Staphylococcus aureus à coagulase positive Staphilococcus à coagulase

négative (SCN)

Classi cation = Staphyloque doré (aureus) Gram positif / aérobie

Gram positif / aérobie

Physiopathologie Beaucoup de facteurs de virulence: Opportunistes

- Adhésines = colonisation patient Multi-résistance aux antibio
- Capsule = résistance SI/ phagocytose
- Extension locale de l’infection par toxines
(cible membranes cellulaires), enzymes
(dégradent TC +favorise extension foyer
infecté)
- Di usion hématogène = via
thrombophlébites locales avec rôle
coagulase qui forme un caillot autour de la
bactérie. = endocardite voir dissémination
Peut adhérer aux plaquettes et engendrer des
thrombus
- Staphylokinase induit et favorise formation
localisation septique secondaires
- Sécrétion toxines
➡ Exfolitatines = impertigo bulleux
➡ TSST-1 = toxine chox toxique au
staphylococcique (nécrose ++)
➡ Leucocidine de Panton-Valentine (PVL) =
lyse cellules autour en formant des pores
(furoncle)

Transmission Réservoir naturel = H et animaux à sang chaud

- Fosses nasales
- Plis inguinaux, plis axiliaires
- Tube digestif
- Direct (manuportage ++)
- Indirect (source envirronementale)

Clinique Bactérie pyogène + toxicogène = infections Clinique bas bruit, « subaigue »

nosocomiales et communautaires Mais résistance antibio
Clinique buryante mais sensible aux antibio
- Infections suppuratives (multiplication
bactérie)
- Infection toxiniques liées à la di usion de
toxines spéci ques

Dg - MALDI-TOF
- Facile à trouver = GRAM positif (cellules en
violet + amas/grappes raisins)

Prophylaxie Mesure antisepsie/ individuelle et collective

Lavage mains + SHA +++

Ttt - Décolonisation à S.aureus + antibioprophylaxie Résistance ATB

(chir cardiaque)
- Antibioprophylaxie
- Si chir cardiaque = reception crème antibio
pour décoloniser les voies aériennes
- Résistance à certains betalactimines
ff
fi
fi
ff
 Streptococcus pyogènes Streptococcus agalactiae Streptococcus pneumonia

Famille Groupe A (Beta hémolytique) Groupe B (beta hémolytique) Alpha hémolytique

Habitat Pathogène humain - Tube digestif - VAS

- VAS (pharynx) - Voies génitales - Poumons
- Peau
Transmiss - Par goutelettes des VAS Interhumaine rare sauf lors de G Transmission interhumaine
ion - Contact direct par plaies Recherche obligatoire en per extrêmement rare
cutanées souillées partum pour éviter les infections Enfants bas âges ++ (1/2
materno-foetales colonisé)
Portage vaginal +++

Physiopat Potentiel épidémique +++ - Adhésines - Capsule = résistance

ho Bactérie pyogène + risque - Capsule (barrière contre phagocytose
toxinique radicaux libres oxygénés) - Pneumolysine (cytotoxine) =
« Mangeur de chair » lyse cellules, capacité de
Facteurs virulence xation Ig et devient une
- Adhésines molécule pro in ammatoire
- Capsule Agent bactérien le +
- Enzymes EC fréquemment id dans les
- Toxines supra antigénique pneumonies communautaires
documentées

Clinique Asymtomatique 5% Infections néonatales A ecte la sphère ORL et

- Symptomes toxiniques - Sépticémies globales respiratoire
érythrogènes (scarlatine) précoces et mortelles
- État de choc avec risque - Sd méningés précoce Prévalent chez enfants - 2ans et
CIVD (premières heures de vie) et adultes +65 ans
- Nécrose des extrémités et de tardif (2 à 8 semaines après) Pour méningites bactériennes
décès communautaires
Infection adulte hors G = PA++
Infections invasives graves Enfant (-6 mois ++) méningites
- Érysipèles fréquentes
- Arthrites Puis pneumopathie ++
- Septicémies
+ 65 ans = augmentation
Infections locale fréquentes méningites
- Angines +++

