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Generic 50800868

Le document présente les méthodes de collecte de données sur la biodiversité dans le cadre du projet BIOTA, en mettant l'accent sur l'harmonisation des techniques par groupe taxonomique. Il décrit les approches d'échantillonnage, notamment aléatoire, systématique et stratifié, pour évaluer la végétation et d'autres communautés biologiques. Les objectifs incluent la collecte de données fiables pour la recherche et la validation de modèles sur la dynamique de la végétation et les changements climatiques.
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Le document présente les méthodes de collecte de données sur la biodiversité dans le cadre du projet BIOTA, en mettant l'accent sur l'harmonisation des techniques par groupe taxonomique. Il décrit les approches d'échantillonnage, notamment aléatoire, systématique et stratifié, pour évaluer la végétation et d'autres communautés biologiques. Les objectifs incluent la collecte de données fiables pour la recherche et la validation de modèles sur la dynamique de la végétation et les changements climatiques.
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10 Méthodes de collecte des données

de terrain pour l’évaluation et le suivi


de la biodiversité
Field methods for biodiversity
assessment and monitoring
La biodiversité et ses composantes sont bien complexes à appréhender de manière analytique que ce
soit au niveau local, national ou régional, et leur évaluation nécessite diverses techniques d’études et
de suivi faisant appel à diverses disciplines scientifiques. Dans le cadre du projet BIOTA, les méthodes
d’études ont été harmonisées par groupe taxonomique et elles ont été utilisées par les différents grou-
pes de recherche qui ont participé au projet sur leurs sites de travail respectif. Ce chapitre présente ces
méthodes et autres techniques utilisées sur le terrain pour évaluer et suivre la biodiversité à différents
niveaux écologiques (espèce, population, écosystème, paysage). Un accent particulier est accordé aux
plantes, fourmis, termites, poissons, amphibiens et chauves souris.

Biodiversity and its components are highly complex at local, national and regional scales, and
their assessment requires different techniques of studies and monitoring from scientific dis-
ciplines. In the frame of the BIOTA research project, methods have been harmonized for each
taxonomic group studies conducted in different sites by different research teams. This chapter is
designed to present such methods and techniques used in the field to assess and monitor bio-
diversity at different scales of ecological organization (species, population, ecosystem and land-
scape level). Particular emphasize is given to plants, ants and termites, fishes, amphibians, and
bats.

Fig. 10.0: La méthode d’échantillonnage par boîtes est le meilleur moyen d’évaluer de façon quantitative les
communautés de tétards résidant dans les étangs et les flaques d’eaux. | The box sampling method is the
best way to quatitativelöy assess tadpole communities in ponds and puddles. MMO
10: Methodes | Methods

représentatifs de l’ensemble de la zone d’étude sur la base de plans

10.1
d’échantillonnage variables.
Collecte des données sur les
plantes Il existe principalement trois types d’échantillonnage :
„„ L’échantillonnage aléatoire qui est basé sur un choix au hasard
des sites d’observation;
Adjima Thiombiano La végétation est l’une des caractéristiques majeures de la biogéo- „„ L’échantillonnage systématiquek qui consiste à quadriller la
Karen Hahn-Hadjali graphiek et se définit comme étant l’ensemble des communautés zone d’étude puis à sélectionner les sites sur la base d’un pas éta-
Annick Koulibaly végétales renfermant la florek qui consiste en une liste de toutes les bli (ou distance fixe entre les sites);
Brice Sinsin espèces végétales d’une région donnée. Recueillir des informations „„ L’échantillonnage stratifié qui consiste à classifier d’abord en dif-
sur la végétation contribue à résoudre les problèmes écologiques férents types de formations puis à choisir à l’intérieur de chaque
liés par exemple à la conservation biologique ou même à prendre type un échantillon pris au hasard ou de manière systématique.
des mesures d’aménagement de certains milieux. Cela peut égale-
ment servir de base pour prédire les changements futurs. Dans le cadre de BIOTAk, nous avons surtout privilégié l’échan-
Dans le but d’obtenir une information juste de la végétation d’une tillonnage stratifié qui permet à toutes les communautés d’être pri-
région, il est nécessaire de mener à la fois des travaux de terrain et ses en compte et de rendre les observations plus fiables. Les obser-
des observations en laboratoire. vations effectuées dans chaque site peuvent porter sur :
„„ Des relevésk floristiques (simples listes, Fig 10.1)
Dans l’impossibilité matérielle de parcourir entièrement les zones à „„ Des relevés phytosociologiquesk (avec des coefficients affectés
étudier (au regard de leur superficie, de leur accessibilité, de la diver- à chaque espèce pour exprimer leur poids et leur fréquence res-
sité des facteurs à mesurer), il est souvent prélevé des échantillons pectifs, Fig. 10.2)

representative samples of the entire study zone have to be


taken on the basis of variable sampling designs.

Collecting field data: Plants Mainly, three types of sampling exist:


„„ Random sampling based on a random selection of observa-
tion sites;
Vegetation is one of the main characteristics of biogeogra- „„ Systematick sampling that consists of marking out the
phyk. It is defined as the group of plant communities within flo- study zone, then selecting the sites based on an established
rak, consisting of a list of all the plant species in a given region. step (or fixed distance between sites);
Collecting this information on plants contributes to resolving „„ Stratified sampling that consists of first classifying the study
ecological problems linked to biological conservation or can region into different types of formations, then choosing a
even be taken into account in planning measures of some en- sample within each type taken randomly or systematically.
vironments. Data on vegetation can also serve as a basis for pre-
dicting future changes. Within the BIOTAk framework, we favoured stratified sampling
In order to obtain correct information on the vegetation of a which takes all plant communities into account and allows for
region, both fieldwork and laboratory observations need to be reliable observations.
undertaken. The observations made at each site can result
„„ In the floristic observation (simple lists, Fig.10.1)
Given the impossibility of completely covering a whole „„ Phytosociologicalk observations (with coefficients calcu-
study region (taking into account the size of the study re- lated for each species to express their respective weight and
gion, accessibility, and the diversity of parameters to measure), frequency, Fig.10.2)

642
„„ Des mesures dendrométriques (mesures des diamètres et hau-
teurs, Fig.10.3)
le tout sur la base de fiches conçues au préalable. En outre, une
récolte d’échantillons a toujours accompagné ces observations
en vue de préciser la détermination, d’enrichir les différents her-
biersk et de constituer une base de données pour les travaux ul-
térieurs (Fig.10.4). Tout échantillon collecté doit être le plus
complet possible (fleurs, fruits, tiges, feuilles et racines pour les
10.1
monocotylédonesk).
Dans le cadre du programme BIOTA nous avons mené les observa-
tions de terrain à travers 2 dispositifs :
1. Des observatoires permanents installés le long de gradients
climatiques dans lesquels nous menions des inventaires de fa-
çon périodique (chaque 3 ans) en considérant un gradient
d’utilisation de l’Homme (aires protégées et zones d’activités
humaines) ;
2. Des sites distribués dans les différentes zones écologiques de
chaque pays en rapport avec les travaux de thèse des étudiants.

Une méthode standard a été utilisée par tous les acteurs du pro-

10.2

„„ Dendrometric measurements (measurements of diameters


and heights of woody species, Fig.10.3)
all based on a previously defined sampling design. Additionally,
a collection of plants should always accompany these obser-
vations to prove the species identification, enrich herbariumsk
and create a database for later research (Fig.10.4). All samples
collected should be as complete as possible (flowers, fruit,
twigs, leaves and roots for monocotyledonsk). Fig. 10.1: L’inventaire floristi-
que simple. | Simple floristic in-
Within the framework of the BIOTA program, we undertook ventory. KKO
field observations following two stategies: Fig. 10.2: Les relevés phytoso-
1. Permanent observatories installed along the climatic gradi- 10.3 ciologiques de la strate herba-
ents in which we undertook inventories periodically (every cée. | Phytosociological ob-
three years) considering a gradient of anthropogenick land 10.4 servations of the herbaceous
use intensity (protected areas and zones of human activity); stratum. MSC
2. Sites distributed in the different ecological zones of each Fig. 10.3: Mesures dendromé-
country in relation to students’ thesis work. triques. | Dendrometric Mea-
sures. ATH
A standard method was used by all program participators, Fig. 10.4: Confection de l’her-
which is indispensable to the future synthesis and comparison bier. | Preparing the herbari-
between sites. um. ATH

643
10: Methodes | Methods

gramme, ce qui est indispensable à une synthèse future et une com- „„ Fournir des données fiables pour la validation des différents
paraison entre les sites. modèles développés çà et là sur la végétation, et sur les change-
Les objectifs poursuivis à travers cette méthode standard et les ob- ments climatiquesk
servatoires sont : „„ Impliquer les différents acteurs et promouvoir l’harmonisa-
„„ Collecter des données scientifiques fiables au profit des tion des méthodes à l’échelle de chaque pays et en Afrique de
chercheurs, étudiants, gestionnaires des parcs et décideurs l’Ouest.
politiques
Dispositif d’ensemble des observatoires
L’étude de la flore et de la végétation reposait sur une série de 3
placeaux imbriqués dont les superficies sont : 100 m², 1 000 m² et
10 000 m² (Fig. 10.5).

Les travaux d’inventaire


Sur chaque site d’inventaire, chaque auteur des travaux s’efforce de
récolter les informations qui s’avèreront capitales sur le site d’obser-
100 m
1: Inventaire floristique vation. Les données stationnelles les plus importantes sont : la date,
simple | Simple floristic in- l’auteur des observations, les formations végétales en présence ainsi
ventory; 10 000 m2 que leur taux de recouvrement, les caractéristiques pédologiques et
2: Relevés des ligneux | topographiques, les traces des activités humaines.
Ligneous inventories;
1000 m2
3: Les relevés de la strate her-
bacée | Herbaceous stra-
tum inevntories; 100 m2
4: Appréciation de la régé- „„ Involving different actors and promoting the harmonization
nération | Evaluation of re- of methods at the scale of each country in West Africa.
generation; 25 m2

Mechanism of all the observatories


The study of the flora and the vegetation is based on a series
Fig. 10.5: Dispositif d’inventaire dans les observatoires de BIOTA. Les données collectées sont varia- of 3 overlapping plotsk with areas of: 100 m², 1 000 m² and
bles d’une superficie à une autre. | Inventory mechanism in the BIOTA observatories. The collected 10 000 m² (Fig. 10.5).
data vary from one area to another.
Inventories
On each inventoried site, the author tries to collect key informa-
tion of the observation site. The most important data are: date,
The objectives pursued through this standard method and ob- author of the observations, plant formations present as well as
servatories were: their coverage, pedological and topographic characteristics,
„„ Collecting reliable scientific data as base data for for re- signs of human activities.
searchers, students, park managers and political decision
makers 1. Simple floristic inventory (10 000 m²)
„„ Supplying reliable data to validate the different models de- This is an itinerant floristic inventory, which consists of covering
veloped in different places on vegetation dynamics and cli- a given area and inventorying the different species based on
mate changek their presence (Fig. 10.2). The method was applied on a hect-
are scale (100 m x 100 m). It is a rapid and simple method and is

