Mémoire Final
Mémoire Final
Présenté Par :
1) M. Mouloud BENOUSSAD
2) M. Zoubir DRIF
Tout d’abord الحمد هلل رب العالمينle tout puissant de nous avoir accordé la puissance et
la volonté et la patience pour la réalisation de ce travail.
Ce travail a été réalisé au sein du Laboratoire pédagogique de l’université de Ain
Temouchent.
On remercie tout d’abord le Dr lachachi MERIEM notre encadreur pour tous les
efforts fournis durant toute cette période de travail, sa patience son investissement
et sa bienveillance ont fait que ce travail fut abouti avec succès, Merci beaucoup à
vous chère Madame, votre bienveillance a fait que nous nous somme surpasser afin
de fournir le maximum d’effort possible, vous avez notre éternel reconnaissance
gratitude.
Je dédie tout d’abord ce travail a mes deux grand père وتعالى سبحانه برحمته يرحمهم هللا, c’est
les personnes qui ont le plus compté de ma vie, leur éducation et leurs conseils m’ont
toujours été d’une aide précieuse, ils ont fait de moi ce que je suis aujourd’hui, ils sont
plus de ce monde, mais il reste bien vivant dans ma tête et mon cœur, مثواكم ويجعل يرحمكم هللا
الجنة.
Je dédie ce travail bien sûr à mes parents qui m’ont toujours soutenue, encourager et
poussée vers l’avant pour que je puisse à la hauteur des exigences je ne vous
remercierais jamais assez pour tout ce que vous avez fait, j’espère juste être à la hauteur
de vos exigences et j’espère que vous saurez fière de moi, merci pour tout.
Ce travail est dédié également à mes deux grand-mères qui ont fait en sorte que je sois a
la hauteur et m’ont toujours poussée depuis la plus tendre enfances pour que je soie
meilleure encore plus meilleure.
Je le dédie également a ma grand-mère paternelle et ma tente Dalila qui ne sont plus de
ce monde mais qu’elle reste bien vivante dans ma mémoire et mon cœur ويجعل يرحمكم هللا
الجنة مثواكم.
A mes oncles paternelle Malik, Omar, Amine et ma tante Aziza, Ils ont été bien plus que
des oncles et une tente, je ne vous remercierais jamais assez pour tout ce que vous avez
fait pour moi, vous avez tous une grande part dans ma réussite ma réussite, chacun de
vous a joué un rôle important et fait en sorte que je soie meilleure, merci pour tous.
A mes oncles Maternelle Meftahi Hassen, Mohammed et Larbi qui m’ont été d’un grand
soutien moral pour la réussite de mes études et dans ma vie active, une dédicace spéciale
a Larbi qui a toujours été pour moi un modèle de réussite et ma montré le chemin de
cette réussite et m’a prouvé que tout été possible a condition de travaillé et faire des
sacrifice merci beaucoup tonton
A mes tente Saliha et Lynda qui ont toujours cru en moi et a ma réussite, leur soutien
moral m’a toujours poussé a ce que je sois meilleure merci beaucoup à vous.
A ma sœur qui m’a été toujours d’un soutien moral, aussi modeste soie-t-il mais qui été
important pour moi, merci frangine.
A mes cousins, Benoussad Omar, Fouad, Cherif et le banjamain Iles, pour moi vous
n’êtes pas des cousins mais les frères que je n’ai pas eus, j’espère être fier de vous autant
que vous être fier de moi aujourd’hui.
A mes cousine, Benoussad Ines, Fetta, et la petite Ilhem j’espère être fier de vous, sans
oublier Mefathi Ines et Eline, et Boudrari Sarah.
A mes cousin Meftahi Ghiles, Samy, et le benjamain Yanis pour vos encouragements et
votre soutien, merci pour votre soutien, sans oublier mes cousin et cousine Ait Maamar
Larbi Zoubir Massinissa, Mohamed et Tahar, Asma et Yasmine pour tout votre soutien
moral qui m’a fait progresser.
Au épouse de mes oncles qui ont été d’une aide précieuse durant mon parcours.
A mon cher Amis, Bousahla Mouhamed que je considéré comme un frère, tu as été plus
qu’un ami je ne te remercierais jamais assez pour tout ce que tu as fait pour moi, ton
soutien surtout dans le moment difficile m’a été bénéfique, merci mon frère.
A mes Amis d’enfance Said bensedik et Oussama berichi merci pour tous les moments
passé ensemble.
A mon cher amis bourgir ilies qui a été présent dans les moments difficile
Une dédicace spéciale a Monsieur Gerouji Said mon professeur de SNV qui a été le
moteur de ma jeune carrière et qui a su tirer le meilleur de moi-même, merci maitre
j’espère être a la hauteur de vos Esperance.
Une dédicace spéciale a NZ, une personne chère,qui m’a été d’un grand soutien durant
mon parcours universitaire et une sources d’inspiration qui me poussait a être
meilleure, Merci beaucoup.
A mon binôme Drif zoubir, Malgré tout le stresse que tu m’a provoqué en plus des
angoisse merci comme même pour cette collaboration.
A tous ceux qui me connaissent.
Dédicace :
{ ZOUBIR }
6-Etude microscopique……………………………………………………………………20
5.2. Résultat de l’analyse microscopique des colonies obtenu sur Mac conckey du prélèvement
de la surface de la paillasse à côté du robinet du laboratoire 07………………………………39
IND: Test Indole - production d'indole à partir de tryptophane par l'enzyme tryptophanase.
Réactif - L'indole est détecté par l'ajout du réactif de Kovac.