Séquelles
- Rhumatisme articulaire aigu
- Glomérulonéphrite
- Chorées
- Myocardites
Diagnosti - Gram positif - Gram positif en longues Tests urinaires par capsule qui
c - Longues chainettes chainettes permet le typage bactérien
- Milieu enrichi en sang - Milieu enrichi en sang (recherche antigènes)
- Atmosphère aéro-anaérobie - Aéro-anaérobie - Petites chainettes
(préférentiellement anaérobie) - Disposition de diplocoque
- MALDI-TOF - Millieu enrichi en sang
- GRANADA = géloses - Aéro-anaérobie
spéciales (strepto B pousse - Produit une hémolyse
couleur orange brique) incomplète (alpha)

Prophylaxi Recherche portage Vaccination obligatoire chez

e OBLIGATOIRE dès l’entrée en enfants (utilisation capsule)
salle de travail par bio mol ➡ Non conjugué (RI complexe)
Si positif = ATB (1H max avant
naissance) ➡ Conjugué (adjuvant, RI plus
forte)

Traitement Extrêmement sensible aux ATB Toujours sensible aux pénicillines

(Pénicillines ++) )))
fi
ff
fl
 Enterococcus spp. = entérocoques

Habitat Tube digestif mammifères et animaux sang chaud

Espèces Enteroccocus faecalis (virulence ++)

- Sd infectieux aigues importants
- Communautaires

Enterococcus faecium (pas très virulent)

- Adaptation ++
- Multirésistance aux ATB et antiseptiques
- Résistance au stress osmotique, variations température
- Nosocomiales ++
- Colonisation ++
Physiopatho Tout type d’infection

Diagnostic - Gram positif

- En diplocoque (paire)
- Petites chainettes très courtes
- Catalase négative
 Neisseria meningitidis (méningocoque) Neisseria gonorheae (gonorhéé)

Habitat - Bouche des H Bouche animaux + H

- Strictement humain
Physiopatho - Capsule (protège de la phagocytose)
- 5 sérogroupes prédominants (A, B, C, Y
et W135) = invasif

Facteur virulence
- Souche hyper-virulente (pili type IV,
endotoxines)
- Précurseur
- Individu avec susceptibilité
Clinique Touchent nourrissons, ado, jeunes adultes H = symptomatique ++
- Meningite = sd méningés fébrile chez F = asymptomatique ++
jeunes adultes et enfants, troubles neuro
sensorielles avec trouble visuel, auditif, - Très symptomatique/ bruyant
du developpement - H = urétrites, dysuries très douleureuses
- Méningoccoémies - F = leucorrhées, douleurs abdo (moins
bruyant) avec risque dissémination ++,
Complications: risque stérilité
- Choc septique - Ano-rectites et infection pharyngées
- Purpura fulminans = CIVD
Épidémio - Commensales - Pas de portage
- Transmission interhumaines par - Pathogène strict
goutelettes - IST (gonorrhée ou blennorragie) en
- En Fr = IIM faibles (cas sporadique++) augmentation
- Épidémie en afrique sub-saharienne
- Pic enfant -2 ans et de 15 à 25 ans
- France = B ++
- Afrique = A et C
- Asie = X
- Portage faible avec porteurs
asymptomatique et sérogroupes
spéci que associées aux infections
invasives

Diagnostic - Gram négatif - Gram négatif

- Diplocoque - Diplocoque
- Ponction lombaire - Prélevement écoulement urétraux pour
- Hémocultures la mise en culture
- Biopsie cutanée si purpura - PCR à partir d’urines
- URGENCE DG/ THÉRAPEUTIQUE
- Méthode biochimique et bactériologiques
- PCR (rapide)
- Examen direct systématique puis
réalisation PCR pour déterminer
sérogroupe

