D’une molécule d’acide phosphorique
-D’une base azotée : A, C, G, U.
Structure de l’ARN
La réplication de l’ADN
La réplication de l’ADN
- La réplication est le processus par lequel la
cellule copie son ADN avant de se diviser.
- Ce mécanisme est nécessaire pour la
transmission du matériel génétique aux cellules
filles.
Mécanisme de réplication de l’ADN
-La réplication débute par la séparation des deux
brins de l’ADN.
-L’ADN est déroulé en un point précis appelé :
Origine de la réplication
Mécanisme de réplication de l’ADN
Mécanisme de réplication de l’ADN
-La double hélice de
l’ADN est déroulée par
une enzyme l’hélicase.
Mécanisme de réplication de l’ADN
Chacun des 02 brins d’ADN joue le rôle de
modèle pour former un brin
complémentaire.
Mécanisme de réplication de l’ADN
La synthèse des 02 brins d’ADN se déroule
de façon bidirectionnelle et simultanée
Mécanisme de réplication de l’ADN
Le mécanisme de réplication est différent pour
chacun des brins, car les 02 brins sont
antiparallèles
Mécanisme de réplication de l’ADN
-L’initiation
La réplication ne peut se faire qu’avec une amorce
(primer) constituée par
un petit fragment d’ARN synthétisé par une ARN
polymérase (ou primase).
Mécanisme de réplication de l’ADN
Mécanisme de réplication de l’ADN
Les amorces doivent être supprimées avant la fin de
la réplication.
Les lacunes temporairement créées sont comblées
par l’ADN.
Mécanisme de réplication de l’ADN
L’enzyme responsable de la synthèse de l’ADN est
une ADN polymérase.
Mécanisme de réplication de l’ADN
Mécanisme de réplication de l’ADN
La terminaison :
Correspond à l’arrêt de la réplication lorsqu’une
fourche rencontre un signal de terminaison de la
réplication.
Mécanisme de réplication de l’ADN
La terminaison :
Les 02 molécules filles sont séparées grâce à l’action
des topoisomérases
Mécanisme de réplication de l’ADN
Les caractéristiques de la réplication
Semi-conservatrice
L’ADN se réplique selon un mode semi conservatif.
Chaque cellule synthétisée présente un brin
parental et un brin néo synthétisé.
Les caractéristiques de la réplication
Les caractéristiques de la réplication
Les caractéristiques de la réplication
Orientée :
Chaque brin parental est lu dans le sens 3’---5’ et sert
de matrice à la synthèse d’un brin complémentaire et
antiparallèle, appelé brin fils synthétisé dans le sens
5’---3’.
Les caractéristiques de la réplication
Bidirectionnelle
: La synthèse des 02 brins d’ADN se
déroule dans des directions opposées.
Les caractéristiques de la réplication
Semi discontinue : avec la synthèse d’un brin
précoce et d’un brin tardif
Mécanisme de réplication de l’ADN
Brin précoce (de 5’à 3’): La réplication est continue
Brin tardif (de 3’ à 5’): est synthétisé sous forme de
petits fragments appelés : fragments d’Okasaki.
Mécanisme de réplication de l’ADN
Chaque brin parental est lu dans le sens 3’…5’
Chaque brin fils, synthétisé dans le sens 5’…..3’
L’expression de l’information
génétique
L’expression de l’information
génétique
Notions générales
Lesinformations nécessaires pour fabriquer une
protéine sont codées dans un gène de l’ADN.
Notions générales
Le gène est constitué d’un ensemble de génons : des
triplets de nucléotides ADN
Notions générales
Notions générales
Legène est délimité des gènes voisins par des génons
de départ et d’arrêt.
Notions générales
Notions générales
Notions générales
Gènes de structure est une portion d’ADN qui code
pour la fabrication d’une protéine de structure.
Notions générales
Notions générales
Ilexiste d’autres gènes que les gènes de
structure. Ceux qui codent pour des protéines
fonctionnelles.
Remarque
L’expression génétique n’est jamais totale dans une
cellule donnée :
les cellules matures sont différenciées : chacune
n’exprime que les gènes « dont elle a besoin » :
L’expression de l’information
génétique
Définition : L’expression génétique est la fabrication
par la cellule d’une protéine donnée, en suivant
l’information génétique portée par un gène de
l’ADN.
L’expression de l’information
génétique
La synthèse des protéines, se fait en deux étapes :
- Transcription « dans le noyau »
- Traduction « dans le cytoplasme »
LA TRANSCRIPTION
LA TRANSCRIPTION
Définition : la transcription de l’ADN est la
fabrication, dans le noyau, d’une molécule d’ARN-
messager, dont les nucléotides (A, U,C,G), sont
complémentaires de ceux du brin transcrit de l’ADN.
LA TRANSCRIPTION
Elle dépense de l’énergie, nécessite des « matières
premières » : nucléotides.
LA TRANSCRIPTION
- Elle nécessite l’intervention d’une enzyme : L’ARN
polymérase
LA TRANSCRIPTION
Signaux d’initiation:
-30 pb= boite TAATA
-70 pb = CAAT
Signaux de terminaison :
Séquence de 6 pb à la fin du gène, reconnue par l’ARN
endonucléase
LA TRANSCRIPTION
Initiation:
L’initiation de la transcription par l’ARN
polymérase est assurée par des facteurs
transcriptionnels qui s’assemblent sur une région
en amont du gène à transcrire qui porte le nom de
promoteur
LA TRANSCRIPTION
LA TRANSCRIPTION
Signal d’initiation = promoteur
Site sur l’ADN d’une centaines de bases auquel
l’ARN polymérase se fixe pour commencer la
transcription.
