Microbiologie

Morphologie et structure bactérienne

I- INTRODUCTION
Qu’est-ce que la microbiologie ?
La microbiologie est l'étude des micro-organismes
“microbes” trop petits pour être étudiés à l'œil
nu.
Les micro-organismes comprennent:
- les virus,
- les bactéries,
- les protozoaires,
- les algues microscopiques,
- les champignons.
I- INTRODUCTION
Branches de microbiologie:

•Bactériologie: L'étude des bactéries.

•Mycologie: L'étude des champignons.

•Phycologie: L'étude des algues.

•Parasitologie: L'étude des parasites.

•Virologie: L'étude des virus.

I- INTRODUCTION

Morphologie des principaux micro-organismes

5
I- INTRODUCTION

6
I- INTRODUCTION

Quelques domaines d’application de la microbiologie:

- Microbiologie médicale
- Microbiologie de la santé public
- Microbiologie alimentaire
- Microbiologie industrielle
I- INTRODUCTION
-La microbiologie médicale:
S’occupe des maladies humaines et animales. Les
microbiologistes médicaux identifient l’agent responsable
d’une maladie infectieuse et prennent les mesures pour
l’éliminer et étudient la façon dont les micro-organismes
provoquent la maladie

-La microbiologie de la santé publique:

Est en relation étroite avec la microbiologie médicale. Elle
essaie de contrôler la propagation des maladies
contagieuse en vérifiant les réserves alimentaires et
l’approvisionnement en eau
I- INTRODUCTION
Historique
La découverte du monde
microbien a été réalisée grâce au
hollandais Anthonie Van
Leeuwenhoeck (1632-1723), à
l’aide d’un microscope qu’il avait
inventé. Il est le premier
scientifique à entrevoir les
formes de vie unicellulaires qu'il
nomme animalcules
I- INTRODUCTION
La théorie de la génération spontanée
• A l’époque, on admettait communément la théorie
de la génération spontanée: formation de vie à partir
de la matière morte (Aristote et Needham)
• Francesco Redi, un philosophe italien, a déclaré que
les vers ne résultent spontanément de la viande,
mais des œufs pondus par les mouches
I- INTRODUCTION

Discréditation de la théorie de la génération

spontanée
• En 1859, le chimiste français Louis Pasteur a
discrédité définitivement cette théorie par la
conception de ballon avec coll de cygne
• Quand l’air n’a pas accès, le bouillon peut être stocké
indéfiniment sans multiplication des
microorganismes
I- INTRODUCTION
I- INTRODUCTION
I- INTRODUCTION
Les fondateurs de la microbiologie
- LUIS PASTEUR

- Met les bases de la méthode de stérilisation et d’asepsie

-Découvre les agents étiologiques des nombreuses

infections

- Réalise des vaccins par inactivation de la pathogénicité des

microorganismes (la rage, le charbon, le choléra)
I- INTRODUCTION
Les fondateurs de la microbiologie
- ROBERT KOCH
-Il a examiné les microorganismes en utilisant
des préparations fixées par la chaleur et colorés
avec des colorants de base

-Il a introduit les milieux solides dans la pratique

de la microbiologique

-Il a reproduit les maladies expérimentalement

par inoculation de l’agent étiologique des
maladies infectieuses chez les animaux de
laboratoire
II- PLACE DES BACTERIES DANS LE MONDE VIVANT

Définition
• Les bactéries = micro-organismes unicellulaires
de petite taille (1 à 10 µm).
• Elles appartiennent au règne des protistes
inférieurs
o Les protistes supérieurs « Eucaryotes »
o Les protistes inférieurs « Procaryotes »
II- PLACE DES BACTERIES DANS LE MONDE VIVANT

Les procaryotes se distinguent des eucaryotes par:

• L’absence de membrane nucléaire

• Un chromosome unique
• L’absence de mitochondries, d’appareil de Golgi
et de réticulum endoplasmique
• La présence de peptidoglycane
II- PLACE DES BACTERIES DANS LE MONDE VIVANT
PROCARYOTES EUCARYOTES
Taille 1- 10 µm 10 - 100 µm
Type de noyau Pas de vrai noyau Noyau vrai délimité par
une enveloppe
Division de la cellule Division simple Mitose (multiplication de la
(Scissiparité) cellule)
Méiose (formation de
gamètes)
Métabolisme Anaérobie ou aérobie Aérobie
ADN Généralement un seul Généralement plus d’un
chromosome de forme chromosome linéaire
circulaire
Organites Absents Présents (mitochondrie,
appareil de Golgi,
réticulum endoplasmique
Chaine respiratoire A la surface de la Dans les mitochondries
membrane plasmique 18
II- PLACE DES BACTERIES DANS LE MONDE VIVANT
Cellule procaryote
II- PLACE DES BACTERIES DANS LE MONDE VIVANT
Cellule eucaryote
II- PLACE DES BACTERIES DANS LE MONDE VIVANT
Classification phénotypique
- Coloration de Gram
- Gram positive +
- Gram négative -

