Éxercices Corrigés
Éxercices Corrigés
BIOLOGIE CELLULAIRE 1
PACES_0
Semestre 1
FASCICULE D’EXERCICES
Yvon CAVALOC
[email protected]
lOMoARcPSD|13316797
TD Biologie Cellulaire 1
Ce fascicule d’exercices sera votre compagnon pour les Travaux Dirigés (TD) de Biologie Cellulaire 1 tout au long
de ce semestre. Merci de l’apporter avec vous le jour de votre TD.
Les TD viennent en appui aux Cours Magistraux (CM) et permettent de vous amener à vous interroger sur les
grandes fonctions cellulaires tout en affinant vos connaissances.
Ces TD ne sont pas uniquement une mise en application du cours, mais également le lieu où certaines notions
peuvent être approfondies.
Il est très important pour la suite de votre cursus que vous assimiliez bien la structure de la cellule et de ses
constituants, ainsi que les relations qui unissent les éléments moléculaires que vous aurez l’occasion de voir en
détail en biochimie.
Les TD sont obligatoires et doivent être préparés avant la séance. Nous n’excluons pas la possibilité d’un contrôle
noté en début de séance pour nous assurer que le travail a bien été effectué en amont.
Beaucoup des exercices traités sont des exercices extraits des évaluations des années précédentes. Il y a des
exercices de divers types :
- Questions de cours : Ces questions permettent de vérifier votre niveau de connaissance du cours
- QCM : Les Questions à Choix Multiples s’intéressent à des aspects précis du cours. Elles permettent de
mesurer si vous avez une connaissance suffisamment précise et claire des notions essentielles. Il n’y a
pas de piège dans les QCM, mais un bon niveau de compréhension est nécessaire pour pouvoir s’en
sortir.
- Exercices de réflexion : Pour aborder ces exercices, vous devrez montrer que vous maîtrisez les
mécanismes cellulaires. Il s’agit de faire des analyses de cas précis, en répondant clairement et de
manière concise aux questions posées.
Yvon Cavaloc
[email protected]
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TD Biologie Cellulaire 1
Question 1
Annoter le schéma ci-dessous, représentant un fibroblaste en déplacement
Question 2
Observez cette image d’une cellule et entourez les lettres correspondant aux réponses justes :
-3-
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Question 3
Observez cette image d’une cellule et répondez aux questions posées :
Identifiez, en donnant le nom et le numéro correspondant, l’organite ou l’élément cellulaire défini ci-dessous :
Définition Nom N°
-4-
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2/ La cytométrie en flux
A. Est une technique utilisant de la radioactivité
B. Est une technique utilisant la fluorescence
C. Utilise un ou plusieurs lasers
D. Permet notamment de détecter des molécules présentes à la surface des cellules grâce à des anticorps
E. Permet de compter le nombre de cellules
Question 5
Identifiez les éléments de 1 à 12
4
3
5
6
9
10
11 [ 1
12 [
2
-5-
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Quels milieux ont permis d’obtenir les 3 images A, B et C respectivement ? Justifiez votre réponse.
Question 6 - QCM
1/ Les lipides membranaires
A. Tous les phospholipides membranaires sont construits à partir d’un alcool commun : le glycérol
B. Deux acides gras seulement estérifient deux fonctions alcool du glycérol dans les glycérophospholipides
C. Les propriétés de charge électrique des phospholipides dépendent de la nature du groupement qui estérifie
l’acide phosphatidique.
D. Le cholestérol est un composé lipidique abondant des membranes bactériennes
E. Les phospholipides membranaires sont synthétisés sur la face luminale du réticulum endoplasmique lisse
-6-
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D. Les perméases sont des protéines membranaires transportant les molécules polaires du milieu où elles
sont le moins concentrées vers le milieu où elles sont le plus concentrées
E. La membrane plasmique joue un rôle de barrière sélective grâce à ses nombreuses protéines assurant un
transport orienté et sélectif
9/ FRAP
Question 7
On réalise, au temps tO, un marquage fluorescent des protéines membranaires d’une cellule.
1. Expliquez comment on effectue ce type de marquage.
Expérience 1
Au temps t1, on décolore rapidement au laser une zone de la cellule, et on mesure dans cette même zone la fluorescence
émise.
