BIODIVERSITE, ECOLOGIE, EVOLUTION

Syllabus

1
Première année, semestre 1

2
Mention Inter-mentions SEM M1S1 CRD 3
Intitulé UE (TC1) Traitement statistique des données
Responsable 1 Franck Torre Email 1 [email protected]

Responsable 2 Eric Meineri Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Déterminer, développer et appliquer des méthodes (BEE)
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Permettre la compréhension et la mise en ouvre des méthodes d'analyses statistiques basiques couramment
OBJECTIFS
utilisées en sciences environnementales
SAVOIR-FAIRE Analyses statistiques
Connaissances générales et appliquées en analyses statistiques et pratique d'un langage de programmation
CONNAISSANCES
dédié à la statistique
Contenus - Programme détaillé
Initiation au langage informatique R ; Rappels sur les tests paramétriques basiques ; Formation aux modèles
CONTENU linéaires (régressions linéaires simples et multiples, analyse de variance (ANOVA) et l'analyse de covariance) ;
Formation à l'analyse factorielle (ACP)
Connaissance de la loi normale, connaissance de la théorie de l'estimation (moyenne, variance) et du théorème
PRE-REQUIS
central limite, initiations aux principaux tests paramétriques (Student, corrélation-régression, ANOVA),
OBLIGATOIRES
utilisation correcte d'un ordinateur.
PRE-REQUIS
Connaissance basique en programmation informatique
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Analyse statistiques, R, tests paramètriques, modèle linéaire, analyse multivariées

HEURES
REPARTITION
10 heures CM ; 20 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

3
Mention Inter-mentions SEM M1S1 CRD 3
Intitulé UE (TC2) Traitement cartographique des données
Responsable 1 Olivier Cavalié Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Déterminer, développer et appliquer des méthodes (BEE) ; Mobiliser les savoirs en contexte professionnel (GEE) ; Développer des
compétences et des savoirs-faire spécifiques (RIE) ; Générer, interpréter et modéliser des résultats expérimentaux (SCE) ; Appliquer des
méthodes et outils en géosciences (STPE)
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Le SIG s'est imposé comme un outil incontournable pour l'étude de données localisées géographiquement. Il
permet à la fois une représentation aisée des données de terrain et facilite la recherche et le croisement
d'informations. Pour cela, cet outil est très prisé des bureaux d'études et des scientifiques. Les objectifs de cette
OBJECTIFS UE sont donner une connaissance de base solide des principes du SIG et d'apprendre pratiquement comment
manipuler des données à travers un logiciel open source très utilisé. Cette compétence est indispensable pour
d'insertion des étudiants dans la vie professionnelle en lien avec leurs études d'environnement ou de sciences de
la Terre.
Représenter des données spatiales. Numériser et créer des données à partir de données déjà existantes.
SAVOIR-FAIRE
Géolocaliser des images aériennes. Croiser des informations à partir de différents jeux de données.
Principes de base du SIG et des types de données associés au SIG. Principe d'acquisition des images satellites.
CONNAISSANCES
Apprendre les bases de la cartographie. Principe de création d'une base cartographique.
Contenus - Programme détaillé
Cours Magistral (4h): ; Partie 1 : ; 1. Introduction: A quoi servent les cartes? ; 2. Espace Géographique ; 3.
Représentation de la Terre ; 4. La cartographie ; Partie 2 : ; 5. Introduction au SIG ; 6. Information
géographique ; 7. Structure et modèle ; 8. Banque de données spatialisées ; 9. Principales fonctionnalités
CONTENU
des SIG ; Partie 3 : ; 10. Introduction à l'imagerie satelittaire ; Partie 4 : ; 11. Introduction à QGIS ; ; TP (26h)
: ; Découverte d'un logiciel SIG : QGis ; WMS (Web Map service) et WFS (Web Feature Service) ; Mise en page ;
Les données vectorielles ; Les données raster ; ;
Etre à l'aise avec windows, savoir organiser un espace de travail (création de répertoire, sous-répertoire etc.).
PRE-REQUIS
Savoir zipper et dézipper proprement un(des) fichier(s). Savoir ouvrir un fichier excel et le sauver sous le format
OBLIGATOIRES
CSV. ; Faire le TP0 (téléchargeable sur Ametice)
PRE-REQUIS
Télécharger et Installer QGIS sur son ordinateur, regarder des tutoriels et essayer de les reproduire.
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS SIG - raster - vecteur - images multispectrales - numérisation - requête - base de données

HEURES
REPARTITION
4 heures CM ; 26 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100 % CC ©5LBE

4
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1 CRD 6
Intitulé UE (BE100) Démarche scientifique en écologie
Responsable 1 Eric Meineri Email 1 [email protected]

Responsable 2 Benoît Geslin Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Concevoir, gerer et animer un projet
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'UE vise, par un apprentissage pratique, à la construction et l'application d'une démarche scientifique complète
pour répondre à une problématique en écologie. Elle permettra aux étudiants de développer et de mobiliser un
ensemble de compétences pour 1) définir une problématique de recherche et des objectifs opérationels, 2)
concevoir des hypothèses scientifiques 3) concevoir et mettre en place un plan d'échantillonnage, 4) collecter les
OBJECTIFS
données sur le terrain, 5) analyser ces données et les interpréter, 6) comprendre le contexte socio-ecologique du
système étudié , 7) présenter des résultats sous la forme d'un article scientifique et 8) présenter à l'oral les
résultats de ces travaux. ; Dans son ensemble, cette UE prépare aux stages de M1 et M2 en introduisant toutes
les étapes nécessaires à la conduite d'une étude scientifique pertinente.
Choisir l'information et mobiliser la connaisance scientifique pour émetre de nouvelles hypothèses, rechercher
l'adéquation entre obejctifs et moyens en intégrant les difficultés propres au terrain, choisir et appliquer des
SAVOIR-FAIRE méthodes d'échantillonnage et d'analyse des données, interpréter de manière pécise des résultats et savoir les
synthétiser, confronter et discuter de ces résulats, rédiger un rapport ou article scientifique, présenter ces
résultats lors d'un oral.
Appréhension de la diversité des approches (descriptive, inférentielle, expérimentale, comparative) et des
CONNAISSANCES relations entre elles, modes d'inférences et diversité des analyses statistiques en écologie, connaissances sur la
biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes étudiés dans ce contexte.
Contenus - Programme détaillé
L'UE s'appuie sur des enseignements fondamentaux (épistémologie, démarche scientifique, approches
inductives et hypothético-déductives), une immersion sur le terrain pendant une semaine et des travaux dirigés
dédiées à l'analyse des données, l'interprétation, la rédaction scientifique et la présentation des résultats. Une
CONTENU
ouverture pluridisciplinaire Ecologie/Sciences Humaines sera développée dans le cadre d'une collaboration
effective avec le master Gestion Durable des Territoires de Montagne de Gap en lien avec des enseignants-
chercheurs en géographie et éthno-écologie.
Capacité à lire et synthétiser la littérature scientifique en français et anglais. ; Connaitre les principales
méthodes d'échantillonnage utilisées en écologie. ; Compétences en analyses statistiques (niveau basique) :
PRE-REQUIS
exploration graphique, statistiques descriptives, modèles linéaires (LM et ANOVA), analyses multivariées (ACP)
OBLIGATOIRES
et bases de l'utilisation de R (Enseignements de l'UE TC1.1). ; Connaitre les bases de la rédaction d'un rapport
scientifique
PRE-REQUIS Connaitre l'approche hypothético-déductive ; Système d'information géographique (niveau basique) : import et
RECOMMANDES croisement de données, conception de cartes (Enseignements de l'UE TC1.2).
Approche hypothetico-déductive, hypothèses, terrain, démarche scientifique, méthodes d'échantillonnage,
MOTS-CLEFS
analyse de données, rédaction scientifique.
HEURES
REPARTITION
6 heures CM ; 14 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 40
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 15% CC1 + 50% CC2 + 35 %ET ©5LBE

5
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1 CRD 3
Intitulé UE (BE101) Ecologie fonctionnelle et écosystèmes
Responsable 1 Mathieu Santonja Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de cette UE est de donner les connaissances sur le fonctionnement des écosystèmes terrestres et
aquatiques, et des processus écosystémiques associés. Les flux de matière et d'énergie à travers les réseaux
trophiques, le recyclage de la matière organique via l'étude du processus de décomposition des litières, les
OBJECTIFS
notions de traits et groupes fonctionnels et les relations « biodiversité - fonctionnement des écosystèmes »
seront ainsi abordés afin de fournir aux étudiants de bonnes bases écologiques pour appréhender le
fonctionnement des écosystèmes.
Mise en évidence des facteurs de contrôle du fonctionnement des écosystèmes ; mise en place de plans
SAVOIR-FAIRE
d'expériences et mesures d'indicateurs adaptés à l'étude des processus fonctionnels.
CONNAISSANCES Connaisances en écologie fonctionnelle de niveau intermédiaire

Contenus - Programme détaillé

- Ecosystème, processus écosystémiques et services écosystémiques ; - Traits fonctionnels et groupes
CONTENU fonctionnels ; - Flux de matière et d'énergie dans les écosystèmes terrestre et aquatique ; - Relations
biodiversité - fonctionnement des écosystèmes ; - Gestion des écosystèmes et stockage du carbone
PRE-REQUIS
Notions de bases en écologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS Niveau L3 ou équivalent dans le domaine des sciences naturelles, de la biologie générale, biologie des
RECOMMANDES organismes et des populations
Traits fonctionnels ; groupes fonctionnels ; Interactions plante-sol ; production ; décomposition ; services
MOTS-CLEFS
écosystémiques ; relation biodiversité-fonctionnement des écosystèmes ; gestion des écosystèmes.
HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 22 heures TD ; 4 heures TP PEDAGOGIE 4
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

6
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1 CRD 3
Intitulé UE (BE102) Ecosphère et environnement
Responsable 1 Raphael Gros Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de l'UE est de former les étudiants à la connaissance, à la compréhension et à l'analyse des facteurs
climatiques, édaphiques et hydriques qui conditionnant la biodiversité, son évolution et la dynamique des
écosystèmes continentaux méditerranéens et tempérés, en interaction avec les activités humaines. ; L'accent est
mis ici sur l'évolution des sols, les milieux humides continentaux et de leurs usages, les évolutions climatiques
planétaires qui déterminent certains gradients hydriques, thermiques, halins du milieu dont les variations dans
l'espace et dans les temps influencent la structure et la dynamique des écosystèmes et de leur biodiversité.
L'importance de l'historique des activités humaines est approfondie par l'exemple des forêts. ; L'enseignement
est dispensé sous la forme de CM, TD et d'une sortie de terrain. Les enseignements analyseront les facteurs et
OBJECTIFS
établiront les liens entre leur évolution et les processus écologiques. ; Les thèmes abordés seront : 1) La qualité
des sols et des évolutions naturelles et sous contraintes, 2) Les relations entre le climat et le sol, 3) Les causes et
conséquences de la temporalité et de la salinité dans la structuration et la dynamique écologique des zones
humides méditerranéennes et 4) Le rôle des activités humaines passées dans la dynamique forestière actuelle.
Les expansions forestières intègrent des héritages anthropiques différents en fonction des époques de l'histoire
et des biomes. Les jeunes forêts actuelles sont donc différentes de celles qui se sont installées dans le passé. Le
rôle des activités anthropiques passées sera mis en lumière par une approche pluridisciplinaire associant
archives biologiques et archives historiques.
Savoir estimer la productivité d'un sol via l'estimation de sa réserve en eau utile, de sa fertilité, son aération ;
Evaluer la qualité des sols et leur rareté fonctionnelle ; Croiser des données et des indicateurs d'anthropisaiton
SAVOIR-FAIRE
de disciplines issues des SVT et des SHS, appréhender des échelles corrélées et emboîtées d'espace et de temps
; Evaluer la qualité de l'eau via ses composants physico-chimiques et ses communautés faunistiques
Les connaissances abordées dans cette UE relève des Sciences du sol (Qualité du sol : droit, fonctions
écologiques et rareté fonctionnelle ; Trajectoires d'évolution des sols : pédogenèses et effet des changement
globaux ; notions et calculs tels que la Capacité d'Echange Cationique, les réserves utiles et facilement
CONNAISSANCES utilisables, les fonctions de transferts pédologiques, la temporalité de la balance hydrique locale des sols en
contexte de changement climatique), de la climatologie (évapo-transpiration), de l'écologie forestière et
historique (dynamiques forestières et héritage anthropique), et du fonctionnement des écosystèmes
aquatiques.
Contenus - Programme détaillé
; Cours et TD 1 (R Gros) : Le sol, un facteur écologique majeur ; 1-Qualité du sol ; Définitions, concept et droit, ;
Fonctions écologiques, indicateurs et indicandum, ; Outils d'évaluation de la qualité des sols ; Rareté
fonctionnelle ; 2-Evolution de la qualité des sols ; Trajectoires d'évolution des sols ; A long terme : pédogenèses
; A courts terme : changements climatiques, changement d'usage, conservation des sols ; ; Cours et TD 2 (A.
Saatkamp) : Cycle de l'eau, relations sol-eau-plante et une vision mécaniste ; Estimation de RU/RFU, fonction de
pedotransfert/van GEnuchten, dynamique du réservoir hydrique ; ; Cours 3 (B. Talon) : Evolution du climat et
des usages au cours du temps - Conséquences pour la Biodiversité ; Illustré par des études de cas ciblées
CONTENU
apportant le recul nécessaire sur la notion de référentiels dits « naturels », ce cours éclairera le rôle des
sciences du passé (paléoclimatologie, paléoécologie, bioarchéologie, écologie historique) et du croisement
inter-sciences (SVT/SHS) dans l'appréhension de l'impact des sociétés sur les écosystèmes forestiers depuis la
Préhistoire jusqu'au 19° siècle, et ce pour mieux comprendre leur dynamique actuelle. ; ; Cours4 (S. Fayolle) :
Facteurs ecologiques et perturbations des écosystèmes aquatiques ; Facteurs structurants les écosystèmes
aquatiques méditerranéens – Perturbations des milieux aquatiques - Gestion des milieux aquatiques
temporaires. ;

7
PRE-REQUIS Connaissances sur les convections et cellules macro-climatiques, la granulométrie/texture, les paramètres
OBLIGATOIRES physico-chimiques des écosystèmes aquatiques et des sols.
PRE-REQUIS
Connaissances générales des écosystèmes aquatiques et en sciences du sol
RECOMMANDES
Facteurs, fonctionnement et résilience des systèmes, socio-écosystèmes, impacts anthropiques, dispositifs
MOTS-CLEFS
d'observation, pédologie, relation plantes-sols, climat, trajectoires écologiques
HEURES
REPARTITION
19 heures CM ; 5 heures TD ; 6 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

8
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1 CRD 3
Intitulé UE (BE103) De l'évolution à la diversité du vivant
Responsable 1 Kaldonski Nicolas Email 1 [email protected]

Responsable 2 Saatkamp Arne Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC 1 : Maîtriser les concepts permettant d'identifier et de répondre à des problématiques en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'UE « Evolution et processus à l'origine de la diversité du vivant » a pour objectif de faire comprendre et de faire
OBJECTIFS maîtriser des notions et modèles conceptuels propres à l'évolution biologique tels que la théorie des jeux, la
fitness inclusive, l'évolution du sexe et de la reproduction et la théorie darwinienne.
SAVOIR-FAIRE Comprendre les processus micro- et macro-évolutifs à l'origine de la biodiversité.

CONNAISSANCES Sélection naturelle et adaptations, exemples de modèles en écologie évolutive.

Contenus - Programme détaillé

Amener les étudiants à réfléchir sur les différentes modalités évolutives produisant la diversité du vivant par
différentes approches : ; - les modèles en écologie (théorie des jeux, fitness inclusive,stratégie évolutivement
stable (ESS), dispersion de risque (bet-hedging) et l'évolution des traits d'histoire de vie) ; ; - évolution du sexe
et de la reproduction des organismes (origine et diversité du sexe et de la reproduction, déterminisme du sexe,
CONTENU biais de sex-ratio, gène égoïste) ; ; - évolution des systèmes de reproduction chez les plantes (avantages et
désavantages de la reproduction sexuée, allogamie/autogamie/geitonogamie, dioecie/hermaphrodisme,
herchogamie/dichogamie, traits floraux, autoincompatibilité/autocompatibilitédans la trajectoire de Barrett) ; -
phénomènes d'adaptation par sélection darwinienne : mutation de novo, standing variation ou introgression
adaptative ? Recherche des marques de sélection dans les génomes.
PRE-REQUIS Connaissances en biologie animale et végétale, en écologie générale, en génétique mendélienne, en génétique
OBLIGATOIRES des populations, en évolution.
PRE-REQUIS Maîtrise de la diversité des échelles spatio-temporelles en évolution. Génétique quantitative. Concepts en
RECOMMANDES biologie évolutive.
Stratégie évolutivement stable ; trait d'histoire de vie ; gène égoïste ; évolution des reproductions sexuée et
MOTS-CLEFS
asexuée ; sélection ; héritabilité ; Génome et adaptation.
HEURES
REPARTITION
17 heures CM ; 13 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100 % CC ©5LBE

9
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1 CRD 3
Intitulé UE (BE104) Des populations aux communautés
Responsable 1 Alex Baumel Email 1 [email protected]

Responsable 2 Christophe Lejeusne Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 « Connaître »
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de l'enseignement est de fournir les connaissances théoriques et méthodologiques formant le socle
scientifique des études de biodiversité en établissant un lien entre les phénomènes à l'ouvre à l'échelle des
OBJECTIFS
populations (niches écologiques, histoire démographiques) et à l'origine des assemblages d'organismes à
l'échelle locale et régionale
Réaliser une étude des relations espèces/environnement et en déduire une estimation de l'amplitude des
SAVOIR-FAIRE niches écologiques, évaluer la diversité et la différenciation, comprendre et mener une analyse
phylogéographique.
Théories de la niche écologique, des communautés et de la biogéographie. Phylogéographie descriptive. Indices
CONNAISSANCES
de diversité.
Contenus - Programme détaillé
L'enseignement se structurera en deux grands chapitres. Le premier portera sur les niches écologiques, la
différenciation des assemblages et le lien conceptuel entre écologie des populations et écologie des
communautés. Le deuxième chapitre portera sur les causes historiques à l'origine des assemblages et
développera l'approche par phylogéographie descriptive et comparative. Les études de cas développés durant
CONTENU
l'enseignement renforceront l'apprentissage des analyses de diversité de niveau alpha et beta. L'analyse des
données se fera essentiellement dans R et s'accompagnera de lecture de chapitres et d'articles choisis par les
enseignants. Durant la réalisation des travaux les étudiants seront formés à l'identification, l'élaboration et la
rédaction des résultats, incluant les figures et tableaux.
PRE-REQUIS
Écologie et génétique des populations, biogéographie, analyse de données.
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Initiation à R, Analyses multivariées, connaissances naturalistes
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Diversité, Niche écologique, Phylogéographie, Communautés, Analyse de données, R

HEURES
REPARTITION
12 heures CM ; 18 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

10
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1 CRD 6
Intitulé UE (BE105) Méthodes en écologie
Responsable 1 Sophie GACHET Email 1 [email protected]

