Chapitre 1 Biosignalisation
Chapitre 1 Biosignalisation
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 3
Février 2018
Introduction
Intérêt de communiquer ?
- Afin d’induire une action : proliférer, se différencier, migrer, se
maintenir fonctionnel ou tout simplement mourir…
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 4
Février 2018
Introduction
Organismes unicellulaire et pluricellulaire
La signalisation cellulaire a été essentiellement abordée dans le
cadre d’organismes multicellulaires, elle peut toutefois intervenir
entre les cellules de deux organismes distincts.
Exemples :
- Mammifères : l'embryon communique avec des cellules de l'utérus.
- Bactéries : dans l'appareil digestif humain, les bactéries échangent des
signaux entre elles et avec les cellules épithéliales et du système
immunitaire.
- Levures : Lors de l'accouplement de Saccharomyces cerevisiae, certaines
cellules envoient autour d'elles un signal peptidique qui stimule des
récepteurs à la surface d'autres cellules de levure lors de l'accouplement.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 5
Février 2018
Définition
Dans certains cas, l'activation du récepteur provoquée par la
liaison du ligand à un récepteur est directement couplée à la
réponse de la cellule au ligand.
Cependant, pour de nombreux récepteurs situés à la surface de la
cellule, les interactions ligand-récepteur ne sont pas directement
couplées à la réponse de la cellule. Le récepteur activé doit tout
d'abord interagir avec d'autres protéines au sein de la cellule
avant que l'effet physiologique du ligand sur le comportement de
la cellule ne se manifeste.
Il arrive fréquemment que le fonctionnement d'une chaîne de
plusieurs protéines cellulaires en interaction soit modifiée à la
suite de l'activation du récepteur. L'ensemble des modifications
cellulaires induites par l'activation du récepteur est appelé voie ou
mécanisme de transduction du signal (wikipedia)
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 6
Février 2018
Définition
La signalisation cellulaire : qu’est-ce que c’est ?
- La signalisation cellulaire (signalisation transmembranaire ; transduction du
signal) est le processus par lequel les cellules communiquent avec leur
environnement et répondent temporairement aux différents stimuli
qu’elles peuvent percevoir (jusqu’à un certain degré en fonction des cellules).
- Intracrine
- Juxtacrine
- Autocrine
- Paracrine
- Synaptique
- Endocrine
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 9
Février 2018
Introduction
Rappel : Formes de communication cellulaire (Intracrine)
Ce mode de communication concerne des molécules telles que
certaines cytokines et hormones où celles-ci agissent au niveau du
cytoplasme des mêmes cellules qui les ont produites.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 10
Février 2018
Introduction
Rappel : Formes de communication cellulaire (Contact direct)
Ce mode de communication concerne quelques facteurs de croissance ainsi que
certaines cytokines et hormones et surtout dans les phénomènes d’adhésion et
de reconnaissance immunitaire. L’action peut s’effectuer par interaction entre 2
molécules membranaires des cellules juxtaposées.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 11
Février 2018
Introduction
Rappel : Formes de communication cellulaire (juxtacrine)
Ce mode de communication concerne surtout les ions (Ca++). L’échange
s’effectue entre les cellule par jonction communicante entre les cytoplasmes
des 2 cellules ou jonctions gap ce qui permet une réponse coordonné et rapide.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 12
Février 2018
Introduction
Rappel : Formes de communication cellulaire (Autocrine)
Ce mode de communication concerne des molécules telles que des
hormones et des cytokines où celles-ci agissent au niveau des
membranes cellulaires des mêmes cellules qui les ont produites.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 13
Février 2018
Introduction
Rappel : Formes de communication cellulaire (Paracrine)
Ce mode de communication concerne des molécules telles que
certains peptides où ceux-ci agissent au niveau des cellules
voisines des cellules qui les ont produites.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 14
Février 2018
Introduction
Rappel : Formes de communication cellulaire (Synaptique)
Ce mode de communication concerne exclusivement les
neurotransmetteurs qui sont libérés au niveau des fentes
synaptiques stimulant la cellule cible.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 15
Février 2018
Introduction
Rappel : Formes de communication cellulaire (Endocrine)
Ce mode de communication concerne les hormones endocrines
qui sont véhiculées à travers le sang vers leurs cellules cibles.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 16
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
1. Molécule signale
2. Récepteur du signal
3. Transducteur du signal
(optionnel)
4. Effecteur du signal
5. Réponse au signal
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 17
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
La molécule signale
Le signal transmit à la cellule cible peut se présenter sous
différentes formes :
Signal
moléculaire
Signal
physique
Polaire Non polaire Signal
gazeux
Stéréocils et photons
Monoxyde d’azote
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 18
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
La molécule signale
- Neurotransmetteurs : dopamine, sérotonine,
acétylcholine, glycine, adénosine
- Neuropeptide : endomorphine, vasopressine,
Signal ocytocine
moléculaire - Chemokines : IL 1-18, GM-CSF, G-CSF
- Hormones peptidiques : glucagon, somatostatine,
LH, FSH, GH, prolactine insuline.