Expérience 2
A partir du temps t1, on applique en continu un laser pour décolorer une région de la cellule. On mesure la fluorescence
émise dans une région adjacente.
Expérience 3
A partir d’un temps t1, on applique en continu un laser pour décolorer une région de la cellule. On mesure la fluorescence
émise dans cette même région.
2. Comment s’appelle ce type d’expérience ?
3. Donnez l’aspect des courbes mettant en évidence l’évolution de l’émission de fluorescence au cours du temps.
4. Que pouvez-vous en déduire ?
5. Que dire de l’expérience 3 ?
Question 8
Le thymus est un organe important pour la maturation des lymphocytes T. Le thymus d'une souris normale de 4 semaines
est prélevé, dilacéré et les cellules ainsi récupérées sont lavées. Ces cellules sont incubées avec deux anticorps
reconnaissant chacun une protéine transmembranaire exprimée par les lymphocytes T (1) un anticorps anti-CD4 couplé à
un fluorochrome, la phycoérythrine (PE), et (2) un anticorps anti-CD8 couplé à un autre fluorochrome, l'allophycocyanine
(APC). L'analyse par cytométrie de flux des cellules ainsi marquées est représentée sur la figure suivante :
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6 67
couplé à l’allophycocyanine
Anti-CD8
17
Anti-CD4
couplé à la phycoérythrine
1. Rappeler le principe de la cytométrie de flux
2. Sur la figure ci-dessus, à quoi correspondent :
a. Chaque point
b. Les lignes horizontale et verticale
c. Les nombres 6, 67 et 17
3. Que pourrions-nous conclure, d’après ce graphe, sur les lymphocytes T présents dans le thymus de la souris de 4
semaines ?
Question 9
On étudie in vitro l'entrée d'un acide aminé, la leucine, dans un œuf d'oursin après fécondation. Dans toutes les expériences,
le milieu extracellulaire reste isotonique et la leucine est électriquement neutre. Le milieu extra cellulaire dans lequel est
plongé l’œuf contient du NaCI 440 mM, du KCI 12 mM, et du MgCl2 10 mM. On ajoute à ce milieu de la leucine. On mesure
simultanément un flux entrant de leucine et une brève dépolarisation de la membrane (- 80 mV à - 70 mV).
Comment expliquez-vous cette dépolarisation ?
Proposez un mécanisme d'entrée de la leucine.
Question 10
On mesure la perméabilité de la membrane d'une fibre musculaire au déoxyglucose en mesurant le flux entrant de cette
molécule (le déoxyglucose est une molécule qui est transportée comme le glucose, mais qui n’est pas métabolisée).
Si on effectue la même mesure, sur une bicouche lipidique artificielle composée exclusivement de lipides, dans les mêmes
conditions expérimentales, on s'aperçoit que la perméabilité est 100 fois inférieure.
Comment pouvez-vous expliquer cette différence?
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Question 11
Un segment d’intestin retourné est maintenu en survie in vitro dans un milieu nutri-
tif. Le retournement de la paroi permet de mettre la face séreuse (S), normalement
en relation avec le sang circulant, vers l’intérieur et la face muqueuse (M) orientée
vers l’extérieur. Les 2 extrémités du segment d’intestin sont ligaturées pour séparer
les 2 compartiments (S) et (M). La préparation est placée dans un milieu correcte-
ment oxygéné. Dans le compartiment (S) (interne), la concentration en NaCl est
fixée à 150 mM et la concentration en glucose à 0,9 g/L durant toute la durée de
l’expérience, sauf lorsque des concentrations différentes sont appliquées.
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Après 24 heures d’incubation, les membranes sont isolées, les protéines membranaires sont extraites, séparées
par électrophorèse et la protéine GLUT-4 est visualisée par western blot. On obtient les résultats suivants :
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QUESTIONS DE COURS
Microvillosité
Jonction serrée
Desmosome ponctuel
Jonction lacunaire
Lame basale
Contact focal
Celui-ci est un contact focal, car il n’est pas
Question 3 en contact avec les filaments intermédiaires
Complétez le tableau suivant
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Question 4
Identifiez les éléments du cytosquelette représentés sur les 3 schémas suivants. Vous en donnerez :
a) Le nom
b) Le nom du monomère protéique qui les compose
c) Le diamètre
d) Les caractéristiques dynamiques
e) La localisation cellulaire
f) Les fonctions principales
A B C
NOM Filaments intermédiaires Microtubules Microfilaments
Monomère protéique Kératine (vimentine,
desmine,prot des Tubuline Actine
neurofilaments…)
Diamètre 10 – 11 nm 25 nm 7-9 nm
Dynamique Dynamique Dynamique
Pas dynamique (Polymérisation / (Polymérisation /
Dépolymérisation) Dépolymérisation
Localisation Dans tout le cytoplasme.