644
Afrique de l’Ouest | West Africa

1. L’inventaire floristique simple (10 000 m²) a été appliquée par tous les étudiants doctorants. Dans chaque pla-
Il s’agit d’un inventaire floristique itinérant qui consiste à parcourir ceau (homogène et représentatif) toutes les espèces ligneuses sont
une aire donnée et d’en recenser les différentes espèces sur la base recensées puis un coefficient d’abondance-dominance (fréquence
de leur présence (Fig. 10.2). C’est la méthode qui a été appliquée à et poids de l’espèce) est affecté à chacune d’elles. Ces coefficients
l’échelle d’un hectare (100 m x 100 m). Méthode rapide et simple, qui prennent en compte le nombre d’individus ainsi que leur recou-
elle est souvent sollicitée dans plusieurs cas notamment lorsque la vrement, sont estimés visuellement et exprimés en pourcentage.
superficie à inventorier est relativement importante, ou lorsqu’on Pour ce faire, l’échelle à 6 coefficients de Braun-Blanquet a été utili-
veut disposer de la liste des espèces sur une aire donnée. Cette mé- sée (Tab. 10.1).
thode présente l’avantage d’être rapide mais ne considère pas la fré- Dans le cas des observatoires de BIOTA nous avons effectué un
quence et le poids de chacune des espèces ; toutefois, elle permet inventaire des espèces ligneuses et à chacune d’elles un coefficient
une bonne comparaison de la phytodiversiték entre les biomes. d’abondance-dominance a été appliqué en utilisant l’échelle de
Londo (Tab. 10.2) et en fonction des strates.
2. Les relevés des ligneux (1 000 m²)
„„ Les relevés k phytosociologiques „„ Mesures dendrométriques
Cette méthode a surtout été utilisée par les étudiants doctorants sur En plus des travaux phytosociologiques des mesures ont été ef-
leurs sites d’étude. Ce sont des relevés qui permettent de décrire, de fectuées par les doctorants dans des placeaux de 1 000 m² (ou de
caractériser, de classifier et de suivre la dynamique des associations 30 × 30 m) en vue d’apprécier l’état des structures de populations
végétales. de différentes communautés végétales ou de certaines espèces choi-
Dans le cadre de BIOTA une approche phytosociologique basée sies sur la base de certains critères (importance socio-économique,
sur des relevés effectués dans des placeaux de 1 000 m² (rectangles écologique, etc.). Pour ce faire, tous les individus ligneuxk de dia-
de 50 m de long sur 20 m de large) ou dans des carrés de 30 × 30 m mètre à hauteur de poitrine (DHP) ≥ 5 cm et de hauteur ≥ 1,30 m

often applied when the area to be inventoried is relatively large the number of individuals as well as their coverage and are es-
or when one wants to have a species list for a given area. This timated visually and expressed in percentages. To do this, the
method has the advantage of being rapid, however it does not scale of six Braun-Blanquet coefficients was used (Tab. 10.1).
consider the frequency and the weight of each of the species; In the case of BIOTA observatories, we did a ligneous species in-
nonetheless, it permits a good comparison of phytodiversityk ventory and additionally, an abundance-dominance coefficient
between different biomes. was applied by using the Londo scale (Tab. 10.2) and according
to the function of strata.
2. Ligneous inventories (1 000 m²)
„„ Phytosociological relevésk „„ Dendrometric Measures
This method was used mostly by PhD students on their study In addition to the phytosociological work, measurements were
sites. These are reports that enable the description, character- taken by PhD students in 1 000 m² (or 30 x 30 m) plots with the
ization, classification of plant associations and allow following aim of assessing population structures of different plant com-
their dynamics. munities or some selected species, their selection based on cer-
tain criteria (socio-economic, ecological importance, etc.). To
In the framework of BIOTA, a phytosociological approach based do this, all ligneous individuals with a diameter at breast height
on relevés done in 1 000 m² plots (rectangles 50 m long by (DBH) ≥ 5 cm and height ≥1.30 m were measured by using a
20 m wide) or in 30 x 30 m squares were applied by all the PhD timber callipers (Fig. 10.3) or a Pi-Tape Linear Measure (for the
students. In all plots (homogenous and representative) all the diameter) and a graded pole or a clinometer (e.g. Suunto, for
ligneousk species were inventoried then an abundance-dom- height). Furthermore, additional notes were taken on the form
inance coefficient (frequency and weight of the species) was of the individuals, their state of health, as well as their phenol-
allocated to each of them. These coefficients take into account ogy. All plant individuals that did not fulfil the measurement

645
10: Methodes | Methods

sont mesurés en utilisant un compas forestier (Fig. 10.3) ou un ru- de Braun-Blanquet sont utilisées sur la base d’une appréciation du
ban pi (pour le diamètre) et une perche graduée ou un inclinomè- nombre d’individus et de leur recouvrement.
tre (p.e. Suunto, pour la hauteur). En outre, des observations com- Dans le cadre d’études spécifiques, la méthode des points quadrats
plémentaires ont souvent porté sur la forme des individus, leur état a quelquefois été utilisée sur des lignes de 25 à 50 points de lecture
sanitaire ainsi que leur phénologie. Tous les individus végétaux ne en vue d’apprécier la diversité floristique, la fréquence spécifique et
remplissant pas les conditions de mesure sont pris en compte dans la contribution spécifique.
la régénération. Les résultats de ces mesures permettent de dégager Enfin, dans le cadre de l’estimation de la capacité de charge, des
la tendance progressive ou régressive des différentes populations mesures de biomasse ont été effectuées sur des placettes de 1 m²
d’espèces et des communautés végétales dans leur ensemble. dans lesquelles on procède à une fauche intégrale des herbacées, à
la mesure du poids frais et puis sec (après séchage jusqu’au poids
3. Les relevés de la strate herbacée (100 m²) constant à l’étuve à 60 °C voire 105 °C au laboratoire).
Les relevés de la strate herbacéek sont effectués sur des placeaux de
superficie plus réduite en raison de leur plus grande sensibilité aux 4. Appréciation de la régénération (25 m²)
variations des facteurs stationnels. Installés au sein des placeaux des Dans le souci de mieux apprécier la dynamique des communautés
ligneux (Fig. 10.5), leur nombre dépend fortement de l’hétérogé- et des espèces, des placettes de 25 m² ont quelquefois été installées
néiték du site. Chaque facièsk ou unité de végétation devra être pris dans les placeaux des ligneux. A l’intérieur de ces placettes le nom-
en compte. Dans chacun des placeaux les différentes espèces sont bre d’individus par espèce est compté et la hauteur de chacun d’eux
recensées (espèces herbacées comme ligneuses) et chacune affectée est mesurée puis rangée plus tard dans les différentes classes de hau-
d’un coefficient d’abondance-dominance exprimant sa fréquence et teur : 0-0,5 m ; 0,5-1 m ; 1-2 m ; 2-4 m ; 4-8 m ; ≥ 8 m.
son poids. Tout comme pour les ligneux, les échelles de Londo ou

Tab. 10.1: Echelle de Londo. | Londo-Scale. criteria were taken into account in describing regeneration ca-
Londo Echelle recouvrement | Range of cover (%) pacity. The results of these measurements enabled obtaining
1 0 - <1 the progressive or regressive tendency of the different species
2 1 - <3 populations and plant communities all together.
4 3 - <5
10 5 - <15 3. Herbaceous stratum inventories (100 m²)
20 15 - <25 The records of the grassy stratum were done on plots with a
… ... smaller area since the sensitivity of grass species to the varia-
tions of site factors is higher. Located within the ligneous plots
90 85 - <95
(Fig.10.5), their number of plots depends greatly on the hetero-
100 95 - 100
geneityk of the site. Each plant formation or vegetation unit
Tab. 10.2: Braun-Blanquet: (Echelle d’abondance-dominance). should be taken into account. In each of the plots, all species
Braun-Blanquet: (cover-abundance scale). was inventoried (grassy species and ligneous) and each esti-
B.-B. Recouvrement (%) Range of cover (%) mated by an abundance-dominance coefficient that expressed
+ < 5 %, peu d’individus < 5 %, few individuals their frequency and weight. Just as for the ligneous, the Londo
1 <5 %, indiv. nombreux <5 %, numerous indivi. or Braun-Blanquet scales were used assessing the number of in-
2 5-25 % 5-25 % dividuals and their coverage.
3 25-50 % 25-50 % Within the specific studies, the point-quadrat-method was
4 50-75 % 50-75 % sometimes used with lines of 25 to 50 reading points aimed at
evaluating the floristic diversity, specific frequency and specific
5 75-100 % 75-100 %
contribution.

646
Afrique de l’Ouest | West Africa

Conclusion
Les méthodes d’étude de la végétation et de la flore sont variables et
dépendent fortement des objectifs et des moyens disponibles. Dans
un souci de mise en commun des observations de terrain pour une
meilleure comparaison des travaux et un meilleur suivi de la phy-
todiversité aux échelles nationale et régionale, une harmonisation
des méthodes s’impose. C’est dans l’esprit de réduire les disparités
entre les données d’observations que le programme BIOTA a mis
au point ce dispositif qui permet non seulement de caractériser en
un instant précis la flore et la végétation mais aussi de suivre leur
dynamique spatio-temporelle. L’un des grands acquis de cette stan-
dardisation des méthodes réside incontestablement dans la mise en
commun des données pour leur valorisation scientifique (publica-
tions, base de données, etc.).

Finally, for the estimation of the carrying capacity, biomass between the observational data, the BIOTA program has devel-
measurements were done on plots of 1 m² in which we did a oped this approach. It can not only characterize the flora and
complete cutting of grasses. We measured the fresh and then vegetation at a specific point in time but it can also be used to
the dry weight (after drying upto a constant weight, the cham- monitor their dynamics in space and time. One great benefit of
ber at 60 ° or 105 °C in the laboratory). this standardizition of methods without doubt lies in the pos-
sibility of pooling of data for scientific usage (publications, data-
4. Evaluation of regeneration (25 m²) bases, etc.).
To better quantify the community and species dynamic, 25 m²
plots were sometimes installed within the ligneous plots. In
these plots, the number of individuals per species was counted
and the height of each of them was measured an categorized
in different height classes: 0-0.5 m; 0.5-1 m; 1-2 m; 2-4 m; 4-8 m;
≥ 8 m.

Conclusion
The vegetation and flora study methods are variable and de-
pend very much on the goals of the study and available re-
sources. For the sake of sharing field observations for a bet-
ter comparison of reaserch and for better monitoring of plant
diversity at the national and regional scale a harmonization of
methodologies is required. In the spirit of reducing disparities

647
10: Methodes | Methods

habitudes alimentaires différentes, la combinaison de l’échantillon-

10.2
nage des deux taxons peut apporter plus d’informations. Un proto-
Évaluation des communautés cole standardisé d’évaluation combinée des termites et des fourmis
de termites et de fourmis est donc crucial pour permettre des comparaisons entre des cas
d’étude, l’échange d’informations et de données et constituer une
bonne opportunité pour le suivi de la biodiversiték tropicale.
Dorkas Kaiser Protocole standardisé pour l’évaluation
Souleymane Konaté combinée des communautés de termites Dispositif d’echantillonnage
[Link] Linsenmair et de fourmis Les communautés de termites et de fourmis peuvent êtres évaluées
simultanément. Pour ce faire, un schéma d’échantillonnage stan-
En Afrique de l’Ouest, les termites et les fourmis constituent des dardisé essentiellement adapté aux termites en savane, à savoir le
éléments clés de la faunek du sol. Les termites font partie des orga- protocole d’évaluation rapide ou RAP (Rapid Assessment Proto-
nismes du sol les mieux adaptés aux conditions arides et semi-ari- col) inspiré de Jones & Eggleton [2] pour les termites en forêts, a
des et ont un rôle central dans la dynamique et le fonctionnement été mise au point. Ce protocole standard termite-fourmis combiné
des écosystèmesk [1]. Le haut niveau de spécialisation écologique est conçu autour de trois transectsk sur une distance de dix mètres,
des termites et des fourmis, combiné à un modeste degré de diver- chacun mesurant 50 mètres de long. Un transect est utilisé pour les
sité, en font des taxonsk candidats comme indicateurs biologiques termites et deux pour les fourmis. Le transect est une ligne imagi-
des perturbations anthropogéniquesk. L’échantillonnage conjoint naire de 50 m de long, 2 m de large qui est subdivisé en 10 sections
des deux taxons revêt un intérêt spécial en raison de leur forte in- contiguës de 10 m² (5 m x 2 m) chacune. En cas d’inclinaison dans
teraction et à cause de leur connexion étroite (et à facettes) avec de l’habitatk, le transect doit être placé horizontalement. Dans chaque
nombreux autres groupes d’organismes. Par ailleurs, du fait de leurs site, plusieurs méthodes peuvent être utilisées pour la collecte des

of the two taxa is more informative. A standardized protocol of


a combined assessment of termites and ants is therefore crucial
Assessment of termite and to allow comparisons between case studies, exchange of infor-

ant communities mation and data, and may be a good tool for the monitoring of
tropical biodiversity.

Protocol for the standardized combined as- Study sites


sessment of termite and ant communities Termite and ant communities can be assessed simultaneous-
ly. Based on a standardized sampling scheme mainly adapted
In West Africa, termites and ants represent key components to termites in savannas, the “rapid assessment protocol” (RAP)
of the soil faunak. Termites are among the soil organisms best (based on Jones & Eggleton [2]) for termites in forests, a stan-
adapted to arid and semi-arid conditions and they play a cen- dardized combined assessment of termite and ant commu-
tral role in the dynamics and functioning of the ecosystemk nities has been developed. The combined termite-ant stan-
[1]. The high level of ecological specialization combined with a dard protocol is based on three transectsk in a distance of
modest degree of diversity make termites and ants candidate ten meters of eachother, all three of them fifty meters long.
taxak for biological indicators of anthropogenick disturbance. One transect was used for termites and two transects for ants.
The sampling of both taxa together is of special interest, be- The baseline transect is 50 m long, 2 m wide and divided into
cause of their strong interactions among each other and be- 10 contiguous sections of 5 m x 2 m each. In case of an in-
cause of their tight and multifaceted connection to many other cline in the habitatk, the transect has to be placed horizon-
groups of organisms in tropical ecosystems. Moreover, because tally. On each study site, termite and ant species are collected
of their different food habits, the combination of the sampling

648
Afrique de l’Ouest | West Africa

termites et des fourmis (Tableau 10.3). La figure 10.6 montre sché-


matiquement une combinaison des différentes méthodes dans un
même site.