Figure 5 : prélèvement de l’air par la méthode du bio collecteur sur dans le compartiment à
côté des étuves bactériologiques……………………………………………………………..13
Figure 16 : Résultat du test de coagulase des colonies isolées sur Chapman du prélèvement de
la poignée de porte…………………………………………………………………………….40
Listes des tableaux
Tableau 9 : Résultat de la méthode d’écouvillonnage sur Milieu Mac Conckey après 48 Heures
d’incubation…………………………………………………………………………………..32
Tableau 13: Résultat après stérilisation par évaporation de l’eau et par le formol par la méthode
de sédimentation sur boite …………………………………………………………………....42
Tableau 14: Résultat obtenu après stérilisation par des détergents, par la méthode
d’écouvillonnage sur milieu Chapman………………………………………………………..43
Tableau 15: Résultat obtenu après stérilisation par des détergents par la méthode
d’écouvillonnage sur milieu Mac Conckey …………………………………………………..45
Tableau 16: Résultat obtenu après stérilisation par des détergents par la méthode
d’écouvillonnage sur milieu Gélose nutritive…………………………………………………48
Tableau 17: Bactérie isolée a partir de la paillasse du robinet et leur origine……………….48
Introduction
Introduction
1- Introduction
L’air et les surfaces sont naturellement contaminés par des micro-organismes d’origine
environnementale ou humaine (Parnell P, Wilcox MH. 2010).
La flore atmosphérique est constituée d’une flore de base, présente sur les supports que sont les
poussières, et composée d’organismes saprophytes résistant à la dessiccation et aux ultraviolets
: bactéries à Gram positif (Bacillus, Sarcines, etc.) et champignons filamenteux (Aspergillus,
Penicillium, Mucor, etc.), (Galvin S, et al. 2014).
La contamination des surfaces se fait par contact direct (mains) ou indirect (objets souillés)
avec l’homme, par dissémination d’eau (milieu de vie de nombreux micro-organismes
saprophytes), et par sédimentation des particules de l’air.
les objectifs de cette étude étaient d'évaluer la Charge microbienne dans le Laboratoire
pédagogique de biologie au Niveau de l’université de Ain Temouchent et les échantillons d'air
émis pendant les travaux effectué avec diverses techniques d’échantillonnage. Plus
précisément, nous nous sommes concentrés sur les bactéries totales, la diversité bactérienne qui
peut se trouver sur ce lieu de travail
L’analyse microbiologique de l’air et des surfaces fait partie des examens les plus connue et
reconnu dans le domaine de la microbiologie, du fait de son importance dans l’évaluation des
risques sanitaire liée aux contaminations microbiennes, et de son importance dans la prévention
de la santé humaine d’une part, et d’autre part par rapport à la qualité expérimentale lors des
1
Introduction
manipulations qui peuvent faussée les résultats des analyses effectué au sein d’un laboratoire
d’analyse microbiologique.
Ces analyses ont pour buts d’évaluée le taux et la charge de contamination, mais également
la recherche spécifique et sélectif de certaine bactérie qui peuvent être pathogène et nuisible a
la santé humaine.
Pour cela, plusieurs méthodes peuvent être utilisées pour dénombrer et ciblé des germes
Potentiellement pathogènes, par leur efficacité et leur facilité de manipulation, afin d’obtenir
de bons résultats.
C’est dans ce cadre que nous proposons cette étude et qui consiste à :
Une recherche et une identification des bactéries isolées a partir de l’air et différentes surfaces
du lieu d’étude.
2
Synthèse
bibliographique
Synthèse bibliographique
Les objectifs du contrôle sont de garantir une bonne qualité hygiénique et une bonne
qualité marchande et de minimiser les pertes. Ils doivent permettre d’éviter la présence de
microorganismes pathogènes dans les produits afin de ne pas risquer une altération de la qualité
hygiénique des produits finis ou, au moins de détecter ces microorganismes s’ils sont présents
(scriban, 1999).
Ce type de contaminants regroupe les micro-organismes (MO) vivants tels que les
levures, moisissures, bactéries et virus. Ces organismes ont besoin, pour se développer et se
multiplier, de conditions d’humidité et de chaleur. Nous devons donc veiller à maitriser ces
différents paramètres afin de minimiser le risque de développement de MO. La présence de MO
dans les préparations stériles peut engendrer différents problèmes. D’une part si des MO
pathogènes ou toxiques sont présents, ils peuvent transmettre leur pouvoir pathogène ou toxique
(Ernst T, 1994).
3. Analyse de l’air
L’air est le premier des éléments indispensables à la vie, chose dont nous n’avons pas toujours
conscience, mais c’est aussi le plus soumis aux pollutions d’origines humaines. Au cours des
dernières années, la multiplication des alertes épidémiques dues aux aérosols microbiens et les
3
Synthèse bibliographique
L'air est un important vecteur de contamination. On y trouve surtout des bactéries à Gram +
(Micrococcus, Bacillus), et des spores de champignons. Les micro-organismes de l'air sont
présents sur des particules de plus grande taille (squames, microgouttelettes de salive,
poussières).
4
Synthèse bibliographique
La dissémination des microorganismes se fait à partir de réservoirs humains d’une part, les
microbiologistes et le personnel du laboratoire où de réservoirs environnementaux d’autre part,
supports inserts (Surfaces, matériel, textiles) et fluides (air, eau, gaz). (Huart C, 2011).
⦁ Sources environnementales
⦁ Sources humaines
5
Synthèse bibliographique
La flore d’origine humaine est composée des bactéries émises par l’organisme humain,
essentiellement les flores commensales cutanées et éventuellement La flore digestive :
Staphylococcus coagulase négative notamment Staphylococcus epidermidis et Staphylococcus
hominis, Escherichia coli streptocoques et entérobactéries.
Elle résulte de l’inhalation de particules infectieuses véhicules par des aérosols. Les
aérosols sont constitués de goulette de liquide, ou de particules solides, détachées d’un produit
sous l’action de forces mécaniques (vibrations, pression…).
Elle peut être direct, par ingestion accidentelle a l’occasion d’un pipetage (à la bouche),
dont la pratique doit formellement proscrite tant pour les solutions chimiques que pour les
liquides biologiques.
Elle peut se faire par projection ou contact direct cutané, sur peau lésée (plaie,
Excoriations, lésions d’eczéma…), voie sur peau saine pour certaines bactéries qui peuvent
traverser celle-ci (brucella, leptospira, francisella…)
Elle peut être aussi le fait d’une projection sur des muqueuses, en particulier au niveau
des conjonctives oculaires très perméables aux transmissions infectées.
