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Acide Ribonucleique Arn: A-Structure Générale

L'acide ribonucléique (ARN) est essentiel à la synthèse des protéines et à l'expression de l'information génétique, jouant un rôle clé dans les mécanismes de transcription et de traduction. Il existe trois types d'ARN (ARNm, ARNr, ARNt) qui participent à la biosynthèse des protéines, et des anomalies dans l'ARN peuvent entraîner des perturbations dans cette synthèse. Les applications de l'ARN en biologie moléculaire incluent des méthodes d'exploration comme le RNA-seq et des utilisations thérapeutiques telles que les vaccins à ARNm et l'interférence par ARN.

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Acide Ribonucleique Arn: A-Structure Générale

L'acide ribonucléique (ARN) est essentiel à la synthèse des protéines et à l'expression de l'information génétique, jouant un rôle clé dans les mécanismes de transcription et de traduction. Il existe trois types d'ARN (ARNm, ARNr, ARNt) qui participent à la biosynthèse des protéines, et des anomalies dans l'ARN peuvent entraîner des perturbations dans cette synthèse. Les applications de l'ARN en biologie moléculaire incluent des méthodes d'exploration comme le RNA-seq et des utilisations thérapeutiques telles que les vaccins à ARNm et l'interférence par ARN.

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ACIDE RIBONUCLEIQUE ARN

INTRODUCTION :
Toutes les cellules vivantes possèdent des acides nucléiques, représentés selon le pentose en présence, par l'acide
ribonucléique (ARN), et par l'acide désoxyribonucléique (ADN).
Acide ribonucléique, localisation essentiellement cytoplasmique, participe à l’expression de l’information génétique
et entre en jeu dans les 2 mécanismes de synthèse protéique : transcription, traduction.
INTERET : - Rôle capital dans la synthèse des protéines nécessaires pour la vie humaine
- Avancé de l’étude moléculaire et de méthode thérapeutique basées sur ARN

