1.

2 – Taxinomie et
diversité

SBI 3U

Dominic Décoeur
p. 10 - 25
Introduction à la taxinomie

Taxinomie = science de la classification

Unité de la classification = espèce

• Actuellement ~ 1,5 millions d'espèces connues

• Il y en aurait en tout entre 10 et 40 millions

Dès le XVIIe siècle on a senti le besoin de "classer" les espèces, de

les regrouper en fonction de certains critères
Carl von Linné (1707 – 1778)
Naturaliste suédois qui a établi le système
de classification encore utilisé aujourd'hui.

Dans le système de Linné, les

organismes vivants sont regroupés en
catégories de plus en plus vastes
imbriquées les unes dans les autres.

Linné regroupait les organismes en fonction de leurs ressemblances

anatomiques. Aujourd’hui, on tente de regrouper dans les mêmes
catégories les organismes qui ont une origine évolutive commune.
La hiérarchie des groupes

Chaque catégorie
=
Taxon

Afin de bien marquer les différents

degrés de ressemblance, les
scientifiques ont subdivié chaque
règne en une série de catégories
de plus en plus réduites.
La hiérarchie des groupes

• Plusieurs genres semblables forment une familles

• Plusieurs familles semblables forment un ordre

• Plusieurs ordres semblables forment une classe

• Plusieurs classes semblables forment un embranchement

• Plusieurs embranchements semblables forment un règne

Taxon Exemple Organismes compris dans
le taxon
Règne Animaux Abeille, requin, cheval,
huître, grenouille, chien,
couguar, lynx du Canada,
lynx roux

Embranchement Cordés Requin, cheval, grenouille,

chien, couguar, lynx du
Canada, lynx roux

Classe Mammifères Cheval, chien, couguar,

lynx du Canada, lynx roux
Ordre Carnivores Chien, couguar, lynx du
Canada, lynx roux
Famille Félidés Couguar, lynx du Canada,
lynx roux
Genre Lynx Lynx du Canada, lynx roux
Espèce Lynx canadensis Lynx du Canada
Espèce Lynx rufus Lynx roux
Règne

Embranchement (ou phylum)

Classe
On peut aussi ajouter
des sous-catégories.
Ex. Super-classe,
Ordre sous-classe, sous-
embranchement, etc.
Famille

Genre

Espèce

Chaque espèce est nommée en utilisant le

nom de son genre et le nom de l’espèce
proprement dite = nomenclature binômiale
Règne Animal

Embranchement des Chordés

Classe des Oiseaux

Ordre des Passériformes

Famille des Turdidés

Genre Turdus

L'espèce à laquelle Espèce : Turdus

appartient l’organisme migratorius
est nommée en
combinant le nom du
Merle d'Amérique genre et le nom de
l'espèce proprement
dite.
Règne Végétaux

Embranchement des Trachéophytes

Classe des Angiospermes

Ordre des Térébinthales

Famille des Acéracés

Genre Acer

Espèce : Acer
saccharum

Érable à sucre
Règne Animal

Embranchement des Chordés

Classe des Mammifères

Ordre des Primates

Famille des Hominidés

Genre Homo

Espèce : Homo
sapiens
La nomenclature binomiale
Dans le système de Linné, chaque espèce est désignée par le nom les
deux derniers taxons : Genre et Espèce

• S'écrit en italique (ou souligné)

• Genre avec Majuscule
• espèce avec minuscule
Canis lupus = loup

Ex. Canis latrons = coyote

Canis domesticus = chien

Felis domesticus = chat

Le fait que le loup, le coyote et le
chien portent le nom Canis indique Ursus americanus = ours
qu’ils appartiennent au même genre et
qu’ils se ressemblent beaucoup.
Si l'espèce a déjà été mentionnée dans l'article, on peut écrire
seulement l'initiale du genre.

C. lupus
H. sapiens
Ex. U. americanus

Si on peut identifier le genre, mais pas l'espèce précise, ou si on veut

parler du genre en général, on peut écrire : Genre sp.

Ex. Canis sp.

Ursus sp.
Homo sapiens

 Homo = nom de genre

 Signifie « homme »
 sapiens = nom d’espèce
 Signifie: intelligent, sage, raisonnable
ou encore prudent.

