Année universitaire 2024-2025
DES-BIO : UE-4.1 / ECUE-1: Biologie moléculaire
CHAPITRE 1 :
BASES DE LA BIOLOGIE MOLECULAIRE
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Professeur DJAMAN A. Joseph
Université Félix Houphouët-Boigny / Institut Pasteur de Côte d’Ivoire
SOMMAIRE DU COURS
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CHAPITRE 1 : BASES DE LA BIOLOGIE MOLECULAIRE
q Module 1. : Historique de la découverte de l’ADN
q Module 2. : Structure des acides nucléiques
q Module 3. :
ü 3.1- Notions sur la réplication de l’ADN
ü 3.2- Notions sur la transcription
ü 3.3- Notion sur la traduction
CHAPITRE 1 :
BASES DE LA BIOLOGIE MOLECULAIRE
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Module 2. : Structure des Acides Nucléiques
A.N. polymères biologiques pour fonction, coder les
informations génétiques des êtres vivants.
Ce codage se base sur la succession de motifs chimiques :
les bases d'acides nucléiques.
On les trouve dans les 2 types d'acides nucléiques :
- les Acides DesoxyriboNulcéiques (ADN) et
- les Acides RiboNucléiques (ARN)
Ces biopolymères ont de nombreux points communs dans
la mesure où ils sont tous les 2 constitués de groupements
phosphodiester, de groupements d’ose (Ribose ou
Désoxyribose) et de bases.
NB : Les bases fournissent la diversité chimique à ces
polymères.
On peut schématiser un polymère d’acide nucléique par une
succession de motifs de base appelé monomère ou
nucléotide («-Phosphodiester-Ose-Base »)
Ces nucléotides sont reliés par des liaisons
phosphodiesters
ADN
I
Tous les êtres vivants possèdent un matériel génétique sous
forme d’acides nucléiques.
Ø L’acide désoxyribonucléique (ADN) chez la plupart des
organismes (homme, végétaux, parasites, virus, etc.) et
Ø l’acide ribonucléique (ARN) chez certains virus
ELEMENTS CONSTITUTIFS DES A.N.
1. LES BASES
Chaque acide nucléique contient quatre bases.
-Trois sont communes à l’ADN et l’ARN : adénine, cytosine et
guanine.
- La quatrième base diffère : thymine dans l’ADN et uracile
dans l’ARN.
On trouve deux catégories de bases :
- Les purines constituées de 2 cycles aromatiques
-Les pyrimidines constituées d’1 seul cycle aromatique
Bases
Uracile (Ura)
BASES PURIQUES
Les bases « puriques » (A et G) qui sont construite sur un motif purine
Adénine motif pyrimidique Guanine
Noyau imidazole
2. LES OSES
Les deux sucres rencontrés sont le ribose dans l’ARN et le
désoxyribose dans l’ADN
-- Pour le ribose, c’est du b-D-ribofuranose (2’-OH),
- - Pour le désoxyribose c’est du b-D-désoxyribofuranose
-qui dérive du précédent par réduction de la fonction alcool
portée par le carbone 2 (2’-H).
Sucres constitutifs des A.N.
Remarque :
Le désoxyribose plus stable que le ribose,, ce qui est adapté
à la conservation de l’information génétique.
L’élimination de l’hydroxyle du ribose diminue d’un facteur
100 la possibilité de l’hydrolyse de l’ADN par rapport à l’ARN.
- OH
3. LES NUCLÉOSIDES
Liaison entre un OSE et une BASE. Cette liaison est donc de
type b-N-glycosidique, et forme ::
- soit des ribonucléosides (cas de l’ARN),
- soit des désoxyribonucléosides (cas de l’ADN)
Nucléosides puriques
Nucléosides-pyrimidiques
4. L’ACIDE PHOSPHORIQUE
La liaison entre l’acide phosphorique (H3PO4) et l’ose se fait
par une liaison ester suivant une réaction très classique
(fonction acide réagit avec une fonction alcool pour former
une liaison ester et l’eau).
