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Bioénergétique : Calculs d'Enthalpie et Réactions

Le document présente des exercices de bioénergétique pour le Master 1 en biochimie appliquée, incluant des calculs de variations d'enthalpie libre standard et de constantes d'équilibre pour diverses réactions biochimiques. Les exercices portent sur des réactions telles que la phosphorylation du glucose, l'hydrolyse de l'ATP, et des réactions redox, en utilisant des données thermodynamiques. Les étudiants doivent appliquer des concepts de thermodynamique pour analyser les réactions dans des conditions physiologiques.

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Bioénergétique : Calculs d'Enthalpie et Réactions

Le document présente des exercices de bioénergétique pour le Master 1 en biochimie appliquée, incluant des calculs de variations d'enthalpie libre standard et de constantes d'équilibre pour diverses réactions biochimiques. Les exercices portent sur des réactions telles que la phosphorylation du glucose, l'hydrolyse de l'ATP, et des réactions redox, en utilisant des données thermodynamiques. Les étudiants doivent appliquer des concepts de thermodynamique pour analyser les réactions dans des conditions physiologiques.

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Université Abou Bekr Belkaïd Année universitaire 2024-2025

Faculté SNV-STU
Département de Biologie Régulation métabolique et pathologies
Master 1 Biochimie appliquée

TD n° 01 : Bioénergétique

Exercice 1
1. Calculer les variations d’enthalpie libre standard des réactions suivantes à partir des constantes d’équilibre
(pH = 7 et à 25°C).
1.1. Glucose-6-phosphate ↔ Glucose-1-phosphate (K’eq = 0.053)
1.2. Phosphoénolpyruvate + H2O ↔ Pyruvate + phosphate (K’eq = 7.4 × 1010 mol/l)
1.3. Glycérol-1-phosphate + H2O ↔ Glycérol + phosphate (K’eq = 41 mol/l)
2. Calculer les constantes d’équilibre des réactions suivantes à pH = 7, et à 25°C, à partir des variations
d’enthalpie libre standard.
2.1. Glucose-6-phosphate ↔ Fructose-6-phosphate (∆G°’ = +1.7 KJ/mol)
2.2. Maltose + H2O ↔ 2 Glucose (∆G°’ = – 15.5 KJ/mol)
2.3. ATP + H2O ↔ ADP + phosphate (∆G°’ = – 30 KJ/mol)
Données :
∆G°’ = – R×T×ln K’eq
∆G’ = ∆G°’ + R×T×ln Q
R = 8.3 J.mol-1K-1
∆G°’ = – n×F×∆E°’
F = 96500 J.mol-1.V-1

Exercice 2
1. Calculer la constante d’équilibre de la réaction de phosphorylation directe du glucose par le phosphate
inorganique.
Glucose + phosphate ↔ Glucose-6-phosphate + H2O (∆G°’ = + 14 KJ/mol)
2. Dans la cellule hépatique, les concentrations physiologiques sont les suivantes :

Glucose 5.00 mmol/l

Phosphate 5.00 mmol/l

Glucose-6-phosphate 0.25 mmol/l

• Calculer la variation d’enthalpie libre réelle de la réaction de phosphorylation directe du glucose par
le phosphate inorganique à 37°C. Conclure.
3. En réalité, la phosphorylation du glucose dans la cellule est couplée à l’hydrolyse de l’ATP :
ATP + H2O ↔ phosphate + ADP (∆G°’ = – 30 KJ/mol)

• Ecrire la réaction couplée et calculer la variation d’enthalpie libre standard et la constante d’équilibre
correspondante.

4. Calculer la variation d’enthalpie libre réelle de la réaction couplée à 37°C, sachant que les
concentrations d’ADP et d’ATP sont respectivement de 1.3 et 3.4 mmol/l. Conclure.

Exercice 3
1. En s'appuyant sur le fait que plus un couple redox a un potentiel de réduction standard bas, plus il a
tendance à céder ses électrons, écrivez les 2 demi-réactions redox correspondant à chacune des

1
réactions globales (couplées) ci-dessous, de telle sorte que chaque réaction globale soit écrite dans le
sens thermodynamiquement spontané.

(1) pyruvate + β-hydroxybutyrate ↔ lactate + acétoacétate


(2) acétoacétate + NADH + H+ ↔ β-hydroxybutyrate + NAD+
(3) FADH2 + cyt b (Fe3+) ↔ FAD + cyt b (Fe2+) + H+
(4) L-Glu + H2O + NADP+ ↔ α-cétoglutarate + NH3 + NADPH +H+
Remarques :
(2 H+ + 2 e-) sont échangés dans la réaction (1) ; la réaction (3) n’est pas équilibrée.

2. Calculez la variation d’énergie libre de Gibbs standard dans les conditions physiologiques (ΔG°') de
la réaction (4) considérée dans le sens spontané.
Données : (FAD / FADH2) : E°' = - 0,06 V
(pyruvate / lactate) : E°' = - 0,19 V
(cyt b (Fe3+) / cyt b (Fe2+)) : E°' = + 0,08 V
(NAD+ / NADH + H+) : E°' = - 0,32 V
(acétoacétate / β-hydroxybutyrate) : E°' = - 0,35 V
(NADP+ / NADPH + H+) : E°' = - 0,32 V
(α-cétoglutarate + NH3 / L-Glu) : E°' = - 0,14 V
T = 37°C ; R = 8,32 J.°K-1.mol-1 ; F = 23060 Cal.V-1
Exercice 4
Les concentrations d’ATP, d’ADP et de phosphate dans deux tissus différents figurent dans le tableau ci-
dessous.

Cellule musculaire (mmol/l) Cellule hépatique (mmol/l)

ATP 8.05 3.38

ADP 0.93 1.32

Phosphate 8.05 4.80

Calculer la variation d’enthalpie libre réelle de la réaction d’hydrolyse de l’ATP en ADP et phosphate à 37°C
dans chacun des deux tissus. Conclure.

Donnée : ∆G°’ d’hydrolyse de l’ATP en ADP = - 30 KJ/mol.

Exercice 5
Dans la voie de la glycolyse l'aldolase catalyse la coupure d'un ose en C6 en 2 oses en C3 :
D-fructose 1,6-diphosphate ↔ D-glycéraldéhyde 3-phosphate + dihydroxyacétone phosphate

La variation d'énergie libre standard de formation des deux trioses est de + 5,79 kcal/mol.

1. Ecrire cette réaction avec les formules développées.


2. In vivo les concentrations de ces composés sont les suivantes :
[D-fructose 1,6-diphosphate]φ = 31 µM ; [D-glycéraldéhyde 3-phosphate]φ = 18,5 µM ; [dihydroxyacétone
phosphate]φ = 138 µM
Les conditions de concentrations in vivo sont-elles voisines des conditions de concentration à l'équilibre ?
3. Cette réaction est-elle facilement réversible in vivo ?
Données : R = 1,99 cal.K-1.mol-1 ; T = 37°C

2
Exercice 6
Soit la réaction de réduction de l'acétaldéhyde en éthanol, catalysée par l'alcool déshydrogénase
CH3-CHO + NADH + H+ ↔ CH3-CH2OH + NAD+
1. Ecrivez les 2 demi-réactions redox correspondant à cette réaction globale.
2. Calculez, à 25°C, la variation d'énergie libre de Gibbs standard physiologique de la réaction considérée
dans le sens spontané.
3. Calculez la valeur de la constante d'équilibre.

Donnée : E°' (acétaldéhyde / éthanol) = - 0,163 V.

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