Biochimie Métabolique
Enseignant Intervenant
Professeur Noureddine BOURHIM
Semestre
S1
Module
Année scolaire Chimie-Biochimie
2024-2025
[Link]
Plan du cours (1):
Chapitre 1: Métabolisme des sucres
1.1 Introduction au métabolisme
1.2 La glycolyse
1.2.1: Devenir du Pyruvate
1.2.2: Fermentation Alcoolique
1.3.3: Fermentation Lactique
1.3 Cycle de Krebs
1.3.1: Entrée du pyruvate dans le mitochondrie (PDH)
1.3.2: Les réactions du cycle de Krebs
1.3.3: Bilan énergétique du cycle de Krebs
1. 4 Bioénergétique
1.4.1: Les étapes de transfert des électrons
1.4.2: Mécanisme de la phosphorylation oxydative
1.4.3: Les navettes Glycérol-3-phosphate et Malate/aspartate
1.4.4: Bilan de l’oxydation complète d’une molécule de Glucose
1.5 Entrée des autres sucres dans la glycolyse
1.6 Métabolisme du Glycogène
1.6.1: Glycogénogenèse
1.6.2: Glycogénolyse
1.6 La Néoglucogenèse
1.8 La voie des pentoses phosphates
Objectifs pédagogiques:
Après ce)e première par-e de ce chapitre l’étudiant doit être capable de:
1- Introduire la glycolyse comme l’exemple d’une voie
catabolique dégradant les disaccharides ou les
polysaccharides après leur hydrolyse.
2- Décrire la séquence des étapes enzymatiques en distinguant
la phase de consommation de l’ATP (emprunt) et celle de
remboursement.
3- Insister sur la capacité de la glycolyse à générer des
cofacteurs réduits (NADH,H+) riches en énergie, de l’ATP et des
précurseurs, susceptibles d’être repris par d’autres voies
cataboliques ou anaboliques.
4- Introduire les réactions de la fermentation alcoolique et la
fermentation lactique.
3
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.1 Introduction au métabolisme
BIOCHIMIE MÉTABOLIQUE
LES SOURCES
D’ÉNERGIE
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.1 Introduction au métabolisme
LE MÉTABOLISME C’EST QUOI ?
C’est l’ensemble des réactions
chimiques qui vont dégrader ou
synthétiser des éléments dans
l’organisme.
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.1 Introduction au métabolisme
Catabolisme Anabolisme
Qui dégrade + Qui crée
MÉTABOLISME
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.1 Introduction au métabolisme
VUE GÉNÉRALE
DU
MÉTABOLISME
CELLULAIRE
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.1 Introduction au métabolisme ALIMENTATION
PROTÉINES SUCRES LIPIDES
Acides aminés Sucres simples Acides gras
Glycolyse
Pyruvate ATP
Acétyl CoA
Cycle de l’acide citrique
Phosphorylation oxydative
ATP
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.1 Introduction au métabolisme
MÉTABOLISME DES SUCRES
(Glucides)
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.1 Introduction au métabolisme
SACCHAROSE
saccharase
GLUCOSE FRUCTOSE
11 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.1 Introduction au métabolisme
GLUCOSE
Le glucose est un sucre très important pour les
cellules.
Les cellules dégradent le glucose afin de
récupérer l’énergie directement utilisable par
l’organisme.
Mais, la quantité de glucose doit être maintenue
constante dans l’organisme (Glycémie).
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.1 Introduction au métabolisme
La glycémie, appelée aussi
"taux de sucre" ou "taux de
glucose" dans le sang.
La glycémie peut varier pour
plusieurs raisons :
- L’alimentation.
- Le Diabète.
- Certains Médicaments, etc....
Les 3 états de la glycémie:
- Hypoglycémie ☞ Inférieur à 0.60g/l
- Glycémie normale A jeun ☞ entre 0.70g/l et 1.10g/l
- Hyperglycémie à jeun ☞ Supérieur à 1.10g/l
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.1 Introduction au métabolisme
Pour maintenir cette glycémie normale,
le corps dispose de différentes voies
métaboliques, dans le but:
1- D’augmenter le taux de glucose dans le
cas d’une hypoglycémie
Ou bien,
2- De diminuer le taux de glucose dans le
cas d’une hyperglycémie.