Réseau dense autour du Origine dans le Réseau sous la membrane
noyau. centrosome plasmique (cortex
Fixé à la membrane Dans tout le cytoplasme cellulaire)
plasmique (desmosomes)
Fonctions principales Rail de communication Morphogénèse cellulaire
Charpente de la cellule pour les vésicules Motilié cellulaire
Résistance mécanique Organisation des organites Rail de communication
Cohésion des tissus Fuseau mitotique pour les vésicules sous-
épithéliaux Fonctionnement des cils et membranaires
flagelles Contractions cellulaires
Question 5
a- Sur le schéma suivant, identifiez les structures numérotées de 1 à 4
Jonctions serrées
Ceinture d’adhérence
Desmosome ponctuel
Jonction lacunaire
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a- Occludine / claudine
b- Desmoplakine / plakoglobine
c- Cadhérine
d- Kératine
e- Connexine
Question 6 - QCM
QCM 1 - A propos du cytosquelette 1, 2 et 3
A Les fibres 1 sont des microtubules microfilaments
B Les fibres 2 sont des microfilaments
C Les fibres 3 présentent les caractéristiques de résistance mécanique les plus
élevées filaments intermédiaires
D Les fibres 3 sont très dynamiques, ce qui permet à la cellule de se déplacer sur
un support solide
E Les fibres 2 sont présentes dans tout le cytosol des cellules cortex cellulaire
QCM 2 - A propos des jonctions A, B et C
A Les jonctions A s’établissent grâce aux occludines
B Les jonctions B et C utilisent des intégrines
C Les jonctions C forment une ceinture qui entoure les cellules épithéliales
D Les jonctions B délimitent les domaines apicaux et baso-latéraux des cellules épithéliales
E Les jonctions C permettent les liaisons entre la cellule et la matrice extracellulaire
QCM 3 - Les jonctions GAP
A Permettent d’ancrer deux cellules adjacentes par l’intermédiaire de cadhérines
B Forment des canaux qui laissent passer les petites molécules
C Empêchent le passage de molécules extracellulaires de la zone apicale à la zone baso-latérale
D Permettent le passage d’ADN d’une cellule à l’autre, favorisant ainsi le brassage génétique
E Sont localisées notamment sur les faces latérales des cellules épithéliales
QCM 4 - Les filaments intermédiaires
A Sont issus de la polymérisation de protéines globulaires
B Sont issus de monomères variables en fonction des cellules concernées
C Sont situés dans le cytoplasme des cellules eucaryotes
D De type lamine ont un assemblage régulé par phosphorylation
E Ont un rôle essentiellement, mécanique
QCM 5 - Les microfilaments
A Sont formés par de l'actine polymérisée
B Portent des protéines associées nécessaires à l'association et au déplacement des microfilaments
C Sont présents dans toutes les cellules eucaryotes
D Présentent des extrémités ayant des propriétés de polymérisation différentes
E Sont, par leur dynamique, à l'origine des mouvements de la surface cellulaire
TD Biologie Cellulaire 1
Questions :
a) Nommer la structure identifiée par « A » Ce sont les microvillosités
b) Quel est l’élément indiqué par une flèche ? Justifier votre réponse
Ce sont les jonctions serrées. En effet, elles bloquent le passage de l’hydroxyde de lantane du pôle apical vers le
pôle basolatéral (Photo 1) ou du pôle basolatéral vers le pôle apical (photo 2). Ces jonctions forment donc des
points d’étanchéité de l’épithélium en bloquant les passages paracellulaires (entre les cellules 1 et 2).
c) Quels sont ses rôles et sa composition moléculaire ?
- Jonction cellulaire
- Etanchéité des épithéliums
- Polarisation des cellules
d) Quel est l’ordre de grandeur du grossissement effectué sur la photo 1 ?