Recensement des specimens

1. Section:
Microhabitats : Chaque section de 10 m² est fouillée jusqu’à 2 m
au-dessus du sol. Tous les micro-habitats susceptibles d’abriter des
termites sont concernés ; par exemple, dans les horizons superfi- 1: Section: microhabitats &
ciel de sol, sous les bois morts, sous les écorces, dans les sols riches décapages de sol. |
en humus, dans les accumulations de litière au pied des troncs d’ar- Section: microhabitats &

50 m
bres, sous et à l’intérieur des branches mortes (Fig. 10.7A), dans soilscrapes; 2 x 5 m
les branches mortes rattachés aux arbres vivants, dans les struc- 2: Stations Winkler | Winkler
tures biogéniques (termitières épigées, plaquages de sol et ban- sites; 1 m2

12m
des de végétation). Il en va de même pour les fourmis. Les plaqua- 3: Pièges à fosse | Pitfall traps
ges de sol sont construits par les termites sur la source alimentaire
afin d’en éviter le dessèchement et aussi pour se protéger contre les 10 m
prédateursk.
Décapages de sol : (Fig. 10.7B) 12 mottes de terre (12 cm x 12 cm

5m
x 10 cm) sont prélevés aléatoirement dans chaque section à l’aide de

by different methods (Tab 10.3). Figure 10.6 shows the combi-


nation of the two different methods within a study site. Fig. 10.6: Schéma du dispositif mixte lors de l’échantillonnage simultané des termites et des fourmis
pour l’estimation rapide de la biodiversité (inspiré de Jones & Eggleton, 2000 et Agosti et al, 2000). |
Specimen census Position of sampling sites according to the combined standardized ant and termite assessment
protocol.
1. Section:
Microhabitats: In each section, termites are hand-searched in the whole section. The soil taken out of these scrapes is hand-
all different microhabitats that are known to be preferred sites: sorted on a tray in situ and all termites and ants are collected.
soil, inside and under rotten logs, under the bark of rotten logs, The total sampling time per section for micro-habitat inspec-
humus-rich soil and accumulations of litter at the base of tree tion and soil scrapes should be fixed, e.g. 60 minutes. Further-
trunks, below and inside fallen branches (Fig. 10.7A), and dead more, all sampling should be done during the cooler morn-
wood attached to trees (up to a height of 2 m above ground ing hours (06:00h – 11:00h) as termite activity can markedly
level), termite-made structures like epigeal mounds, soil sheet- decrease in the savanna later during the day. Stopping rules
ings and runways on vegetation. Ants are also collected. Soil apply if no more microhabitats can be found (e.g. in degraded
sheetings are constructed by termites during their foraging or land-use habitats) resulting in a shorter sampling time per
activity over the food source as protection against desiccation section.
and predatorsk.
2. Winkler sites:
Soil scrapes: (Fig. 10.7B) Twelve samples of surface soil The original Winkler method was described for forest habitats
(12 cm x 12 cm x 10 cm depth) are taken in each section. They where litter covers the soil surface [3]. In habitats where such
are dug with a machete at random locations distributed over litter layers are missing, a modified version was adopted. Every

649
10: Methodes | Methods

machettes. Le sol récupéré est trié sur place pour en extraire les ter- 3. Pièges à fosse:
mites et les fourmis qui sont conservés dans de l’alcool 90 %. Il est Huit pièges fossesk remplis d’alcool 45 % sont enterrés dans le sol
conseillé de fixer le temps mis par section pour la fouille des micro- à 1m de chaque station Winkler et laissés ouverts pendant 48 heu-
habitats épigés et des mottes de terre ; par exemple 60 minutes. En res. Il s’agit en réalité de Fobelets en plastique contenant un demi-
outre, il est recommandé de réaliser tout l’échantillonnage pendant litre d’alcool qui sert de solvant. Les pièges sont placés assez pro-
les premières heures de la journée (soit entre 6 heures et 11heures), fondément de telle sorte que le bord supérieur soit au même niveau
étant donné que l’activité des termites en savane baisse considéra- que la surface du sol et les fourmis en fourragement y tombent tout
blement aux heures chaudes. Des pauses peuvent être observées si simplement. Les pièges doivent être protégés contre la pluie et les
aucun micro-habitat n’a été identifié comme c’est le cas par exem- chutes de feuilles mortes à l’aide d’un toit transparent (Fig. 10.7D).
ple dans les habitats dégradés ou destinés à l’utilisation des sols ;
ce qui entraîne donc un échantillonnage plus rapide de la section Methodes d’echantillonnage
considérée. supplementaires
Tout effort supplémentaire d’échantillonnage réduit considérable-
2. Stations Winkler : ment les marges d’erreurs au cas où des listes de vérification des es-
La méthode Winkler (Fig. 10.7C) a été décrite initialement pour pèces locales ont été compilées à partir de transects à répétition [2].
les habitats forestiers où la litière couvre la surface du sol [3]. En Plusieurs méthodes supplémentaires s’appliquent afin de compléter
cas d’absence totale de litière, on procède à une modification de la les listes des espèces :
méthode d’échantillonnage. Ainsi, la végétation est fouillée tous les
12 m à la recherche de fourmis, les parcellesk de 1 m2 (ou stations Fouilles opportunistes: Des observations directes et non-standar-
Winkler) sont ensuite retirées et les fourmis en fourragement sont disées s’effectuent autour des transects sur une distance de 50 m.
récoltées pendant 15 minutes.

Tab. 10.3: Récapitulatif des étapes majeures pendant l’échantillonnage des fourmis et des termites selon un protocole mixte. | Main steps of ant and termite community
assessments.

Termites Fourmis
Méthode | Method Zone | Area Nombre | Number
Termites Ants

Fouille des micro-habitats 10 sections (10 m²) par transect de 50 m


10 m² (5 m x 2 m) x x
Micro-habitat inspection 10 sections (10 m2) per transect of 50 m

8 par section
Mottes de terre | Soil scrapes 12 cm x 12 cm x 10 cm x x
8 per site

8 quadrats de 1m² par site, disposées de part et d’autre


Stations Winkler au transect principal parallèlement, distants de 10 m
1m x 1m (1m²) - x
Winkler sites l’un de l’autre. | 8 qudrats of 1 m2per site; parallel to
main transect in a distance of 10 m on both sides.

Gobelet en plastique enterré entièrement (dia-


Pièges fosses 8 par transect et placé chacun à 1m des Winkler
mètre = 17 cm) . | Dug in lower half of water - x
Pitfall traps 8 per site; 1 m from Winkler sites
bottle (diameter = 17 cm).

650
A

Fig. 10.7: Récapitulatif des éta-


pes majeures pendant l’échan-
tillonnage des fourmis et des
termites selon un protocole
mixte : | Main steps of ant and
termite community assess-
ments: DKA
A: Fouille des micro-habitats.
Micro-habitat inspection.
B: Mottes de terre. | Soil
scrapes.
C: Stations Winkler. | Winkler
sites.
D: Pièges fosses. | Pitfall traps.

651
Appâts : Il est possible d’attirer activement les fourmis et les termi-
tes avec différents appâts disposés partout dans l’habitat selon un
modèle standardisé. En tenant compte de la taille du site exploré, 10
répliquats par type d’appât sont disposées à une distance de 5 m à
10 m l’un de l’autre. Trois types d’appâts sont décrits ci-dessous:
„„ Des rouleaux de papier hygiénique et des blocs de bois mous
(Fig. 10.8A & B)sont déposés de manière alternée au sol à une
distance de 5 m à 10 m l’un de l’autre. L’appât doit être vérifié ré-
gulièrement pendant 10 jours.
„„ Des «sceaux à tamis» sont utilisés pour les fourmis légionnai-
res souterraines. On mélange un peu d’huile de palme avec un
échantillon de sol dans une bouteille d’eau remplie de moi-
tié et perforée à l’aide d’un fer à souder. Ces sceaux à tamis [4]
peuvent être enterrés de sorte à ce que le bord supérieur soit au
A
même niveau que la surface du sol. Ils doivent être vérifiés régu-
lièrement pendant 14 jours.
B
„„ Des biscuits, du thon (Fig. 10.8C)et de l’eau sucrée sont aussi
utilisés. Ils sont disposés, par exemple, dans des sacs en plasti-
que et distribués de manière alternée à travers l’habitat pour at-
tirer les fourmis. Les appâts sont vérifiés au bout de deux heures

12 m, the vegetation is at first searched for ants and then to-


tally removed within an area of 1 m2 (so-called Winkler sites, Fig.
10.7C) and all ants on the ground are collected for the duration
of 5 minutes.

3. Pitfall traps:
Eight alcohol (45 % alcohol) filled “pitfall trapsk” are dug into
C
the soil in a distance of one meter of each Winkler site and left
open for 48 hrs. As a trap, the lower halves of 1 ½ litre plastic
water bottles can be used. The traps have to be placed deep
enough into the soil so that their upper rim is level with the soil
surface. Ants walking on the ground, simply fall into these traps.
The traps have to be protected against rain and litter fall with a
transparent roof (Fig. 10.7D).

Fig. 10.8: Appâts. | Baits. DKA Additional sampling methods


A: Rouleaux de papier hygiéni- Additional sampling effort greatly reduces any sampling bias
que. | Toilet paper rolls. which might be expected if the local species checklistsk had
B: Blocs de bois. | Soft wood been compiled only from repeated transects [2]. In order to
blocks. complete the local species lists several methods can be applied
C: Thon. | Tuna fish. additionally.

652
Afrique de l’Ouest | West Africa

pour constater la présence ou non des fourmis. Si possible, il


faut faire une autre vérification deux heures après la première.

Identification de termites et de fourmis


Les termites et les fourmis collectés sont placés dans des fioles rem-
plies d’alcool éthylique et stockés pour leur identification ultérieu-
re. Les échantillons font l’objet d’une identification taxonomiquek
jusqu’au niveau de l’espèce ou de la morpho-espèce en utilisant la
littérature appropriée (voir références bibliographiques). La confir-
mation des espèces déterminées est réalisée par comparaison avec
les collections de référence disponibles à la station d’écologie de
Lamto (Côte d’Ivoire), à l’Université de Ouagadougou (Burkina
Faso), au Musée Royal de l’Afrique Centrale de Tervuren (Belgi-
que), et au Musée d’Histoire Naturelle de Londres. Une nouvelle
collection de référence devrait être entreprise afin de confirmer au
besoin d’autres espèces récoltées.

Hand collections: Direct observations and non-standardized „„ Cookies, tuna (Fig. 10.8C) and sugar water: Crumbs of cook-
hand-collections can be conducted in the area around the ies, tuna and sugar water can be placed e.g. on plastic bags
transects up to a distance of about 50 m. and alternately distributed across the habitat to attract ants.
After two hours, all baits have to be checked for ants. If pos-
Baits: Ants and termites can also be actively attracted to differ- sible, all baits should be checked a second time four hours
ent baits which are placed in a standardized pattern all over the after placement.
habitats. 10 replicates per bait type should be placed at a dis-
tance of about 5 m to 10 m, depending on the size of the study Identification of termite and ant samples
site. Three types of baiting are described here: All collected termites and ants are placed in vials filled with
„„ Toilet paper rolls and soft wood blocks (Fig. 10.8A & B) alter- 90 % ethanol and stored for later identification. The samples
nately placed on the soil surface in a distance of about 5 m have to be identified taxonomicallyk to the level of species or
to 10 m to each other to attract termites. The bait has to be morpho-species using appropriate literature. Reference collec-
checked regularly for up to 10 days. tions of termites and ants (e.g. Station of Ecological research
„„ Sieve buckets: For subterranean army ants palm oil can be of Lamto (Cote d’Ivoire), University of Ouagadougou (Burkina
mixed with soil and filled in the lower halves of 1 ½ litre Faso), Royal Museum for Central Africa (Belgium) and Natural
plastic water bottles which are perforated before by the History Museum of London) are also used to confirm prelimi-
means of a soldering iron. These so-called “sieve buckets” [4] nary identifications. An own reference collection should be
can then be burrowed below the soil surface so that its up- made and kept to e.g. confirm new localities of species or allow
per border is on a level with the soil surface. They have to be corrections of identifications later on.
checked regularly for the duration of 14 days.

