Une collection de plantes Africaines en ligne
Bazan Samantha¹, Taugourdeau Simon1,², Ndiaye Ousmane³
1 – SELMET, Univ Montpellier, CIRAD, INRA, SupAgro, Montpellier, France, 2 – CIRAD, UMR SELMET,-DP PPZS Dakar, Sénégal, 3 – ISRA Centre de recherche zootechnique de Dahra, PPZS Dahra, Sénégal
Herbier
Collection de plantes ou de parties de plantes
L'herbier ALF desséchées sous presse, étiquetées et nommées
qui servent pour les études de botanique.
du Cirad
Institut où sont conservées ces plantes séchées.
60 000 spécimens
L’herbier ALF est riche en spécimens provenant d’Afrique et en
particulier de la zone Soudano-sahélienne. Les importants travaux 60 types
des agropastoralistes et des malherbologistes ont permis
d’enrichir considérablement la collection sur ces thématiques.
5 500 espèces
50 pays représentés
300 collecteurs
Données d’herbier et informatisation
Plateforme de numérisation e-ReColNat Banc de numérisation de l’herbier
(Crédit photo Picturae)
Un spécimen d’herbier se compose d’un échantillon de la plante
accompagné d’une étiquette renseignée.
Les données essentielles sont : Numérisation
la date et le lieu de collecte 32 000 planches de l'herbier du Cirad ont été numérisées dans le
le nom du collecteur cadre du programme national e-ReColNat (2015). Ces images
le nom scientifique de l’espèce haute-qualité sont accessibles sur la plateforme Recolnat, et
nous poursuivons la numérisation de l'herbier.
D’autres données peuvent être ajoutées :
Phénologie
Nom vernaculaire
Usages
…
Pour valoriser au mieux ces données, elles sont depuis des années
saisies dans des bases de données spécifiques. L’herbier du Cirad
utilise Sonnerat, une base de données commune avec le MNHN.
Moteur de recherche eReColNat, spécimens herbier ALF
Le programme E-ReColNat a pour objectif d’extraire et de
mettre à disposition les données naturalistes des collections françaises.
Le programme est coordonné par le Museum national d'histoire naturelle
et concerne plus de 60 partenaires. Cela représente potentiellement 100
millions de spécimens naturalistes en France enseignant 350 ans de
récolte. La méthode consiste à associer une numérisation massive avec
Vu de l’herbier du Cirad Planches d’herbiers sous la loupe binoculaire pour une saisie des données via le web 2.0 / web participatif.
(photo Pierre Poilecot) identification
Mise en ligne
Quels usages pour l’herbier ?
L'herbier du Cirad est accessible physiquement à tous sur
Les herbiers sont classiquement utilisés en botanique pour demande et sa base de données est en ligne.
Le site web de l’herbier permet :
Décrire et classer les plantes
Rechercher des spécimens
Servir de référence
Comprendre la distribution des espèces Visualiser toutes les données informatisées
Apprendre la botanique et bientôt d’accéder au scan de la planche
Etudier l’impact des changements climatiques
Réaliser des analyses génétiques
CIRAD - Octobre 2019 - Colloque Science Ouverte au Sud
Etudier des usages pour l'homme
Analyser les liens homme/plante par la linguistique
Optimiser des mesures de conservation
... alf.plantnet-project.org
Il existe une très grande variété de thématiques de
recherche s'appuyant sur les herbiers, parfois très éloignées
de la botanique fondamentale.
[email protected] Nous développons des protocoles d’analyses chimiques non-
destructives en utilisant la SPIR (Spectrométrie Proche
InfraRouge)
Samantha Bazan
Conservatrice de l'herbier ALF
[email protected] Moteur de recherche dans la base herbier ALF