Prophylaxie Vaccin obligatoire pour la mecque - ATB pour patient + partenaires sexuels
MDO - Éducation et protection
Vaccin obligatoire pour type C depuis 2018
Vaccin type B non obligatoire même si
circule le + en France
TTT des cas contact
fi
 Tuberculososis cpx Mycobacterium Leprae Mycobactérie non tuberculeuse
« Bacille de Koch » « Bacille de Hensen »

Famille Mycobactérie Mycobactérie Mycobactérie

Types de tuberculose: Types:
- Bacille de Koch - Atypiques
- Bovis - MOT et MNT
- Afrivanum - Patho commensales ou
- Bovis BCG saprophytes, oportunistes
- Microti
Épidémio Quelques centaines de
milliers (Afrique, Asie,
Amérique latine +++)

Physiopatho Alcoolorésistante (toutes 2 types - De type saprophytes

mycobactérie) - Pauci bacillaires - Commensales transitoires
Paroi riche en acide mycolique - Multi bacillaire (+5 lésions) - Opportunistes
Non encapsulée, rectiligne +/- - Patho une fois dans l’organisme
incurvé, non sporulée

Clinique - Toux pulmonaire Lésion cutanées et Pulmonaire

- Sueurs nocturnes nerveuses - Complexe MAC (avium, IC,
- Fièvre - Achromique et insensible chimerea) (provient de
- AEG - Perte coloration peau et l’envirronement) = infection
- Asthénie sensibilité pulmonaire et disséminé,
- Sang dans crachats lymphadénite
- Xenopi (eaux douches et mer) =
70% pulmonaire mime état tuberculeux, parfois
20% extra pulmonaire pronostic sévère
(adénopathie cervicales, patho - Kansasii (milieu acqueux)
rénales, péricardiques, pahto
osseuses, méningites,…) Patho cutanées
- Ulcérans = ulcère de Cook,
oedème, papule prurigineux et
indolore, ulcère à fond
nécrotique
- Marinum (eau de mer et piscine
sans chlore, aquarium ++) =
papulonodules, ulcération,
atteintes ganglionnaires
satellites
- Chelonea = id ++, forme
cutanée et invasive
- Absessus = ic, cutané + pulmo
- Fortuitum = cutané

Patho ganglionnaire =
lymphadénite (avium, kansasii, IC)

Transmission Contact prolongé avec peau Par inhalation via douche

et les muqueuses Par inoculation

Diag - Aérobie stricte - Biopsie peau

- Croissance lente - PCR spécial
- Multiplication IC et EC - Pas de coloration ni
- Examen direct (Zhiel ou culture in vitro
Auramine) = grosses
colonies, couleur crème,
sèche, rugueuse avec forme
chou eur
- PCR
- 2 croix de BAARS
- MPT 64 = dg rapide

Ttt ATB
fl
 Borrelia = maladie de Lyme Leptospira Treponema = Syphillis

Famille Spirochètes Spirochètes Spirochètes

Transmis Via morsures d’arthropodes Via urines souillées RS ++, TMF

sion

Épidémio Provient de l’hémisphère N En hausse, grave +++ Problème de santé publique

Provient des USA (zone boisée, Régions tropicales et
humide) subtropicales ++ avec
Fréquente (42 cas/100k habitant) dé cicence hygyène ++
Pathologie de lyme (burgdorferi
sensu lato= sensi stricto, garinii, Personne à risque =
afzelli) agriculteur, éboueurs,
Fièvre non spéc que (recurrentis pratique activité eau douce
avec vecteur poux de corps)

Physiopt 1. Tiques Ixodes pond oeufs Vit dans petits rongeurs ou Pathogène pour l’H
ho qui deviennent larves animaux d’élevage Non cultivable
2. Larves s’accroche aux
rongeurs
3. Larve libère 1er hote et
devient nymphe
4. Soit rencontre hôte
accidentel Homme
5. Soit retroune au rongeur,
mammifères