X 45 000 environ
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Question 8
Les embryons de souris subissent au stade 8 cellules un processus appelé compaction. Les cellules d’un embryon compacté
sont moins arrondies et possèdent entre elles des surfaces de contact plus importantes et des jonctions intercellulaires
s’établissent.
On veut savoir si des jonctions communicantes sont présentes avant et/ou après ce changement.
On injecte deux substances marqueurs, la peroxydase du raifort (HRP), une enzyme de 40000 Daltons, ou la fluorescéine,
molécule fluorescente de 330 Daltons dans 2 cellules voisines d’un embryon au stade 8 cellules, avant (A) ou après (B) la
compaction.
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L’anticorps contre la Dsg2 n’a pas d’effet sur l’adhésion des cellules. La Dsg2 n’est
sans doute pas mobilisée dans ces cellules.
Par contre l’anticorps contre la Dsg3 (AK23) induit une désolidarisation cellulaire. La Dsg3 est certainement
fortement impliquée dans les jonctions de ces cellules.
D’après les résultats de cette expérience et vos connaissances :
A. Les cadhérines sont des protéines transmembranaires
B. L’anticorps AK23 induit la rupture de jonctions serrées Pas de cadhérines dans les jonctions serrées
C. La Dsg3 est plus importante que la Dsg2 pour les jonctions cellulaires mises en place dans notre culture
cellulaire
D. La suppression du gène Dsg2 n’aurait pas d’incidence sur les jonctions entre les cellules utilisées dans
cette expérience
E. Les desmogléines nécessitent du calcium pour se lier les unes aux autres Comme toutes les cadhérines
Question 10 (Session 1 - 2014) (d’après Cahu et al. (2008) PLoS One, 3, e3938)
Lorsque la cellule entre en mitose, elle doit mettre en place un fuseau de division aussi appelé fuseau mitotique.
Pour se faire, le centrosome de la cellule est dupliqué durant la phase S du cycle cellulaire et un réseau de
microtubules s’établit entre les deux centrosomes qui constitueront les pôles du fuseau mitotique. Normalement
bipolaire, le fuseau de division peut être monopolaire par mauvaise séparation des centrosomes (figure 1), mais
alors, la séparation des chromatides ne se fera pas correctement.
Des protéines accessoires participent à la mise en place de ce fuseau mitotique, et parmi elles, la protéine Eg5
semble jouer un rôle important. Afin de mieux comprendre sa fonction, une équipe de chercheurs a dans un
premier temps recherché si des modifications post-traductionnelles pouvaient modifier l’activité d’Eg5. Ils ont
préincubé la protéine Eg5 sauvage fusionnée à la GFP (WT-GFP) ou une version mutée sur la thréonine en position
937 (Thréonine changée en Valine : T937V-GFP) en présence de la kinase Cdk1 et de 32P. La figure 2A présente la
protéine Eg5 fusionnée à la GFP. La figure 2B montre les essais de phosphorylation. Le panel « 32P » est une
autoradiographie des protéines Eg5 mises en évidence dans le panel inférieur « C » par coloration au bleu de
Coomassie. La figure 2C a été réalisée en incubant les différentes versions de la protéine Eg5 en présence d’un
microtubule artificiel placé sur lame de microscope et de la kinase Cdk1 (+) ou en son absence (-).
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TD Biologie Cellulaire 1
Enfin, les auteurs ont mesuré la quantité relative de fuseaux mitotiques bipolaires et monopolaires dans 4 lignées
cellulaires. La première (mock) exprime la protéine Eg5 sauvage. La lignée ∆Eg5 n’exprime pas la protéine Eg5.
WT correspond à la lignée ∆Eg5 complétée avec la protéine Eg5 sauvage et T937A à cette même lignée complétée
avec la version mutée T937A de la protéine Eg5. Les pourcentages de fuseaux mono et bipolaires pour chacune
de ces lignées sont représentés dans la figure 3.