Parmi les Hominidés actuels, il se

distingue d’un point de vue physiologique
par sa bipédie, son cerveau plus
volumineux et son système pileux moins
développé

Identifié par Linné (1758)

La subdivision des règnes

Il existe plusieurs subdivisions dans un Règne.

 Le cheval ressemble plus au chien qu’au requin (le

cheval et le chien sont des mammifères; le requin est
un poisson).

 Le cheval ressemble plus au requin qu’à l’huître (le

cheval et le requin sont des vertébrés; l’huître est un
invertébré).
Devoirs

 p.396
(2, 3, 5, 6)
Diversité des organismes vivants

 Les espèces sont différentes entre elles. Cependant,

on trouve aussi des différences entre les individus
d’une même espèce (p. ex., l’humain).

 La diversité vient :
 des mutations génétiques;

 de la combinaison de chromosomes lors de la méiose;

 de la sélection naturelle.
La sélection naturelle

Cette théorie correspond à un tri des individus les plus aptes à survivre
ou à se reproduire, quelle que soit la raison pour laquelle ils possèdent
une telle aptitude. Elle repose sur 3 principes.

1. Principe de variation : les individus diffèrent les uns des autres.

2. Principe d’adaptation : les individus les plus adaptés au milieu

survivent et se reproduisent davantage.

3. Principe d’hérédité : les caractéristiques avantageuses doivent être

héréditaires.
Le degré de parenté

 Afinde savoir si certaines espèces ont des

liens de parenté, on vérifie :

 l’anatomie;

 l’embryologie;

 la biochimie;

 l’ADN.
 Anatomie : la disposition des structures
osseuses

 Par exemple, la plupart des scientifiques pensent que

les oiseaux sont descendants des dinosaures.

 Les structures biologiques qui ont la même origine

évolutive sont dites homologues.

 Les organes devenus inutiles ou peu utiles, mais qui

sont encore présents sont appelés “organes
vestigiaux” (p. ex., les muscles des oreilles, le
coccyx, l’appendice, le mécanisme de la “chair de
poule”).
Structures homologues des membres antérieurs
des Mammifères

Baleine Chauve-souris Cheval Humain

Différents groupes de vertébrés possèdent des os similaires, ce qui

laisse croire qu’ils ont le même ancêtre.
Structures homologues des membres antérieurs
des Mammifères
 Embryologie : la comparaison des êtres vivants aux
premiers stades du développement embryonnaire

Poisson

Oiseau

Porc

Homme

http://www.pbs.org/wgbh/nova/odyssey/clips/
Ainsi, on peut découvrir entre des espèces des relations impossibles à
observer chez des organismes adultes.
Biochimie : l’étude de la composition des
protéines.

 Les
protéines qui forment un organisme sont
déterminées par les gènes.

 Ainsi,on peut déceler les ressemblances et

les différences génétiques entre des
organismes en comparant la séquence
d’acides aminés.

 Plus
la séquence est rapprochée, plus les
organismes ont un lien de parenté.
Comparaison d’une protéine présente chez plusieurs vertébrés
La biochimie : un exemple concret

On pensait autrefois que le cobaye (à gauche) était un

rongeur, comme la souris (à droite). Les résultats des
études moléculaires ont cependant obligé les
scientifiques à placer le cobaye dans un taxon propre.
La biochimie : un exemple concret

La limule (à droite) est plus étroitement apparenté aux

araignées modernes et à un animal disparu appelé
“trilobite” (à gauche) qu’aux crabes.
L’analyse de l’ADN : le prélèvement des
échantillons d’ADN.

 L’analysede l’ADN est une méthode qui

consiste à séparer les brins, puis à mêler un
brin d’un échantillon avec un brin de l’autre.
L’ADN : un exemple concret

Macaque 93% Être humain 98% Chimpanzé

Chez l’être humain et le macaque, 93% des gènes sont les mêmes. Dans le
cas de l’humain et du chimpanzé, 98% des gènes sont les mêmes.
La phylogénie

 Placer les espèces dans divers taxons, c’est émettre une

hypothèse sur l’évolution des organismes en se basant sur :

 un ancêtre commun;

 le caractère de l’ancêtre et les nouveaux caractères

dérivés de l’évolution.

 L’étude de la phylogénie nous permet :

 d’étudier la transmission de maladie chez divers espèces;

 de répondre à des grandes questions sur l’évolution et

l’extinction de certaines espèces.

