Cours de Crypto Refait
Cours de Crypto Refait
PLAN :
Chap I: PRESENTATION DES CHAMPIGNONS
1-Généralités
2-Terminologies des divisions
Chap 2 : CHAMPIGNONS ANIMAUX OU
MYCETOZOAIRES
1-Introduction
2- Classe Des Myxomycètes
3-Classe Des Acrasiomycètes
4-Classe Des Plasmodiophoromycètes
CRYPTOGAMIE
• PLAN :
• Chap 3 : CHAMPIGNONS ALGUES CLASSES
DES OOMYCETES
• Chap 4: CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
1. Organisation générale
2. Organisation cytologique
3. Besoins nutritionnelles
4. Mode de vie
5. Cycle de reproduction
CRYPTOGAMIE
• PLAN :
• Chap5: CHAMPIGNONS A SIPHONS
1. Classe des Chrytridiomycètes
2. Classe des Zygomycetes
3. Classe Gloméromycètes
4. Classe des trichomycètes
CRYPTOGAMIE
• PLAN:
• Chap6: CHAMPIGNONS A ASQUES OU
ASCOMYCOTINA
1. Caractères généraux
2. Classe des Taphrinomycètes
CHAP:PRESENTATION DES CHAMPIGNONS
1-Généralités
– Les champignons appelés Mycètes ou Fungi:
• Ne constituent pas un groupe homogène.
• Doivent leur unité à leur mode de vie
très généralement saprophyte (vivent de matières
organiques en décompositions)
• Sont tous des eucaryotes (s’opposent ainsi aux
Procaryotes : Achées, Eubactéries)
• Sont dépourvus de chlorophylle d’où leur hétérotrophie
totale vis-à-vis du carbone
• Sont rangés comme consommateurs à l’instar des
animaux .
CHAP:PRESENTATION DES CHAMPIGNONS
1-Généralités
– Les champignons appelés Mycètes ou Fungi
• Ensemble très diversifié estimé à environ un million
d’espèce
• Ensemble polyphylétique comprenant:
– Les champignons amiboïdes ou animaux
– Les champignons algues
– Les champignons stricto sensu ou Eumycota
CHAP:PRESENTATION DES CHAMPIGNONS
• 1-Généralités
– Figure précisant la place des champignons dans
l’arbre du vivant
Eubactéries
Procaryotes
Archées
Lignée verte Algues et plantes vertes
Animaux
Hétérocontes
Algues brunes
Oomycètes
Protistes
Mycétozoaires
………..
………..
CHAP:PRESENTATION DES CHAMPIGNONS
Classe mycètes
Ordre ales
Famille acées
CHAP 2:CHAMPIGNONS ANIMAUX OU
MYCETOZOAIRES
PLAN:
1-Introduction
2- Classe Des Myxomycètes
3-Classe des Des Acrasiomycètes
4-Classe des Plasmodiophoromycètes
CHAP 2:CHAMPIGNONS ANIMAUX OU
MYCETOZOAIRES
• 1-Introduction
– Les champignons amiboides ou champignons –
animaux:
• Ne partagent q’une ressemblance superficielle de leur
appareils sporifères avec les autres champignons.
• Leur usage étant de les faire figurer dans les ouvrages
de mycologie
CHAP 2:CHAMPIGNONS ANIMAUX OU
MYCETOZOAIRES
• 1-Introduction
– La monophylie proposée par la structure du
facteur d’élongation EF1 a permis des distinguer
• Les myxomycètes ( 700 espèces connus dont 160 en
France ) caractérisés par les plasmodes
• Les Acrasiomycètes (une dizaine d’espèces ) à structure
cellulaire
• Les Plasmodiophoromycètes (50espèces ) tous
parasites .
