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TP6 : Manipulation de Données avec tidyr

Ce document présente un TP sur la manipulation des données avec la bibliothèque R 'tidyr', incluant des fonctions comme pivot_longer, pivot_wider, separate et unite. Les objectifs incluent la transformation de jeux de données pour faciliter l'analyse statistique et la création de graphiques. Des exercices pratiques sont également fournis pour appliquer ces concepts sur un jeu de données 'maladies'.

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TP6 : Manipulation de Données avec tidyr

Ce document présente un TP sur la manipulation des données avec la bibliothèque R 'tidyr', incluant des fonctions comme pivot_longer, pivot_wider, separate et unite. Les objectifs incluent la transformation de jeux de données pour faciliter l'analyse statistique et la création de graphiques. Des exercices pratiques sont également fournis pour appliquer ces concepts sur un jeu de données 'maladies'.

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Matière : TP Analyse des données avec le langage R ISIMA

Enseignant : Nesrine Blel & Malak Zaouali 1er semestre


Niveau : LFI-GLSI3 Année :2024-2025

TP6 : Manipulation des données avec tidyr

Objectifs :
 Utiliser les fonctions de la bibliothèque tidyr.
 Changer la structure des données en utilisant les fonctions :
 pivot_longer()
 pivot_wider()
 separate()
 unite()
 Ces fonctions facilitent l'analyse statistique, la création de graphiques et la préparation
des données.
Manipulation avec la bibliothèque « tidyr » :
Soit le jeu de données « murders » :
1. Nous allons transformer les données d’un format long à format large en utilisant la
fonction « pivot_wider » pour avoir les types d'armes comme variables (colonnes).
 names_from : prends le nom de la variable à pivoter.
 values_from : prends les valeurs à utiliser pour remplir les nouvelles variables.

# Fonction “pivot-wider”:
R> murders_wide <- murders %>% pivot_wider(names_from = Weapon, values_from = Count)

2. Fusion de deux colonnes en utilisant la fonction « unite » :

#fusion de deux variables (colonnes)


R> murders_fus <- murders %>% unite("State_Year", State, Year)

3. Séparation de deux variables (colonnes) en utilisant la fonction « separate » :

#separation de deux variables (colonnes)


R> murders_separated <- murders %>% separate(State_Year, into = c("State", "Year"), sep =
"_")

4. Remplissage des valeurs manquantes en utilisant la fonction « fill » :

#remplissage des valeurs manquantes


R> murders_filled <- murders_wide %>% fill(c(Gun, Knife), .direction = "up")

#Vérifier s’il existe encore des valeurs manquantes


R> sum(is.na(murders_filled))
5. Transformation du jeu de données d’un format large vers un format long, en utilisant la
fonction « pivot_longer » :

#transformation de format large vers un format long


R> df_long <- murders_separate %>% pivot_longer(cols = c(Gun, Knife), names_to = "Weapon",
values_to = "Count" )

 cols : Les colonnes à pivoter


 names_to : Le nom de la nouvelle colonne où les noms des colonnes pivotées seront
stockés.
 values_to : Le nom de la nouvelle colonne où les valeurs associées seront stockées .
NB : vous pouvez ajouter l’argument « values_drop_na = TRUE », où les lignes contenant
des valeurs NA dans les colonnes pivotées seront supprimées.

Exercice : (créer un nouveau jeu de données pour chaque question)

Soit le jeu de données « maladies » :

1. Créez un nouveau jeu de données ne contenant que les colonnes Maladie,


Symptom_Principal, Contagieuse et Total_Cas.
2. Extraire uniquement les lignes où la maladie est contagieuse et la gravité est "Élevée".
3. Trier les maladies par Total_Cas dans l'ordre décroissant.
4. Combinez les colonnes Symptom_Principal et Gravité en une seule colonne nommée
Symptome_Gravité.
5. Transformez les colonnes Symptom_Principal et Gravité en un format long avec deux
colonnes : Variable et Valeur.
6. Séparer la colonne Symptome_Gravité.
7. Transformer la colonne Gravité en format large en utilisant les valeurs de la colonne
Total_Cas.

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