Responsable 2 Evelyne FRANQUET Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC « Déterminer, développer et appliquer des méthodes »
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Être capable d'établir et de suivre un protocole d'échantillonnage et de quantification des populations et
OBJECTIFS
communautés animales, végétales et microbiennes terrestres et aquatiques, et d'en interpréter les résultats.
Mettre en ouvre les différentes techniques actuelles d'échantillonnage des êtres vivants, d'analyses des
SAVOIR-FAIRE
propriétés physico-chimiques et biologiques des habitats. Rédiger un compte-rendu scientifique
Connaître les différentes méthodes et techniques d'échantillonnage et de quantification des populations et
CONNAISSANCES communautés animales, végétales et microbiennes terrestres et aquatiques
et décrire leur biotope.
Contenus - Programme détaillé
Introduction : [CM] Formuler une problématique de manière étayée et précise ; identifier un ensemble
d'hypothèses ; conduire une expérience en conditions contrôlées ; concevoir une stratégie et un plan
d'échantillonnage, délimiter une aire d'échantillonnage. ; Faune : [CM] Réaliser un inventaire des arthropodes
terrestres ; mesurer la taille d'une population animale (CMR, point d'écoute.) [TD] Mettre en ouvre les
méthodes nécessaires pour réaliser un échantillonnage d'invertébrés aquatiques dans le contexte d'une étude
d'impact et réfléchir sur la notion de facteurs confondants (cas de la démoustication). ; Flore : [CM] Réaliser,
après un panorama illustré de différentes méthodes, un inventaire floristique ; estimer le recouvrement
végétal /abondance relative des espèces végétales dans des communautés végétales, pour déterminer (i) in
natura, la taille des populations, les modalités de reproduction, de flux de pollen (taux de visites des fleurs), de
dispersion des fruits/graines et (ii) ex situ (en fonction de certains facteurs contrôlés), la germination,
croissance et reproduction des plantes, les relations de voisinage ; tout ceci dans un contexte de dynamique et
structure des populations végétales. Décrire différentes méthodes pour analyser la variabilité de traits
morphométriques et fonctionnels intra- et inter-spécifiques. Présenter plusieurs cas d'étude avec leurs
résultats / interprétation écologique pour les communautés et les populations végétales. [TD] Connaître les
principales méthodes d'estimation de la biomasse des plantes (méthodes destructives et non destructives pour
diverses formations végétales : herbacée, chaméphytique, arborée). Apprendre à traiter des données
dendrométriques sur des écosystèmes forestiers pour évaluer des biomasses ligneuses et foliaires à l'échelle
des parcelles et à l'échelle des peuplements, en intégrant des données de spatialisation du couvert forestier.
CONTENU
Être capable de construire des modèles allométriques et d'en discuter la pertinence. Apprendre à traiter des
données de suivi de biomasses pour en déduire des valeurs de production et de productivité de différents
stades de la succession du chêne vert. Comprendre la différence entre production et productivité et les
problèmes d'interprétation des données qui peuvent résulter de la confusion entre ces notions. Être capable de
faire une analyse critique de différents modèles et des limites de leur domaine de validité pour choisir un
modèle adapté au jeu de données de terrain. [TP-sorties] Appliquer, sur le terrain, des méthodes de calcul
d'une aire minimale d'échantillonnage, de géoréférencement d'une parcelle d'étude, de quantification des
paramètres géographiques (pente, distance à la mer, altitude, orientation...) et des paramètres climatiques
d'un habitat (température air et sol, humidité air et sol, précipitation, vent.), d'exécution de relevés floristiques,
de caractérisation de la croissance des plantes, de description de la répartition locale des plantes. Apprendre à
remplir une fiche de terrain, organiser les données pour un traitement statistique et rédiger un rapport de
terrain. Mettre en oeuvre du matériel de terrain permettant d'estimer la biomasse des peuplements (Relascope
de Bitterlich pour la mesure de la surface terrière du peuplement) et s'initier au carottage à la tarière de
Pressler pour apprendre à prélever des échantillons permettant des analyses dendroécologiques
(détermination de l'âge, datation d'évènements...) ; Sol : [CM] Décrire un profil de sol et identifier les
différentes formes d'humus ; quantifier les propriétés physico-chimiques (pH, teneurs en matière organique, C
et nutriments, texture, structure, densité apparente et réelle...) et biologiques (micro-organismes, microfaune,
mésofaune, macrofaune) des sols ; estimer la dynamique et la structure d'une population/communauté
11
 animale édaphique (macro et mésofaune). [TD] Définir un projet d'étude précis en réponse à un appel d'offre :
i) réalisation du design expérimental (stratégie et plan d'échantillonnage) ; ii) proposition de méthodes
d'analyses à utiliser ; iii) budgétisation du projet d'étude. [TP] Utiliser, dans une approche sur le terrain, des
méthodes de prélèvement de sols et les principales analyses physico-chimiques (pH, conductivité, densité,
porosité, C et N totaux...), microbiologiques (dosages enzymatiques) et de la méso et macrofaune de différents
types de sol (agrosystèmes vs. forêts) ; réaliser des analyses comparatives et leurs interprétations.
PRE-REQUIS
Bases d'écologie et de pédologie, biologie des populations
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Échantillonnage, protocole, quantification

HEURES
REPARTITION
16 heures CM ; 26 heures TD ; 12 heures TP PEDAGOGIE 6
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100% CC ©5LBE

12
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1 CRD 6
Intitulé UE (BE206) Ecologie chimique
Responsable 1 Catherine Fernandez Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 Connaître
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de ce cours est de donner les connaissances sur l'importance de la communication chimique dans les
OBJECTIFS écosystèmes qu'elle soit inter organismes ou en réponse aux conditions environnementales et son implication
dans le fonctionnement des écosystèmes.
Techniques d'analyses chimiques - ; Traiter des donner afin de mettre en évidence des interactions biotiques
SAVOIR-FAIRE
chimiques.
Présentation de l'écologie chimique. Voies de biosynthèse des molécules impliquées. Plant Specialized
CONNAISSANCES Metabolites (PSM) comme défenses chimiques. Interactions plante / plante. Interactions plante / insecte.
Ecologie chimique marine. Phytoremédiation. Odeurs et sociétés.
Contenus - Programme détaillé
Quatre grandes thématiques seront traitées : chaque thématique sera abordée grâce à la mise à disposition de
cours de de bibliographie ; les étudiants construiront un projet de groupe traitant d'un des thèmes proposés. ;
1- La diversité chimique : quelles sont les substances impliquées : principales voies métaboliques - variations de
production en fonction des conditions environnementales - techniques d'analyse chimiques des composés ; 2-
la médiation chimique : les composés chimiques comme défense ou attracteur odeurs et sociétés (insectes
CONTENU
sociaux) ; le parfum du sexe (pollinisation, recherche de partenaires) ; la médiation chimique en
cascade.(relations tri-trophiques) ; la communication chez les microorganismes et/ou chez les plantes ; 3- Rôle
des composés dans le fonctionnement des écosystèmes : Les armes chimiques des organismes immobiles :
l'allélopathie, la défense contre l'herbivorie et les pathogènes ; 4- Le métabolisme source d'inspiration :
Ecologie chimique et agriculture ; Phytoremédiation
PRE-REQUIS
Notions de bases en écologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS Niveau L3 ou équivalent dans le domaine des sciences naturelles, de la biologie générale, biologie des
RECOMMANDES organismes et des populations

MOTS-CLEFS Médiation chimique, défenses, fonctionnement des écosystèmes, écotechnologies

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 20 heures TD ; 6 heures TP PEDAGOGIE 14
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

13
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1TE CRD 3
Intitulé UE (BE101TE) Ecologie fonctionnelle et écosystèmes
Responsable 1 Mathieu Santonja Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC3 - Concevoir, gérer et animer de façon collaborative un projet scientifique et écologie et construire son projet professionnel
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de cette UE est de donner les connaissances sur le fonctionnement des écosystèmes terrestres et
aquatiques, et des processus écosystémiques associés. Les flux de matière et d'énergie à travers les réseaux
trophiques, le recyclage de la matière organique via l'étude du processus de décomposition des litières, les
OBJECTIFS
notions de traits et groupes fonctionnels et les relations « biodiversité - fonctionnement des écosystèmes »
seront ainsi abordés afin de fournir aux étudiants de bonnes bases écologiques pour appréhender le
fonctionnement des écosystèmes.
Mise en évidence des facteurs de contrôle du fonctionnement des écosystèmes ; mise en place de plans
SAVOIR-FAIRE d'expériences et mesures d'indicateurs adaptés à l'étude des processus fonctionnels ; mener un projet qui vise
à étudier l'impact d'une perturbation sur le fonctionnement d'un écosystème terrestre ou aquatique.
CONNAISSANCES Connaissances en écologie fonctionnelle de niveau intermédiaire

Contenus - Programme détaillé

- Écosystème, processus écosystémiques et services écosystémiques ; - Traits fonctionnels et groupes
fonctionnels ; - Flux de matière et d'énergie dans les écosystèmes terrestre et aquatique ; - Relations «
CONTENU biodiversité - fonctionnement des écosystèmes » ; - Gestion des écosystèmes et stockage du carbone ; ; Après
avoir abordés ces différentes notions, les étudiants construiront un projet de groupe visant à étudier l'impact
d'une perturbation sur le fonctionnement d'un écosystème terrestre ou aquatique.
PRE-REQUIS
Notions de bases en écologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS Niveau L3 ou équivalent dans le domaine des sciences naturelles, de la biologie générale, biologie des
RECOMMANDES organismes et des populations
Traits fonctionnels ; groupes fonctionnels ; Interactions plante-sol ; production ; décomposition ; services
MOTS-CLEFS
écosystémiques ; relation biodiversité-fonctionnement des écosystèmes ; gestion des écosystèmes.
HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 15 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 15
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 40 % CC + 60 % ET ©5LBE

14
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1TE CRD 3
Intitulé UE (BE102TE) Ecosphère et environnement
Responsable 1 Raphael Gros Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de l'UE est de former les étudiants à la connaissance, à la compréhension et à l'analyse des facteurs
climatiques, édaphiques et hydriques qui conditionnant la biodiversité, son évolution et la dynamique des
écosystèmes continentaux méditerranéens et tempérés, en interaction avec les activités humaines. ; L'accent est
mis ici sur l'évolution des sols, les milieux humides continentaux et de leurs usages, les évolutions climatiques
planétaires qui déterminent certains gradients hydriques, thermiques, halins du milieu dont les variations dans
l'espace et dans les temps influencent la structure et la dynamique des écosystèmes et de leur biodiversité.
L'importance de l'historique des activités humaines est approfondie par l'exemple des forêts. ; L'enseignement
est dispensé sous la forme de CM, TD et d'une sortie de terrain. Les enseignements analyseront les facteurs et
OBJECTIFS
établiront les liens entre leur évolution et les processus écologiques. ; Les thèmes abordés seront : 1) La qualité
des sols et des évolutions naturelles et sous contraintes, 2) Les relations entre le climat et le sol, 3) Les causes et
conséquences de la temporalité et de la salinité dans la structuration et la dynamique écologique des zones
humides méditerranéennes et 4) Le rôle des activités humaines passées dans la dynamique forestière actuelle.
Les expansions forestières intègrent des héritages anthropiques différents en fonction des époques de l'histoire
et des biomes. Les jeunes forêts actuelles sont donc différentes de celles qui se sont installées dans le passé. Le
rôle des activités anthropiques passées sera mis en lumière par une approche pluridisciplinaire associant
archives biologiques et archives historiques.
Savoir estimer la productivité d'un sol via l'estimation de sa réserve en eau utile, de sa fertilité, son aération ;
Evaluer la qualité des sols et leur rareté fonctionnelle ; Croiser des données et des indicateurs d'anthropisaiton
SAVOIR-FAIRE
de disciplines issues des SVT et des SHS, appréhender des échelles corrélées et emboîtées d'espace et de temps
; Evaluer la qualité de l'eau via ses composants physico-chimiques et ses communautés faunistiques
Les connaissances abordées dans cette UE relève des Sciences du sol (Qualité du sol : droit, fonctions
écologiques et rareté fonctionnelle ; Trajectoires d'évolution des sols : pédogenèses et effet des changement
globaux ; notions et calculs tels que la Capacité d'Echange Cationique, les réserves utiles et facilement
CONNAISSANCES utilisables, les fonctions de transferts pédologiques, la temporalité de la balance hydrique locale des sols en
contexte de changement climatique), de la climatologie (évapo-transpiration), de l'écologie forestière et
historique (dynamiques forestières et héritage anthropique), et du fonctionnement des écosystèmes
aquatiques.
Contenus - Programme détaillé
; Cours et TD 1 (R Gros) : Le sol, un facteur écologique majeur ; 1-Qualité du sol ; Définitions, concept et droit, ;
Fonctions écologiques, indicateurs et indicandum, ; Outils d'évaluation de la qualité des sols ; Rareté
fonctionnelle ; 2-Evolution de la qualité des sols ; Trajectoires d'évolution des sols ; A long terme : pédogenèses
; A courts terme : changements climatiques, changement d'usage, conservation des sols ; ; Cours et TD 2 (A.
Saatkamp) : Cycle de l'eau, relations sol-eau-plante et une vision mécaniste ; Estimation de RU/RFU, fonction de
pedotransfert/van GEnuchten, dynamique du réservoir hydrique ; ; Cours 3 (B. Talon) : Evolution du climat et
CONTENU des usages au cours du temps - Conséquences pour la Biodiversité ; Illustré par des études de cas ciblées
apportant le recul nécessaire sur la notion de référentiels dits « naturels », ce cours éclairera le rôle des
sciences du passé (paléoclimatologie, paléoécologie, bioarchéologie, écologie historique) et du croisement
inter-sciences (SVT/SHS) dans l'appréhension de l'impact des sociétés sur les écosystèmes forestiers depuis la
Préhistoire jusqu'au 19° siècle, et ce pour mieux comprendre leur dynamique actuelle. ; ; Cours4 (S. Fayolle) :
Facteurs ecologiques et perturbations des e;Connaissances sur les convections et cellules macro-climatiques, la
granulométrie/texture, les paramètres physico-chimiques des écosystèmes aquatiques et des sols."
PRE-REQUIS Connaissances sur les convections et cellules macro-climatiques, la granulométrie/texture, les paramètres
OBLIGATOIRES physico-chimiques des écosystèmes aquatiques et des sols.
15
PRE-REQUIS
Connaissances générales des écosystèmes aquatiques et en sciences du sol
RECOMMANDES
Facteurs, fonctionnement et résilience des systèmes, socio-écosystèmes, impacts anthropiques, dispositifs
MOTS-CLEFS
d'observation, pédologie, relation plantes-sols, climat, trajectoires écologiques
HEURES
REPARTITION
19 heures CM ; 5 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 6
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

16
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1TE CRD 3
Intitulé UE (BE103TE) De l'évolution à la diversité du vivant
Responsable 1 Kaldonski Nicolas Email 1 [email protected]

Responsable 2 Saatkamp Arne Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'UE « Evolution et processus à l'origine de la diversité du vivant » a pour objectif de faire comprendre et de faire
OBJECTIFS maîtriser des notions et modèles conceptuels propres à l'évolution biologique tels que la théorie des jeux, la
fitness inclusive, l'évolution du sexe et de la reproduction et la théorie darwinienne.
SAVOIR-FAIRE Comprendre les processus micro- et macro-évolutifs à l'origine de la biodiversité.

CONNAISSANCES Sélection naturelle et adaptations, exemples de modèles en écologie évolutive.

Contenus - Programme détaillé

Amener les étudiants à réfléchir sur les différentes modalités évolutives produisant la diversité du vivant par
différentes approches : ; - les modèles en écologie (théorie des jeux, fitness inclusive,stratégie évolutivement
stable (ESS), dispersion de risque (bet-hedging) et l'évolution des traits d'histoire de vie) ; ; - évolution du sexe
et de la reproduction des organismes (origine et diversité du sexe et de la reproduction, déterminisme du sexe,
CONTENU biais de sex-ratio, gène égoïste) ; ; - évolution des systèmes de reproduction chez les plantes (avantages et
désavantages de la reproduction sexuée, allogamie/autogamie/geitonogamie, dioecie/hermaphrodisme,
herchogamie/dichogamie, traits floraux, autoincompatibilité/autocompatibilitédans la trajectoire de Barrett) ; -
phénomènes d'adaptation par sélection darwinienne : mutation de novo, standing variation ou introgression
adaptative ? Recherche des marques de sélection dans les génomes.
PRE-REQUIS Connaissances en biologie animale et végétale, en écologie générale, en génétique mendélienne, en génétique
OBLIGATOIRES des populations, en évolution.
PRE-REQUIS Maîtrise de la diversité des échelles spatio-temporelles en évolution. Génétique quantitative. Concepts en
RECOMMANDES biologie évolutive.
Stratégie évolutivement stable ; trait d'histoire de vie ; gène égoïste ; évolution des reproductions sexuée et
MOTS-CLEFS
asexuée ; sélection ; héritabilité ; Génome et adaptation.
HEURES
REPARTITION
17 heures CM ; 13 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30% CC + 70% ET ©5LBE

17
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1TE CRD 3
Intitulé UE (BE104TE) Des populations aux communautés
Responsable 1 Alex Baumel Email 1 [email protected]

Responsable 2 Christophe Lejeusne Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de l'enseignement est de fournir les connaissances théoriques et méthodologiques formant le socle
scientifique des études de biodiversité en établissant un lien entre les phénomènes à l'ouvre à l'échelle des
OBJECTIFS
populations (niches écologiques, histoire démographique) et à l'origine des assemblages d'organismes à l'échelle
locale et régionale
Réaliser une étude des relations espèces/environnement et en déduire une estimation de l'amplitude des
SAVOIR-FAIRE niches écologiques, évaluer la diversité et la différenciation, comprendre et mener une analyse
phylogéographique.
Théories de la niche écologique, des communautés et de la biogéographie. Phylogéographie descriptive. Indices
CONNAISSANCES
de diversité.
Contenus - Programme détaillé
L'enseignement se structurera en deux grand chapitres. Le premier portera sur les niches écologiques, la
différenciation des assemblages et le lien conceptuel entre écologie des populations et écologie des
communautés. Le deuxième chapitre portera sur les causes historiques à l'origine des assemblages et
développera l'approche par phylogéographie descriptive et comparative. Les études de cas développés durant
CONTENU
l'enseignement renforceront l'apprentissage des analyses de diversité de niveau alpha et beta. L'analyse des
données se fera essentiellement dans R et s'accompagnera de lecture de chapitres et d'articles choisis par les
enseignants. Durant la réalisation des travaux les étudiants seront formés à l'identification, l'élaboration et la
rédaction des résultats, incluant les figures et tableaux.
PRE-REQUIS
Écologie et génétique des populations, biogéographie, analyse de données.
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Initiation à R, Analyses multivariées, connaissances naturalistes
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Diversité, Niche écologique, Phylogéographie, Communautés, Analyse de données, R

HEURES
REPARTITION
20 heures CM ; 10 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

18
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1TE CRD 6
Intitulé UE (BE105TE) Méthodes en écologie
Responsable 1 Christine Ballini Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC2 - Déterminer, développer et appliquer des méthodes et des outils dédiés à l'analyse des objets biologiques et écologiques
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Être capable d'établir et de suivre un protocole d'échantillonnage et de quantification des populations et
OBJECTIFS
communautés végétales, animales, et microbiennes, terrestres et aquatiques, et d'en interpréter les résultats.
Mettre en oeuvre les différentes techniques actuelles d'échantillonnage des êtres vivants, d'analyses des ;
SAVOIR-FAIRE
propriétés physicochimiques et biologiques des habitats. Rédiger un compte-rendu scientifique.
Connaître les différentes méthodes et techniques d'échantillonnage et de quantification des populations et ;
CONNAISSANCES
communautés animales, végétales et microbiennes terrestres et aquatiques et décrire leur biotope.
Contenus - Programme détaillé
Introduction générale : Formuler une problématique et une question scientifique de manière étayée et précise
/Identifier les variables permettant de répondre à une question scientifique : variables indépendantes et
dépendantes /Identifier un ensemble d'hypothèses /Conduire une expérience in situ ou en conditions
contrôlées / Concevoir une stratégie et un plan d'échantillonnage / Déterminer une aire d'échantillonnage /
Utiliser des indices de diversité courants. ; Etude de la flore-végétation : Réaliser un inventaire floristique, un
relevé de végétation / Estimer le recouvrement végétal, l'abondance relative, la fréquence des espèces /
Estimer la biomasse d'un peuplement, d'une communauté ou population végétale /Estimer la dynamique et la
CONTENU
structure d'une population/communauté végétale (variabilités morphométrique et biométrique intra et
interspécifiques ; traits fonctionnels) / Evaluer la diversité végétale, la répartition spatiale des individus, estimer
leur densité. ; Etude de la faune : Mettre en ouvre les méthodes nécessaires pour réaliser un inventaire
biologique aquatique /Réaliser un inventaire des arthropodes terrestres/Mesurer la taille d'une population
animale (CMR, point d'écoute.) ; Etude du sol : Décrire un profil de sol, et identifier les différents types
d'humus/ Quantifier les propriétés physico-chimiques et biologiques du sol / Caractériser une activité
microbienne / Estimer la dynamique et la structure d'une communauté animale édaphique.
Bases en écologie générale, écologie des communautés et des populations végétales et animales, en
PRE-REQUIS
microbiologie ; connaissances générales en sciences du sol-pédologie ; connaissances en statistiques
OBLIGATOIRES
(statistique descriptive, tests classiques de comparaison de deux échantillons, Khi2, régressions)
PRE-REQUIS Niveau L3 ou équivalent dans le domaine des sciences naturelles, de la biologie générale, biologie des
RECOMMANDES organismes et des populations