Polaire Non polaire
- Régulateurs de développement : delta, serrate,
Wnt, BMP, hedgehog, nodal
- Facteurs de croissance : TNFα, TNFβ, EGF, VEGF,
BDNF, NGF, FGF
- Matrice extracellulaire : fibronectine
- Molécules d’adhésion : cadhérines
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 19
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
La molécule signale
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 20
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
La molécule signale
Signal
physique
Stéréocils et photons
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 22
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
La molécule signale
Les photons
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire
Cours de Signalisation cellulaire – Pr. Jérôme Guerlotté 23
Université des Antilles et de la Guyane, Domaine Sciences, Technologies, Santé
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
La molécule signale• Le NO est un radical libre qui peut diffuser à
travers la membrane plasmique et affecter les
cellules avoisinantes.
• La NO synthase est responsable de la fabrication
de NO à partir d’arginine et d’oxygène.
• L’action du NO s’effectue principalement à partir
de l’activation de son récepteur cible (l’enzyme
soluble guanylate cyclase) qui lorsqu’elle est
Signal
gazeux
activé, produit un second messager la cGMP
• Actions :
- Relâchement des vaisseaux sanguins
- Régulation de la libération de
Monoxyde d’azote neurotransmetteurs
- Réponse immunitaire cellulaire
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 24
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
La molécule signale
L'acétylcholine libérée L'oxyde nitrique (NO) "un messager passe-muraille"
par les nerfs sur les
cellules endothéliales,
provoque la relaxation
des cellules
musculaires lisses de
la paroi vasculaire.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 26
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les récepteurs cellulaires
Un récepteur est une protéine de la membrane cellulaire ou du
cytoplasme ou du noyau cellulaire qui se lie spécifiquement à un facteur
spécifique ou un ligand, tels qu’un neurotransmetteur, une hormone, une
protéine un peptide un lipide ou un gaz.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 27
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les récepteurs cellulaires
Les 6 grandes classes de récepteurs
V – Récepteurs nucléaires
VI - Récepteurs de contact
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 28
Cours de Signalisation cellulaire – Pr. Jérôme Guerlotté
Février 2018 Université des Antilles et de la Guyane, Domaine Sciences, Technologies, Santé
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les récepteurs cellulaires : Récepteurs nucléaires
- Ils ont principalement un rôle de facteur
de transcription : ce sont des protéines qui
agissent dans le noyau (en relayant des
signaux hormonaux) et qui modulent la
transcription des gènes.
- Ils agissent en trans : ils induisent la
transcription de gènes codant des
protéines qui à leur tour activent de
nombreux autres gènes.
- Certains agissent sur d'autres voies de
signalisation intracellulaire.