Clinique - Éryhtème migrant depuis le Primoinfection aspéci que Syphillis primaire (21j)
point de morseure de facon (1/2s incubation) - Chancre unique, fond propre,
centrifuge - Sd fébrile induré et génital
- Fièvre - Sd algique - Régression spontanée
- Adénopathie - Atteinte cutanée- - Adénopathie satellite non
- Hépato-splénomégalie muqueuse in ammatoire
- Sd méningés Syphillis secondaire (-1an)
Maladie de Lyme = Burgdorferi - Roséole
Thyphus récurrent = Recurrentis Rechute (J15) - Syphillides papuleuse
- Atteinte hépatique - Signes extra cutané (fébricule,
- Rénales céphalées, poly-adénopathie)
- Pulmo Syphillis latente précoce
- Neuro - Asymptomatique
- Cardiaque - Sérologie positive
- Occulaire Syphillis tertiaire
- Gommeuse (dissémination masses
Forme sévère = maladie de in ammatoire, destruction tissu)
Weil - Osseuse
- Cardiovasculaire
- Neuro et Tabès (neuro tardive rare)
Dg Dg di cile car très petite - SPirochète aux extrémités Direct = état frais
en crochet - Mobile
Direct - 2 chromosomes - Hélicoidale
- Biologie moléculaire PCR circulaires - Visible en microscopie à fond noir
(typage, détection acide - Culture in vivo possible sur injection
nucléique patho) Direct lapin (à l’ancienne)
- Sérologie - Pas d’hémoculture Utlisation immuno urorescence
- Culture impossible - Biomol (PCR) directe avec Ac mono/polyclonaux
Biomoléculaire (pcr)
Indirect : Indirect Indirecte
- AUgmentation Ac dans le - ELISA - Sérologie
temps - Agglutination - Séroconversion
- 1er test (Se++, Sp- -) microscopique (MAT) - Test Ag non tréponémique (TNT)
- 2ème test = WesternBlot VDRL et RPR
- Test Ag tréponémique avec FTA
test (con rmation après TNT)
- ELISA + WB
fl
fl
fi
ffi
fi
fi
fl
fi
 Chlamydia COxiella Burnetii = èvre Rickettsies
Q

Famille

Épidémio 1ère cause d’IST en Très rare, très létale Très rare
france Zoonose mondiale Zoonose
Nombre sous estimé car Infection animale à vie
bcp cas asymptomatique

Transmission Contact sexuel Inhalation poussières Via tique

TMF (infection occulaire et contaminés par excrétions
pulmo chez enfant) animales répendue par le
vent

Physiopatho 2 formes Grande résistance extérieure

- Corps réticulé (CR): Bactérie cosmopolite
végétative, non Réservoir naturel = animaux
infectieuse, IC, active et arthropodes
- Corps élémentaire (CE) H = hote accidentel
: infectieuse, EC, pas de
division Zone avec peu d’hygiène

CR se développe et se
di érencie du CE

Clinique Infections chroniques Fièvre Q aigue - Fièvre boutonneuse

- Légère débribilité - Fébrile exanthématique
Trachomatis - Sd pseudo grippaux
- Trachome Fièvre Q chronique = - Éruption maculeuse,
Pneumniae pronostic + sombre vésiculeuse, papuleuse
- Infection respiratoire - Escarre d’inoculation
Psittaci (signe spéc que)
- Pneumopathie sévères,
décès foudroyants

Dg Direct Non visible sous GRAM Directe

- PCR Petite bacille IC dans - Biopsie cutanée
phagolyosomes - Culture cellulaire
Indirect - Bio mol
- Sérodiagnostic Direct - Gimenez ou
- Micro- - Coloration Gimenez immunohistochimie
immuno uorescence - Immunohstochimie
- Biomoléculaire Indirecte
- Sérodiagnostic
Indirect
- Sérodiagnostic avec
immuno o indirecte
- ELISA
ff
fl
fl
fi
fi
 Bacille à GRAM positif sporulées toxicogènes « Clostridium »
anaérobie