°Lorsqu’une deuxième, puis une troisième molécule d’acide
phosphorique vont se greffer sur la première, la liaison est de
type anhydride d’acide =è on parle de nucléotides mono-, di-
et triphosphates. .
Liaison phosphoanhydride
(Energétique)
5. LES NUCLÉOTIDES
Ils résultent de la liaison entre une base, un ose et un à trois
acides phosphoriques
Base
Ac. phosh.
Sucre
Nucléotides
Nomenclature des nucléotides
i
Désoxyribonucléosides Ribonucléosides
monophosphatés monophosphatés
Bases Nucléotides Nucléotides
Thymine Ac. désoxythymidilique (dTMP) —
Cytosine Ac. désoxycytidlque (dCMP) Ac. Cytidylique (CMP)
Adénine Ac. désoxyadénylique (dAMP) Ac. adénylique (AMP)
Guanine Ac. Désoxyguanylique (dGMP) [Link] (GMP)
Uracile — [Link] (UMP)
RESUME
Liaison
b-osidique
Carbone
réducteur
6. LES POLYNUCLÉOTIDES
La liaison entre deux nucléotides se fait par la formation d’une liaison ester
entre l’acide phosphorique d’un nucléotide et la fonction alcool portée par
le carbone 3¢ de l’ose de l’autre nucléotide :
Si l’on considère les deux extrémités d’un acide nucléique,
++ l’une contient un résidu d’acide phosphorique porteur de deux
fonctions acides libres (extrémités 5¢P) ;
Base
++ l’autre contient un hydroxyle libre sur le carbone 3¢ de l’ose (extrémité
3¢OH).
Base
- Par convention, les chaînes polynucléotidiques sont
orientées de 5¢ vers 3¢ et seront donc lues dans ce sens, y
compris lorsque l’ADN est circulaire.
5’
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è
3’
’
Polynucléotides ( 4 nucléotides) 2 chaînes polynucléot. (4 x 2 nucléotides)
7. APPARIEMENTS DES BASES DANS D’ADN
…… Interaction de type liaison hydrogènes
Séquence d’ADN avec les appariements de bases
L’ appariement dont la liaison est de type hydrogène fait que l'association de deux bases se fait dans
un même plan. Cet appariement canonique s'appelle également appariement Watson-Crick
Séquence d’ADN avec les appariements de bases
8. RESUME
Caractéristiques ADN ARN
Désoxyribose Ribose
Nom du sucre utilisé
(pour le « D » de ADN) (pour le « R » de ARN)
A (adénine) A (adénine)
Noms des quatre bases T (thymine) U (uracile)
utilisées C (cytosine) C (cytosine)
G (guanine) G (guanine)
Nombre de chaînes 2 1
Sucre – Base - Ac. Phosphorique
NUCLEOTIDE
5’-A G G G T C C C T A A G G C G T -3’
Structure en double hélice de l’ADN
La structure en double hélice de l'ADN est stabilisée par deux forces :
+ les interactions électrostatiques de type liaison hydrogène entre deux
paires de base comme décrit précédemment et
+ les interactions de type van der Waals suite à l'empilement des bases
(stacking en anglais).
Les liaisons π conjuguées (liaison chimique covalente) formant les cycles
aromatiques s'alignent perpendiculairement à l'axe principal de la double
hélice et permettent de diminuer leurs interactions avec le solvant.
La structure en double hélice confère à l'ADN les propriétés structurales
suivantes :
v L'ADN double brin est formé de 2 sillons asymétriques (appelé
majeur et mineur ou encore grand et petit sillon)
v La forme majoritaire, celui de la forme B, est appelée hélice droite.
v Chaque paire de base est orthogonale à l'axe de la double hélice
(angle +/- 1.2°)
v Un tour d'hélice nécessite ~21 nucléotides (soit ~10.5 paires de base)
et s'effectue sur 34 Å
v La distance entre deux bases est d'environ 3,4 Å (= 3,4. 10-10 m)
v Le diamètre de la double hélice fait 20 Å