Figure 2 :
A. RAS
B. Eg5 est phosphorylée par Cdk1 sur la thréonine 937 (apparition d’une bande radioactive sur la protéine
WT si présence de Cdk1 et pas de bande si la thréonine est mutée)
C. La protéine Eg5 se fixe sur les microtubules (visualisation de la fluorescence associée à Eg5 le long d’un
microtubule sur la 2e lame) à condition qu’elle soit phosphorylée (besoin de la Cdk1 et pas de fixation si
la thréonine est mutée)
Figure 3 :
Lorsque l’on enlève Eg5, on voit le taux de fuseaux monopolaires augmenter dramatiquement. Cet effet est
contrebalancé si on ajoute la protéine Eg5, par contre, la protéine mutée sur la thréonine (non phosphorylable) ne
restaure pas la fonction perdue en enlevant Eg5 (∆Eg5). La protéine Eg5 doit être phosphorylée pour fire des
fuseaux bipolaires.
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Question 11 (Session 1 - 2015) (D’après Laurent et al. (1999) J Cell Biol, 144, 1245)
La listeriose est une maladie bactérienne, transmise essentiellement par l’alimentation, liée à la présence de Listeria
monocytogenes et pouvant entrainer des atteintes sévères allant jusqu’à la septicémie ou une méningite. Pour se
déplacer dans les cellules infectées, la listeria recrute des monomères d’actine et en induit la polymérisation. Les
filaments ainsi générés forment comme des queues de comète qui propulsent littéralement les bactéries dans le
cytosol.
Afin de lutter efficacement contre ces pathogènes, on s’intéresse aux mécanismes impliqués dans le recrutement
de l’actine par la bactérie. Parmi les protéines qui participent à la dynamique du cytosquelette, la protéine VASP a
été identifiée, comme un bon candidat pour réguler le développement de la listeria.
Des extraits cellulaires ont été utilisés sans traitement particulier (NT) ou ont été passés 3 fois sur colonne
contenant un anticorps reconnaissant spécifiquement la protéine VASP (∆VASP) afin d’enlever spécifiquement
cette protéine de l’extrait. Parallèlement, un troisième extrait est également passé à travers une colonne, mais celle-
ci ne contenait aucun anticorps particulier (Mock). Ces trois extraits, complémentés ou non avec 1 µM de la
protéine VASP, exprimée dans un système hétérologue, ont été mis en présence de Listeria monocytogenes et la
vitesse de déplacement de la bactérie a été mesurée. Les résultats sont donnés dans la figure ci-contre.
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EXERCICES
Exercice 1
La toxine botulique, sécrétée par la bactérie Clostridium botulinum, est responsable d’une maladie paralytique grave, le
botulisme. La toxine botulique, bien que connue comme l’un des poisons les plus violents, est utilisée en cosmétique en
dose très faible pour induire la paralysie des muscles frontaux et limiter ainsi l’apparition de rides.
On s’intéresse au mécanisme d’action de cette toxine. Pour cela, des terminaisons nerveuses ont été prélevées chez le rat
et les vésicules synaptiques (VS) ont été isolées. On rappelle le mécanisme de fusion vésiculaire (figure 1).
a- A quelle famille de protéines appartiennent les protéines synaptobrevin, VAMP, SNAP25 et syntaxin ?
Les protéines SNAREs
Dans un premier temps, la toxine botulique (BoTx) est incubée en présence de terminaisons synaptiques (TS). Après 30
minutes d’incubation, certaines protéines membranaires sont analysées par électrophorèse suivie d’un western blot. On
obtient les résultats suivants :
etylcholine
Release
and
Botulinum
Toxin
Effect 11061
TABLEIV
b- Que montrent ces résultats ? Proposez un rôle pour la BoTx.
Effect of melittin, arachidonic acid, oleic acid, and stearic acid on
BoTx inhibition of K+-stimulated PHIAChrelease from PC12 On voitcells
une disparition de la bande de SNAP25, au profit de bandes plus
PC12 cells were prelabeled with [3H]choline chloride basses (donc plus petites). Il y a donc eu une dégradation de la protéine
(for [3H]
ACh), exposed to 2 nM BoTx for 2 h at 37"C as described (protéolyse)
under
"Experimental Procedures." Cells were then perfused with the indi-
cated concentrations of agents for 8 min before K+ stimulationfor 8
min, andthe release of [3H]ACh was determined. K+-stimulated
increase was calculated by subtraction of basal release from total K+-
stimulated release. The use of 1~ L (butM not 0.01 and 0.1 p ~ melittin
)
and 100 p~ (but not 10 and 30 p ~ AA ) increased the basal [3H]ACh
values (9.4 k 0.3% of the control), which were taken into account in
calculating
Dans un K+-stimulated
second temps,[3H]ACh release. The
les neurones data de
moteurs arerat
expressed
ont été incubés en présence d’un précurseur radioactif de l’acétylcholine
as percent of [3H]ACh released following K+stimulationin the
(Ach),
absence afin qu’ils
of indicated puissent
agents and are fabriquer
mean f S.E. ceofneurotransmetteur.
