Cours de Biochimie
11/06/2023
I. Introduction générale
I.1. Définitions et objectif
✓ Biochimie : Chimie des êtres vivants (ou science des bases chimiques
de la vie) ou chimie de la matière vivante
✓ C’est la discipline scientifique qui explore chez les êtres vivants, les
réactions chimiques qui permettent le maintien de l’état vivant
✓ Elle étudie donc la constitution chimique des substances qui
composent la matière vivante ainsi que celle des réactions qui s’y
déroulent
• Ces réactions, dites biochimiques, se distinguent des réactions chimiques
ordinaires par leur haute spécificité grâce à l’action des enzymes
• Toutes ces réactions chimiques naturelles vont permettre avant tout de construire
les tissus de l'organisme et de les dégrader
I. Introduction générale
I.1. Définitions et objectif
✓ L’analyse de la matière biologique montre qu’elle est constituée de
molécules se conformant aux mêmes lois physiques régissant la
matière inanimée
✓ Or les organismes vivants possèdent des propriétés qu’on ne
rencontre pas dans le monde inanimé.
• C’est le cas notamment de : reproduction, locomotion, spécificité des fonctions
des composants, spécificité d’extraire et de transformer de l’énergie à partir de
leur environnement et respiration
Résumé: la biochimie consiste à déterminer la façon dont les molécules
inanimées qui constituent l’organisme vivant réagissent les unes avec les
autres pour maintenir et perpétuer la vie.
✓ L’étude de toutes ces propriétés extraordinaires constitue l’objet de la
biochimie
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I. Introduction générale
I.2. Subdivision
✓ Traditionnellement, la biochimie se divise en deux branches: biochimie
générale et biochimie métabolique
• Biochimie générale (biochimie descriptive, structurale ou statique) est une
branche de la chimie organique qui décrit les substances qui composent les
êtres vivants
• Biochimie métabolique (dynamique) s’apparente à la physiologie:
o Elle étudie les différentes voies métaboliques de la cellule
o C’est-à-dire les réactions chimiques qui élaborent des molécules des
êtres vivants (anabolisme) ou leur destruction (catabolisme) productrice
d’énergie sous le contrôle enzymatique
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I. Introduction générale
I.2. Subdivision
✓ Dans un autre classement, la biochimie comprend la biochimie
structurale, la biochimie métabolique, l’enzymologie et la biochimie
moléculaire
• Biochimie structurale: étudie la composition atomique précise des molécules biologiques
(lipides, protéines, glucides, acides nucléiques, etc.), la façon dont ses atomes s’assemblent
et la structure tridimensionnelle qui en résulte.
• Biochimie métabolique: étudie les différentes voies métaboliques de la cellule, c’est-à-dire
toutes les réactions chimiques qui assurent la synthèse des molécules du vivant
(anabolisme) ou leur destruction, productrice d’énergie (catabolisme) qui se déroulent de
manière ininterrompue dans la cellule, sous le contrôle d’enzymes.
• Enzymologie: est la branche de la biochimie qui étudie les enzymes, leurs structures et leurs
activités.
• Biochimie moléculaire qui se familiarise avec la biologie moléculaire = ensemble des
réactions qui permettent l'expression et la transmission du message génétique. C'est donc la
biochimie de l'ADN, qui est le vecteur de l'information génétique. 5
I. Introduction générale
I.3. Applications
✓ En médecine
• Elle permet d’éclairer les causes des maladies et de proposer par
conséquent des traitements innovants
✓ En agronomie
• C’est grâce à la biochimie qu’on est capable d’optimiser le rendement
des cultures ou de développer des engrais ciblés, et d’améliorer le
stockage des récoltes et l’élimination des parasites.
✓ En diététique
• La biochimie apporte une meilleure compréhension des effets des
carences alimentaires ( elle aide à concevoir des régimes alimentaires
plus sains)
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I. Introduction générale
I.3. Quelques rappels
▪ Hydrophile (qui a de l’affinité pour l’eau) : composé attiré et tendant à être dissous par l’eau
et les solvants polaires.
▪ Hydrophobe : composé repoussé par l’eau, il est donc insoluble dans l’eau. Il n’a pas la
capacité de créer des liaisons hydrogène avec les molécules d’eau.
▪ Lipophile : se réfère à la capacité d’un composé chimique à se dissoudre dans les graisses, les
huiles, les lipides et les solvants non polaires.
▪ Corps gras : un corps gras est une substance composée de molécules ayant des propriétés
hydrophobes
▪ Amphiphile : une espèce chimique (soit une molécule ou un ion) possèdant à la fois un
groupe hydrophile et un groupe hydrophobe. Les savons sont basés sur cette propriété.
▪ Hydrocarbure : composé organique contenant exclusivement des atomes de carbone (C) et
d’hydrogène (H).
▪ Composé aromatique : composé chimique contenant un système cyclique respectant la règle
d’aromaticité de Hückel.
▪ Composé aliphatique : composé carboné acyclique ou cyclique, saturé ou insaturé, à
l’exclusion des composés aromatiques
I. Introduction générale
I. 4. Constituants de la matière biologique
✓ Matière biologique animale ou végétale est constituée de plusieurs
éléments chimiques engagés dans les combinaisons minérales (Eau,
matières minérales) et organiques (glucides, lipides, protides,
vitamines, enzymes, hormones,…).
Eau
Matières
MATIÈRE
minérales
BIOLOGIQUE
Matières
sèches
Matières
organiques
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❖ Composition élémentaire
✓ La matière vivante comprend deux types d’éléments:
▪ Les éléments majeurs qui représentent 99,9 % de l’organisme humain entier:
C, H ,O, N, S, P, CI, Ca, Mg, K, Na (onze); parmi ceux-ci C, H, O et N ont, eux
seuls, une teneur de 95%.
▪ Les oligoéléments se trouvant en très petite quantité dans la matière
vivante. C’est le cas notamment de Fe, Zn, Cu, Mn, Mo, Co, F, Ni et I.
I. Introduction générale
❖ N.B: Importance biologique des quelques atomes
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I. Introduction générale
❖ Composition minérale et organique
✓ Les substances minérales de la matière vivante sont constituées de
sels minéraux et de l’eau.
• Les sels minéraux sont principalement à l’état solide non ionisé (ex
éléments minéraux de squelette et de dents) et en solution sous
forme d’ions.
✓ Les substances organiques peuvent être classées en deux catégories
selon leurs fonctions biochimiques: les substances organiques
fondamentales et les substances organiques fonctionnelles
• Les substances organiques fondamentales participent à la constitution anatomique des
tissus végétaux et animaux. Par dégradation, elles libèrent l’énergie nécessaire aux
fonctions vitales. Ce sont : glucides ou sucres (appelés aussi hydrates de carbone), lipides ou
matières grasses et protéines
• Les substances organiques fonctionnelles exercent une fonction particulière dans le
fonctionnement de l’organisme. C’est le cas des enzymes, hormones, vitamines et acides
nucléiques.
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I.5. Subdivision du cours
✓ Module I: Biochimie structurale
✓ Module II: Biochimie moléculaire et enzymologie
✓ Module III: Biochimie métabolique
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I.6. Prérequis et bibliographie majeure
✓ Chimie Générale
✓ Chimie organique
✓ Physiologie
✓ Biologie,….
❖ Bibliographie : en cours
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I. Introduction générale
I.7. Organisation du cours
✓ Volume horaire : 120 H
• 90 heures théoriques, 15 heures de travaux dirigés et 15 heures
de travaux pratiques
✓ Enseignements par chapitre de chaque module : ex cathedra et
séminaires issus des travaux en groupes des étudiants
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