- Forme de bactéries
- Sphérique ou ovale- cocci
- Cylindrique- bacilles
- Virgule- vibrions
- Spiralée- spirochètes
II- PLACE DES BACTERIES DANS LE MONDE VIVANT
Classification génotypique

Une donnée importante pour la classification bactérienne

est le pourcentage en nucléotides: Guanine et Cytosine (%
G + C) de chaque génome. Ainsi, deux espèces
bactériennes proches auront des pourcentage en G et C
voisins

- 2 bactéries appartenant à la même espèce auront

des GC% identiques

-2 bactéries dont les GC% diffèrent de plus de 5%

appartiennent à des espèces différentes
II- PLACE DES BACTERIES DANS LE MONDE VIVANT
Classification analytique

Les microorganismes sont nommés selon les

règles du système binomial de Linné

Le nom de chaque microorganismes est formé

par deux fragments:

- Le premier: le nom du genre, sa première lettre

en majuscule
- Le seconde: qualificatif, sa première lettre en
minuscule
II- PLACE DES BACTERIES DANS LE MONDE VIVANT
Classification analytique (exemple)
Règne: Bacteria

Embranchement: Proteobacteria

Classe: Gammaproteobacteria

Ordre: Enterobacteriales

Famille: Enterobacteriaceae

Genre: Escherichia

Espèce: Escherichia coli

III- METHODE D’ETUDE DES BACTERIES

Microscope optique
Compte tenue de leur taille, les bactéries seront
visualisées par le microscope
 Etat frais: observation entre lame et lamelle de la
mobilité et la forme des bactéries
III- METHODE D’ETUDE DES BACTERIES

 Frottis colorés: observation de la morphologie

bactérienne
• Bleu de méthylène • Coloration de Ziehl-Nielsen

• Coloration de Gram
III- METHODE D’ETUDE DES BACTERIES

Microscope électronique (ME)

Permet une étude fine de la structure bactérienne ou
l’anatomie bactérienne. La résolution du ME est
fortement haute: grossissement de x 50 à x 1 200 000
III- METHODE D’ETUDE DES BACTERIES

Microscope électronique (ME)

L’analyse des échantillons par microscopie

électronique ne peut se faire sans une préparation
spécifique selon la nature de l’échantillon.
Cette préparation dépend également de ce qui est
recherché, allant de l’analyse ultrastructurale au
microscope électronique en transmission (MET)
au balayage de la surface de l’échantillon au
microscopie électronique à balayage (MEB).
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

Dans une cellule bactérienne, nous distinguerons:

1- Organes constants: présents chez toutes les
bactéries de toutes les espèces

Appareil nucléaire
Cytoplasme
Membrane cytoplasmique
Paroi (absente chez les Mycoplasmes)
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

2- Organes inconstants: Présents ou non selon

l’espèce bactérienne et selon les conditions de
milieux
Spores
Capsules
Plasmides
Cils ou flagelles
Pili
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
Éléments facultatifs Éléments constants
CHROMOSOME
PILI
COMMUNS
PAROI

ESPACE
PERIPLASMIQUE
PLASMIDE

MEMBRANE
CAPSULE CYTOPLASMIQUE

CYTOPLASME
FLAGELLE
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

1- Paroi
 Enveloppe sous jacente à la capsule
 Elle assure à la bactérie sa rigidité, sa forme et
sa résistance aux milieux extérieurs
 Sa structure diffère selon qu’il s'agit de
bactéries Gram + ou Gram - mais les deux ont
un élément en commun: Le peptidoglycane
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

PAROI DE BACTÉRIES GRAM +

- Epaisse par rapport à la paroi des Gram -

- Structure homogène
- Constituée en grande partie de peptidoglycane
couplé aux acides teichoiques et aux acides
lipoteichoiques
- Les acides teichoiques sont le support de
l’antigénicité chez les Gram +
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

PAROI DE BACTÉRIES GRAM +

IV-ANATOMIE BACTERIENNE
PAROI DE BACTÉRIES GRAM -
Structure plus complexe bien que plus fine que
celle des Gram +, elle contient en plus de
peptidoglycane, une enveloppe externe formée
de:
- Phospholipides
- Porines (Protéines)
- Lipopolysaccharides
- Lipoprotéines de Braun
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