- Ils peuvent être classés en deux principales
catégories selon leur mécanisme d'action
et leur distribution subcellulaire en
absence de leur ligand (Type I et Type II)
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 29
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les récepteurs cellulaires : Récepteurs nucléaires
Récepteur nucléaire de type I : situés dans le cytosol puis délocalisés dans le
noyau. Son activation induit :
• la dissociation d'une protéine de choc thermique
• la translocation active du récepteur nucléaire du cytoplasme vers le
noyau
• l'homo-dimérisation du récepteur nucléaire
• sa fixation sur une séquence spécifique de l'ADN : HRE « Hormone
Responsive Element » .
Récepteur nucléaire de type II : toujours maintenus dans le noyau, fixés sous
forme d'hétéro-dimères (avec un autre R. de type "retinoid X receptor") à
l'ADN. En l'absence de ligand, ces récepteurs sont souvent complexés à des
protéines co-répressives. la fixation du ligand induit :
• la dissociation des co-répresseurs et le recrutement de protéines co-
activatrices de la transcription
• recrutement de protéines de transcription (ARN polymérase)
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 30
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les récepteurs cellulaires : Récepteurs nucléaires
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les récepteurs cellulaires : Récepteurs membranaires
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 32
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les récepteurs cellulaires : les récepteurs canaux
On peut distinguer schématiquement trois types de récepteurs membranaires : les
récepteurs canaux, les récepteurs enzymes et les récepteurs liés aux protéines G.
La caractéristique générale des récepteurs canaux est d’avoir une réponse
instantanée et de courte durée.
L’ouverture du canal nécessite souvent l’interaction simultanée de deux molécules
activatrices (récepteur nicotinique à l’acétylcholine et récepteur GABAA).
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 33
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les récepteurs cellulaires : les récepteurs enzymes
Quels sont les 4 principaux types de récepteurs enzymes
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 34
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les récepteurs cellulaires : les récepteurs enzymes
Possédant une activité enzymatique.
La modulation de son activité est de
type kinase ou guanylate cyclase ou
phosphatase :
1) Protéine kinase. Pour la plupart
tyrosine kinases (RTK) ex
récepteur à l’insuline. Il en existe
aussi à activité sérine/thréonine
kinase.
2) Guanylate cyclase. L’activation
de ce récepteur provoque la
formation, de GMPc à partir de
GTP. Ces GMPc activent des
protéines kinases.
3) Phosphatase. Impliquées dans
des cascades de
Marir Rafik déphosphorylation (plus rares)
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 35
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les récepteurs cellulaires : les récepteurs enzymes
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 36
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les récepteurs cellulaires : les RCPG
Les RCPG ont une structure commune à 7 hélices α transmembranaires (TM1-TM7) présentant
3 boucles extracellulaires (E1, E2 et E3) et 3 boucles intracellulaires (I1, I2 et I3).
L'extrémité N-terminale de la protéine est extracellulaire et l'extrémité C-terminale est
intracellulaire. Leurs ligands sont variés : hormones, neurotransmetteurs, chimiokines, ions
calcium, phéromones, photons etc.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 37
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les récepteurs cellulaires : les RCPG
Les RCPG sont classés selon leurs propriétés pharmacologiques en 4 principales super familles :
- classe A rhodopsin like (la plus large et la plus étudiée); classe B secretin-like, classe C
metabotropic glutamate/pheromone, et classe F frizzled receptors
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 38
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Désensibilisation des récepteurs
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 39
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Désensibilisation des récepteurs
La phosphorylation de résidus Ser ou Thr de l'extrémité C-terminale par les
GRK « G-protein-coupled receptor kinases », joue un rôle capital dans le
traffic intracellulaire et le recyclage des RCPG.
1. Ceci augmente la fixation de β-arrestines sur la surface intracellulaire du
récepteur. En masquant cette surface, les β-arrestines empêchent ainsi
le couplage du RCPG avec sa protéine G, c'est la désensibilisation du
RCPG.