653
10: Methodes | Methods

les poissons, le chercheur a besoin de mener ses propres études sur

10.3
Recherches ichtyologiques l’habitatk des poissons, il doit les capturer à un moment précis pour
confirmer leur présence/apparition dans un micro habitat spécial
dans les eaux douces d’Afrique de la zone d’étude.
de l’Ouest
Aire echantillon POUR L’ETUDE des
Timo Moritz Les poissons vivent dans les milieux aquatiques et cela parait trivial poissons
mais c’est le point critique des études sur les poissons. Très souvent, Avant de capturer un poisson, l’objectif de recherche doit être pris
on ne peut pas rester pendant longtemps dans leurs environne- en compte et ensuite une méthode de pêche appropriée doit être
ments pour les étudier. Pour les eaux douces d’Afrique de l’Ouest, choisie. Les questions de recherche peuvent venir de l’un des quatre
une surveillance directe serait nécessaire, étant donné que la plupart aspects suivants :
des plans d’eau sont peu transparents, les observations visuelles sur
les poissons ne sont pas by l’observation visuelle des poissons n’est 1. L’inventaire des espèces
généralement possible. Ainsi, la collecte des données doit se faire Une liste détaillée des espèces apparaissant dans une zone d’étude
de manière indirecte. La visite d’un marché de poissons peut nous conduit à plusieurs autres questions, concernant par exemple le po-
donner une première impression de l’abondance des différentes tentiel des ressources halieutiques, la comparaison avec les autres
espèces locales. Mais l’utilisation de telles données n’est que d’une organismes aquatiques ou le changement de communautés dû à
valeur limitée : Il n’y a généralement pas d’information sur le lieu et l’action humaine. Excepté une simple liste de noms, les inventaires
le moment exact de la capture des poissons, les méthodes utilisées, des espèces peuvent contenir des données supplémentaires telles
ou les espèces supplémentaires que le vendeur aurait ajouté à celles que l’apparition relative, les changements temporaires itératifs ou
d’une même prise. Pour avoir des données détaillées et valides sur les préférences pour les habitats spéciaux. Pendant l’inventaire des

their occurrence in a special microhabitat, in the respective


area, at a certain point in time.
Ichthyologic research in West
African freshwaters Specific areas of fish research
Before catching fish, the focus of the research question must be
considered, and then an appropriate method for fish collection
How many fish? has to be chosen. Research questions could originate from one
Fishes live in aquatic environments – this sounds trivial, but it is of the following four main aspects:
the critical point for studies on fish. Usually we can not stay in
their environment for a longer period of time to survey them. 1. Species inventory
For West African freshwaters direct surveillance would be of lit- A detailed list of species occurring in a respective area is the
tle help anyway, as most water bodies have only little transpar- base for many other questions, concerning e.g. fisheries poten-
ency and visual observations on fish are usually not possible. tial, comparisons with other water bodies or community chang-
Accordingly, data collection has to be carried out more indirect- es due to human impact. Except for a simple list of names spe-
ly. A visit to a fish market can give us a first impression of the lo- cies inventories may contain additional data such as relative
cal abundance of different fish species. But the use of such data occurrence, temporary changes in abundance or preferences
is only of limited value: there is usually no information when or for special habitats. During planning of fish inventories one has
where exactly the fish were caught, which methods were used, to take into account that fish communities at a certain place
or which additional species were in the same catch. To get valid may change throughout the year and also between years.
and detailed data on fish, the researcher has to perform his own
studies in the fishes’ habitatk; he has to catch them to confirm

654
Afrique de l’Ouest | West Africa

poissons, il faut prendre en compte le fait que les différentes com- me le rapport de masculinité ou le rapport des mâles sexuellement
munautés de poissons peuvent varier à un endroit particulier au actifs.
cours de l’année et aussi d’une année à l’autre. 3. Les habitudes alimentaires
En plus de la reproduction, l’alimentation est un élément important
2. La reproduction pour la compréhension de la biologie d’une espèce et son rôle dans
Certains poissons sont capables de se reproduire au cours de l’an- le système écologique. Pour étudier les habitudes alimentaires des
née ou pendant une longue période de l’année, d’autres seulement poissons, on les dissèque et on analyse le contenu du tube digestif.
une fois par an ou même une seule fois dans leur vie. Les comporte- Il existe plusieurs différentes approches d’évaluation et d’analyse
ments reproducteurs sont très souvent induits par des changements des données respectives, mais il n’y a véritablement pas d’approche
saisonniers. De telles informations sont essentielles par exemple standard. Lorsque vous vous lancez dans une telle étude, vous devez
pour définir les plans de gestion des pêches. Pour collecter les don- savoir tout ceci et être capable de choisir la méthode appropriée.
nées nécessaires, les gonades des espèces de poissons respectives Les indices unissant différentes valeurs sont très utilisés, bien que
doivent être évaluées à différentes périodes au cours de l’année. La très rares ([8], [9], [10]).
condition doit partir de “l’immaturité” à différents degrés de « dé-
veloppement » à la « maturité » ([5], [6]). La fécondité devrait 4. Les habitudes migratoires
également être déterminée à travers le nombre d’oeufs par kg par De nombreuses espèces de poissons des eaux douces d’Afrique de
femelle ou à partir du rapport poids des ovaires sur poids total du l’Ouest effectuent plusieurs mouvements dans les bassins fluviaux.
corps [7]. Le dimorphismek sexuel existe chez plusieurs espèces de On peut distinguer deux types de mouvements:
poissons des eaux douces d’Afrique de l’Ouest. Ainsi, certaines don- „„ Les migrations longitudinales, c’est-à-dire dans la rivière de
nées peuvent être recueillies uniquement par examen externe, com- l’amont vers l’aval;

2. Reproduction There are many different approaches how to assess and analyze
Some fish are able to produce offspring throughout the year or the respective data, but there is no general approach. When un-
during a longer period of the year, others spawn only once per dertaking such a study one has to be aware of this and choose
year or even in their life. Reproductive behaviour is usually trig- a suited method. Indices uniting different values are widely
gered by seasonal changes. Such information is essential, e.g. used, but usually not well-founded [8], [9], [10].
for fishery management plans. To collect the necessary data
the gonads of a respective fish species have to be evaluated 4. Migration patterns
at several points during a year. The condition has to be deter- Several of the West African freshwater fish species perform
mined from ‘immature’ over different degrees of ‘developing’ to major movements within river basins. Two types can be
‘mature’ [5], [6]. Also fecundity should be determined in terms distinguished:
of egg number per kg female, or the weight relation of ovaries „„ Longitudinal migrations, i.e. within the river like from up-
to total body weight [7]. Sexual dimorphismk exists in several stream to downstream;
fish species of West African freshwaters, thus some data can be „„ Lateral migrations, i.e. from the main river channel to the
achieved only by external examination, like sex ratio or ratio of floodplain or temporary habitats and back.
sexually active males.
Such migrations are usually related to spawning and/or open-
3. Feeding habits ing of new feeding areas. Hints to such migrations may come
Besides reproduction, feeding is the major key issue for the un- from data assessing the frequency of different species over
derstanding of the biology of a species and its role in the eco- time. Assured proofs are more difficult to obtain and may come
logical system. To study feeding habits of fish stomach analyses from direct observations, tagging experiments or telemetry
are used most commonly. techniques allowing the tracing single specimensk.

655
10: Methodes | Methods

„„ Les migrations latérales, c’est-à-dire de la rivière principale aux Avantage : de nombreux poissons peuvent être capturés avec les dif-
plaines d’inondation ou aux habitats temporaires et dans le sens férentes tailles qui sont représentées (selon le maillage) ;
contraire. Inconvénient : de nombreux spécimens non désirés sont pêchés et
De telles migrations sont très souvent liées à la recherche de frayè- meurent, sans compter les espèces aquatiques autres que les pois-
res et/ou à la recherche nouvelles zones d‘alimentation. Les indica- sons telles que les serpents, les mammifèresk aquatiques ; les spé-
tions de telles migrations peuvent être obtenues à partir des don- cimens capturés sont souvent blessés; les filets sont fréquemment
nées évaluant la fréquence des différentes espèces dans le temps. endommagés par les bois flottants ou les crocodiles ; on a besoin
Les preuves concrètes sont plus difficiles à obtenir et peuvent venir d’une pirogue pour les installer. Cette méthode n’est pas appropriée
d’observations directes, d’expérimentations après marquage ou de pour les zones protégées.
techniques de télémesure permettant le suivi des espèces en voie de
disparition. Les filets éperviers (Fig. 10.9) sont souvent utilisés dans plusieurs
régions d’Afrique. Ces filets ronds sont lancés dans l’eau à partir du
LA peche rivage ou d’une embarcation. Leur diamètre peut varier entre 1,5 et
Les filets maillants sont des « filets de pêche » typiques. A l’aide 5m; les filets les plus larges ont généralement un maillage réduit.
de flotteurs et de plombs, les filets sont positionnés dans les colon- Avantage : les poissons seront attrapés en vie avec moins de domma-
nes d’eau, très souvent on se sert de pirogues pour les poser. De tels ges ; les données exactes sur leurs parcours aller-retour peuvent être
filets font généralement entre 25 et 250 m de long et 1 à 3 m de hau- obtenues.
teur. La taille des spécimensk capturés est déterminée par le mailla- Inconvénients : pas appropriés pour les surface très couvertes par la
ge. Très souvent, pour des raisons scientifiques, les combinaisons végétation, de bois flottants ou d’un substrat très agité ; il faut être
de filets avec différents maillages sont utilisées. habile aux techniques de lancement du filet ; prises très souvent pe-
tites en fonction du temps de travail.

Catching fish Disadvantage: many not needed specimen are caught and die,
Gill nets – are the typical “fishing nets”. By means of floaters and as well as non-fish species like turtles, snakes and aquatic mam-
sinkers the nets are positioned in the water column usually us- malsk; caught specimen are usually damaged; nets often get
ing a boat. Such nets are often between 25 and 250 m long and damaged, e.g. by driftwood or crocodiles; a boat is needed for
Fig. 10.9: Un pêcheur mon- 1 to 3 m in height. The size of the caught specimen is deter- installation. This method is not suited for protected areas.
trant la manière de jeter le filet mined by the mesh size. For scientific purpose combinations of
épervier. | A fisherman show- nets with different mesh sizes are often used. Cast nets – (Fig. 10.9) are commonly used in many areas of Afri-
ing how to throw a cast net. Advantage: many fish can be caught; different size classes are ca. These round nets are thrown by different techniques on the
TMO represented (depending on mesh size); water surface. Their diameter can vary from 1.5 to 5 m; larger

656
Afrique de l’Ouest | West Africa

Pièges – Ils sont faits de différents matériaux où les poissons peu- avec un petit maillage sont très pratiques.
vent entrer sans pouvoir en sortir. Dans plusieurs régions d’Afrique Avantage : les larges sennes peuvent permettre de larges prises, les
de l’Ouest, les pièges à poissons sont entièrement faits avec du bois petites sennes attraperont tous les poissons vivants directement
ou avec du filet fixé sur un cadre en bois. (Fig. 10.10) Les pièges dans leurs (micro) habitats.
peuvent être appâtés (exemple: morceaux de poissons, différents Inconvénients : les larges sennes requièrent une grande main d’œuvre
ingrédients de plantes) ou non et peuvent être équipés de structu- pour la lancée alors que les petites sennes sont rarement applicables
res supplémentaires pour augmenter la zone à partir de laquelle les aux larges des eaux.
poissons sont conduits vers le piège.
Avantage : peuvent être installés dans presque tous les habitats Poisons - Ils sont soit des extraits de plantes, des ichtyocides mo-
aquatiques. dernes soit des pesticidesk non spécifiques issues de l’agriculture.
Inconvénients : certains pièges sont difficiles à installer. Pour éviter Dans plusieurs régions d’Afrique de l’Ouest, ces derniers sont com-
l’asphyxie des poissons ou des animaux autres que les poissons, la munément utilisés de manière croissante avec évidemment des
dernière chambre des grands pièges doit être ouverte afin de facili- conséquences dramatiques sur les écosystèmesk et les consomma-
ter la respiration. teurs. La Roténone est un poison spécifique aux poissons qui est
généralement utilisé dans l’élevage des crevettes et également pour
Les sennes – (Fig. 10.11) sont communément utilisées pour la pê- faire des collections scientifiques.
che en haute mer ou en aquaculturek mais de plus en plus, on les Avantages : permet les ramassages dans des habitats difficiles d’ac-
utilise pour la pêche en eau douce. Dans les eaux douces d’Afrique cès, tels que les rapides.
de l’Ouest, ces filets mesurent généralement entre 25 et 80 m de Inconvénients : mauvaise application dans les eaux stagnantes, élimi-
long et sont tirés suivant l’étendue de la rivière ou du lac. Pour des ne tous les poissons de la masse d’eau.
raisons scientifiques, les petits filets de 2m de long et 1,5 de hauteur

nets usually have a larger mesh size. Traps – also fykes or bow nets are constructions of different
Advantage: fish is caught alive with little damage; exact data on material where fishes can enter but not escape. In many areas
their whereabouts can be obtained. of West Africa traps are constructed completely of wood, or
Disadvantage: not suited for areas with much vegetation, drift- with net material on a wooden frame (Fig. 10.10). Traps can be
wood, or very bumpy substrate; one has to be proficient in the baited (e.g. pieces of fish or mush from various plant ingredi-
throwing techniques of the nets; often small catch considering ents) or not, and can be equipped with additional structures to
the working time. increase the area from which fishes are led to the trap.
Advantage: can be installed in almost all aquatic habitats.
Disadvantage: some trap constructions are difficult to install. To