6
Synthèse bibliographique
Une boîte de Pétri contenant un milieu gélosé est laissée ouverte pendant une durée
prédéterminée afin de recueillir les particules par sédimentation (Figure 1). Cette méthode
simple à mettre en œuvre présente l’inconvénient majeur de la durée de prélèvement. (Nilson
S, et al 1983).
Des biocollecteurs d’air microbien sont utilisés afin de réaliser le prélèvement. Un certain
volume d’air est aspiré au travers d’un crible qui permet de faire s’impacter les MO et particules
sur une boîte de Pétri contenant un milieu gélosé. Le volume aspiré doit être représentatif de la
zone considérée. Le débit de l’air doit être suffisant pour pouvoir prélever 1 m3 d’air dans un
temps raisonnable et afin d’obtenir une vitesse d’impaction appropriée, et d’assurer l’impaction
des particules tout en assurant la conservation de la viabilité des particules. Cette méthode
nécessitant l’usage d’un équipement présente également l’inconvénient majeur de la durée de
prélèvement (BPF, 2011)
7
Synthèse bibliographique
Figure 2 : Méthode par aspiration pour réaliser un prélèvement d’air actif (ISO.2003)
C'est la technique la plus simple pour mettre en évidence les micro-organismes vivant dans
l'air qui nous entoure et que nous inhalons. Une boîte de Pétri, remplie d'un milieu gélosé nutritif
spécifique est laissée ouverte pendant 8h. Elle est placée ensuite à incuber plusieurs jours. Il
reste à dénombrer et identifier les colonies qui apparaissent à la surface du milieu.
Comme toute méthode faisant appel à des milieux gélosés, seuls les germes vivants
peuvent être isolés et le choix du milieu et de la température d'incubation sont déterminants.
Parmi les surfaces qui peuvent être source de contamination, on peut citer le sol, le plafond
et les parois de laboratoire. Leur contamination est avant tout à des apports par contact (quand
les gens les touchent) ou par sédimentation des contaminants aéroportés
Toutes les surfaces doivent faire l’objet d’un monitoring, que ce soient les sols, les murs
ou les surfaces des équipements. (US FDA, 2004)
8
Synthèse bibliographique
surfaces ouvertes (cloisons, plafonds, sols, mobiliers, équipements...) des surfaces fermées des
machines ou du matériel.
Les surfaces constituent un support pouvant recevoir et héberger à la fois des salissures et
des micro-organismes. Arrivés à proximité des surfaces réceptrices, par sédimentation ou par
contact, les micro-organismes peuvent adhérer par l’intermédiaire d’interactions physico-
chimiques, interactions qui dépendent des propriétés physico-chimiques de surface des micro-
organismes et du revêtement. La rugosité et la topographie de la surface jouent également un
rôle important sur le nombre de bactéries adhérentes.
En laboratoire de biologie, les laboratoires pédagogiques peuvent être contamines par des
micro-organismes provenant des échantillons (sang, selles, terre, eau…) ou des cultures
(moisissures, bactéries.). En outre, certains agents biologiques peuvent être introduits
involontairement dans les locaux par le biais d’objets (emballages, matériel de prélèvement…),
ou encore de personnes (vêtements).
Lorsque ces micro-organismes sont dispersés dans l’air (renversement accidentel d’un
flacon, utilisation de vortex…), ils peuvent contaminer des surfaces même éloignées (Meubles,
sols, murs…) ensuite, les micro-organismes prolifèrent lorsqu’ils trouvent des conditions
favorables.
9
Synthèse bibliographique
-une température optimale de croissance pouvant varier selon les micro-organismes (ceux
retrouvent chez l’homme préfèrent des températures situes autour de 37°C).
Lors de contacts avec les surfaces contamines, les micro-organismes sont capables de
pénétrer par les petites lésions de la peau ou à travers les muqueuses lorsque la personne porte
les mains aux yeux ou au nez.
⦁ Boîte contact
Il s’agit d’une boîte de Pétri possédant un ménisque de milieu de culture convexe. La boîte
est fixée à un appareil permettant une application facilitée sur la surface à contrôler.
⦁ Lame gélosée
Elle est recouverte de chaque côté par un milieu de culture. On applique directement le
milieu de culture sur la surface à contrôler.
10
Synthèse bibliographique
⦁ Pétri film
Il s’agit d’un milieu gélosé déshydraté placé entre deux films. On l’applique directement sur
la surface à contrôler après réhydratation.
Un écouvillon sec ou humidifié est frotté contre la surface à contrôler. Cet écouvillon sert
ensuite à ensemencer des milieux de culture. (Le Gallou F, et al 2017).
Cette technique consiste à utiliser une boîte de culture particulière dans laquelle le milieu
gélosé dépasse le bord de la boîte sous la forme d'un ménisque convexe. En appliquant ce
ménisque sur l'endroit suspect, une grande partie des germes restent "piégés" sur le milieu
gélosé. (Zureik M, et al 2002).
11
Matériel
et méthode
Matériel et méthode
2-(4) paillasses (3 paillasses comme poste de travail et une pour les travaux de nettoyage et
rangement du matériel)
12
Matériel et méthode
2. Prélèvement
2-1 Prélèvement des échantillons d’air
Figure 5 : prélèvement de l’air par la méthode du bio collecteur sur dans le compartiment à
côté des étuves bactériologiques
13
Matériel et méthode
14
Matériel et méthode
15
Matériel et méthode
La sédimentation C’est une technique ancienne qui a été très répandue et a constitué une
approche simple de l’aérocontamination. Cette technique consiste à exposer de façon passive
un support nutritif ou non (boite de Pétri, plexiglas, gel) à la chute naturelle des spores sous
l’effet de la gravitation. Outre les avantages liés à un coût faible, à l’absence d’appareillage.
