Classification Baltimore
La classification Baltimore est une classification des virus, proposée par le biologiste américain1,2
David Baltimore (lauréat du prix Nobel de physiologie ou médecine en 1975). Il s’agit d’un système
de classification scientifique basé sur le génome des virus et leur type d'acide nucléique (à ADN
ou à ARN, simple brin, double-brin) et son mode d'expression dans la synthèse de l’ARN messager
viral, ainsi que le procédé de réplication de l'ADN.
La classification de Baltimore.
Légende: DNA = ADN, RNA = ARN, ss = simple brin, ds =
double brin, m = messager.
Elle permet la classification des virus par leurs caractéristiques biologiques, qui peuvent être
classées selon3 :
le type de cellule permettant la réplication du virus ;
la durée du cycle de réplication virale ;
la stratégie de réplication du virus (la classification de Baltimore).
Classification
La classification des virus en fonction de leur génome signifie que dans une catégorie donnée
tous se comportent de la même façon, ce qui donne une certaine indication sur la façon de
procéder à des recherches plus approfondies. La classification est :
Virus à ADN, groupes I et II :
Groupe I - Virus à ADN à double brin (Adenovirus, Herpesvirus, Poxvirus)
Groupe II - Virus à ADN à simple brin : ADN à polarité (+) (Parvovirus)
Virus à ARN, groupes III, IV et V :
Groupe III - Virus à ARN à double brin (Reovirus)
Groupe IV - Virus à ARN simple brin à polarité positive : ARN à polarité (+) (Picornavirus,
Togavirus, Coronavirus)
Groupe V - Virus à ARN simple brin à polarité négative : ARN à polarité (-) (Orthomyxovirus,
Rhabdovirus)
Virus à transcription inverse, groupes VI et VII :
Groupe VI - Rétrovirus à ARN simple brin : ARN à polarité (+) avec ADN intermédiaire dans le
cycle de vie (Retrovirus)
Groupe VII - Pararétrovirus à ADN double brin (Hepadnavirus)
Virus à ADN
Groupe I - Virus à ADN à double brin
Ce type de virus doit habituellement entrer dans le noyau de la cellule hôte avant de pouvoir se
répliquer. En outre, ces virus ont besoin de l’ADN polymérase de la cellule hôte pour la réplication
du génome viral et sont donc fortement tributaires du cycle cellulaire. La propagation de l'infection
et la production de nouveaux virus nécessitent que la cellule soit dans une phase de réplication
car c’est à ce moment que les polymérases de la cellule sont actives. Le virus peut induire une
division cellulaire forcée, et lorsque cela survient de façon chronique, cette action peut conduire à
une transformation de la cellule et, finalement, au cancer. Les exemples connus concernent les
Herpesviridae, les Adenoviridae et les Papovaviridae.
Il n'existe qu'un seul exemple bien étudié dans lequel un virus de groupe I ne se réplique pas dans
le noyau, c’est celui de la famille des poxvirus, un groupe de virus hautement pathogènes qui
infectent les vertébrés et dont l’un des représentants est le virus de la variole.
Groupe II - Virus à ADN à simple brin
Les virus qui entrent dans cette catégorie comprennent certains agents infectieux qui n’ont pas
été aussi bien étudiés, mais sont toujours très liés aux vertébrés. Citons deux exemples, les
Circoviridae et les Parvoviridae. Ils se répliquent dans le noyau et forment un ADN double brin
intermédiaire pendant la réplication. Un circovirus humain répandu mais asymptomatique,
appelée Virus transfusionnel (en anglais Transfusion Transmitted Virus ou TTV) fait partie de ce
groupe.
Virus à ARN
Groupe III - Virus à ARN à double brin
Comme avec la plupart des virus à ARN, les virus de ce groupe se répliquent dans le cytoplasme,
sans avoir à utiliser les polymérases de la cellule hôte autant que les virus à ADN. Cette famille n'a
pas été aussi bien étudiée que les autres et comprend deux grandes sous familles, les Reoviridae
et les Birnaviridae. La réplication est monocistronique et individuelle, par segments de génomes,
ce qui signifie que chacun des gènes code une seule protéine, contrairement à d'autres virus, dont
la transcription se montre plus complexe.
Groupes IV & V: virus à ARN simple brin
Ces virus sont constitués de deux types, tous deux partageant cependant le fait que la réplication
se déroule essentiellement dans le cytoplasme, et que la réplication n'est pas aussi dépendante
du cycle cellulaire que pour d'autres virus à ADN. Cette catégorie de virus est l'une des mieux
étudiées, avec celle des virus à ADN double brin.
Groupe IV - virus à ARN simple brin à polarité positive
(Virus (+)ssARN ou de type ARN messager)
La polarité positive des virus à ARN et en conséquence le fait que tous les gènes soient définis
comme sens permet aux ribosomes de l'hôte de les décrypter directement pour synthétiser
immédiatement des protéines. Ceux-ci peuvent être divisés en deux groupes, qui tous deux se
répliquent dans le cytoplasme:
Virus avec ARN messager polycistronique où l'ARN génomique forme l'ARNm et est traduit en
poly-protéine qui est ensuite clivée pour former des protéines matures. Cela signifie que le gène
peut utiliser plusieurs méthodes pour produire des protéines à partir du même brin d'ARN, le
tout dans un souci de réduire la taille de son génome.