three experiments. Après traitement à la toxine botulique ou pas, on mesure la
quantité
Values d’Ach
of control libéréerelease
[3H]ACh dans (pmol/mg
le milieu.ofOnprotein/8
obtient min)
les résultats
are as suivants :
follows: basal, 0.35 f 0.02; stimulated, 1.56 f 0.13.
Treatment [3H]ACh release
c- Quel est l’effet de l’addition de BoTx dans le milieu ?
% control
Le BoTx inhible la libération d’AChdans le milieu (baisse de
None 100.0 f 2.3
BoTx (2 nM) 8.3 k 0.7" l’exocytose)
BoTx (2 nM), then melittin
0.01 p M 9.7 k 1.2"
0.1 p M 31.0 f 1.0"
d- Quel rôle joue la meltittin dans cette expérience ?
20
1 WM 95.0 f 2.2 La meltittin semble être un inhibiteur de la BoTx.
BoTx (2 nM), then AA
10 p M 9.7 f 0.3"
3H]ACh 30 p M 27.3 k 0.7"
)and [3H] 100 p M 96.0 f 1.5
KC1 was BoTx (2 nM), then oleic acid
linechlo- 10 p M 9.0 f 0.6"
at 37 "C 30 p M 9.3 f 0.9" - 20 -
imulated 100 p M 10.3 & 0.9"
d in the BoTx (2 nM), then stearic acid
e control 10 p M 7.3 f 0.3"
ted with 30 p M 9.7 f 0.9"
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e- Proposer un mode d’action de la BoTx dans la paralysie observée dans les cas de botulisme ?
La toxine botulique pourrait agir en induisant la protéolyse de la protéine SNAP25 (t-SNARE). Ainsi, SNAP25 et Syntaxin ne
pourraient pas interagir et les vésicules d’exocytose ne peuvent pas fusionner avec la membrane plasmique. L’exocytose
est bloquée et les neuromédiateurs ne seront pas libérés.
Donc, pas de stimulation de la cellule musculaire, donc paralysie.
Exercice 2(d’après Klockow et al. (2002) EMBO J. ; Macia et al. (2006) Dev. Cell ; Kirchhausen et al. (2008) Methods
Enzymol.)
La dynamine est une protéine indispensable au mécanisme d’endocytose à clathrine et !
à cavéoline. Afin de mieux comprendre le mode d’action de cette protéine, une équipe
de chercheurs a recherché des molécules interférant avec la dynamine. Ils ont ainsi
isolé le Dynasore, petite molécule de 331 g/mol.
L’activité de la dynamine a été mesurée en présence de GTP et en présence de GppNHp,
un analogue non hydrolysable du GTP. En présence de 1 µM de dynamine, les auteurs
ont évalué la quantité de nucléotide présente dans le milieu au cours du temps. Les
résultats obtenus sont présentés ci-contre :
La dynamine est capable d’hydrolyser le GTP
!
Dans un second temps, l’activité de la dynamine a été évaluée en présence et en absence
de dynasore. Dans la courbe suivante, l’hydrolyse du GTP a été évaluée en fonction de la
quantité de substrat (GTP) :
Enfin, la structure des vésicules d’endocytose a été observée en présence (Dynasore – B) et en absence (Vehicle – A) de
dynasore. Les images obtenues en microscopie électronique à transmission sont les suivantes :
Exercice 3 (d’après Sorensen et al. (2006) J Biol Chem., 281, 468 et Tevten et al. (2007) FEBS J., 274, 1881)
L’hypercholestérolémie familiale est due à une mutation dans le gène codant le récepteur du LDL (LDLR) qui se traduit par
une accumulation de LDL dans la circulation sanguine pouvant entrainer une maladie coronarienne prématurée. Afin
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TD Biologie Cellulaire 1
d’étudier le rôle de cette mutation, une lignée de cellules (CHO) a été transfectée avec une forme sauvage (WT), normale du
gène LDLR ou une forme mutée de ce récepteur où une glycine en position 544 a été remplacée par une valine (G544V).