*Promoteur n’est pas transcrit.
LA TRANSCRIPTION
LA TRANSCRIPTION
L’élongation:
L’ARN polymérase se déplace ensuite le long de l’ADN
dans le sens 3’… 5’ en ouvrant une partie de la molécule
d’ADN par déroulement de la double hélice sur une
courte distance (la boucle de transcription)
La chaine ARNm s’allonge dans le sens 5’…3’
LA TRANSCRIPTION
L’élongation:
L’ADN lu se recombine immédiatement après la
lecture.
LA TRANSCRIPTION
La terminaison:
La terminaison de la transcription est encore mal
connue.
L’ARN polymérase continue à transcrire jusqu’à ce
qu’elle rencontre des sites localisés dans la nature
est peu connue.
En résumé
En résumé
En résumé
LA TRANSCRIPTION
La transcription de l’ADN (chez les eucaryotes)
produit :
- De nombreux ARN messager (un
pour chaque protéine différente)
- Un ARN ribosomique
- Des ARN de transfert .
LA TRANSCRIPTION
Étapes nucléaires :
-Transcription intégrale du gène (exons + introns)
Étapes cytoplasmiques :
Maturation du pré-ARNm
Épissage = coupure et élimination des introns
LA TRANSCRIPTION
-Les exons = séquences codantes
-Les introns = séquences non codantes
- L’épissage consiste à enlever les introns et
recoller les exons
LA TRANSCRIPTION
L’épissage est catalysé par le snRNP (small
nuclear ribonucleotides particles).
LA TRANSCRIPTION
Caractéristiques d’une molécule d’ARN :
- Exemple : fraction d’ADN : …
TACAAGGACACC … brin transcrit
…ATGT T CC T GT GG … brin non transcrit
écrire la fraction d’ARN-messager correspondant
LA TRADUCTION
LA TRADUCTION
Définition : La traduction est la synthèse d’un
polypeptide à partir de l’ARNm.
Remarque : c’est « l’étape cytoplasmique » de la
synthèse d’une protéine.
LE CODE GENETIQUE
Universel (c’est le même pour tous les êtres vivants)
Répétitif = redondant = dégénéré : on peut obtenir
parfois le même acide aminé à partir de plusieurs
codons différents.
LA TRADUCTION
- La constitution des liaisons peptidiques nécessite de
l’énergie.
ETAPES DE TRADUCTION
Initiation :
-ARNm se fixe à un ribosome, composé d'une petite
sous-unité et d'une grande sous-unité, qui va
assembler une séquence d'acides aminés, selon le
(code Génétique)
Le code génétique
Chaque codon (groupe de 3 nucléotides de l'ARNm)
correspond à un acide aminé.
LA TRADUCTION
Sauf 3 codons (codons-stop)
UAA, UGA, UAG, qui provoquent l'arrêt de la
traduction.
LA TRADUCTION
- Le codon AUG, appelé codon-initiateur, va
permettre de commencer la traduction,
Correspond à l'acide aminé méthionine, qui se
détachera plus tard de la chaîne polypeptidique
ETAPES DE TRADUCTION
Elongation :
-Le ribosome se déplace dans le sens 5….3 -
La protéine sera formée en commençant par
l'extrémité N-terminale et en terminant par
l'extrémité C-terminale.
LA TRADUCTION
Un même ARN-messager est traduit successivement
au niveau de plusieurs ribosomes, qui constituent
ensemble un polysome. Les protéines fabriquées sont
bien sûr identiques.
LA TRADUCTION
TRADUCTION
Bien que la protéine est constituée au départ d’une
simple suite d’acides aminés, elle
n’est fonctionnelle qu’après avoir une structure
tridimensionnelle.
Propriétés physico-chimiques de l’ADN
La dénaturation
La dénaturation de l’ADN s’obtient par
déstabilisation des liaison hydrogènes entre les
bases azotées.
Ceci provoque la dissociation de la structure
double hélice et la séparation des deux brins.
La dénaturation
Cette déstabilisation est provoquée par:
Augmentation de la T°
pH alcalin (dénaturation alcaline)
Agent chimique (urée), Formamide
La dénaturation
La renaturation
Larenaturation de l’ADN est la réassociation des
deux brins d’ADN qui ont été séparés par
dénaturation (mm brins)
La renaturation
La température de fusion
= la T° de fusion
Elle représente la T° à laquelle 50% des liaisons
hydrogènes sont déstabilisée: on parle de DNA
demi-dénaturé
La température de fusion
Il faut noter que la valeur de la température de fusion
Tm est d'autant plus élevée que le pourcentage de
bases G+C est grand
La température de fusion
Propriétés spectrales
- Le spectre d'absorption de l'ADN n'est pas identique
à celui du même ADN dénaturé par la chaleur
(chauffage à 100°C) ou par l'urée ou encore à pH très
alcalin.
Propriétés spectrales
L'ADN dénaturé a une absorption à 260 nm plus élevée
que l'ADN double brin.
La charge
La charge de l’ADN à pH physiologique est négative
et directement proportionnelle à leur longueur (nb de
nucléotides).
Cette propriété est utilisée pour les séparer par
électrophorèse.
La Solubilité
-L’ADN est un polyanion soluble dans l’eau
en formant des solutions à viscosité élevée.
-Les alcools et en particulier l’éthanol,
précipitent les molécules d’ADN sous forme
agglomérats en longues fibres
La densité
La densité des molécules d'ADN est telle
qu'on peut les séparer par
ultracentrifugation.