Biochimie - Lipides

Les acides gras.

Acides carboxyliques aliphatiques :

CH3–(CH2)n–COOH
Ils sont présents sous formes libres ou estérifiées.
En général, ils ont un nombre pair d’atome de carbone et sont non-ramifiés dans le règne animal
(linéaire).
Le nom dérive de celui de l’hydrocarbure correspondant, le suffixe _oïque remplaçant le _e final.
Exemple : (C16) hexadécane  acide hexadécanoïque.

La numérotation se fait toujours en partant du groupement carboxyle (COOH) vers le méthyl (CH 3)
terminal.

Nomenclature des carbones : 3 2 1

CH3–(CH2)n–CH2–CH2–COOH
ω ou n β α

Propriétés : -saturation / insaturation :

Les acides gras peuvent être saturés ou insaturés (présence de doubles liaisons au sein de la chaîne
carbonée).

-isomérie de la double liaison :

En principe les doubles liaisons sont en forme cis dans notre organisme, mais on trouve des isomères
trans présents dans l’alimentation.

-la longueur de la chaîne carbonée.

-le nombre pair ou impair de la chaîne carbonée.

-les ramifications de la chaîne carbonée.

Nomenclature :
Nombre de carbones. Nom commun. Non systémique.

4 Butyrique.

6 Caproïque.

8 Caprylique. Octanoïque.

10 Caprique. Décanoïque.

12 Laurique. Dodécanoïque.

14 Myristique. Tétradécanoïque.

16 Palmitique. Hexadécanoïque.

18 Stéarique. Octadécanoïque.

20 Arachidique. Eicosanoïque.

16 C=O
|
Acide palmitique. OH

Acide hexadécanoïque.

L’acide palmitique est un acide gras saturé à 16 atomes de carbones. C’est le principal acide gras
synthétisé par nos cellules.
Il se présente sous forme solide à température ambiante. Il est abondant dans toutes les graisses animales
ou végétales.

18 C=O
|
Acide stéarique. OH

Acide octadécanoïque.

L’acide stéarique est un autre acide gras à longue chaîne abondant dans toutes les graisses animales ou
végétales. Il peut également être biosynthétisé par notre organisme.
C’est un solide blanc utilisé dans l’industrie pour faire des bougies ou du savon.

Acides gras mineur :

-acides gras ramifiés : on retrouve des acides gras ramifiés notamment chez des organismes procaryotes
(bactéries GRAM+).
 -acides gras à nombre impair : toujours présent mais en petite quantité.
Ces acides gras utilisent des vois métaboliques spécifiques lors de leur oxydation.
Les acides gras insaturés :
Nomenclature :
Comme pour les acides gras saturés, le dérivé de l’hydrocarbure correspondant :
Exemple : Δ C16 :1 hexadécène  acide hexadécènoïque.

-la double liaison est indiquée par le signe Δ, accompagné du numéro du premier carbone participant à
la double liaison.
-on utilise également le signe : suivi du nombre de doubles liaisons, suivi de la place de celle-ci sur la
chaîne carbonée entre parenthèse.
-enfin on indique le nombre de carbone existant entre la double liaison et le carbone terminal soit par le
signe ω ou n suivi du chiffre correspondant.

Exemple :

16 10 COOH
7
Acide Δ7,10 hexadéca-dièn-oïque.
C16 Δ7,10.
C16 : 2 (7,10).
ω6 C16 : 2 ou n-6 C16 : 2.

Isomérie Cis / Trans :

H R R R
C=C C=C
R H H H

Isomérie Trans. Isomérie Cis.

Les isomères trans vont se comporter comme des acides gras saturés. Au contraire les isomères cis vont
se comporter différemment.
 les isomères cis introduisent du désordre dans les structures biologiques. C=O
|
18 10 OH

Acide oléique (ω9).

Acide Cis Δ9 octadécènoïque.
Acide gras saturé ou Présence d’acide gras
trans. en cis.

L’acide oléique est le plus abondant des acides gras insaturés dans notre organisme. Il est présent dans
toutes les huiles animales ou végétales mais peut également être synthétisé par notre organisme. Il est donc non
indispensable.
C=O
18 |
12 10 OH

Acide linoléique (ω6).

Acide cis Δ9, 12 octadécadiènoïque.
 L’acide linoléique est un acide gras à longue chaîne carbonée présent dans les huiles végétales (huile de
maïs, arachide,…)
Il ne peut pas être synthétisé dans notre organisme, c’est donc un acide gras qui nous est indispensable.
Il fait partie de la famille des acides gras ω6 et il est le précurseur des acides gras de cette famille dans
notre organisme, il est donc essentiel.
C=O
14 |
18 16 12 10 OH

Acide linolénique (ω3).

Acide cis Δ9, 12, 15 octadécatriènoïque.