Bactéries environnementales = production et libération toxines

Possède des spores qui permettent de rentrer en dormance et permet à
la bactérie de survivre à des conditions défavorables (RÉSISTANCE)
Très pathogènes (toxi-infections)

Clostridium tetani = tetanos - NN++ ou PA (pas de rappels)

- 100/ an en France
- 1millions/ an dans le monde
- Plaies causés par jardinage ou dues à des morsures
- Atteintes des synapses neurologiques
- Contractions non controlées, convulsion et atteinte SN autonome

Ttt= attendre que la toxine disparraise

- Clostridium botulinum = Spore permettent de résister à la mise en conserve
botulisme

- Clostridium di cile = - Par ingestion de spore

colite pseudo - Résiste à acidité gastrique
membraneuse - PA qui ont pris des ATB ( ore intestinale apauvri)
- Décaper épithélium colique = in ammation
- Diarrhées, colite, perforation intestinale, péritonite
- Il faut empecher la prolifération (possible gre e de selles)

TTT Pb = infection polymicrobienne

Bétalactamines + inihibiteur bétalactamases
Si suspition germes anaérobie = ajout métronidazole (quasi pas de
résistance contre cet ATB)

Baccille GRAM positif non sporulées

- « Bactéroides Fragillis »
- Commensales
- Germe du colon
- Production céphalosporinase inhibé par les inhibiteurs de bétalactamases
- Infection sous diaphragmatique
- Quasi totalité germes anaérobies sont sensibles à l’amoxicilline SAUF la B. Fragilis
- Donc amoxicilline + inhibiteur bétalactamase OU céphalosporine + métronidazole
ffi
fl
fl
ff
 Bacillus anthracis Corynebactérium diphtheriae Listeria monocytogenes
« Maladie du charbon » « Diphtérie »

Habitat Envirronement Peau et muqueuses ++ Envirronement

Bacillus GRAM positif sporulées Non sporulées GRAM positif non sporulée
aérobies

Pathogénéci Toxines Toxines diphtérique Capacité survie IC (pas de toxine)

té

Physiopatho 1. Animal mange ferraille Strictement humaine Infecte les monocytes

et 2. Nécrose organes Contagieuse Survit en IC (cache la RI)
transmissio 3. Animal enterré
n 4. Contamination du Infection locale avec Germe saprophyte ubitiquaire
champ dissémination toxines Infection animal + H
5. Spores peristent dans
le sol Entrée lors d’ingestion aliments
6. H marche avec plaie contaminés et non cuits
sur sol contaminé
Traverse barrière hémato
encéphalique + foeto placetaire

La seul cellules résistance est la PNN

Polymérisation actine du
cytosquelette, grâce à l’actine elle
rentre dans la cellules adjacente sans
sortir (infection cellules de proche en
proche)
Utilise des microtubules pour se
deplacer de cellules en cellules

Épidémio Zoonose Très rare en France car 500 à 600/ an en France

- Animal se contamine en vaccination régulée
broutant Mais pas rare dans le monde

Humains
- Professionelles ++
Clinique Formes cutanées ++ - Lésion locale + manifestation Peut provoquer des FC et morts
toxiniques souvent à foetales in utero
distance
- Angine pseudo- Infection la + grave = infection
membranneuse (incubation disséminée (systémique)
2-6 jours) puis èvre
modérée et angine banales Fébricule
- Petite èvre
Fausses membranes extensives
sur les amygdales et la luette et
formes adénopathies satellites
parfois volumineuse

Formes sévères
- Mycocardites avec trouble
ryhtme
- Hypotension
- Collapsus
TTT Sensible à l’amoxicilline
Résistante aux céphalosporines

Ttt référence n= amoxicilline +

gentamicine
fi
fi