Les virus à transcription complexe, pour lequel un ARNm subgénomique, l’intervention des
ribosomes et un traitement protéolytique des polyprotéines peut être nécessaire. Tous ces
mécanismes différents produisent des protéines à partir du même brin d'ARN.
Parmi les exemples de cette catégorie on trouve les familles des Astroviridae, des Caliciviridae,
des Coronaviridae, des Flaviviridae, des Picornaviridae, des Arteriviridae et des Togaviridae.
Groupe V - virus à ARN simple brin à polarité négative
Les virus à ARN à polarité négative et même l'ensemble des gènes définis comme antisens ne
peuvent pas être directement décrypté par les polymérases de l'hôte pour produire
immédiatement des protéines. Au lieu de cela, ils doivent être transcrits par les polymérases
virales dans une forme "lisible" à polarité positive. Ceux-ci peuvent également être divisés en deux
groupes:
Les virus contenant un génome non segmenté pour lesquels la première étape de la réplication
est la transcription du brin de génome (-) par la polymérase virale ARN-dépendante en ARNm
monocistronique codant les différentes protéines virales. Une copie (+) du génome est alors
produite qui sert de matrice pour la production d’un brin (-) du génome. La réplication se déroule
dans le cytoplasme.
Les virus dont le génome est segmenté pour lesquels la réplication se produit dans le noyau
cellulaire, et dont l'ARN polymérase virale ARN-dépendante monocistronique produit un ARNm à
partir de chaque segment de génome. La différence la plus importante entre les deux est
l'emplacement de la réplication.
Parmi les exemples dans cette catégorie figurent les familles des Arenaviridae, des
Orthomyxoviridae, des Paramyxoviridae, des Bunyaviridae, des Filoviridae et des Rhabdoviridae
(cette dernière famille inclut le virus de la rage).
Virus à ADN ou à ARN à transcription inverse
Ces virus utilisent la transcriptase inverse ou rétrotranscriptase (en anglais reverse transcriptase
ou encore RT), une enzyme qui transcrit l'information génétique des virus de l'ARN en ADN, qui
peut s'intégrer dans le génome de l'hôte.
Groupe VI – rétrovirus à ARN simple brin
Une famille bien étudiée dans cette classe de virus est celle des rétrovirus. Un élément
déterminant est l'utilisation de la transcriptase inverse pour convertir l'ARN à polarité positive en
ADN. Au lieu d'utiliser l'ARN pour les matrices de protéines, ils utilisent l'ADN pour créer les
matrices qui sont greffées dans le génome de l'hôte en utilisant l’intégrase. La réplication peut
alors commencer avec l'aide des polymérases de la cellule hôte. Un exemple bien étudié est celui
du VIH.
Groupe VII - Pararétrovirus à ADN double brin
Ce petit groupe de virus, illustré par le virus de l’hépatite B (qui fait partie de la famille des
Hepadnaviridae), comprend des virus à ADN double brin, un génome sans chevauchement qui est
ensuite complété afin de former un cercle fermé par liaison covalente (ADN ccc) qui sert de
matrice pour la production d’ARNm viral et d’ARN subgénomique. L'ARN prégénomique sert de
matrice pour la transcriptase inverse virale et pour la production d'ADN génomique.
Notes et références
(en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé
« Baltimore classification (https://en.wikipedia.org/wiki/Baltimore_classification?oldid=2915034
33) » (voir la liste des auteurs (https://en.wikipedia.org/wiki/Baltimore_classification?action=history)).
1. (en) Baltimore D, « Expression of animal virus genomes », Bacteriol Rev, vol. 35, no 3,1971,
p. 235–41 (PMID 4329869 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/4329869), lire en ligne (http://mmbr.asm.o
rg/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=4329869) [archive])
2. Professeur Colimon, « Classification modifiée de Baltimore selon la stratégie de réplication
des virus (http://www.med.univ-rennes1.fr/resped/s/viro/multivir/multivirus.html#iiiiiii
i) [archive] », Université de Rennes I - Département de virologie, 16 octobre 2001 (consulté le
22 mai 2009)
3. Professeur Colimon, « Structure et classification des virus (http://www.med.univ-rennes1.fr/r
esped/s/viro/struc/struclass.html) [archive] », Université de Rennes I - Département de
virologie, 8 octobre 2001 (consulté le 22 mai 2009)
Liens externes
"Virus Taxonomy Portal." (http://athena.bioc.uvic.ca/bioDoc/cuptonclass/virus-taxonom
y) [archive] (Website.) Viral Bioinformatics Resource Center & Viral Bioinformatics - Canada.
Retrieved on 2007 -09-27.
Family Groups - The Baltimore Method (http://www.virology.net/Big_Virology/BVFamilyGroup.ht
ml) [archive]
The Universal Virus Database of the International Committee on Taxonomy of Viruses (https://w
ww.ncbi.nlm.nih.gov/ICTVdb/) [archive]
The taxonomy portal of the Genbank database (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Brows
er/wwwtax.cgi?name=Viruses) [archive]
Portail de la virologie