STRUCTURE :
A- Structure générale :
- ARN est polymère monocaténaire = simple brin. Il est formé de la répétition d'un module de base le nucléotide
associant trois molécules dérivant de:
- l'acide phosphorique (H3PO4)
- du ribose, pentose estérifié en 5' par l'acide phosphorique
- d'une base azotée, purique ou pyrimidique, contractant une liaison 5 N- osidique avec le pentose
o Puriques : Adénine (A), Guanine (G)
o Pyrimidiques : Cytosine (C), Uracile (U), Thymine (T)
o Uracile (U) est uniquement chez l’ARN.
- Structure secondaire variable.
B- Différentes classes :
Il existe 3 types d’ARN qui jouent un rôle essentiel dans la transcription (ARNm) et la traduction
(ARN t et ARNr) de l'information génétique qui aboutit à la biosynthèse des protéines :
1- ARNm : provient de la transcription, chaîne polynucléotidique complémentaire d’un brin d’ADN, synthétisé dans le
noyau grâce à l’ARN polymérase II, puis de transporter l'information génétique recueillie du noyau sous forme de
codons vers le cytoplasme (expression de l’information génétique)
- Il va ensuite se placer sur une unité d'assemblage des protéines, le ribosome, où il sera traduit pour élaborer une
séquence d’acides aminés nécessaires à la synthèse des protéines.
- Sa taille est proportionnelle à celle des protéines pour laquelle il code.
- L’ARNm est constitué de 5’ vers 3’ d’un chapeau, région 5’ non codante, cadre ouvert de lecture (région codante,
limitée par un codon initiateur AUG et stop : UGA, UAA ou UAG), région 3’ non codante et queue poly(A) nécessaire
pour la stabilité et l’adressage de l’ARNm.
- Seuls les ARNm sont des ARN codants.
2- ARNr (ribosomique) : ribosome = ARN ribosomique + protéines. Support pour la synthèse des protéines.
L’ARNr : - Situé dans le cytoplasme, sa biosynthèse a lieu au niveau du nucléole grâce l’ARN polymérase I
Ribosome :
- 2 sous unités de taille différente placées l’une au-dessus de l’autre.
- 2 sites d’attachement pour les ARNt : A et P.
3- ARNt (transport):
Chaîne monocaténaire recourbée en forme d’une feuille de trèfle, ayant un pôle portant l’anticodon et l’autre
portant l’acide aminé activé, le produit formé = [Link] possède une double spécificité qui joue un rôle
d’adaptateur moléculaire :
- une pour l’acide aminé (extrémité de fixation de l’AA)
- et l’autre pour l’ARNm (anticodon : permet de connaître le codon de l’ARNm)
C’est un vecteur qui va reconnaître les acides aminés dans le cytoplasme pour les amener jusqu'au brin d'ARN
messager où s’effectue la synthèse protéique.
4- Petits ARN : Sn ARN U synthétisée grâce à l’ARN polymérase III, riches en uracile, s’associent à des protéines pour
former les ribonucléoprotéines, rôle dans la maturation de l’ARNm.
ROLE DANS LA SYNTHESE DES POLYPEPTIDES : 2 étapes :
A- Transcription :
1- Initiation :
- L’ARN polymérase associée à un facteur protéique se fixe à l’ADN sur le promoteur et provoque le relâchement des
histones à l’endroit où la transcription doit s’effectuer.
- Un seul des 2 brins peut servir de matrice (brin non codant) : Site d’initiation : CAT (0).
Promoteur marque le début de séquence à transcrire, deux séquences :
• ATA : - 30 bases. • CAAT : - 70 bases.
2- Elongation :
- L’ARN polymérase transcrit l’ARNm à partir de la matrice dans le sens 5’-3’, les ribonucléotides se placent en face
des désoxyribonucléotides aboutissant à la formation d’un ARN pré-messager (A->U, T->A, C->G, G->C).
3- Terminaison :
- Par un signal porté par le brin d’ADN qui indique la fin du gène ARN néo formé se détache du gène.
4- Maturation ARN pré messager -> ARNm :
Capping en 5' : Un guanylique méthylé et des protéines sont ajoutées en 5’ = coiffe protégeant l’ARN de la
dégradation, et permettant son adressage.
Polyadénylation en 3' : Elimination de tous les nucléotides en aval du dernier exon (le site de coupure = AAUAAA), et
ajout d’une queue polyA.
Epissage : L’élimination de toutes les séquences introniques avec ligature ordonnée des exons. Les sites d’épissage
sont (5'GU........ AG 3').
N.B. : l’epissage alternatif : plusieurs maturations différentes produisent des ARNm différents à partir du même ARN
pré-messager.
B- Traduction :
- Dans le cytoplasme, décodage de l’ARNm en chaîne d’AA.
1- Initiation :
- L’ARNm possède une séquence de bases de départ lui permettant de s’amarrer au site de liaison de la petite sous-
unité ribosomale, chargé d’un méthionyl-ARNt initiateur. Cette dernière enjambe l’ARNm jusqu’à ce qu’elle
rencontre le codon initiateur => Fixation de la grande sous-unité sur la petite sous-unité : ribosome fonctionnel.
2- Elongation :
- Le M-ARNt-I se fixe sur le site P du ribosome, au site A se fixe l’amino-acyl ARNt suivant. L’enzyme peptidyl
transférase catalyse la liaison méthionine et AA1, le dipeptide formé est fixé au site A. Le ribosome avance d’un
codon dans le sens 5’-3’ (le peptidyl ARNt sur site P) site A vacant fixation d’un nouveau amino acyl ARNt.
- Renouvellement de l’opération jusqu’au site de terminaison.
- Au fur et à mesure que le ribosome avance, un autre peut être fixé = polysome.
3- Terminaison :
Arrêt au niveau des codons stop libération de la chaîne polypeptidique. La pro-protéine formée doit subir une
maturation pour être active.
ANOMALIES EN PATHOLOGIE HUMAINE
- Les anomalies de l’ARN peuvent entraîner des perturbations de la synthèse protéique.
- L’ARNm reproduit toutes les anomalies du brin d’ADN.
- La mutation de l’ARN est moins grave que celle de l’ADN car il a une durée de vie brève contrairement à l’ADN qui
est fixe et se transmettant de génération en génération.
APPLCATION EN BIOLOGIE MOLECULAIRE
A- Méthode d’exploration
RNA-seq concerne le séquençage de l’ensemble des transcrits (transcriptome) d’une cellule, d’un tissu ou d’un
organisme. Le RNA-seq est majoritairement utilisé pour l’analyse de l’expression différentielle des gènes entre des
cellules soumises à des conditions différentes.
B- Utilisations thérapeutiques et biotechnologiques
L'ARN est utilisé aujourd'hui dans un certain nombre d'applications en biologie moléculaire, en particulier grâce au
processus d'interférence par ARN, qui consiste en l'introduction dans des cellules eucaryotes de courts fragments
d'ARN double-brin appelés « petits ARN interférents ». Seuls les ARNm contenant une séquence correspondant à
celle du pARNi sont dégradés, ce qui permet de diminuer sélectivement l'expression d'une protéine donnée.
Des essais d'utilisation de cette technique à des fins thérapeutiques sont envisagés, par exemple en ciblant des
gènes viraux pour lutter contre des infections, ou des oncogènes, dans le cas de cancers. Ils nécessitent cependant
de stabiliser les petits ARN interférents (pARNi) pour éviter leur dégradation par des ribonucléases et de cibler leur
action vers les cellules concernées.
C- Vaccin ARNm est un type de vaccin activant le système immunitaire adaptatif au moyen d'ARNm dont la séquence
nucléotidique code une protéine identique ou semblable à un antigène d'agent pathogène ou à un antigène tumoral.
Cette protéine est produite directement dans les cellules cibles par traduction de l'ARNm contenu dans le vaccin, et
est reconnue par le système immunitaire de l'organisme, qui réagit en produisant des anticorps dirigés contre l'agent
pathogène ou le cancer qu'on cherche à neutraliser.
CONCLUSION : La biologie moléculaire est un ensemble de techniques permettant d'étudier la structure des acides
nucléiques (ADN et ARN) et le contrôle de leur expression. Ses applications sont très nombreuses aussi bien dans les
laboratoires de diagnostic clinique (bactériologie, biochimie, génétique, hématologie, parasitologie etc.) que dans les
laboratoires de recherche ou dans l'industrie pharmaceutique.

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