2. les β-arrestines fixent le RCPG aux éléments de la machinerie
d'internalisation, la clathrine et l'adaptateur de la clathrine AP2
(clathrin,β 2-adaptin). Il y a alors endocytose du RCPG dynamin (Dyn)-
dependent
3. le RCPG est alors : - soit dirigé vers les lysosomes pour y être dégradé
- soit recyclé vers la membrane plasmique où il est de
nouveau apte à percevoir le signal
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 40
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Désensibilisation des récepteurs
Down-regulation
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 41
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
La cellule peut aussi internaliser le récepteur et son ligand
pour prolonger le signal
Prolonger le receptors:
G-protein-coupled signal Signaling from the inside
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 42
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les transducteurs du signal : Les protéines G
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 43
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les transducteurs du signal : Les protéines G
Les chaines α
- Membranaire 39 à 46 kDa
- Liaison non covalente aux chaînes β et γ
- Fixation du GTP et GDP
- Fixation au récepteur
- Liaison à l’effecteur
Les chaines β
- Soluble 35 à 39 kDa
Les chaines γ
- Membranaire 8 kDa
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 44
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les transducteurs du signal : Les protéines G
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 45
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les transducteurs du signal : Les protéines G
Les sous-unités (β–γ) peuvent agir sur des effecteurs
différents de ceux reconnus par la sous-unité α, après
l'activation et la dissociation des sous-unités.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 47
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
III - 1 : Les différents éléments du couplage
Les effecteurs duIIIsignal
-1-D : Les effecteurs
Les protéines G conduisent le signal qu’elles ont elles mêmes reçues sans quitter
la membrane. Celui-ci est diffusé dans le cytoplasme par un effecteur.
ENZYMES ENZYMES
Adénylate cyclase Adénylate cyclase
Phospholipase C-β Phospholipase C-β
Phospholipase A2 Ligands Phospholipase A2
Phosphodiestérase GMPc des RCPG Tyrosine phosphatases
CANAUX IONIQUES Tyrosine kinases
TRANSPORTEURS CANAUX IONIQUES
EFFECTEUR EFFECTEUR
par Gα par βγ
Seconds
messagers
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 48
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les effecteurs du signal : enzyme
Réponse cellulaire
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 49
Février 2018
dénylate cyclase :
nsmembranaires
oplasmiques catalytiques
Acteurs de la signalisation cellulaire
alyse la Les
réaction ATPdu signal
effecteurs AMPc + PPi
: enzyme
stimuléeAdénylate unité αs-GTP provenant de
cyclase :
par la sous
- 12 segments transmembranaires
par son Ho spécifique
- 2 domaines cytoplasmiques catalytiques
- catalyse la réaction ATP --------------> AMPc + PPi (régulée par PDE)
tion ligand entraîne une
- stimulée par inhibition
αs-GTP provenant de l’activité
de l’activation de par le ligand
du RCPG
impliquée est a te
y l
Adénylate
n se
dont la sous d é la
cyclase
A y c
αι
αi-GTP) inhibe α c ATP
PP
cyclase
GGTT
! AMPc
Dans certains cas, il y a inhibition de l’activité
Marir Rafik
de AC (protéinePKA
G de type αi-GTP)
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 50
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
L'AMP cycliste
Les effecteurs du signal : enzyme
NH2
N
O O O N
5' Adénine
-O - P - O - P - O- P - O - CH2 N N
O
O- O- O-
4' 1' ATP
Phosphates
3' 2'
OH OH Ribose
Adénylate cyclase
NH2
N
N
5'
O O N N
O - CH2
-O - P - O - P - OH O
O- O- 4' 1'
Adénylate
cyclase
Protéine kinase A
α ATP
- 2 sous unité catalytique (C)
P
AMPc ( )
R C C R
+ AMPc +
R C R
C
PKA inactive
+ ATP
R R C
R C
R PKA
C C
P
S S
133 133
CREB CREB +
CRE CRE
CREB : cyclic AMP response element binding protein
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 53
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Activation de la phospholipase C-β spécifique des
Les effecteurs du signal : enzyme
phosphatidylinositol par les protéines Gq
Phospholipase C-β :
Histamine
- enzyme transmembranaires
Angiotensine II formés de 2 domaines (SH3 et PH)
- catalyse la réaction PI(4,5)P2 --------------> IP3 + DAG
Thromboxane
PLC-β
αq β γ
P +
GD
! IP3, alors
Les PLCβ participent à la production d’IP3
+ DAG
que les PLCδ sont activées par l’IP3.