Cette technique permet d’exposer les supports pendant des durées importantes dans la limite
toutefois de la dessiccation des gels et des milieux. Cependant le volume d’air ainsi traité n’est
pas mesurable et dépend largement des flux au sein de l’espace échantillonné. Les
inconvénients principaux qui ont fait abandonner cette méthode sont liés à la remise en
suspension des spores les plus petites favorisant la sélection des spores les plus volumineuses.
La reproductibilité de ce type d’échantillonnage est faible. Son usage est aujourd’hui abandonné
(Nilson S et al, Berlin 1983).
Avantages Inconvénients
Pas besoin de matériel spécifique Temps de prélèvement long (jusqu’à 4h par boite)
On a utilisé une boite de pétrie en verre de petit calibre contenant de la Gélose nutritive
compatible a la surface ovale de la sortie d’air de l’appareille pour l’isolement non sélectif des
micro-organismes de l’air, et une boite de milieu CHAPMAN pour l’isolement des
staphylocoques.
16
Matériel et méthode
Avantages Inconvénients
Les méthodes utilisées lors de notre pratique au laboratoire sont la méthode de la boite RODAC
(Contact) et la méthode de l’écouvillonnage.
L’impaction Les propriétés d’inertie des particules sont souvent utilisées pour les extraire d’un
écoulement transportant un aérosol. En effet dans le cas d’un écoulement curvilinéaire, l’inertie
provoque la déviation des particules des lignes de courant du fluide.
Ce mécanisme est mis en œuvre, notamment dans les impacteurs au sein desquels l’air est
brusquement accéléré par passage au travers d’une section réduite et brutalement dévié par une
surface de collection solide (gélose ou surface adhésive) ou liquide.
Les particules selon leur inertie vont, soit suivre les lignes de courant, soit s’impacter sur la
surface de collection pour celles possédant l’inertie la plus importante. L’impaction dépend de
plusieurs facteurs tels que la taille, la densité et la vélocité initiale des particules ainsi que des
paramètres physiques du dispositif de collecte (dimension de la buse, débit du gaz porteur,
distance entre la buse et la surface de collection) (Zureik M, Neukirch C, 2002).
17
Matériel et méthode
Avec un écouvillon stérile humide, sur une surface de 25 cm2 est considéré comme équivalent
au prélèvement par boite contact à condition de décharger l’écouvillon en étoile sur une boite
de Pétri de diamètre 9 cm.
Standardisée
Possible
Possible
⦁ Isolement et ensemencement
Faire des prélèvements par écouvillonnage, après avoir tremper l’écouvillon stérile dans de
l’eau distillée stérile, sur les différents compartiments :
18
Matériel et méthode
Interrupteur du laboratoire 07
Étuve du Laboratoire 07
Robinet du laboratoire 07
L’étuve du laboratoire 07
Paillasse du laboratoire 07
Ensuite on ensemence par écouvillonnage sur les différents milieux de cultures (milieu de base
qui est la gélose nutritive) et milieux sélectifs Chapman (pour l’isolement des Staphylocoques)
et Mac Conckey (pour l’isolement des Entérobactérie), en veillant à imbibée l’écouvillon dans
l’eau distillée stérile à chaque retournement des boites à 120 degrés, ensuite incubé les boites à
37 °C pendant 48 H
-La taille
19
Matériel et méthode
La surface d’une colonie bactérienne peut être lisse, rugueux, renvoyer la lumière de
façon à leur donner un reflet métallique ou un aspect irisé.
-La consistance (élastique, crémeuse, gélatineuse)
L’identification a été réalisé dans le but d’identifié les genres bactériens qui ont fait leur
croissance sur les différents milieux de culture après prélèvement des sur différent
compartiment du laboratoire pédagogique.
Méthode
Déposer sur une lame propre une goutte d’eau distillée à l’aide d’une pipette pasteur puis on prélève
des fines colonies isolées sur boite (Gélose Chapman) a l’aide d’une pipette pasteur boutonnée ensuite
bien étaler sur la lame ces colonies bactériennes puis flamber la lame par des passages rapide sur le bec
bunsen.
20
Matériel et méthode
7-test Enzymatique
-Méthode
Verser 1ml de plasma humain (sérum) dans un tube a hémolyse stérile ensuite à l’aide d’une pipette
pasteur on prélève des colonies bactériennes sur milieu gélosée Chapman puis on trempe la pipette dans
le tube a hémolyse et on homogénéise et incuber a 37°C pendant 4H.
8. Identification biochimique par la galerie API 20 E Pour l’identification des
Entérobactérie sur milieu Mac conckey
Pour cela, on a préparé 2 suspension bactérienne différente avec une de chaque colonie prélevée
sur milieu Mac Conkey du prélèvement de la paillasse à côté du robinet
21
Résultats et
Discussion
Résultats et discussion
Suite à une période de 2 semaines (du 23 Mai au 10 Juin 2021), l’analyse de la qualité
bactériologique de l’air et des surfaces du laboratoire pédagogique de l’université belhadj
bouchaib, A été évaluée par les méthodes de sédimentation sur boite et le bio collecteur
(Capteur d’air) afin de déterminer le taux de contamination microbiologique de l’air, et par la
réalisation de plusieurs prélèvements au niveau de différentes surfaces du laboratoire pour la
recherche et l’identification des bactéries responsable de cette contamination.
22
Résultats et discussion
23
Résultats et discussion
En Comparant nos résultats avec l’étude faite dans le cadre d’un mémoire de fin d’étude au
niveau d’une l’industrie pharmaceutique NADPHARMADIC Production en 2015 Par la
méthode de sédimentation sur boite, ou les résultats ont été significatif concernant la présence
de bactéries sur milieu PCA et moins significatif concernant les levures sur milieu Sabouraud,
Nos résultat obtenus se rapproche des résultats obtenu lors de l’étude faite au niveau
NADPHARMADIC Production en 2015, car le nombre de UFC varie entre 24<UFC<108
dans nos résultat obtenu alors que les résultat de l’étude au niveau de l’industrie
pharmaceutique varie entre 10<UFC<91
La présentation des résultats obtenus dont le nombre de germes Recherchés doit être
inférieur ou égale à 100 UFC/ 4 heures représentant la classe D dans la qualité
microbiologique de l’air dans notre travaille st conforme selon la norme exigée.