657
10: Methodes | Methods

Equipements de pêche électrique - (Fig. 10.12)Utilisent la nature appropriées.


du poisson pour les attirer à partir de champs électriques. Ils sont Le choix de la méthode appropriée de collecte pour l’étude des
ensuite entassés dans un endroit très proche de l’épuisette. poissons dépend de plusieurs facteurs tels la main d’oeuvre disponi-
Avantages : les poissons seront juste étourdis et pas blessés, ils sorti- ble l’habitat dans lequel l‘échantillonnage se fera, les conditions du
ront de leurs caches, même ceux qui s’abritent entre les pierres. projet ou les problèmes de conservation.
Inconvénients : du fait de la conductivité réduite des eaux douces
d’Afrique de l’Ouest, la méthode ne peut être utilisée que dans les DONNEES SUPPLEMENTAIRES ET TRAITEMENT DES
endroits peu profonds avec un substrat rocheux. POISSONS
Hameçons - peuvent être montés sur des cannes à pêche ou en Avant de commencer un projet, il faut savoir de quel type de don-
groupes de longues lignes. Cette méthode est communément uti- nées on a besoin pour l’étude. Dans le domaine de la pêche, il paraît
lisée par les pécheurs d’Afrique de l’Ouest. Les longues lignes peu- judicieux de peser les poissons capturés, les répartir en fonction de
vent être appâtées ou non. Ce n’est pas une méthode adaptée pour leur prix ou leur rang taxonomiquek. Pour des objectifs de recher-
des études scientifiques. che plus complexes, d’autres données supplémentaires doivent être
Tarissement des masses d’eau - en vidant l’eau des étangs, il collectées.
est possible de ramasser tous les poissons présents dans l’habitat Après la prise, les poissons doivent être marqués d’une couleur
concerné. Particulièrement en saison sèche, cette méthode peut ou pris en photo, en étant toujours vivants. Les mesures commu-
provoquer une perte de l’habitat, refuge pour les espèces de tailles nes qui peuvent être prises sur le terrain sont celles de la longueur
réduites. standard (et la longueur totale) et du poids. Après la mensuration,
Autres méthodes – Les épuisettes et cadres des filets sont com- les spécimens vivants sont souvent relâchés dans l’eau. D’autres
munément utilisés par les pêcheurs. Pour les petits habitats aqua- études, telles que les mesures morphologiques pour la détermina-
tiques ou les zones à végétation dense, ces méthodes peuvent être tion des espèces ou à des fins taxonomiques, les études sur l’état de

avoid drowning of air-breathing fish or non-fish animals, the last Disadvantage: wrong application, e.g. in standing water, will
chamber of larger trap constructions should allow air-breathing. clear the water body completely of fish.

Seines – (Fig. 10.11) are commonly used in marine fisheries Electric fishing equipment – (Fig.10.12) uses the nature of fish
or in aquaculturek ponds, but increasingly also in freshwater to be attracted from electric fields. They are then stunned in an
fisheries. In West African freshwaters these nets are usually be- area close to the anode scoop.
tween 25 and 80 m in length and are dragged to a stretch of Advantage: fish will be stunned and usually not damaged; fish
river or a lake. For scientific purpose small nets of 2 m length will come out from their hiding places, even from deep be-
and 1.5 m height with small mesh size are very useful. tween stones.
Advantage: large seines may produce large catches; small seines Disadvantage: due to the low conductivity in West African fresh-
will catch all fish alive directly in their (micro-) habitat. waters the method can be used only in few shallow areas with
Disadvantage: large seines require many people for handling; rocky substrate; improper use can be life threatening.
small seines are poorly applicable in open waters.
Hooks – can be used single on a fishing rod or in groups in
Poisons – may be traditional plant extracts, modern ichthy- long lines. This method is commonly used by West African fish-
cides or not-specific pesticidesk from agriculture. In many areas ermen. Long lines can be baited or not. It is, however, not a use-
of West Africa the latter is getting increasingly more common ful method for scientific purposes.
with dramatic consequences for ecosystemsk, and also con-
sumers. Rotenone is a fish-specific poison commonly applied in Depleting water bodies – by scooping can be used to collect
shrimp farming, which is also used for scientific collections. all fish present in the respective biotopek. Especially in the dry
Advantage: allows collections in difficult habitats, like rapids.

658
reproduction, l’analyse des contenus stomacaux ou encore le fait
d’établir des spécimens de référence, ne sont pas possibles sur ce
terrain. Dans ce cas, les spécimens requis doivent être préservés. Le
poisson doit être anesthésié, par exemple: à l’aide du MS-222, de Fig. 10.10: Pièges souvent utilisés et
la Benzocaïne ou de l’essence de girofle, avant de le passer dans du conçu à partir d´un filet fixé sur un piquet
formol tamponné à 4 %. Le formol non tamponné pourrait avoir de bois. | Commonly used trap made of
de grandes proportions d’acide formique qui endommageraient les net on a wood frame. TMO
échantillons. Pour l’extraction de l’ADN, le tissu enrobé de formol Fig. 10.11: Pêche avec la senne sur un af-
ne peut généralement plus être utilisé. Ainsi, pour de telles études, fluent du fleuve Mou-Houn. | Fishing with
un petit échantillon de tissu doit être mis de coté avant tout contact a seine on a branch of the river Mou-
avec le formol et conservé dans de l’éthanol de 90 à 99 %. Pour une Houn. TMO
longue conservation, le poisson doit être plongé dans du formol à Fig. 10.12: Utilisation d´équipements de
l’éthanol 70 % et les échantillons d’ADN devraient être conservés pêche électrique en eau peu profonde.
dans un congélateur. Using electric fishing equipment in shal-
10.10
La connexion entre les données et les spécimens doit être assurée, low water. KCO
généralement en étiquetant ces derniers. La documentation utilisée
pour l’identification des espèces doit toujours être citée. Une iden-
tification incorrecte rendra les résultats inexploitables et dévaluera
complètement l’étude. Pour les spécimens rares ou non définis, il
convient de remettre leurs références à divers musées où la commu-
nauté internationale de chercheurs pourra les consulter.

season this method may result in the loss of a refuge habitat for
smaller species.

Other methods – commonly used among fish researcher are


dip nets and frame nets. For small aquatic habitats or densely
vegetated areas these may be the most suited methods.

When choosing the appropriate collecting method for a fish


10.11
study many different factors should be considered, such as the
assignment of tasks, the habitat in which sampling will take
10.12
place, the funds of the project or conservational issues.

Additional data and fish treatment


Before starting a project it has to be clarified which type of data
is needed for the investigation. For a basic question in fisheries
it might be sufficient to weigh the fish catch, grouped by price
or taxonomick level. For more complex research goals other
data has to be collected as well.
After catching, live colouration should be noted or a photo-
graph be taken. Common measurements, which can be taken
in the field, are standard length (and total length) and weight.

659
10: Methodes | Methods

Les paramètres biotiques et abiotiques pendant l’échantillonnage inhabituelles, l’exemple des œufs des cyprinodontidés qui peu-
doivent être décrits suivant les objectifs de recherche. Les paramè- vent résister sur des terres arides en attendant la saison des pluies.
tres biotiques peuvent comporter la berge et la végétation aquati- D’autres espèces ont des organes de sens exceptionnels, tels que
que, les prédateursk ou les interactions avec les autres animaux. Les les mormyres électriques qui peuvent communiquer et s’orien-
paramètres abiotiques les plus importants sont la position géogra- ter à l’aide de faibles décharges électriques. En plus des nombreux
phique et les caractéristiques de l’eau telles que la température, la champs de recherche fondamentale, les études ichtyologiques me-
conductivité, le pH, la transparence et la vitesse de l’eau. La concen- nées dans les eaux douces d’Afrique de l’Ouest donnent une base
tration de l’oxygène et le niveau de l’eau peuvent également être des pour des plans de gestion durable des ressources halieutiques et
aspects importants mais sont souvent difficiles à évaluer lors des peuvent servir à déterminer les espèces appropriées pour l’élevage
travaux de terrain. aquacole.

Perspectives
Quelques aspects principaux de l’ichtyologiek et les possibilités
d’études sur les poissons d’eau douce d’Afrique de l’Ouest ont été
mentionnés ici mais il y a beaucoup d’autres questions qui restent
en suspens pour les explorations à venir. Par exemple de nombreu-
ses espèces de poissons des savanes présentent des adaptations
morphologiques et physiologiques spéciales, telles que les orga-
nes respiratoires accessoires, pour s’adapter aux températures éle-
vées, une faible teneur en oxygène des eaux et une faible disponi-
bilité des eaux. Certains poissons ont des formes de reproduction

After measurement, live specimen can often be returned to rare or questionable specimens it may be appropriate to depos-
the water. Other investigations, like morphological measure- it vouchers in lager museum collections where they are acces-
ments for species determination or taxonomic questions, stud- sible to the international research community.
ies on reproductive state, analyzing stomach contents, or pro- Biotic and abiotic parameters of the sampling location should
viding voucher specimens, are not possible to perform in the be sampled according to the research question. Biotic parame-
field. In that case the needed specimens have to be preserved. ters may include shore and aquatic vegetation, common pred-
Fish should be anaesthetized, e.g. using MS-222, benzocaine atorsk or interactions with other animals. The most important
or clove oil, before transferring them into 4 % buffered forma- abiotic parameters are geographic position, and water char-
lin. Older, non-buffered formalin may have high proportions of acteristics as temperature, conductivity, pH, transparency, and
formic acid which may damage samples. For DNA extraction current. Also oxygen concentration and water level may be im-
formalin fixed tissue generally cannot be used anymore. Thus portant aspects, but are sometimes difficult to assess during
for such studies small tissue samples have to be taken separate- field work.
ly before contact with formalin and kept in 90 to 99 % ethanol.
For longer storage fish should be transferred from the formalin Outlook
solution to 70 % ethanol and DNA samples should be stored in A few main aspects of fish biology and possible studies on West
a freezer. African Freshwater fishes have been mentioned here, but there
are numerous other issues waiting for further exploration. For
The connection of data and specimen has to be assured, usu- example many fish species of the savanna region show special
ally by labelling the specimens. Literature used for species iden- morphological and physiological adaptations, like accessory
tification should always be cited. Without correct identification, breathing organs, to cope with high temperatures, low oxygen
results are irreproducible and devaluate the complete study. For contents of water and low water availability. Some fish have

660
Afrique de l’Ouest | West Africa

unusual reproduction patterns, like the killifish producing eggs,


which may persist in dry earth until the next rainy season. Other
species show exceptional organs and senses, like the electric
mormyrids performing communication and orientation using
weakly electric discharges. Besides numerous fields of basic re-
search, ichthyologicalk studies in West African freshwaters pro-
vide the basis for sustainable fisheries management plans and
may help determine species suited for aquaculture farming.