CHAP 2:CHAMPIGNONS ANIMAUX OU
MYCETOZOAIRES
2- Classe Des Myxomycètes
– Les Myxomycètes (du grec muxa , mucosités) ont:
• Aspect: masses gélatineuses
• Couleurs: vives, jaune, rouge ou brun
• Dimension : varié de quelques millimètres à la taille d’une
grosse assiette
• Vivent pour la plupart sur le bois mort , les feuilles ;
• Se déplacent très lentement( à la recherche de la nourriture
ou dans les conditions optimales de développement) grâce
aux pseudopodes qui les servent à la fois à la reptation sur
le substrat et à l’ingestion de petites particules alimentaires
CHAP 2:CHAMPIGNONS ANIMAUX OU
MYCETOZOAIRES
2- Classe Des Myxomycètes
– Mode de vie et déplacement
• Les Myxomycètes (du grec muxa , mucosités) ont
– Un mode de nutrition analogue aux amibes
– Sont attirés par les parties les plus humides
– Sont repoussés par la lumière
– C’est le cas de physarum polycephalum
CHAP 2:CHAMPIGNONS ANIMAUX OU
MYCETOZOAIRES
CHAP 2:CHAMPIGNONS ANIMAUX OU
MYCETOZOAIRES
2- Classe Des Myxomycètes
– L’appareil végétatif ou plasmode
– Masse gélatineuse de forme irrégulière
– Tantôt épaisse et condensée
– tantôt étirée en de long et fragiles diverticules étalés sur le
sol ou les débris végétaux (cas particulier de Fuligo septica)
CHAP 2:CHAMPIGNONS ANIMAUX OU
MYCETOZOAIRES
Cycle de reproduction de plasmopara viticola , agent du mildiou de la vigne , espèce monoïque (les organes
males et femelles sont portés par le même mycélium) comme pour la majorité des péronosporales la
reproduction sexuée a lieu par autofécondation , la phase haploïde est très courte, la fécondation suivant la
méiose(RC). Les planospores perdent leur flagelles dans le seul but de différencier les tissus de l’hôte.
CHAP 3:CHAMPIGNONS A ALGUES OU CLASSE DES
OOMYCETES
• Ordre des péronosporales
Le thalle:
• diploïde par rapport à l’hôte
• Interne ou externe chez les formes saprophytes
• Exclusivement interne chez les espèces parasites
• Intra cellulaire chez les Péronosporales les plus
Primitives ou phytium (se développe dans les cellules
mêmes de l’hôte dont il épuise le contenu)
• Rappelant ainsi le mode de vie aquatique des espèces
archaïques
CHAP 3:CHAMPIGNONS A ALGUES OU CLASSE DES
OOMYCETES
• Ordre des péronosporales
Le thalle
• Chez les péronosporales évoluées
– Mycéllium devient inter cellulaire
– Emet des suçoirs ou haustoriums à l’intèrieur de la cellule ce
qui peut etre interprété comme une première adaptation à
un milieu pauvre en eau.
• Dans les deux cas il s’agit d’endoparasites(champignons
se développant à l’interieur de la cellule hote )
La multiplication sexuée
CHAP 3:CHAMPIGNONS A ALGUES OU CLASSE DES
OOMYCETES
• Ordre des péronosporales
Reproduction sexuée
• Oogamie siphonogame comme chez les Saprolégniales
– Le gametocyste male vient s’appliquer contre l’oogone
perfore la paroi grâce à un tube copulateur
– Ce tube véhicule le ou les gamètes males jusqu’au gamètes
femelles ou oosphères .
• Il ya adaptation à un milieu aérien sec :
– L’oogone ne contient plus q’une oosphère chez la majorité
des péronosporales
– Les autres noyaux de l’oogone sont généralement rejetés à
l’exterieur et forment le périplasme ( tissus syncytial à role
protecteur)
CHAP 3:CHAMPIGNONS A ALGUES OU CLASSE DES
OOMYCETES
• Ordre des péronosporales
Reproduction sexuée
• Le périplasme : après fécondation est à l’origine d’une
épaisse parois protectrice permettant l’hivernation du
Zygote.
• Au printemps après germination de l’oospoore le vent
assure la dispersion des sporocystes formés sur le
sporocystophore de germination.
La multiplication asexuée:
• Est réalisé par des sporocystes isolés ou groupés à
l’extremité des sporocystophores ramifiés
•
CHAP 3:CHAMPIGNONS A ALGUES OU CLASSE DES
OOMYCETES
• Ordre des péronosporales
La multiplication asexuée
• Sporocystes et porocystophores :
• Initiés au debut à l’intérieur du végétal sortent par les
stomates (uniquement à la face interne des feuilles )
• Se développent en milieu aérien, la dispersion étant favorisée
par le vent.