Production de deux messagers lipidiques
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 54
Février 2018
PLC-β : Phospholipase spécifique des phosphatidyl inositol (PI)
Acteurs de la signalisation cellulaire
Activation de la phospholipase C-β spécifique des
phosphatidylinositol
Les effecteurs du signal : enzymepar les protéines Gq
Histamine Les différents types de phospholipases
Angiotensine II
Thromboxane
PLA1
CO O CH2
CO O CH PLC choline,
Tête éthanolamine,
CH2 O PO2 O sérine,
PLA2PLC-β polaire
inositol
αq β =γ Lipide membranaire
Phosphatidyl Inositol PLD
GD
P +
PLC
PO=
3
CO O CH2 5 O PO=
IP3 DAG 4
3
+
CO O CH 1
=O P
CH OH 3
Production de deux
2
messagers lipidiques
Marir Rafik
Diacylglycérol : DAG Inositol triphosphate : IP3
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 55
Février 2018
2nd messagers lipidiques
PLC-β : Phospholipase spécifique des phosphatidyl inositol (PI)
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les effecteurs du signal : enzyme
2: Voies de
nsduction
s protéines
Marir Rafik
G
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 56
Février 2018
A: Voie de la
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les effecteurs du signal : enzyme
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 57
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Seuil de tolérance
Désensibilisation / Tolérance
par inactivation de la signalisation
La morphine agit sur un RCPG couplé à une protéine Gi qui inhibent l’adénylate
cyclase La
et morphine
la production
agit sur d’AMPc.
un récepteur RCPG couplé à une protéine Gi qui inhibent
l'adénylate cyclase et la production d'APMc, ainsi que l'activité de la PKA.
Pour sePour
désensibiliser de la
se désensibiliser morphine
à la etfaire
morphine et faire remonter
remonter led'AMPc,
le taux taux d’AMPc,
la cellule la cellule
augmente le taux
augmente d’adénylate
le taux d'adénylatecyclase.
cyclase et de PKA.
Le morphinomane est donc obligé d'augmenter la dose pour retrouver l'effet initial.
Le morphinomane est donc obligé d’augmenter la dose pour retrouver l’effet initial
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 59
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Les seconds messagers
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 60
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
III - 2 : Voies de transduction par les Protéines G
Les
III -2-seconds
C : Diversitmessagers
é des voies de transduction par les protéines G
Protéine G Effecteur primaire Second Effecteurs secondaires Effets biologiques
messager
Adénylate cyclase :AC AMPc PKA (protéines kinases phosphorylations
(activation) AMPc dépendantes)
Gαs
Canaux Ca++ (activation) Ca++ Activation NO synthase Synthèse de NO
Activation Ca++-ATPase Stockage de Ca++
Adénylate cyclase AMPc PKA (protéines kinases phosphorylations
(inhibition) AMPc dépendantes)
Gαi
Canaux K+ (ouverture) Sortie de K+ Hyperpolarisation cellules
musculaires coeur
Cyclo-oxygénase Prostaglandines
Phospholipase A2 : Acide Thromboxanes
Gα12
PLA2 (activation) arachidonique
Lipo-oxygénase Leucotriènes
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 63
Février 2018
SH3 SOS
Recruited
Acteurs de la signalisation cellulaire signalling
enzymes
Autres acteurs (intermédiaires internes)
Protéines d’échafaudage
(Scaffolding proteins) : c d Ion
1 Signal channel
Focused enzy
Figure 1 | Properties of adaptor, doc
Marir Rafik
[Link]@[Link] the
Chapitre 1 : Signalisation distinguishing features 64of signal-o
cellulaire
Février 2018
Adaptor proteins, such as growth fac
Acteurs de la signalisation cellulaire
Autres acteurs (intermédiaires internes)
Protéines d’échafaudage
(Scaffolding proteins) :
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 65
Février 2018
SH3 SOS
P
Recruited
Acteurs de la signalisation cellulaire signalling
