PARTIE 1: MYCOLOGIE GENERALE + CHAPITRE 1: GENERALITES + CHAPITRE 2: DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE EN MYCOLOGIE + CHAPITRE 3: CLASSIFICATION DES CHAMPIGNONS>, Wo sor PARTIE 2: MYCOLOGIE SPECIALE \ + CHAPITRE 1: LES MYCOSES A vse PORTUNISTES BBM Facute de Médecine, Cctavie Lingua Met, MD, Pnd ee + CHAPITRE 2: LES MYCOSES.A CRAMPIGNONS DIMORPHIQUES ey Karate, MO, So + CHAPITRE 3: LES MYCOSES\A\CHAMPIGNONS FILAMENTEUX OPPORTUNISTES + CHAPITRE 4: LES DERMATOPHYTES ‘Année académique 2024-2025 oe * Mycologie médicale: Etude des champignons microscopiques d’intérét médical * Levure: champignon unicellulaire, généralement rond ou ovoide, qui se reproduit par bourgeonnement.* Plus de 100 000 espéces connues * La plupart sont saprophytes ; environ 0,5 % sont pathogénes ou opportunistes * Prévalence élevée pour les dermaphytoses et candidoses trés peu contagieuse & exception des der rmatophytoses, candidose et Morphologie int par bourgeonnement (ex: Candida) * Forme filamenteuse (s/t de filaments appelés hyphes), segmenté Chaque segment contient le cytoplasme et les noyaux. ex: Aspergillus e sO cress von peer conker x ao a La majorité des champigné 1s ne forment pas de spores sexuées he Type de spores ‘Structure qui permettent la propagation et Pepidogiyeane, tipopbyacchande et luca, mnnane et hitne | eames malt eytopasme 2 types de diagnostic **Le diagnostic direct décéle dans les produits pathologiques la présence du champignon ou ses composants(antigenes ou génome) * Le diagnostic indirect décé A .. le sang d'une réponse immunitaire sous forme d’anti pécifiques du champignon SoLe prélévement + La rentabilité de Vexamen mycologique dépend de la qualité du prélévement + Squames cutanées ou unguéales + Expectoration / aspirations / Liquide Broncho-alvé: * Biopsies pulmonaires * Biopsies / Ponctions.. * Urines + Muqueuses... + Le prélévement doit étre fait & oi se trouve le champignon La microscopie aprés coloration + Observation du prélévement dans un réactif dissociant ou éclaircissant + KOH 30%, Noir Chlorazole . Ea *Chloral lactophenol (poils-cheveux) * Scotch®-Test 2 7 * Observation dans de I’encre de chine * Recherche de Cryptococcus neofetm *Colorations spécifiquesounon” * May Grunwald Giemsa (MGG) * Gomori-Grocott imprégnation argentique + Periodic acid schiff (PAS) 1. La microscopic * Levures ont plusieurs formes (ex. candida + Formes bourgeonnantes, blastos + Pseudo-filaments + Filaments, hyphes + Arthrospores * Capsule ra AEA ire seul permet de poser le diagnostic d'infection fongique avée certitude Ex:encre de chine positive [Link]-LGR.=cryptococcose neuro-méningée 2. La culture et identification + + antibiotiques( chloramphénicol) inhibe la croissance bactérienne (Onychomycoses non-dermatophytiques Candida, Scytalidium, Fusarium, Acremonium, Aspergillus, Scedosporium...) jeu de Sabouraud + Actiione™ e + +/-cycloheximide + Empéche la pousse des moisissures. Isolement des dermatophytes (cr cn cometnesen bey lente) des levures* Culture 4 30 et 35°C + Temps de culture variable 1s, Mucorales) : mycoses exotiques (Hist. + Hémocultures dans les flacons ordingire ~ Levures : 1-5 jours (prolonger a 1 tient sous Antifongique) - Champignons: 5-10 jours CG NB: Aspergillus dans des hémBe6iphres = contamination - Mycose exotique: eS + pour la détection rapide des infections fongiques. + Surtout en cas de fongémie lorsque les hémocultures sont positives 4, La sérologie VA + Recherche des antigenes 5 \) * tent antigbe cryptooccique dangle tghM@plsma ou sérum oe eee + Le test de fantigane py eeharide &'Histoplasmeo (HPA) est un bon indicateur de Thistoplasmose active ifyasive ou disséminée ectrométrie de masse {MALDI-TOF)= Matrix Asistedaser Desorption/LonzationTime-of- ight. ‘Avec * Recherche des anticorps * Utile lorsqu'elle est appliquée & une maladie fongique spécifique. + Efficace en fonction des mycoses. + Tests sérol lus courants : + les tests immunoenzymatiques = = la fois les anticorps IgG et oe Pent + Agglutination de YT latexr due & Malassezia 3 Trichophyton + Mycoses opportunistes + Maladie opportuniste dj + Mycoses ae 5 + Selon le mode de ec Sexuée + Asexuée classe Division issures ex. Aspergillus implantation ex. Sporothrix schenckii Genre classe Division Genre> Candida : C. albicans, C. glabrata, C. tropicalis, C. parapsilosis, et C. krusei Diagnostic * Prélavement : sang, sécrétions vaginales , urines, selles, ongles ou lésions Epidémiologie cutanées ou cutanéomuqueuses... + Commensal de la peau et des muqueuses (digestive , vaginale et buccale * Examen direct : Gram positif (60%)) de ’homme et les animaux + culture: + 596 de femmes souffrent de candidose vulv a le recidivante + Sabourraud Pathologies opportunistes: °. 