Tout cela, sous la dépendance de deux
hormones pancréatiques; l’insuline et le
glucagon.
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.1 Introduction au métabolisme
Pancréas
Cellules
INSULINE b a GLUCAGON
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.1 Introduction au métabolisme
Parmi les voies impliquées dans le
métabolisme des sucres, de la
régulation du taux de glucose on peut
citer:
- La GLYCOLYSE
- La GLYCOGÉNOLYSE
- La GLYCOGÉNOGENÈSE
- La NÉOGLUCOGENÈSE
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
LA GLYCOLYSE
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
LA GLYCOLYSE
Glucose
2x CH3-C-COOH
＝
O
2xPyruvate
200 m en 19 s 32
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
- La molécule de glucose est dégradée
dans une série de réactions enzymatiques.
- La glycolyse se fait entièrement dans le
cytoplasme en dix réactions.
- La glycolyse est une voie du catabolisme.
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
ENTRÉE DU GLUCOSE DANS LA CELLULE
- Le glucose ne peut pas pénétrer dans la
cellule par simple diffusion.
- Son entrée est assurée par des
transporteurs spécifiques.
- On connaît actuellement 5 transporteurs
membranaires de glucose appelés GLUT*
numérotés de 1 à 14 (GLUT-1 à GLUT-14).
* GLUT= GLUCOSE TRANSPORTER
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
Insuline
1
Glucose 3 Pancréas
GLUT 4
2
4
6
Glycogène
5 Pyruvate
TRANSPORT DU GLUCOSE SOUS Acide
L’ACTION DE L’INSULINE Gras
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
Réaction N°1
Phosphorylation Du Glucose
Hexokinase
Glucokinase
1
Irréversible
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
Réaction N°2
Conversion du glucose-6-phosphate en
Fructose-6-Phosphate
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
Réaction N°3
Phosphorylation du Fructose-6-Phosphate
en Fructose 1,6-BisPhosphate
3
Irréversible
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
Réaction N°4
Hydrolyse du fructose 1,6-bisphosphate
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
Glucose
DHAP GA3P
TRIGLYCÉRIDES
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
Réaction N°5
Interconversion des triose phosphates
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
Réaction N°6
Oxydation de de la glycéraldéhyde-3-
phosphate en 1,3 bisphosphoglycerate
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
Réaction N°7
Transfert de groupement Phosphoryl
du 1,3-bisphosphoglycerate à l'ADP
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
Réaction N°8
Conversion du 3-phosphoglycerate en
2-phosphoglycerate
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
Réaction N°9
Déshydratation du 2-phosphoglycerate pour former
la phosphoénolpyruvate (PEP)
Fluor
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
Réaction N°10
Transfert du groupement phosphoryl à
partir de phosphoénolpyruvate à l'ADP
10
Irréversible
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
les
1 10
sib
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év
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ns
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3
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Tr
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
RÉSUMÉ
LES ÉTAPES
DE LA
GLYCOLYSE
1 Glucose (6C)
2 Pyruvate (2x3C)
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse
L'équation globale de la
glycolyse
GLUCOSE + 2 NAD+ + 2 ADP + 2 Pi
2PYRUVATE + 2(NADH, H+) + 2 ATP
+ 2H2O
DG°' = - 85 KJ/mole
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2 La glycolyse DEVENIR DU PYRUVATE
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.1 Devenir du pyruvate
DEVENIR DU PYRUVATE
- A la fin des 10 réactions enzymatiques de la glycolyse
on obtient, à partir du glucose, la formation de 2
molécules d'ATP, de 2 NADH,H+, et de 2 pyruvates dans
toutes les cellules.
- Le devenir du pyruvate va dépendre des conditions
suivantes :
- La présence ou l'absence de l'oxygène dans
l'environnement de la cellule.
- La situation énergétique de la cellule.
