Objet et Etude de la biochimie
A) Objet de la biochimie
La biochimie est la science qui a pour objet l’étude des êtres vivants, ainsi que des
phénomènes dont ils sont le siège du point de vue de la chimie.
Comme discipline scientifique, la biochimie s’intéresse en particulier aux structures, aux
fonctions et aux interactions de macromolécules biologiques telles que les glucides, les
lipides, les protéines et les acides nucléiques qui constituent les structures cellulaires, et
réalisent de nombreuses fonctions biologiques. Les résultats de la biochimie trouvent des
applications dans des nombreux domaines tels que la médecine, la diététique,
l’agriculture etc.…
B) Etude de la biochimie
Elle consiste en l’étude des réactions chimiques qui se déroulent au sein des êtres
vivants et notamment dans les cellules cette étude repose sur certains concepts
biochimiques :
1. Le métabolisme : Le métabolisme est l’ensemble des réactions chimiques
qui se déroulent au sein de la cellule vivante pour lui permettre de se
maintenir en vie, de se reproduire, de se développer et de répondre aux
stimuli de son environnement.
2. Le métabolite : C’est un composé organique intermédiaire ou issu du
métabolisme. Par opposition aux macromolécules le métabolite désigne
une petite molécule. C’est un monomère (par analogie avec la
polymérisation). Ex : le glucose est un métabolite, contrairement au
glycogène qui est un polysaccharide (macromolécule)
3. L’enzyme : C’est une substance organique produite par des cellules
vivantes, qui agit comme catalyseur dans les changements chimiques.
4. La biosynthèse : C’est la fonction de substances par un être vivant dans
son milieu interne ou dans les excrétâts (coquilles des œufs ou des
mollusques ; écorce de l’arbre ; mucus etc.…)
5. La voie métabolique : C’est l’ensemble de réactions chimiques, se
déroulant dans une cellule vivante, et catalysées par une série d’enzymes
qui agissent de manière séquentielle. Les voies métaboliques peuvent être
linéaires, ramifiées ou cycliques.
- Si une voie métabolique aboutit à la synthèse d’une molécule, elle
est dite voie anabolique
- Si une voie métabolique conduit à la dégradation d’un composé, la
la voie est catabolique.
Chap1: Composition et structure de la matière vivante
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I. Composition élémentaire de la matière vivante
La matière vivante est constituée des éléments suivants :
1. éléments minéraux
- L’eau
- Les sels minéraux
2. éléments organiques Ce sont des macromolécules organiques
appartenant à 3 grandes familles :
- Les glucides
- Les lipides
- Les protides
3. Les acides nucléiques (ADN et ARN)
4. Les acides animés
Tableau donnant la composition moléculaire et les pourcentages en masse
de l’organisme humain (adulte)
Familles ou espèces chimiques Pourcentage en masse
eau 70%
protéines 15%
Acides aminés et métabolite 0,8%
Lipides et métabolites 2%
glucides et métabolites 3%
acides nucléiques 7%
sels minéraux (ions inorganiques) 1%
nucléotides et métabolites 0,8%
Divers 0,4%
II. Composition Chimique de la matière vivante
La matière vivante est constituée de macromolécules, elles mêmes constituées de
plusieurs éléments chimiques dont : le carbone l’hydrogène, l’azote, l’oxygène, le
soufre, le phosphore, le fer, le magnésium, le cuivre etc.….
- Le carbone, l’hydrogène, l’oxygène et l’azote constituent les 4 éléments
fondamentaux des molécules organiques de la matière vivante (glucides- lipides
protides -acides animés ARN - ADN)
- Le phosphore et la soufre sont importants dans la conception de la
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membrane cellulaire.
