SORBONNE UNIVERSITE

2nd semestre 2020- 2021 – Valérie Brocheriou

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UEDS- Biologie

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BIOLOGIE MOLECULAIRE

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FICHE DE COURS 3 :
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REGULATION DE LA
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TRANSCRIPTION PROCARYOTE
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 REGULATION DE LA TRANSCRIPTION PROCARYOTE

Table des matières

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I- Organisation du génome procaryote p.3

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II- Régulation de l’opéron lactose p.4

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A- L’induction de l’opéron lactose par le lactose est sous contrôle négatif

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p.6

Br
B- La répression de l’opéron lactose par le glucose est sous contrôle positif p.7

de
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C- Régulation transcriptionnelle chez les procaryotes p.8

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 I- Organisation du génome procaryote
Quel est l’impact de la transcription procaryote sur l’organisation de son génome ?
Rappel : Unité de transcription

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Une unité de transcription procaryote peut contenir 1 ou plusieurs gènes.

em

1 gène est une portion d’ADN codant 1 ARN (ARNm, ARNt, ARNr, ARN régulateur)
Ex

Les ARN sont synthétisés en quantités très variables.

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Organisation du génome d’E. Coli :

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Circulaire
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4377 gènes dont 4290 codent des protéines

E
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Orange : gènes dans une orientation

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Jaune : gènes dans l’autre sens, utilisant l’autre brin d’ADN comme brin transcrit
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Chez les procaryotes, l’ARNm est souvent polycistronique = quand on a une unité de

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transcription, elle peut contenir plusieurs gènes. Donc l’ARNm polycistronique issu de la
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transcription servira à la synthèse de plusieurs protéines différentes. La synthèse de ces
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différentes protéines est donc coordonnée.
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Initiation de la traduction :
de

- Eucaryote : 1 ARNm codera 1 protéine ; la coiffe est reconnue par la petite sous- unité
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du ribosome, qui se déplace ensuite jusqu’à l’AUG, codon initiateur

pl
em

- Procaryote : exemple : 1 ARNm avec 3 AUG. ARNm ne porte pas de coiffe. Le

Ex

ribosome reconnaît la séquence de Shine- Dalgarno située quelques nucléotides en

EA

amont de chaque AUG. Puis le ribosome se déplace au 1er AUG.

U
G
N
M

II- Régulation de l’opéron lactose

SA
E
N
N

On rappelle que 1 à 2 copies d’un gène peuvent se trouver amplifier sous 10 à 10 6 copies
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d’une protéine. Il existe donc un contrôle du niveau d’expression, qui peut se conduire au
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niveau transcriptionnel ou au niveau traductionnel, en fonction des besoins de la cellule.

ge

En ce qui concerne l’opéron lactose, le contrôle est essentiellement transcriptionnel.

id
Br
de

Cet opéron permet donc aux bactéries de métaboliser le lactose par la béta- galactosidase
re
ai

après son internalisation via une perméase. Cet opéron code 1 ARNm polycistronique, qui
pl
em

codera pour 3 protéines ; la béta- galactosidase, la perméase, une transacétylase.

Ex
EA

Le lactose induit environ 1000 fois cet opéron au niveau de sa transcription.

U
G

Quand on se place dans un milieu contenant glucose et lactose, on obtient une courbe
N
M

bimodale montrant une première phase de croissance utilisant le glucose (opéron Lac réprimé)
SA

puis une phase de latence avant la transcription de l’opéron Lac et l’utilisation du lactose :
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On observe donc une préférence de l’utilisation du glucose, et cela est vrai quel que soit le

G
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rapport Glucose/ Lactose : le glucose est toujours utilisé en premier :

M
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D’autre part, l’ARNm Lac (codé par l’opéron lactose) arrête de s’exprimer quand on ajoute du
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glucose, ce qui montre encore cette préférence pour le glucose :

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 Donc l’opéron lactose est fortement transcrit seulement en présence de lactose et seulement
en absence de glucose.