L’acide linolénique est un acide gras à longue chaîne carbonée présent dans les huiles végétales (huile
de lin).
Il n’est pas synthétisé dans l’organisme il est donc indispensable comme l’acide linoléique. Il fait partie
de la famille des acides gras ω3 et il est le précurseur des acides gras de cette famille dans notre organisme  il
est essentiel.
C=O
20 18 16 10 4 |
14 12 8 6 OH
Acide arachidonique (ω6).
Acide cis Δ5, 8, 11, 14 eicosatétraènoïque.

L’acide arachidonique appartient à la série des acides gras ω6, comme l’acide linoléique. Il peut
d’ailleurs être synthétiser dans l’organisme à partir de ce dernier, il n’est donc pas indispensable.
C’est un précurseur direct des eicosanoïdes.

Biochimie - Lipides

La biosynthèse des acides gras.

La biosynthèse des acides gras met en jeu des voies métaboliques spécifiques qui ne sont pas seulement
l’inverse de la β-oxydation.
Elle s’effectue au niveau cytosolique dans les cellules des différents tissus. Principalement au niveau du
foie et du tissu adipeux.
Le premier substrat est l’acétyl-CoA, le produit final de la biosynthèse est l’acide palmitique (palmitate).
1) L’acétyl-CoA carboxylase :
O L’acétyl-CoA carboxylase utilise la biotine (B8) comme coenzyme.

H3C–C–S-CoA

O– ATP.
 Acétyl-CoA C’est l’étape clé de la lipogenèse, facilement régulée. Elle est
O=C–OH carboxylase.
inhibée par le palmitate et les catécholamines. Elle est au contraire stimulée
ADP + Pi.
O

O

par le citrate et par l’insuline.
O–C–CH2–C–S-CoA

Malonyl-CoA. Acyl-CoA.
Insuline.
+ –
Phosphatase. Citrate.
P P
Carboxylase Carboxylase Carboxylase
active. inactive active.
citrate
Kinase.

+
Glucagon, catécholamines.
 2) L’acide gras synthase :
Toutes les activités enzymatiques nécessaires à la biosynthèse des acides gras sont regroupées au sein
d’une même chaîne peptidique qui constitue donc une protéine multi-enzymatique géante : L’acide gras
synthase.
Le regroupement des différentes activités sur une même protéine permet un meilleur rendement
(proximité des différents sites…).

O O
  H–S-PAN-Enz
O–C–CH2–C–S-CoA Dans un premier temps, le malonyl-CoA se fixe sur un groupement
Malonyl-CoA.
pantothénique (PAN analogue du CoA) de l’acide gras synthase.
Malonyl trans-acylase.
Ce groupement PAN est situé sur un bras flexible qui va permettre
la présentation du malonyl aux différents sites présents sur le complexe
O O
  multi-enzymatique.
O–C–CH2–C–S-PAN-Enz + CoA-SH. O

Malonyl enzyme. H3C–C–S-CoA H–S-CYS-Enz
Les groupements acétyls (ou acyls) se fixent quant à eux sur un Acétyl-CoA.

deuxième site de liaison de l’enzyme correspondant à un groupement Acétyl trans-acylase.

cystéine.
Ce second groupement est situé à proximité du groupement PAN. O

H3C–C–S-CYS-Enz + CoA-SH

Acétyl enzyme.

Acétyl enzyme. Malonyl enzyme.

O O O
   Le bicarbonate est libéré lors de la réaction de la
H3C–C–S-CYS-Enz O–C–CH2–C–S-PAN-Enz
condensation.
H2O. 3-céto-acyl synthase. Ainsi, bien qu’il soit nécessaire à la réaction, le bicarbonate
(Enzyme de condensation).
n’apparaît pas dans le produit final.

O O Tous les carbones des acides gras biosynthétisés dans

 
H3C–C–CH2–C–S-PAN-Enz H–S-CYS-Enz + HCO3– l’organisme proviennent de l’acétyl-CoA.
3-céto-acyl-enzyme.

O O
3-céto-acyl-enzyme.  
H3C–C–CH2–C–S-PAN-Enz
Ces trois réactions enzymatiques sont inverses de NADPH, H+.

celles de la β-oxydation. 3-céto-acyl réductase.

NADP+
Les deux réactions de réduction utilisent le NADPH, OH O
3-hydroxy-acyl-enzyme.  
H3C–CH–CH2–C–S-PAN-Enz
H+ et non le NADH, H+.
3-hydroxy-acyl déshydratase.
De façon générale, le NADPH, H+ est utilisé de H2O.

manière préférentielle dans les voies anaboliques. Trans-Δ-2-énoyl enzyme

O

O H3C–CH=CH–C–S-PAN-Enz
 La chaîne acyl (possédant 2 NADPH,
carbones
H+ .
Acyl enzyme H3C–CH2–CH2–C–S-PAN-Enz Trans-Δ-2-énoyl réductase.
(n + 2) : butyryl enzyme. supplémentaires) est ensuite transférée par l’acyl-trans-
H–S-CYS-Enz O NADP+
Acyl enzyme 
acylase sur le(n résidu cystéine.
+ 2) : butyryl enzyme. H3C–CH2–CH2–C–S-PAN-Enz
Acyl trans-acylase
 Elle peut ensuite subir un nouveau cycle
d’élongation.
Apres 7 cycles d’élongation, on aboutit à la
formation du palmityl-enzyme (C16). L’action d’une
thioestérase permet la libération du palmitate.