MOTS-CLEFS Plan d'échantillonnage, communautés, populations, indices de diversité, inventaires biologiques,

HEURES
REPARTITION
16 heures CM ; 26 heures TD ; 12 heures TP PEDAGOGIE 6
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

19
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S1TE CRD 6
Intitulé UE (BE106TE) Ecologie chimique
Responsable 1 Anne Bousquet-Mélou Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC3 - Concevoir, gérer et animer de façon collaborative un projet scientifique et écologie et construire son projet professionnel
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de ce cours est de donner les connaissances sur l'importance de la communication chimique dans les
OBJECTIFS écosystèmes qu'elle soit inter organismes ou en réponse aux conditions environnementales et son implication
dans le fonctionnement des écosystèmes.
SAVOIR-FAIRE Mener un projet qui vise à étudier des interactions biotiques chimiques.
Présentation de l'écologie chimique. Voies de biosynthèse des molécules impliquées. Plant Secondary
Metabolites (PSM) comme défenses chimiques. Interactions plante / plante. Interactions plante / arthropodes.
CONNAISSANCES
Interactions proie /prédateur. Interactions ressource / consommateur. Ecologie chimique marine.
Phytoremédiation. Odeurs et sociétés.
Contenus - Programme détaillé
Quatre grandes thématiques seront traitées : chaque thématique sera abordée grâce à la mise à disposition de
cours de de bibliographie ; les étudiants construiront un projet de groupe traitant d'un des thèmes proposés. ;
1- La diversité chimique : Quelles sont les substances impliquées : principales voies métaboliques - variations de
production en fonction des conditions environnementales - chimiotaxonomie - - techniques d'analyse
chimiques des composés ; 2- la médiation chimique : Odeurs et sociétés (insectes sociaux) ; le parfum du sexe
CONTENU
(pollinisation, recherche de partenaires) ; la détection d'une proie, d'un prédateur ; la médiation chimique en
cascade (relations tri-trophiques) ; la communication chez les microorganismes et/ou chez les plantes ; 3- Rôle
des composés dans le fonctionnement des écosystèmes : Les armes chimiques des organismes immobiles :
l'allélopathie, la défense contre l'herbivorie et les pathogènes ; 4- Le métabolisme source d'inspiration :
Ecologie chimique et agriculture ; Phytoremédiation et ionomique
PRE-REQUIS
Notions de bases en écologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS Niveau L3 ou équivalent dans le domaine des sciences naturelles, de la biologie générale, biologie des
RECOMMANDES organismes et des populations

MOTS-CLEFS Médiation chimique, défenses, fonctionnement des écosystèmes, écotechnologies

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 20 heures TD ; 6 heures TP PEDAGOGIE 34
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

20
Première année, semestre 2

21
Mention Inter-mentions SEM M1S2 CRD 6
Intitulé UE (TC3R) Stage M1
Responsable 1 Porteurs de mention Email 1

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Développer un projet professionnel en Géosciences (STPE)
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Apprendre à conduire un projet scientifique de façon autonome sous encadrement d'un scientifique : rédiger et
OBJECTIFS évaluer la faisabilité d'un projet ; rédiger une esquisse de projet ; conduire la recherche, analyser et synthétiser
les résultats sous forme de rapport qui suit les conventions d'un article scientifique standard.
Savoir organiser son temps et évaluer la faisabilité d'un projet de recherche en écologie ; suivre les étapes d'un
SAVOIR-FAIRE
projet de façon autonome ; savoir rédiger des textes scientifiques
Connaissances sur la démarche scientifique ; savoir citer des travaux scientifiques ; savoir écrire des
CONNAISSANCES introduction, méthodes, résultats et discussions ; connaissances en statistiques pour analyser des données en
écologie ; connaissances en informatique
Contenus - Programme détaillé
1) Recherche de sujet de stage en écologie ; 2) Réunion de cadrage pour le suivi du projet 3) Un TD sur les
modalités de l'écriture de rapport (structure du rapport, consignes de rédaction, exemples d'écriture) 4) rendu
CONTENU d'un pré-projet à la fin du premier mois du stage 5) rendu d'un commentaire sur le pré-projet 6) rendu du
rapport final 7) soutenance et retour sur le rapport réalisé ; il y a 5 h de TD en présentiel, les 27h restants x 2
groupes sont pour les encadrants à la hauteur d'une heure par étudiant encadré.
PRE-REQUIS Connaissances en statistiques pour analyser des données en écologie ; connaissances en informatique
OBLIGATOIRES (word/R) connaissances en écologie.
PRE-REQUIS
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Stage M1 ; Projet scientifique ; Entreprise ; Recherche ; Laboratoire

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 0 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

22
Mention Tronc commun SEM M1S2 CRD 3
Intitulé UE (TC4S2) Anglais - conversation
Responsable 1 Michel Marton Email 1 [email protected]

Responsable 2 Alexis Bachelart Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Déterminer, développer et appliquer des méthodes (BEE)
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Comprendre une communication orale et un document écrit en anglais de spécialité ; s'exprimer à l'oral, en
OBJECTIFS
continu et en interaction, en utilisant des structures complexes dans un anglais de spécialité.
SAVOIR-FAIRE Savoir s'exprimer de façon claire et intelligible afin d'optimiser la communication à l'oral.
Connaissances langagières liées au fonctionnement de la langue ainsi qu'au contenu lexical se rapportant à la
CONNAISSANCES
spécialité.
Contenus - Programme détaillé
Les cours se déroulent en anglais et reposent sur une interaction entre étudiants guidée par l'enseignant. Les
thèmes étudiés sont abordés par l'intermédiaire de documents écrits, audio ou vidéo variés, récents et
CONTENU authentiques. La mise en activité des étudiants vise à renforcer leurs compétences par la pratique. Des
supports numériques de soutien et d'approfondissement sont mis à disposition des étudiants pour leur auto-
apprentissage.
PRE-REQUIS
Niveau d'anglais confirmé par un test d'autoévaluation sur plateforme GoFluent en fin de semestre impair
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Aisance à l'oral en situation de dialogue ou de monologue.
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Hazard, risk, catastrophes, experts, management, town planning, old age, gender equality...

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 12 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50% CC + 50% ET ©5LBE

23
Mention Tronc commun SEM M1S2 CRD 3
Intitulé UE (TC4S2) Anglais - cours classique
Responsable 1 Alexis Bachelart Email 1 [email protected]

Responsable 2 Michel Marton Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Déterminer, développer et appliquer des méthodes (BEE)
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Comprendre une communication orale et un document écrit en anglais de spécialité ; produire un message écrit
OBJECTIFS argumenté en utilisant des structures complexes dans un anglais de spécialité ; s'exprimer à l'oral, en continu et
en interaction, en utilisant des structures complexes dans un anglais de spécialité.
Apprendre à trouver ou reconnaître l'information pertinente ; savoir préparer et assurer une communication
SAVOIR-FAIRE efficace ; savoir s'exprimer de façon claire et intelligible afin d'optimiser la communication, qu'elle soit orale ou
écrite.
Connaissances langagières liées au fonctionnement de la langue ainsi qu'au contenu lexical se rapportant à la
CONNAISSANCES
spécialité.
Contenus - Programme détaillé
Les cours se déroulent en anglais et reposent sur une interaction entre étudiants guidée par l'enseignant. Les
thèmes étudiés sont abordés par l'intermédiaire de documents écrits, audio ou vidéo variés, récents et
CONTENU authentiques. La mise en activité des étudiants vise à renforcer leurs compétences par la pratique. Des
supports numériques de soutien et d'approfondissement sont mis à disposition des étudiants pour leur auto-
apprentissage.
PRE-REQUIS Être capable de comprendre le sens explicite et le sens implicite d'articles de presse ainsi que de documents
OBLIGATOIRES audio ou vidéo liés à la spécialité.
PRE-REQUIS
Niveau d'anglais B1 du CECRL
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Catastrophes, old age, gender equality...

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 18 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

24
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 3
Intitulé UE (BE201) Le sol vivant
Responsable 1 Raphael Gros Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de l'UE est de former les étudiants à la connaissance, à la compréhession et à l'étude de la biodiversité
et de l'écologie des sols. Ces connaissances sont indispensables pour aborder le fonctionnement global des
écosystèmes et en particulier les relations plantes - sol. Le sol supporte de nombreuses fonctions écologiques
assurées par une multitude d'organismes, dont certaines sont à la base services écosystémique essentiels tels
que la régulation du climat et la production végétale. Les organismes du sol, leur diversité, leur abondance et
leur activité, sont contrôlés par différents facteurs abiotiques (température, disponibilité en eau.) et biotiques
(prédation) qu'il est nécessaire d'évaluer pour en mesurer les incidences sur le fonctionnement des écosystèmes
terrestres. Nous apporterons dans cette UE des réponses à des questions telles que : quels sont les principaux
OBJECTIFS
mécanismes et processus impliqués dans les cycles de la matière ? Quels organismes interviennent ? Quelles
sont les interactions biotiques dans les sols ? Comment peut-on les prélever, les étudier, les dénombrer ? Les
théories d'écologie générale s'appliquent-elles à l'écologie du sol ? quels sont les ingénieurs de l'écosystème
dans les sols ? Comment peut-on utiliser ces connaissances pour répondre à des enjeux de conservation des sols
et des écosystèmes ? Quels peuvent être les effets du réchauffement climatique, de l'artificialisation ou des
pollutions sur la biodiversité et les fonctions des sols ? ; Cette UE permettra aux étudiants de compléter leur
formation en écologie générale par la compréhension et la mise en ouvre d'outils adaptés à l'étude du sol,
compartiment central dans le fonctionnement des écosystèmes terrestres.
Construire des plans d'expérience et d'échantillonnage pour étudier les changements de la biodiversité du sol à
différentes perturbations et stress des changement globaux (changement climatique, changement d'usage,
SAVOIR-FAIRE
pratiques forestières, artificialisation.) ; Prélever, dénombrer et identifier les principaux ordres et sous ordres
de la faune du sol. ; Construire une analyse des réponses de la biodiversité du sol aux changements globaux ;
Connaître : ; Les enjeux de la conservation des sols et de leur biodiversité ; Les organismes du sol et leur
biologie ; Les modes de classification des organismes du sol ; Les répartitions spatiales et temporelles des
CONNAISSANCES
organismes du sol, et les facteurs de répartition ; Les facteurs déterminants les réseaux d'interactions
trophiques dans un sol
Contenus - Programme détaillé
Enjeux de la conservation des sols et de leur biodiversité (Artificialisation, érosion hydrique, perte de C,
pollution, érosion de la biodiversité) ; Biodiversité des sols (classifications, facteurs de diversification, facteurs
CONTENU de distribution, fonctions écologiques, ingénieurs du sol, interactions plantes-sols.) ; Les facteurs de contrôles
biotique et abiotiques du réseaux trophique du sol ; Impacts des changement globaux sur le réseau trophique
du sol et conséquences pour les services écosystémiques associés
Connaissances générales sur les sols (propriétés physiques, chimiques et biologiques), leur répartition et leur
PRE-REQUIS
évolution. ; Connaissance de la classification taxonomique de la faune ; Analyse de données et calculs d'indices
OBLIGATOIRES
de diversité
PRE-REQUIS
Connaissances approfondies en écologie fonctionnelle et en sciences du sol.
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Biodiversité du sol, fonctionnement, écosystèmes, végétation, réseaux trophiques, interactions

HEURES
REPARTITION
20 heures CM ; 6 heures TD ; 4 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

25
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 3
Intitulé UE (BE201TE) Le sol vivant
Responsable 1 Christine Ballini Email 1 christine [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de l'UE est de former les étudiants à la connaissance, à la compréhession et à l'étude de la biodiversité
et de l'écologie des sols. Ces connaissances sont indispensables pour aborder le fonctionnement global des
écosystèmes et en particulier les relations plantes - sol. Le sol supporte de nombreuses fonctions écologiques
assurées par une multitude d'organismes, dont certaines sont à la base de services écosystémiques essentiels
tels que la régulation du climat et la production végétale. Les organismes du sol, leur diversité, leur abondance et
leur activité, sont contrôlés par différents facteurs abiotiques (température, disponibilité en eau.) et biotiques
(prédation) qu'il est nécessaire d'évaluer pour en mesurer les incidences sur le fonctionnement des écosystèmes
terrestres. Nous apporterons dans cette UE des réponses à des questions telles que : quels sont les principaux
OBJECTIFS
mécanismes et processus impliqués dans les cycles de la matière ? Quels organismes interviennent ? Quelles
sont les interactions biotiques dans les sols ? Comment peut-on les prélever, les étudier, les dénombrer ? Les
théories d'écologie générale s'appliquent-elles à l'écologie du sol ? quels sont les ingénieurs de l'écosystème
dans les sols ? Comment peut-on utiliser ces connaissances pour répondre à des enjeux de conservation des sols
et des écosystèmes ? Quels peuvent être les effets du réchauffement climatique, de l'artificialisation ou des
pollutions sur la biodiversité et les fonctions des sols ? ; Cette UE permettra aux étudiants de compléter leur
formation en écologie générale par la compréhension et la mise en ouvre d'outils adaptés à l'étude du sol,
compartiment central dans le fonctionnement des écosystèmes terrestres.
Construire des plans d'expérience et d'échantillonnage pour étudier les changements de la biodiversité du sol à
différentes perturbations et stress des changement globaux (changement climatique, changement d'usage,
SAVOIR-FAIRE
pratiques forestières, artificialisation.) ; Prélever, dénombrer et identifier les principaux ordres et sous ordres
de la faune du sol. ; Construire une analyse des réponses de la biodiversité du sol aux changements globaux ;
-Connaître : ; Les enjeux de la conservation des sols et de leur biodiversité ; Les organismes du sol et leur
biologie ; Les modes de classification des organismes du sol ; Les répartitions spatiales et temporelles des
CONNAISSANCES
organismes du sol, et les facteurs de répartition ; Les facteurs déterminant les réseaux d'interactions trophiques
dans un sol
Contenus - Programme détaillé
-Bases en pédologie-rappels : mécanismes généraux de la pédogenèse : altération et désagrégation des roches,
processus de différenciation du profil d'un sol, horizons pédologiques, exemples de sol formés. ; Enjeux de la
conservation des sols et de leur biodiversité (Artificialisation, érosion hydrique, perte de C, pollution, érosion de
CONTENU la biodiversité) ; Biodiversité des sols (classifications, facteurs de diversification, facteurs de distribution,
fonctions écologiques, ingénieurs du sol, interactions plantes-sols.) ; Les facteurs de contrôles biotiques et
abiotiques du réseau trophique du sol ; Impacts des changement globaux sur le réseau trophique du sol et
conséquences pour les services écosystémiques associés
PRE-REQUIS -Connaissances générales sur les sols : propriétés physiques, chimiques et biologiques, répartition, évolution. ;
OBLIGATOIRES Connaissance de la classification taxonomique de la faune ; Analyse de données et calculs d'indices de diversité
PRE-REQUIS
Connaissances générales en écologie fonctionnelle et en sciences du sol.
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Biodiversité du sol, fonctionnement, écosystèmes, végétation, réseaux trophiques, interactions,

HEURES
REPARTITION
22 heures CM ; 4 heures TD ; 4 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C MAX (30% CC + 70% ET ; 100% ET) ©5LBE
26
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 4
Intitulé UE (BE202) Ecologie comportementale et interactions biotiques
Responsable 1 Nicolas Kaldonski Email 1 [email protected]

Responsable 2 Benoît Geslin Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 : Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution.
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'UE « Ecologie comportementale et interactions biotiques » se structure en deux parties : ; - l'une aborde des
notions avancées liées à la prise de décisions des animaux et son étude, et traitera notamment de la méthode
experimentale en écologie comportementale et des méthodes d'analyses comportementales, dans les contextes
de l'intelligence animale et de la motivation, de la notion d'acquis et d'inné dans les comportement de la faune
OBJECTIFS jusqu'à la notion de transmission culturelle et des régimes d'appariement ainsi que des soins parentaux. ; -
L'autre se penchera sur les concepts avancés dans le domaine des interactions biotiques tels que le passage de la
symbiose à l'antagonisme ou encore la notion de réseaux d'interactions en écologie. ; Les étudiants auront ainsi
des bases solides quant à la compréhension fine des mécanismes comportementaux et des interactions
biotiques.
Maîtrise des processus avancés intervenant dans la prise de décision des animaux et les concepts actuels qui
SAVOIR-FAIRE
décrivent et expliquent les interactions entre organismes.
Analyse comportementale. Méthode experimentale. Cognition et intelligence animale. Régime d'appariement.
CONNAISSANCES
Eusocialité. Réseaux d'interaction. Théorie des graphes. Mutualisme et antagonisme.
Contenus - Programme détaillé
Démarche expérimentale et test d'hypothèses en écologie comportementale ; cognition et intelligence animale
; prise de décision et motivation ; régimes d'appariement ; soins parentaux ; eusocialité avancée ; du phénotype
CONTENU étendu à la manipulation comportementale. ; De la symbiose à l'antagonisme ; la notion de réseaux
d'interactions en écologie ; Pollinisation ; la théorie des graphes et ses applications ; TD sous R Package
Bipartite ; sortie terrain mutualisée.
PRE-REQUIS
Connaissances de base en biologie, en écologie et en évolution.
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS Connaissances sur les relations trophiques, la sélection sexuelle, la vie en groupe des animaux, connaissances
RECOMMANDES naturalistes.
Ecologie comportementale, interactions biotiques, prise de décision, démarche expérimentale, régime
MOTS-CLEFS
d'appariement, eusocialité, symbiose, antagonisme.
HEURES
REPARTITION
29 heures CM ; 3 heures TD ; 8 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

27
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 4
Intitulé UE (BE203) Approches rétrospectives de la diversité, des écosystèmes et des environnements
Responsable 1 Guiter Frédéric Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 : Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution.
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Le but de cette UE est d'apporter une culture scientifique complémentaire aux disciplines écologiques classiques
grâce aux reconstitutions paléoécologiques menées dans des contextes variés (montagnes, zones côtières), et
OBJECTIFS
ainsi donner l'opportunité aux étudiants de prendre conscience des processus/forçages à long terme qui
régissent l'évolution des écosystèmes sur plusieurs millénaires
SAVOIR-FAIRE Esprit de synthèse.

CONNAISSANCES Ecologie des communautés. Ecologie forestière. Pédologie. Limnologie.

Contenus - Programme détaillé

A travers des études pluridisciplinaires (incluant paléoécologie, archéologie, géosciences s. l.) sur la période
quaternaire (2,6 Ma), l'UE propose une grande diversité de connaissances et de savoirs sur les trajectoires
CONTENU écologiques et environnementales passées. Par cette approche rétrospective, l'UE approfondit ainsi les grands
enjeux de l'écologie (érosion de la biodiversité, des sols, impact anthropique, changements climatiques) sur des
échelles de temps variées, à long terme.
PRE-REQUIS
Ecologie. Botanique.
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Géologie. Climatologie. Archéologie. Histoire.
RECOMMANDES
Ecologie des Communautés, Paléoécologie, Ecologie Historique, Anthropocène, Quaternaire, Changements
MOTS-CLEFS
Globaux
HEURES
REPARTITION
30 heures CM ; 10 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

28
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 3
Intitulé UE (BE203TE) Approches rétrospectives de la diversité, des écosystèmes et des environnements
Responsable 1 Guiter Frédéric Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Le but de cette UE est d'apporter une culture scientifique complémentaire aux disciplines écologiques classiques
grâce aux reconstitutions paléoécologiques menées dans des contextes variés (montagnes, zones côtières), et
OBJECTIFS
ainsi donner l'opportunité aux étudiants de prendre conscience des processus/forçages à long terme qui
régissent l'évolution des écosystèmes sur plusieurs millénaires
SAVOIR-FAIRE Esprit de synthèse.

CONNAISSANCES Ecologie des communautés. Ecologie forestière. Pédologie. Limnologie.