2 Curomogine + Hémoculture ~ Candidose : muguet (bouche et vagin\Jaeandidose buccale peut entrainer une maladie invasive si non trai nies) - Vulvoganite, intertrigo, en -antibiotique, corticoides - Candidémie 9 + Maldi-Tot + PCR Catace > Cryptococcus : C neoformans et C gatii Clinique Epidémiologie + Responsable: cryptococcose méningée (forme classique). : ‘ + Elle peut envahir aussi la peau, les os, les poumons (capsule phénol oxydase Saprophyte de sol. in vivo, il est encapsulé : sont des facteurs de virulence} * Cn. biovar neoformans: cosmopolite dans les fientes de pigeons et Diagnostic: les copeaux de bois tropicaux (groupe & risque: immunodéprimés (VIH, * Prélvement : LCR traitement immunosuppresseur) * Cn. biovar gatii; uniquement racer aa tope: /'Eucalyptus camatdulesis (immunocompétents) xN -Encre de chine -Culture sur Sabouraud + antibiotiqui amannie “Ag soluble Ere de chine conwe : ue -Test d'agglutination au latex\, “). + Transmission est aérienn PCR. °O” p= PCR. ~\ Traitement: ) Amphotéricine B et 5- fluorocytosine (5-FC)foplasma, Blastomyces , Paracoccidioides, Coccic + Asymptomatique alias + Localisée : + Hépatosplénomégalie chez enfant Histoplama : + Pulmonaire chez Vadulte (similaire a la tuberculose) + 2 biovars: H. copsulatum capsulatum (amérique) S(Geposuttum duboi « Disséminée @ + saprophyte du sol enrichi ( riche en azot Ye ) engigite® oiseaux et en guanos de chauve-souris nos x i (ay ies du champignon + Prélevement expectorations, LEG a + Transmission aérienne suite & inh os én sang ou lavage gastrique istoplasmine et cutanée + En ROC: cas’ Kimpese ( Kor wement pour pldémiologques parce que iterferent avec les ; : ests sérologiques) + Infection intracellulaire fe réticulo endothelial (moelle osseuse, poumons, NY foie et rate) + Culture + gélose au dextrose Sabouraud a 25 °C (forme mycélienne) a 37°C (forme on G a sid icémie, greffe d’ + Sérologie : fixation du complément , immunodiffusion et E1A (antigénes , Pena ae cone eee anticorps) + >L million de personnes sont affectées d'aspergillose invasive + Histopathologie Faery uuvoir pathogéne + Immunocompétents: Aspergillose bron sévere avec sensibi \m@naire allergique (ABPA), asthme ee mcennncnus Sg aco eee en saxon + Intoxication due a Faflatoxine’suiPles céréales avec des moisissures (A,flavus, A. parasiticus) & la base du tancer primitif du foie + Otomycose ([Link]) Traitement : amphotériciné B (trés toxique) et [Itraconazole ( cas bénin)biologique 3 genres: Microsporum (cheveux et peau glabre) + Examen a l'état frais ou aprés coloration bleu lactique, Gomori-Grocott... Trichophyton (cheveux, peau glabre et ongles ) be Epidermophyton (peau glabre et ongles) coretep Ber oave + Culture ou 1ons keratinophiles (peau, cheveux et ony * Cosmopolites + Gélose Sabouraud + AB (chloramphéni i, — LON 4 + Touche 2x plus e sexe masculin e Le 5 + 40 espéces reconnues, plusieurs sont eS du sol + Détection des antignes solut lesa a + La moitié sont des pathogénes pougktidayme, le mammifere et Foiseau + PCR * + Sont regroupés selon le réseryo) + Histopathologie SS * Traitement: amphotér ,, vériconazole Pouvoir pathogéne et transmission + Production de la kératinase * Chez I’homme par contact direct homme & homme ou animal ou par des objets contaminés ou exposition direct au sol * Agent causant la teigne ou tinea * Selon la localisation; Diagnostic + Prélévements : ongles , cheveux, poils , squames, pus ou biopsie + Examen direct : lampe de Wood , KOH, blanc de calcofluor, coloration de PAS + Sabouraud avec actidione + Sabourraud avec chloramph + Sabourraud avec chloramphé Vincubation va de 10 jours 4 ao la température ambiante Traitement + Itraconazole et Terbinafine + Griseofulvine infection: + Echinocandines het even ses) ey fevelu et ongle (6 8 9mois de traitement)