LEÇON : EXAMEN CYTOBACTÉRIOLOGIQUE DU LCR
INTRODUCTION
1. Définition
o L'examen cytobactériologique du liquide céphalorachidien
(LCR) est un ensemble de tests réalisés sur un échantillon de
LCR pour diagnostiquer des infections du système nerveux
central (SNC) telles que les méningites, les encéphalites ou les
myélites. Il permet de détecter des cellules inflammatoires,
des agents pathogènes (bactéries, virus) et des anomalies
biochimiques. Le LCR est un fluide clair qui circule autour du
cerveau et de la moelle épinière, et son analyse peut fournir
des informations cruciales pour établir un diagnostic.
2. Intérêt de la leçon
o L’examen cytobactériologique du LCR est essentiel dans la
prise en charge des infections du SNC, permettant de
différencier les causes infectieuses (bactériennes, virales,
fongiques) des autres causes possibles de symptômes
neurologiques. Cette analyse aide non seulement à identifier
l’agent pathogène responsable, mais aussi à évaluer le
pronostic et guider le traitement antibiotique ou antiviral
approprié.
1. RAPPELS CLINICO-BIOLOGIQUES
Indications cliniques pour l’examen du LCR :
o Fièvre accompagnée de signes neurologiques (céphalées,
photophobie, vomissements, raideur de la nuque).
o Signes d'infection du SNC tels que la méningite ou
l’encéphalite.
o Suspicion de myélite ou d'abcès cérébraux.
Anatomie du LCR :
o Le LCR est produit par les plexus choroïdes dans les
ventricules cérébraux et circule à travers les ventricules, le
canal rachidien et autour de la moelle épinière.
o Il sert à amortir les chocs, nourrir le SNC et éliminer les
déchets.
2. DIAGNOSTIC (par syndrome)
L'examen cytobactériologique du LCR permet de poser un diagnostic différentiel en fonction
des symptômes cliniques.
2.1 Prélèvement
1. Produits pathologiques
o Le produit pathologique ici est le LCR, qui est prélevé par
ponction lombaire (PL). Ce prélèvement est réalisé
généralement au niveau de la région lombaire (L3-L4) ou sous
l’espace intercostal pour obtenir environ 10 à 20 mL de LCR.
2. Transport
o Le LCR doit être transporté rapidement au laboratoire pour
analyse. En cas de retard, il doit être conservé à température
ambiante si l’analyse ne peut être réalisée immédiatement.
o Il ne doit pas être congelé, car cela pourrait altérer les
résultats des tests.
3. Conservation
o Si l’examen ne peut être effectué dans l’immédiat, le LCR peut
être stocké à 4°C pour une période limitée (24 heures
maximum).
o Pour les examens microbiologiques, il est important de
maintenir l’intégrité de l’échantillon en évitant les
contaminations extérieures.
2.2 Diagnostic bactériologique direct
1. Regarder, isoler, identifier et étudier sa sensibilité aux antibiotiques
o Après la réception du LCR, plusieurs examens sont réalisés
pour diagnostiquer la cause de l'infection du SNC.
1.1 Examen bactériologique direct
o Examen macroscopique :
Le LCR normal est clair et incolore. Un LCR trouble ou
purulent peut indiquer une infection bactérienne. Un
LCR sanguinolent peut suggérer un traumatisme ou une
hémorragie subarachnoïdienne.
La couleur et la clarté du LCR peuvent fournir une
première indication de l'origine de l'infection.
o Examen microscopique :
Coloration de Gram : La coloration de Gram permet
d’observer la présence de bactéries, leur morphologie
(coques, bacilles), et leur comportement en présence de
colorants (Gram positif ou négatif).
Culture : La culture du LCR sur différents milieux
bactériologiques (gélose au sang, gélose chocolat,
milieu de Sabouraud pour les champignons) permet
d’isoler les bactéries responsables. La culture du LCR
doit être effectuée dans un environnement contrôlé pour
maximiser la croissance des pathogènes.
o Identification des agents infectieux :
L’identification des bactéries se fait par des tests
biochimiques (tests de fermentation des sucres,
catalase, coagulase, etc.), la mise en culture, et parfois
des méthodes spécifiques telles que la PCR pour
identifier des agents pathogènes non cultivables (par
exemple, les virus ou les mycobactéries).
o Antibiogramme :
Un antibiogramme est effectué pour déterminer la
sensibilité de l’agent pathogène aux antibiotiques et
guider le traitement. Ce test est crucial pour choisir un
traitement ciblé et éviter la résistance aux antibiotiques.
1.2 Examen immunologique direct
o Test de détection des antigènes : Des tests rapides
comme les tests de détection d'antigènes spécifiques
(immunofluorescence, ELISA) peuvent être utilisés pour
identifier des agents pathogènes spécifiques, notamment les
virus (comme l'Herpès simplex, le virus de la grippe).
o Immunofluorescence directe (IFA) : Cette méthode permet
de détecter directement des antigènes spécifiques des agents
pathogènes présents dans le LCR.
1.3 Biologie moléculaire
o PCR : La PCR (Polymerase Chain Reaction) est utilisée pour
amplifier l'ADN ou l'ARN des agents infectieux présents dans
le LCR. Elle est particulièrement utile pour identifier des
agents pathogènes qui sont difficiles à cultiver, comme les
virus ou certaines bactéries.
o La PCR permet aussi de détecter plusieurs agents pathogènes
simultanément (méningite bactérienne, virale, tuberculeuse,
etc.).
2.3 Diagnostic indirect (immunologique indirect)
L'examen indirect consiste à évaluer la réponse de l’hôte à l'infection. Cette approche permet
de détecter des signes d'inflammation ou des traces de l'interaction entre l'agent pathogène et
le système immunitaire de l'hôte.
1. Marqueurs de l'inflammation
o Protéine C-réactive (CRP) : La CRP est un marqueur
d'inflammation aiguë qui peut être détecté dans le LCR. Une
élévation de la CRP peut indiquer une infection bactérienne.
o Cellules inflammatoires : L'examen du LCR peut révéler une
élévation des globules blancs (pleocytose) dans le cas de
méningite ou d'encéphalite. Une augmentation des
polynucléaires neutrophiles est typique d'une infection
bactérienne, tandis que des lymphocytes sont plus souvent
présents dans les infections virales.
2. Méthodes et résultats
o Les tests sérologiques peuvent également être utilisés pour
détecter des anticorps spécifiques produits par l'hôte en
réponse à une infection.
o Des méthodes comme l’immunoblotting ou l’ELISA peuvent
être utilisées pour caractériser la réponse de l’hôte à un
pathogène spécifique.
3. Interprétation des résultats
o L'interprétation des résultats nécessite une corrélation avec
les données cliniques et les autres examens biologiques. Une
épidémie virale ou bactérienne, la présence de symptômes
neurologiques, et l'évolution de l'infection doivent être prises
en compte pour ajuster le traitement.
CONCLUSION
L'examen cytobactériologique du LCR est un outil essentiel pour diagnostiquer les infections
du système nerveux central. Il permet de différencier les étiologies bactériennes, virales et
autres, et d'orienter efficacement le traitement. La rapidité du diagnostic, en particulier à
travers la culture, la PCR et l’immunofluorescence, est cruciale pour éviter des complications
graves, comme des lésions cérébrales permanentes, et pour assurer une prise en charge
adaptée.
