Chapitre 3 - Partie 2 :
Transcription.
Chez les procaryotes, un gène est défini structurellement comme une séquence d’ADN
comprenant un promoteur, un site d’initiation et un site de terminaison. Chez les eucaryotes, il
faut compléter cette définition par la présence d’introns localisés à l’intérieur de la partie
transcrite du gène. D’autre part, il existe chez les procaryotes des gènes organisés en opérons
(voies métaboliques) et donnant des ARNm polycistroniques. Mais on trouve également des
gènes de structure plus simple ne contenant, comme chez les eucaryotes, qu’une seule unité
de traduction.
L’unité de transcription d’un gène correspond à la séquence présente dans le transcrit primaire
d’ARN.
Chez les procaryotes comme chez les eucaryotes, la transcription est divisée en trois étapes
initiation, élongation et terminaison.
I\ Transcription chez les procaryotes.
L’ARN polymérase ADN dépendante est une enzyme formée de plusieurs sous-unités le core-
enzyme a la structure a2bb’ et l’holoenzyme a2bb’s chez E. coli. Elle polymérise les
nucléotides dans le sens 5’à3’ à partir d’un promoteur. Cette enzyme n’a pas besoin d’amorce,
n’utilise qu’un brin comme matrice et progresse à une vitesse d’environ 30 nucl./sec.
A\ L’initiation.
L’initiation de la transcription se fait au niveau d’une séquence appelée promoteur. Ce
promoteur est constitué de deux séquences très conservées, situées respectivement 35 et 10 pb
en amont du site d’initiation de la transcription (+1).
Le core-enzyme a une affinité faible pour les séquences d’ADN double brin. Par contre la
présence du facteur s dans l’holoenzyme confère à l’ARN polymérase une très forte affinité
pour le promoteur. L’holoenzyme explore donc l’ADN par liaison non spécifique et se lie
fortement aux régions promotrices qu’elle dénature localement pour commencer la
transcription. L’initiation va durer le temps que la polymérase associe 7 ou 8 ribonucléotides
sous forme d’un polymère hybridé au brin matrice. Comme le core-enzyme présente une très
forte affinité pour les hétéroduplexes ARN/ADN, le facteur s se décroche et c’est le core-
enzyme qui va seul continuer la transcription.
B\ L’élongation.
Le core-enzyme continue la polymérisation tout en déroulant l’ADN en aval et en le ré
enroulant une fois la séquence copiée. En amont du site de polymérisation on trouve un
hybride ARN/ADN d’environ 17pb.
C\ La terminaison.
Aucune homologie de séquence n’a été retrouvée sur l’ADN au-delà du dernier nucléotide
présent à l’extrémité 3’ d’ARN procaryotes. Par conséquent, les signaux de terminaison sont
localisés dans la partie déjà transcrite de l’ARN. D’autre part, on ne retrouve pas de séquence
consensus dans cette région mais plutôt une structure conservée.
Cette structure est une épingle à cheveux qui mobilise les nucléotides de l’ARN normalement
impliqués dans l’hybride ARN/ADN. Cette structure secondaire contient en général une forte
proportion de G/C suivit d’une région riche en U. Le raccourcissement de l’hétéroduplexe et
le faible taux de liaisons hydrogènes restant déstabilisent l’hybride ARN/ADN et le core-
enzyme se décroche.
Certains terminateurs possèdent trop peu de G/C dans la région correspondant à l’épingle à
cheveux pour que cette structure ne se forme pas. Un facteur supplémentaire (facteur r) va
alors stabiliser cette structure secondaire. On parle dans ce cas de terminaison r dépendante
par opposition aux terminaisons r indépendantes.
D\ Les ARNs polycistroniques.
Certains gènes procaryotes sont rassemblés en opérons structures qui renferment plusieurs
gènes, impliqués dans une même voie métabolique, sous le contrôle d’un même promoteur.
On retrouve donc au sein d’un même ARN, des séquences codant pour plusieurs protéines.
II\ Transcription chez les eucaryotes.
Il existe chez les eucaryotes trois ARN polymérases différentes:
ARN polymérase 1 : transcription des ARN ribosomiques
ARN polymérase 2 : transcription des ARN messagers et ARNsn
ARN polymérase 3 : transcription des ARN de transfert et des ARNr 5S.
Ces ARN polymérases sont de grosses protéines multimériques présentant des propriétés
différentes.
Chez les eucaryotes le mécanisme de base de la transcription est identique à ce qui a été décrit
pour les procaryotes. Cependant, la structure des promoteurs est différente et les transcrits
primaires obtenus sont toujours monocistroniques. Enfin, une des différences majeures
concerne les modifications post-transcriptionnelles des ARN eucaryotes;
ARNr (sauf le 5S) : méthylation, bases modifiées (par ex : UàyU-pseudoU) et épissage
ARNt : méthylation, épissage et bases modifiées (UàWU)
ARNr 5S : pas de modification
ARNm : coiffés, épissés et polyadénylés. Certaines adénines peuvent également être
méthylées
A\ Maturation des ARNr.
B\ Capping.
Au cours de la transcription, lorsque les ARNs atteignent 20 à 30 nucléotides de longueur, une
7 méthyl-guanosine est ajoutée sur le premier nucléotide en 5’, par une liaison phosphodiester
5’à5’. Tous les ARNm sont coiffés excepté les ARNm codant pour les histones. Il existe trois
types de coiffes que l’on distingue en fonction de leur taux de méthylation
- CAPO : seule la guanosine est méthylée en position 7
- CAP1 : CAPO + méthylation du C2’ du premier nucléotide et parfois de l’hétérocycle
- CAP2 : CAP1 + méthylation du CT du second nucléotide
C\ Polyadénylation.
A la fin de la transcription, l’extrémité 3’ de l’ARNm est clivé au niveau d’une séquence
conservée hexamérique (AAUAAA) puis une extrémité poly A est rajoutée. Par la suite cette
queue polyA sera raccourcie dans le cytoplasme.
D\ Epissage.
A la fin de la transcription, alors que le polyA vient d’être rajouté, les introns vont être
éliminés. Les introns font donc partie du transcrit primaire et sont absents de l’ARN mature.
Le mécanisme d’épissage se fait grâce à l’intervention de particules ribonucléo-protéiques
appelées les snRNP (U1 à U6). Chacune de ces particules est formée d’un ARN et de
plusieurs protéines. Un type d’épissage est décrit dans la figure ci dessous :
I : Structure du transcrit primaire
II : U1 reconnaît le site 5’ d’épissage par interaction ARN/ARN ;
III : U2 reconnaît le site de branchement par le même type d’interaction ;
IV : l’hétérotrimère U4/U5/U6 se lie. U5 reconnaît le site 5’ d’épissage. U6 interagit
avec U2.
V : U1 se dissocie. U5 se déplace de l’exon à l’intron.
VI : U4 se dissocie. U6 catalyse la trans-estérification - le site 5’ d’épissage est coupé et le
lasso est formé.
VII : Le site 3’ d’épissage est coupé et les deux exons ligaturés. L’ARN épissé est libéré.
U2/U5/U6 restent accroché sur le lasso.
VIII : Le lasso est “débranché”