- L’eau et les sels minéraux apportent à l’organisme les oligoéléments
indispensables à sa santé (Na – K-Ca Mg-Zn-Mn-I-Fe…)
III. Structures des éléments organiques
1. Les glucides : Jadis appelés hydrates de carbone ou encore
carbohydrates car répondant à la formule chimique générale C n (H2O) p, les
glucides se présentent généralement sous forme de cristaux blancs. Ils font partie
des constituants essentiels de la matière vivante dont ils représentent la principale
source d’énergie dans les réactions métaboliques. L’oxydation des glucides au
cours de la digestion apporte environ 17 KJ /g. Les glucides sont répartis entre 2
grandes familles :
- Les oses (monosaccharides) tels que le glucose, le fructose ou le galactose
(ose : ne peut être hydrolysé en glucides plus simples)
- Les osides (oligosaccharides et polysaccharides) qui sont des polymères
d’oses tels que le saccharose, le lactose ou le maltose. La plupart des glucides
alimentaires contiennent du glucose (amidon, glycogène, saccharose, lactose…).
Chez l’homme tous les glucides sont livrés aux cellules sous forme de glucose
(C6H12 O6). Un des 16 stéréo-isomères du glucose :
H O
C
H OH
HO H
H OH
H OH
CH2OH
2. Les lipides : les lipides ou corps gras, sont les graisses de la vie courante. Ils sont
insolubles dans l’eau : on dit qu’ils sont hydrophobes. Ils existent sous 3 formes
principales : les acides gras, les cholestérols et les triglycérides dont la forme
utilisable par l’organisme humain est à base du glycérol. Les triglycérides sont
essentiels à l’organisme. Ils constituent principalement les graisses animales et les
huiles végétales. Ils représentent une réserve importante en énergie.
3. Les protéines : les protéines sont constituées d’un enchainement
d’acides aminés liés par des liaisons peptidiques. Ce sont des macromolécules de
la cellule dont elles constituent la pièce maîtresse lui permettant de digérer sa
nourriture, produire son énergie, fabriquer ses constituants et de se déplacer.
Liste des 20 acides aminés principaux
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Nom Code (3lettres) Nom Code (3lettres)
Glycine Gly Asparagine Asn
Alanine Ala Acide glutamique Glu
Valine Val Glutamine Gln
Leucine Leu Lysine Lys
Isoleucine Ile Arginine Arg
Sérine Ser Phénylalanine Phe
Thréonine Thr Tyrosine Try
Cystéine Cys Tryptophane Try
Méthionine Met Histidine His
Acide aspartique Asp proline Pro
NB: Les acides aminés essentiels sont soulignés
Chap. 2 : Le Métabolisme
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I) le métabolisme de l’eau et des sels minéraux
1.a .Rôle de l’eau dans l’organisme
L’eau est un constituant essentiel, aussi bien pour les végétaux que les animaux.
- Chez les végétaux, l’eau alimente la sève des plantes qui transporte les
éléments indispensables à leur croissance.
- Chez les animaux, l’eau irrigue chaque cellule. Elle apporte aux cellules
les substances nutritives et les débarrasse des déchets et toxines. Privés l’eau,
animaux et végétaux ne peuvent survivre très longtemps. L’eau est indispensable
au fonctionnement de nos cellules l’organisme humain (personne adulte) est
constitué d’environ 60% d’eau. Ce taux est de 85% chez l’enfant. Les besoins en
eau sont différents selon qu’on est au repos ou au cours d’un effort physique.
1. b. Mouvements de l’eau dans l’organisme
Dans l’organisme, l’eau peut se retrouver dans trois compartiments
possibles :
- la cellule
- le sang (dans le plasma sanguin)
-les tissus interstitiels (ni la cellule- ni le sang)
Les entrées et sorties d’un compartiment à l’autre constituent les
mouvements de l’eau dans l’organisme et assurent en permanence une
hydratation parfaite de notre corps.
1. c. L’eau métabolique
L’eau métabolique est l’eau crée à l’intérieur d’un organisme vivant par le
biais de son métabolisme, par oxydation des nutriments énergétiques de sa
nourriture. Chez l’homme environ 8% à 10% des besoins en eau de l’organisme
sont obtenus par production métabolique d’eau.
1. d. Métabolisme de l’eau
L’organisme élimine en permanence de l’eau via les excrétions (urines), la
respiration et surtout la transpiration. L’eau est indispensable pour assurer les
différentes fonctions métaboliques du corps humain (régulation de la
température, transport des nutriments hormones et enzymes dans le sang,
transport de l’oxygène aux cellules etc.….)
