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Régulation Expression Génique

Le document traite de la régulation de la transcription chez les eucaryotes, en se concentrant sur la structure des promoteurs, les facteurs de transcription, et l'impact de la chromatine sur l'accessibilité de l'ADN. Il aborde également des exemples spécifiques tels que la régulation du gène EPO en réponse à l'hypoxie et l'épissage alternatif du récepteur à l'hormone de croissance. Enfin, il décrit la régulation post-transcriptionnelle et de la stabilité des ARNm, notamment en relation avec le fer.

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Régulation Expression Génique

Le document traite de la régulation de la transcription chez les eucaryotes, en se concentrant sur la structure des promoteurs, les facteurs de transcription, et l'impact de la chromatine sur l'accessibilité de l'ADN. Il aborde également des exemples spécifiques tels que la régulation du gène EPO en réponse à l'hypoxie et l'épissage alternatif du récepteur à l'hormone de croissance. Enfin, il décrit la régulation post-transcriptionnelle et de la stabilité des ARNm, notamment en relation avec le fer.

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Régulation de la transcription

Structure d’un promoteur eucaryote

Séquences régulatrices
TATA box
+1

Jusqu'à -50 kb Jusqu'à +50 kb


Régulation de la transcription
Facteurs de transcription spécifiques
1967 : "facteurs de transcription"
Walter GILBERT GILBERT et MULLER-HILL /PTASHNE Mark PTASHNE

Facteurs Généraux
de Transcription
Séquences régulatrices
ARN
+1 polymérase

Jusqu'à -50 kb

Facteurs de Transcription Spécifiques : activateurs ou répresseurs


Un exemple : Régulation transcriptionnelle du gène EPO

Promoteur GTF
HRE TATA
Sans HIF Gène EPO
Normoxie ARN
pol
Transcription faible Peu de protéine EPO

Promoteur GTF
HRE TATA
Avec HIF Gène EPO
Hypoxie HIF ARN
+ pol
Transcription forte Beaucoup de protéine EPO
L’ADN n’est jamais ‘nu’…
mais sous forme de chromatine
1879 : « Chromatine » 1973 : « Collier de perles »
Walther FLEMMING (1843-1905) Olins & Olins

1974 : « Nucléosome »
Roger KORNBERG (1947-)

1987 : Compaction de l'ADN


Susan GASSER et Ulrich LAEMMLI
Les différents niveaux de compaction de l'ADN

Courte région de la
2nm
double hélice d'ADN

Enroulement de l’ADN
autour des histones, 11nm
"colliers de perles"

Interphase Fibre chromatinienne de 30nm


~30nm faite de
nucléosomes empilés

Chromatine vue sous un


grossissement plus faible 300nm
Repliement de l'hélice
en boucles

La chromatine est
condensée 700nm
Mitose
Chromosome métaphasique 1400nm
La chromatine participe à la régulation de la
transcription
P Chambon 1976
RT Simpson 1991

Rôle structurant:
condensation de l’ADN et
Chromatine condensée organisation du noyau

Rôle fonctionnel: accessibilité


de l’ADN
Facteur de
transcription

Chromatine ouverte, accessible


L'épissage alternatif
Un exemple : Régulation de l’expression du gène

codant le récepteur à l’hormone de croissance

Forme membranaire Forme soluble


(récepteur) GH (protéine de liaison)
hormone
de croissance

Domaines
transmembranaires
Régulation ?

Epissage alternatif
Post-transcriptionnel
Quantité trop élevée -> Quantité trop élevée ->
gigantisme nanisme
Régulation post-transcriptionnelle chez la souris

= Epissage alternatif

1-6 7 8 9 10

ARNm du récepteur à GH

Epissage

1-6 7 8A 8 9 10
i7 i8A i8

ARN prémessager

Epissage

1-6 7 8A 8 9 10

Coupure et polyadénylation

1-6 7 8A AAAAA

ARNm de la protéine de liaison à GH


Régulation de la stabilité des ARNm, un exemple : gène codant le récepteur à la transferrine

Ø Quantité de Fer élevée -> taux ARNm (et protéine) Récepteur Transferrine faible
=> Fer non importé

ARNm R Tf
3 Déstabilisation du messager
5
=> plus de traduction
IRE

Ø Quantité de Fer faible -> taux ARNm (et protéine) Récepteur Transferrine élevé
Fe
=> Fer importé
IRP

ARNm R Tf Stabilisation de l’ARNm


5 3
=> traduction
IRE

IRE : Iron Responsive Element (élément de réponse au fer) IRP1 : Iron Responsive Protéine (Protéine de réponse au fer)
Régulation de la traduction, un exemple : gène codant la ferritine

Ø Quantité de Fer élevée -> taux de protéine ferritine élevé => Fer piégé

ARNm de la Ferritine
5 3 Traduction du messager

Fe
Ø Quantité de Fer faible -> taux de protéine ferritine faible => Fer non piégé
IRP

ARNm Ferritine
5 3 Traduction réprimée
IRE

IRE : Iron Responsive Element (élément de réponse au fer) IRP1 : Iron Responsive Protéine (Protéine de réponse au fer)
Régulation de stabilité des protéines, un exemple : HIF
Promoteur GTF
HRE TATA
Transcription forte Gène EPO
HIF ARN
+ pol

ARNm HIF-1 Cytoplasme


ARNm HIF-1 5 1 3 5 7 9 11 13 15 3

2 4 6 8 10 12 14
5 1 3 5 7 9 11 13 15 3

2 4 6 8 10 12 14

TRADUCTION
TRANSCRIPTION Noyau
1 3 5 7 9 11 13 15

HIF-1
2 4 6 8 10 12 14

gène Hif-1
hypoxie normoxie

HIF-1
DEGRADATION
HIF-1

acgtg
Gène EPO
HRE
5 3

5 3 5 3
EPO
5 3

5 3 5 3

5 3 5 3

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