Contenus - Programme détaillé

A travers des études pluridisciplinaires (incluant paléoécologie, archéologie, géosciences s. l.) sur la période
quaternaire (2,6 Ma), l'UE propose une grande diversité de connaissances et de savoirs sur les trajectoires
CONTENU écologiques et environnementales passées. Par cette approche rétrospective, l'UE approfondit ainsi les grands
enjeux de l'écologie (érosion de la biodiversité, des sols, impact anthropique, changements climatiques) sur des
échelles de temps variées, à long terme.
PRE-REQUIS
Ecologie. Botanique.
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Géologie. Climatologie. Archéologie. Histoire.
RECOMMANDES
Ecologie des Communautés, Paléoécologie, Ecologie Historique, Anthropocène, Quaternaire, Changements
MOTS-CLEFS
Globaux
HEURES
REPARTITION
20 heures CM ; 10 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

29
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 3
Intitulé UE (BE204) Ecologie numérique
Responsable 1 Eric Meineri Email 1 [email protected]

Responsable 2 Franck Torre Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Déterminer, développer et appliquer des méthodes
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Devenir autonome dans la mise en place et l'interprétation d'analyses statistiques de niveau intermédiaire
OBJECTIFS
portant sur le fonctionnement des systèmes écologiques
Choisir parmis un panel les outils statistiques les plus appropriés à l'analyses de données écologiques ; Être en
mesure de mettre en place un ensemble de modèles linéaires, loglinéaires et logistiques, ainsi que les analyses
SAVOIR-FAIRE multivariées les plus courantes pour répondre à des hypothèses précises ; Savoir interpréter de manière
précises les résulats obtenus ; Savoir synthetiser et représenter graphiquement et spatialement les résulats
obtenus ; Pratiquer le logiciel R
CONNAISSANCES Conception, mise en place et interprétation de modèles et analyses statistiques de niveau intermédiaire

Contenus - Programme détaillé

Modéliser et analyser les dénombrements (modèles loglinéaires) ; Modéliser et analyser les proportions
(modèles logistiques) ; Modéliser et analyser les données binaires (modèles logistiques) - Introduction aux
CONTENU
modèles de répartition d'espèces ; Réalisation et interprétation d'analyses multivariées à un ou plusieurs
tableaux (ACP, AFC, RDA/CCA, RLQ .).
PRE-REQUIS Maitrise des statistiques inférentielles basiques (tests de comparaison de moyennes, modèles linéaires et
OBLIGATOIRES analyses en composante principale (ACP) sous R
PRE-REQUIS
Bonnes capacités en programmation sous R
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Modèles statistiques, GLM, modèle loglinéaire, modèle logistique, analyses multivariés

HEURES
REPARTITION
8 heures CM ; 0 heures TD ; 16 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

30
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 3
Intitulé UE (BE204TE) Ecologie numérique
Responsable 1 Eric Meineri Email 1 [email protected]

Responsable 2 Franck Torre Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC2 - Déterminer, développer et appliquer des méthodes et des outils dédiés à l'analyse des objets biologiques et écologiques
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Devenir autonome dans la mise en place et l'interprétation d'analyses statistiques de niveau intermédiaire
OBJECTIFS
portant sur le fonctionnement des systèmes écologiques
Choisir parmis un panel les outils statistiques les plus appropriés à l'analyses de données écologiques ; Être en
mesure de mettre en place un ensemble de modèles linéaires, loglinéaires et logistiques, ainsi que les analyses
SAVOIR-FAIRE multivariées les plus courantes pour répondre à des hypothèses précises ; Savoir interpréter de manière
précises les résulats obtenus ; Savoir synthetiser et représenter graphiquement et spatialement les résulats
obtenus ; Pratiquer le logiciel R
CONNAISSANCES Conception, mise en place et interprétation de modèles et analyses statistiques de niveau intermédiaire

Contenus - Programme détaillé

Modéliser et analyser les dénombrements (modèles loglinéaires) ; Modéliser et analyser les proportions
(modèles logistiques) ; Modéliser et analyser les données binaires (modèles logistiques) - Introduction aux
CONTENU
modèles de répartition d'espèces ; Rélisation et interprétation d'analyses multivariées à un ou plusieurs
tableaux (ACP, AFC, RDA/CCA, RLQ .).
PRE-REQUIS Maitrise des statistiques inférentielles basiques (tests de comparaison de moyennes, modèles linéaires et
OBLIGATOIRES analyses en composante principale (ACP) sous R
PRE-REQUIS
Bonnes capacités en programmation sous R
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Modèles statistiques, GLM, modèle loglinéaire, modèle logistique, analyses multivariés

HEURES
REPARTITION
8 heures CM ; 0 heures TD ; 16 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

31
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 3
Intitulé UE (BE205) Structure et dynamique du paysage
Responsable 1 Benoît Geslin Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC 2 Construire. Déterminer, développer et appliquer des méthodes et des outils dédiés à l'analyse des objets biologiques et
écologiques.
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Cette UE a pour objectif de procurer aux étudiants les connaissances initiales en écologie du paysage pour passer
OBJECTIFS de l'observation à la quantification - comprendre comment les patrons spatiaux affectent et structurent la
biodiversité.
Lecture du paysage, indices paysagers, aménagement trame verte et bleue, cartographie, rédaction de rapport,
SAVOIR-FAIRE
analyse bibliographique ;
Les notions importantes en écologies du paysage, les grands concepts ayant amené ou issus de cette discipline,
CONNAISSANCES la quantification du paysage, la trame verte et bleue, les notions de fragmentation, d'hétérogénéité,
l'importance de l'histoire des paysages.
Contenus - Programme détaillé
-1) Histoire de l'écologie du paysage ; 2) Concepts, méthodes, applications (hétérogénéité, fragmentation,
connectivité) ; 3) Les corridors écologiques ; 4) Les services écosystémiques et l'écologie du paysage ; 5) La
CONTENU
trame verte et bleue ; 6) Les paysages historiques ; ; TD - les indices paysagers ; ; Sortie - Lecture du paysage +
impact des patrons spatiaux sur les interactions plantes - pollinisateurs.
PRE-REQUIS
Théorie en écologie (métapopulations, biogéographie insulaire), statistiques de licence, indice de Shannon,
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
AFC, Tableaux de contingence, SIG
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Paysages, hétérogénéité, fragmentation, trame vert et bleue, indices paysagers

HEURES
REPARTITION
18 heures CM ; 0 heures TD ; 12 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % CT ©5LBE

32
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 4
Intitulé UE (BE207) Interfaces littorales : structure et fonctionnement
Responsable 1 Catherine Fernandez Email 1 [email protected]

Responsable 2 Christophe Lejeusne Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 Connaître
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de l'enseignement est de fournir les connaissances théoriques et méthodologiques sur la structure et le
OBJECTIFS fonctionnement des écosystèmes littoraux, zone d'interface et de transition entre les écosystèmes terrestres et
marins, ainsi que leur importance pour les services écosystémiques.
SAVOIR-FAIRE Méthodes d'échantillonnages, Technique d'entretien, Analyse et synthèse de documents

CONNAISSANCES Structures et fonctionnement des écosystèmes littoraux ; enjeux de conservation des écosystèmes littoraux

Contenus - Programme détaillé

L'unité détaillera les paysages littoraux en se focalisant sur les différents écosystèmes (terrestres,
dulçaquicoles, saumâtres et marins) le constituant : lagunes et mangroves, systèmes dunaires, côte rocheuse,
herbiers, coralligène et récifs coralliens, anthroposystèmes comme les ports seront notamment étudiés. Pour
CONTENU
chacun, la structure et le fonctionnement seront abordés ainsi que leur dynamique spatio-temporelle, et leur
importance pour les services écosystémiques sera mis en exergue. L'évolution historique et sociologique
(perceptions) de ces écosystèmes sera abordée.
PRE-REQUIS
Fonctionnement des écosystèmes
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Populations et écologie des communautés, connaissances naturalistes
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Écosystèmes littoraux, fonctionnement, services écosystémiques

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 20 heures TD ; 20 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

33
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 4
Intitulé UE (BE208) Conservation : approches évolutive, fonctionnelle et biogéographique
Responsable 1 Frédéric Médail Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 : Connaître. Maitriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et
de répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Cette UE vise à fournir les éléments théoriques et appliquées nécessaires aux approches biologiques et
OBJECTIFS
écologiques développées dans le cadre des sciences de la conservation
SAVOIR-FAIRE Eléments de diagnostic et de conduite d’opérations en biologie de la conservation
Connaissances nécessaires en écologie, biologie et génétique des populations, biogéographie, biostatistiques ;
CONNAISSANCES
connaissances naturalistes souhaitables
Contenus - Programme détaillé
Cette UE présente les diverses approches nécessaires afin de conduire des opérations de conservation de la
biodiversité́ et discute des facteurs de forçages à l’origine de l’altération de la biodiversité. Elle comprend les
CONTENU volets suivants : la biologie de la conservation, une discipline de crise ; approches de conservation
biogéographique, évolutive et fonctionnelle ; facteurs de forçages (altérations des habitats et surexploitation
des ressources) ; impacts du changement global et conservation de la biodiversité
PRE-REQUIS
Maîtrise des concepts en écologie des communautés, biogéographie, biologie et génétique des populations
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Connaissances naturalistes
RECOMMANDES
Conservation biogéographique ; conservation évolutive ; conservation fonctionnelle ; populations ; espèces ;
MOTS-CLEFS
habitats ; perturbations ; impacts du changement global
HEURES
REPARTITION
24 heures CM ; 2 heures TD ; 14 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100 % ET ©5LBE

34
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 3
Intitulé UE (BE209) Droit de l'environnement
Responsable 1 Email 1

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

A compléter
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
OBJECTIFS A compléter

SAVOIR-FAIRE A compléter

CONNAISSANCES A compléter

Contenus - Programme détaillé

CONTENU A compléter

PRE-REQUIS
A compléter
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
A compléter
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS A compléter

HEURES
REPARTITION
18 heures CM ; 2 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C XX % CC + XX % ET ©5LBE

35
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 3
Intitulé UE (BE210) Génétique de la conservation
Responsable 1 Alex Baumel Email 1 [email protected]

Responsable 2 Didier Aurelle Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Maitriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de répondre à
des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'unité enseignement « Génétique de la conservation » vise à initier les étudiants à une ; réflexion sur le rôle des
OBJECTIFS phénomènes génétiques et évolutifs dans la vulnérabilité des populations, ainsi que dans les actions de gestion
et conservation.
Lire et présenter un article de génétique/génomique de la conservation. Concevoir une expérience de
SAVOIR-FAIRE
génétique de la conservation par simulations, suivies d'analyses dans R
CONNAISSANCES Génétique des populations, biologie évolutive, génétique de la conservation

Contenus - Programme détaillé

L'unité s'organisera en trois chapitres essentiels visant à organiser les connaissances issues de la ; génétique des
populations et de la biologie évolutive pour les recruter lors de travaux dirigés. Les grands thèmes abordés
seront : (1) Écart à la population théorique et problématiques liées aux effectifs réduits, (2) Flux de gènes et
CONTENU échanges génétique, incluant l'introgression génétique, (3) Rôle de la diversité génétique dans les processus de
réponse au changement environnemental. Les enseignements seront structurés sous forme de mini-cours
intégrés aux projets, d'une bibliographie à lire pour préparer une présentation orale sur un cas d'étude
empirique et de modélisations sur ordinateur qui feront l'objet d'un rapport.
PRE-REQUIS
Génétique des Populations, Biologie Evolutive
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Initiation à R, à la simulation par coalescence, biologie des populations et conservation
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS biodiversité, génétique, conservation, population, adaptation, évolution, changement, vulnérabilité

HEURES
REPARTITION
6 heures CM ; 6 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 18
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C XX % CC + XX % ET ©5LBE

36
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 4
Intitulé UE (BE211) Intégrité et restauration écologique
Responsable 1 Raphael Gros Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires, transdisciplinaires permettant d'identifier et de répondre
à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'UE Intégrité et restauration écologique vise à développer les connaissances nécéssaires pour permettre la
compréhenssion 1) des stratégies et techniques de restauration ou de réhabilitation, 2) des différentes étapes
d'une action de restauration écologique et socio-écologique (du diagnostic à l'évaluation des résultats), et 3) des
acteurs impliqués dans un projet de restauration écologique. ; Au sens strict, la restauration écologique permet
de réparer les écosystèmes que les activités humaines ont détruits ou endommagés. Elle initie ou accélère le
OBJECTIFS
rétablissement de la composition spécifique, de la structure de la communauté, ou encore du fonctionnement
écologique d'un écosystème antérieur. La restauration écologique fait donc appel au génie écologique et
nécessite une bonne connaissance de l'écologie fonctionnelle et évolutive des écosystèmes ciblés, de la
perturbation en cours et le choix de l'écosystème de référence pour guider la réalisation et le suivi du projet de
restauration. ;
SAVOIR-FAIRE Savoir restaurer, réhabiliter ou recréer des habitats ou des paysages dégradés.
Les concepts abordés sont ceux de résilience, d'état stable alternatif, d'hystérèse, d'écosystèmes de référence,
CONNAISSANCES de fonctions écologiques, de systèmes socio-écologiques. ; Les techniques d'ingénierie écologique utilisése en
restauration , les acteurs, les objectifs et l'évaluation des opération de restauration sont également décrites.
Contenus - Programme détaillé
-Sous la forme de CM, TD et de sorties illustratives, les thèmes abordés sont : ; Perturbations et intégrité des
écosystèmes (résilience, état stable alternatifs, seuils,.) ; Restauration, réhabilitation, renaturation : histoire,
objectifs, techniques ; Écosystèmes et trajectoires de référence ; Évaluation du succès de restauration ;
CONTENU
Restauration des terrains de montagne (sortie et TD) ; Restauration et réhabilitation des steppes
méditerranéennes (sortie) ; Acteurs de la restauration écologique ; Rôle des savoirs locaux en RE et restauration
socio-écologique
PRE-REQUIS
Connaissances approfondies en écologie générale
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Connaissances en biologie de la conservation, ingénierie écologique
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Restauration, réhabilitation, écosystèmes, référence, seuil, perturbation

HEURES
REPARTITION
16 heures CM ; 8 heures TD ; 16 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

37
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 4
Intitulé UE (BE212) Analyses écologiques spatialisées 1
Responsable 1 Agathe Leriche Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC 1 : Connaître. Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et
de répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Cette UE a pour objectif de fournir aux participants les connaissances pratiques approfondies nécessaires à la
gestion, l'analyse et la cartographie des données spatiales qu'ils sont susceptibles de collecter dans le cadre de
leurs stages, futures recherches ou projets professionnels. Les objectifs de cette UE sont donc 1) de consolider
les connaissances acquises dans l'UE SIG du portail du master sur la manipulation des différents types de
OBJECTIFS
données, les systèmes de coordonnées et les requêtes spatiales basiques, 2) de renforcer ces connaissances en
appréhendant de nouveaux outils d'analyses spatiales et 3) de rendre les étudiants autonomes pour identifier
une chaîne de traitement SIG en réponse à une problématique écologique, et ce depuis l'acquisition des données
à la restitution, en passant par l'analyse spatiale des données.
Maîtrise et pratique avancées des outils courants de SIG pour répondre à une problématique écologique et
SAVOIR-FAIRE
mettre en place une stratégie d'échantillonnage sur le terrain.
CONNAISSANCES Système d'Information Géographique (SIG) ; Logiciel QGis© ; Qfield© sur smartphone

Contenus - Programme détaillé

L'UE se déroulera sous la forme d'un projet, permettant aux étudiants de développer les étapes d'une chaîne de
traitement SIG comprenant notamment la spatialisation d'un protocole d'échantillonnage, de la vectorisation et
CONTENU
du géoréférencement, de l'acquisition de données sur le terrain à l'aide de Qfield©, de la conversion de
formats de données, des requêtes spatiales et attributaires et de la restitution cartographique
PRE-REQUIS
Maîtrise de l'outil informatique ; bases de SIG équivalentes au contenu de l'UE TC2 SIG du portail
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Qgis ; Qfield ; Chaîne de traitement SIG ; Analyses spatiales ; GPS

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 0 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 40
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100 % CC ©5LBE

38
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 4
Intitulé UE (BE213) Biodiversité remarquable, invasive et ordinaire
Responsable 1 Saatkamp Arne Email 1 [email protected]

Responsable 2 Affre Laurence Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 Connaître Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant
d'identifier et de répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Réflexion sur les fondements de l'évaluation de la biodiversité : ; - pouvoir utiliser avec un esprit critique le
concept d'espèces allochtone et invasive et les moyens d'évaluation et exemples de leurs impacts ; - pouvoir
appliquer, comprendre les limites et mise en ouvre des catégories de raretés et notamment les évaluations IUCN
; - comprendre les changements environnementaux à l'origine de la dégradation et de l'homogénéisation de la
biodiversité ; eutrophisation des milieux terrestres ; - histoire d'utilisation des terres en milieu méditerranéen et
OBJECTIFS
biodiversité ; - pratiques agro-sylvo-pastorales méditerranéennes de plantes traditionnelles et cortèges associés
; - transfert pratiques anciennes et gestion de conservation ; - impact du changement climatique récent sur la
biodiversité ; -biodiversité remarquable chez les insectes ; cas d'invasion de la fourmi d'Argentine; description de
la rareté chez les insectes; impact des perturbations sur les communautés d'arthropodes ; - notions générales sur
le concept de Biodiversité ordinaire : définitions et importance ; exemples appliqués à la faune
Savoir évaluer les facteurs actuels et passés déterminant de la biodiversité actuelle, transfert pour la gestion
SAVOIR-FAIRE
conservatoire, évaluation selon des critères IUCN, savoir décider la gestion ou non des espèces invasives
Caractéristiques et fonctionnement des invasions et de la régression d'espèces ; fonctionnement de
CONNAISSANCES changement de communautés après abandon d'utilisation de terres traditionnelle, eutrophisation de milieu
terrestre
Contenus - Programme détaillé
- concepts fondamentaux dévaluation de la biodiversité ; ; - concept d'allochtone, exotique et invasive ; ; -
principes d'évaluation et exemples d'impacts des espèces invasives ; ; - débats sociétaux (écologiques,
économiques, sociaux) sur la gestion des espèces invasives ; ; - catégories de raretés et IUCN ; ; - changements
environnementaux à l'origine de la dégradation de la biodiversité ; ; - eutrophisation des milieux terrestres ; ; -
histoire d'utilisation des terres en milieu méditerranéen et biodiversité ; ; - pratiques agro-sylvo-pastorales
CONTENU
méditerranéennes de plantes traditionnelles et cortèges associés ; ; - transfert pratiques anciennes et gestion
de conservation ; ; - impact du changement climatique récent sur la biodiversité ; ; - biodiversité remarquable
chez les insectes ; cas d'invasion de la fourmi d'Argentine; description de rareté chez les insectes ; impact des
perturbations sur les communautés d'arthropodes ; - notions générales sur le concept de Biodiversité ordinaire
: définitions et importance ; exemples appliqués à la faune.
PRE-REQUIS
Connaissances en écologie, biogéographie, écologie fonctionnelle et biologie des populations
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Connaissances naturalistes en botanique, entomologie, diversité des vertébrés
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Listes rouge, évaluation IUCN, eutrophisation, changement d'usages, invasion d'espèces

HEURES
REPARTITION
10 heures CM ; 22 heures TD ; 8 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C ECI : 100 % CC + 0 % ET ©5LBE

39
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 3
Intitulé UE (BE214) Eaux et sols : gestion des risques
Responsable 1 Email 1

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

A compléter
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
OBJECTIFS A compléter

SAVOIR-FAIRE A compléter

CONNAISSANCES A compléter

Contenus - Programme détaillé

CONTENU A compléter

PRE-REQUIS
A compléter
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
A compléter
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS A compléter

HEURES
REPARTITION
6 heures CM ; 20 heures TD ; 4 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C XX % CC + XX % ET ©5LBE

40
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 4
Intitulé UE (BE215) Ecologie des systèmes anthropisés
Responsable 1 Benoît Geslin Email 1 [email protected]

Responsable 2 Magali Deschamps-Cottin Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 : Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de cet UE est d'acquérir des connaissances en écologie du paysage, écologie urbain, réseaux d'acteurs
OBJECTIFS
et analyse des réseaux d'interactions dans les paysages anthropisés (urbains, périurbains, agricoles)
Les étudiants apprendront à cartographier des occupations de sol, à réaliser une lecture du paysage, à
SAVOIR-FAIRE appréhender un réseau d'acteurs, à analyser un réseau bipartite et à comprendre le fonctionnement des
écosystèmes anthropisés.
Connaissances initiales en écologie du paysage, écologie urbaine, trame verte et bleue, réseaux d'interactions,
CONNAISSANCES
réseaux d'acteurs.
Contenus - Programme détaillé
Ecologie du paysage - introduction générale ; Paysage, concept méthodes applications (Fragmentation
Hétérogénéité). ; Ecologie des paysages urbains ; Les indices paysagers ; La connectivité, les corridors, la trame
CONTENU
verte et bleue ; Les interactions bipartite et l'analyse des réseaux dans les systèmes anthropisés ; Sortie lecture
du paysage et impact des patrons spatiaux sur les relations plantes-pollinisateurs
PRE-REQUIS Théorie en écologie (biogéographie insulaire, métapopulations), connaissance sur les interactions biotiques,
OBLIGATOIRES biologie des populations et des communautés.
PRE-REQUIS
Statistiques (AFC, tableaux de contingence), SIG, aménagement
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Ecologie du paysage, urbanisation, réseaux d'acteurs, connectivité, réseaux mutualistes.