• Chez les Phytium
– Les sporocystes émettent encore des planospores biflagéllées
– Phytophtora forme des planospores en milieu humide et un
siphon en milieu sec
• Chez les genres plus évolués (péronospora)
– Le sporocyste forme dans tous les cas le siphon
CHAP 3:CHAMPIGNONS A ALGUES OU CLASSE DES
OOMYCETES
• Ordre des péronosporales
• Schéma d’adaptation des sporocystes et sporocystophores
à la vie aérienne :
CHAP 3:CHAMPIGNONS A ALGUES OU CLASSE DES
OOMYCETES
• Ordre des péronosporales
• Classification:
– Les phythiacées :
» Vivent en Saprophytes sur les débris organiques ou en
parasites des petits animaux et végétaux exemples:
• Plasmopara viticola responsable du mildiou de la vigne
• Phytophora infestans responsable du mildiou de la
pomme de terre
– Les péronosporacées :
» Parasites obligatoire des végétaux
» Responsables des mildious,encres, pourritures exemple:
• Plasmopora viticola responsable du mildiou de la
vigne
CHAP 3:CHAMPIGNONS A ALGUES OU CLASSE DES
OOMYCETES
• Ordre des péronosporales
• Classification:
– Les albuginacées
» Avec sporocystophores courts groupés en bouquets sous les
épidermes de la face intérieur des feuilles
» Toujours parasites
CHAP 3:CHAMPIGNONS A ALGUES OU CLASSE DES
OOMYCETES
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Introduction:
– Champignons vrais ou Eumycota
– Groupe frère des champignons animaux
– Classe monophylétique caractérisé par des
cellules mobiles :
• Flagelle postérieur unique et propulsif (spermatozoides
animaux)
– Opisthocontes (du grec opisthen, en arrière et
chonte, Flagelle )
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
Basisiomycotina
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Organisation Générale:
– Rudimentaire (appareil végétatif ou mycélium
constitué de filaments plus ou moins ramifiés sur
lesquels se différencient le moment venu les
organes de dispersions et de reproductions
– Présence de filaments à structure coenocytiques
(contiennent de nombreux noyaux non séparés les
uns les autres : ce sont des siphons mycéliens )
chez les plus archaiques.
– Chez les Asco et Basidiomycètes l’apparition des
cloisons isolant les noyaux aboutit aux hyphes
cloisonnées
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Organisation Générale
– Les hyphes et siphons:
• Croissent par leurs apex en arrière et de manière plus ou
moins ordonnée se produisent des bourgeonnements à
l’origine des ramifications
• L’ensemble est maillé par des anastomoses entres filaments.
– Les ramifications :
• Correspondent à la néoformation des nouveaux axes à
croissance linéaire
• Le nombre dépend de l’intensité de
l’alimentation(augmentation exponentielle sur un milieu de
culture riche , non limitant.
• La formation de nouvelles ramifications est équivalentes
aux nouvelles cellules produites par division chez les levures
ou les bacteries
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Organisation Générale
– Les anastomoses:
• Résultent de la multiplication des filaments
néoformés(quand un nouvel axe bute sur un déjà formé ,il
s’anastomose au précédent)
• Assurent les interconnexions entres hyphes et siphons
– Permettent le passage des nutriments voir d’organites
– Permettent un développement synchrone de l’ensemble du
mycélium
– Les filaments mycéliens
• Divergent et se ramifient à partir d’un point centrale(
germination d’une spore par exemple)
• Donnent naissance à un organisme dont le front de
croissance est circulaire en raison de la vitesse de croissance
pratiquement identique des différents hyphes
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Organisation Générale
– Les filaments mycéliens:
• Assurent une surface maximale entre le champignon et
le milieu dont il tire sa subsistance (une des qualités
essentielle)
• Cette surface maximale de contact est favorisée par le
faible diamètre des hyphes et des siphons qui
n’excèdent pas 5 à10µm chez la plupart des
espèces(plus le volume d’un organe est petit, plus sa
surface est importante)
• En recouvrant complètement le substrat va assez vite
utiliser les nutriments qu’il contient et devra sans fin
augmenter son périmètre de croissance à la recherche
de nouvelles nourritures
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Organisation Générale
– Les filaments mycéliens
• Les filaments de la zone centrale se vident de leur
cytoplasme
• Les parties vivantes du mycélium forment alors un espace
annulaire (mode de croissance bien visible in vitro lorsque le
champignon est ensemence dans un milieu homogène)
• Croissance bidimensionnelle la plus fréquente: utilisation e
l’interface entre deux milieux
– L’un apportant les éléments nutritifs solubles (sol , surface d’un
pot de confiture
– L’autre du dioxygène
• Croissance possible à trois dimensions dans les milieux
suffisamment poreux
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Organisation Générale
– La croissance du mycélium:
• Le mycélium est limité à l’apex des hyphes et des
siphons
• Concomitance entre croissance et assimilation des
nutriments
• Couplage logique car:
– La croissance utilise les métabolites venant du substrat
– Croissance n’est mécaniquement possible que si le substrat
est désorganisé et consommé partiellement.