Dans cette méthode on peut constater que le plus grand nombre d’unité forment colonies
bactérienne ou de cellules fongiques viables dans un échantillon a été trouver a côté le bureau
de l’ingénieur du laboratoire qui est de l’ordre de 108 UFC/ m 3 qui est au-dessous la limite
des normes de l’US Pharmacopée qui doit être < ou = 200 UFC/ m 3 et en comparant ces
résultats à d’autres études comme l’industrie pharmaceutique (ex : l’étude faite au niveau de
l’industrie pharmaceutique NADPHARMADIC en 2015) qui frôle la valeur maximale de 91
dans différents endroits on conclue que nos résultat son bien aux dessous des normes limitée.
24
Résultats et discussion
Sur GN ( Indénombrable)
Surface a coté de l’étuve du laboratoire 07
Les résultats obtenus grâce à cette méthode se trouve en un nombre indénombrable d’UFC
sur la surface a côté du paillasse et de l’étuve du laboratoire 7 indiquant d’une part l’efficacité
de la méthode et l’accumulation d’un nombre assez important de colonie de bactéries supérieur
aux normes de l’USP qui doivent être ≤ 200 UFC/m3, en comparant ces résultats avec l’étude
faite au niveau de l’industrie pharmaceutique NADPHARMADIC en 2015 (lors des travaux
de mémoire de fin d’étude) dont les résultats avoisinent les 25UFC/m3 ça nous montre que nos
résultats sont bien au-dessus de la norme établie en comparant nos résultats avec ceux de
l’industrie pharmaceutique (l’industrie pharmaceutique NADPHARMADIC) La qualité
25
Résultats et discussion
microbiologique de l’air doit répondre aux normes de l’US Pharmacopée , dont le nombre de
germes recherchés
Doit être inférieur ou égale à 200UFC/m3 représentant la classe D. Les résultats obtenus dans
notre travail(tableau7) sont conformes respect de la norme nombre de germes comptés est ≤
200UFC/m3.
Le laboratoire
Salle de préparation 09 00
Salle d’incubation 02 00
Salle de manipulation 09 00
(PSM)
26
Résultats et discussion
68 UFC
Gélose nutritive Interrupteur du laboratoire
07
22 UFC
Dans l’analyse des surfaces par la méthode de la boite RODAC on trouve une différence du
nombre d’UFC d’une part par rapport au milieu de culture et d’autre part par rapport à la surface
analysé avec un milieu de culture de Chapman sur la poignée de la porte du laboratoire 8 un
nombre de 68 supérieurs à celui du milieu de gélose nutritive sur interrupteur du laboratoire 07
qui est de 22 UFC.
27
Résultats et discussion
28
Résultats et discussion
Étuve du Laboratoire 07
29
Résultats et discussion
Poignée du laboratoire 08
30
Résultats et discussion
L’étuve du laboratoire 07
Dans ce milieu on constate un nombre indénombrable d’UFC dans la majorité des prélèvements
indiquant la présence de plusieurs souche bactérienne et fongique.
31
Résultats et discussion
Tableau 9 : Résultat de la méthode d’écouvillonnage sur Milieu Mac Conckey après 48 Heures
d’incubation.
Ces résultats nous indiquent la présence de bactéries bacille gram négatif dispersées sur tout le
laboratoire.
32
Résultats et discussion
33
Résultats et discussion
L’étuve du laboratoire 07
La présence d’un nombre indénombrable d’UFC sur le milieu de Chapman révèle la nature
halophile et halotolérantes des bactéries dispersées sur les lieus prélevés du laboratoire citées
ci-dessus
34
Résultats et discussion
3.1 Interprétation des résultats obtenus en utilisant la méthode de sédimentation sur boite
En se basant sur les résultats obtenus, on peut observer 2 types de germes microbiens (fines et
grosse colonies) avec une charge microbienne pas très importante en vus de la limite >180
UFC/m3
En se basant sur les résultats obtenus sur le milieu GN, on peut apprécier une importante
charge microbienne assez importante ainsi qu’une diversité microbienne (présence de fine et de
grosses colonies formant un tapis bactérien).
En se basant sur les résultats obtenus sur le milieu Chapman, on peut dire qu’il y’a un nombre
élevé de bactéries pathogène au niveau du compartiment prélevé.
35
Résultats et discussion
On peut conclure qu’il y’a un taux élevé de contamination par des micro-organisme, en plus de
la présence de micro-organisme pathogène dans le compartiment prélevé.
Concernant les résultats obtenus du prélèvement de paillasse à côté du robinet sur le milieu
MacConckey on peut observer 4 types de colonies bactérienne de la famille des entérobactéries
(car il y’a présence de fine et de très fines colonies et de grosses colonies ainsi que la présence
de bactérie fluorescente).
Concernant les résultats obtenus du prélèvement de la poignée de porte sur milieu Chapman on
peut apprécier deux types de Staphylocoques (colonies jaune et colonies blanche).
Concernant les autres résultats obtenus, on peut constater une présence de fines colonies
blanche formant un tapis bactérien.
-Concernant les résultats obtenus du prélèvement de la poignée de porte sur milieu gélose
nutritive on peut apprécier deux types micro-organismes qui sont indénombrable.
Pour les autres résultats on peut apprécier plusieurs types de colonies bactériennes (fine et
grosses), et même la présence de moisissures.
En se basant sur les résultats obtenus, on peut déduire que le laboratoire pédagogique est
vraiment très contaminé et envahie par une multitude de micro-organisme diverses et varié avec
une charge microbienne importante, ce qui crée une biodiversité de ces dernières, que ça soit la
flore commensale ou bien la flore de contamination qui est pathogène.