HEURES
REPARTITION
12 heures CM ; 16 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

41
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 4
Intitulé UE (BE216) Gestion et naturalité
Responsable 1 Brigitte TALON Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 Connaître : Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et
de répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Mettre en évidence le lien entre naturalité et biodiversité des systèmes écologiques, soumis et non soumis à des
OBJECTIFS mesures de gestion (CM et TD). Faire connaitre les différents acteurs de la gestion des espèces et des espaces en
territoire non urbains et périurbains (rencontre avec ces acteurs en salle et sur le terrain).
Possession des savoirs et concepts essentiels dans les sciences écologiques, de l'aménagement et de la gestion
SAVOIR-FAIRE
du territoire, de l'environnement et des patrimoines naturels et culturels.
Prise en compte de la dimension temporelle des processus écologiques. Richesse et vulnérabilités des socio
CONNAISSANCES
écosystèmes (naturels et anthropisés)
Contenus - Programme détaillé
Définition des concepts de naturalité, d'écosystème de référence, de « past dependency ». Evaluation de la
biodiversité à différentes échelles de temps. Importance des perturbations et de la dimension économique
(exploitation, gestion) sur la structure, la composition et la biodiversité des systèmes écologiques, notamment
forestiers. Quelle gestion pour quelle biodiversité ? Quel usage du territoire ? Réflexions sur le ré-
ensauvagement et la libre évolution : nouveaux modes de conservation de la nature ? ; 16h CM : Ecosystèmes
forestiers (définition, structure, composition, etc) Recul historique sur l'ancienneté et le poinds de
l'anthropisation. Dépendance au passé /Les différents types de gestion forestière (ex : taillis, coupes à blanc,
CONTENU gestion à couvert continu)/Impact des perturbations et de la gestion sur la biodiversité, au travers de différents
exemples d'écosystèmes (suberaies, futaies médio-européennes, steppes boisées, plantations)/Naturalité.
Ecosystèmes de référence. Ré-ensauvagement et libre évolution : nouveaux modes de conservation de la
nature ? ; 12h TD : Dossier à réaliser en binôme sur « La biodiversité des milieux naturels dans différentes
situations de gestion ou non gestion". Libre choix de la thématique. Rendu d'un diaporama synthétique et
soutenance orale. / Débat/discussion sur la base d'un doc, article, etc choisi par les étudiants, et animé par eux.
; 12h TP : deux sorties de terrain dans des espaces protégés gérés (PNR, PN) et non gérés (RBI). Rencontres avec
les acteurs de ces espaces. Calcule d'indice de biodiversité potentielle. ;
Compétences approfondies en biologie générale, notions de base en écologie générale et en écologie
PRE-REQUIS
forestière. Motivation et attrait particulier pour la gestion et la compréhension de la biodiversité en interaction
OBLIGATOIRES
avec son environnement.
PRE-REQUIS Connaissance des trajectoires dynamiques, notions de silviculture, reconnaissance des principaux arbres ert
RECOMMANDES arbustes des forêts médio-européennes et méditerranéennes.
Ecosystèmes forestiers, Ecosystème de référence, Changement global, Gestion, Libre évolution, Naturalité,
MOTS-CLEFS
Héritage
HEURES
REPARTITION
16 heures CM ; 12 heures TD ; 12 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

42
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 3
Intitulé UE (BE217) Atelier de paysage et nature en ville
Responsable 1 Jean-Noël Consalès Email 1 [email protected]

Responsable 2 Magali Deschamps-Cottin Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC 1 Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Dans cette UE, il s'agit, à travers le prisme des outils de l'urbanisme, de l'aménagement du territoire et de la
planification de comprendre comment les territoires de l'urbain peuvent intégrer des éléments de biodiversité
favorisant les fonctionnements écologiques (connectivité, fragmentation.) et, inversement, comment les espaces
OBJECTIFS
à caractère de nature peuvent participer du processus d'urbanisation. Il s'agit notamment de comprendre
comment la nature, en général, et la biodiversité, intègrent les documents d'urbanisme et de planification afin
de fournir, à la ville, des services écosystémiques.
Observation du paysage et des espèces végétales structurantes. Méthodes d'analyse éco-paysagère qui
SAVOIR-FAIRE croiseront des échelles et des thèmes. Restitution graphique des analyses (croquis, photo-interprétations,
coupes, blocs diagrammes, transects.).
Sur le plan méthodologique et des connaissances acquises, l'accent sera mis sur des apports utilisant une
CONNAISSANCES approche éco-paysagère dans la compréhension et l'analyse des territoires par l'examen des dimensions
sensibles, culturelles et objectives de l'espace.
Contenus - Programme détaillé
Résolument transdisciplinaire, ce module s'organise sous la forme d'un workshop d'une semaine. Il regroupera
des étudiants d'un master 1 d'urbanisme et les étudiants du M1 Ecogest. ; Il a pour objectif d'interroger la
manière dont sont prises en compte les différentes formes de natures urbaines dans la planification et
l'urbanisme contemporains, à travers la notion intégratrice de paysage. Sur le fond, il s'articule sur des cours
destinés à présenter les notions essentielles du système écologique urbain afin de mieux comprendre leur
intégration dans les documents de planification et d'urbanisme régionaux et locaux ainsi que de cours sur les
CONTENU
outils qui seront mobilisés pour la construction d'un discours graphique. Sur la forme, il propose une expérience
d'arpentage de terrain destinée à réaliser, in situ, une lecture partagée d'un territoire retranscrit, in visu, par
différents outils d'analyse paysagère (roquis, photo-interprétations, coupes, blocs diagrammes, etc.). ; Déroulé :
; Jour 1 : Cours en salle et outils de travail ; Jour 2 et 3 : Arpentage de terrain, lecture de paysage et croquis. ;
Jour 3 et 4 : TD en salle de retour de terrain, utilisation d'outils graphiques pour aborder comment restituer
l'observation.
PRE-REQUIS
Aucun
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Macrovision du Territoire, Aménagement, Représentation graphique, Socio-écosystème

HEURES
REPARTITION
6 heures CM ; 12 heures TD ; 12 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100 % CC ©5LBE

43
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 4
Intitulé UE (BE218) Biosurveillance et écotoxicologie
Responsable 1 MOREAU Xavier Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 : Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Comprendre les enjeux et la complexité de la contamination environnementale. Acquérir les concepts et des
OBJECTIFS
méthodes récentes de la biosurveillance pour une application à la santé environnementale et humaine.
Posséder les outils écotoxicologiques et écotechnologiques pour concevoir, réaliser et interpréter une analyse
SAVOIR-FAIRE intégrative d'un socio-écosystème perturbé ; Mobiliser les acquis pour promouvoir des démarches innovantes
favorisant la préservation des ressources naturelles et le développement durable ;
Avoir une vision intégrative de la diversité des contaminants et de leurs effets sur la santé environnementale et
CONNAISSANCES
humaine
Contenus - Programme détaillé
* Principaux toxiques de l'environnement et cas concrets d'atteintes à l'environnement et à la santé humaine
CONTENU
(Minamata, Seveso, pollution du Rhône.).
PRE-REQUIS
Bases d'écophysiologie, de physiologie animale et végétale, de biologie cellulaire et de microbiologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS Bases en écotoxicologie et concernant les impacts biologiques des perturbations de l'environnement sur les
RECOMMANDES organismes.
Bioindicateurs, Biomarqueurs, indices biologiques, diagnostic environnemental, sciences « omiques »,
MOTS-CLEFS
écotoxicologie
HEURES
REPARTITION
26 heures CM ; 6 heures TD ; 8 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

44
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 4
Intitulé UE (BE219) Enjeux écologiques des sites et sols pollués
Responsable 1 Stéven CRIQUET Email 1 [email protected]

Responsable 2 Hélène Folzer Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC 1 Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Evaluer les enjeux écologiques des sites et sols pollués à travers l'identification de l'impact de pollutions sur le
OBJECTIFS
fonctionnement biologique des sols, des communautés microbiennes, des plantes et sur leurs interactions.
Caractériser sur le terrain une pollution ; savoir échantillonner des sols pollués ; caractérisation au laboratoire
SAVOIR-FAIRE de l'impact de polluants sur les communautés édaphiques (microorganismes), sur le fonctionnement des
plantes, leurs traits et leurs interactions
CONNAISSANCES Typologie d'une pollution de sol ; impacts écophysiologiques (microorganismes, plantes) de polluants, traits

Contenus - Programme détaillé

Interactions polluants - physiologie des communautés microbiennes : 10h CM ; Impact et réponses des plantes
CONTENU au stress métallique et aux sols salés : 10 h CM ; Techniques d'étude de la biodiversité microbienne : 4h CM ;
Sortie terrain sur site pollué : 4 h ; Travaux pratiques en laboratoire : 12 h
PRE-REQUIS
Ecologie, Microbiologie, Ecophysiologie végétale, bases de biologie moléculaire
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Notions de pédologie
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Pollutions, Risques, Vulnérabilité, Sols, Ecophysiologie

HEURES
REPARTITION
24 heures CM ; 0 heures TD ; 16 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 40 % CC + 60 % ET ©5LBE

45
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 4
Intitulé UE (BE220) Enjeux écologiques des hydrosystèmes urbains
Responsable 1 Hélène Folzer Email 1 [email protected]

Responsable 2 Evelyne Franquet Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC 1 Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
S'emparer des sujets autour des enjeux écologiques des hydrosystèmes urbains. Savoir évaluer l'état des
OBJECTIFS
hydrosystèmes urbains, comprendre leur fonctionnement et évaluer les enjeux écologiques associés
Construction d'un plan d'expérience sur le terrain afin de répondre à des questions scientifiques par des
SAVOIR-FAIRE approches multidisciplinaires et à travers différents organismes pour évaluer le fonctionnement des
hydrosystèmes urbains.
Évaluation de l'état de fonctionnement des hydrosystèmes urbain à travers l'utilisation d'indicateurs et de traits
CONNAISSANCES
de réponse des organismes et des communautés caractéristiques de ces environnements.
Contenus - Programme détaillé
Définitions et délimitation des zones humides et des hydrosystèmes urbains. Caractérisation du syndrome des
rivières urbaines. Quelles sont les menaces qui existent sur ces zones et leur biodiversité (altération, enjeux et
raréfaction). Quelles sont les fonctions et services ecosystémiques rendus par les hydrosystèmes en zone
urbaine (trame bleue et trame turquoise). ; Hélophytes, fonctions et services. ; Indication de qualité d'eau :
CONTENU introduction sur le Système d'Évaluation de la Qualité de l'eau SEQ Eau, Indice diatomique, Indice Invertébrés
multimétrique (I2M2). ; Rôles des biofilms microbiens dans le fonctionnement des hydrosystèmes ; Approche
par étude de cas (sortie terrain mutualisée avec l'UE BE214) sur fleuve côtier urbain Caravelles- Aygalades avec
prise en compte des indicateurs bactériens (détection entérobactéries), des communautés de diatomées et
d'invertébrés benthiques (indice diatomique et indice invertébrés multimétriques) et de la qualité des eaux.
PRE-REQUIS
Compétences en écologie, notions de base en chimie, écophysiologie végétale et animale
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS Connaissances sur la structure des communautés et le fonctionnement des rivières non dégradées.
RECOMMANDES Microbiologie de l'eau et du sol.
Approche multidisciplinaire, multi organismes, multi échelles, fonctionnement des hydrosystèmes anthropisés,
MOTS-CLEFS
milieux humides.
HEURES
REPARTITION
19 heures CM ; 6 heures TD ; 15 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 40 % CC + 60 % ET ©5LBE

46
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 6
Intitulé UE (BE221) Transition écologique en agriculture : gestion de l'eau et pratiques durables
Responsable 1 Anne-Marie FARNET DA SILVA Email 1 [email protected]

Responsable 2 Jean-Luc BOUDENNE Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Déterminer, développer et appliquer des méthodes ; Maîtriser les concepts et mobiliser ses savoirs ; Concevoir, gérer et animer de
façon individuelle ou collaborative un projet scientifique
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Savoir répondre à des questions scientifiques en lien avec la transition environnementale en agriculture (e.g.
solutions alternatives aux pratiques agricoles conventionnelles) par une approche co construite avec les acteurs
OBJECTIFS
du monde socio professionnel concerné en engageant les multiples champs disciplinaires en sciences de
l'environnement.
Construction d'un plan d'expérience sur le terrain afin de répondre à des questions scientifiques, identification
et réalisation d'expériences en laboratoire afin de répondre à ces questions, interactions avec divers
SAVOIR-FAIRE
interlocuteurs (académique, monde socioprofessionnel), coordination d'un travail de groupe à compétences
diversifiés et restitution intégrative des résultats avec proposition d'actions.
Apprentissage d'une démarche multidisciplinaire et connaissances en sciences du sol, chimie
CONNAISSANCES environnementale, écophysiologie végétale., apports cruciaux des approches en sociologie et géographie dans
les enjeux de la transition environnementale
Contenus - Programme détaillé
- Les grands enjeux de la transition environnementale et agriculture (solutions alternatives aux intrants de
CONTENU l'agriculture conventionnelle, la ressource eau en quantité et qualité, comment co-construire la transition avec
les acteurs du monde agricole : approches psycho-sociales..).
PRE-REQUIS
Compétences en écologie, notion de bases en chimie, sciences du sol et écophysiologie végétale.
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Pré requis théoriques et pratiques en chimie et microbiologie de l'eau et des sols, en écophysiologie végétale
RECOMMANDES
Approches multiacteurs, pratiques agricoles innovantes, solutions basées sur la Nature, réutilisation des eaux
MOTS-CLEFS
usées
HEURES
REPARTITION
28 heures CM ; 12 heures TD ; 20 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

47
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 2
Intitulé UE (GIDO201) Fundamentals in Law of the shoreline
Responsable 1 Email 1

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

A compléter
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
OBJECTIFS A compléter

SAVOIR-FAIRE A compléter

CONNAISSANCES A compléter

Contenus - Programme détaillé

CONTENU A compléter

PRE-REQUIS
A compléter
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
A compléter
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS A compléter

HEURES
REPARTITION
20 heures CM ; 0 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C XX % CC + XX % ET ©5LBE

48
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2 CRD 5
Intitulé UE (GIDO202) Approches pluridisciplinaires de la conservation des océans et du littoral
Responsable 1 Email 1

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

A compléter
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
OBJECTIFS A compléter

SAVOIR-FAIRE A compléter

CONNAISSANCES A compléter

Contenus - Programme détaillé

CONTENU A compléter

PRE-REQUIS
A compléter
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
A compléter
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS A compléter

HEURES
REPARTITION
30 heures CM ; 20 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C XX % CC + XX % ET ©5LBE

49
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2TE CRD 6
Intitulé UE (BE200TE) Démarche scientifique en écologie
Responsable 1 Anne Bousquet-Mélou Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC3 - Concevoir, gérer et animer de façon collaborative un projet scientifique et écologie et construire son projet professionnel
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Mise en situation des étudiants du Master BEE TE (OSU Institut Pythéas, Université Aix Marseille) et de ceux du
Master GEDD de la Faculté des Sciences Ben M'Sick (Université Hassan 2 de Casablanca) dans le cadre d'une
école de terrain commune « Nord-Sud de la Méditerranée ». Cette école aura pour objectif l'étude croisée des
forêts de chênes lièges françaises et marocaines afin i) de comparer les menaces et opportunités concernant la
OBJECTIFS
biodiversité et les savoirs locaux dans un contexte de changement climatique et de changement d'usage et ii)
d'identifier les processus d'adaptation de ces socio-écosystèmes. Des approches interdisciplinaires abordées via
une pédagogie active favoriseront la formation en compétences transversales indispensables pour la mise en
place de projets de durabilité.
- Détecter les problèmes découlant des changements globaux ; ; - Savoir travailler en groupe ; ; - Mener des
SAVOIR-FAIRE recherches pratiques et réaliser des enquêtes socio-écologique ; ; - Savoir interpréter de manière précises les
résulats obtenus ; ; - Savoir synthetiser et restituter en groupe les résultats obtenus.
Concepts en écologie fonctionnelle, gestion forestière, gestion des socio-écosystème, ethnoécologie et gestion
CONNAISSANCES
de projet de niveau intermédiaire
Contenus - Programme détaillé
En M1, les étudiants se focaliseront sur les problèmes rencontrées dans les forêts de chêne liège sur la rive
Nord de la Méditerranée (France), et plus particulièrement sur les problèmes de sousexploitation et de risques
d'incendie qui pèsent sur ces forêts. ; Méthodes en écologie axées sur le fonctionnement et la gestion des
forêts : Estimation de la biomasse et du stock de carbone des peuplements forestiers, étude de la biodiversité
CONTENU
végétale et des organismes du sol (abondance, diversité, structure et dynamique des communautés), structure
et dynamique des communautés. ; Bases en ethnobiologie : Concepts et méthodes de base en ethnoécologie et
application à un défi de durabilité, à savoir la conservation des forêts de liège en tant que systèmes socio-
écologiques.
PRE-REQUIS
UE du S1 du M1 BEE
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS Niveau L3 ou équivalent dans le domaine des sciences naturelles, de la biologie générale, de biologie des
RECOMMANDES organismes et des populations
Ecologie forestière, ethnobiologie, gestion des socio-écosystème, changements globaux, durabilité, forêt
MOTS-CLEFS
méditerranéenne
HEURES
REPARTITION
6 heures CM ; 6 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 48
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 25%CC1+25%CC2+50%CC3 ; (CC3 = oral terminal) ©5LBE

50
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2TE CRD 3
Intitulé UE (BE202TE) Ecologie comportementale et interactions biotiques
Responsable 1 Nicolas Kaldonski Email 1 [email protected]

Responsable 2 Benoît Geslin Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'UE « Ecologie comportementale et interactions biotiques » se structure en deux parties : ; - l'une aborde des
notions avancées liées à la prise de décisions des animaux et son étude, et traitera notamment de la méthode
experimentale en écologie comportementale et des méthodes d'analyses comportementales, dans les contextes
de l'intelligence animale et de la motivation, de la notion d'acquis et d'inné dans les comportement de la faune
OBJECTIFS jusqu'à la notion de transmission culturelle et des régimes d'appariement ainsi que des soins parentaux. ; -
L'autre se penchera sur les concepts avancés dans le domaine des interactions biotiques tels que le passage de la
symbiose à l'antagonisme ou encore la notion de réseaux d'interactions en écologie. ; Les étudiants auront ainsi
des bases solides quant à la compréhension fine des mécanismes comportementaux et des interactions
biotiques.
Maîtrise des processus avancés intervenant dans la prise de décision des animaux et les concepts actuels qui
SAVOIR-FAIRE
décrivent et expliquent les interactions entre organismes.
Analyse comportementale. Méthode experimentale. Cognition et intelligence animale. Régime d'appariement.
CONNAISSANCES
Eusocialité. Réseaux d'interaction. Théorie des graphes. Mutualisme et antagonisme.
Contenus - Programme détaillé
Démarche expérimentale et test d'hypothèses en écologie comportementale ; cognition et intelligence animale
; prise de décision et motivation ; régimes d'appariement ; soins parentaux ; eusocialité avancée ; du phénotype
CONTENU étendu à la manipulation comportementale. ; De la symbiose à l'antagonisme ; la notion de réseaux
d'interactions en écologie ; Pollinisation ; la théorie des graphes et ses applications ; TD sous R Package
Bipartite ; sortie terrain mutualisée.
PRE-REQUIS
Connaissances de base en biologie, en écologie et en évolution.
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS Connaissances sur les relations trophiques, la sélection sexuelle, la vie en groupe des animaux, connaissances
RECOMMANDES naturalistes.
Ecologie comportementale, interactions biotiques, prise de décision, démarche expérimentale, régime
MOTS-CLEFS
d'appariement, eusocialité, symbiose, antagonisme.
HEURES
REPARTITION
27 heures CM ; 3 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