– Le champignon explore son substrat et son extension est sa
condition de survie.
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Organisation Générale
– La croissance du mycélium:
• Le champignon ralentit son taux de croissance ou même
l’annule lorsque les éléments nutritionnelles ne sont plus
fournis de façon équilibrée
• Les aliments sont stockés sous une forme ayant un potentiel
osmotique faible:
– Carbone sous forme de glycogène ou d’inclusions lipidiques
– Azote sous forme d’amino acide vacuolaires ou protéines
– Phosphore sous forme de polyphosphates
• Le déséquilibre alimentaire déclenche la phase reproductive
au cours de laquelle les éléments emmagasinés seront
utilisés.
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Organisation Générale
– La croissance du mycélium
• Le mycélium en se substituant au milieu garde un
caractère diffus qui n’est sans forme propre
• Les processus d’agrégation stimulent les organes
• Les structures morphologiques se différencient au
niveau des organes de dispersion et de reproductions
• L’absence de corrélations hormonales connues est à
l’origine de la simplicité structurale
• Pas d’hormone de type animal connus(les auxines
gibbérélines et autres s’explique par les rapports
symbiotiques ou parasitaires des champignons et des
plantes.
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Organisation Cytologique
– Comme tous les eucaryotes les champignons ont
leurs chromosomes réunis dans le noyaux
– Possèdent un système endomembranaire
(réticulum et appareil de Golgie qui ne se
différencie pas de dictyosomes typiques )et
endosquelette d’actine et de tubuline
– Faible différenciation (car paires de bases 1000fois
moins que chez les plantes et animaux )
– La paroi glucidique constituée d’une seule strate
de microfibrilles (constitués de chitines dispersés
dans une membrane de glucane )
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Organisation Cytologique
– La division cellulaire :
• Relativement difficile à observée en raison de la petite
taille des noyaux
• Absence de centioles
• Absence de phragmoplasme comme chez les végétaux(
la bipartition du noyaux ne s’accompagne pas de la
formation d’un cloison)
• Formation du cloison indépendant de la mitose chez les
champignons
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Besoins nutritionnels
– Les champignons se nourrisent par absor
botrophie(absorbent les substances organiques et
minérales à l’état dissous car dépourvus du
pouvoir phagocytaire et hétérotrophe)
– Seules de petites molécules peuvent traverser la
parois , les grosses doivent préalablement être
dégradées
• La paroi de l’apex des hyphes et des siphons présente
une structure qui permet à la fois son extension et la
dégradation –assimilation du substrat
•
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Besoins nutritionnels
– formation d’une structure viscoélastique :
• Cytosol demeure fluide , une rigidité en arrière plan est
réalisé par les ponts calciques
• La fragilité est compensé par un réseau d’actine de
l’extremité du dôme apicale
• Rôle de cette structure viscoélastique :
– Extension de la paroi par un apport continu de chitine et de
glucane
– Sortie pouvant etre volumineuse des enzymes hydrolysantes
par exocytose ( les enzymes restent accrochés à la couches
des hyphes )
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Besoins nutritionnels
– Lorsque le milieu est riche,l’absorption intense
conduit à la synthèse de nombreuses visicules
d’exocytoses
– L’entrée des assimilats (oses ,amonoacides )est
réalisée par cotransport
– Les besoins sont:
• Eau ,sels minéraux(phosphates sulfates ,nitrates)
• ,oligo éléments(fer ,cuivre )
• Source de carbone organique
• Parfois les vitamines , stérols ,acides gras, purines
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Besoins nutritionnels
– Les vitamines
• Pyrimidines chez les Mucoracées (Asidia racémosa)
• Thiazol(Mucor romanianus
• Pyrimidines et thiazol pour phycomyces de thiazol
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Besoins nutritionnels
– Le carbone est apporté par les oses ,les acides
organiques (n’importe quelle source convient
pour les mucors et Aspergillus)
– Les nitrates(principales source d’azote)
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Mode de vie :
– Saprophytisme (vivent au dépend de la matière
organique en décomposition)
– Parasitisme pour certains ( vivent au dépend des