661
10: Methodes | Methods

Tous (tes) les transects/parcelles doivent être contrôlés avec le

10.4
même soin d’échantillonnage, en tenant compte du temps et de
Méthodes : Echantillonnage l’intensité du travail. Pour les amphibiens, il est particulièrement
des amphibiens important d’agir de façon constante quelque soit la durée (quo-
tidienne ou saisonnière) (Fig. 10.13) puisque les espèces présen-
tent un taux d’activités différent en fonction de la quantité de pluie,
Mark-Oliver Rödel Sites d’étude et effort de la température, de l’heure ou de la saison. Des contrôles répétés
d’échantillonnage sur des transects ou parcelles identiques faits les mêmes jours ou
Les amphibiens des forêts peuvent être mieux suivis en établissant pendant des jours consécutifs doivent être évités afin d’assurer l’in-
des transectsk standardisés (lignes droites de longueur définie, voir dépendance des données. Généralement, mener une étude sur les
Rödel & Ernst [11] ou des parcellesk (surfaces aux dimensions amphibiens nécessite peu de moyens. Bien que des matériaux plus
connues). La longueur du transect et la dimension de la parcelle coûteux soient cités plus bas, tout le monde peut se permettre de
doivent être les mêmes au cours de l’étude et dépendent de la ques- mener une étude significative et importante sur les amphibiens sans
tion spécifique de recherche posée. La marche le long du transect avoir besoin de trop de moyens financiers autres que les frais de
prenant trop de temps, il est conseillé de l’exécuter d’abord de fa- transport. Ainsi, le manque d’argent ne peut être une excuse valable
çon aléatoire indépendamment des conditions atmosphériques. pour ne pas mener de la recherche sur les amphibiens.
Ainsi les données devraient être rassemblées pendant une saison au
cours de la première année afin d’obtenir une connaissance précise
de la faunek locale. Pendant des saisons consécutives de travail de
terrain, la fréquence d’échantillonnage peut être réduite lorsque les
données phénologiques des espèces sont connues [12].

especially important to invest the same effort per season and


day-/night-time (Fig. 10.13), as different species may show dif-
Methods: Sampling ferent activity rates depending on amount of rainfall, tem-

amphibians perature, daytime or season. A repeated control of identical


transects or plots on the same or consecutive days should be
avoided to ensure independence of data. Generally working
Study sites and sampling effort with amphibians can be extremely cheap. Although we list vari-
Amphibians in forests can best be monitored by establish- ous more expensive material below, everybody can do mean-
ing standardized transectsk (a straight line of a defined length, ingful and important amphibian work without any budget oth-
see Rödel & Ernst [11] or plotsk (an area of a defined size). The er than for travelling. Hence, lack of money is not a good excuse
length of the transect and the size of plot has to be the same for not doing amphibian research.
throughout a study and depends on the specific research ques-
tion. Transect walks are time intensive. It is advisable to perform Species census
them first randomly independent of prevailing weather condi-
tions. Data should be gathered throughout a whole season in 1. Visual and acoustic monitoring
the first year to obtain a thorough knowledge of the local fau- An area or habitatk is searched systematicallyk for individuals
nak. In consecutive field seasons, the frequency of sampling in a defined time period.
can be reduced when general phenological traits of the species
are known [12]. Visual: All frogs seen are recorded at species level. This meth-
All plots/transect have to be investigated with the same sam- od is applicable to all different habitat types. In savanna ar-
pling effort, regarding time and intensity. For amphibians it is eas, however, the regions around ponds and streams will be

662
Afrique de l’Ouest | West Africa

Inventaire des especes exploité pour un suivi acoustique. Un tel suivi est particulièrement
applicable aux espèces de rainettes et de grenouilles arboricoles, de
1. Suivi visuel et acoustique litière et enfouies qui ne sont généralement détectées par un suivi
Un milieu ou habitatk est recherché systématiquementk pour les visuel. Le recensement des différents coassements peut être utilisé
individus à un temps bien défini. pour estimer l’abondance relative des mâles, la composition des
espèces, le lieu de reproduction et la phénologie de la reproduc-
Visuel : toutes les grenouilles rencontrées sont inventoriées tion des espèces. Comme il est difficile d’avoir un nombre exact de
jusqu’au niveau spécifique. Cette méthode est applicable à tous les mâles qui coassent, cette méthode donne simplement des données
types d’habitats. Toutefois en savane, les régions situées autour des qualitatives ou semi-quantitatives. La largeur du transect pour le
mares et des ruisseaux seront probablement les seuls endroits où suivi acoustique dépend de l’aptitude à détecter le coassement de
les grenouilles peuvent être enregistrées visuellement avec certitu- chaque espèce (app. 10-15 m de chaque côté du transect).
de [11]. Les grenouilles attrapées peuvent être marquées d’un pin-
çon [13] afin d’en recueillir des données pour une estimation de la Combinaison: une combinaison des techniques, visuelle et acous-
population via les méthodes de capture/ ré-capture [14]. Pour une tique peut être appliquée. Cette méthode est fréquemment utilisée
simple enquête de courte durée, les méthodes déjà décrites sont pour des évaluations rapides ou sur de larges surfaces. Les données
suffisantes mais doivent probablement être accompagnées de piè- collectées sont exprimées en nombre d’individus par espèce ren-
ges adaptés. contrée dans une surface par unité de temps, ex: 8 spécimensk de
l’espèce A par heure/personne. L’échantillonnage visuel et acous-
Acoustique : dans la majorité des cas, les grenouilles mâles coas- tique normalisé sur un transect (parcelle), selon notre expérien-
sent de façon spécifique pour signaler leurs positions vis à vis des ce, donne de meilleures données quantitatives sur les amphibiens
partenaires potentiels et des rivaux. Ce comportement peut être de forêt dans l’espace et dans le temps. Ces données peuvent être

probably the only areas where frogs can be recorded reliably by Combination: A combination of visual and acoustic techniques
vision [11]. Captured frogs can be marked by toe clipping [13] can be applied. This method is frequently used for rapid assess-
to use the data for population estimates via capture / re-cap- ments and the evaluation of larger areas. The resulting data are
ture methods [14]. For simple short-term surveys the encoun- expressed in numbers of individuals of a certain species found
ter methods are sufficient but should possibly accompanied by in an area per unit time, e.g. eight specimensk of species A per
opportunistic trapping. 1 man-hour. Standardized visual and acoustic transect (plot)
sampling, according to our experience, provides the best quan-
Acoustic: Since in the majority of frog species males use spe- titative data on forest amphibians with regard to space and
cies-specific calls to advertise their position to potential mates time. These data can be used for comparisons between habi-
and rivals, this behaviour can be exploited for acoustic moni- tats, seasons and years [15] and standardized transect surveys
toring. Especially tree-frogs and frogs that hide in leaf-litter or are especially useful for long-term studies.
call from underground will usually not be detected by visual
searches and thus acoustic monitoring is a must for frog assess- 2. Passive sampling
ments. Counts can be used to estimate relative abundance of Species that rarely call or live underground or migrating aquatic
calling males, species composition, as well as breeding habi- frogs can be sampled by passive sampling techniques, i.e. pitfall
tat use and breeding phenology of species. As it is difficult to and funnel traps along drift fences. These usually consist of du-
get accurate numbers of calling males, this method gives only rable plastic gauze, app. 0.5 m high and stapled vertically onto
qualitative or semi-quantitative data. The width of the acoustic wooden stakes. Close to the fence plastic buckets are buried in
transect depends on the ability to detect each species’ adver- the soil in a way that the opening of the bucket is level with the
tisement call (approx. 10-15 m to either side of the transect). surrounding surface. Duct tape can be used to reduce the di-
ameter of the buckets and to construct funnel-like openings in

663
10: Methodes | Methods

utilisées pour comparer les habitats, les saisons et les années [15]. 3. Echantillonnage des têtards:
Les investigations sur un transect normalisé sont particulièrement Les têtards peuvent fournir des informations supplémentaires dans
utiles pour des études à long terme. un suivi ou une évaluation des espèces. Les têtards se capturent fa-
cilement avec des filets à armature (Fig. 10.15) et peuvent ensuite
2. Echantillonnage passif: être identifiés. Si les essais du filet à armature sont normalisés en
Les espèces coassant rarement ou vivant dans le sol ou encore les termes de nombre, vitesse et longueur, les prises peuvent également
grenouilles aquatiques migratrices peuvent être échantillonnées par être utilisées dans des analyses semi-quantitatives. Pour des don-
des techniques d’échantillonnage passives, (réalisation de trous ou nées quantitatives réelles, la méthode par boîte peut être employée.
utilisation d’entonnoirs à nasse le long de barrières). Les barrières Une boîte métallique est choisie (meilleure utilisation 50 x 50 x 50
sont généralement composées de toiles en plastique écologiques, cm), ouverte par le haut et par le bas et déposée verticalement dans
app. 0,5 m de haut dressé verticalement sur des supports en bois. Le la mare (Fig. 10.16). Le liquide contenu à l’intérieur de la boîte est
godet en plastique est enterré dans le sol, près de la clôture de telle ensuite examiné avec un tamis en plastique et tous les individus
sorte que l’ouverture du godet soit au même niveau que la surface sont capturés et comptés. Au fur et à mesure que le contenu de la
qui l’entoure. Un ruban adhésif en toile peut être utilisé pour ré- boîte est connu, la méthode permet une évaluation réelle des as-
duire le diamètre des godets et des ouvertures en forme d’entonnoir semblages des têtards. Le choix des micros habitats par les différen-
construites en vue d’empêcher qu’elles s’échappent de l’enclos. Tou- tes espèces peut être déterminé en enregistrant les caractéristiques
tefois, la plupart des anoures sont de bons sauteurs, donc il est diffi- de l’habitat pour la mare et dans la boîte, telles que la densité de la
cile de les retenir avec ces barres. Les enclos sont vérifiés au moins végétation, le type de sol, la profondeur de l’eau, etc. Pour collecter
une fois par jour. des échantillons dans une mare de façon représentative, les diffé-
rentes caractéristiques de la mare en question (l’eau en surface et en
profondeur, eau couverte ou non de végétation aussi bien au bord

order to impede escaping from traps. However, most anurans vegetation, at the bank and in the middle of the pond etc.)
are strong jumpers and thus difficult to trap with these arrays. have to be sampled in accordance to their surface proportion
Traps have to be checked at least on a daily basis. of the whole pond.

3. Sampling tadpoles Site conditions


Tadpoles may add further valuable information to a monitor- To assess the habitat preferences of particular species and to in-
ing or species assessment. Tadpoles can be caught easily with vestigate correlations of species assemblages with environmen-
dip-nets (Fig. 10.15) and then identified. If dip-net trials are stan- tal variables, all study sites have to be characterized by variables
dardized in number, speed and length, the catches may also that are meaningful for amphibians. All characters should be
be used semi-quantitatively in analysis. For real qualitative data collected in a representative way. One should at least collect all
the box-method can be employed. A metallic box (best use 50 habitat parameters on all corners of the plot and at mid-point,
x 50 x 50 cm), open on top and bottom is thrown into the pond hence having five points with habitat characteristics.
(Fig. 10.16). the water content inside the box is then examined
for tadpoles with a plastic sieve, all individuals are captured and Substrate types and litter coverage
counted. As the water content of the box is known, the method Substrate types and litter coverage may be very important for
allows for real density assessments of tadpole assemblages. mi- terrestrialk frog species. These habitat characters can be as-
crohabitat choice of the various species can be determined by sessed as distinct types (e.g. sand, clay, rock etc.) or estimated in
recording habitat data from the pond and within the box sam- percentage of coverage.
ples such as vegetation density, soil type, water depth etc. To
sample a pond representatively the various different structures
of a pond (shallow and deep water, water with and without

664
et à l’intérieur de la mare, etc.) doivent être enregistrées suivant
leurs proportions par rapport à la surface de la mare entière.

Conditions du site
Pour évaluer la préférence des habitats par des espèces précises et
pour déterminer les corrélations entre les assemblages des espèces
avec les variables environnementales, tous les sites doivent être ca-
ractérisés par des variables importantes pour les amphibiens. Les
caractéristiques de chaque site doivent être collectées de façon re-
présentative. On doit donc au moins collecter tous les paramètres
dans tous les coins et au centre de la parcelle c’est-à-dire obtenir les
10.13 10.14
caractéristiques de cinq points pour un habitat.

Les types de substrats et la couche de litière


Les types de substrats et la couche de litière peuvent être très im-
portants pour les espèces de grenouilles litière. On peut les clas-
ser en types distincts (ex: sable, argile, roches, etc.) ou les esti-
mer en fonction de la proportion des composantes exprimées en
pourcentage.