51
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M1S2TE CRD 3
Intitulé UE (BE205TE) Structure et dynamique du paysage
Responsable 1 Benoît Geslin Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Cette UE a pour objectif de procurer aux étudiants les connaissances initiales en écologie du paysage pour passer
OBJECTIFS de l'observation à la quantification - comprendre comment les patrons spatiaux affectent et structurent la
biodiversité.
Lecture du paysage, indices paysagers, aménagement trame verte et bleue, cartographie, rédaction de rapport,
SAVOIR-FAIRE
analyse bibliographique ;
Les notions importantes en écologies du paysage, les grands concepts ayant amené ou issus de cette discipline,
CONNAISSANCES la quantification du paysage, la trame verte et bleue, les notions de fragmentation, d'hétérogénéité,
l'importance de l'histoire des paysages.
Contenus - Programme détaillé
1) Histoire de l'écologie du paysage ; 2) Concepts, méthodes, applications (hétérogénéité, fragmentation,
connectivité) ; 3) Les corridors écologiques ; 4) Les services écosystémiques et l'écologie du paysage ; 5) La
CONTENU
trame verte et bleue ; 6) Les paysages historiques ; TD - les indices paysagers ; Sortie - Lecture du paysage +
impact des patrons spatiaux sur les interactions plantes - pollinisateurs.
PRE-REQUIS
Théorie en écologie (métapopulations, biogéographie insulaire), statistiques de licence, indice de Shannon,
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
AFC, Tableaux de contigence, SIG
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Paysages, hétérogénéité, fragmentation, trame vert et bleue, indices paysagers

HEURES
REPARTITION
22 heures CM ; 0 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 8
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % CT ©5LBE

52
Deuxième année, semestre 3

53
Mention Inter-mentions SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (TC5P) Montage de projets - marchés publics - entrepreneuriat
Responsable 1 Email 1

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Concevoir, gérer et animer un projet (BEE)
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
OBJECTIFS A compléter

SAVOIR-FAIRE A compléter

CONNAISSANCES A compléter

Contenus - Programme détaillé

CONTENU A compléter

PRE-REQUIS
A compléter
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
A compléter
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS A compléter

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 24 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 6
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C XX % CC + XX % ET ©5LBE

54
Mention Inter-mentions SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (TC5R BEE GEE TE) Atelier Sciences : de l'état de l'art à la médiation scientifique
Responsable 1 Emmanuel Corcket Email 1 [email protected]

Responsable 2 Pascale Prudent Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Concevoir, gérer et animer un projet (BEE)
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Cette unité d'enseignement a pour objectif (i) la réalisation d'un projet tutoré intégratif permettant aux
étudiants de comprendre comment aller de la théorie à la pratique, en prenant en compte les enjeux
OBJECTIFS environnementaux liées au contexte socio-économique actuel et (ii) la création d'un support de vulgarisation
scientifique au choix qui puisse être remobilisé pour sensibiliser un public à des problématiques
environnementales et écologiques.
- comprendre et maîtriser les dimensions scientifiques d'une problématique environnementale choisie ; ; -
SAVOIR-FAIRE travailler de manière collaborative et mettre en oeuvre les moyens pratiques de réalisation d'un projet ; ; -
diffuser et vulgariser l'information scientifique en relation avec des acteurs socio-économiques.
CONNAISSANCES A compléter

Contenus - Programme détaillé

L'UE se déroulera de la façon suivante : ; 1°) Identification d'une grande thématique environnementale (GTE) à
aborder, d'intérêt pour la société, en identifiant les enjeux scientifiques et son importance socioéconomique ;
2°) Identification d'une problématique à la fois scientifique et socioéconomique par groupe de 3-4-5 étudiants
dans le cadre de cette GTE. Travail bibliographique sur les bases scientifiques de ces problématiques. ; 3°)
CONTENU
Conception d'une réalisation (audio-visuelle : affiche, vidéo, expo photo ; pratique ; démonstrateur en salle ou
in situ...) permettant d'illustrer, d'expliquer, de sensibiliser un public bien identifié (scolaire, professionnels,
grand public, universitaire...) à la problématique environnementale choisie ; 4°) Réalisation concrète du projet ;
5°) Présentation orale et pratique des réalisations, contexte scientifique, enjeux de société et discussions
PRE-REQUIS
Unités d'enseignement de M1
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
A compléter
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Médiation scientifique ; Enjeux environnementaux

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 24 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 6
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100% CC ©5LBE

55
Mention Inter-mentions SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (TC5R BEE PR) Atelier Sciences : de l'état de l'art à la médiation scientifique
Responsable 1 Emmanuel Corcket Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Concevoir, gérer et animer un projet (BEE)
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Cette unité d'enseignement a pour objectif (i) la réalisation d'un projet tutoré intégratif permettant aux
étudiants de comprendre comment aller de la théorie à la pratique, en prenant en compte les enjeux
OBJECTIFS environnementaux liées au contexte socio-économique actuel et (ii) la création d'un support de vulgarisation
scientifique au choix qui puisse être remobilisé pour sensibiliser un public à des problématiques
environnementales et écologiques.
Comprendre et maîtriser les dimensions scientifiques d'une problématique environnementale choisie ; ; -
SAVOIR-FAIRE travailler de manière collaborative et mettre en oeuvre les moyens pratiques de réalisation d'un projet ; ; -
diffuser et vulgariser l'information scientifique en relation avec des acteurs socio-économiques.
CONNAISSANCES A compléter

Contenus - Programme détaillé

L'UE se déroulera de la façon suivante : ; 1°) Identification d'une grande thématique environnementale (GTE) à
aborder, d'intérêt pour la société, en identifiant les enjeux scientifiques et son importance socioéconomique ;
2°) Identification d'une problématique à la fois scientifique et socioéconomique par groupe de 3-4-5 étudiants
dans le cadre de cette GTE. Travail bibliographique sur les bases scientifiques de ces problématiques. ; 3°)
CONTENU
Conception d'une réalisation (audio-visuelle : affiche, vidéo, expo photo ; pratique ; démonstrateur en salle ou
in situ...) permettant d'illustrer, d'expliquer, de sensibiliser un public bien identifié (scolaire, professionnels,
grand public, universitaire...) à la problématique environnementale choisie ; 4°) Réalisation concrète du projet ;
5°) Présentation orale et pratique des réalisations, contexte scientifique, enjeux de société et discussions
PRE-REQUIS
Unités d'enseignement de M1
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
A compléter
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Médiation scientifique ; Enjeux environnementaux

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 24 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 6
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100% CC ©5LBE

56
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE301) Biogéographie, passé et présent
Responsable 1 Frédéric Médail Email 1 [email protected]

Responsable 2 Frédéric Guiter Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 (Connaître) : Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier
et de répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Sensibiliser les étudiants à l'importance de l'histoire biogéographique et de la paléoécologie dans la
OBJECTIFS
compréhension de l'organisation de la diversité des écosystèmes actuels et de leur biodiversité du Paléarctique
Acquérir une approche croisant de multiples échelles d'espace et de temps. ; Acquérir une démarche
SAVOIR-FAIRE multidisciplinaire pour l'étude de la biodiversité (aspects fonctionnels, évolutifs). ; Savoir rédiger et s'exprimer
oralement en français et en anglais ; bonnes capacités d'analyse et de synthèse.
Connaissances en écologie, biogéographie, paléoécologie, dynamique des systèmes écologiques. Rôle des
CONNAISSANCES variations spatiotemporelles à l'échelle globale sur la dynamique de la biodiversité. Cycles climatiques. Impact
des activités humaines et des changements globaux sur la biodiversité.
Contenus - Programme détaillé
Cette UE traite de la dynamique actuelle et passée des paysages méditerranéens et eurasiatiques, en inscrivant
les approches sur le temps long. Il aborde les conséquences des changements paléogéographiques et
CONTENU environnementaux passés (ex. notion de refuge) et l'impact historique des pressions anthropiques sur la
structure et la dynamique des systèmes écologiques. Un focus particulier concerne les systèmes insulaires et
ceux de montagnes.
PRE-REQUIS
Connaissances en écologie, biologie des populations, paléoécologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Connaissances en géologie
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Biogéographie insulaire, Refuges, montagnes, Méditerranée

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 30 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

57
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE301TE) Biogéographie, passé et présent
Responsable 1 Brigitte Talon Email 1 [email protected]

Responsable 2 Frédéric Guiter Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Sensibiliser les étudiants à l'importance de l'histoire biogéographique et de la paléoécologie dans la
OBJECTIFS
compréhension de l'organisation de la diversité des écosystèmes actuels et de leur biodiversité du Paléarctique
Acquérir une approche croisant de multiples échelles d'espace et de temps ; Acquérir une démarche
SAVOIR-FAIRE multidisciplinaire pour l'étude de la biodiversité (aspects fonctionnels, évolutifs) ; Savoir rédiger et s'exprimer
oralement en français et en anglais ; bonnes capacités d'analyse et de synthèse
Connaissances en écologie, biogéographie, paléoécologie, dynamique des systèmes écologiques. Rôle des
CONNAISSANCES variations spatiotemporelles à l'échelle globaale sur la dynamique de la biodiversité. Cycles climatiques. Impact
des activités humaines et des changements globaux sur la biodiversité.
Contenus - Programme détaillé
Cette unité d'enseignement traite de la dynamique actuelle et passée des paysages méditerranéens et
eurasiatiques, en inscrivant les approches sur le temps long. Il aborde les conséquences des changements
CONTENU paléogéographiques et environnementaux passés (ex. notion de refuge) et l'impact historique des pressions
anthropiques sur la structure et la dynamique des systèmes écologiques. Un focus particulier concerne les
systèmes insulaires et ceux de montagnes.
PRE-REQUIS
Connaissances en écologie, biologie des populations, paléoécologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Connaissances en géologie
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Refuges, montagnes, Méditerranée

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 30 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

58
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE302) Interactions biotiques
Responsable 1 Anne Bousquet-Mélou Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de ce cours est d'approfondir les connaissances sur les interactions inter et intra espèces et de
développer les connaissances des nouveaux outils d'analyse des réseaux d'interaction. L'approfondissement des
OBJECTIFS
connaissances portera également sur la réponse des interactions et réseaux d'interactions face aux
perturbations anthropiques.
Analyses statistiques des réseaux d'interaction ; modélisation ; synthèse bibliographique des principales
SAVOIR-FAIRE hypothèses abordées dans les différentes parties du cours, présentation orale devant le groupe, réalisation
d'une affiche scientifique.
Connaissances approfondies dans les interactions biotiques, réponse des interactions biotiques face aux
CONNAISSANCES
changements globaux.
Contenus - Programme détaillé
Réseaux d'interactions: Nouvelles méthodes d'analyses ; Symbioses dans les sols - approfondissement ;
CONTENU
Interactions hôtes-Parsitoides ; Interactions faune sol ; Interactions tricheuses ; chimie des invasions
PRE-REQUIS Notions de bases en écologie ; UEs écologie chimique et Ecologie Comportementale et Interactions Biotiques,
OBLIGATOIRES connaissance de master 1 en statistiques uni et multivariées,
PRE-REQUIS
Connaissance du logiciel R. Connaissances en écologie fonctionnelle.
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Interactions biotiques - Réseaux - Processus écologiques - Perturbations anthropiques.

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 0 heures TD ; 6 heures TP PEDAGOGIE 24
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

59
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 6
Intitulé UE (BE303) Fonctionnement des écosystèmes, changements globaux et services écosystémiques
Responsable 1 Virginie Baldy Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Objectifs et acquis d'apprentissages spécifiques de l'UE
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de cette UE est d'approfondir les connaissances sur les concepts en écologie fonctionnelle, et les
impacts des changements globaux sur ces écosytèmes et les services qu'ils offrent à la société. Une partie de cet
OBJECTIFS enseignement est interdisciplinaire, avec des approches d'ethno-écologie. Il est essentiellemet basé sur de la
pédagogie active, incluant des mesures de terrain liées à des programmes de recherche et la participation à un
workshop international et interdisciplinaire sur la biodiversité et le changement climatique.
Analyses statistiques adaptées à l'étude des processus fonctionnels ; mesures d'indicateurs fonctionnels sur des
SAVOIR-FAIRE
sites expérimentaux forestiers et littoraux méditerrannéens
CONNAISSANCES Ecologie fonctionnelle

Contenus - Programme détaillé

Cette UE propose de présenter les grands concepts théoriques en écologie fonctionnelle permettant d'étudier
la réponse des écosystèmes aux changements globaux (e.g. hypothèses de diversité-stabilité, gradient de
CONTENU stress). Il sera abordé, avec un focus sur les forêts et le littoral méditerranéen, la vulnérabilité et la résilience
des écosystèmes face aux changements environnementaux, avec les notions de mitigation, d'adaptation et de
gestion adaptative en utilisant les outils de modélisation afin de prédire la dynamique de ces écosystèmes.
PRE-REQUIS
Notions de bases en écologie ; UE de Master 1 BEE écologie fonctionnelle et écosystèmes
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Maîtrise de l'outil R, travail en groupes, approche par projet
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Ecologie fonctionnelle, changements globaux, services écosystémiques, forêt, littoral, Méditerranée

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 12 heures TD ; 18 heures TP PEDAGOGIE 28
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

60
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE304) Stratégies d'échantillonnage & modélisation statistique des systèmes écologiques
Responsable 1 Alexandre Millon Email 1 [email protected]

Responsable 2 Christophe Lejeusne Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Les étudiant.es seront formées à la définition d'une stratégie d'échantillonage à même de générer des données
OBJECTIFS suffisantes pour répondre à une question écologique clairement posée, en utilisant les outils de modélisation
statistique adéquats.
SAVOIR-FAIRE Synthèse des connaissances scientifiques ; remobilisation des connaissances ; Analyses statistiques

CONNAISSANCES Statistiques appliquées à l'écologie

Contenus - Programme détaillé

L'objectif de cette UE est de faire prendre conscience aux étudiant.es de l'importance de la réflexion quant à la
mise en ouvre d'une stratégie d'échantillonnage sur le terrain, ou en laboratoire, échantillonnage à même des
générer des données en quantité et de qualité suffisantes pour répondre à une question écologique par ailleurs
précisément posée. Ce travail en amont de la collecte de données, trop souvent ignoré, est en effet
indispensable pour vérifier l'adéquation des ressources avec les objectifs fixés. Passée cette première étape, qui
s'appuie notamment sur l'évaluation de la méthodologie utilisée dans les rapports de stage des promotions
précédentes, les étudiant.es se voient proposer une série de jeux de données écologiques réels afin de
renforcer et valider leur savoir-faire quant à la mise en ouvre des différentes étapes de la modélisation
CONTENU
statistique. Les bases de la modélisation linéaire, notamment quant à la sélection des modèles et la prise en
compte de l'incertitude dans les estimations, sont d'abord rappelées à travers l'utilisation de modèles linéaires
gaussiens. Ensuite les étudiant.es sont confronté.es aux modèles linéaires généralisés afin d'analyser des
données de présence/absence et d'abondance. Finalement, les principaux cas de figure nécessitant l'utilisation
de modèles mixtes, combinant effets fixes et aléatoires, sont abordés toujours à partir d'exemple concrets. A
mi-parcours de l'UE, il est demandé aux étudiant.es d'analyser un ou plusieurs jeux de données à la maison
avec une correction co-construite par l'ensemble du groupe de TD lors de la séance suivante, ceci permettant
aux étudiant.es de valider leurs acquis en vue de l'examen terminal.
PRE-REQUIS
Utilisation du logiciel R (-Studio) ; Bases en analyses statistiques
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Bases en modèles linéaires généralisées (UE M1)
RECOMMANDES
Adéquation objectifs-ressources ; Puissance statistique ; Stratégie d'échantillonnage ; Modèles linéaires
MOTS-CLEFS
généralisées ; Modèles mixtes ; Sélection de modèles
HEURES
REPARTITION
2 heures CM ; 28 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100 % ET ©5LBE

61
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE305) Démarche experte en écologie
Responsable 1 Virginie BALDY Email 1 [email protected]

Responsable 2 Catherine Fernandez Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC3 (Appliquer) : Concevoir, gérer et animer, de façon individuelle ou collaborative, un projet scientifique en écologie et/ou biologie
évolutive, et construire son projet professionnel.
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Les objectifs de cette UE sont, à travers une approche pédagogique par projet : ; Connaitre et maitriser la
démarche scientifique, les financements possibles et l'encadrement institutionnel nécesssaires au montage d'un
OBJECTIFS projet de recherche en sciences écologiques ou d'un projet d'aménagement/conservation/restauration ; ; Savoir
réaliser une expertise naturaliste/environnementale et appliquer la réglementation en termes de conservation
(cette expertise peut être le thème du projet d'aménagement/conservation/restauration).
Démarche scientifique, synthèse bibliographique, recherche de sources de financements, rédaction et
SAVOIR-FAIRE présentation de projet, communication scientifique, travail en groupe, application de la réglementation
spécifique en écologie et conservation
Sciences écologiques, biodiversité, fonctionnement des écosystèmes, services écosystémiques, conservation,
CONNAISSANCES
réglementation spécifique en écologie et conservation
Contenus - Programme détaillé
1) Présentation des objectifs de l'UE et des attentes en termes d'acquisition de connaissnaces, de savoir faires
et de restitution ; ; 2) Présentation de la démarche scientifique, du contexte institutionnel, des sources de
financements (e.g. appel à projet, appel à manifestation d'intérêt), méthodes de restitution (communication
CONTENU orale et écrite, médiation) ; ; 3) Choix du sujet sur lequel portera le projet en concertation avec les enseignants :
thématique de recherche en sciences écologiques, ou projet d'aménagement/conservation/restauration ; ; 4)
Restitution intermédiaire sur l'état d'avancement du projet (sujet proposé et démarche scientifique) ; ; 5)
Restitution finale.
PRE-REQUIS
UE intégrative qui mobilise les connaissances et les compétences acquises en M1 BEE
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Recherche bibliographique
RECOMMANDES
projet scientifique/technique, biodiversité, fonctionnement des écosystèmes, financements, réglementation,
MOTS-CLEFS
conservation
HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 6 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 15
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 20 % CC + 80 % ET ©5LBE

62
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE305) Démarche experte en écologie
Responsable 1 Virginie BALDY Email 1 [email protected]

Responsable 2 Catherine Fernandez Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC3 "Appliquer" : Concevoir, gérer et animer, de façon individuelle ou collaborative, un projet scientifique en écologie et/ou biologie
évolutive, et construire son projet professionnel.
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Les objectifs de cette UE sont, à travers une approche pédagogique par projet : ; Connaitre et maitriser la
démarche scientifique, les financements possibles et l'encadrement institutionnel nécesssaires au montage d'un
OBJECTIFS projet de recherche en sciences écologiques ou d'un projet d'aménagement/conservation/restauration ; ; Savoir
réaliser une expertise naturaliste/environnementale et appliquer la réglementation en termes de conservation
(cette expertise peut être le thème du projet d'aménagement/conservation/restauration).
Démarche scientifique, synthèse bibliographique, recherche de sources de financements, rédaction et
SAVOIR-FAIRE présentation de projet, communication scientifique, travail en groupe, application de la réglementation
spécifique en écologie et conservation
Sciences écologiques, biodiversité, fonctionnement des écosystèmes, services écosystémiques, conservation,
CONNAISSANCES
réglementation spécifique en écologie et conservation
Contenus - Programme détaillé
1) Présentation des objectifs de l'UE et des attentes en termes d'acquisition de connaissnaces, de savoir faires
et de restitution ; ; 2) Présentation de la démarche scientifique, du contexte institutionnel, des sources de
financements (e.g. appel à projet, appel à manifestation d'intérêt), méthodes de restitution (communication
CONTENU orale et écrite, médiation) ; ; 3) Choix du sujet sur lequel portera le projet en concertation avec les enseignants :
thématique de recherche en sciences écologiques, ou projet d'aménagement/conservation/restauration ; ; 4)
Restitution intermédiaire sur l'état d'avancement du projet (sujet proposé et démarche scientifique) ; ; 5)
Restitution finale.
PRE-REQUIS
UE intégrative qui mobilise les connaissances et les compétences acquises en M1 BEE
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Recherche bibliographique
RECOMMANDES
projet scientifique/technique, biodiversité, fonctionnement des écosystèmes, financements, réglementation,
MOTS-CLEFS
conservation
HEURES
REPARTITION
6 heures CM ; 0 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 24
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 20 % CC + 80 % ET ©5LBE