Les gènes sauvages et mutés sont associés au gène codant la GFP. La localisation des produits de ces transgènes est
observée au microscope à fluorescence. On obtient les images suivantes :
A. La GFP permet de localiser dans la cellule le récepteur sauvage et le récepteur muté du LDL
B. Le récepteur sauvage est présent uniquement à la membrane plasmique on voit aussi le golgi très nettement
C. La localisation du récepteur muté pourrait expliquer l’hypercholestérolémie familiale pas de récepteur à la membrane =
pas d’absorption
D. Dans les conditions normales, le récepteur du LDL doit transiter par l’appareil de Golgi Pour toutes les protéines
membranaires : REG -> Golgie -> Membrane
E. Le récepteur muté est séquestré dans le réticulum endoplasmique Même localisation que la Conc A
Le phénylbutyrate (4-PBA) est un composé chimique capable de pénétrer dans les cellules. Pour tester son efficacité
éventuelle dans un traitement de l’hypercholestérolémie familiale, il a été utilisé sur des cellules CHO transfectées avec la
forme sauvage (WT) ou mutée du récepteur au LDL en absence (G544V) ou en présence de 4-PBA (G544V + 4-PBA). Le
nombre de récepteurs à la membrane est déterminé à l’aide d’un anticorps couplé au fluorochrome Alexa488, dirigé contre
le LDLR.
En parallèle, pour déterminer l’internalisation des LDL, celles-ci ont été couplées au colorant fluorescent DiD et incubées à
37°C en présence des trois types cellulaires ci-dessus. Après lavage, la fluorescence associée aux cellules est évaluée.
Les résultats obtenus sont représentés dans la figure ci-dessous :
Intensité de fluorescence
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Exercice 4
L’endocytose par récepteur est un procédé permettant le transport de macromolécules dans la cellule. Les expériences qui
ont permis d’élucider ce mécanisme ont été réalisées par Goldstein et Brown au cours d’une étude sur
l’hypercholestérolémie familiale. Les expériences suivantes ont été réalisées à partir de fibroblastes d’individus sains (S) et
de fibroblastes de 2 individus malades non apparentés (A et B). Dans un premier temps, la protéine Apo-B des LDL
d’individus sains a été radiomarquée à l’iode 125 pour faciliter sa détection et sa quantification.
Expérience 1 : Des cultures de tissus ont été soumises aux LDL radiomarqués à +4°C durant 5 min, puis rincées abondamment avec
du liquide physiologique. La radioactivité associée à chaque type cellulaire a été déterminée.
Rq : on ne distingue pas par cette approche si la radioactivité est localisée à la surface ou dans les cellules étudiées
Résultats : Une forte quantité de radioactivité est retrouvée associée aux cellules saines (S) et à celles du patient A. Aucune
radioactivité n’est associée aux cellules du patient B. Un traitement à la trypsine (une protéase à spectre large) élimine toute
radioactivité associée aux cellules S et A.
A 4°C, il n’y a pas d’activité enzymatique. Donc, on ne voit que des mécanismes rapides ne nécessitant pas d’énergie. Ici,
on voit la fixation des LDL sur les récepteurs. S et A fixent bien et pas B.
Donc B possède un récepteur incapable de lier les LDL, alors que A oui. Donc, soit pas de récepteur dans B, soit mutation
dans la partie réceptrice.
Expérience 2 : Les cellules sont mises en contact avec la radioactivité (LDL) à faible température durant 5 min, lavées puis
incubées à 37° durant 30 min.
Résultats : Les résultats sont identiques à ceux de l’expérience précédente. Par contre, si on incube ensuite les cellules 30
min en présence de trypsine (37°), la radioactivité associée aux cellules saines perdure. Comme dans l’expérience 1, la
radioactivité associée aux cellules A disparaît.
Maintenant, on mesure la capacité d’endocytose. Le lavage élimine les LDL mal fixées (pas liées par le récepteur) et la
passage à 37° pendant un temps long permet l’intégration des LDL dans la cellule (endocytose).