enzymes
Autres acteurs (intermédiaires internes) R
Protéines d’échafaudage
c proteins) :
(Scaffolding d Ion Plasma e
Signal channel membrane E
2
A avec C A
Sca old protein
Protéines s’associant
plusieurs protéines et A
regrouper au sein
B d’une région
Signalling
particulière pour assurer leurs
fonctions
cascade
C B
Marir Rafik Langeberg LK, et al. Nature reviews Molecular cell biology. 2015
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 67
Février 2018
SH3 SOS P
PI3K
P P ac
Recruited P P P P at
Acteurs de la signalisation cellulaire
signalling AKT PDK1 p
enzymes
Autres acteurs (intermédiairesRecruited
internes)signalling enzymes fu
en
Protéines d’échafaudage
d (Scaffolding
Ion Plasma
proteins) : 3
e ki
channel membrane E ector Coordinated
regulation
ei
A B of an e ector by
Protéines s’associant avec C
A au sein
plusieurs protéines A
gnalling d’une plateforme pour assurer in
une fonction coordonnée
ascade C lin
B th
si
Focused enzyme activity gr
erties of adaptor, docking and scaffold proteins. The figure depicts kn
Nature Reviews | Molecular Cell Biology
se
Marir Rafik
ng features of signal-organizingChapitre
[Link]@[Link] proteins and
1 : Signalisation of scaffold proteins. 68
cellulaire
Février 2018
ns, such as growth factor receptor-bound protein 2 (GRB2) (part a), and
Acteurs de la signalisation cellulaire
Autres acteurs (intermédiaires internes)
Protéine d’ancrage aux PKA (Anchoring proteins) :
Elles jouent un rôle majeur dans la signalisation cellulaire en s’associant
aux kinases et phosphatases afin de stabiliser ces protéines et de mettre
en contact les différents sites d’interaction. Ex : AKAP (A Kinase
Anchoring Protein) et RACK (Receptor for Activated C Kinase
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 69
Février 2018
[Link] / Nov2007
Acteurs de la signalisation cellulaire
Domaines protéiques pour des interactions spécifiques
Domaine de liaison/de régulation
Site
secondaire SH2 Domaine « Src Homology 2 »
100 aa
P Spécificité: phosphotyrosine et
Site SH3 Domaine « Src Homology 3 »
primaire I environnement côté C-terminal
-Y-X-X-hy- 60 aa
Spécificité: proline
Spécificité: phosphosérine
P
I PH Domaine « Pleckstrin
-R-S-X-S-X-P- Homology »
100 aa
+++ +++ +++
Spécificité: interaction avec
PDZ Domaine 100 aa Phospholipides phospholipides membranaires
Spécificité: extrémité C-terminale
-E-S/T-D-V-COOH
Marir Rafik
[Link] / Nov2007 43
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 71
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
La réponse au signale
Les réponses cellulaires peuvent être :
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 72
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
La réponse au signale
IV - 1 : Amplification
du signal
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 73
Février 2018 (Molecular Biology of the Cell)
Acteurs de la signalisation cellulaire
La réponse au signale
plusieurs types de réponses se
produisent suite à un seul
stimulus de façon coordonné et
durant différentes périodes
d’action.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 75
Février 2018
IV- 2 : Interaction des voies de signalisation
Acteurs de la signalisation cellulaire
IV -2-B : voies « récepteurs enzymes » et RCPG
La réponse au signale
Cross-talk βγ
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 76
Février
(Molecular Biology 2018
of the Cell)
Acteurs de la signalisation cellulaire
5. Présence de boucles de rétro régulation
La réponse au signale
Un même facteur de transcription (FT) peut moduler (+/-) l’expression de plusieurs gènes
cibles.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 78
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
La réponse au signale
Un même facteur de transcription peut activer ou inhiber la transcription d’un gène.
