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Série 03 GG PCR

Le document présente une série d'exercices sur l'amplification par PCR dans le cadre d'un cours de biochimie. Les exercices incluent des calculs sur la taille des segments amplifiés, la conception des amorces, la température de fusion, et des explications sur le phénomène exponentiel de la PCR ainsi que ses applications. Enfin, il aborde des questions pratiques concernant le rendement et le nombre de cycles nécessaires pour amplifier un fragment d'ADN spécifique.

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Université de Jijel

Faculté de sciences et de la nature et de la vie


Département de biologie moléculaire et cellulaire
Licence biochimie
Module de GENIE GENETIQUE

Série 04
Exercice N°1 :
On se propose d’amplifier par PCR un fragment nucléotidique de 118 à 288 inclus dans la séquence
suivante :

1. Quel sera la taille du segment amplifié sans tenir compte des amorces ? En tenant compte de ces
amorces ?
2. Indiquer la structure des amorces de 21 pb nécessaires pour amplifier le segment désigné.
3. Rappeler les critères de choix des amorces.
4. Calculer la température de fusion Tm de chaque amorce en utilisant la relation :
Tm= 2. (A+T) + 4. (G+C) en Cooù le A est le nombre d’adénine, T de thymine, C de cytosine et G de
guanine.

Exercice N°2 :
- Expliquer comment l’amplification par la PCR est un phénomène exponentiel et écrire la relation
donnant le nombre de copies totales « N » en fonction de nombre de cycles « n ».
-Discuter quelques applications de la PCR.

Exercice N°3 :
On veut amplifier une séquence d’ADN par PCR. Le fragment d’ADN amplifié mesure 320 pb. On
parle de 100 ng d’un ADN génomique de 3.109 pb. Le rendement de la PCR est de 95%.
1. Quel est le facteur d’amplification de la PCR pour obtenir 1μg du fragment de 320 pb ?
2. Combien de cycles de PCR devra-t–on faire ?

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