Pour comparer nos résultats, on a choisi Une étude faite par le Laboratoire d’hygiène
hospitalière, (Hôpitaux Universitaires de Strasbourg) ont effectué une analyse des surfaces
similaire a la nôtre, leur résultats de prélèvement de surfaces en milieu hospitalier. O. Meunier,
C. Hernandez, M.Piroird,R.Heilig,D.Steinbach,A.Freyd AnnBiolClin2005;63(5):481-6
36
Résultats et discussion
Les résultats d’analyse des surfaces sont répartis dans le tableau ci-dessous
Trois cent soixante frottis de surface ont été réalisés dans les services cliniques à proximité
des patients ou dans les locaux de soins.
Trois cent soixante frottis de surface ont été réalisés dans les services cliniques à proximité
des patients ou dans les locaux de soins. Quarante-sept prélèvements (13,0 %) n’ont pas permis
de mettre en évidence de colonies bactériennes, par l’une ou l’autre des quatre techniques et
sont dits « négatif ». Sur l’ensemble des 313 prélèvements positifs, 718 souches bactériennes
d’espèces différentes ont été isolées et identifiées. L’association des quatre tech- niques a
permis d’isoler et d’identifier 1 seule espèce bactérienne dans 94 cas (26,1 % des
prélèvements), 2 espèces bactériennes différentes dans 103 cas (28,6 % des prélèvements), 3
espèces bactériennes dans 77 cas (21,4 % des prélèvements) et 4, 5, 6, 7, 8 et 9 espèces
bactériennes
Différentes dans respectivement, 22, 10, 3, 2, 1 et 1 cas. En moyenne, 1,99 bactéries ont ainsi
été isolées et identifiées pour l’ensemble des 360 prélèvements et une moyenne de 2,29
bactéries pour chaque prélèvement positif.
D’après cette comparaison on peut déduire qu’il y’a une concordance avec notre travail de
recherche concernant la présence de staphylocoques et entérobactéries.
On peut en conclure qu’il existe des microorganismes au niveau de notre laboratoire
pédagogique qui sont semblable aux bactéries trouvées en milieu hospitalier et qui sont
pathogènes et virulentes.
37
Résultats et discussion
D’après cette comparaison avec nos résultat obtenus on peut déduire qu’il y’a une concordance
avec notre travail de recherche concernant la présence de staphylocoques et entérobactéries.
Les bactéries les plus pathogène trouver de notre analyser les plus pathogènes se trouve au
niveau de la poigné de porte et des paillasses du laboratoire.
4.2 Résultat obtenus par l’utilisation de la méthode de la boite RODAC
En se référant au résultat obtenu de l’analyse des surfaces par cette méthode sur milieu
Chapman, on peut déduire qu’il y’a une contamination assez importante par des micro-
organismes pathogènes avec un taux élevé.
En se basant sur les résultats obtenus sur le milieu GN, on peut apprécier deux types de micro-
organisme (fines et grosses colonies) avec un taux pas très élevés (22 UFC).
Cocci en grappe
de raisin
Cocci en
chainette
Cocci isolée
38
Résultats et discussion
Cette observation microscopique est une orientation pour pouvoir déduire le genre et l’espèce
de la bactérie isolée.
39
Résultats et discussion
40
Résultats et discussion
6-1-Test de la coagulase
Figure 16 : Résultat du test de coagulase des colonies isolées sur Chapman du prélèvement de
la poignée de porte.
En se basant sur l’examen Macroscopique et microscopique des colonies ainsi que le test de
coagulase on peut déduire que la bactérie isolée est staphylococcus auréus (Staphylocoque a
coagulase +)
41
Résultats et discussion
Tableau 13: Résultat après stérilisation par évaporation de l’eau et par le formol par la méthode
de sédimentation sur boite
4 UFC
Au-dessus de la paillasse du laboratoire 07
(stérilisation par évaporation de l’eau).
6 UFC
L’intérieur de l’étuve bactériologique
(stérilisation par le formol )
0 UFC
42
Résultats et discussion
6 UFC
7-2-Résultats de l’analyse microbiologique des surfaces après stérilisation par la
méthode d’écouvillonnage
Tableau 14: Résultat obtenu après stérilisation par des détergents, par la méthode
d’écouvillonnage sur milieu Chapman.
0 UFC
Poignée de placard du laboratoire 07
43
Résultats et discussion
Paillasse du laboratoire 07
0 UFC
Poignée de L’étuve du laboratoire 07
0 UFC
44
Résultats et discussion
Tableau 15: Résultat obtenu après stérilisation par des détergents par la méthode
d’écouvillonnage sur milieu Mac Conckey
0 UFC
Poignée de placard laboratoire 07
0 UFC
Paillasse du laboratoire 07
0 UFC
45
Résultats et discussion
0 UFC
Robinet du laboratoire 07
0 UFC
Tableau 16: Résultat obtenu après stérilisation par des détergents par la méthode
d’écouvillonnage sur milieu Gélose nutritive
46
Résultats et discussion
9 UFC
Interrupteur laboratoire 07
3 UFC
Poigné de l’étuve Laboratoire 07
0 UFC
47
Résultats et discussion
Paillasse du Laboratoire 07
9 UFC
Robinet du laboratoire 07
6 UFC
Poignée de porte du laboratoire 07
0 UFC
48
Résultats et discussion
20 UFC
La stérilisation a donnée des résultats assez satisfaisants vu que le taux de la charge microbienne
a diminué voir insignifiant et nul dans certain prélèvement de certain compartiment par rapport
au prélèvement initial.
Malgré ces résultat la stérilisation n’a pas été total mais seulement partiel en vus des résultats
obtenus.
49
Résultats et discussion
En plus des rougeurs cutanées, ce syndrome peut provoquer des vomissements, de la diarrhée,
des maux de tête ou un prurit selon la quantité d'histamine ingérée. (Nakasone E et al 2015),
(Lee YC, et al 2013). Ce syndrome est principalement associé aux poissons « scombroïdes »
appartenant aux Scombridae et Scombere socidae familles où se produit une décarboxylation
microbienne exogène de l'histidine. (Lee YC, et al 2013) -(Kanki M et al, 2002).