PAROI DE BACTÉRIES GRAM -

 La paroi des Gram - ralentit et empêche

l’entrée des substances toxiques, colorants et
des antibiotiques

 Les protéines permettent le passage des

substances et des antibiotiques selon leur
diamètre et leur charge
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

PAROI DE BACTÉRIES GRAM -

IV-ANATOMIE BACTERIENNE
A B
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

Coloration de Gram
- Christian Gram a été l’inventeur de la coloration
de Gram

- Cette coloration est fondée sur l'action

successive de certains colorants

- Permet de distinguer entre:

-Bactéries Gram + (violette)
-Bactéries Gram - (rose)
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
Coloration de Gram
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

Coloration de Gram
1- Coloration au cristal violet ou violet de gentiane (1
min)

2- Fixation par le lugol (l’iode) (1 min)

3- Décoloration par l’alcool (40 à 50 secondes)

4- Rinçage à l’eau

5- Contre coloration par la fushine basique (1 min)

IV-ANATOMIE BACTERIENNE
[Link] par le violet de gentiane
Action combinée du violet de gentiane et du Lugol
(=mordançage)
→ le cytoplasme de toutes les bactéries est coloré en
violet

2.Décoloration par l’alcool

Différence au niveau de la paroi des bactéries Gram +/
Gram - (perméabilité des bactéries Gram - à l’alcool)

→ L’alcool permet la décoloration des bactéries Gram -

incolores
→ Les Gram + restent colorées en violet
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

3. Contre-coloration par la fuschine ou la safranine

- Permet de visualiser à nouveau, les corps cellulaires

des bactéries Gram - en rose

L'intérêt de cette coloration

- Donner une information rapide sur la cause de la

maladie

- Choisir les antibiotiques la sensibilité des souches

IV-ANATOMIE BACTERIENNE
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

Streptococcus Staphylococcus

Listeria
Bacillus

Micrococcus Bacilles
sporulés
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
Paroi des Bacilles Acido-Alcoolo Résistants (BAAR)

• Les mycobactéries sont classées parmi les

bactéries Gram +, mais elles sont colorées à
chaud par la fuscine phéniquée (technique de
Ziehl-Nielsen)

• Leur paroi est riche en lipides, formée de

peptidoglycane associé à des molécules
d’arabino-galactane et des acides mycoliques,
d’où l’imperméabilité aux antibiotiques courants.
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

Conclusion sur les rôles de la paroi

- Confère la forme à la bactérie
- Evite aux bactéries de s'éclater malgré la forte
pression osmotique qui règne à l'intérieur du
cytoplasme
- Propriétés antigéniques (Antigène O de
Salmonella)
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
2- Membrane cytoplasmique
- La membrane est située sous la paroi
- Formée d’une double couche de phospholipides
ou s’insère des protéines enzymatiques:
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

Rôles de la membrane cytoplasmique

- Responsable des échanges entre la bactérie et les
milieux extérieurs: barrière osmotique (transfert passif),
contient aussi des systèmes de transport qui assurent la
pénétration active et sélective de certaines substances
(sucres, acides aminés, ions, minéraux)

- Site du métabolisme énergétique (siège de la chaîne

respiratoire)

- Site de fixation des flagelles

IV-ANATOMIE BACTERIENNE
3- Cytoplasme
C’est un hydrogel délimités par une membrane
cytoplasmique contenant:
-Des ribosomes qui interviennent dans la
synthèse des protéines
-Des substances de réserve comme des glucides
(amidon et surtout glycogène), des lipides et parfois
des minéraux (fer, soufre….)
-Des organites spécialisés comme des vacuoles à
gaz (permettant aux bactéries aquatiques de flotter à
la surface de l’eau)
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
4- Appareil nucléaire
- Une seule molécule d’ADN bicaténaire, circulaire et
pelotonné sur elle-même, composé d’unités appelées
nucléotides
- Ne possède pas de membrane nucléaire, sa structure
est diffusée dans le cytoplasme
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

4- Appareil nucléaire

-Constitue le support de l’information

génétique héréditaire

-Assure la transmission de l’information

génétique aux cellules filles par autoréplication

-Site d’action de certains antibiotiques

IV-ANATOMIE BACTERIENNE

5- Capsule
- Réseau de polysaccharides situé au delà de la paroi

- Vue à l’état frais après coloration à l’encre de chine ou

par la réaction de gonflement à l’aide d’anticorps
spécifiques
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