 On représente l’évolution à l’aide d’un arbre phylogénétique.

Un arbre phylogénétique

Cet arbre phylogénétique représente les relations entre diverses

espèces de mammifères herbivores
Ces espèces sont différentes, mais elles se ressemblent.

Quels sont leurs liens de parenté?

Raton laveur Petit panda Ours Panda

Cet arbre phylogénétique représente les liens de parenté entre les
pandas, les ours et le raton laveur.
Le cladogramme

 C’estun diagramme ramifié semblable à un

arbre phylogénétique.

 Cependant,on l’utilise afin de vérifier des

hypothèses opposées.
Exemple 1
Les espèces A, B, C et D descendent toutes d’un même ancêtre, Y. Elles
en ont toutes hérité certains caractères primitifs.
Plus tard, au point 3, une des
espèces s’est divisée en deux
nouvelles espèces, C et D. Ces
espèces ont en commun un
ensemble de caractères dérivés.

A B C D

2 3
Plus tard, au point 2, une
des espèces s’est
divisée en deux
nouvelles espèces, A et
B. Ces espèces ont en
1
commun un ensemble À l’origine, l’espèce ancestrale Y
de caractères dérivés. s’est divisée en deux espèces au
point 1. Chaque espèces fille
présente des caractères dérivés
Y particuliers qui les distinguent
l’une de l’autre.
Exemple 2
L M N

La position des espèces et des branches de ce cladogramme

montre que :

• les trois espèces ont le même ancêtre;

• l’espèce L a divergé la première au point 1;
• les espèces M et N ont divergé au point 2;
• les espèces M et N sont les plus étroitement apparentées
Une comparaison de caractères communs
chez trois organismes vivants

Organismes Caractères comparés

Nombre de Nombre d’os de la Présence d’une
doigts mâchoire inférieure queue
Grenouille 5 Plus de 1 Non
Cheval 1 1 Oui
Humain 5 1 Non
Le cladogramme à l’aide du codage

Caractères analysés Code Organisme

Nombre de doigts Cinq 0 Grenouille, humain
Un 1 Cheval
Nombre d’os de la Plusieurs 0 Grenouille
mâchoire Un seul 1 Cheval, humain
inférieure
Présence d’une Présence 0 Cheval
queue Absence 1 Grenouille, humain

Ainsi, la grenouille obtient le code 001, le cheval 110 et l’humain 011.

Le cladogramme suivant tient compte du nombre d’organismes
analysés.

À chaque embranchement, on inscrit le nom d’un organisme et son

code. Ensuite, on note le nombre de modifications nécessaires pour
passer d’un code à l’autre
Cladogramme A

Cheval Grenouille Homme

110 001 011

0 1
001

2 1
000
Cladogramme B

Grenouille Homme Cheval

001 011 110

1 1
010

1 1
000
Cladogramme C

Homme Grenouille Cheval

011 001 110

1 2
000

2 0
000
Résumé....

On retient toujours le ou les cladogrammes qui

présentent le moins de modificatins.

Les cladogrammes A et B comprennent un total de

quatre modifications. Le cladogramme C en
contient cinq.

Donc, on retiendra les cladogrammes A et B

puisqu’ils présentent le moins de modifications.
1a. Corps en forme d’étoile avec plusieurs bras …………....................2
1b. Corps pas en forme d’étoile………………................................… 4

2a. Nombre de bras égal à 5……………..………..................…..…….3

2b. Nombre de bras supérieur à 5…………......................…...……...Soleil

3a. Longueur des bras moins de 3 fois la largeur du disque central .Astérie
3b. Longueur des bras plus de 3 fois la largeur du disque central… Ophiure

4a. Corps recouvert d’épines pointues……………..................…….Oursin

4b. Corps non-recouvert d’épines pointues …................……................5

5a. Corps allongé.........................................................................Holothurie

5b. Corps en forme de disque aplati............................................Clypéastre
Clypéastre Ophiure Holothurie

Astérie Oursin Soleil

Devoirs

 p. 15
(1, 2, 3, 4)

 p. 18
(1, 3, 6, 7, 8, 10)

 p. 21
(8, 9, 11, 12)

 p. 25
(1, 3, 5, 6, 7)