10.15
Fig. 10.13: La plupart des espèces de grenouilles sortent la nuit
donc le meilleur moyen de les attraper est d’utiliser les lampes tor-
10.16
ches. | Most frog species are nocturnal and thus best searched
with the aid of flashlights at night. KHA
Fig. 10.14: Les photos prises avec un appareil numérique avec
« fish eye » donnent la possibilité de mesurer la couverture de la vé-
gétation dans les habitats forestiers. | Photos with a fish-eye-lense
on a digital camera provide an easy an standardized possibility
to measure vegetation cover in forest habitats. LSA
Fig. 10.15: Echantillonnage des têtards. | Tadpole sampling.
MOR
Fig. 10.16: La méthode d’échantillonnage par boîtes est le meilleur
moyen d’évaluer de façon quantitative les communautés de tétards
résidant dans les étangs et les flaques d’eaux. | The box sampling
method is the best way to quantitatively assess tadpole com-
munities in ponds and puddles. MMO

665
10: Methodes | Methods

Climat quantitativement en images hémisphériques (Fig. 10.14). L’évalua-


Le climat est important pour les amphibiens et un minimum de tion du degré de dégradationk de la forêt comme caractéristique de
données doit être collecté sur cet aspect notamment la température l’habitat est décrite dans la section « méthodes de description de la
(toujours mesurer à l’ombre juste au-dessus et à 1 m du sol), l’humi- végétation ».
dité et la précipitation. Les meilleures mesures sont celles qui sont Structure de la végétation de la savane: Comparativement aux fo-
régulièrement enregistrées pendant la période d’étude. Si cela n’est rêts, il est très difficile de trouver les amphibiens dans la savane et
pas possible, une jauge de pluie et un thermomètre peuvent être de compter. Par conséquent, la plupart des études menées dans les
utilisés. savanes seront nécessairement focalisées sur les zones de reproduc-
tion des grenouilles et les environnants. Les données doivent être
Structure de la végétation enregistrées à des distances différentes des zones de reproduction.
Données sur la structure de la végétation des forêts. Elles décri- La végétation peut être évaluée directement aux bords de la mare
vent la structure générale de la végétation des forêts. Le moyen le et à une distance de 10 m, 50 et 100m (dans toutes les directions)
plus facile (et le moins cher) de le faire est d’estimer à vue d’œil pour trouver la densité des classes de taille particulières (ex: herbes
la densité de la végétation dans différentes strates (ex: canopéek, allant jusqu’à 30 cm, herbes au-delà de 30 cm, larges buissons, pe-
strate arborescente inférieure, strate arbustive et buissons, végéta- tits et grands arbres). L’usage et la couverture du sol environnant
tion pastorale de sous bois). Pour prendre en compte les différen- doivent être notés, ex: terrains d’activités agricoles ou utilisation de
tes perceptions des observateurs, il est bien d’utiliser un système pesticidesk), établissements humains, termitières, etc.
qui donne toujours des résultats comparables (ex: catégories de
densité distinctes : strate absente, présente mais avec des vides pré- Exploitation de la zone de reproduction
dominants, vides présents mais végétation prédominante, strate Aussi bien dans la forêt que dans la savane, il est toujours très
fermée). L’ouverture de la canopée peut être également mesurée important de quantifier la disponibilité en sites aquatiques de

Climate Savanna vegetation structure: It is far more difficult to find and


Climate is important to amphibians and minimum data should count amphibians in a savanna, compared to the forest floor.
comprise temperature (just above ground and in 1 m height, Hence most surveys in savannas will necessarily focus on the
always measured in the shade); humidity and rainfall. Best are breeding sites of frogs and their surroundings. Data should be
measures that are regularly taken throughout the study period. recorded in different distances to the breeding sites: vegetation
If this is not possible a rain gauge and a thermometer may be can be assessed directly at the ponds’ edge and in 10 m, 50 m
used. and 100 m distance (in all four directions) in densities of par-
ticular size classes (e.g. grass up two 30 cm, grass higher than
Vegetation structure 30 cm, small bushes, large bushes, small trees and high trees).
Forest vegetation structure data describe the general vegeta- Surrounding land use or cover should be noted, e.g. fields (ag-
tion structure of a forest. The easiest (and cheapest) way to do ricultural activities or use of pesticidesk), settlements, termite
that is to estimate vegetation density in different strata by eye mounds etc.
(e.g. canopyk, lower tree stratum, bush and shrub stratum, un-
derstory). To account for differences between observers’ per- Breeding site exploration
ception it is best to use a system that always delivers compa- Regardless of forest or savanna, for amphibians it is always of
rable results (e.g. distinct density categories: stratum absent; particular importance to quantify the availability of potential
present but gaps predominate, gaps present but vegetation aquatic breeding sites and their quality. Hence every aquatic
predominates, stratum closed). Canopy openness can also be habitat has to be recorded with respect to type, surface and
measured quantitatively by hemispheric images (Fig. 10.14). depth. It is also useful to determine, climate parameters (pre-
The assessment of the degree of forest degradationk as habitat cipitation, temperature, humidity or even substrate moisture
character is described in the vegetation methods section. in a standardized way), breeding site type (stagnant or flowing;

666
Afrique de l’Ouest | West Africa

reproduction et leur qualité pour les amphibiens. Ainsi, chaque ha-


bitat aquatique doit être enregistré en tenant compte du type, de la
surface et de la profondeur. Il est utile de déterminer les paramètres
du climat (précipitation, température, humidité mais aussi l’humi-
dité du substrat de façon normalisée), le type de site de reproduc-
tion (stagnante ou ruisselante, permanente ou temporaire), la sur-
face, la profondeur (à différents points de l’étang, la vitesse de l’eau
courante), le substrat du sol, la transparence de l’eau, les espaces
ombragés, les espaces ouverts ou couverts de végétaux. La tempé-
rature de l’eau à certaines profondeurs peut également être impor-
tante. La composition chimique de l’eau peut apporter des données
utiles mais n’est cependant pas une exigence absolue au cas où il n’y
aurait pas assez de moyens pour cette méthode. Les amphibiens
des savanes en particulier semblent s’adapter à une large gamme de
paramètres aquatiques. Si la composition chimique de l’eau peut
être évaluée, elle doit d’abord se focaliser sur le pH, la conductivité,
l’oxygène et l’ammonium.

permanent or temporary), surface, depth (at various points of


the water), speed (in flowing water), substrate of the ground,
visibility, shaded area, open or vegetated area. Water tempera-
ture in different depths may also be important. Water chemistry
may add useful data but is not an absolute requirement, if fund-
ing is not sufficient to afford these methods. Especially savanna
amphibians seem to accept a wide range of water parameters.
If water chemistry can be assessed it should foremost focus on
pH, conductivity, oxygen, nitrate, and ammonium.

667
10: Methodes | Methods

Pour conduire des études informatives et réussies sur les chauves-

10.5
souris, l’échantillonnage requiert une expertise particulière, qui
Échantillonnage de chauve- idéalement doit être acquise avant de se lancer dans un projet. Cel-
souris le-ci inclut :
1. La sélection de méthode(s) d’échantillonnage adéquate(s)
2. Une expérience de la manipulation des chauves-souris
Elisabeth K.V. Kalko Les chauves-souris sont des bioindicateursk très importants du fait 3. Les connaissances nécessaires à l’identification des espèces et
Jakob Fahr de leur richesse spécifique, de leur diversité écologique et de leur la collecte de spécimensk de référence
présence en grand nombre [16]. La diversité des espèces, c’est-à- 4. L’application d’un plan d’étude statistiquement solide et adap-
dire, leur présence, absence tout comme leur abondance apportent té aux questions de recherche posées.
des informations cruciales sur le statut des écosystèmesk et leur
fonctionnalité. Les changements dans la diversité et la dynamique 1. METHODES D’ECHANTILLONNAGE
des populations de chauves-souris peuvent être également être sur- Les résultats de l’échantillonnage dépendront largement de la mé-
veillés au cours du temps, en réaction à l’influence anthropogéni- thode appliquée, chaque méthode n’étant optimale que pour un
quek et au changement global [17, 18]. De manière générale, les sous-ensemble des espèces de la communauté d’une zone détermi-
chauves-souris sont très peu étudiées sur le continent africain [19]. née. L’installation de filets japonais (filets à maille fine en polyes-
Souvent, il manque même des données élémentaires sur la diversité ter ou en nylon ; tailles préférées : 6 ou 12 m de long, 2,6 m à 3 m
des espèces locales [20]. Par conséquent, il est urgent de mener des de haut, avec 4 à 5 poches, sur des perches de 3 ou 4 m) est la mé-
études spécifiques et sur leurs communautés pour combler ce man- thode la plus répandue pour capturer les chauves-souris. La qualité
que d’information. de l’évaluation de la diversité et la composition spécifiques avec les
filets japonais dépend du nombre, de la configuration, du type et de

This includes:
1. Selection of adequate sampling method(s)
2. Experience on how to handle bats
Sampling bats 3. Knowledge in species identification and collection of
voucher specimenk
4. Application of statistically sound study design that is tai-
Bats are very important bioindicatorsk as they are species-rich, lored according to the respective research questions.
ecologically diverse, and frequently occur in larger numbers
[16]. Species diversity, i.e., presence and absence of species as 1. Sampling methods
well as their abundance, give crucial information about the Results of bat sampling depend to a large degree on the meth-
status of ecosystemsk and their functionality. Bats also permit od applied because each method is best suited only for a sub-
monitoring of change in diversity and population dynamics set of bats occurring in an area.
over time as a reaction to anthropogenick influence and global Setting mist nets (fine-meshed polyester or nylon nets; pre-
change [17, 18]. Overall, bats are largely understudied in most ferred size: 6 or 12 m long, 2.6-3.0 m high with 4-5 shelves) on
parts of Africa [19]. Often, even basic data on local species rich- tall poles (≈ 3-4 m) is the most widely used method for the
ness are lacking [20]. Therefore, comprehensive community and capture of bats. Assessing species richness and composition of
case studies are urgently needed to fill this gap. bats with mist-netting is affected by the number, configuration,
To make studies on bats particularly rewarding and successful, type and size of mist nets, whether they are set on the ground
bat sampling requires some expertise that, ideally, should be (understory nets, Fig. 10.18), in the canopyk (canopy nets, Fig.
acquired before starting with a project. 10.17) or as “net-walls” with several nets stacked on top of each
other starting from the ground up into the (sub)canopy level

668
la taille des filets japonais, de leur installation au sol (filets de sous-
bois, Fig.10.18), en canopéek (filets de canopée, Fig. 10.17) ou sous
forme de «murs de filets » avec plusieurs filets empilés les uns sur
les autres, du sol jusqu’au niveau de la canopée [21]. Ces derniers
sont très efficaces [19], mais leur installation et leur surveillance de-
mandent beaucoup de temps [21]. Les filets japonais sont disponi-
bles chez les commerçants et fournisseurs spécialisés (se référer aux
listes de [22]). Afin de les préserver en bon état, ces filets ont besoin
d’être réparés régulièrement, suite aux dommages causés par les
chauves-souris.
Un autre moyen de capture répandu est le piège-harpe (Fig. 10.19)
10.17
[23] : Plusieurs couches de fins fils de nylon sont installées dans un
cadre au pied duquel est attaché un grand sac de capture. Les piè-
ges-harpes peuvent être suspendus en l’air avec des cordes ou bien
être installés sur le sol en position verticale. Quand une chauve-sou-
ris vole jusqu’aux fils tendus, elle glisse vers le bas et tombe dans le
sac de capture. Ces pièges sont bien adaptés à la capture des petites
chauves-souris insectivoresk, notamment dans les habitatsk fores-
tiers. Un meilleur succès de capture peut être atteint quand les piè-
ges sont installés devant des grottes, le long des voies de passage des
chauves-souris, en lisière de forêt ou dans des clairières. La réussite

[21]. Net-walls are very efficient [19], but their set-up and opera-
tion is time-consuming [21]. Mist nets are available at special-
ized shops and dealers (see lists in [22]). They need to be main-
tained in good shape by regularly mending them as they are
damaged by the bats.
10.18
Another frequently used capture device is harp traps (Fig.
10.19) [23]. Fine nylon strings are set in one or more layers
(banks) in a frame that has a large capture bag attached to the
bottom. Harp traps can be hung in the air with strings or set
on the ground in a vertical position. When a bat flies against
the taught strings, it slides down and drops into the capture
bag. Harp traps are well suited to capture small insectivorousk
bats, especially in forest habitatsk. High capture success can be
reached when they are set in front of caves, in flyways of bats
along trails, at forest edges, and in forest gaps. Capture success
of harp traps depends to a large degree on the selection and
type of study locality, their usefulness should be tested in the Fig. 10.17: Filets japonais de canopée. | Canopy mist net.
chosen area before a decision is made on long-term use. Harp JFA
traps can be bought commercially or they can also be con- Fig. 10.18: Filets japonais de sous-bois. | Understory mist
structed locally (for details see [21]). net. NWE
10.19
Fig. 10.19: Piège-harpe. | Harp trap. JFA