Le métabolisme de l’eau est essentiellement sous la dépendance des reins
et des hormones chargées de stabiliser l’hydratation et le sodique organique.
Toute modification de l’état d’hydratation sera immédiatement pris en compte et
stabilisé par une dilution ou une concentration des urines.
2. Métabolisme des sels minéraux
Les sels minéraux, éléments chimiques essentiels entrant dans la
composition des l’organisme, sont présents dans l’alimentation. Ils se présentent
sous forme ionique (anion ou cation).
Exemple : Na+ ; Cl- ; Ca²+ ; K+ ; I- .
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Ce son des substances indispensables à l’organisme. On les classe en 2
catégories :
- Les 6 macro- éléments ou éléments majeurs (Ca, Cl, Mg, P, K, Na)
- Les 15 éléments traces ou oligoéléments (As, B, Cr, Co, Cu, Fe, F,I ,Mn, Mo, Ni ,
Se ,Si, V, Zn).
Ils sont indispensables à la réalisation de nos fonctions multiples organiques comme la
minéralisation, le contrôle de l’équilibre en eau, les systèmes lymphatiques et
hormonaux, les systèmes musculaires, nerveux, immunitaires etc.…..
II) Métabolisme des glucides :
Le métabolisme des glucides est l’ensemble des divers processus
biochimiques responsables de la formation, de la dégradation et de l’inter
conversion des glucides chez les organismes vivants.
Le glucide le plus important est le glucose. Il est métabolisé par presque tous les
organismes vivants. Les organismes capables de respiration aérobie métabolisent
le glucose et l’oxygène pour libérer de l’énergie (stockée sous forme d’ATP) et
donner de l’eau et du dioxyde de carbone selon:
C6H12 O6 + 6O2 6CO2 + 6H2O +E
(Cycle de KREBS – respiration cellulaire).
La dégradation du glucose, qui libère du dioxyde de carbone (CO 2) et de l’eau
(H2O) au cours de la respiration cellulaire est une source d’énergie importante (E)
pour les cellules vivantes. Le glucose est une molécule énergétique en biochimie.
Il est utilisé comme source d’énergie à raison de 2871KJ.mol soit environ 16KJ .g-1.
Cette énergie libérée par ces réactions est récupérée sous forme d’ATP (Adénosine
Triphosphate) par l’ATP synthase. Le glucose fournit presque toute l’énergie
consommée par le cerveau. En cas de baisse du taux de glucose disponible pour le
cerveau, certaines fonctions cérébrales sont altérées (self contrôle – prise de
décision).
III) Métabolisme des lipides
Le métabolisme des lipides est l’ensemble des réactions des constructions (anabolisme) des
lipides au sein de l’organisme.
Les lipides alimentaires (acides gras- cholestérol –triglycérides) sont mélangés aux sels biliaires et
à la lipase pancréatique dans l’intestin grêle pour former des micelles (agrégats de molécules
bipolaires). Ces micelles sortent des cellules de l’intestin grêle sous forme de chylomicrons
(lipoprotéines formées en période de digestion) responsables du transport des lipides de l’intestin
grêle vers les tissus adipeux où ils sont retraités.
IV) Métabolisme des protéines (acides aminés)
Les protéines sont constituées d’un enchainement d’acides aminés qui constituent l’unité de base
du métabolisme des protéines. Les acides aminés peuvent être soit dégradés, soit à nouveau
transformés en protéines.
1
1. dégradation : les acides aminés empruntent le cycle de l’urée c'est-à-dire une
suite de réactions qui les transforment en urée qui passera dans le sang et sera
éliminée dans les urines.
2. Synthèse : Les acides aminés peuvent à nouveau recréer des protéines en passant
par le processus dit de « traduction » et qui utilise le code génétique de la cellule.
V) Métabolisme des acides nucléique : (ADN – ARN)
ADN : Acide Désoxyribonucléique
ARN : Acide Ribonucléique
Les acides nucléiques sont des macromolécules relativement complexes. Ils entrent dans
la famille des biomolécules , car d’une très grande importance dans le règne de la vie. Ce
sont des polymères dont le monomère est le nucléotide. Ces nucléotides sont reliés par
des liaisons phosphodiesters. ADN et ARN sont le support de l’information génétique.
