Le microbiote intestinal et son rôle dans l’immunité
4 septembre 2025
Résumé
Le microbiote intestinal, ensemble des micro-organismes résidant dans le tube digestif,
interagit étroitement avec le système immunitaire. Ces interactions influencent le dévelop-
pement immunitaire, la régulation inflammatoire et la résistance aux infections, et ont des
implications cliniques importantes (maladies inflammatoires, allergies, métabolisme).
Mots-clés : microbiote, immunité, barrière intestinale, cellules immunitaires, inflammation,
dysbiose.
1 Introduction
Le tube digestif héberge des milliards de micro-organismes (bactéries, virus, champignons)
qui forment le microbiote intestinal. L’équilibre de cet écosystème (eubiose) est essentiel pour la
santé : il participe à la digestion, à la synthèse de molécules, et joue un rôle clé dans l’éducation
et la modulation du système immunitaire.
2 Problématique et hypothèses
Problématique : Comment le microbiote intestinal influence-t-il le système immunitaire et
quelles conséquences pour la santé ?
Hypothèses de travail :
H1. Un microbiote équilibré favorise la maturation des cellules immunitaires et la tolérance.
H2. Une dysbiose (déséquilibre) contribue aux maladies inflammatoires et aux allergies.
H3. Interventions (probiotiques, prébiotiques, alimentation) peuvent moduler l’immunité via
le microbiote.
3 Rappels : barrières et acteurs immunitaires intestinaux
— Barrière physique : épithélium intestinal, mucus.
— Immunité innée : cellules épithéliales, macrophages, cellules dendritiques, cellules NK,
peptides antimicrobiens.
— Immunité adaptative : lymphocytes B sécréteurs d’IgA sécrétoires, lymphocytes T
régulateurs (Treg) et effecteurs.
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4 Mécanismes d’interaction microbiote–système immunitaire
Éducation du système immunitaire
— Les micro-organismes commensaux stimulent la maturation des centres germinatifs et la
production d’IgA.
— Certains composants bactériens (LPS, peptidoglycanes) et métabolites (acides gras à
chaîne courte, SCFA) activent des récepteurs PRR (TLR, NLR) et modulant la réponse
immunitaire.
Maintien de la tolérance
— Les SCFA (ex. butyrate) favorisent la différenciation des Treg et la production d’IL-10.
— IgA sécrétoires limitent l’adhérence des pathogènes tout en préservant la flore commen-
sale.
Barrière intestinale et inflammation
— Dysbiose → perméabilité intestinale accrue (“leaky gut”), translocation microbienne et
inflammation systémique.
— Rôle des macrophages et des DC dans la détection et la réponse à ces signaux.
5 Conséquences cliniques et applications
5.1 Maladies inflammatoires de l’intestin (MII)
— Dysbiose souvent observée dans la maladie de Crohn et la rectocolite hémorragique.
— Approches thérapeutiques : antibiotiques ciblés, probiotiques, transplantation de micro-
biote fécal (TMF).
5.2 Allergies et auto-immunité
— Déséquilibres précoces du microbiote chez le nourrisson associés à un risque accru d’al-
lergies (hypothèse de l’hygiène).
— Modulation du microbiote comme stratégie préventive/curative.
5.3 Métabolisme et immunité
— Microbiote et obésité : signaux inflammatoires chroniques de bas grade influençant la
résistance à l’insuline.
— Implications pour maladies métaboliques et inflammatoires.
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6 Propositions d’activités pédagogiques (SVT, tronc commun)
1. Étude de documents : comparer microbiotes de sujets sains vs patients MII (graphique,
diversité alpha/béta).
2. Expérience simplifiée : observation (schématique) de l’effet d’un antibiotique sur la
diversité microbienne ; discussion des conséquences immunitaires.
3. Débat : avantages et risques de la transplantation de microbiote fécal.
7 Conclusion
Le microbiote intestinal est un acteur central de l’immunité ; son équilibre conditionne la
résistance aux infections, la régulation inflammatoire et la santé métabolique. Comprendre ces
interactions ouvre des pistes thérapeutiques prometteuses (probiotiques, TMF, interventions
alimentaires).
Bibliographie indicative
— Revues sur le microbiote intestinal et immunité.
— Articles sur les SCFA et la différenciation des Treg.
— Travaux cliniques sur la transplantation de microbiote fécal.
Annexe : lexique
— Dysbiose : déséquilibre de la composition du microbiote.
— SCFA : acides gras à chaîne courte (butyrate, propionate, acétate).
— TMF : transplantation de microbiote fécal.