Comme indiqué par Haruki et al (2014), R. ornithinolytica était considéré comme hautement
virulent en raison de sa présence chez des patients fragiles avec des comorbidités importantes
et de son association initiale avec le genre Klebsiella, qui comprend plusieurs souches
virulentes.Cependant, selon des cas rapportés précédemment, le pronostic est très variable et
dépend de l'état de santé général du patient et du type d'infection, et les résultats ne sont pas
nécessairement mauvais lorsqu'un traitement approprié est mis en place rapidement (Haruki Y
et al,2014).
La plupart des espèces du genre Raoultella sont généralement largement sensibles aux
antibiotiques d'après les isolats des séries de cas de la littérature. 34 À l'instar de certaines
espèces de Klebsiella, Raoultella spp . Présentent une résistance intrinsèque à l'ampicilline et à
la ticarcilline qui sont le résultat de bêta-lactamases codées dans les chromosomes (Sekowska
.A 2017 ) – (Pacilli M, Nataraja RM,2019).
La septicémie à Serratia est connue pour causer une morbidité et une mortalité
cliniquement significatives. Cliniciens ont été incertains quant au rôle du biogroupe 1 de
Serratia odorifera en tant qu'agent pathogène humain, car la plupart des isolats n'ont pas été
associés à une maladie invasive. Serratia odorifera biogroup1 a été identifié pour la première
fois en 1978, et les cliniciens n'étaient pas certains de son rôle en tant qu'agent pathogène
humain car il n'existe que 12 rapports antérieurs de cet organisme causant la maladie (J J Lopez
Jr, 1998,M A Cook 1).
50
Résultats et discussion
Pseudomonas putida est une cause rare d'infections de la peau et des tissus mous. Elle est
souvent associée à un traumatisme ou à un état immunodéprimé. Nous présentons le premier
cas mortel de bactériémie due à des infections de la peau et des tissus mous, qui avaient comme
facteurs de risque la malnutrition, l'immobilité et les maladies vasculaires périphériques.
Dans la littérature décrivent un large éventail de conditions qui ont conduit à une bactériémie à
P putida, y compris la pneumonie (Von Graevenitz et al,1971), (Yoshino Y et al,2011).
À notre connaissance, nous présentons le premier cas mortel de bactériémie à P putida due à
une infection des tissus mous, même avec un traitement antimicrobien approprié.
Discussion générale
Concernant le taux de contamination des surfaces, les résultats de ce travail peuvent présenter
des biais en rapport avec la méthode de prélèvement choisi, car selon certains auteurs, La
méthode utilisant la gélose contact est plus sensible pour détecter les bactéries globalement et
51
Résultats et discussion
la présence des Cocci à Gram positif dans l’environnement, bien que la technique par
écouvillonnage humide semble mieux détecter les bacilles à Gram négatif [GANGNEUX 2002,
LEMMEN 2001].
Les sites les plus contaminées étaient les paillasses, les robinets, les poignées de portes, les
lavabos et les étuves. Cette situation est liée aux faites que ces matériels sont fréquemment
manipulés par le personnel ou les étudiants. Cette observation est confirmée par Marty
[MARTY 1998].
Cette colonisation importante des sites constitue un risque réel de transmission manuportée
des bactéries pouvant être à l’origine d’infection [OIE 2002]. Afin de réduire cette transmission
manuportée au niveau des poignées des auteurs hygiénistes comme Séguier à Strasbourg,
proposaient l’utilisation des poignées de portes ULNA.
Concernant les bactéries isolées une forte proportion des bacilles à Gram négatif est notée. Cette
proportion élevée serait due à la méthode de prélèvement, car selon la littérature, la technique par
écouvillonnage humide semble mieux détecter les bacilles à Gram négatif [GANGNEUX 2002,
LEMMEN 2001].
La présence des bactéries (dans le tableau 15) constitue un risque infectieux pour le personnel du
laboratoire les enseignants et les étudiants. Marquant ainsi la nécessité de l’hygiène du laboratoire
démontré par la stérilisation entre autres dans notre expérience.
52
Conclusion
générale
Conclusion générale
Conclusion
Les méthodes de prélèvement et d’analyse microbienne dans les milieux de laboratoire
pédagogique d’Ain Temouchent (air, surfaces) ont fait l’objet de nombreux travaux afin
d’améliorer la collecte, la quantification et l’identification des micro-organismes.
Les efforts ont été plus marqués pour les prélèvements d’air avec le développement de
nouveaux capteurs et bio collecteurs, notamment individuels, qui permettent, grâce à des durées
plus importantes de recueil des micro-organismes (quelques heures), une meilleure évaluation
de l’exposition humaine.
52
Conclusion générale
De ce fait, des stérilisations ont été effectué afin de permettre de savoir leur effet et impacte sur
le développement microbien au niveau du laboratoire pédagogique, et s’est avéré qu’elles ont
donné de bons résultats.
53
Reference
bibliographique
Références bibliographiques
Bonne pratiques de fabrication (2011). LD.1. Fabrication des médicaments stériles. [ed.]
Bulletin Officiel. 2011. Vol. 8bis
54
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striped marlin fillets implicated in a foodborne poisoning. J Food Prot. 2013;76(5):860–866.
doi:10.4315/0362-028X.JFP-12-298
Martino R, Martínez C, Pericas R, Salazar R, Solá C, Brunet S, et al (1996). Bactériémie
due aux bacilles gram-négatifs non fermentants du glucose chez les patients atteints de
néoplasies hématologiques et de tumeurs solides. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1996;15:610-
615.
Auger, C., Kondo, S., & Marty, A. (1998). Multivesicular release at single functional synaptic
sites in cerebellar stellate and basket cells. Journal of Neuroscience,
Moletta-Denat Marina (2012), Les aérosols microbiens dans l’air du temps : le point
sur la microbiologie de l’air intérieur
Nakasone E, Kaneshiro R, Min K, Tokeshi J (2015). Emergence of Raoultella ornithinolytica
on O‘ahu: a case of community-acquired R. ornithinolytica urinary tract infection. Hawai‘I J
Med Public Health. 2015;74:174–175.