Rôle de la capsule

 Facteur de virulence, car il protège la bactérie

de la phagocytose
 Empêche la pénétration de certains
antibiotiques
 Confèrent une résistance face aux détergents
 Permet l’adhérence de la bactérie sur les tissus
vivants
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
6- Plasmides
- Petites molécules d'ADN bicaténaire, circulaire
- Capables de se propager d'une bactérie ou d’une espèce
à une autre par un processus de conjugaison ou de
transformation
- Peuvent porter des gènes de virulence ou de résistance
aux antibiotiques
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
7- Flagelles
- Appendices locomoteurs des bactéries mobiles
- Structure mince et ondulées qui naissent de la
membrane cytoplasmiques
- Constituées d’un corps basal, d’un crochet et d’un
filament
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
7- Flagelles
• 1 seul flagelle polaire = Ciliature monotriche
• 1 touffe de flagelles polaires = lophotriche
• 1 flagelle à chaque pôle = amphitriche
• Des flagelles entourant la bactérie = préritriche
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
8- Pili
Structures allongées de nature protéique disposés
régulièrement sur la surface bactérienne

Spécifiques aux bactéries Gram - rarement chez les

bactéries Gram +
On distingue 2 catégories:
a. Les pili communs ou fimbriae: responsables de
l’adhésion sur différents supports inertes ou
vivants
b. Les pili sexuels: Permettent l’attachement des
bactéries entre elles lors de la conjugaison.
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
8- Pili
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
9- Spores
Forme de vie au ralentie. Sans multiplication, ni
métabolisme, qui se forme lorsque le milieu est
appauvri en nutriments ou dans des conditions
physiques défavorables
« Spore = bactérie au repos »
Sporulation
Bactérie Spores

Germination
Spores Bactérie
végétative
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
9- Spore
- Le cytoplasme renfermant une copie du chromosome
- Le cortex est riche en calcium associé au dipicolinate
responsable de la thermo-résistance
- Le tunique externe est formée de kératine, ce qui lui
confère une résistance à divers agents physiques ou
chimiques comme les radiations, la pression, les
antibiotiques
- Les spores sont thermorésistantes car ils résistent 10
minutes à 80 ⁰C, et même 5 min à 120 ⁰C, alors que les
cellules végétatives sont détruites
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

 Les procédés de stérilisation ne sont pas satisfaisants

à moins de chauffer longtemps et à très haute
température
 Pour les produits fragiles, on a développer le
procéder de tyndallisation qui consiste à alterner des
périodes de chauffe modérée (60°C) qui permettent
de détruire les formes végétatives, avec des périodes
de refroidissement à température ambiante. Ceci
provoque la germination des spores et rend possible
leur élimination lors du cycle de chauffe suivant
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

Schéma d’une spore bactérienne

IV-ANATOMIE BACTERIENNE

Endospores de Bacillus
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
9- Spores

A: ovale, terminale
B: rectangulaire, terminale
C: rectangulaire, subterminale
D: rectangulaire, centrale
E: circulaire, terminale
F: circulaire, centrale
G: sporange gonflé, position
terminale
IV-ANATOMIE BACTERIENNE
Les étapes de la sporulation

1. Conversion du matériel nucléaire en un filament

chromatique axial
2. Invagination de la membrane cellulaire et formation du
septum, ce qui isole une partie de l'ADN
3. La membrane de la grosse cellule englobe la petite cellule
qui est finalement endocytée: préspore
4. Formation du cortex
5. Les protéines de la tunique sont formées autour du cortex
6. L’endospore arrive à maturité
7. Des enzymes lytiques détruisent le sporange et libèrent la
spore
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

Cycle sporal
IV-ANATOMIE BACTERIENNE

Etape de germination du spore

Activation : correspondant à une lésion des enveloppes

sporales par des agents physiques (choc thermique) ou
chimiques (acides, lysozyme)
Initiation : Débute en présence de conditions favorables
d’hydratation et de métabolites effecteurs (alanine,
magnésium, adénosine) qui pénètrent à travers les
enveloppes endommagées
Emergence : Émergence de la nouvelle cellule végétative,
grâce à l’altération des enveloppes
 TD 1

1. Décrire la technique de la coloration de Gram.

Quelle est son utilité en microbiologie ?
2. Qu’est-ce qu’un plasmide ?
3. Au niveau de quelle structure de la cellule
bactérienne est localisée la chaine de transfert
des électrons ?
4. Comment certains groupes bactériens réagissent-
ils aux conditions défavorables de milieu ?

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75
76
Après 24h

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78
-Staphylocoque aureus
-Enteroccocus
-Streptoccocus

-Pseudomonas

-Bacillus anthracis

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