Le traitement à la trypsine dégrade les protéines situées à la surface de la cellule. Donc, si l’endocytose n’a pas eu lieu, le
récepteur sera dégradé et la LDL sera libérée. La radioactivité perdure dans la cellule saine car la LDL est protégée à l’intérieur
de la cellule. Elle disparaît sur la cellule A (qui pourtant fixait), donc la LDL est toujours dehors.
Expliquez très brièvement et clairement, en vous référant aux étapes requises pour l’endocytose, pourquoi les patients A et
B souffrent d’hypercholestérolémie.
Donc A a un LDLR muté dans sa partie intracytoplasmique (il peut fixer, mais ne déclenche pas l’endocytose) et B est muté
dans sa partie extracellulaire (il ne peut pas fixer, donc pas endocyter non plus).
Exercice 5
L’hypercholestérolémie familiale est due à des mutations dans le gène codant pour le récepteur aux LDL. Chez deux patients
atteints de cette maladie (HF1 et HF2), on évalue la capacité à fixer et internaliser les LDL, en comparaison avec un individu
sain (N). Les résultats sont donnés dans la figure ci-dessous.
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TD Biologie Cellulaire 1
Mais aucun des deux ne peut faire d’endocytose. HF1 muté dans la partie extracellulaire du LDLR et HF2 muté dans la partie
intracellulaire.
B. Comment expliquez vous que la synthèse du cholestérol soit très élevée chez les malades atteints d’hypercholestérolémie
familiale ?
Les 2 malades, qui ne font pas d’endocytose, présentent une synthèse abondante de cholestérol. Il y a donc visiblement
une boucle de régulation négative qui s’opère dans les cellules saines : plus la cellule absorbe de cholestérol, moins elle en
fabrique. Les malades souffrant d’HF présentent un taux de synthèse élevé.
Exercice 6
Pour pénétrer dans la cellule, les virus ont développé des stratégies en
s’appuyant sur les mécanismes d’endocytose. Afin de comprendre le mode
d’entrée de l’influenzavirus (virus de la grippe), une étude a été réalisée sur
des cellules issues de rein de chien (MDCK – pour Madin-Darby Canine
Kidney cells).
Dans un premier temps, le taux d’infection par le virus a été mesuré dans les
cellules MDCK en présence de différents inhibiteurs de l’endocytose : La
chlorpromazine (CPZ) est un inhibiteur de la voie d’endocytose à clathrine, le
5-(N-éthyl-N-isopropyl)-amiloride (EIPA) est un inhibiteur de la
macropinocytose ainsi que l’IPA3 qui agit en bloquant la kinase Pak1
impliquée dans le remodelage du cytosquelette.
La CPZ réduit l’entrée du virus. Donc, il est fort possible que le virus détourne l’endocytose à clathrine pour entrer dans la
cellule.
MAIS, on n’atteint pas le zéro. Donc, il y a peut-être un autre mécanisme.
L’EIPA augmente le phénomène d’inhibition, donc la macropinocytose est potentiellement aussi détournée. La macropinocytose
implique un remodelage du cytosquelette d’actine. Cela explique que l’IPA3 ait le même effet que l’EIPA.
Les résultats sont donnés dans la figure (A). La figure B montre deux virus entrant dans la cellule MDCK. Les virus sont identifiés
par une flèche.
*
*
On voit sur ces images le virus associé à de la macropinocytose et à de l’endocytose à clathrine (2e image avec un
épaississement de la membrane au niveau de la vésicule d’endocytose = manteau de clathrine).
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Exercice 7
Le schéma suivant montre le cycle d’absorption du fer par la cellule.
b/ Tracez les courbes d’association de la transferrine avec le fer et de la transferrine avec son récepteur, en fonction du pH.
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TD Biologie Cellulaire 1
Exercice 8
Le schéma ci-contre montre le mécanisme de l’endocytose du cholestérol :
A = LDL
B = Récepteur au LDL
C = Manteau de clathrine
D = Vésicule recouverte de clathrine
E = Vésicule d’endocytose nue
F = Endosome en cours d’acidification (intermédiaire entre précoce et tardif)
G = Lysosome primaire
H = Lysosome secondaire
I = Vésicule de recyclage des récepteurs
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