63
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 6
Intitulé UE (BE306) Mise en ouvre de la démarche scientifique : écoles de terrain collaboratives
Responsable 1 Virginie Baldy Email 1 [email protected]

Responsable 2 Alexandre Millon Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC3 (Appliquer) : Concevoir, gérer et animer, de façon individuelle ou collaborative, un projet scientifique en écologie et/ou biologie
évolutive, et construire son projet professionnel.
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
OBJECTIFS Intégration de la démarche scientifique en écologie
Collaboration avec un partenaire de recherche/gestion ; Recherche bibliographique ; Définition d'une
problématique scientifique originale (fondamentale ou appliquée) ; Elaboration d'une stratégie
SAVOIR-FAIRE
d'échantillonnage ; Mise en ouvre d'une collecte de données ; Analyses statistiques & interprétation des
résultats ; Rédaction scientifique (anglais optionnel)
CONNAISSANCES Démarche scientifique

Contenus - Programme détaillé

Cette UE a un double ojectif. Dans un premier temps, il sera proposé aux étudiant-e-s une mise en situation
réelle permettant la mobilisation des principes d'une démarche scientifique pertinente, et son application dans
un cadre de recherche appliquée en écologie. Le cour de cette UE repose sur la mise en place, par les étudiants
eux-mêmes, d'une collaboration avec une structure de gestion de l'environnement (e.g. Parcs Nationaux,
Fondation Tour du Valat, Réserve Naturelle, Ville de Marseille, associations). Les étudiant-e-s vont co-
construire, avec le gestionnaire, une problématique de recherche appliquée dès la rentrée et préparer une
CONTENU
école de terrain réalisé sur 5 jours fin septembre-début octobre. Au cours de celle-ci, les étudiant-e-s
définissent les objectifs spécifiques, la stratégie d'échantillonnage et assurent la collecte de données. L'analyse
statistique de ces données, leur interprétation pour répondre clairementaux questions posées la rédaction du
rapport final constitueront un fil rouge tout au long du S3, en interaction avec les enseignements délivrées dans
les autres UEs. Des ateliers de communication scientifique (rédaction et présentation orale, en anglais ou en
français selon le choix de l'étudiant-e) viendront également alimenter les points d'étape réguliers.
PRE-REQUIS Principes de base en écologie ; Lecture de l'anglais scientifique ; Base rédactionnelle scientifique ;
OBLIGATOIRES Appréhension de la démarche scientifique globale
PRE-REQUIS
Analyses statistiques
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS démarche scientifique ; mesures de terrain ; traitement des données

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 0 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 60
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 65 % CC + 35% ET ©5LBE

64
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE307) Modélisation statistique pour l'écologie fonctionnelle et spatiale
Responsable 1 Mathieu Santonja Email 1 [email protected]

Responsable 2 Eric Meineri Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC2 (Construire) : Déterminer, développer et appliquer des méthodes dédiés à l'analyse des objets biologiques et écologiques
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Devenir autonome dans la mise en place et l'interprétation d'analyses statistiques de niveau avancé utilisées en
OBJECTIFS
écologie fonctionnelle et spatiale
- Choisir parmi un panel les outils et les modèles statistiques les plus appropriés à l'écologie fonctionelle, à
l'aplication de modèles de répartition et à l'analyse de données spatialisées en écologie ; ; - Maitriser les
SAVOIR-FAIRE méthodes d'automatisation et de répétition d'analyses via l'utilisation de boucles ; ; - Découvrir des méthodes
non-paramétriques pour les estimations d'erreurs et la validation de modèles statistiques ; ; - Savoir synthétiser
et représenter graphiquement et spatialement les résulats obtenus ; ; - Pratiquer le logiciel R.
CONNAISSANCES Conception, mise en place et interprétation de modèles et d'analyses statistiques de niveau avancé

Contenus - Programme détaillé

- Modèles de répartitions d'espèces (SDM) ; - Modèles d'équations structurelles (SEM) ; - Apprentissage des
CONTENU
boucles dans R ; - Bootstraping, validation croisée et jack-kniffing
Principes de base en écologie ; maitrise des statistiques dispensée dans les UE « Traitement statistique des
PRE-REQUIS
données », « Traitement cartographique des données » et « Ecologie numérique », très bonnes capacités en
OBLIGATOIRES
programmation sous R
PRE-REQUIS
RECOMMANDES
Modèles statistiques, modélisation de distribution d'espèces, équations structurelles, boucles de
MOTS-CLEFS
programmation
HEURES
REPARTITION
8 heures CM ; 18 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 4
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100 % CC ©5LBE

65
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 6
Intitulé UE (BE308) Perturbations et conservation en milieux littoraux
Responsable 1 Christophe Lejeusne Email 1 [email protected]

Responsable 2 Catherine Fernandez Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC 1 Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'enseignement dispensé vise à connaitre et appréhender pour les milieux littoraux les enjeux écologiques des
OBJECTIFS perturbations de grande ampleur, ainsi que leurs conséquences sur les services écosystémiques, mais aussi
d'aborder les possibilités de conservation et restauration de ces milieux.
SAVOIR-FAIRE Approche synthétique et interdisciplinaire

CONNAISSANCES Perturbations et conservation en milieux littoraux

Contenus - Programme détaillé

Il s'agit d'une part de comprendre les mécanismes spécifiques des perturbations appliqués aux milieux littoraux
et d'autre part d'appréhender les conséquences écologiques de ces perturbations chroniques ou ponctuelles
sur la structure et la dynamique de fonctionnement des écosystèmes littoraux. Les perturbations abordées
CONTENU
seront notamment la fragmentation et la destruction des habitats, le changement climatique, les invasions
biologiques, la pollution et la contamination. Les enjeux et méthodes de conservation/restauration de ces
milieux seront abordés ainsi que les enjeux pour les services écosystémiques qu'ils rendent.
PRE-REQUIS
Interfaces littorales : structure et fonctionnement, Fonctionnement des écosystèmes
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Écologie des populations et communautés
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Perturbations ; écosystèmes littoraux ; conservation en milieu littoral

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 40 heures TD ; 20 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC +70 % ET ©5LBE

66
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 5
Intitulé UE (BE309) Analyses écologiques spatialisées 2
Responsable 1 Agathe Leriche Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Maîtriser les concepts et utiliser les savoirs
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de cette UE est d'apporter aux étudiants une compréhension approfondie et la capacité de mise en
ouvre de méthodologies d'analyses spatiales appliquées à l'écologie, en se focalisant sur celles particulièrement
OBJECTIFS
employées dans le cadre de la conservation et de la gestion (distribution d'espèces et estimation de taille de
populations en tenant compte de la détection imparfaite, évaluation de domaine vital.)
Mise en ouvre d'analyses statistiques et de modélisation spatiales avancées pour répondre à des
SAVOIR-FAIRE
questionnements écologiques, en mettant en oeuvre une démarche scientifique rigoureuse
CONNAISSANCES Compréhension des analyses statistiques et modélisation spatiales en relation avec les processus écologiques

Contenus - Programme détaillé

Manipulation et représentation des données dans l'espace sous R, concepts théoriques d'écologie spatiale,
analyses de patrons spatiaux (e.g. détection de phénomènes d'aggrégation d'individus), prise en compte de
l'auto-corrélation spatiale, concepts théoriques et mise en pratique des modèles de distribution d'espèces
CONTENU
(Species Distribution Model, Site-Occupancy), d'évaluation de taille de populations animales ou végétales
(Distance Sampling) incluant la prise en compte de la détectabilité, ainsi que de l'évaluation de taille de
domaines vitaux (analyse de données de tracking GPS).
PRE-REQUIS Programmation basique sous R ; connaissances statistiques correspondant à l'UE Ecologie Numérique du M1
OBLIGATOIRES BEE S2 et notamment des modèles linéaires
PRE-REQUIS
Compréhension des données spatiales et des manipulations basiques dans un logiciel de SIG type Qgis©
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Patron spatial ; autocorrélation spatiale ; SDM ; Site-Occupancy ; Distance Sampling ; tracking GPS ; R©

HEURES
REPARTITION
12 heures CM ; 18 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 16
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100 % CC ©5LBE

67
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 7
Intitulé UE (BE310) Biologie de la conservation et gestion adaptative
Responsable 1 Alexandre Millon Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Maitriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de répondre à
des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Les étudiant.es seront formé.es à la mise en ouvre de recherche-action dédiée à la préservation de la
OBJECTIFS
Biodiversité dans des contextes et pour des groupes taxonomiques variées.
Synthèse des connaissances scientifiques ; remobilisation des connaissances ; réalisation de projet ; restitution
SAVOIR-FAIRE
orale ;
CONNAISSANCES Démarche de gestion adaptative

Contenus - Programme détaillé

Un ensemble de CM présente le concept de gestion adaptative à travers ses 6 étapes-clés : 1- Définition des
objectifs quant à l'état du système d'intérêt via une démarche de co-construction impliquant l'ensemble des
parties prenantes, 2- Mise en ouvre de modalité de gestion alternatives, 3- Elaboration d'un modèle intégrant
les processus écologiques décrivant l'état du système, 4- Récolte de données renseignant l'état du système, 5-
Modélisation de l'état futur du système, sur la base des données récoltées, intégrant une mesure de
l'incertitude, 6- Prise de decision quant à la modalité de gestion à mettre en place et réitération à partir de
l'étape 2. Différents exemples de mise en ouvre dans une variété de contexte de gestion de la biodiversité en
CONTENU France et à l'international sont passés en revue. Le volet international est notablement renforcé par
l'intervention de 3 chercheur.ses développant de la recherche-action à l'étranger sur des thématiques variées
telles que la gestion des espèces invasives, l'analyse des réseaux d'interaction dans un contexte de zoonoses ou
encore la cohabitation humains/grands carnivores. Enfin, les étudiant.es réalisent un projet tutoré au sein
duquel ils doivent proposer une stratégie de recherche-action à développer pour résoudre un enjeu de
conservation de la biodiversité. Les étudiant.es devront mettre en ouvre les compétences acquises dans les
autres UEs pour réaliser ce projet et présentent à l'oral leur stratégie devant un ou plusieurs spécialistes. Ce
projet est également l'occasion de préparer l'examen terminal qui propose un exercice similaire, à l'écrit.
PRE-REQUIS
Concepts généraux en écologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Concepts en biologie de la conservation (UE M1)
RECOMMANDES
Dynamique de population, Risque d'extinction, Recherche-action, Développement durable, Conflit Homme-
MOTS-CLEFS
Biodiversité
HEURES
REPARTITION
16 heures CM ; 0 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 43
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100 % ET ©5LBE

68
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE311) Pratiques et acteurs de la gestion des espaces et des espèces
Responsable 1 Alexandre Millon Email 1 alexandre.millon@ univ-amu.fr

Responsable 2 Agathe leriche Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Maitriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de répondre à
des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Cette UE a pour objectif i) de donner aux étudiants la vision du réseau des principaux organismes de la gestion et
de la conservation de la Biodiversité en France, de leur fonctionnement et de leurs interactions, ii) de renforcer
OBJECTIFS
leur culture générale sur les pratiques de gestion et de conservation via la présentation par les organismes de cas
d'études concrets et un symposium sur les pratiques de gestion et de conservation au niveau international.
Synthèse des connaissances scientifiques ; remobilisation des connaissances ; restitution orale ; gestion de
SAVOIR-FAIRE
débats
CONNAISSANCES Connaissance du réseau d'acteurs de l'environnement et des pratiques de gestion et de conservation

Contenus - Programme détaillé

Rencontres avec les principaux acteurs de la gestion de la Biodiversité en France : des professionnels de la
gestion de la Biodiversité d'origines diverses (chercheurs, associations, espaces naturels protégés, bureaux
d'études, collectivités territoriales) proposent des interventions couvrant un large panel de disciplines, de
modèles d'études et de groupes taxonomiques: gestion des espèces invasives, chasse, typologie des habitats,
politiques régionales, plans nationaux d'action, bases de données naturalistes, réseaux collaboratifs, etc. Il est
demandé à chaque intervenant de présenter des cas d'étude concrets relatifs à des programmes de
CONTENU conservation d'espèces, d'espaces ou d'écosystèmes et également de présenter sa structure et les modalités de
recrutement au sein de celle-ci. ; Cette UE permet également aux étudiants d'acquérir une culture générale
concernant les pratiques de gestion des espaces et des espèces via des symposiums : chaque étudiant.e choisit
une thématique de gestion (e.g. conflits grands carnivores / activités humaines, gestion des espèces invasives,
impact de la fragmentation des paysages sur les populations, énergies renouvelables / biodiversité) en la
développant sur la base d'un panel de publications scientifiques qu'il/elle aura sélectionnées et dont il/elle
présente une synthèse à l'ensemble de la promotion avant d'animer un temps long d'échanges sur le sujet. ;
PRE-REQUIS
Concepts généraux en écologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Acteurs de l'environnement ; réseau professionnel ; débats ; culture générale en gestion et conservation

HEURES
REPARTITION
6 heures CM ; 24 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100 % ET ©5LBE

69
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE312) Droit de l'environnement et ERC
Responsable 1 Isabelle Lafffont-Schwob Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC3 Déterminer, développer et appliquer des méthodes
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Appréhender le droit de la planification de l'eau et le droit industriel appliqué à la protection de la biodiversité ;
OBJECTIFS
Réaliser un volet complet d'une étude d'impact sur une zone d'étude
Maitriser les bases du Droit de la planification de l'eau : SDAGE, SAGE, Contrats de milieux, aspects législatifs et
réglementaires), les PLU ,PLUI, ERC (sous forme de jeu de rôle): ; Réaliser le volet complet d'une étude
SAVOIR-FAIRE d'impact : contextualisation, bibliographie, définition de protocoles, inventaires/diagnostic sur une zone
d'étude, analyse des impacts, définition de mesures, cas particuliers, concertation avec porteurs de projet,
services de l'Etat et autres acteurs locaux (en collaboration avec des professionnels)
CONNAISSANCES Connaissancex en droit ; Maitrise de la séquence ERC

Contenus - Programme détaillé

Droit de la planification de l'eau : SDAGE, SAGE, Contrats de milieux, aspects législatifs et réglementaires)PLU
PLUI. ERC (sous forme jeu de role): réalisation du volet complet d'une étude d'impact, contextualisation,
CONTENU bibliographie, définition de protocoles, inventaires/diagnostic sur une zone d'étude, analyse des impacts,
définition de mesures, cas particuliers, concertation avec porteurs de projet, services de l'Etat et autres acteurs
locaux(en collaboration avec des professionnels)
PRE-REQUIS
Bases en écologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Notions de droit
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Droit de l'environnement, Séquence ERC

HEURES
REPARTITION
8 heures CM ; 18 heures TD ; 4 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 70 % CC + 30 % ET ©5LBE

70
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE313) Ecologie urbaine
Responsable 1 Valérie Bertaudière-Montès Email 1 [email protected]

Responsable 2 Christine Robles Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC 1 Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
S’initier à l’écologie urbaine pour comprendre et savoir analyser les enjeux de gestion de la biodiversité dans les
OBJECTIFS
espaces urbanisés
SAVOIR-FAIRE Transposition des concepts de l’écologie das les milieux fortement urbanisés
Identifier les réseaux d’acteurs et savoir appréhender le fonctionnement et les enjeux de
CONNAISSANCES
maintien/conservation des espèces dans les écosystèmes fortements anthropisés
Contenus - Programme détaillé
Partie 1 : Historique : de Chicago jusqu’à aujourd’hui en France et ailleurs dans le monde. ; Partie 2 : Notions
d’écosystème(s) urbain(s) : au niveau climatique, artificialisation des sols. ; Partie 3 : Transposition des concepts
de l’écologie en milieu urbain.-Niche écologique, notion d’habitat, d’aire minimale, théorie de la perturbation,
relation aire-espèce, insularité. ; Partie 4 : Questionner les méthodes d’études en milieu urbain. ; Partie 5 : Les
grandes problématiques écologiques ( Connectivité et fragmentation des milieux, Espèces invasives,
CONTENU
Homogénéisation biotique, Conservation. ; Partie 6 : Les services écosystémiques : quels services sont associés
à la nature en ville. ; ; Les TD permettront à travers une revue bibliographique des différents taxons présents
en urbain, d’identifier les réseaux d’acteurs et d’aborder les différents enjeux autour de leur maintien et des
outils de leur gestion. Cette approche conduite en TD sera croisée avec l’UE de Sociologie des enjeux
environnementaux.
PRE-REQUIS
Connaisance des grands concepts en écologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Biodiversité, urbain, socio-écosystème, fonctionnement, conservation

HEURES
REPARTITION
18 heures CM ; 12 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

71
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE314) Gestion de la biodiversité aux différentes échelles du territoire
Responsable 1 Magali Deschamps-Cottin Email 1 [email protected]

Responsable 2 Benoit Geslin Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC 1 Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Faire dialoguer écologues et acteurs du territoire pour la gestion concertée de la biodiversité des territoires
OBJECTIFS fortements anthropisés. Connaître les réseaux d'acteurs. Approfondir les connaissance en gestion de la
biodiversité dans les espaces urbains.
Acquérir des outils pour la gestion de la biodiversité et le dialogue avec les acteurs du territoire. Savoir
SAVOIR-FAIRE
construire un réseau d'acteurs. Savoir appréhender la littérature scientifique et la littérature grise.
Connnaissances des acteurs et des outils de suivis et de gestion des territoires. Notions sur les plans de gestion,
CONNAISSANCES
leur mise en place et applications. Suivi et connaissance de la biodiveristé urbaine.
Contenus - Programme détaillé
Introduction sur l'Historique de la gestion de la biodiversité et regard à l'échelle mondiale sur la nature en ville.
; Partie 1 : Contexte et stratégies pour la Biodiversité. Histoire de l'aménagement des villes et de la place de la
biodiversité en ville. ; Partie 2 : Politiques d'aménagement (1/ Trames vertes, trames bleues, trames brunes,
trames noires, trames bleu marine, coefficients de biotopes. 2/ Intégration de la biodiversité dans les politiques
de Planification urbaine. 3/ Comment gérer les espèces protégées et les espèces invasives sur les territoires) ;
Partie 3 : Politiques de gestion (Code de l'arbre, Gestion différenciée, Permis de végétaliser et gestion des parcs
CONTENU
urbains...) ; Partie 4 : Observatoires, indicateurs et dispositifs divers de suivis (Les différents observatoires avec
leurs échelles, Sciences participatives, Espèces sentinelles, Indicateurs, indices. ). ; Partie 5 : Les agricultures en
ville - agriculture soutenable. ; Sorties : 1/ échange autour d'un plan de gestion sur la réserve de Donzère-
Mondragon ; mise ne place du plan de gestion (état initial, enjeux du territoire, gestion mise en place.) 2/parc
urbain et échange avec les gestionnaires de ces espaces sur la conduite de ces milieux et leurs usages humains
et non humains. ;
PRE-REQUIS
aucun
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Ecologie du paysage première année.
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Acteurs du territoire, aménagement, gestion des espaces

HEURES
REPARTITION
16 heures CM ; 8 heures TD ; 6 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