L’ADN joue un rôle dans la duplication des molécules avant la mitose (division cellulaire :
création de deux cellules filles identiques)
ADN Transcription ARNpm Maturation ARNm Traduction Peptide
ARNt
Protéine peptide ARNRib Maturation Acides Aminés
Et association
VI Rôles des protéines et des enzymes
1. Les enzymes : les enzymes ont pour rôle d’accélérer des réactions chimiques dans
les organismes vivants. Elles jouent le rôle de catalyseurs.
Exemple :
- alpha amylase (enzyme de salive) est une enzyme digestive pour la digestion de
l’amidon.
- lipase linguale aide à digérer les lipides du lait maternel chez le nourrisson.
2. Les protéines : Dans la cellule vivante, les protéines jouent plusieurs rôles
essentiels .Elles ont des fonctions cellulaires et des fonctions biochimiques.
a) Fonctions cellulaires :
- Elles participent au renouvellement des tissus et à la constitution de toutes les
cellules de la peau, des os, des muscles, du sang, des organes, des phanères
(cheveux, ongles, poils)
- Elles interviennent dans toutes les fonctions vitales de l’organisme : les hormones,
les neurotransmetteurs et les enzymes sont des protéines ;
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- Elles produisent du glucose par néoglucogenèse ;
- Elles sont compensatrices des pertes azotées du corps (transpiration, perte des
cheveux, pertes fécales, urinaires…) ;
- Elles sont nécessaires à la contraction musculaire et donc à l’origine des mots.
b) Fonctions biochimiques : Certaines protéines sont des catalyseurs. Elles
permettent à des réactions chimiques de se dérouler rapidement dans les
conditions de tp et de pression conformes à la vie. Elles jouent le rôle
catalytique des enzymes.
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LBM1 ANNEE 2019
ELEMENTS DE BIOCHIMIE
Cours de M. Mahaman Kabirou BOUZOU
1
Région de Maradi Nom :……………………………………………………….. Note
I.S.P MARAFA (Maradi) Prénom : ……………………………………………………..
1ère Année ASB (TC) 1ère Evaluation de CHIMIE Date :
Exercice 1 : (5pts) Répondre par Vrai ou Faux aux affirmations suivantes :
1) La formule générale des alcanes est :
A) C n H2n
B) C2n H2n
C) CnH2n+2
D) C2nHn
E) C2n H2n+2
2) Un alcène est un hydrocarbure dont la molécule possède :
A) Un double liaison carbone – oxygène
B) Exclusivement des simples liaisons carbone- carbone
C) Un double liaison carbone – hydrogène
D) Une double liaison carbone- carbone
E) Des simples liaisons carbone –hydrogène
Exercice 2 : (5pts) Répondre par Vrai ou Faux aux affirmations suivantes :
1) une molécule dont la formule brute est C5H10 est :
a) un hydrocarbure
b) un hydrocarbure saturé
c) un alcool
d) un hydrocarbure insaturé
e) un alcène
2) A la formule brute C2H6O correspondent les deux formules structurales différentes
A et B suivantes :
(A)= CH3- CH2-OH (B) = CH3-O-CH3
(A) et (B) son dits:
a) diastéréoisomères
b) isomères de conformation
c) isomères de fonction
d) isomères de chaînes
e) isomères de position
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Exercice 3 :(6pts) Choisir la bonne réponse en mettant une croix dans la case
correspondante :
1) Chez les alcanes combien d’atomes sont liés à chaque atome de carbone :
a) 2
b) 3
c) 4
d) 5
2) Parmi les formules suivantes cocher celles qui correspondent à des alcanes :
a) C6H14 f) C3H8
b) C7H14 g) C5H10
c) C4H10 h) C6H6
d) C8H12 i) C5H12
e) C3 H 4 j) C2H6
Exercice 4: (4pts) Ecrire dans chaque case la bonne réponse.
1) La formule ci- contre est une formule CH3-CH3
2) La formule ci- contre est une formule C2 H 6
H H
3) La formule ci - contre est une formule H-c- c-H
HH
H H H CH3
4) Les formules C= C et C= C sont des ……………
CH 3 CH3 CH3 H