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 79
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
La réponse au signale
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 80
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
L’arrêt du signal
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 81
Février 2018
Acteurs de la signalisation cellulaire
Adaptation / désensibilisation
L’arrêt du signal
On distingue 3 niveaux de désensibilisation :
1 – LIG
1 - reca
2 - dég
du liga
2 – RE
a/ - ina
Régulation de la concentration en ligand par ph
OIM5 !
découp
- Recapture
- Dégradation b/ - Inte
récepte
recycla
Marir Rafik
"recept
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 82
Février 2018
3 – SIG
Acteurs de la signalisation cellulaire
Messagers secondaires communs à toutes les cellules :
AMPc, DAG, IP3, Ca2+
Grandes voies de transduction communes :
PKA, PKC, MAPK…
Diversité des composants de chacune de ces voies
Régulations entrecroisées entre les voies
Amplification du signal jusqu’à la réponse
Identification
- Des récepteurs
- Des protéines couplées aux récepteurs
- Des effecteurs et intermédiaires
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 84
Février 2018
Grandes voies de signalisation
Voie PI3K/Akt
DNA-PK
mTORC2
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 86
Février 2018
Grandes voies de signalisation
Voie PI3K/Akt
Kinase
Phosphatase
Transcription Factor
Direct Stimulatory Modification
Caspase
Direct Inhibitory Modification
Receptor
Multistep Stimulatory Modification
Enzyme Multistep Inhibitory Modification
Deacetylase
Ribosomal subunit
Grandes voies de signalisation
Voie MAPK/Erk
Marir Rafik
[Link]@[Link] 88
Février 2018
Grandes voies de signalisation
Voie MAPK/Erk
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 89
Février 2018
Grandes voies de signalisation
Voie MAPK/Erk
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 90
Février 2018
Grandes voies de signalisation
Voie Jak/Stat
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 91
Février 2018
Grandes voies de signalisation
Voie Jak/Stat
Kinase
Phosphatase
Transcription Factor
Direct Stimulatory Modification
Caspase
Direct Inhibitory Modification
Receptor
Multistep Stimulatory Modification
Enzyme Multistep Inhibitory Modification
Deacetylase
Ribosomal subunit
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 92
Février 2018
Investigation des interactions en
signalisation
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 94
Février 2018
Investigation des interactions en
signalisation
Double Double
hybridehybride
DA : domaine d’activation Système rapporteur
DA DL : domaine de liaison à l’ADN
TF
DL colonies de levures
pas d’expression
mARN expression du gène
DA prot 2 prot 3
Fusion protéines et modules du
facteur de transcription prot 1 DL DL
Expression du système
mARN
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 95
Février 2018
Investigation des interactions en
signalisation
FRET (fluorescence resonance energy transfer)
FRET : Fluorescence Resonance Energy Transfer
L. Stryer; Annu Rev Biochem 1978; 47: 819–846
R0
excitation 10-70 Å émission
accepteur
nm
475 525
Noyau
e- Émission de fluorescence
Photon
(lumière d'excitation) Fluorescence Resonance
Energy Transfer
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 97
Février 2018
Investigation des interactions en
signalisation
FRET : Fluorescence Resonance Energy Transfer
Donneur Accepteur
Transfert
d énergie
Noyau
e-
e-
Photon
émis
Photon
d’excitation
Fluorescence Resonance
Energy Transfer
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 98
Février 2018
Investigation des interactions en
signalisation
FRET : Fluorescence Resonance Energy Transfer
Bioluminescence
Resonance Energy Transfer
wikipedia
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 99
Février 2018
Investigation des interactions en
signalisation
FRET : Fluorescence Resonance Energy Transfer
Avantages :
• Etude dynamique en temps réel
• Applicable in vivo dans le système cellulaire originel
• Peut être couplé à un signal biologique
• Applicable dans tous les compartiments cellulaires
Inconvénients :
• Création de protéines chimériques qui peuvent modifier les
interactions
• Nécessite la surexpression des protéines testées
Application :
• Signification biologique des interactions
• Localisation cellulaire par couplage avec des techniques de
microscopie
Marir Rafik
[Link]@[Link] Chapitre 1 : Signalisation cellulaire 100
Février 2018