autres êtres vivants
– Symbiose :quelques uns sont en relation avec les
organismes vivant et forment avec eux une
association à bénéfice réciproque
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Mode de vie
– Les espèces se développent sur les substances
mortes d’origine animale ou végétale
– Les ascomycotina et basidiomycotina s’attaquent
• Aux bois flottant dans les milieux marins
• Aux dérivés pétroliers provenant des navires
• Participent à la destruction des matières organiques
dans la mangrove
– Les champignons sont anérobies à l’exception de
quelques uns vivant dans la panse des ruminants
– Les levures et certains Mucor fermentnt en
anaérobie
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Mode de vie
– Contraintes de dévéloppement:
• Doivent développer une forte pression osmotique intra
vacuolaire (assurée par les polyol exemple du
mannitol)car colonisent les milieux organiques à forte
densité moléculaire
• Doivent se protéger des rayons UV(synthétisent les
anthocyanes protecteurs)
• Synthétisent des mélanines (les organes reproducteurs
sont souvent de couleurs foncée , les vieux mycélium
deviennent verdâtres et noirs ).
• Doivent résister à la sécheresse, adaptation la moins
réussie (parois des hyphes et des siphon fois moins
grande que chez les végétaux)
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Mode de vie
– Les champignons saprophytes synthétisent une
grande variété d’exoenzymes qui leur permettent
de s’adapter aux différents substrats
– Les champignons Telluriques :
• Présent dans le sol participent activement au cycle de
l’azote en provoquant la dégradation de l’humus(
consomation de la cellulose et la lignine constituants
des acides humiques )
• Les pourritures cubiques, molle ou blanches
constituent les différents modes d’attaques
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Mode de vie
– Les champignons Telluriques
• Certaines moisissures sont des agents d’altération des
matières organiques les plus variées , mal conservées
ou exposés à l’humidité (cuir, papiers, matière
plastique)
• d’autres se développent sur les matières alimentaires
et sécrètent des substances extrêmement toxiques
pour l’homme
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Mode de vie
– Les champignons levuriformes
• Sont à l’origine des processus de fermentations mis à
profit dans l’industrie chimique et alimentaire
• D’autres émettent dans le milieu extérieurs des
antibiotiques utilisés en therapeutiques (exemple de la
mucidule visqueuse qui produit la mucine éliminant les
autres êtres dans les bois morts)
– Les champignons ne produisent que les
métabolites secondaires par rapport aux plantes
et aux animaux
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Le parasitisme :
– Phénomène fréquent apparu grace aux besoins
nutritionnelles favorables des saprophytes chez
les êtres vivants
– Facilité par le faible diamètre des hyphes et par
leur pouvoir de dissémination
– Divers modes:
• Obligatoires
• Facultatifs(champignons de forets)
• opportunistes (cavité naturelles ou téguments de
l’homme et des animaux)
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Mode de vie
– La symbiose: cas des mycorhizes et des lichens
• Les mycorhises:
– Association étroites entre champignons et végétaux
supérieurs des fougères aux plantes à fleurs
– Développent un réseau filamenteux autour des racines et
amplifient considérablement la surface de contact entre les
racines et les solutions ou particules du sol permettant ainsi
aux plantes de puiser aisément leur éléments minéraux
– Chez l’oignon zon d’absorption de 1 et2 mm,et en présence
de mycorhises,6-8 cm, le champignon recoit de la plante la
substance cabonée.
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Mode de vie
– La symbiose: cas des mycorhizes et des lichens
• Les Lichens
– Résultent de l’union d’une algue et d’un champignon
» Algue:
• Souvent appelées gonidies , appartiènnenent aux
cyanobactéries du genres Nostoc
• Seule une 20taine participent à la formation des
lichens
» Champignons :
• 1Milers d’espèces appartenant aux Ascomycotina
sont inconnu à l’état libre
• Ne peuvent vire qu’en association avec les algues
• Culture délicate à l’état saprophyte
CHAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Rôle de la lumière
• Besoins trophiques
HAP4 :LES CHAMPIGNONS OU EUMYCOTA
• Cycle de développement et de
reproduction(figure 4-7)