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A- L’induction de l’opéron lactose par le lactose est sous contrôle négatif

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Test utilisé : la béta- galactosidase clive le substrat XGal en un produit bleu en présence d’un
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inducteur IPTG, qui mime la présence de lactose mais qui est non métabolisable  sa
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concentration reste élevée tout au long de l’expérience. En utilisant ce test, des souches
id
Br

mutantes de bactéries ont été identifiées dont la régulation de l’opéron lactose est altérée :
de

M1 : incapable d’induire l’opéron lactose : colonies restent blanches

re
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M2 : constitutivement induit : colonies toujours bleues- ex : mutation dans gène codant la

pl
em

protéine LacI
Ex
EA

Cette protéine LacI réprime la transcription de l’opéron Lac. Sous contrôle d’un promoteur Pi
U
G

constitutif, la protéine LacI est produite en permanence, et fixe spécifiquement l’opérateur :

N
M

ceci empêche la reconnaissance du promoteur par la sous- unité sigma de l’ARN polymérase.
SA

Ceci est appelé contrôle négatif (intervention d’un répresseur).

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 En présence de l’inducteur lactose, celui-ci fixe LacI et l’empêche de se fixer à l’opérateur.
En effet, l’inducteur entraîne un changement de conformation de LacI (dimère) : plus de
fixation possible à l’ADN car les hélices alpha de fixation (grises sur la photo), qui étaient en
surface, se retrouvent enfouies au cœur de la protéine.

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En absence de lactose, petite expression de l’opéron pour qu’il y ait de la perméase : ainsi,

N
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quand il y a un peu de lactose, il peut entrer dans la bactérie.

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B- La répression de l’opéron lactose par le glucose est sous contrôle
ge

positif
id
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de
re

Contrôle positif = implication d’un activateur de transcription

ai
pl
em

Le glucose est donc préférentiellement utilisé quand présence de lactose et de glucose 

Ex

comment s’opère la répression par le glucose ? Il s’agit d’une répression catabolique.

EA
U
G
N

En amont du promoteur P existe une séquence palindromique, qui est un site de fixation pour
M

la protéine CRP, qui est un activateur transcriptionnel. Or, CRP ne peut fixer l’ADN que
SA

lorsqu’elle est liée à l’AMPc. Quand la CRP- AMPc est fixée, elle augmente le recrutement
E
N
N

de l’ARN polymérase = contrôle positif.

BO

Or, en présence de glucose, les concentrations en AMPc sont faibles : CRP ne peut alors plus
R
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fixer l’ADN.
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ge
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Conditions métaboliques Effets

Br
de

+ glu CRP non fixée : expression basale : pas d’activation

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+ lac LacI non fixée : répression levée

em

+glu CRP non fixée : expression basale : pas d’activation

Ex
EA

-lac Répresseur LacI fixé

U
G

 Opéron inactivé
N
M

-glu CRP- AMPc fixée

SA

-lac Répresseur LacI fixé

E

 Opéron inactivé
N
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-glu CRP- AMPc fixé : activation

R

+lac Répresseur LacI non fixé

 Opéron activé

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 C- Régulation transcriptionnelle chez les procaryotes

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Contrôle Protéine Effet

M
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Positif Activateur La fixation de la protéine sur

E
le promoteur ou des sites

N
N
régulateurs augmente le

BO
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tS niveau de transcription par
rapport au niveau basal
ge

Négatif Répresseur La fixation d’une protéine

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sur le promoteur ou des sites

de

régulateurs diminue le niveau

re
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de transcription par rapport

pl
em

au niveau basal
Ex
EA

Comment une protéine régulatrice fixe- t- elle l’ADN ? Dans la molécule d’ADN, le
U
G

plateau des bases azotées est perpendiculaire au plan de la double hélice, ce qui définit grand
N
M

et petit sillons. Les paires GC et CG au niveau du petit sillon ont un profil d’atomes donneurs
SA

et accepteurs de protons identiques. Idem pour AT et TA. L’information accessible par le

E
N

grand sillon est donc plus riche, et la grande majorité des protéines qui fixent l’ADN le fait au
N
BO

niveau du grand sillon.

R
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ge
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Induction ou Activation Répression

Br

Contrôle positif Contrôle négatif Contrôle positif Contrôle négatif

de
re

Fixation d’un Levée de répression Levée d’une Fixation d’un

ai

activateur (CRP- grâce à un inducteur activation (Glucose répresseur (LacI sur

pl
em

AMPc) (LacI/ inducteur qui empêche opérateur)

Ex

lactose) activation par CRP)

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