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.2 La fermentation alcoolique
EN ABSENCE D'OXYGÈNE
Chez les microorganismes et les levures
Production d’Alcool
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.2 La fermentation alcoolique
TRANSFORMATION DU PYRUVATE EN ETHANOL
- La transformation du pyruvate en
éthanol se rencontre chez les levures qui
possèdent une pyruvate décarboxylase.
- Le pyruvate est décarboxylé en
acétaldéhyde par la pyruvate
décarboxylase.
- Cette réaction est irréversible.
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.2 La fermentation alcoolique
Réaction de la « Fermentation
Glucose Alcoolique ».
Pyruvate
TPP, Mg++
Pyruvate
décarboxylase CO2
+ CO2
Acétaldéhyde
NADH + H+
Alcool
déshydrogénase NAD+
Éthanol (Alcool)
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.2 La fermentation alcoolique
PYRUVATE DÉCARBOXYLASE
+
+ 2CO2
ALCOOL DÉSHYDROGÉNASE
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.2 La fermentation alcoolique
Lorsque les réactions de la
glycolyse sont poursuivies par la
transformation du pyruvate en
éthanol, on parle de fermentation
alcoolique.
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.2 La fermentation alcoolique
LA RÉACTION GLOBALE
DE
LA FERMENTATION ALCOOLIQUE
Glucose + 2 ADP + 2 Pi
2 Ethanol + 2 CO2+ 2 ATP
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.3 La fermentation lactique
EN ABSENCE D’OXYGENE
Chez les animaux
Lactate
Production du Lactate
Lactate
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.3 La fermentation lactique
REDUCTION DU PYRUVATE EN
LACTATE
Lorsque la cellule ne dispose pas
de mitochondries (comme les
globules rouges), est privée
d'oxygène (anaérobiose) ou en
conditions hypoxiques (tissu
musculaire en contraction rapide),
le pyruvate est réduit en lactate par
le NADH,H+ formé au cours de la
glycolyse.
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.3 La fermentation lactique
Réaction de la « Fermentation
Lactique ».
Glucose
Pyruvate
Lactate NADH + H+
Déshydrogénase NAD+
(LDH)
Lactate
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.3 La fermentation lactique
FERMENTATION LACTIQUE
LACTATE DESHYDROGENASE (LDH)
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.3 La fermentation lactique
BILAN DE LA FERMENTATION
LACTIQUE
GLUCOSE + 2ADP + 2 Pi
2 LACTATE + 2 ATP
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.3 La fermentation lactique
Comparaison
FERMENTATION ALCOOLIQUE
Microorganismes et Levures
+ CO2 + 2 ATP
FERMENTATION LACTIQUE
Les animaux
+ 2 ATP
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.3 La fermentation lactique
CYCLE DES CORI
- Le lactate est le produit final de la dégradation
du glucose.
- Il diffuse dans le milieu extracellulaire et
constitue un déchet.
- Le lactate, déversé dans le sang chez le
mammifère, peut être retransformé dans le foie
en glucose par la voie de la néoglucogenèse
(Cycle des Cori).
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
1.2.3 La fermentation lactique
CYCLE DES CORI
SANG
SANG
1 Chapitre 1: Métabolisme des Sucres
Résumé
1.2.3 La fermentation lactique
GLUCOSE
2 PYRUVATE
Présence d’oxygène Hypoxie Absence d’oxygène
ACÉTYLCOA ALCOOL
MICROORGANISMES ET LEVURES
CYCLE DE ACIDE LACTIQUE
KREBS LES ANIMAUX
A retenir
1- Définir le métabolisme cellulaire.
2- Retenir les caractéristiques d’une voie catabolique : réduction
du nombre de carbones du substrat, formation de cofacteurs
réduits riches en énergie et/ou de l’ATP, génération de précurseurs
de biosynthèse.
3- Connaitre les séquences de la glycolyse en portant une
attention particulière aux enzymes catalysant les réactions
irréversibles.
4- Retenir les réactions de consommation de l’ATP et celles à
l’origine de la production de l’ATP.
5- Connaître le devenir du pyruvate à l’issue de la glycolyse, les
enzymes qui sont impliquées dans la fermentation alcoolique et la
fermentation lactique.
6- Connaître le bilan de l’oxydation partielle d’une molécule de
glucose.
·
53