Laurent, P., Holmgren, S., & Nilsson, S. (1983). Nervous and humoral control of the fish
heart: structure and function. Comparative Biochemistry and Physiology Part A: Physiology,
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Références bibliographiques
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Series, No. 961
Zureik, M., Neukirch, C., Leynaert, B., Liard, R., Bousquet, J., & Neukirch, F. (2002).
Sensitisation to airborne moulds and severity of asthma: cross sectional study from European
Community respiratory health survey.
56
Résumé
Depuis plusieurs année, l’analyse de l’air et des surfaces font partie des analyses qui ont une
importance capitale par leur importance sur le plan sanitaire et prévention des pathologies lié à
la présence de microorganismes pathogènes, mais également la formation de biofilm qui suscite
de plus en plus d’intérêt et d’inquiétude concernant la contamination des surfaces. L’air et les
surface constitue un milieu de croissance idéal pour les microorganismes provenant de de
l’environnement et les micro-organismes aéroporté ainsi que les microorganismes résponsable
de la formation de biofilm. L’objectif de ce travail est d’étudier la qualité bactériologique de
l’air et des surfaces au niveau du laboratoire pédagogique de Ain Temouchent afin d’isoler et
d’identifier les microorganismes potentiellement pathogènes afin de prévenir les risques
sanitaires lié a la contamination par des microorganismes pathogène d’une part, d’un autre coté
l’objectif et de dénombré et quantifié les microorganismes qui sont en grand nombre susceptible
de crée une pathologie.
Les bactéries de l’air et des surfaces sont connues pour provoquer certaine maladie infectieuse
notre objectif c’est de d’évalué et de contrôler tous les compartiments du laboratoire susceptible
D’être contaminée, pour cela plusieurs méthodes d’analyse ont été utilisée afin d’isolé et
d’identifié les microorganismes responsables de la contamination de mettre en évidence
l’origine de la contamination.
Les résultats du contrôle bactériologique de l’air et des surfaces ont révélé qu’il y’avais un taux
très élevé de microorganisme mais également des bactéries susceptibles d’être pathogène
(Staphylococcus auréus, Raoultella ornithinolytica, Acinétobactére baumanii,).
La plupart des compartiments prélevé sont chargé en microorganisme, mais seulement quel que
compartiment ou l’air et les surface sont contaminée par des microorganismes pathogènes.
Mot clé : Analyse de l’air et des surfaces, microorganismes pathogènes, maladie infectieuse
ملخص
من والوقاية الصحة حيث من كبرى أهمية لها التي التحليالت من جز ًءا واألسطح الهواء تحليل كان ،سنوات لعدة
والقلق االهتمام يثير الذي البيوفيلم تكوين أيضًا جهة ومن ،لألمراض المسببة الدقيقة الكائنات بوجود المرتبطة األمراض
األسطح تلوث حول المتزايد
وكذلك الهواء في المحمولة الدقيقة والكائنات البيئة من الدقيقة الحية للكائنات مثالية لنمو وسيلة واألسطح الهواء يوفر
البيوفيلم تكوين عن المسؤولة الدقيقة الحية الكائنات
أجل من تموشنت عين لجامعة التعليمي المخبر في واألسطح للهواء البكتريولوجية الجودة دراسة هو العمل هذا من الهدف
من الميكربيولوجي بالتلوث المرتبطة الصحية المخاطر منع أجل من لألمراض المسببة الدقيقة الحية الكائنات وتحديد عزل
كبير عدد في تخلق أن المحتمل من التي الدقيقة الحية الكائنات وتحديد تعداد هو الهدف ،أخرى جهة ومن جهة
.األمراض من
جميع ومراقبة تقييم هو هدفنا ،معينة معدية أمراضًا تسبب واألسطح الهواء في الموجودة البكتيريا أن المعروف من
الحية الكائنات وتحديد عزل أجل من التحليل طرق من العديد استخدام تم لذلك ،ملوثة تكون أن يحتمل التي المخبر أقسام
التلوث مصدر على الضوء لتسليط التلوث عن المسؤولة الدقيقة
البكتيريا وخاصة ،الدقيقة الحية الكائنات من جدًا عالية نسبة وجود واألسطح للهواء البكتريولوجية التحاليل نتائج أظهرت
مثل لألمراض مسببة تكون أن يحتمل التي
األقسام بعض فقط ولكن ،الدقيقة الحية بالكائنات ملوثة كانت منها عينات أخذ تم التي البيداغوجي المخبر أقسام معظم
.لألمراض المسببة الدقيقة بالكائنات ملوثة كانت
لألمراض المسببة الدقيقة بالكائنات واألسطح الهواء في البكتيري التحليل ,المعدية األمراض :المفتاحية الكلمات
Abstrat
For several years, the analysis of air and surfaces have been part of the analyzes which are of
capital importance due to their importance in terms of health and prevention of pathologies
linked to the presence of pathogenic microorganisms, but also the formation of biofilm gives
rise to growing interest and concern regarding surface contamination. The air and the surface
provide an ideal growth medium for microorganisms from the environment and airborne
microorganisms as well as microorganisms. The objective of this work is to study the
bacteriological quality of the air and surfaces at the educational laboratory of Ain Temouchent
in order to isolate and identify potentially pathogenic microorganisms in order to prevent the
health risks linked to contamination. by pathogenic microorganisms on the one hand, on the
other hand the objective and to enumerate and quantify the microorganisms which are in large
number likely to create a pathology.
Bacteria in the air and surfaces are known to cause certain infectious diseases our objective
is to evaluate and control all the compartments of the laboratory likely to be contaminated, for
this several methods of analysis have been used in order to isolate and identify the
microorganisms responsible for the contamination to highlight the origin of the contamination.
The results of the bacteriological control of the air and surfaces revealed that there was a very
high rate of microorganisms but also of suceptibly pathogenic bacteria (Staphylococcus
aureus, Raoultella ornithinolytica, Acinétobactére baumanii,).
Most of the compartments sampled are loaded with microorganism, but only some compartment
or the air and the surfaces are contaminated with pathogenic microorganisms.