72
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE315) Sociologie des enjeux environnementaux contemporains
Responsable 1 Carole Barthélémy Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC 1 Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Connaissance et maîtrise des travaux sociologiques sur les enjeux environnementaux urbains ; Apprentissage et
OBJECTIFS maîtrise de l'enquête en sociologie ; Maîtrise d'une démarche interdisciplinaire entre sociologie et sciences du
vivant
Elaboration d'une démarche d'enquête en sociologie : problématisation et questions de recherche ;
constitution de la population d'enquête ; élaboration de la grille d'entretien ; réalisation d'entretiens semi-
SAVOIR-FAIRE
directifs ; saisie et analyse des données recueillies. ; Articulation de connaissances issues de disciplines
différentes
CONNAISSANCES Résultats sociologiques au sujet des enjeux environnementaux urbains

Contenus - Programme détaillé

CM : enseignements de sociologie de l'environnement appliqués aux enjeux urbains : Sociologie et
environnement urbain : une histoire de représentations sociales et de savoirs / La gestion de la nature en ville :
CONTENU actions publiques et contradictions / Les habitant-e-s et la nature en ville : pratiques et inégalités sociales ; TD :
réalisation d'une enquête auprès d'acteurs engagés dans des dispositifs de gestion de la nature en ville. Ce TD
sera croiser avec des travaux réalisés sur des taxons dans le cadre de l'UE Ecologie urbaine.
PRE-REQUIS
aucun
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
aucun
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Sociologie de l'environnement ; gestion de la nature ; espaces urbains

HEURES
REPARTITION
22 heures CM ; 8 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 40 % CC + 60 % ET ©5LBE

73
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 6
Intitulé UE (BE316) Ingénierie écologique
Responsable 1 Isabelle Laffont-Schwob Email 1 [email protected]

Responsable 2 Magali Deschamps-Cottin Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC 1 Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Mieux appréhender la génèse et les concepts d'ingénierie écologique. Mieux distinguer la diversité des courants
scientifiques et connaitre le réseau d'acteurs les mettant en application. Savoir évaluer la pertinence d'outils
OBJECTIFS
d'ingénierie écologique sur la base de retours d'expériences. Questionner les enjeux et limites des sollutions
fondées sur la nature.
Evaluer les outils d'ingénierie écologique (IE), diagnostic intégratif adapté aux contextes socio-
SAVOIR-FAIRE
environnementaux et écologiques. Enjeux et limites.
Ingénierie écologique pour la gestion de l'eau, pour la lutte contre l'érosion des sols et pour le maintien de la
CONNAISSANCES
biodiversité. Evaluation des outils d'IE mobilisés au prisme des services écosytémiques rendus.
Contenus - Programme détaillé
-Ingénierie écologique de l'échelle du site à l'approche paysagère. ; Concepts mobilisés ; Notions de Trames et
continuités (verte, bleue..) ; ; Apport de la biodiversité sur la qualité de l'eau, qualité de l'air et des
environnements urbains. ; Retours d'expériences à travers deux dispositifs expérimentaux (Parc Urbain des
CONTENU
Papillons, Citadelle de Marseille.) ; ; Evaluation de l'efficacité des barrières végétales contre l'erosion des sols : ;
Analyses non destructives et estimation de biomasse (terrain et TD) ; Biodiversité des haies et intérêts
écologiques.
PRE-REQUIS
Notion en écologie végétale
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Notion de trame, biodiversité
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Biodiversité, concepts, fonctions écosystémiques, eau, sol, air, génie végétal

HEURES
REPARTITION
32 heures CM ; 16 heures TD ; 12 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

74
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 6
Intitulé UE (BE317) Bioremédiation
Responsable 1 Stéven CRIQUET Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC 1 Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et en sciences de l'évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
OBJECTIFS Acquérir des connaissances récentes et approfondies en matière de bioremédiation incluant la phytoremédiation

SAVOIR-FAIRE Maîtrise des concepts récents de bioremédiation

CONNAISSANCES Connaissances approfondies des bases fondamentales de la bioremédiation et de leur mise en pratique

Contenus - Programme détaillé

Caractérisation des principaux polluants. Typologie des pollutions/contaminations. Devenir des contaminants
inorganiques et organiques dans l'environnement (hydrosphère, pédosphère et atmosphère). Concepts avancés
de présence, disponibilité (mobilité) et biodisponibilité. Concepts de spéciation chimique (espèces chimiques,
fractions échangeables) et de spéciation fonctionnelle (bioaccumulation, phytodisponibilité, biodisponibilité
pour l'humain). Notions de modèles mathématiques prédictifs de l'évolution de polluants. Interactions
fonctionnelles polluants/microorganismes. Ecophysiologie microbienne, mécanismes cellulaires microbiens
(bactériens et fongiques) de détoxification de polluants organiques (hydrocarbures aliphatiques et
aromatiques, pesticides, polluants émergents) et inorganiques (métaux, métalloïdes) : biominéralisation,
CONTENU biotransformation, bioassimilation, bioaccumulation, biofiltration, cométabolisme. Valorisation des fonctions
microbiennes et techniques actuelles de dépollution (in situ, hors sols, traitements de nappes etc.) :
biostimulation, bioaugmentation, bioleaching, bioventing, etc. Exemples de retours d'expériences de
bioremédiation, en particulier de polluants récalcitrants à la biodégradation microbienne, incluant des visites
d'entreprises de bioremédiation. ; Phytoremédiation et zooremédiation : avancées les plus récentes en
bioremédiation faisant appel aux végétaux et aux animaux. Concepts de phytoremédiation, phytodégradation,
phytoextraction, phytoaccumulation, phytostabilisation, phytovolatilisation, rhizodégradation, rhizofiltration.
Valorisation de la biomasse animale en bioremédiation. Exemples de cas concrets de phytoremédiation (ETMM,
micro-polluants, etc.), de phytoépuration d'effluents, etc.
PRE-REQUIS
Bases en biologie végétale, animale et en microbiologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Bases en physiologie végétale
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Pollutions, Bioremédiation

HEURES
REPARTITION
23 heures CM ; 21 heures TD ; 16 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

75
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3 CRD 3
Intitulé UE (BE318) Restauration, réhabilitation et intégration écologique
Responsable 1 Raphael Gros Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires, transdisciplinaires permettant d'identifier et de répondre
à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Au sens strict, la restauration écologique permet de réparer les écosystèmes que les activités humaines ont
détruits ou endommagés. Elle initie ou accélère le rétablissement de la composition spécifique, de la structure
de la communauté, ou encore du fonctionnement écologique d'un écosystème antérieur. Dans le contexte du
développement des infrastructures de production d'énergies renouvelables, la restauration écologique peut
servir de mesure des réductions des impacts et d'intégration environnementale. La restauration écologique fait
donc appel au génie écologique et nécessite une bonne connaissance de l'écologie fonctionnelle et évolutive des
OBJECTIFS
écosystèmes ciblés, de la perturbation en cours et le choix de l'écosystème de référence pour guider la
réalisation et le suivi du projet de restauration. L'UE Restauration, réhabilitation et intégration écologique vise à
développer les connaissances nécéssaires pour permettre 1) la compréhenssion des stratégies et techniques de
restauration, de réhabilitation ou d'intégration écologique, 2) l'identification des acteurs impliqués dans un
projet de restauration écologique et 3) le déploiement des différentes étapes d'une action de restauration
écologique (du diagnostic à l'évaluation des résultats).
SAVOIR-FAIRE Savoir restaurer, réhabiliter ou recréer des habitats ou des paysages dégradés.
Les concepts abordés sont ceux de résilience, d'état stable alternatif, d'hystérèse, d'écosystèmes de référence,
CONNAISSANCES de fonctions écologiques, de systèmes socio-écologiques. Les techniques d'ingénierie écologique utilisés en
restauration, les acteurs, les objectifs et l'évaluation des opérations de restauration sont également décrites.
Contenus - Programme détaillé
Perturbations et intégrité des écosystèmes (résilience, état stable alternatifs, seuils, théorie des filtres.) ;
Restauration, réhabilitation, renaturation : histoire et objectifs ; Écosystèmes et trajectoires de référence ;
Techniques de restauration écologique et notamment rôle des espèces ingénieurs ; Évaluation de la
CONTENU
restauration ; Restauration des terrains de montagne (sortie et TD) ; Restauration et réhabilitation des steppes
méditerranéennes (sortie Crau) ; Restauration et intégration écologique des centrales photovoltaïques ; Acteurs
de la restauration écologique
PRE-REQUIS
Connaissances approfondies en écologie générale
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Connaissances approfondies en ingénierie écologie
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Restauration, réhabilitation, (socio-)écosystèmes, référence, seuil, perturbation

HEURES
REPARTITION
12 heures CM ; 0 heures TD ; 12 heures TP PEDAGOGIE 6
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 20 % CC + 80 % ET ©5LBE

76
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3TE CRD 3
Intitulé UE (BE302TE) Interactions biotiques
Responsable 1 Anne Bousquet-Mélou Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de ce cours est d'approfondir les connaissances sur les interactions inter et intra espèces et de
développer les connaissances des nouveaux outils d'analyse des réseaux d'interaction. L'approfondissement des
OBJECTIFS
connaissances portera également sur la réponse des interactions et réseaux d'interactions face aux
perturbations anthropiques.
Analyses statistiques des réseaux d'interaction ; modélisation ; synthèse bibliographique des principales
SAVOIR-FAIRE hypothèses abordées dans les différentes parties du cours, présentation orale devant le groupe, réalisation
d'une affiche scientifique.
Connaissances approfondies dans les interactions biotiques, réponse des interactions biotiques face aux
CONNAISSANCES
changements globaux.
Contenus - Programme détaillé
Réseaux d'interactions: Nouvelles méthodes d'analyses ; Symbioses dans les sols - approfondissement ;
CONTENU
Interactions hôtes-Parsitoides ; Interactions faune sol ; Interactions tricheuses ; chimie des invasions
PRE-REQUIS Notions de bases en écologie ; UEs écologie chimique et Ecologie Comportementale et Interactions Biotiques,
OBLIGATOIRES connaissance de master 1 en statistiques uni et multivariées,
PRE-REQUIS
Connaissance du logiciel R. Connaissances en écologie fonctionnelle.
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Interactions biotiques - Réseaux - Processus écologiques - Perturbations anthropiques

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 0 heures TD ; 6 heures TP PEDAGOGIE 24
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 30 % CC + 70 % ET ©5LBE

77
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3TE CRD 6
Intitulé UE (BE303TE) Fonctionnement des écosystèmes, changements globaux et services écosystémiques
Responsable 1 Virginie Baldy Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC1 - Maîtriser les concepts et utiliser des savoirs scientifiques disciplinaires et transdisciplinaires permettant d'identifier et de
répondre à des problématiques en sciences écologiques et évolution
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
L'objectif de cette UE est d'approfondir les connaissances sur les concepts en écologie fonctionnelle, et les
impacts des changements globaux sur ces écosystèmes et les services qu'ils offrent à la société. Une partie de cet
OBJECTIFS
enseignement est interdisciplinaire, avec des approches d'ethno-écologie. Il est essentiellement basé sur de la
pédagogie active.
Analyses statistiques adaptées à l'étude des processus fonctionnels ; mesures d'indicateurs fonctionnels sur des
SAVOIR-FAIRE
sites expérimentaux forestiers et littoraux méditerranéens
CONNAISSANCES Ecologie fonctionnelle

Contenus - Programme détaillé

Cette UE propose de présenter les grands concepts théoriques en écologie fonctionnelle permettant d'étudier
la réponse des écosystèmes aux changements globaux (e.g. hypothèses de diversité-stabilité, gradient de
CONTENU stress). Il sera abordé, avec un focus sur les forêts et le littoral méditerranéen, la vulnérabilité et la résilience
des écosystèmes face aux changements environnementaux, avec les notions de mitigation, d'adaptation et de
gestion adaptative en utilisant les outils de modélisation afin de prédire la dynamique de ces écosystèmes.
PRE-REQUIS
Notions de bases en écologie ; UE de Master 1 BEE écologie fonctionnelle et écosystèmes
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Maîtrise de l'outil R, travail en groupes, approche par projet
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Ecologie fonctionnelle, changements globaux, services écosystémiques, forêt, littoral, Méditerranée

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 40 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 20
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

78
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3TE CRD 6
Intitulé UE (BE304TE) Modélisation statistique des systèmes écologiques
Responsable 1 Mathieu Santonja Email 1 [email protected]

Responsable 2 Eric Meineri Email 2 [email protected]

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC2 - Déterminer, développer et appliquer des méthodes et des outils dédiés à l'analyse des objets biologiques et écologiques
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Devenir autonome dans la mise en place et l'interprétation d'analyses statistiques de niveau avancé portant sur
OBJECTIFS
le fonctionnement des systèmes écologiques
- Choisir parmis un panel les outils et modèles statistiques les plus appropriés à l'analyses de données
écologiques ; - Être en mesure de mettre en place un ensemble de modèles statistiques pour répondre à des
hypothèses précises ; - Adapter les analyses aux spécificités et la compléxité de l'échantillonage utilisé sur le
SAVOIR-FAIRE
terrain ; - Savoir identifier les effets fixes et les effets aléatoires en modélisation statistique ; - Savoir
interpréter de manière précises les résulats obtenus ; - Savoir synthetiser et représenter graphiquement et
spatialement les résulats obtenus ; - Pratiquer le logiciel R
CONNAISSANCES Conception, mise en place et interprétation de modèles et analyses statistiques de niveau avancé

Contenus - Programme détaillé

- Modèles linéaires à effets mixtes (LMM) ; - Modèles linéaires généralisés à effets mixtes (GLMM) ; - Modèles
CONTENU additifs généralisés (GAM) ; - Modèles de répartitions d'espèces (SDM) ; - Modèles d'équations structurelles
(SEM)
Principes de base en écologie ; maitrise des statistiques dispensée dans les UE « Traitement statistique des
PRE-REQUIS
données », « Traitement cartographique des données » et « Ecologie numérique », Bonnes capacités en
OBLIGATOIRES
programmation sous R
PRE-REQUIS
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Modèles statistiques, LMM, GLMM, GAM, SDM, SEM

HEURES
REPARTITION
12 heures CM ; 0 heures TD ; 48 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 50 % CC + 50 % ET ©5LBE

79
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S3TE CRD 6
Intitulé UE (BE306TE) Mise en ouvre de la démarche scientifique : écoles de terrain collaboratives
Responsable 1 Mathieu Santonja Email 1 [email protected]

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

BCC3 - Concevoir, gérer et animer de façon collaborative un projet scientifique et écologie et construire son projet professionnel
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Mise en situation des étudiants du Master BEE TE (OSU Institut Pythéas, Université Aix Marseille) et de ceux du
Master GEDD de la Faculté des Sciences Ben M'Sick (Université Hassan 2 de Casablanca) dans le cadre d'une
école de terrain commune « Nord-Sud de la Méditerranée ». Cette école aura pour objectif l'étude croisée des
forêts de chênes lièges françaises et marocaines afin i) de comparer les menaces et opportunités concernant la
OBJECTIFS
biodiversité et les savoirs locaux dans un contexte de changement climatique et de changement d'usage et ii)
d'identifier les processus d'adaptation de ces socio-écosystèmes. Des approches interdisciplinaires abordées via
une pédagogie active favoriseront la formation en compétences transversales indispensables pour la mise en
place de projets de durabilité.
- Savoir travailler en groupe ; ; - Diagnostics écologiques et détection de problèmes découlant des changements
globaux ; ; - Définition d'une problématique scientifique originale ; ; - Élaboration d'une stratégie
SAVOIR-FAIRE
d'échantillonnage et mise en ouvre d'une collecte de données ; ; - Analyse et interprétation de manière précises
des résultats obtenus ; ; - Synthèse et restitution des résultats obtenus sous forme de présentation orale.
Concepts en écologie fonctionnelle, gestion forestière, gestion des socio-écosystèmes, ethnoécologie et gestion
CONNAISSANCES
de projet de niveau avancé
Contenus - Programme détaillé
En M2, les étudiants se focaliseront sur les problèmes rencontrés dans les forêts de chêne liège sur la rive Sud
de la Méditerranée (Maroc), et plus particulièrement sur les problèmes de surexploitation et dégradation de
ces forêts. ; Adaptation des forêts au changement climatique : Evaluation de l'indice de biodiversité potentielle
(IBP) ; vulnérabilité des forêts méditerranéennes face aux changements globaux ; concepts de résilience,
CONTENU
d'atténuation et d'adaptation, en utilisant des outils de gestion adaptative et de modélisation pour prédire la
dynamique de ces écosystèmes. ; Science de la durabilité : Défis complexes et impact des changements globaux
sur les savoirs locaux autochtones ; menaces sociales, économiques et écologiques liées à la diversité
bioculturelle. Perte de la langue, érosion des savoirs locaux autochtones.
PRE-REQUIS
Notions de bases en écologie ; UE de Master 1 BEE Démarche scientifique en écologie
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
Connaissances approfondies en écologie fonctionnelle, écologie forestière et en sciences du sol.
RECOMMANDES
Ecologie forestière, ethnobiologie, gestion des socio-écosystèmes, changements globaux, durabilité, forêt
MOTS-CLEFS
méditerranéenne
HEURES
REPARTITION
6 heures CM ; 6 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 48
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 25%CC1+25%CC2+50%CC3 ; (CC3 = oral terminal) ©5LBE

80
Deuxième année, semestre 4

81
Mention Inter-mentions SEM M2S4 CRD 30
Intitulé UE (TC6) Stage de fin d'études en laboratoire ou en entreprise
Responsable 1 Porteurs de mention Email 1

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

Concevoir, gérer et animer un projet (BEE)
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
Apprendre à conduire un projet scientifique de façon autonome sous encadrement d'un scientifique : rédiger et
OBJECTIFS évaluer la faisabilité d'un projet ; rédiger une esquisse de projet ; conduire la recherche, analyser et synthétiser
les résultats sous forme de rapport qui suit les conventions d'un article scientifique standard.
Savoir organiser son temps et évaluer la faisabilité d'un projet de recherche en écologie ; suivre les étapes d'un
SAVOIR-FAIRE
projet de façon autonome ; savoir rédiger des textes scientifiques.
Connaissances sur la démarche scientifique ; savoir citer des travaux scientifiques ; savoir écrire des
CONNAISSANCES introduction, méthodes, résultats et discussions ; connaissances en statistiques pour analyser des données en
écologie ; connaissances en informatique.
Contenus - Programme détaillé
1) Recherche de sujet de stage en écologie ; 2) Réunion de cadrage pour le suivi du projet 3) Un TD sur les
modalités de l'écriture de rapport (structure du rapport, consignes de rédaction, exemples d'écriture) 4) rendu
CONTENU d'un pré-projet à la fin du premier mois du stage 5) rendu d'un commentaire sur le pré-projet 6) rendu du
rapport final 7) soutenance et retour sur le rapport réalisé ; il y a 5 h de TD en présentiel, les 27h restants x 2
groupes sont pour les encadrants à la hauteur d'une heure par étudiant encadré.
PRE-REQUIS Connaissances en statistiques pour analyser des données en écologie ; connaissances en informatique
OBLIGATOIRES (word/R) connaissances en écologie.
PRE-REQUIS
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS Stage M2 ; Projet scientifique ; Entreprise ; Recherche ; Laboratoire

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 0 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C 100 % ET ©5LBE

82
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S4 CRD 20
Intitulé UE (BE401) Stage en entreprise
Responsable 1 Email 1

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

A compléter
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
OBJECTIFS A compléter

SAVOIR-FAIRE A compléter

CONNAISSANCES A compléter

Contenus - Programme détaillé

CONTENU A compléter

PRE-REQUIS
A compléter
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
A compléter
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS A compléter

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 0 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 0
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C XX % CC + XX % ET ©5LBE

83
Mention Biodiversité, écologie et évolution (BEE) SEM M2S4 CRD 3
Intitulé UE (BE402) Socle pour la transition écologique
Responsable 1 Email 1

Responsable 2 Email 2

Compétences visées - Acquis d’apprentissages de la mention

A compléter
Objectifs et acquis d’apprentissages spécifiques de l’UE
OBJECTIFS A compléter

SAVOIR-FAIRE A compléter

CONNAISSANCES A compléter

Contenus - Programme détaillé

CONTENU A compléter

PRE-REQUIS
A compléter
OBLIGATOIRES
PRE-REQUIS
A compléter
RECOMMANDES

MOTS-CLEFS A compléter

HEURES
REPARTITION
0 heures CM ; 0 heures TD ; 0 heures TP PEDAGOGIE 30
CM/TD/TP
ACTIVE
M3C XX % CC + XX % ET ©5LBE

84
85