669
10: Methodes | Methods

de capture avec les pièges-harpes dépend grandement de la sélec- d’Afrique, les analyses se limitent souvent à l’étude des modes d’ac-
tion et du type de site d’étude. Leur efficacité doit être testée dans la tivité [27]. La meilleure stratégie pour l’inventaire acoustique est de
zone choisie avant de prendre une décision quant à leur utilisation à contacter les experts pour avoir leurs conseils et une formation sur
long terme. On peut acheter les pièges-harpes dans le commerce ou la meilleure façon de s’y prendre. Le type de détecteur de chauves-
les fabriquer localement (pour plus de détails, voir [21]). souris et son micro déterminent la qualité et le rayon d’enregistre-
Une autre méthode, qui consiste à enregistrer et identifier les chau- ment des cris d’écholocation.
ves-souris insectivores aériennes par leurs cris d’écholocation, est D’autres méthodes d’échantillonnage des chauves-souris compren-
une option de plus en plus répandue pour évaluer la richesse spé- nent les recherches de perchoirs (gîtes; Fig. 10.21) et la capture
cifique et l’activité des chauves-souris : inventaire acoustique. avec des filets à main (voir [21]). L’idéal est d’appliquer un mélan-
Cette méthode est particulièrement utile pour les chauves-souris ge de plusieurs méthodes d’échantillonnage pour obtenir un inven-
insectivores volant à haute altitude et qui sont soit très rarement taire (quasi) exhaustif des espèces [28].
échantillonnées soit complètement ignorées [24], [25]. L’inven-
taire acoustique apporte alors des données qui ne peuvent s’obtenir 2. MANIPULATION DES CHAUVES-SOURIS
par aucun autre moyen. Malheureusement, cette méthode d’échan- Si les filets japonais et/ou les pièges-harpes sont les principaux
tillonnage est assez coûteuse. Elle requiert des équipements de qua- moyens de capture, il est conseillé (en cas de besoin) de deman-
lité et, en plus des enregistrements des chauves-souris sur le terrain, der conseil et de suivre une formation adéquate sur la façon de dé-
l’acquisition ou l’établissement de bibliothèques de cris locaux [26]. gager les chauves-souris des filets et de les manipuler. Etant donné
Il est également nécessaire d’acquérir une connaissance préala- que les chauves-souris peuvent être porteuses de maladies [29], le
ble de l’analyse des cris à l’aide des programmes d’analyse de sons risque d’infection peut être minimisé en prenant des précautions
adaptés. Étant donné qu’il n’existe pas de bibliothèques de cris ni de pour éviter leurs morsures et en se vaccinant contre la rage. Dans les
programmes de mesure automatiques dans la plupart des régions études impliquant la capture puis le relâcher de chauves-souris, il

As another method, recordings and identification of aerial in- [21]). Ideally, a mix of several sampling methods should be ap-
sectivorous bats by their echolocation calls is increasingly be- plied to achieve a (near-) comprehensive inventory of species
coming an option to assess species and activity of bats: acous- [28].
tic monitoring. This method is especially useful for high-flying
insectivorous bats, which have been frequently undersampled 2. Bat handling
before or went completely undetected [24], [25]. Acoustic mon- If mist nets and/or harp traps are the main capture devices in
itoring delivers data that cannot be obtained with any other a study, it is recommended, if needed, to seek advice and to
method. Unfortunately, this sampling method is rather expen- receive proper training how to extract bats from the nets and
sive. It requires quality equipment and requires, in addition to how to handle them. As bats are known to host various diseas-
the actual recording of the bats in the field, establishment of lo- es [29], infection risk can be kept at a minimum with precau-
cal call libraries [26]. As a prerequisite, one needs to be knowl- tions to avoid in getting bitten by bats, and rabies vaccination
edgeable in call analysis with sound analysis programs. As there is essential. Any study that involves capture and subsequent re-
are no extensive call libraries or automated measurement pro- lease of bats requires that animals are handled in a stress-min-
grams available yet for most parts of Africa, analysis is frequent- imizing way by freeing them quickly from the net and keeping
ly limited to study activity patterns [27]. The best strategy for them temporarily in soft cloth bags before they are processed
acoustic monitoring is to get into contact with experts for ad- and released again at the capture site. Measurements of the
vice and training how to do it most efficiently. The type of bat bats (e.g. size, body mass, age, gender, reproductive conditions)
detector and its microphone determine the quality and the should to be taken in a standardized way that follows inter-
range at which echolocation calls can be recorded. national recommendations. Detailed instructions are given in
Other sampling methods for bats include roost searches Kunz & Parsons [22].
(Fig.10.21) and captures with handnets (for more details see

670
Afrique de l’Ouest | West Africa

est recommandé de limiter la manipulation des animaux afin de ré- et des échantillons de tissu pour analyses ADN ultérieures repré-
duire le stress associé. Il faut donc les dégager rapidement du filet et sentent des données très utiles. Si les espèces ne peuvent être étu-
les garder temporairement dans un sac en toile avant des les traiter diées sur place, il est recommandé de collecter des spécimens de
et de les relâcher sur le site de capture. Les informations prises sur référence qui sont envoyés plus tard aux experts pour être identi-
les chauves- souris (par exemple la taille, la masse corporelle, l’âge, fiés (voir [32]). Au préalable, il convient de prendre contact avec les
le sexe, l’état reproducteur) doivent suivre une procédure standardi- experts des musées, universités ou centres de recherche ayant une
sée, conformément aux recommandations internationales. Des ins- connaissance des faunesk de chauve-souris concernées.
tructions détaillées sont fournies par Kunz & Parsons [22].
4. PLAN D’ETUDE
3. IDENTIFICATION DES ESPECES ET SPECIMENS L’étude des chauves-souris est vraiment nécessaire pour appro-
DE REFERENCE fondir nos connaissances sur ces animaux sur le continent afri-
La qualité d’une étude sur les chauves-souris dépend d’une iden- cain. Étant donné que ces études prennent du temps, nécessitent
tification correcte des espèces. La taxonomiek des chauves-sou- beaucoup de matériels ainsi qu’une préparation et une expertise
ris en Afrique est en constante évolution et il n’est pas surprenant conséquentes, il est primordial, pour en assurer la réussite, de dé-
de découvrir de nouvelles espèces. La première étape, qui consiste finir clairement leurs objectifs avant de commencer. Ces objectifs
à rassembler l’information nécessaire à l’identification à partir de déterminent les procédures d’analyse (les statistiques), la taille de
sources diverses (publications, livres, experts auprès de musées et l’échantillon requis pour obtenir des résultats significatifs et le nom-
autres institutions académiques), doit être suivie d’une formation, bre de répétitions nécessaires. Dans certaines études, le marqua-
idéalement dispensée par des experts dans le domaine, sur la maniè- ge des chauves-souris est important pour obtenir des données de
re d’utiliser les clés d’identification. [30] et [31] proposent des clés «capture / recapture» [33] tandis que dans d’autres, la description
quelque peu dépassées mais toujours utiles. Des photos détaillées détaillée des micro-habitats représente l’élément crucial. L’étude

3. Species identification and voucher specimen intensive and require substantial preparations, materials and
The quality of any study on bats depends on correct species expertise, it is essential for the success of the project to clearly
identification. The taxonomyk of the bat faunak of Africa is in define the goal of the study at the outset. The goal of the study
a state of flux, and it is not surprising to find new species. As a determines the analytical approach (statistics), the sample size
first step, materials for species identification need to be gath- needed to obtain meaningful results, and how many replica-
ered from various sources (publications, books, experts at mu- tions are required. For some studies, marking bats might be im-
seums and other academic institutions) followed by training, portant for capture-recapture data (see [33]), in others detailed
ideally through experts in this field, on how to use identification descriptions of microhabitats might be critical elements. In
key(s). Outdated but still useful keys are included in [30] and community studies, the quality of the data should be controlled
[31]. Detailed photographs and tissue samples for later DNA for by species richness estimators as a way to find out how well
analysis are helpful for documentation. In cases where species sampled the study sites are. In preparation for any kind of study,
cannot be identified in the field, collection of voucher speci- detailed protocols should be established, including spread
mensk is recommended, which can be subsequently sent to sheets that permit fast and reliable data entry and subsequent
experts for identification (for details see [32]). It is recommend- analysis. The locations of capture devices as well as roost and
ed to pro-actively search for contacts with experts in museums, feeding sites should be documented with GPS receiversk.
at universities or research institutions who have a background
in the respective bat fauna. Assessing assemblage structure and species
richness of bats
4. Study design Studies on bats usually follow one of two ways. They either fo-
Studies on bats are very much needed to improve our cus on composition and structure of bat assemblages or the
knowledge of African bats. As those studies are rather time- studies are designed to maximize documentation of species

671
10: Methodes | Methods

des communautés et la qualité des données doivent être évaluées l’optimisation de la documentation de la diversité des espèces. Cet-
au moyen d’estimateurs de la diversité spécifique qui permettent te dernière thématique est importante pour l’évaluation rapide de la
de juger de l’efficacité de l’échantillonnage. Avant toute étude, il est richesse spécifique dans des zones n’ayant pas encore été invento-
recommandé d’établir des protocoles détaillés comprenant des riées, où l’échantillonnage est quasiment inexistant ou bien étant
feuilles d’analyse permettant une saisie de données rapide, efficace, sous l’imminence d’une menace, par exemple du fait de change-
et adaptées aux analyses à suivre. Les emplacements des dispositifs ments dans les modes d’utilisation des terres ou du fait d’une ex-
de capture, les perchoirs et les lieux d’alimentation doivent être en- ploitation minière intensive.
registrés grâce à des récepteurs GPSk. L’évaluation de la structure des communautés et de leurs change-
ments dans le temps exige l’utilisation d’un protocole de capture
evaluation de la structure des COMMU- standardisé. Ceci garantit la comparaison entre les données et l’ap-
NAUTES et de la diversité des especes des plication de méthodes statistiques. Par exemple, pendant chaque
chauves-souris période d’échantillonnage, on installera le même nombre de filets
Les études relatives aux chauves-souris s’orientent générale- japonais selon la même configuration. La figure 10.20 illustre un
ment vers une de ces deux directions : elles se concentrent soit exemple de configuration standardisée de filets japonais utilisée
sur la composition et la structure des communautés, soit sur dans le cadre du projet BIOTAk [19]. L’échantillonnage standardisé
à des intervalles prédéfinis sur une longue durée (plusieurs années)
permet d’obtenir des informations précieuses sur la dynamique de
la diversité et le renouvellement des espèces [18, 19]. Il est possi-
ble d’obtenir des résultats similaires en utilisant d’autres moyens de
capture ou grâce à l’inventaire acoustique, sous réserve que ces pro-
tocoles aient été standardisés.

richness. The latter is particularly important for rapid species as-


sessments in areas that have never been inventoried, that are
100 m

seriously undersampled, or that are under immediate threat, for


example through changes in land use or extensive miningac-
tivities. Assessment of assemblage structure and change over
time requires the use of a highly standardized capture protocol.
200 m This ensures that data are comparable with each other and that
statistical methods can be applied. For instance, the same num-
ber of mist nets needs to be set during each sampling period in
the same configuration and for the same length of time. Figure
10.20 gives an example illustrating a standardized mist net con-
figuration used in the BIOTAk project [19]. Standardized sam-
pling at pre-determined intervals over longer time periods (sev-
Fig. 10.20: Disposition standardisée de filets japonais au niveau eral years) permits exciting new insights into the dynamics of
du sol (barres) selon des transects. Le piège-harpe est installé dans species richness and turnover [18, 19]. Similar results can be ob-
des sites appropriés le long du transect, le système de filets éle- tained with the placement of other capture devices or acous-
vés (« filets de canopée ») à l’intérieur ou à proximité du transect. tic monitoring if it is done in a standardized way. If the goal of a
Standardized arrangement of ground-level mist nets (bars) in study is to maximize the number of species present in an area,
transects. The harp trap was installed in suitable sites along the opportunistic sampling is more effective. Here, mist nets and/
transect path, the elevated net system (“canopy nets”) within or or harp traps are placed deliberately at sites where capture suc-
next to the transect. cess is high and maximum number of species can be expected.

672
Si l’objectif de l’étude est de maximiser le nombre d’espèces pré-
sentes dans une zone, l’échantillonnage opportuniste est alors plus
efficace. Dans ce cas, les filets japonais et/ou les pièges-harpes sont
intentionnellement placés dans des endroits où les chances de cap-
ture sont élevées et où on espère récolter le plus grand nombre d’es-
pèces possible. C’est le cas notamment quand les chauves-souris
sont piégées ou enregistrées près des grottes, sur des voies de pas-
sage, près d’un plan d’eau ou en bordure de forêt. L’échantillonnage
opportuniste s’applique à une grande variété d’habitats, à l’aide de
différentes méthodes (filets de sous-bois, filets de canopée, pièges-
harpes) mises en œuvre sur de nombreux sites.
Ces deux approches ont été menées lors du projet BIOTA : la struc-
ture des communautés d’espèces et la diversité des chauves-souris
ont été évaluées à l’aide de méthodes standardisées sur de longues
durées, alors que les régions inexplorées étaient échantillonnées de
façon opportuniste au cours de périodes courtes.

This is the case if bats are trapped or recorded near caves or in


their main flyways, e.g. near water bodies or forest edges. Op-
portunistic sampling is done in a wide variety of habitats and
sampling methods, combining, for example, understorey nets,
elevated nets and harp nets in a maximum number of sites.
Both approaches have been realized in the BIOTA project: struc-
ture of species assemblages and diversity of bats have been
studied with standardized methods over long periods while
unexplored regions were opportunistically sampled over short
periods.

Fig. 10.21: Rhinolophes (Rhinolophus fumigatus) dans leur gîte:


grotte en Burkina Faso. | Horseshoe bats (Rhinolophus fumigatus)
in their day roost: cave in Burkina Faso. JFA

673
10: Methodes | Methods

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