Bilan de la synthèse de palmitate :

8 acétyl-CoA Palmitate + 8 CoA.
+ 7 ATP. + 7 (ADP + Pi)
+ 14 NADPH, H+. + 14 NADP+.

L’acide gras synthase active est formé de dimères de cette protéine associées
PAN-SH HS-CYS.
de façon anti-parallèle.
Cette association permet la proximité moléculaire de deux groupements PAN
Unité 1 Unité 2
et CYS des deux enzymes.
L’unité fonctionnelle de l’acide gras synthase est en fait constituée de deux
CYS-SH. HS-PAN.
demi-enzymes associées.

Structure de l’acide gras

synthase.

3) L’élongation des acides gras :

Acyl-CoA + malonyl-CoA.

Condensation.
CO2.

3-céto-acyl-CoA. + CoA-SH..
L’élongation des acides gras (> à 16 carbones)
NADPH, H+.
s’effectue au sein du réticulum endoplasmique. Les étapes sont
Réductase.
identiques à celles du complexe de l’acide gras synthase, mais NADP+

3-hydroxy-acyl-CoA.
il n’y a pas de fixation des acides gras sur l’enzyme.
Les enzymes d’élongation permettent la synthèse de
Déshydratase.
stéaryl-CoA et d’acides gras à très longue chaîne (pour le H2O.

cerveau). Trans-Δ-2-énoyl CoA.

NADPH, H+.
Réductase.
NADP+
Acyl-CoA (n + 2)
4) Les acides gras insaturés :
O2 + NADH, H+. 2 H2O + NAD +.
Les animaux ont la capacité de produire des acides gras mono-
H H
insaturés à l’aide d’une désaturase spécifique : La Δ-9 désaturase.  
R–C–C–R R–C=C–R
  Désaturase.  
Cette enzyme est présente au sein du réticulum endoplasmique H H H H

(c’est une enzyme microsomale). Acyl-CoA. Trans-énoyl-CoA.

18 CO–S-CoA. Chez les animaux, les

Stearyl-CoA. doubles liaisons additionnelles
Δ-9 désaturase. à la Δ-9 sont toujours
introduites entre la double
CO–S-CoA. liaison existante et le
18 10 9 carboxyl.

Oléyl-CoA.
Il est donc impossible de biosynthétiser des acides gras ayant des doubles liaisons au-delà de la
position Δ-9.

Δ-5 désaturase.
Les acides linoléique et linolénique
Acide oléique (C18 Δ9).
possèdent des doubles liaison au-delà de la (ω9)

C=O
position 9. ils ne peuvent donc pas être |
18 10 OH
biosynthétisés chez l’homme. Ils doivent
donc être apportés par les aliments. Ils
Δ-6 Δ-4
sont donc appelés acides gras essentiels. Acide linoléique (C18 Δ9,12). désaturase. désaturase.
(ω6)
Les acides gras poly-insaturés sont C=O
18 |
synthétisés par une combinaison de 12 10 OH

Acide linolénique (C18 Δ9,12, 15).

réaction de dénaturation et d’élongation. (ω3)

C=O
14 |
18 16 12 10 OH

 Tous les acides gras qui dérivent de l’acide oléique auront leur dernière double liaison en oméga 9 :
c’est la famille des ω9.
 Tous les acides gras qui dérivent de l’acide linoléique auront leur dernière double liaison en oméga
6 : c’est la famille des ω6.
 Tous les acides gras qui dérivent de l’acide linolénique auront leur dernière double liaison en oméga
3 : c’est la famille des ω3.
La biosynthèse des acides gras ω9 :
Idem pour l’acide linolénique : C=O
|
18 10 9 OH

C18 : 3(9,12, 15). C18

Δ6:désaturase
1(9). C18 : 4(6, 9,12, 15). 1 cycle C20 : 4(8, 11,14, 17).
(Acide oléique)
acide linolénique. Δ-6 désaturase
d’élongation.
 La biosynthèse des acides gras poly-insaturés à très longue chaîne (C22 et C24) fait appel à de nouveaux
cycles d’élongations et de désaturation (Δ4 désaturase).
Ces acides gras (ω3 : acide cervonique C22 : 6) sont notamment présent dans les phospholipides
cérébraux.
ω9 : C20 : 3(5, 8, 12)  C22 : 3  C22 : 4

ω6 : C20 : 4(5, 8, 11, 14)  C22 : 4  C22 : 5

ω3 : C20 : 5(5, 8, 11, 14,

 C22 : 5  C22 : 6
17)

Elongase. Δ4 Désaturase.